Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : National audience
La sédimentation en baie du Mont Saint Michel se caractérise par la mixité des apports, presque exclusivement d’origine marine, carbonatés et silicoclastiques. La question du comblement de cet environnement hypertidal et de l’évolution de son trait de côte, représenté dans le fond de baie (sud et ouest) par des barrières coquillières, se pose à l’horizon des décennies à venir. Comment ce comblement va t-il être affecté par le changement climatique global marqué entre autres par l’accélération de la remontée du niveau marin et par des modifications potentielles de faunes (habitats, espèces..etc) auxquelles peut également contribuer le développement d’activités humaines comme la conchyliculture ?Les travaux présentés ici (projet Sédibaie, DDTM35 / Région Basse Normandie) ont pour objectif de quantifier le taux de sédimentation dans le fond de baie du Mont-Saint-Michel depuis les derniers siècles, et cela afin d’appréhender les tendances à venir. Pour ce faire des carottages courts (moy. 75 cm) ont été réalisés selon 5 radiales côte-large réparties de St Benoit des Ondes (près de Cancale) à La Chapelle Ste Anne (à l’Ouest du Mt St Michel). Les carottes ont fait l’objet d’analyses variées (faciès, granulométrie, teneur en carbonate, XRF, Scopix, datations 14C...). Un échantillonnage de surface a également été réalisé afin de caractériser les assemblages faunistiques actuels (malacofaune, microfaune, vivant, mort). Parallèlement, des travaux spécifiques sont menés sur les barrières coquillières (stratigraphie THR, évolution contenu faunistique, processus d’édification..). Les enregistrements étudiés sur les carottes couvrent la sédimentation du dernier millénaire au moins. Ils mettent en évidence le passage entre un environnement de dépôt dominé par l’action des marées, à un environnement de plus haute énergie, sans doute dominé par l’action des houles (tempêtes ?). Ce changement majeur, visible sur quasiment toutes les carottes à une profondeur variant entre 30 et 50 cm, s’opère peu après 1000 ans cal. BP. (à confirmer). Il est attribué à un changement climatique d’échelle au moins régionale (Atlantique nord). La complexite de l’enregistrement sédimentaire au-dessus du passage tidal/houle met en évidence une variabilité de faciès sédimentaires à haute fréquence, probablement liée à une fluctuation du climat de houle (NAO, Petit Age Glaciaire), ainsi que dans la partie supérieure à des changements d’apports bioclastiques relatifs au développement des installations conchylicoles.
25e Réunion des Sciences de la Terre
Caen, France

hal-01413154
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01413154

Résumé : L'importance des forêts tropicales dans le cycle du carbone à l'échelle planétaire est majeure, tant en terme de stock qu’en terme de flux de CO2. Plusieurs études mettent en évidence des changements au sein des forêts tropicales au cours des 20 dernières années, notamment des changements de la dynamique forestière et une augmentation de la biomasse aérienne. Les déterminants de ces variations sont aujourd’hui discutés et nous proposons ici d’apporter une contribution à ce débat. Les données utilisées dans ce travail proviennent du dispositif de suivi forestier à long terme de Paracou, Guyane Française, mis en place en 1984 et qui recouvre plus de 120 ha de forêt tropicale humide. Les données météorologiques proviennent de la tour à flux du dispositif, Guyaflux. Les mesures de diamètre proviennent de la base Guyafor pour les données annuelles et bisannuelles, et des mesures de 260 arbres à proximité de la tour à flux pour les mesures diamétriques intra-annuelles.Cette thèse se divise en deux grandes parties. La première concerne l’analyse de la biomasse du dispositif de suivi forestier de Paracou en Guyane et l’implication des changements de structure de cette forêt sur le bilan de carbone. Cette partie est constituée de deux points. (i) Quelles échelles temporelles et spatiales sont pertinentes pour analyser les composantes de structure (biomasse, aire basale et nombre de tiges) et de dynamique (croissance, recrutement et mortalité) des forêts tropicales afin de minimiser les effets d’échantillonnage ? Nous avons établi une méthodologie permettant de relier les intervalles de temps et la surface de mesure aux coefficients de variation de chacune des variables de structure et de dynamique de la forêt. (ii) Quels processus démographiques sont prépondérants dans l’explication des variations de biomasse et comment se redistribue la biomasse accumulée dans le système ? L’augmentation de la biomasse observée sur le dispositif de Paracou serait liée à la rareté des évènements de mortalité des gros arbres qui portent une part très importante de la biomasse.La deuxième partie de la thèse concerne l’analyse de l’effet du climat à moyen terme, inter et intra-annuel, et les effets directs du climat dans les changements de dynamique de la forêt. Cette partie se divise en 3 points. (i) Comment quantifier le stress hydrique en forêt tropicale humide ? Nous avons réalisé un modèle journalier de réserve en eau du sol pour les arbres en forêt tropicale. (ii) Quelles variables sont explicatives de la croissance des arbres en forêt guyanaise ? Nous avons montré que l’eau dans le sol est le facteur le plus explicatif du déterminisme climatique parmi un panel de variables climatiques. (iii) Quels traits fonctionnels sont prédicteurs de la réponse des arbres aux variations climatique ? Nous avons déterminé que des traits spécifiques, densité du bois et la hauteur maximale, ainsi que le diamètre de l'arbre au moment de la mesure, modulent la croissance des arbres en réponse au climat.
At a global scale tropical forest play a major role in term of carbon stock as well as in term of CO2 fluxes. Several studies have highlighted changes in tropical forest functioning during the last 20 years including a faster turnover and an increase of above ground biomass. The drivers of these changes are discussed and throughout this thesis we propose to contribute to this debate. We use the data from the Paracou experimental site in French Guiana established in 1984 on 120 hectares of moist tropical forest. Meteorological data come from the flux tower of the site, Guyaflux. We use annual and bisannual diameter measurements from the Guyafor database, and intra-annual diameter increments from the measurements of 260 trees near the flux tower.This thesis has two main parts. In the first part we present the biomass analysis of the Paracou permanent plots and the impact of structural changes in this forest on the carbon budget. The first part is constituted by two points. (i) Which temporal and spatial scale used to analyze the structure (biomass, basal area and stem density) and dynamics (tree growth, recruitment and mortality)components of tropical forest in order to minimized sample bias ? We establish a simple method to rely measurement interval between census and surface of measurement to the coefficient of variation of forests structure and dynamic components (ii) Which demographic process are involved in the explanation of biomass variation and how the biomass is distributed in the system ? The observed increase of biomass at Paracou could be link to the rarity of big trees mortality events. These big trees represent the larger part of the biomass. In the second part, we present the analysis of intra and inter-annual climate variation effects on forest dynamic changes. This part is divided in two points. (i) How to model drought stress in moist tropical forest ? We built a daily water balance model for tropical trees. (ii) Which climate variables explain the tree growth in guianian forests? We shown that soil water availability is the determinant factor of tree growth among a panel of climate variables. (iii) Which functional traits are involved in the tropical tree growth responses to climate? In this analysis, we determined that wood specific gravity, maximum tree height and tree diameter modulate the tree growth response to climate variations.

http://www.theses.fr/2011AGUY0481/document

Éditeur(s) : HAL CCSD Editions Paralia CFL
Résumé : Les lagunes du Golfe du Lion constituent un patrimoine naturel reconnu ainsi qu'un enjeu essentiel pour les activités économiques locales. Leur évolution morphologique est donc une question importante dans le contexte actuel de changements climatiques et environnementaux. L'analyse de données topo-bathymétriques du système des étangs Palavasiens a permis de mieux cerner son évolution depuis le XVIIIème siècle. Les actions anthropiques et les apports du bassin versant apparaissent comme les facteurs principaux de l'évolution du système. Au cours des 40 dernières années, le système montre une tendance à se combler lentement avec une accumulation moyenne de 1,3 mm/an. Des différences de fonctionnement sur chacun des étangs sont mises en lumière en fonction des forçages naturels et anthropiques locaux. Lagoons of the Gulf of Lion, recognized for their natural heritage, are a key challenge for local economic activities. Their morphological evolution is an important issue in the current context of climate and environmental changes. Analysis of topo-bathymetric data of the Palavasian lakes system has helped to clarify its evolution since the XVIII th century. Human impacts and contributions from the watershed appear to be the main drivers governing the evolutionof the system. Over the past40 years, the system shows a tendency to slowly fill at an accumulation rate of 1.3 mm/year. Differences between lagoons are highlighted according to local natural and anthropogenic forcings.
ISSN: 1760-8716

hal-00854075
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00854075
DOI : 10.5150/revue-paralia.2011.007

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : The effects of climate change on extreme events are difficult to assess because extremes present large variability and consequently, it is difficult to identify significant trends in relation to the lack of instrumental long time series. Here we present a record of these extreme storm events in the French Mediterrannean coast over the past 7000 years based on a long sediment core from lagoonal environment in Gulf of Lions. Using a high resolution multiproxies approach on core associating grain size, faunal to reconstruct Mid to Late Holocene history of backbarrier deposits in relation to landfalling activity. Even if change in lagoon geomorphological setting over the Holocene does not allow to compare storm events in terms of intensity trough time, we have recorded six periods of increase in storm activity at 6200, 5500, 4400, 3200, 1500 yr cal B.P. and over the LIA (450 and 100 yr cal B.P.). These evidences of changes in coastal hydrodynamic, inversely correlated to periods of aridification in Western Mediterranean region, are in phase with those observed over the North Atlantic and correspond to Holocene cooling events. This increase in storm activity during Holocene cold events over Mediterranean region was probably due to thermal gradient increase leading to enhanced lower tropospheric baroclinicity over a large Central Atlantic-European domain. This study demonstrates that temperatures in North Atlantic region influence the severe storm activity and therefore the Mediterranean climate at Holocene timescale.
Les effets du changement climatique sur les événements extrêmes sont difficiles à estimer car ces phénomènes présentent une large variabilité, et par conséquent il est délicat d'identifier des tendances significatives compte tenu de l'absence de longues séries de données instrumentales. Dans cette étude, nous présentons un enregistrement de ces tempêtes extrêmes sur la côte Méditerranéenne française au cours des 7000 dernières années à partir de carottes sédimentaires prélevées dans un système lagunaire du Golfe du Lion. L'utilisation d'une approche multi-traceur à haute résolution avec des analyses granulométriques, faunistiques, géochimiques (XRF), en minéraux argileux associées à des données chronologiques de radiocarbone et de 210Pb, 137Cs ; nous a permis de reconstruire l'histoire, au cours de l'Holocène, des dépôts lagunaires en relation avec l'activité des tempêtes. Bien que les paramètres morphologiques de cet environnement lagunaire aient changé durant l'Holocène, ne permettant pas de comparer ces événements au cours du temps en terme d'intensité, nous enregistrons six périodes d'augmentation de l'activité des tempêtes datées à 6200, 5500, 4400, 3200, 1500 an cal B.P. et durant le Petit Age Glaciaire (de 450 à 100 an cal B.P.). Ces changements de l'activité hydrodynamique côtière, en antiphase avec les périodes d'aridifications en Méditerranée de l'Ouest, sont corrélées avec celles observées dans le bassin Nord Atlantique et correspondent aux événements de refroidissement Holocène. L'augmentation de l'activité des tempêtes dans la cette région de la Méditerranée durant les périodes froides, associée à une diminution des températures au pôle Nord, est probablement liée à l'augmentation du gradient thermique qui, par interaction barocline, favorise les cycles d'évolution des tempêtes dans toute l'Europe et la Méditerranée de l'Ouest. Cette étude démontre ainsi que la température dans la région Nord Atlantique influence l'activité des tempêtes extrêmes et donc du climat Méditerranéen à l'échelle de l'Holocène.
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00437757

tel-00437757
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00437757
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00437757/document
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00437757/file/Sabatier_these.pdf

Résumé : La réalisation des campagnes halieutiques Polka et Guyaviv2 au large des côtes guyanaises à la fin des années 80 a permis d’obtenir les relations biométriques qui ont été utilisées depuis cette date pour tous les calculs des captures (spectres par classe de taille) et des évaluations annuelles du stock de vivaneaux (Lutjanus purpureus) (Etienne Prévost 1989; E. Prévost et Tous 1989; Lampert 2012a) Plus de vingt ans après, nous pouvons nous poser la question de la pertinence de ces relations de nos jours. Des changements dans les paramètres de croissance de L. purpureus ne sont pas à exclure suite aux changements climatiques et à la pression de pêche exercée depuis quelques décennies. Ces changements pouvant alors se traduire par des variations dans les relations Taille-Poids (TP). Ce travail vise à mettre à jour les mesures de taille et du poids des individus échantillonnés lors des débarquements, afin d’établir de nouvelles relations TP, ou confirmer les anciennes. Ce travail se borne aux relations TP de l’espèce Lutjanus purpureus, qui représente à elle seule, plus de 90 % des débarquements de vivaneaux en Guyane. Cette espèce est notamment utilisée pour les calculs du stock annuel du vivaneau du plateau guyanais.

Droits : 2013 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00126/23726/21588.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00126/23726/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Coral reefs are amongst the richest and more emblematic ecosystems of the world. These hotspots of biodiversity provide many services to Human societies, bringing leisure and economic added values. In many areas, especially developing countries, these ecosystems are submitted to both climate change (rise of sea temperature and level, acidification) and human coastal pressures (urbanisation, resources exploitation). In this context, an increasing number of Marine Protected Areas is settled on coral reefs environments in order to ensure their conservation and to mitigate local pressures. Hence, one of MPAs Managers' missions is to bring ecological and social data together to build integrated indicators of effectiveness. In Reunion Island, a MPA called the Marine reserve of La Réunion was settled in 2007 along a densely urbanised and populated fringing reef coast. In order to better evaluate its MPA effectiveness, the manager requires the integration of social stakes to the management plan. A uses monitoring protocol was developed in this purpose using an ultra light aircraft and a camera. Data on 15 different recreational and non-recreational uses were acquired between 2010 and 2013, flying 48 times a year, and entered into a Geographic Information System. A huge resulting database allowed the building of an initial knowledge of the spatio-temporal distribution of uses within the Reserve. It also enabled the analysis of the uses' evolution regarding various factors of variations (amenities, facilities, shark attacks, tourism, etc.). Finally, we assessed the contribution to management efficiency using social indicators (governance, pressure indicators), and to interdisciplinary research in bringing ecologic and uses data together. This thesis brings a brand new information about coastal human activity and spatio-temporal dynamics of direct pressures on reef. This tool, designed to be reproducible and cost-optimized, enables the production of a set of indicators. Its integration to the management plan exclusively depends on the strategic choices of the manager.
Les récifs coralliens figurent parmi les biomes côtiers les plus emblématiques de la planète. Ces points chauds de la biodiversité mondiale sont convoités par les sociétés humaines pour leurs qualités paysagères et leur plus-value économique. Exposés au même titre que de nombreux écosystèmes côtiers aux changements climatiques (élévation de la température, acidification des océans), ils sont de toutes parts soumis à une anthropisation littorale mal maitrisée (urbanisation, surexploitation des ressources). Dans ce contexte, de plus en plus d' Aires Marines Protégées (AMP) s'établissent sur des écosystèmes anthropisés, les amenant à intégrer l'Homme au coeur de la gestion. À La Réunion où l'urbanisation littorale est dense et où le paysage des usages littoraux ne cesse de s’étoffer, une Réserve Naturelle Marine (RNMR) a été établie en 2007 sur un récif frangeant. L’évaluation de l’efficacité de cette AMP par son gestionnaire doit se faire par le biais d'un ensemble d'indicateurs écologiques et socio-économiques. C’est en vue d’apporter des connaissances sur la fréquentation et les usages pratiqués au sein de la RNMR que cette thèse a été initiée. Elaboré sur la base d'un suivi en ULM, un protocole a été reproduit chaque année entre 2010 et 2013 et a permis la constitution d'une base de données spatialisée, dont l'exploitation a produit trois types de résultats: i) une connaissance initiale de la répartition spatio-temporelle des usages au sein de la RNMR; ii) une compréhension de l'évolution des dynamiques spatio-temporelles à la lumière des facteurs de variations identifiés (aménagements, aménités, crise requin, tourisme, etc.), et iii) une contribution à la gestion par le développement d'indicateurs sociaux (gouvernance, pressions), et à la recherche interdisciplinaire par une confrontation des données de fréquentation et des données écologiques du milieu. La réflexion menée dans le cadre de cette thèse apporte un éclairage nouveau sur les usages et la fréquentation des littoraux coralliens à La Réunion, et leur traduction en termes de pression anthropique directe. Pensé pour être reproductible et optimisé en termes de coût, cet outil permet la production d’un ensemble d’indicateurs dont l’intégration au plan de gestion dépend exclusivement des choix stratégiques du gestionnaire.
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01308703

Droits : http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/
tel-01308703
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01308703
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01308703/document
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01308703/file/Th%C3%A8se_Lemahieu.pdf

Résumé : This synthesis report assesses the current state of the marine hydrobiological knowledge acquired in the surroundings of the Flamanville electronuclear site (north-west of Cotentin), in the framework of the various project and monitoring programs in the pelagic, benthic and halieutic domains carried out on this site since 1976. Each domain is divided, as much as necessary, into different study areas such as hydrobiology, phytoplankton, microbiology, crustacean larvae or macrophyte algae. For each area, a series of parameters, considered as representative of the evolution of this area, is studied. In this way, for the hydrological area, the sea water temperature and salinity, the mineral nutriment concentrations, the holagen compounds and the boron are monitored. The evolution of each of these parameters enabled us to draw the following conclusions. The vegetal and animal species' physiology is conditioned by climate changes. The study of the pluviometry and air temperature parameters shows that the 1986/2005 period is slightly less humid and warmer than the 1949/2005 period. This reflects also on the sea water temperature whose average values increase on a regular basis.
Ce rapport de synthèse fait le point sur l'état des connaissances hydrobiologiques marines acquises aux abords du site électronucléaire de Flamanville (nord-ouest Cotentin), dans le cadre des différents programmes de projet et de surveillance des domaines pélagique, benthique et halieutique, menés sur ce site depuis 1976. Chaque domaine est divisé, autant que nécessaire, en compartiments d'étude, tels que l'hydrologie, le phytoplancton, la microbiologie, les larves de crustacés ou les algues macrophytes. Pour chaque compartiment, une série de paramètres, jugés représentatifs de l'évolution de ce compartiment, est étudié. Ainsi, pour le compartiment hydrologique, sont suivis la température et la salinité de l'eau de mer, les concentrations en nutriments minéraux, les composés halogénés et le bore. Les évolutions de ces différents paramètres ont permis d'élaborer les conclusions suivantes. La physiologie des espèces animales et végétales est conditionnée par les changements climatiques. L'examen des paramètres pluviométrie et température de l'air montre que la période 1986/2005 est sensiblement plus humide et plus chaude que la période 1949/2005. Cela se répercute également sur la température de l'eau de mer dont les valeurs moyennes croissent régulièrement.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/rapport-6405.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6405/

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : Region Gdansk Pomerania is an excellent geographic area for the development of yachting. Gdansk Bay and the Vistula Lagoon is characterized by very good weather conditions. Numerous advantages of anthropogenic and tourist resorts strengthen the attractiveness of the coast. The marina recently ended in Gdansk, Sopot and Gdynia create very good conditions for the development of yachting. The combination of the Gulf of Gdansk by the river network and channels Żuławy of the Great Masurian Lakes promotes the development of yachting in both the Gulf of Gdansk and Masurian Lake region. However, new infrastructure investments, realized with funding from the EU, like ‘Loop Żuławska’ and the new marina, leading to an increase in tourist traffic and threats to existing reserves and landscape parks. Another problem is the lack of regulation of the right on the crossing of the Strait of Baltiysk, leading from the Vistula Lagoon on the Baltic Sea, which is located in the territorial waters of Russia. The concentration of investments in the region of Żuławy contrasts with too little spending on development of tourist infrastructure in the Hel Peninsula. There are large disparities in tourist traffic. Tourism in Hel Peninsula significantly exceeded the absorption of tourism in the region and leads to the degradation of the local environment. In addition, the seasonality of tourism on the coast favours the trend of maximizing profit tourism enterprises. New, designed ditch the Vistula Spit, which connects directly to the Vistula Lagoon from the Baltic Sea, bypassing the Russian territorial waters, can lead to serious ecological changes.
La région de Gdansk en Poméranie est une excellente zone géographique pour le développement du yachting. La baie de Gdansk et la lagune de la Vistule se caractérisent par de très bonnes conditions climatiques. Divers avantages anthropiques et stations touristiques renforcent l’attractivité de la côte.Les marinas nouvellement terminées à Gdansk, Sopot et Gdynia, créent de très bonnes conditions pour le développement du yachting. La combinaison du golfe de Gdansk, du réseau fluvial et des canaux Żuławy qui relient les Grands Lacs de Mazuries, favorise le développement du yachting dans le golfe de Gdansk et la région des lacs. Les nouveaux investissements dans les infrastructures, réalisés grâce à des financements de l’Union européenne, tels "Loop Żuławska" et la nouvelle marina, conduisent à une augmentation de l’activité touristique qui menace les réserves existantes et les parcs naturels. L’autre problème est l’absence de réglementation relative au droit de passage dans le détroit de Baltiysk, menant de la lagune de la Vistule, qui est située dans les eaux territoriales de la Russie. Entre la concentration des investissements dans la région de Żuławy et les faibles dépenses pour le développement de l’infrastructure touristique dans la péninsule d’Hel, il existe de grandes disparités dans le trafic touristique. Les infrastructures touristiques de la péninsule d’Hel ne sont pas en mesure d’absorber les flux touristiques de la région et la situation conduit inéluctablement à la dégradation de l’environnement. La situation de la lagune de la Vistule, dont les eaux sont partagées entre la Russie et la Pologne, peut entraîner de graves changements écologiques.
Gdańsk
Pologne
Poméranie
Hel
Zulawy

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.10762
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/10762

Résumé : La distribution actuelle des espèces d’arbres des forêts tropicales humides amazoniennes est le résultat de processus dynamiques sur lesquels les perturbations passées, d’origine climatique ou anthropique, peuvent avoir jouées un rôle majeur. Des outils génétiques actuels associés à des méthodes d’analyses puissantes permettent d’inférer et de dater l’empreinte génomique des évènements démographiques subits par les populations naturelles. Le but de cette thèse est de contribuer à une vision d’ensemble de l’évolution démographique de la forêt tropicale humide du plateau des Guyanes pendant le Quaternaire. J’ai d’abord étudié les propriétés des microsatellites (répétitions simple de séquences, SSR) et les limites de leurs applications en tant que marqueurs moléculaires en phylogéographie. Plusieurs allèles SSR contenu dans diverses populations de trois genres d’arbres différents ont été séquencés et le polymorphisme, porté par chaque partie des fragments ADN contenant des SSR, a été étudié. J’ai observé que la quantité de variation génétique était aussi importante dans les régions encadrant le microsatellite que dans le SSR lui-même. Ces régions ont contribué significativement à l’information phylogénétique et ont parfois été la principale source de différenciation entre les individus et les populations. Cette expérience m’a permis de choisir la meilleure stratégie à adopter pour traiter les données de variation génétique des SSR dans des modèles démographiques. J’ai ensuite utilisé ces marqueurs SSR et des méthodes ABC pour étudier l’impact local des occupations humaines précolombiennes sur les forêts en Guyane française. Les changements démographiques subis par des populations de quatre espèces d’arbres ont été comparés entre cinq sites occupés et quatre sites non perturbés. Les perturbations naturelles et induites par l’homme ont contribué à la mise en place de la diversité observée actuellement, comme le suggère des signatures d’effet fondateur détectées sur les sites perturbés ou non. Néanmoins, la taille des populations fondatrices semble être proportionnelle à l’impact humain estimé, indiquant que les perturbations anthropique ont induit un remplacement des populations plus important que les processus écologiques naturels. Pour terminer, j’ai mené une étude de démographie comparative d’espèces d’arbres tropicaux à l’échelle régionale de la Guyane française. Cinq scénarios démographiques ont été testés pour neuf populations de huit espèces en utilisant des microsatellites nucléaires et des séquences chloroplastiques. Les changements démographiques les plus récents détectés convergent vers une signature générale d’expansion de la forêt humide depuis probablement la dernière glaciation. Cela peut suggérer, soit que la composition des forêts du plateau des Guyanes était différente, ou que le couvert forestier était moins étendu. Ce résultat constitue le premier indice de changement passé, probablement d’origine climatique, subi par les communautés forestières du plateau des Guyanes ; qui n’avait jusque-là pas pu être testé avec des méthodes standards en raison d’un manque de fossiles. En conclusion, j’ai recueilli des preuves génétiques que les perturbations, à différents échelles de temps, ont marqué la structure et la composition génétique des forêts du plateau des Guyanes. L’application de ces méthodes à d’autres régions Néotropicales pourrait contribuer, à l’avenir, à reconstruire l’histoire écologique de la forêt amazonienne de façon détaillée.
The current tree species distribution in Amazonian tropical rainforests is the outcome of dynamic processes in which past perturbations, climatic or anthropogenic, may have played a major role. Currently available genetic tools associated with powerful analytical methods allow inferring and dating the genomic imprint of demographic events undergone by natural populations. The aim of my thesis is to contribute to an overview of the demographic evolution of the tropical rainforest in the Guiana shield during the Quaternary. I have first studied the properties of microsatellites or Simple sequence repeat (SSR) and the limits in their applications as molecular markers in phylogeography. Several SSR alleles in multiple populations of three divergent tree genera have been sequenced and the sources of polymorphisms, carried by each portion of SSR-containing DNA amplicons, have been broken apart. I have observed that the amount of variation was as large in flanking regions as in the SSR itself. The former contributed significantly to the phylogenetic information and sometimes was the main source of differentiation among individuals and populations. This experiment allowed me to choose the best strategy to treat SSR variation in demographic modeling. I have subsequently used SSR markers and ABC methods to study the impact of pre-Columbian human settlements at the local level on rainforests in French Guiana. Demographic changes undergone by populations of four tree species were compared between five settled and four undisturbed sites. Both natural turnover and human-induced disturbances appeared as shaping currently observed genetic diversity, with signatures of founder effect both at disturbed and undisturbed sites. Nevertheless, the size of founding populations appeared to be proportional to the estimated human impact, suggesting that human-made disturbance caused deeper population turnover than background ecological processes. Finally, I have conducted a comparative demography study of tropical tree species at the regional level across French Guiana. Five demographic scenarios have been tested for nine populations from eight species using both nuclear microsatellites and chloroplastic sequences. The most recent demographic signals detected converge on a global signature of expansion of the rainforest since probably the last glaciation. This finding can suggest either that the composition of the Guiana shield rainforests was different, or that its global extent was smaller, during earlier epochs of the Pleistocene than today. This result is the first firm indication of changes undergone by the forest communities of the Guiana shield in the distant climatic past – something which could not be tested with standard methods due to almost complete lack of fossil evidence. In conclusion, I have gathered genetic evidence that disturbances, both in historical and geological times, have marked the structure and composition of forests in the Guiana shield.The extensive application of these methods to other regions of the Neotropics maycontribute, in the future, to the detailed reconstruction of the ecological history ofAmazonian forests.

http://www.theses.fr/2012AGUY0568/document

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : L’ouvrage codirigé par O. Chouinard, J. Baztan et J-P. Vanderlinden propose une réflexion sur le défi de la gestion intégrée des zones côtières (GIZC) dans un contexte de changements climatiques. Ce livre est le résultat de rencontres scientifiques qui se sont déroulées à l’Université de Moncton en 2010 dans le cadre de l’Alliance de recherche universités-communautés sur le défi des communautés côtières (ARUC-DCC). Dans ce cadre, différents groupes de recherche, canadiens, québécois, européen...

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/6671