Éditeur(s) : La Rochelle : P. Mesnier
Siècle(s) traité(s) : 18
Droits : Domaine public
Provenance : Communauté d'agglomération de La Rochelle. Médiathèque Michel-Crépeau
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/MMC16107-4
MMC16107-4

Éditeur(s) : Cayenne : Imprimerie du gouvernement
Résumé : Année 1842
Siècle(s) traité(s) : 19
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Guyane. Bibliothèque Alexandre-Franconie
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/FRA11239
FRA11239

Éditeur(s) : Basse-Terre : Imp. du Gouvernement
Siècle(s) traité(s) : 17
Provenance : Archives départementales de Guadeloupe
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/ADG18131
ADG18131

Éditeur(s) : Cayenne : Imprimerie du gouvernement
Résumé : Année 1856
Siècle(s) traité(s) : 19
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Guyane. Bibliothèque Alexandre-Franconie
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/FRA11249
FRA11249

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley/Blackwell
Résumé : International audience
Microsatellites are widely used in population genetics to uncover recent evolutionary events. They are typically genotyped using capillary sequencer, which capacity is usually limited to 9, at most 12 loci for each run, and which analysis is a tedious task that is performed by hand. With the rise of next-generation sequencing (NGS), a much larger number of loci and individuals are available from sequencing: for example, on a single run of a GS Junior, 28 loci from 96 individuals are sequenced with a 30X cover. We have developed an algorithm to automatically and efficiently genotype microsatellites from a collection of reads sorted by individual (e.g. specific PCR amplifications of a locus or a collection of reads that encompass a locus of interest). As the sequencing and the PCR amplification introduce artefactual insertions or deletions, the set of reads from a single microsatellite allele shows several length variants. The algorithm infers, without alignment, the true unknown allele(s) of each individual from the observed distributions of microsatellites length of all individuals. MicNeSs, a python implementation of the algorithm, can be used to genotype any microsatellite locus from any organism and has been tested on 454 pyrosequencing data of several loci from fruit flies (a model species) and red deers (a nonmodel species). Without any parallelization, it automatically genotypes 22 loci from 441 individuals in 11 hours on a standard computer. The comparison of MicNeSs inferences to the standard method shows an excellent agreement, with some differences illustrating the pros and cons of both methods.
ISSN: 1755-098X

hal-01544754
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01544754
DOI : 10.1111/1755-0998.12467

Éditeur(s) : Paris : Payot
Siècle(s) traité(s) : 18
Droits : Domaine public
Provenance : Ville de Pointe-à-Pitre. Réseau des bibliothèques
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/PAP11110
PAP11110

Éditeur(s) : [S.l.] : [s.n.]
Siècle(s) traité(s) : 20
Provenance : Archives départementales de Guadeloupe
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/ADG18171
ADG18171

Éditeur(s) : Cayenne : Imprimerie du gouvernement
Résumé : Année 1923
Siècle(s) traité(s) : 20
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Guyane. Bibliothèque Alexandre-Franconie
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/FRA11241
FRA11241

Éditeur(s) : Paris : Locard Paris : Arthus Bertrand Paris : Armand Koenig
Siècle(s) traité(s) : 19
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Martinique. Bibliothèque Schoelcher
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/SCH13076
SCH13076

Éditeur(s) : Paris : F. Bechet, A. Egron
Siècle(s) traité(s) : 19
Droits : Domaine public
Provenance : Archives territoriales de Guyane
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/GAD11026
GAD11026

Éditeur(s) : Paris : Dufrêne

Droits : Domaine public
Provenance : Communauté d'agglomération de La Rochelle. Médiathèque Michel-Crépeau
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/MMC16100-11
MMC16100-11

Éditeur(s) : Paris : [s.n.]
Résumé : Recueil de textes de lois pour les années 1934,1935,1936
Siècle(s) traité(s) : 19
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Guyane. Bibliothèque Alexandre-Franconie
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/FRA11201
FRA11201

Extrait de : Le Petit Journal Militaire, Maritime, n°30 pp467-468 Colonial
Résumé : Article 2 p. 1 gravure, 3 photos
Siècle(s) traité(s) : 20
Droits : Domaine public
Provenance : ORkidé|Fonds privé Pierre Rostan
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/ORK12168
ORK12168

Éditeur(s) : Genève : chez Jean-Leonard Pellet

Droits : Domaine public
Provenance : Université de Nantes. Service commun de la documentation
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/NAN13054-10
NAN13054-10

Éditeur(s) : Paris : Librairie évangélique
Siècle(s) traité(s) : 17
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Martinique. Bibliothèque Schoelcher
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/SCH13259
SCH13259

Éditeur(s) : Paris : Pagnerre

Droits : Domaine public
Provenance : Archives départementales de Guadeloupe
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/HASH5940ff3e238f321491453f
HASH5940ff3e238f321491453f

Droits : Domaine public
Provenance : Communauté d'agglomération de La Rochelle. Médiathèque Michel-Crépeau
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/MMC16099-12
MMC16099-12

Éditeur(s) : Paris : Treuttel et Wurtz
Extrait de : Collection des voyages et des découvertes des espagnols depuis la fin du XVème siècle
Siècle(s) traité(s) : 15
Droits : Domaine public
Provenance : Archives départementales de Guadeloupe
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/ADG17079
ADG17079

Éditeur(s) : Paris : F. Buisson
Siècle(s) traité(s) : 19
Provenance : Archives départementales de Guadeloupe
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/ADG18223
ADG18223

Éditeur(s) : Paris : A. Challamel
Résumé : Revue mensuelle d'agronomie tropicale : juillet à décembre 1913
Siècle(s) traité(s) : 20
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Guyane. Bibliothèque Alexandre-Franconie
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/FRA11277
FRA11277