Éditeur(s) : GFP : Groupe Français des Pesticides
Extrait de : "Protection des cultures et santé environnementale : héritages et conceptions nouvelles" : congrès, le 26 mai 2014. Université des Antilles et de la Guyane
Description : Les mangroves, forêts littorales des zones intertropicales, sont étroitement liées aux activités humaines et sont donc soumises à des pollutions diverses. De nombreuses villes aux activités portuaires et industrielles sont en effet établies à proximité immédiate ou sur des sols gagnés sur elles. En outre, comme les mangroves se développent préférentiellement au sein et en aval des estuaires dans des secteurs d'accumulation sédimentaire elles sont en contact direct, après leur transport fluvial, avec la diversité des pesticides liée aux activités agricoles pratiquées en amont des bassins versants.
Siècle(s) traité(s) : 21
Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
Permalien : http://www.manioc.org/fichiers/V14182
V14182

Éditeur(s) : DIREN : Direction Régionale de l'Environnement Université des Antilles et de la Guyane DIREN : Direction Régionale de l'Environnement Université des Antilles et de la Guyane
Extrait de : Conférence Internationale "Biodiversité terrestre des Petites Antilles", 8-10 novembre 2010. Université des Antilles et de la Guyane, Faculté des Lettres et sciences humaines, campus de Schoelcher, Martinique.

Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
Provenance : Université des Antilles et de la Guyane. Service commun de la documentation
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Éditeur(s) : DIREN : Direction Régionale de l'Environnement Université des Antilles et de la Guyane DIREN : Direction Régionale de l'Environnement Université des Antilles et de la Guyane

Droits : Document protégé par le droit d'auteur
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Éditeur(s) : DIREN : Direction Régionale de l'Environnement Université des Antilles et de la Guyane DIREN : Direction Régionale de l'Environnement Université des Antilles et de la Guyane
Extrait de : Conférence Internationale "Biodiversité terrestre des Petites Antilles", 8-10 novembre 2010. Université des Antilles et de la Guyane, Faculté des Lettres et sciences humaines, campus de Schoelcher, Martinique.
Siècle(s) traité(s) : 21
Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
Provenance : Université des Antilles et de la Guyane. Service commun de la documentation
Permalien : http://www.manioc.org/fichiers/HASH01f11f9fb97b5909a6e5e775
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Éditeur(s) : Université des Antilles et de la Guyane IRD : Institut de Recherche pour le Développement
Extrait de : "Projet CARIBSAT, système caribéen d'information environnementale" : conférence, le 21 mars 2013. Université des Antilles et de la Guyane
Description : Membre d'une équipe de terrain alimentant l'interprétation des photographies satellitaires, l'intervenant présente les résultats de cette étude : caractérisation des sols et de la matière organique, impacts mécaniques et hydro-chimiques.
Siècle(s) traité(s) : 21
Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
Permalien : http://www.manioc.org/fichiers/V13094
V13094

Éditeur(s) : DIREN : Direction Régionale de l'Environnement Université des Antilles et de la Guyane DIREN : Direction Régionale de l'Environnement Université des Antilles et de la Guyane

Droits : Document protégé par le droit d'auteur
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Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley/Blackwell
Résumé : International audience
Photosynthetic eukaryotes have a critical role as the main producers in most ecosystems of the biosphere. The ongoing environmental metabarcoding revolution opens the perspective for holistic ecosystems biological studies of these organisms, in particular the unicellular microalgae that often lack distinctive morphological characters and have complex life cycles. To interpret environmental sequences, metabarcoding necessarily relies on taxonomically curated databases containing reference sequences of the targeted gene (or barcode) from identified organisms. To date, no such reference framework exists for photosynthetic eukaryotes. In this study, we built the PhytoREF database that contains 6490 plastidial 16S rDNA reference sequences that originate from a large diversity of eukaryotes representing all known major photosynthetic lineages. We compiled 3333 amplicon sequences available from public databases and 879 sequences extracted from plastidial genomes, and generated 411 novel sequences from cultured marine microalgal strains belonging to different eukaryotic lineages. A total of 1867 environmental Sanger 16S rDNA sequences were also included in the database. Stringent quality filtering and a phylogeny-based taxonomic classification were applied for each 16S rDNA sequence. The database mainly focuses on marine microalgae, but sequences from land plants (representing half of the PhytoREF sequences) and freshwater taxa were also included to broaden the applicability of PhytoREF to different aquatic and terrestrial habitats. PhytoREF, accessible via a web interface (http://phytoref.fr), is a new resource in molecular ecology to foster the discovery, assessment and monitoring of the diversity of photosynthetic eukaryotes using high-throughput sequencing.
ISSN: 1755-098X

hal-01149047
http://hal.upmc.fr/hal-01149047
http://hal.upmc.fr/hal-01149047/document
http://hal.upmc.fr/hal-01149047/file/Decelle_2015_PhytoREF.pdf
DOI : 10.1111/1755-0998.12401