Molecular identification of Vibrio tapetis, the causative agent of the brown ring disease of Ruditapes philippinarum Auteur(s) : Paillard, Christine Gausson, Sabrina Nicolas, Jean-louis Le Pennec, Jean Paul Haras, Dominique Éditeur(s) : Elsevier Résumé : Vibrio tapetis is the marine bacterium responsible for the brown ring disease (BRD) affecting die manila clam, Ruditapes philippinarum. Identification of V tapelis has been previously performed using biochemical criteria and serological procedures. All of these methods are time consuming and ill-adapted to individual screening. This study describes an oligonucleotidic probe (Vt446) and two PCR primers, deduced from the 16S rDNA sequence, allowing a fast and specific V tapetis identification using dot blot hybridisation and species-specific primed PCR (SSP-PCR). The probe and primers have been tested on 60 strains, including referenced Vibrio sp., Gram negative and positive bacteria, marine bacteria samples and isolated clam bacteria. For all the 19 V tapetis strains, the results of PCR assays consistently corroborated those of the agglutination tests. The detection limit was estimated to be 10(2) CFU ml(-1). The SSP-PCR method has resulted in V tapetis detection in larvae, m diseased clams, and in asymptomatic broodstock clams that later developed BRD. In conclusion, the two SSP-PCR primers were useful for direct and fast identification of V tapetis strains isolated in clams, and are well suited for the screening of individual R. philippilnarum broodstock clams and larvae from the hatchery. (C) 2005 Elsevier B.V. All rights reserved. Aquaculture (0044-8486) (Elsevier), 2006-03 , Vol. 253 , N. 1-4 , P. 25-38 Droits : 2005 Elsevier B.V. All rights reserved http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/publication-1692.pdf DOI:10.1016/j.aquaculture.2005.03.047 http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1692/ | Partager |
Validation du TED et essais d'une nouvelle grille sélective dans la pêcherie crevettière de Guyane2007 Auteur(s) : Meillat, Marc Morandeau, Fabien Achoun, Joseph Barthelemy, Patricia Résumé : This work is in line with the fishing technology section of the DUHAL (Durability of Halieutic activities) action. It aims to reduce the "side" catches associated with shrimp fishing in French Guyana. Shrimp trawling is indeed considered as one of the fishing activities which generates the most waste. The campaign carried out in November/December 2006 had lead to the following conclusions [...] Ce travail s'inscrit dans le volet technologie pêche de l'action DUHAL (DUrabilité des activités HALieutiques). Son objectif est de réduire sensiblement les captures accessoires associées à la pêche crevettière guyanaise. En effet, le chalutage crevettier est considéré comme une des activités de pêche professionnelle le plus génératrices de gaspillage. La campagne menée en novembre/décembre 2006 avait conduit aux conclusions suivantes : Fenêtre à mailles carrées de 100 mm Les dispositifs à mailles carrées de 100 mm à la jauge, placés sur le dessus de la rallonge, occasionnent des pertes très importantes en crevettes commerciales. Différentes raisons peuvent expliquer ce résultat : − L'emplacement de la fenêtre est sans doute trop près de la poche. Le périmètre de la poche est de 120 mailles de 45 mm à la jauge, or la dimension de la fenêtre est peut être trop importante par rapport à ce périmètre. − Un maillage réduit pourrait diminuer ces pertes. Les résultats sur les poissons de grande taille indiquent une capture plus importante avec le chalut sélectif. L'amélioration de la filtration du chalut imputable aux grandes mailles peut expliquer ce phénomène déjà rencontré dans d'autres pêcheries. Les résultats sur les rejets sont encourageants. Fenêtre à mailles carrées de 70 mm Le dispositif à mailles carrées de 70 mm à la jauge, placé sur le dessus du gorget, occasionne encore des pertes en crevettes non négligeables, bien que sérieusement réduites par rapport au dispositif à mailles de 100 mm. L'action sur les animaux de grande taille est faible. La réduction des captures accessoires (8%) est plus modeste qu'avec le dispositif précédent (23 et 30%). TED L'usage du TED conduit à une perte en crevettes encore importante (23%). Considérant les conditions de pêche guyanaises, on peut envisager d'ajouter à l'avant de la grille un voile concentrateur. Ce dernier permettra de canaliser les différents animaux sur le bas de la grille avant le tri et permettra sans doute de réduire les pertes en crevettes. L'action sur les animaux de grande taille est assez sensible, en particulier sur les raies. L'action sur les rejets est visible (25%) et va dans le sens de la réduction du « gaspillage » pour cette pêcherie.Suite à ces essais et aux travaux menés en juillet 2006, une nouvelle campagne d'essais a été programmée pour valider définitivement les résultats liés à l'usage d'un TED et pour tester un nouveau dispositif sélectif (grille Nordmore) associé à un BRD (Bycatch Reducing Device) particulier, le RES (Radial Escape Section). Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/rapport-6683.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6683/ | Partager Voir aussi Bycatch Reducing Device Radial Escape Section Duhal survey campaign shrimp Selectivity grille Nordmore mailles carrées BRD RES Télécharger |