Les capacités osmorégulatrices chez la crevette bleue Litopenaeus stylirostris, au cours de l’ontogenèse Auteur(s) : Pham, Dominique Éditeur(s) : Université de la Polynésie Française Résumé : The ontogeny of osmoregulation was studied in the blue shrimp Litopenaeus stylirostris in New Caledonia. The implication of branchial organs in ionic regulation was first demonstrated in juveniles by immunolocalization of three ion transporting proteins ( namely NKA, co-transporter NKCC1 and CFTR ) and ionocyte detection was done by means of electron microscopy. The role of the main ion transporting enzyme, NKA, was subsequently investigated during post-embryonic development using an integrative approach associating physiological, histological, immunological and biomolecular studies. Results obtained allowed us to propose a model of the osmoregulatory pattern in L. stylirostris based on weak regulation in the early stages, then progressively this species acquires the adult pattern of hyper-hypo-regulation after metamorphosis with the concurrent development of epipodites and gills. Strong NKA immunofluorescence and abundance of NKA transcripts in these two tissues compared to others organs suggest their functional implication in osmoregulatory processes. The results of this study allow us to increase our knowledge of the penaeid shrimp osmoregulation and to propose zootechnical measures to improve the animal physiological comfort. These propositions have been already tested during larval rearing trials, leading a two-fold-growth in 19 days-old postlarvae. L’étude de l’ontogenèse de l’osmorégulation a été entreprise chez la crevette bleue Litopenaeus stylirostris en Nouvelle-Calédonie. L’implication des tissus de la cavité branchiale dans la régulation ionique a été déterminée au préalable chez des juvéniles par immunolocalisation de trois transporteurs protéiques d’ions, ( la NKA, le co-transporteur NKCC1 et le CFTR ) et par la détection de ionocytes en microscopie électronique. Le rôle de la NKA a été particulièrement étudié et son implication a été examinée au cours du développement post-embryonnaire par une approche intégrative associant des études physiologiques, histologiques, immunologiques et moléculaires. Cette démarche nous a permis de proposer un modèle d’osmorégulation chez L. stylirostris: de faible régulatrice dans les premiers jours de sa vie, cette espèce évolue vers l’hyper-hypo-régulation après la métamorphose avec le développement progressif des épipodites et des branchies. L’immunofluorescence prononcée de la NKA ainsi que l’abondance des transcrits du gène codant la NKA dans les tissus de ces deux organes suggèrent leur implication fonctionnelle dans l’ionorégulation. Les résultats de ce travail nous ont permis d’accroître nos connaissances sur l’osmorégulation chez les pénéidés et de proposer des améliorations zootechniques visant à augmenter leur confort physiologique. Ces préconisations ont fait l’objet de premiers essais en conditions d’élevage et se sont traduites par un doublement de la croissance des post-larves de 19 jours. Droits : 2011 The author, Univ. Polynésie Française http://archimer.ifremer.fr/doc/00052/16314/13816.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00052/16314/ | Partager |
Étude fonctionnelle et structurale de certains domaines des spectrines érythroïdes et non érythroïdes : site de tétramérisation et domaine SH3 Auteur(s) : Nicolas, Gaël Auteurs secondaires : Protéines de la membrane érythrocytaire et homologues non-érythroides ; Université des Antilles et de la Guyane (UAG) - Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS) - Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7) - Université de la Réunion (UR) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) Université Paris-Diderot - Paris VII Marie-Christine Lecomte(marie-christine.lecomte@inserm.fr) Éditeur(s) : HAL CCSD Résumé : contient des versions PDF d'articles scientifiques (versions éditeur) Spectrins are actin binding proteins that constitute the main components of membrane skeletons, the protein network located under the plasma membrane. Erythroid or non erythroid (in this case, they are called fodrins), spectrins play an important structural function in the membrane as demonstrated in the red blood cell. Spectrins are composed of two long α and β chains, associated in tetramers (αβ)2, forming the long flexible filaments of the network. Both chains are composed of repeating units which are folded in a triple helical arrangement (A, B and C helices), except for segment α10 which corresponds to a Src Homology 3 domain (SH3). The head-to-head interaction between dimers implies the N-terminal end of α chain and the C-terminal end of β chain. A model was proposed for the tetramerization site of spectrin : the two A and B helices of the last repeat of α chain interact with the C helix of the β chain in order to constitute a triple-helical structure similar to the repeats along the remainder of spectrin molecule. This model was first inferred from the relationship between the severity of the spectrin self-association defect and the location of the underlying mutations found in hereditary elliptocytosis (HE). Using recombinant peptides we defined the region, on both chains, which was sufficient and necessary to generate a fully functional tetramerization site. Producing peptides carrying a βHE mutation, we reproduced the tetramerization defect as observed in red blood cells of patients. Finally, the presence of an SH3 domain probably gives to spectrins new functions which are different from the stability of the membrane. After contesting the existence of interaction between the fodrin SH3 domain and the α subunit of epithelial sodium channel sensitive to amiloride, we searched for partners of this domain, by screening a rat kidney library with the yeast two-hybrid system. We identified severals proteins implicated in the actin polymerization asoociated with motility or cell differenciation, suggesting that SH3 domain could play a part in this process. Les spectrines, protéines liant l'actine, sont des constituants majeurs du squelette membranaire, réseau multiprotéique localisé sous la membrane plasmique. Érythroïdes ou non érythroïdes (dans ce cas, on les appelle fodrines), les spectrines ont un rôle structural important dans la membrane comme cela a déjà été démontré, pour la spectrine, dans le globule rouge. Elles sont constituées de deux longues chaînes a et ß associées côte à côte en tétramères (aß)2 qui forment les longs filaments du réseau. Chacune des chaînes est composée par la répétition de segments homologues, 22 pour a et 17 pour ß. Ces segments sont constitués de trois hélices a (hélices A, B et C) repliées sur elles-mêmes. Cette succession de structures trihélicoïdales est parfois interrompue par un domaine particulier comme le domaine SH3 (Src Homology 3) présent au milieu de la chaîne a. Les tétramères (aß)2 de spectrine constituent les filaments du squelette membranaire. L'interaction tête-à-tête de deux dimères aß implique les extrémités NH2 de la chaîne a et COOH de la chaîne ß. D'une part la sévérité du défaut d'auto-association et la localisation des mutations associées à celui-ci et d'autre part, les séquences en acides aminés des extrémités impliquées dans le site d'auto-association ont permis de proposer un modèle : la première hélice C isolée de la chaîne a pourrait s'associer aux deux dernières hélices A et B de la chaîne ß pour reconstituer une unité conformationnelle trihélicoïdale semblable à celles observées le long de la molécule. Un défaut dans la formation du tétramère est le support moléculaire le plus fréquemment observé dans les elliptocytoses héréditaires (HE). À l'aide de peptides recombinants, nous avons défini, sur les deux chaînes, les régions nécessaires et suffisantes possédant les caractéristiques pleinement fonctionnelles du site de tétramérisation. Nous avons ensuite, par mutagenèse dirigée, reproduit le lien entre la présence de mutations HE localisées dans les hélices A ou B et le défaut d'auto-association observé dans les globules rouges de patients HE. La présence d'un domaine SH3 localisé au milieu de la chaîne a confère probablement aux spectrine des fonctions autres que le maintien et la stabilité de la membrane. Les SH3, petits domaines protéiques, participent aux interactions protéine/protéine. Le seul partenaire connu du domaine SH3 de la fodrine était la sous-unité a du canal sodium sensible à l'amiloride (ENaC) mais la fonction de ce complexe n'était pas encore caractérisée. À l'aide de différentes méthodes, nous avons remis en cause l'interaction directe entre ENaC et le SH3 de la fodrine. La fonction de ce domaine SH3 étant liée à la nature de son ligand, nous avons donc recherché les partenaires putatifs du domaine SH3 de la fodrine par la technique du double-hybride. 29 partenaires ont été identifiés, regroupés en 19 familles et 10 clones isolés. La spécificité des interactions a été étudiée à la fois par double-hybride, à l'aide de mutants du domaine SH3 de la fodrine produits par mutagenèse dirigée. Les interactions vis-à-vis d'autres domaines SH3 (spectrine ou une protéine de levure non relatée Scd2) ont été également analysées. Enfin, la spécificité de certains partenaires a été confirmée par des études d'interactions in vitro. Deux des protéines les plus spécifiques du domaine SH3 de la fodrine sont des protéines tyrosine-phosphatase PTP. La première est l'isoforme A de PTP de faible poids moléculaire (LMPTPA) mais l'interaction n'a pas été confirmée in vitro. La deuxième, TD14, est une nouvelle PTP dont la seule fonction connue est d'inhiber la formation des foyers tumoraux des cellules surexprimant l'oncogène Ha-ras. Ces PTP pourraient soit déphosphoryler la fodrine, soit être recrutées sous la membrane pour déphosphoryler une autre cible. Nous avons également identifié trois partenaires (N-WASP, Evl et une protéine de la famille des formines) suggérant que les domaines SH3 des spectrines pourraient être impliqués dans les processus de polymérisation de l'actine liés à la mobilité ou la différenciation cellulaire. Mot clés : spectrine, fodrine, tétramérisation, SH3, double-hybride, polymérisation de l'actine https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00284819 Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess tel-00284819 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00284819 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00284819/document https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00284819/file/Nicolas_1999_-_These.pdf | Partager |
Hydrophobic cluster analysis and modeling of the human Rh protein three-dimensional structures Auteur(s) : Callebaut, I. Dulin, F. Bertrand, O. Ripoche, P. Mouro, I. Colin, Y. Mornon, J.-P. Cartron, J.-P. Auteurs secondaires : Institut de minéralogie et de physique des milieux condensés (IMPMC) ; Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC) - IPG PARIS - Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Protéines de la membrane érythrocytaire et homologues non-érythroides ; Université des Antilles et de la Guyane (UAG) - Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS) - Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7) - Université de la Réunion (UR) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier Résumé : International audience Rh (Rhesus) is a major blood group system in man, which is clinically significant in transfusion medicine. Rh antigens are carried by an oligomer of two major erythroid specific polypeptides, the Rh (D and CcEe) proteins and the RhAG glycoprotein, that shared a common predicted structure with 12 transmembrane a-helices (M0 to M11). Non erythroid homologues of these proteins have been identified (RhBG and RhCG), notably in diverse organs specialized in ammonia production and excretion, such as kidney, liver and intestine. Phylogenetic studies and experimental evidence have shown that these proteins belong to the Amt/Mep/Rh protein superfamily of ammonium/methylammonium permease, but another view suggests that Rh proteins might function as CO2 gas channels. Until recently no information on the structure of these proteins were available. However, in the last two years, new insight has been gained into the structural features of Rh proteins (through the determination of the crystal structures of bacterial AmtB and archeaebacterial Amt-1. Here, models of the subunit and oligomeric architecture of human Rh proteins are proposed, based on a refined alignment with and crystal structure of the bacterial ammonia transporter AmtB, a member of the Amt/Mep/Rh superfamily. This alignment was performed considering invariant structural features, which were revealed through Hydrophobic Cluster Analysis, and led to propose alternative predictions for the less conserved regions, particularly in the N-terminal sequences. The Rh models, on which an additional Rh-specific, N-terminal helix M0 was tentatively positioned, were further assessed through the consideration of biochemical and immunochemical data, as well as of stereochemical and topological constraints. These models highlighted some Rh specific features that have not yet been reported. Among these, are the prediction of some critical residues, which may play a role in the channel function, but also in the stability of the subunit structure and oligomeric assembly. These results provide a basis to further understand the structure/function relationships of Rh proteins, and the alterations occurring in variant phenotypes. ISSN: 1246-7820 hal-00112914 https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00112914 DOI : 10.1016/j.tracli.2006.02.001 | Partager |