Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : In the tropical rainforest of Amazonia, the factors driving the evolution of tree species remain poorly understood, and the relative influence of neutral and adaptive processes is continuously debated. In particular, local habitat patchiness draws much attention, as profound changes in the structure and composition of forest communities occur among micro-habitats. Thus, micro-environmental variations related to topography have frequently been invoked as drivers of adaptive radiation leading to sympatric speciation in Neotropical trees. On one hand, the hypothesis of local adaptation has never been investigated at the intra-specific level, i.e. within species currently undergoing population differentiation; on the other hand, many tree species are genetically structured over local scales due to neutral processes, mainly limited gene flow (caused by restricted pollen and seed dispersal). In this study, I used populations of a common tree species of the Guiana Shield - Eperua falcata (Fabaceae) - to study how neutral and adaptive processes shape the distribution of genetic diversity across forest landscapes characterized by local micro-habitat patchiness. I asked three main questions by combining both phenotypic (quantitative genetics) and molecular (population genetics) approaches: 1) How is the genetic diversity structured in forest landscapes of French Guiana? 2) Which evolutionary drivers are relevant to explain the structure of genetic diversity at local scale? 3) Does local adaptation contribute to structure genetic diversity within continuous populations?
En forêt tropicale humide Amazonienne, les facteurs gouvernant l'évolution des espèces d'arbres restent peu connus et continuellement débattus. En particulier, les micro-variations environnementales attirent beaucoup d'attention car elles induisent de profondes modifications de structure et composition des communautés. Les variations micro-environnementales associées à la topographie ont couramment été évoquées comme facteur de radiations adaptatives chez les espèces d'arbres. Cependant, l'hypothèse de l'adaptation locale n'a jamais été testée au niveau intra-spécifique chez les arbres de forêt amazonienne alors que l'on sait que la diversité génétique des arbres tropicaux est couramment structurée à faibles échelles spatiales par des processus neutres (en particulier du fait de restrictions de flux de gènes). Dans cette étude, j'ai étudié le processus de différentiation génétique d'une espèce d'arbre (Eperua falcata, Fabaceae) dans les paysages forestiers de Guyane française grâce à la combinaison d'une approche phénotypique (génétique quantitative) et d'une approche moléculaire (génétique des populations). Je me suis attachée à répondre à trois questions principales : 1) Comment se distribue la diversité génétique dans les paysages forestiers de Guyane française ? 2) Quelles forces évolutives sont impliquées dans le processus de différentiation génétique à faible échelle spatiale ? 3) Est-ce que le processus d'adaptation locale contribue à structurer la diversité génétique à faible échelle spatiale ?
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00967318

NNT : 2013LORR0188
tel-00967318
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Éditeur(s) : HAL CCSD Ecole nationale du génie rural
Résumé :  
Les forêts hétérogènes guyanaises sont des milieux complexes dont la gestion passe par la compréhension de leur organisation (structure spatiale, horizontale et verticale et diversité spécifique) et de leur dynamique. Dans ce contexte, l'étude des stratégies de développement et d'occupation de l'espace des arbres permet de mieux comprendre comment les différentes espèces exploitent et structurent l'hétérogénéité du milieu. Depuis une trentaine d'années, les travaux menés en architecture végétale ont permis d'établir un contexte méthodologique et conceptuel pour étudier la structure globale de l'arbre et pour comprendre les mécanismes morphologiques qui lui ont donné naissance. Après une présentation de concepts majeurs d'architecture végétale, cet article expose les méthodes employées pour quantifier la structure des arbres et les approches permettant d'intégrer les critères architecturaux dans un diagnostic à l'échelle du peuplement.
ISSN: 0035-2829

hal-01032084
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032084

Résumé : Arbusto o arbolito de hasta 5 m, con látex amarillo lechoso o rojizo. Hojas redondeado-aovadas, 3-5 lobadas, cordadas en la base, agudas o acuminadas en el ápice. Cimas pequeñas, densas, largo-pedunculadas; pétalos blanquecinos oblongo-ovados, densamente pilosos. Cápsula elipsoide, de 2.5 a 4 cm; semillas de 2 cm, negruzcas.
Arbuste ou petit arbre pouvant atteindre 5 m, avec un latex jaune laiteux ou rougeâtre. Feuilles arrondies-ovées, à 3-5 lobes, cordées à la base, à l’extrémité aiguë ou acuminée. Cymes petites, denses, à longs pédoncules; pétales blanchâtres oblong-ovés, à pilosité dense. Capsule ellipsoïdale, de 2,5 à 4 cm. Graines de 2 cm, noirâtres.
Shrub or small tree, up to 5 m high, with sticky, milky or reddish latex.  Leaves broadly ovate, margins entire or shallowly 3-5-lobed, cordate at base, acute or acuminate at apex, 15cm x 13cm; cymes with or without peduncles; flowers unisexual, born at different times on the same inflorescence, petals green 6-7 mm long; capsule ellipsoid, 2.5-4 cm long; seeds blackish ca.2 cm long.
Originaria de América tropical, se ha naturalizado en otras regiones tropicales.
Originaire d’;Amérique tropicale, naturalisée dans d’;autres régions tropicales.
Native to tropical America. Naturalized in other tropical regions.

http://www.tramil.net/fototeca/plant200

Résumé : Arbol de hasta 18 m de alto. Hojas pecioladas, subcoriáceas, oblongo elípticas a lanceoladas, agudamente acuminadas, pinnado nervadas de hasta 13 cm de longitud. Inflorescencias estaminadas de 3 a 20 flores; las pistiladas usualmente de una sola flor; flores pequeñas, amarillo cremosas. Fruto piriforme o subgloboso (nuez) de hasta 5 cm, colgante, rojizo o amarillento, con dos valvas; semilla con arilo escarlata.
Arbre pouvant atteindre 18 m de haut. Feuilles pétiolées, presque coriaces, oblongo-elliptiques à lancéolées, terminées en pointe très fine, pennatinnervées pouvant atteindre 13 cm de long. Inflorescences staminées de 3 à 20 fleurs; celles qui sont pourvues d’un pistil ont habituellement une seule fleur; fleurs petites, jaunes-crèmes. Fruit piriforme ou presque arrondi pouvant atteindre 5 cm, tombant, rougeâtre ou jaunâtre, bivalve; graine avec arille écarlate.
Tree dioecious 6-18 m high with a dense crown and aromatic wood.  Leaves simple, alternate, oblong-elliptic, acutely acuminate, pinnately veined, dark green shiny above, paler beneath, 5-15 cm x 2-7 cm; male inflorescences usually 1-10 flowered cyme, fragrant, pale yellow, female inflorescences a 1-3 flowered cyme, but usually 1-flowered, pale yellow; fruit a fleshy, smooth, yellow, sub-globose, drupe, 3-6 cm long with a circumferential, longitudinal ridge; seed brown, ovoid 1.5-4.5cm long covered with a lacinate, red aril.
Nativa de Asia tropical, cultivada en los trópicos del resto del mundo.
Originaire d’;Asie tropicale, cultivée dans les tropiques du reste du monde.
Native to tropical Asia, cultivated in tropical regions around the world.

http://www.tramil.net/fototeca/plant239

Résumé : Árbol de tamaño mediano de hasta 6 m, copa redonda; ramas con espinas delgadas, flexibles, ocasionalmente ausentes. Hojas ampliamente elípticas de 6 a 11 cm de largo con el ápice obtuso o agudo, base cuneada a redondeada. Flores solitarias o en racimos cortos, blancas, aromáticas. Fruto globoso u oval, con 10 a 13 segmentos, pulpa amarillenta, dulce.
Arbre de taille moyenne pouvant atteindre 6 m, cime arrondie; branches avec épines fines, souples, parfois absentes. Feuilles très elliptiques de 6 à 11 cm de longueur avec une pointe obtuse ou aiguë, base rhomboïdale ou arrondie. Fleurs solitaires ou en grappes courtes, blanches, aromatiques. Fruit rond ou ovale, avec 10 à 13 segments, pulpe jaunâtre, sucrée.
Tree 6 -12 m tall with spines. Leaves ovate or oval-elliptic 5-15 cm x 2-8 cm, glabrous dark green above, margins serrate, petiole narrowly winged and articulate; flowers axillary, born single or in small racemes, 2-3cm in diameter, white, aromatic; fruit subglobose or oval, 4-12 cm in diameter, peel thick, ripening orange colour but often remaining green in the tropics, pulp sweet and juicy, seeds nil to many obovoid.
Nativa de Asia, ampliamente cultivada en regiones tropicales y subtropicales.
Originaire d’;Asie, cultivée dans de vastes régions tropicales et subtropicales.
Native to Asia, widely cultivated in tropical and subtropical regions.

http://www.tramil.net/fototeca/plant136

Résumé : Arbusto o arbolito glabro, de hasta 10 m de altura. Hojas alternas, lineares a linear-lanceoladas, estrechamente acuminadas, brillantes en el haz. Inflorescencia terminal o lateral con pocas flores; lóbulos de la corola obovados a ovado-lanceolados; corola hipocraterimorfa, de color naranja o rosado-amarillenta. Drupas rojas al madurar, con dos semillas.
Arbuste ou petit arbre glabre, pouvant atteindre 10 m de haut. Feuilles alternes, linéaires à linéaires-lancéolées, effilées à la pointe, brillantes sur le dessus. Inflorescence terminale ou latérale avec peu de fleurs; lobes de la corolle obovales à ovés-lancéolés; corolle hypocratérimorphe, de couleur orange ou rose-jaunâtre. Drupes rouges lorsqu’elles sont arrivées à maturité, avec deux graines.
Shrub or small tree 3-7 m high, glabrous with milky sap. Leaves spirally arranged, linear, 10-15 x 0.6-1cm, shiny on the upper side; Inflorescence terminal cymes, few-flowered; corolla tubular-campanulate, flower 7-8.5 cm long, bright yellow or pinkish-orange; fruit sickle-shape, 2 x 3 cm, yellow when ripe with a single triangular seed 2 x3 cm.
Nativa de América tropical, cultivada ampliamente en los trópicos de ambos hemisferios.
Originaire d’;Amérique tropicale, abondamment cultivée sous les tropiques des deux hémisphères.
Native to tropical America, widely cultivated in the tropica

http://www.tramil.net/fototeca/plant349

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Diffusion du document : INRA Antilles-Guyane, UMR ECOFOG, 97387 Kourou, Guyane (France) Diplôme : Master Recherche
il s'agit d'un type de produit dont les métadonnées ne correspondent pas aux métadonnées attendues dans les autres types de produit : DISSERTATION
La forêt tropicale guyanaise comporte entre 200 et 300 espèces d'arbres par hectare, alors qu'une forêt tempérée en compte environ une quinzaine. Les forêts tropicales humides sont des écosystèmes qui recèlent une des plus grandes biodiversités de la planète où les interactions entre les espèces et le milieu environnant atteignent des degrés de complexité élevés. Les arbres développent ainsi des stratégies souvent différentes, notamment celle du contrefil que nous avons cherché à décrire et à caractériser, lors de ce stage de Master 2ème année. Cette structure particulière du bois se retrouve dans une proportion importante dans les forêts tropicales. Elle consiste en une alternance d'hélices en S puis en Z de l'orientation longitudinale des fibres. Le stage s'est déroulé en grande partie en Guyane française, au sein de l'UMR « Ecologie des Forêts de Guyane » sur le site de Paracaïbo (Kourou). La première phase a été la prospection et la description du contrefil sur différentes espèces. Nous nous sommes ensuite intéressés au comportement mécanique en flexion statique et dynamique à différentes échelles. Enfin, au Laboratoire de Mécanique et Génie Civil de Montpellier, nous avons réalisé des mesures de l'angle des micros fibrilles afin de déterminer son évolution en fonction de l'angle du fil. Ainsi, prenant en compte les différentes échelles de description, nous avons mis au point un modèle permettant de prédire le comportement d'une poutre contre filée en flexion, connaissant la répartition du contrefil dans la section, la densité, et le module d'élasticité longitudinal orienté selon le fil du bois.
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189254

hal-01189254
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189254
PRODINRA : 19939

Résumé : Arbusto o arbolito de hasta 12 m, ramas armadas con espinas rectas. Hojas pecioladas, compuestas, glabras; 1 a 3 pares de pinas; con folíolos de 12 a 20 pares por pinna, sésiles, linear-oblongos. Flores verde-amarillentas, sésiles, en espigas cilíndricas, densas, de 5 a 10 cm de longitud, pedunculadas. Vaina comprimida, falcada, coriácea indehiscente; semillas aplanadas, ovales de color café.
Arbuste ou petit arbre pouvant atteindre 12 m, branches armées d’épines droites. Feuilles pétiolées glabres, bipennées ou tripennées, dont chaque élément porte 12 à 20 paires de folioles, sessiles, linéaires-oblongues.Fleurs vert-jaunâtres, sessiles, en épis cylindriques, denses, de 5 à 10 cm de longueur, pédonculées. Gousse comprimée, en forme de lame de faucille, coriace indéhiscente; graines plates, ovales, couleur café.
Shrub or small tree, up to 12 m high with spreading branches armed with straight spines 0.6-2.5 cm.  Leaves, petiolate 1-4 cm, bipinnate with glands between pairs of pinnae, pinnae 1 pair rarely 2, leaflets 12-20 pairs linear-oblong, 7-16 x 1.5-3.2 mm, apex obtuse or short abrupt point; inflorescence axillary in spikelike racemes, 5-10 cm long; flowers densely packed with pale yellow corolla 2.5 mm long; pod compressed, 7-20 cm x 1-1.6 cm, slightly curved, pale yellow; seeds brown 6 mm embedded in white sweet pulp.
Nativa de América tropical.
Originaire d’;Amérique tropicale.
Native to tropical America.

http://www.tramil.net/fototeca/plant259

Résumé : Arbusto o arbolito de hasta 9 m, muy ramificado. Hojas alternas, aovadas, de 8 a 20 cm, acuminadas, cordadas en la base, enteras. Inflorescencia en panículas terminales; flores de 4 a 5.3 cm de diámetro; pétalos rosados o blancos, obovados a anchamente ovales. Cápsula (fruto) ovoidea a globoso-ovoidea, de 3 a 4 cm, usualmente con espinas blandas. Semillas con un arilo rojo.
Arbuste ou petit arbre pouvant atteindre 9 m, très ramifié. Feuilles alternes, ovalées, de 8 à 20 cm, acuminées, cordées à la base, entières. Inflorescence en panicules terminaux; fleurs de 4 à 5,3 cm de diamètre; pétales rosés ou blancs, courbes à largement ovales. Capsule ovalée à globuleuse-ovalée, de 3 à 4 cm, avec habituellement des épines molles. Graines avec un arille rouge.
Shrub or small tree, up to 9 m in height, with many branches.  Leaves alternate, ovate, 8 to 20 cm in length, cordate at the base, entire.  Inflorescence in terminal panicles; flowers 4 to 5.3 cm wide; pink or white petals, obovate to broadly oval.  Capsule (fruit), ovoid to globosely-ovoid, 3 to 4 cm in length, usually with soft thorns.  Seed with red aril.
Originaria del trópico americano, cultivada en las regiones tropicales.
Originaire du tropique américain, cultivée dans les régions tropicales.
Native from American tropic and cultivated in tropical regions.

http://www.tramil.net/fototeca/plant101

Résumé : Arbol de 4-5 (raras veces 8) metros de altura, tronco de hasta 20 cm de diámetro y ramas extendidas. Hojas corto-pecioladas, espatuladas, fasciculadas, de 5 a 20 cm. Flores solitarias, amarillentas con venas de color púrpura, de 5 a 6 cm; lóbulos lacerados. Fruto globoso o elipsoideo, liso, lustroso, de 10 a 30 cm de diámetro, de cáscara dura.
Petit arbre de 8 m ou moins, tronc pouvant avoir jusqu’à 20 cm de diamètre et branches allongées. Feuilles à court pétiole, spatulées, fasciculées, de 5 à 20 cm. Fleurs solitaires, jaunâtres avec des veines pourpres, de 5 à 6 cm; lobes très découpés. Fruit arrondi ou ellipsoïdal, lisse, brillant, de 10 à 30 cm de diamètre, à l’écorce dure.
Small tree, up to 8 m tall with shorttrunk up to 20 cm in diameter with long spreading branches; leaves short-petiolate, spatulate, fasciculate, 5-20 cm long; flowers bell-shaped, born on the trunk in clusters, 5-6 cm long, greenish- white to greenish-yellowish with purple markings, foul smelling; fruit globose to ellipsoid, smooth, shiny, 10-30 cm in diameter, with hard shell.
Nativa de América tropical continental, cultivada y naturalizada en los trópicos.
Originaire de l’;Amérique tropicale continentale, cultivée et acclimatée sous les tropiques.
Native to tropical continental America, cultivated and naturalized

http://www.tramil.net/fototeca/plant150

Résumé : Arbusto o árbol de hasta 20 m. Hojas oblongas a anchamente aovadas, de 3 a 15 cm, agudas a acuminadas, aserradas, estrellado-tomentosas, marcadamente asimétricas. Flores amarillentas, fragantes, en cimas axilares pequeñas, con 5 pétalos de 3 mm. Fruto leñoso, globoso u oval, de 2 a 4 cm, con tubérculos duros.
Arbuste ou arbre pouvant atteindre 20 m. Feuilles oblongues à largement ovées, de 3 à 15 cm, aiguës à acuminées, dentées, en forme d’étoile, tomenteuses, très asymétriques. Fleurs jaunâtres, odorantes, sur de petites tiges axillaires, avec 5 pétales de 3 mm. Fruit ligneux, arrondi ou ovale, de 2 à 4 cm, avec tubercules fermes.
Tree deciduous up to 16 m tall with spreading branches. Leaves alternate 20 cm x 7 cm, lanceolate to ovate, unequal at the base, margins crenate-dentate, hairy from sub-glabrous to tomentose; inflorescence axillary in panicles, flowers 3 mm with five yellow-green petals, fragrant; fruit black, woody, warty, sub-globose 1-2 cm in diameter with the faint smell of molasses, seeds numerous.
Regiones tropicales del continente americano.
Régions tropicales du continent américain.
Tropical and sub-tropicalregions of the American continent.

http://www.tramil.net/fototeca/plant179

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé :  Diffusion du document : INRA Antilles-Guyane, UMR ECOFOG, F97387 Kourou, Guyane (France)Diplôme : Master Recherche
il s'agit d'un type de produit dont les métadonnées ne correspondent pas aux métadonnées attendues dans les autres types de produit : DISSERTATION
Origin and maintenance of species diversity is one of the main questions in evolutive biology. Species complexes, ie sister species still exchanging genes, are common in tropical forests and contribute to this diversity. This poster describes the organization of the genetic diversity in two closely related tree species, Carapa guianensis and C. procera, which are in sympatry in French Guiana. By using a clustering method based on nuclear markers (Pritchard et al. 2000), 506 trees sampled in French Guiana have been assigned to a species. Interestingly, many individuals harbored intermediate genome and we assigned to an hybrid group. The geographic distribution of these individuals revealed the presence of a contact zone between the two carapa species in the Eastern part of French Guiana. We then analysed genetic diversity at cholroplast genome and revealed a symmetrical gene flow between the two sister species. In addition, hybridization between hybrids and parental species ar likely possible but still need validations thanks to control crosses. Within species, we finally revealed the presence of a departure from the neutral equilibrium in thedirection of a population expansion likely related to Holocene perturbations. This expansion may have contributed to the hybrid zone formation in French Guiana.
L'origine et le maintien de la diversité spécifique des forêts tropicales humides est une question clé en biologie évolutive. Ce travail contribue à améliorer la compréhension de ces mécanismes à travers l'étude de la distribution de la diversité génétique de deux espèces sœurs interfertiles, le Carapa procera et C. guianensis en Guyane. L'assignation botanique des arbres échantillonnés (506) a été effectuée en adoptant une approche moléculaire qui repose sur l'analyse de la répartition des fréquences alléliques de six microsatellites nucléaires (Pritchard et al. 2000). Chaque locus présente des allèles dont les différences de fréquences entre espèces sont importantes, permettant ainsi d'envisager des outils simples de reconnaissances pour ces espèces difficilement identifiables sur la seule base de leurs caractères phénotypiques. Une zone de contact des deux espèces où les phénomènes d'hybridations sont fréquents a par ailleurs été localisée. En associant une analyse de la diversité au niveau du génome chloroplastique sur un sous ensemble d'individus (244), j'ai pu montrer que l'introgression est bidirectionnelle et que les backcross sont possibles. Les flux de gènes entre les deux espèces sont fréquents, et à l'intérieur des espèces, les populations sont peu structurées bien que la différenciation soit significative entre les sites les plus éloignés. Enfin, ce travail met en évidence que les populations de chacune des deux espèces présentent un signal d'expansion de population, avec un signal plus fort pour le C. procera, qui laisse présager une expansion récente, vraisemblablement à l'origine de la zone de contact. L'impact des évènements climatiques et/ou des activités amérindiennes des 10 000 dernières années pourrait expliquer la restriction puis l'expansion de ce genre post pionnier.
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189488

hal-01189488
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189488
PRODINRA : 42333

Résumé : Arbol de 10 a 15 m o más, de copa densa, redondeada; corteza resinosa. Hojas alternas, oblongo-lanceoladas, agudas o acuminadas, subcoriáceas. Flores verdosas o amarillentas, fragantes, en grandes panículas; pétalos de 5 mm, glabros. Drupa elipsoidea a oblícuamente reniforme, de 5 a 15 cm, mesocarpo carnoso amarillo, agridulce.
Arbre de 10 à 15 m ou davantage, tête dense, arrondie; écorce résineuse. Feuilles alternes, oblongues-lancéolées, pointues ou acuminées, subcoriaces. Fleurs verdâtres ou jaunâtres, odorantes, en grandes panicules; pétales de 5 mm, glabres. Drupe ellipsoïdale à obliquement réniforme, de 5 à 15 cm, mésocarpe charnu, jaune, aigre-doux.
Tree evergreen, 10-15 m high with a dense, rounded crown of foliage, bark resinous.  Leaves alternate, simple, spirally arranged, lanceolate-elliptical, 10-25 cm x 2.5-8 cm; inflorescence a terminal panicle ca 30 cm long; flowers 5-8 mm in diameter, greenish or yellowish, fragrant; fruit a fleshy drupe, ellipsoid to obliquely reniform, 5-15 cm long.
Nativa del sureste asiático, cultivada en zonas tropicales y subtropicales de todo el mundo.
Originaire du sud-est asiatique, cultivée dans les zones tropicales et subtropicales du monde entier.
Native to Southeast Asia, cultivated in tropical and su

http://www.tramil.net/fototeca/plant220

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Tropical forests are a biodiversity hotspot, with the coexistence of numerous species until a fine spatial scale. Particularly, 16.000 tree species coexist in Amazonia, 1.800 in Frenche Guiana and between 120 and more than 200 tree species per hectare. However, there are some uncertainties in maintaining diversity in regard to global changes. Hence before predicting the diversity evolution face of global changes, fundamental studies are needed to understand which assembly processes are involved in the maintenance of diversity. These fundamental studies still relevant given the lack of consensus on the relative importance of assembly processes. This thesis is a continuation of these fundamental studies, using innovative integrative approach, at multi-scale, to address three types of diversity: taxonomic diversity, functional and phylogenetic. Our results challenge the importance of environmental filtering for hydrological and chemical properties of soils, versus the importance of biotic interactions on community assembly. Furthermore, our results suggest that species distributions could be affected by forest dynamics related to falling trees and therefore by light availability. Finally, we have highlighted the importance of dispersal limitation on community assembly.
Les forêts tropicales représentent un ‘hotspot’ de diversité avec un nombre considérable d’espèces qui coexistent jusqu’à une échelle locale fine. Plus particulièrement, 16 000 espèces d’arbres coexistent en Amazonie, 1 800 en Guyane française et entre 120 et plus de 200 espèces d’arbres par hectare. Cependant, le maintien de cette diversité face aux changements globaux actuels et à venir (qu’ils soient anthropiques ou climatiques…) est incertain. Avant de pouvoir prédire l’évolution de la diversité face aux changements globaux, un travail fondamental est nécessaire afin de comprendre les processus d’assemblage des communautés, processus qui maintiennent cette diversité. Ce travail est réalisé depuis de nombreuses années en écologie et reste d’actualité vu l’absence de consensus quant à l’importance relative des processus d’assemblage. Cette thèse s’inscrit dans la continuité de ce travail fondamental en utilisant une approche intégrative innovante, qui aborde de manière multi-échelle trois types de diversité : diversité taxonomique, fonctionnelle et phylogénétique. Nos résultats questionnent sur l'importance du filtrage environnemental quant aux propriétés hydrologiques et chimiques des sols, et sur celle des interactions biotiques dans l’assemblage de la communauté étudiée. Par ailleurs, nos résultats suggèrent que les distributions d’espèces puissent être influencées par la dynamique forestière en lien avec les chutes d’arbres et donc avec la disponibilité en lumière. Enfin, nous avons mis en évidence l’importance de la limitation de dispersion.
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01418447

NNT : 2016YANE0003
tel-01418447
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01418447
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01418447/document
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01418447/file/these.pdf

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Session "Articles"
National audience
Nous présentons ici une méthode permettant de créer et de représenter sous forme vectorielle des classes de transition à partir d'une classification supervisée basée sur des arbres de décision flous. Cette méthode est particulièrement utile pour la classification stricte de données dont les frontières sont naturellement diffuses ainsi que pour leur représentation au sein d'un System d'Information Géographique. C'est le cas par exemple des formations forestières entre lesquels les transitions sont généralement étalées sur plusieurs centaines de mètres avec des gradients dépendant de condition environnementales locales ne permettant pas de définir une transition identique dans toutes les directions. La méthode présentée permet d'ajouter des classes lorsque les zones de transition sont trop étendues plutôt que de fixer une frontière arbitrairement
Actes de la conférence RFIA 2012
Lyon, France

Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess
hal-00656502
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00656502/file/rfia2012_submission_57.pdf

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
Radiocarbon dating and "old wood problem" in the Antilles : the state of the artAmong the many effects that may distort the interpretation of radiocarbon dates are those for which the age of the archaeological event is different from the radiocarbon age of the sample or "14C event" age. This type of problem arises in many cases, notably in the "old wood effect”, and occurs in various regions of the world where very long-lived trees species are common. In the Caribbean anthracological studies indicate a very high frequency of some indigenous centuries-old species such as Guaiacum, Guaiacum officinale L. However the absence of tree-ring data in humid tropical zones deprives us of an accurate inventory of long-lived species and especially the assessment of their longevity. Here we present measurements which enable us to estimate the longevity of archaeological Guaiacum wood posts. They highlight a gap of several centuries between wood from the outer edge and the heart of the tree. This example illustrates the additional uncertainty that can result from dating archeological events when dates are realized on unidentified botanical species from which the area that was sampled is unknown. Another source of error could arise from the use of rot-proof dead wood as fuel if we take into consideration that major hurricanes can produce large amounts of dead wood that may be collected for decades, even centuries. To improve chronometric data used in archaeological interpretations, it is necessary to ensure the quality of the dating process by following a protocol similar to those used in other regions of the world based on a better understanding of the material to be dated by preliminary identifications of wood samples: species, anatomical part, wood moisture content (unseasoned or seasoned).
Radiocarbono y "problema madera vieja", que data de las Antillas: estado del arteEntre los muchos efectos que pueden distorsionar la interpretación de fechas de radiocarbono, destacan aquellos para los que la edad de la prueba arqueológica es diferente de la edad de radiocarbono de la muestra, o la edad del "evento de radiocarbono." Este tipo de problema se presenta en muchos casos, especialmente uno llamado "efecto madera vieja." Esto se refleja en diversas regiones del mundo donde las especies de plantas de mucha longevidad son comunes. En el Caribe, los estudios antracológicos disponibles indican una muy alta frecuencia de algunas especies autóctonas como el guayaco, Guaiacum officinale L. Sin embargo, la casi ausencia de datos de anillos de árboles en los trópicos húmedos, nos impide realizar un inventario exacto de especies de mucha longevidad y sobre todo la evaluación de la longevidad. Algunas de las pruebas presentadas aquí permitieron una estimación de la longevidad de de unos postes de guayaco de origen arqueológico. Ponen de manifiesto una brecha de varios siglos entre las partes externas y el corazón del tronco. Este ejemplo ilustra la aparición de una incertidumbre adicional en la datación de los eventos arqueológicos cuando no conocemos la especie botánica y tampoco la zona de la muestra en el árbol. Otra fuente de error puede surgir de la utilización de la madera muerta de calidad duradera como combustible ya que los grandes huracanes pueden producir grandes cantidades de madera muerta, que puede ser requerida durante décadas, incluso siglos. Para mejorar los datos cronométricos utilizados en interpretaciones arqueológicas, es necesario asegurarse de la calidad de las fechas, y por lo tanto seguir un protocolo similar a los utilizados en otras regiones fundado en una mejor comprensión de los elementos: especie, parte anatómica, humedad de la madera usada (verde o seco).
Parmi les nombreux effets susceptibles de fausser l’interprétation des datations par le radiocarbone, figurent ceux pour lesquels l’âge de l’événement archéologique est différent de l’âge radiocarbone de l’échantillon, ou âge de l’« événement radiocarbone ». Ce type de problème se pose dans de nombreux cas, en particulier celui dénommé « effet vieux bois ». Cette question est prise en compte dans diverses régions du monde où des espèces végétales très longévives sont fréquentes. Dans les Antilles les études anthracologiques disponibles indiquent une fréquence très importante de certaines espèces autochtones multiséculaires dont le gaïac, Guaiacum officinale L.. Cependant, la quasi absence de données dendrochronologiques dans la zone tropicale humide, nous privent d’un inventaire précis des espèces longévives et surtout de l’évaluation de leur longévité. Quelques tests présentés ici ont permis une estimation de la longévité de poteaux d’origine archéologique en bois de gaïac. Ils mettent en évidence un décalage de plusieurs siècles entre les parties externes et le cœur du tronc. Cet exemple illustre l’apparition d’une incertitude supplémentaire dans la datation de l’événement archéologique lorsque que l’on ne connaît ni l’espèce botanique ni la zone de prélèvement dans l’arbre. Une autre source d’erreur pourrait provenir de l’utilisation de bois mort de qualité très durable comme combustible, sachant que les grands cyclones peuvent produire d’importantes quantités de bois mort susceptible d’être récolté pendant des décennies, voire des siècles. Afin d’améliorer les données chronologiques utilisées dans les interprétations archéologiques, il apparaît nécessaire de s’assurer de la qualité des datations, et donc de suivre un protocole similaire à ceux utilisés dans d’autres régions basé sur une meilleure connaissance des éléments datés : espèce, partie anatomique, humidité du bois utilisé (vert ou sec).
Puerto Rico 2013 : Actas del 25to Congreso Internacional de Arqueología del Caribe - Proceeding of the 25th International Congress for Caribbean Archeology - Comptes rendus des communications du 25e Congrés International de l'Archéologie de la Caraïbe
San-Juan, Puerto Rico

hal-01198567
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01198567
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01198567/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01198567/file/Stouvenot%20et%20al.%202015.%20Effet%20vieux%20bois%20radiocarbone%20Antilles%20HD.pdf

Résumé : Les mécanismes à l’origine du maintien de la forte diversité locale des arbres des forêts tropicales humides constituent encore une énigme pour les scientifiques. Cette thèse a pour but d’étudier et de comprendre certains facteurs biotiques et abiotiques qui influencent l’assemblage des communautés des forêts tropicales humides d’Amazonie. A l’aide d’une approche empirique conduite dans les forêts tropicales de Guyane française et du Loreto au Pérou, de nombreuses expériences de terrain ont été mises en place dans le but d’apporter des éléments de réponse sur les mécanismes impliqués dans le maintien de la diversité des communautés d’arbres et d’insectes des forêts amazoniennes. Dans un premier temps, cette thèse permet de souligner l’importance des pressions biotiques exercées sur les communautés d’arbres. En effet, les communautés d’insectes peuvent influencer la composition des communautés d’arbres le long d’un gradient environnemental conduisant à des compromis entre la défense et la croissance. Ces compromis ou tradeoff permettent de maintenir la coexistence des espèces de forêts tropicales humides en favorisant la spécialisation des arbres à leur habitat (Chapitre 1, Annexe 3). Cependant, de nombreux facteurs peuvent engendrer des variations dans les compromis d’allocation exhibés par les plantes, ce qui peut compliquer la validité de ces résultats. Dans ce sens, nous avons souligné l’influence du rôle de la cascade trophique et l’existence chez certaines espèces d’arbres de stratégies d’évitement des insectes (Chapitre 2). Dans un second temps, nous avons montré que les filtres environnementaux et les distances géographiques favorisent un fort turnover de la composition des arthropodes des forêts tropicales (chapitre 3, Annexe 2). Les résultats de cette étude ont des implications fondamentales sur les mécanismes qui expliquent la structuration des communautés d’insectes herbivores. Nous avons souligné l’importance de l’interaction des communautés des insectes herbivores et de leurs plantes associées. De plus, des prédictions sont présentées sur le degré de spécialisation des insectes à leur plante-hôte (Annexe 3), notamment sur les implications possibles dans les compromis d’allocation chez les plantes. Finalement, des perspectives de recherche sont proposées en vue de poursuivre ces travaux de recherche, et notamment des extensions de mes expériences vers d’autres régions tropicales et tempérées et l’intégration de la phylogénie pour comprendre des mécanismes de coévolution entre communautés d’arbres et insectes. Nous proposons également une intégration des résultats de cette thèse dans les stratégies locales et régionales de conservation des forêts tropicales du bassin amazonien.
The mechanisms underlying the maintenance of local diversity of trees in tropical rainforests remain under debate. This dissertation aims to study and understand some biotic and abiotic factors that may influence both tree and insect community assembly in lowland tropical forests of Amazonia. I used an empirical approach to study communities of trees and insects in tropical forests of French Guiana and Peru, to address the extent to which insect herbivores contribute to the turnover of tree species across strong environmental gradients. In Chapter 1, I studied how herbivorous insect communities can influence the composition of tree communities along an environmental gradient by reinforcing tradeoffs between defense and growth that promote habitat specialization (Chapter 1, Appendix 3). The complicated variation in the patterns of growth and defense from this study led me to pursue further observations of an alternative plant defense strategy of time-avoidance of herbivores, which I examined in detail in Chapter 2. I found evidence for coordinated leaf production in some tree species that was consistent with the satiation of herbivores, suggesting that multiple interactions between plants and their herbivores may be responsible for patterns of habitat specialization in trees. In the second part of the dissertation, I examined insect herbivore communities in detail to test for turnover in species composition across geographic and environmental gradients. In Chapter 3, I present evidence for substantial beta-diversity in arthropod communities throughout lowland Amazonian forests. In the discussion I propose research perspectives to complete this research, including the extension of observations to compare tropical and temperate regions and the integration of molecular phylogenetics information to study coevolution of plant lineages and their insect herbivores. I conclude with suggestions for the integration of the results of this thesis in local and regional strategies for the preservation and conservation of tropical forests in the Amazon basin.

http://www.theses.fr/2013AGUY0582/document

Résumé : Arbol de hasta 6 m de alto con copa redonda, espinas largas y más bien flexibles. Hojas de 7 a 10 cm, agudas a acuminadas; pecíolo anchamente alado. Flores axilares de tamaño mediano, blancas. Fruto de 7 a 8 cm de diámetro, globoso, algo aplanado en el ápice, con 10 a 12 segmentos; pulpa ácida.
Arbre pouvant atteindre 6 m de haut, à cime arrondie, avec des épines longues et plutôt souples. Feuilles de 7 à 10 cm, aiguës à acuminées; pétiole en forme d’aile prononcée. Fleurs axillaires de taille moyenne, blanches. Fruit de 7 à 8 cm de diamètre, de forme arrondie, un peu aplati au sommet, avec 10 à 12 segments; pulpe acide.
Tree, up to 10 m tall with slender thorns. Leaf blade 7-20 cm x 7 cm; widely winged petiole; flowers axillary, white 4 cm; fruit, globose, 7-8 cm in diameter, somewhat flat at the top, peel thick, rough and strongly aromatic, pulp acidic and bitter, seeds numerous.
Nativa de Asia, cultivada en regiones tropicales y subtropicales.
Originaire d’Asie, cultivée dans des régions tropicales et subtropicales.
Native to Asia, cultivated in tropical and subtropical regions.

http://www.tramil.net/fototeca/plant133

Résumé : Arbol de hasta 15 m de alto con corteza blanquecina, suave y madera dura y pesada. Hojas obovadas o elípticas, obtusas, con venación finamente reticulada, corto pecioladas. Panículas con flores blancas, glandulosas; cáliz con 5 lóbulos. Fruto ovoide, negro al madurar.
Arbre pouvant atteindre 15 m de haut, écorce blanchâtre et douce, bois dur et lourd. Feuilles obovées ou elliptiques, obtuses, à nervation finement réticulée, avec un court pétiole. Panicules avec fleurs blanches glanduleuses; calice à 5 lobes. Fruit ovoïde, noir une fois parvenu à maturité.
Evergreen tree up to 15 m high with smooth, whitish, variegated and flaking bark, hard and heavy wood.  Leaves simple, entire, opposite in pairs, dark green, leathery, oblong to elliptic, obtuse at the tip, rounded at the base, 15-20 x 5-7 cm, prominent  venation, highly aromatic when crushed; inflorescence a compound panicle 5-10 cm long, flowers numerous 3-4 mm long, white; fruit a subglobose to ellipsoid berry, 8-10 mm long, thickly covered with small convex glands, black when ripe.
Nativa del norte de Sudamérica y las Antillas, cultivada en los trópicos.
Originaire du nord de l’;Amérique du Sud et des Antilles, cultivée sous les tropiques.
Native to northern South America and the Antilles, cultivated in the tropics.

http://www.tramil.net/fototeca/plant280

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : The forests of French Guiana occupy a central part of the region’s potential resource base, but as yet remain almost completely unexploited. This stems from the forestry industry struggling to valorize wood stocks of a high diversity with an extremely heterogeneous distribution. Indeed, identifying essences for future propagation is an issue of both environmental and socio-economic importance for the region. Bagassa guianensis Aubl. and Cordia alliodora (Ruiz & Pav.) Oken. go against conventional models, in that they display the life history characteristics of rapid growth and wood of high quality, and thus are species of high potential for future plantations. Firstly, our study of growth characteristics reveals a defined strategy half way between long-lived species and pioneer species. It is the variability of basic density of wood which is a key trait allowing for such a development, favoring rapid growth in initial years whilst allowing for tree longevity. Secondly, the analysis of a range of wood properties (shrinkage, modulus of elasticity, durability) in relation to tree growth confirms the technologic quality of the two species. It also enables the emergence of new results like the effect of extractives on wood stability, the control of growth as a result of basic density variation, the evolution of leaf traits throughout tree development or the improvement of trunk maintenance thanks to interlocked grain. The knowledge gained in relation to the developmental traits of these two species, and to the quality of their wood allows for the elaboration of plantation projects and what will be required for their success. The results of this study can orientate future studies on novel species for commercialization in French Guiana.
La ressource forestière en Guyane occupe une place maîtresse au sein de la région et est encore majoritairement préservée, mais la filière bois parvient difficilement à valoriser la biodiversité locale en raison de l’hétérogénéité de la ressource. Identifier les essences à planter demain représente aujourd’hui un enjeu à la fois environnemental, économique et social pour la Guyane. Bagassa guianensis Aubl. et Cordia alliodora (Ruiz & Pav.) Oken. vont à l’encontre des modèles usuels en associant vitesse de croissance et qualité du bois et sont identifiées comme prometteuses pour la plantation. Dans un premier temps, l’étude de la dynamique de croissance des deux espèces révèle un modèle écologique singulier, à la fois pionnières et longévives. La variabilité de l’infradensité dans l’arbre est l’élément clé qui permet un tel développement, favorisant une croissance rapide dans les premières années tout en assurant la longévité de l’individu. Dans une seconde partie, l’analyse d’un large panel de propriétés du bois (retrait, module, durabilité) en lien avec le développement de l’arbre confirme les qualités technologiques des deux espèces et permet l’émergence de résultats novateurs tels que le rôle des extractibles sur le retrait, le contrôle de la croissance grâce aux variations d’infradensité, l’évolution des traits foliaires au cours de l’ontogénie ou encore la mise en place de contrefil dans l’arbre pour assurer son maintien. La connaissance acquise vis-à-vis du mode de développement de ces deux espèces et des facteurs influençant la qualité de leur bois permet aujourd’hui de définir avec plus de précision le cadre d’un projet de plantation et les conditions de son succès. Les résultats de cette étude permettent finalement d’orienter la recherche de nouvelles espèces d’avenir pour la plantation en Guyane.
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01338281

tel-01338281
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01338281
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01338281/file/Th%C3%A8se%20Julie%20Bossu.pdf