Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Diffusion du document : INRA Antilles-Guyane, UMR ECOFOG, 97387 Kourou, Guyane (France)
il s'agit d'un type de produit dont les métadonnées ne correspondent pas aux métadonnées attendues dans les autres types de produit : DISSERTATION
Le SPAD-502 est un chlorophylle mètre portatif mesurant la transmittance de la feuille. Contrairement aux méthodes traditionnelles, cet outil est non destructif et les données sont obtenues de façon quasi instantanée. Il est cependant nécessaire d'établir au préalable des courbes de corrélation entre le taux de chlorophylle et la valeur donnée par le SPAD, et ce pour chaque espèce. L'objectif de cette étude était d'établir ces courbes étalons pour 14 espèces de forêt tropicale humide. Il a été montré que la corrélation entre ces deux variables est forte et que le SPAD-502 constitue un bon outil pour réaliser des mesures de taux de chlorophylle sur une grande échelle. L'étude a mis en évidence l'existence de certains problèmes liés à l'utilisation du SPAD. En particulier, chaque courbe étalon n’est a priori valable que pour une seule espèce. L’étude a toutefois démontré que certains regroupements sont possibles, permettant de n'utiliser qu’une courbe pour plusieurs espèces différentes. Les courbes établies ont d’ores et déjà été utilisées dans le cadre d'une étude concernant l'azote alloué par la plante aux différentes étapes de la photosynthèse. Ces travaux préliminaires ont mis en évidence la variabilité inter spécifique des allocations d’azote, suggérant une différence de stratégie entre les espèces.
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189250

hal-01189250
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189250
PRODINRA : 19531

Résumé : Les variétés modernes de canne à sucre sont d'origine bispécifique et possèdent une structure génétique complexe, aneuploïde et hautement polyploïde rendant difficile les études de résistance génétique. La feuille jaune de la canne a sucre est une maladie dont l'agent causal est le sugarcane yellow leaf virus (scylv). Ce virus a une large diversité. Seuls trois génotypes viraux, différenciables par rtpcr, ont été trouves en Guadeloupe. Les objectifs de l'étude sont d'évaluer: l/la possibilité de marquer la résistance de la plante au scylv grâce a une étude d'association pan-génomique 2/l'impact de la diversité de l'agent pathogène sur la résistance de la canne a sucre au scylv. Les études d'association ont été menées avec plus de 4000 marqueurs aflp et d'art sur quatre types de données phénotypiques (intensité et densité virale dans les feuilles et les tiges). Les phénotypes ont été mesures sur 189 variétés de cannes à sucre dans deux essais successifs dans un dispositif en trois blocs randomises. De ces variétés, 40 ont été sélectionnées et ont permis d'obtenir 10 croisements biparentaux. Les descendances obtenues ont été suivies sur deux essais. L'incidence et la diversité du scylv ont été évaluées pour les 40 variétés et les descendances. L'héritabilité au sens strict de la résistance aux scylv a été déterminée. Six marqueurs de résistance au scylv ont été identifies ainsi que deux gènes ayant potentiellement un rôle dans la résistance au virus. L'étude montre également que la résistance de la plante est variable en fonction du génotype du scylv et que cette résistance est en partie transmise aux descendances. Créer des variétés résistantes au scylv est donc possible.
Modern varieties of sugarcane have a bispecific origin and a complex genetic structure, aneuploid and highly polyploid, maklng genetic resistance study uneasy to perform. Yellow leaf of sugarcane is a viral disease whose causal agent is the sugarcane yellow leaf virus (scylv). This virus has a wide range of diversity. Only three viral genotypes, distinguishable by rt-pcr, were found in guadeloupe. The objectives of this srudy are to assess: l/the possibility to find markers associated with plant resistance to scylv through a genome wide association study 2 1 the impact of the pathogen diversity on the resistance of sugarcane to scylv. Association studies have been conducted with more than 4000 aflp and dart markers on four types of phenotypic data (virus intensity and density in leaves and canes). Phenotypes were measured on 189 varieties of sugarcane in two successive trials in a three randomized complete block design. From these varieties, 40 were selected and allowed to obtain 10 biparental crosses. The offspring were followed during two trials. The incidence and the diversity of scylv were evaluated in the 40 varieties and the offspring. The narrow sense heritability of the resistance to the scylvs was determined. Six markers of the resistance to the scylv and two genes, with potential contribution in virus resistance, have been identified. The study also shows that the resistance of the plant is variable depending on the scylv genotype and that this resistance is partly transmitted to the offspring. Breeding for scylv resistance is practicable.

http://www.theses.fr/2012AGUY0554/document