Éditeur(s) : HAL CCSD Oxford University Press (OUP): Policy C - Option B
Résumé : International audience
We report the characterization of a DNA primase/ polymerase protein (PolpTN2) encoded by the pTN2 plasmid from Thermococcus nautilus. Sequence analysis revealed that this protein corresponds to a fusion between an N-terminal domain homologous to the small catalytic subunit PriS of heterodimeric archaeal and eukaryotic primases (AEP) and a C-terminal domain related to their large regulatory subunit PriL. This unique domain configuration is not found in other virus-and plasmid-encoded primases in which PriS-like domains are typically fused to different types of helicases. PolpTN2 exhibited primase, polymerase and nucleotidyl transferase activities and specifically incorporates dNTPs, to the exclusion of rNTPs. PolpTN2 could efficiently prime DNA synthesis by the T. nautilus PolB DNA polymerase, suggesting that it is used in vivo as a primase for pTN2 plasmid replication. The N-terminal PriS-like domain of PolpTN2 exhibited all activities of the full-length enzyme but was much less efficient in priming cellular DNA polymerases. Surprisingly, the N-terminal domain possesses reverse transcriptase activity. We speculate that this activity could reflect an ancestral function of AEP proteins in the transition from the RNA to the DNA world.
ISSN: 0305-1048

Droits : http://creativecommons.org/licenses/by/
hal-01332620
http://hal.upmc.fr/hal-01332620
http://hal.upmc.fr/hal-01332620/document
http://hal.upmc.fr/hal-01332620/file/Nucl.%20Acids%20Res.-2014-Gill-3707-19.pdf
DOI : 10.1093/nar/gkt1385

Résumé : Ce document présente le bilan des campagnes océanographiques françaises réalisées en 2012. Ce document décrit en détail le rôle du SISMER en matière d’archivage de l’information campagne et des données océanographiques. Il présente une vision globale des navires composant la flotte océanographique française et de leur utilisation et permet un accès dynamique à l’information des campagnes par l’intermédiaire du portail Web Nautilus : http://www.ifremer.fr/sismer/index_FR.htm. Ce bilan a été réalisé par l’IFREMER, et notamment par le SISMER qui a la responsabilité de gérer l’information campagne et les résumés des campagnes. La version électronique de ce document se trouve à l’adresse suivante : http://www.ifremer.fr/sismer/FR/doc_FR.htm. Elle permet un accès direct aux descriptifs de campagne par l’intermédiaire de liens hypertextes. Les différents bilans des campagnes océanographiques françaises sont également disponibles sur le site Archimer, archive institutionnelle de l’ IFREMER, à l’adresse suivante : http://archimer.ifremer.fr/.

Droits : 2013 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00149/26002/24102.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00149/26002/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
Pollen records, marine faunal associations and stable isotope compositions of sediments from Rhodes, Greece, have been determined to track environmental changes in the eastern Mediterranean during the Early and Middle Pleistocene. A detailed chronostratigraphic curve, based on magnetostratigraphic data, was obtained by correlating pollen spectra with the Mediterranean oxygen isotopic curve of Ocean Drilling Program Site 975. Five sedimentary sequences that correspond to marine oxygen isotope stage (MIS) 31–27 and to MIS 20–17 have been investigated in the confined Tsampika microbasin. High-amplitude Pinus variations confirm glacio-eustatic changes deduced from changes in marine faunal associations and sedimentary depositional environments. Reflecting climatic cycles identified in the marine carbonate oxygen isotope record, eight vegetation successions (characterized by the dominance first of mesothermic elements, then of mid- and high-altitude elements with Pinus, and ending with maxima in herb and steppe elements) have been documented. Most of them were probably driven by changes in insolation occurring in high northern latitudes (obliquity impact) during the late Early Pleistocene and early Middle Pleistocene.
Journal of the Geological Society, London

hal-00470360
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00470360