Résumé : Les mattes de procaryotes constituent une niche écologique diversifiée. peu étudié!<..en mangrove et jamais décrjte dans les Antilles. L'objectif de cette thèse est de décrire les procaryotes filamenteux reposant sur le sédiment marin et de caractériser les interactions entre la matte, milieu et entre les différents micro-organismes. Nous avons d'abord caractérisé les micro-organismes majoritaires de la matte par le séquençage de l'ADNr 16S et des hybridations moléculaires (FISH). Il a ainsi été possible de décrire deux nouvelles espèces de Beggiatoaceae dont la structure a été étudiée par microscopie électronique. De plus, afin de caractériser l'environnement chimique de ces bactéries, des capteurs potentiométriques ont été utilisés. Ils ont permis de démontrer que les Beggiaotaceae oxydaient les sulfures en prélevant l'oxygène du milieu, tandis que des analyses de microscopie couplées à de l'EDX ont mis en évidence des réserves de soufre intracellulaires dans ces bactéries. Le séquençage de l'ADNr 16S des cyanobactéries filamenteuses a mis en évidence quatre nouvelles espèces de l'ord~e des Oscillatoriales. Deux d'entre elles, du genre Planktothricoides ont révélé une toxicité positive sur les Artemia sp:, les deux autres ont été identifiées comme proches d'Oscillatoria spongeliae, une espèce symbiotique d'éponge, bien que les coupes uItrafines d'une de ces souches aient montré une morphologie interne proche des Tychonema. L'analyse des données a permis d'étoffer les connaissances sur les communautés microbiennes de mangrove et constitue une base intéressante de travail sur la contribution des micro-organismes au fonctionnement de l'écosystème mangrove dans son ensemble
Procaryotic mats are ecological niches, occuring in many ecosystems. Those structures are little studied in marine mangrove sediment and have never been described in West Indies. The purpose ofthis thesis is to characterize the interactions between the mat and the environment, and between the different filamentous micro-organisms living into the mat. In a first place, we characterized the mainly micro-organisrns of the mat by sequencing 16S rDNA. We confirmed these sequences by molecular hybridization (FISH) with specific probes designed from sequences obtained. Thus, it was possible to describe two new Beggiatoaceae strains, whose structure has been studied by electronic microscopy. Furthemore, we used potentiometric captors in situ and in laboratory, by creating a mesocosm, in order to define the chemical environment where involved these bacteria. These experiences proved that the Beggiatoaceae of the mat oxidized the sulfur taking the oxygen from the medium, while the microscopic analysis coupled with EDX showed intracellular sulfur granules into the bacteria. The study of the filamentous cyanobacteria of the mat highlighted four new cyanobacteria strains, all studied by electronic rmcroscopy. Two of them belongs to Planktothrlcoides genus and showed positive toxicity on Artemia salina. The others species are close to Oscillatorla spongeliae, a sponge symbiont, nevertheless, one ofthem showed an intemal morphology close to Tychonema. The analysis of the different results adduces sorne knowledge about mangrove microbial communities. Furthermore, this study can be used as an interesting base to study the micro-organisms contribution in functioning mangrove ecosystem

http://www.theses.fr/2013AGUY0614/document

Éditeur(s) : ISTPM
Résumé : This paper is a part of a study concerned with shellfish culture in France. Before presenting improvements in technique, the author gives fundamentals of the biology of oyster and mussels taxonomy and anatomy, respiration, feeding, reproduction, growth, predators and diseases.
SOMMAIRE ------------------ L'HUITRE ------------------ INTRODUCTION CHAPITRE I. TAXONOIVIIE ET ANATOMIE DES HUITRES 1. Taxonomie des huîtres vivant dans ie monde Introduction et rappel historique Les genres (Pycnodonta, Crassostrea, Ostrea) Les principales espèces et leur répartition dans le monde 2. Anatomie de l'huître La coquille Le corps BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE II - LE TRANSPORT DE L'EAU ET LA RESPIRATION 1. Le transport de l'eau . Mécanisme Méthodes de mesure du courant de transnort Quantités d'eau transportées 2. La respiration 3. L'anaérobiose . BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE III. ALIMENTATION ET VERDISSEMENT DES COQUILLAGES 1. Alimentation des coquillages Anatomic des « coquillages » et leur alimentation 1. La collecte des particules alimentaires 2. L'appareil digestif: et la digestion Besoins alimentaires 1. Besoins quantitatifs 2. Nature des aliments. Besoins qualitatifs Conclusion générale 2. Le verdissement Le verdissement. Biologie de Navicula ostrearia La navicule des huîtres, agent du verdissement Le verdissement dans les claires L'écologie des claires en rapport avec la définition du verdissement Données récentes sur la genèse du verdisîsement La navicule bleue de l'huître : ultrastructure du frustule, cytologie, développement . . Derniers résultats sur les conditions d'apparition et de maintien du verdissement en cultures in vitro et en claires Conclusion BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE IV. - LA REPRODUCTION Généralités Anatomie des organes de reproduction La sexualité des huîtres La ponte Incubation et émission des larves Fécondité Rythmes sexuels, influence du milieu Les rythmes Périodicité et durée des émissions de gamètes Influence du milieu OEufs et larves Influence de l'environnement sur la vie larvaire Métamorphose et fixation BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE V. LES ENNEMIS DE L'HUITRE ET DE L'OSTREICULTURE Les prédateurs Le ver plat, Stylochus sp Les bigorneaux perceurs Autres gastéropodes prédateurs Les pieuvres Les crustacés Les échinodevmes Les poissons Les oiseaux Les compétiteurs Animaux Végétaux Le chambrage BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE VI. - MALADIES ET MORTALITES 1. Maladies parasitaires Parasites divers Grégarines Trématodes Cestodes Copépodes Maladies à caractère endémique ou épidémique Les viroses Les champignons La maladie des branchies Les flagellés ; Hexamita sp Les haplosporidies La maladie de la glande digestive de l'huître plate et son agent, Marteilia refringens La maladie de Malpèque 2. Mortalités d'origines diverses Variations excessives de la température Variations excessives de la salinité Eutrophisation Mortalités du Belon Mortalité massive de la baie de Matsushima BIBLIOGRAPHIE ------------------ LA MOULE ------------------ TaxonoiTiie La coquille Le corps Alimentation. Croissance. Engraissement La filtration Mécanisme . . . . Action de la température, de la salinité et de l'oxygène dissous Durée journalière Vitesse de filtration Les éléments nutritifs La digestion La croissance L'engraissement La reproduction Glande génitale et sexe Evolution de la gonade Description des phénomènes Facteurs influençant l'évolution de la gonade Emission des produits génitaux Description du phénomène Facteurs influençant l'émission des produits génitaux Vie larvaire Développement de la larve, sa métamorphose Taille des larves Comportement des larves Action de différents facteurs sur la vie des larves Fixation Résumé Les ennemis Prédateurs Compétiteurs Parasites Causes diverses de mortalité BIBLIOGRAPHIE
Revue des Travaux de l'Institut des Pêches Maritimes (0035-2276) (ISTPM), 1976-06 , Vol. 40 , N. 2 , P. 149-346

Droits : Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/1976/publication-1796.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1796/

Éditeur(s) : HAL CCSD Ecole nationale du génie rural
Résumé :  
absent
ISSN: 0035-2829

hal-01032081
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032081

Éditeur(s) : Université des Sciences et Techniques du Languedoc, Montpellier
Résumé : On étudie les parasitoses à Marteilia refringens et à Haplosporidium armoricanum de l’huître plate européenne Ostrea edulis. L’étude de M. refringens précise certains aspects de la biologie de l’agent infectieux. Elle montre que les modalités du cycle de développement du parasite et l‘ultrastructure des stades les plus évolués de la sporogenèse peuvent être modifiées selon les conditions hydrobiologiques du milieu dans lequel est cultivé l’hôte. Elle établi que l’action du parasite conduit à la destruction des épithéliums digestifs de l’huître et s’exerce en interférant avec le métabolisme protéique d’O. edulis. Elle précise l‘ultrastructure des cellules impliquées dans des proliférations hémocytaires atypiques associées à la parasitose et établit la nature néoplasique du phénomène. L’étiologie de l’hémocytose n’est toutefois pas déterminée. Enfin elle met en évidence un cas d‘hyperparasitisme de M. refringens par une Microsporidie. L’étude ultrastructurale de la sporogenèse et des effets pathogènes du Protozoaire vis à vis de l’hôte nous conduit à identifier l’hyperparasite comme Nosema ormieresi et montre que certains stade de M. refringens peuvent être fortement altérés par l’infestation microsporidienne. L’étude d’une Haplosporidie observée chez O. edulis du bassin d’Arcachon (France) nous amène à comparer la sporagenèse du parasite avec celle d’autres Haplosporidies d’invertébrés marins. Les caractéristiques de la spore nous incitent à inclure le parasite dans le genre Haplosporidium et le rapprochement du Protozoaire avec Minchinia armoricana conduit à l’identifier comme Haplosporidium armoricanum. L’étude de la pathogenèse des infections à M. refringens et à H. armoricanum permet de préciser les relations entre les parasites étudiés et leur hôte commun l’huître plate et les interactions hôte-parasite-milieu pouvant intervenir dans le caractère des deux maladies.

Droits : The Author, Univ. Montpellier, ISTPM
http://archimer.ifremer.fr/doc/00083/19411/17022.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00083/19411/

Résumé : L'objectif de cette thèse est de s'intéresser à la chimie des substances naturelles (extraction et caractérisation des molécules issues des forêts de Guyane) et d'étudier des extraits ou familles de molécules naturelles ayant des propriétés inhibitrices de la corrosion du zinc. Dans la première partie du document, un screening de plantes a été effectué. Celles dont les extraits ont présenté les propriétés inhibitrices les plus intéressantes - la Mansoa alliaceae et la Bagassa guianensis -ont été sélectionnées parmi les Il plantes étudiées. Dans la seconde partie du document, différentes techniques électrochimiques ont été utilisées- la spectroscopie d'impédance électrochimique (SEI) et la polarisationlinéaire (PL)- afin de calculer les taux d'inhibition et de remonter aux mécanismes réactionnels caractérisant l'inhibition. Ainsi, le rôle des paramètres tels que le mode d'extraction et le milieu corrosif (ASTM et NaCI3%) sur le taux d'inhibition ont été étudiés. Ces travaux ont débouché sur de nombreux résultats expérimentaux nouveaux et notamment un modèle dynamique prenant en compte l'efficacité de l'inhibiteur en fonction de sa concentration dans le milieu
The objective of this thesis is to focus on the chemistry of na tura! substances (extraction and characterization of molecules from forests of French Guiana) and to study extracts or families ofnatural molecules with inhibiting properties of zinc corrosion. In the first part of the document, a screening of plants was made. Those whose extracts have shown the most interesting potential inhibitors - the Mansoa alliaceae and Bagassa guianensis - were selected among the Il plants studied. In the second part of the paper, different electrochemical techniques were used - the electrochemical impedance spectroscopy (EIS) and linear polarization (LP) - to calculate the inhibition rate and to understand the reaction mechanisms characterizing the inhibition. Thus, the role of parameters such as the method of extraction and the corrosive medium (ASTM and NaCI3%) on the inhibition rate were studied. This work bas led to many new experimental results including a dynamic mode! taking into account the effectiveness of the inhibitor according to its concentration in the medium

http://www.theses.fr/2014AGUY0745/document