Éditeur(s) : HAL CCSD American Society for Microbiology
Résumé : International audience
Molecular diagnosis of congenital toxoplasmosis or disseminated toxoplasmosis is based mainly on PCR. The repeated DNA element rep529 has become the main DNA target used in most PCR methods, whether laboratory developed or commercial. In this multicenter study, we evaluated the Toxoplasma ELITe MGB (Elitech) commercial kit by comparison with three reference quantitative PCR assays (RAs) used routinely in three proficient laboratories of the French National Reference Center for Toxoplasmosis network, using Toxoplasma calibrated suspensions diluted to obtain a range of concentrations from 0.1 to 10,000 parasites/ml. These suspensions were extracted with either the DNA extraction kit (EXTRAblood; Elitech) recommended by the manufacturer or the QIAamp DNA minikit (Qiagen). The Toxoplasma ELITe MGB assay was also evaluated on a panel of 128 clinical samples, including 56 amniotic fluid samples, 55 placenta samples, and various other samples, of which 95 originated from patients with proven toxoplasmosis. The ELITe MGB assay amplified low-concentration replicates (<10 parasites/ml) of calibrated suspensions less frequently than the RAs of 2/3 laboratories. Additionally, the combination of EXTRAblood and Toxoplasma ELITe MGB yielded poorer sensitivity than the combination of QIAamp DNA minikit and ELITe MGB for low parasite concentrations (P < 0.001 for 1 parasite/ml). On clinical samples, the sensitivity and the specificity of the commercial assay were 89% and 100%, respectively. The sensitivity ranged from 79% (placenta samples) to 100% (amniotic fluid samples). Overall, this study shows that the Toxoplasma ELITe MGB assay is suitable for the diagnosis of toxoplasmosis from non-cell-rich or non-hemoglobin-rich samples and that the EXTRAblood kit is not optimal.
ISSN: 0095-1137

hal-01526432
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01526432
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01526432/document
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01526432/file/Evaluation%20of%20the%20Toxoplasma.pdf
DOI : 10.1128/JCM.02379-16

Éditeur(s) : HAL CCSD American Society for Microbiology
Résumé : International audience
Toxoplasmosis is a life-threatening infection in immunocompromised patients (ICPs). The definite diagnosis relies on parasite DNA detection, but the incidence and burden of disease are ill-known in HIV-negative patients. A three-year retrospective study was conducted in 15 reference laboratories from the network of the French National Reference Center for Toxoplasmosis, to record the frequency of Toxoplasma DNA detection in ICPs, to review the molecular methods used for diagnosis and the prevention measures implemented in transplant patients. During the study period, out of 31,640 PCR performed in ICPs, 610 were positive (323 patients). Blood (n=337), cerebrospinal fluid (n=101) and aqueous humor (n=100) samples were more frequently positive. Chemoprophylaxis schemes in transplant patients differed between centers. PCR follow-up of allogeneic hematopoietic stem-cell transplant (allo-HSCT) patients was implemented in 8/15 centers. Data from 180 patients (13 centers) were further analyzed regarding clinical setting and outcome. Only 68/180 (38%) patients were HIV+; the remaining 62% consisted in 72 HSCT, 14 solid-organ transplants, and 26 miscellaneous immunodeficiencies. Cerebral toxoplasmosis and disseminated toxoplasmosis were most frequently observed in HIV and transplant patients, respectively. Of 72 allo-HSCT patients with a positive PCR, 23 were asymptomatic; all were diagnosed in centers performing systematic blood PCR follow-up, and received specific treatment. Overall survival of allo-HSCT patients at two months was better in centers with PCR follow-up than in other centers (p<0.01). This study provides updated data on the frequency of toxoplasmosis in HIV-negative ICPs and suggests that regular PCR follow-up of allo-HSCT patients could guide pre-emptive treatment and improve outcome.
ISSN: 0095-1137

hal-01134189
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01134189
DOI : 10.1128/JCM.03282-14
PUBMED : 25762774

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : National audience
Comme c'est le cas pour toute innovation technique, l'avènement de la Télévision Numérique Terrestre (TNT) en France repose sur un ensemble d'imaginaires technologiques. En effet, l'illusion techniciste se cristallise autour de la croyance collective selon laquelle la technique recélerait des vertus humanistes, à savoir, le progrès, le développement, la démocratie, la réduction des inégalités, la rencontre, l'échange, le partage, etc. La TNT est d'abord une technologie prometteuse qui performe le mode de diffusion hertzienne. Elle permet de diffuser sur un même canal hertzien de six à dix chaînes au lieu d'une seule en analogique. Elle augmente l'offre de programmes (chaînes nationales publiques et privées, chaînes locales publiques et privées) en proposant un bouquet de chaînes gratuites en qualité numérique. Ainsi, la TNT se présente comme une technologie produite avec la volonté de répondre aux attentes des utilisateurs en termes de confort visuel et sonore. Dans la perspective de l'arrêt de la diffusion hertzienne analogique, la TNT permet également d'allouer les fréquences libérées à d'autres modes de télécommunication en pleine expansion tels que la radio numérique, la télévision mobile personnelle, Internet sans fil, les télécommunications professionnelles, la téléphonie, etc.
L'OUVERTURE NUMERIQUE: DU LOCAL AU GLOBAL La télévision numérique terrestre dans les DOM : quels enjeux socio-économiques et socioculturels pour nos sociétés ultramarines ?
Lamentin (Guadeloupe), France

hal-01152892
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01152892
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01152892/document
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01152892/file/Identites_regionales_vs_Televison_Numerique_Terrestre.pdf

Éditeur(s) : HAL CCSD Réseau « Développement durable et territoires fragiles »
Résumé : The Green and Blue infrastructure (Trame verte et bleue –TVB) is a new conservation policy tool based on the notions of ecological network and corridor. The introduction of this new instrument through the French Grenelle environment commitments brings about some change in the spatial strategy of the conservation policy. Beyond the identification of priority conservation areas, ecological planning of all the territory is concerned. The TVB’s implementation process establishes the connection of multi and nested decisional and action levels. It thus creates specific situations of complexity and uncertainty that require innovation and perpetual change of governance. The study of the Auvergne region case through the adaptive governance analytical framework highlights the potential fruitful role of Regional nature parks in such dynamics of change and learning. Mots-clés : aménagement durable des territoires, biodiversité, réseau écologique, corridor écologique, gouvernance adaptative, socio-écosystème, trame verte et bleue Keywords : Sustainable landplaning, Biodiversity, Ecological network, Adaptive governance, socio-ecosystem
La Trame verte et bleue (TVB), nouveau dispositif d’action publique visant à enrayer la perte de biodiversité traduit un renouvellement des référentiels de justification des politiques de conservation et de leur stratégie territoriale. Il s’agit d’intégrer la planification écologique dans l’aménagement de l’ensemble du territoire. Le processus de territorialisation de la TVB met en rapport de multiples niveaux de décision et d’action imbriqués. Il crée de ce fait des configurations inédites de complexité et d’incertitude et implique des innovations en termes de gouvernance que le cadre analytique de la gouvernance adaptative permet d’appréhender. En nous appuyant sur l’exemple du Parc Naturel Régional des Volcans d’Auvergne, nous analysons le rôle que ces institutions sont susceptibles de jouer dans ces dynamiques de changement et d’apprentissage socio-technique et politique qui conditionnent une mise en œuvre effective de la TVB.
ISSN: 1772-9971

hal-01195370
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01195370
DOI : 10.4000/developpementdurable.9675
PRODINRA : 269288

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag
Résumé : A detailed and integrated geologic–hydraulic–geophysical–geochemical study of groundwater flow in the near-vicinity of a borehole drilled into fractured and karstified limestone demonstrates the power of such an integrated approach in localising and characterising preferential groundwater flow pathways and ambient borehole flow. The study, conducted in the vicinity of a 100-m-deep research borehole on the island of Mallorca, achieves such characterisation on a scale from millimetres to tens of metres in scale. More specifically, it adds single packer and open-hole pumping test interpretations to the results obtained during fluid logging, impeller flowmeter testing, borehole imaging, core descriptions and an innovative fracture analysis. This approach allows the delineation of the main flowing features and showed that such features are directly or indirectly linked to karst phenomena. Understanding this complex flow system is critical for an appropriate assessment of groundwater resources and the design of sustainable groundwater production schemes.
ISSN: 1431-2174

hal-00404921
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00404921
DOI : 10.1007/s10040-006-0086-4

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Tectonically controlled landforms develop morphologic features that provide useful markers to investigate crustal deformation and relief growth dynamics. In this paper, we present results of morphotectonic experiments obtained with an innovative approach combining tectonic and surface processes (erosion, transport, and sedimentation), coupled with accurate model monitoring techniques. This approach allows for a qualitative and quantitative analysis of landscape evolution in response to active deformation in the three end-member geological settings: compression, extension, and strike–slip.Experimental results outline first that experimental morphologies evolve significantly at a short time scale. Numerous morphologic markers form continuously, but their lifetime is generally short because erosion and sedimentation processes tend to destroy or bury them. For the compressional setting, the formation of terraces above an active thrust appears mainly controlled by narrowing and incision of the main channel through the uplifting hanging-wall and by avulsion of deposits on fan-like bodies. Terrace formation is irregular even under steady tectonic rates and erosional conditions. Terrace deformation analysis allows retrieving the growth history of the structure and the fault slip rate evolution. For the extensional setting, the dynamics of hanging-wall sedimentary filling appears to control the position of the base level, which in turn controls footwall erosion. Two phases of relief evolution can be evidenced: the first is a phase of relief growth, and the second is a phase of upstream propagation of topographic equilibrium that is reached first in the sedimentary basin. During the phase of relief growth, the formation of triangular facets occurs by degradation of the fault scarp, and their geometry (height) becomes stationary during the phase of upstream propagation of the topographic equilibrium. For the strike–slip setting, the complex morphology of the wrench zone, composed of several interacting fault segments, enhances the interactions with the drainage network. Because of the widening of the main fault zone toward the surface, a significant amount of distributed deformation is observed along the wrench zone. Locally, where two terminations of fault segments interact, less than a quarter of the far field displacement can remain measurable using fault offsets, leading to a systematic underestimation of the real fault slip rate.These different experimental examples illustrate the great potential of the approach coupling deformation mechanisms and erosion–transport–sedimentation processes to investigate qualitatively and quantitatively the morphotectonic evolution of tectonically controlled landscapes.
ISSN: 0169-555X

hal-01243587
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01243587
DOI : 10.1016/j.geomorph.2015.02.011

Éditeur(s) : HAL CCSD Presses Universitaires du Septentrion
Résumé : aménagement durable des territoires; biodiversité; réseau écologique; corridor écologique; gouvernance adaptative; socio-écosystème; trame verte et bleue
La Trame verte et bleue (TVB), nouveau dispositif d'action publique visant à enrayer la perte de biodiversité traduit un renouvellement des référentiels de justification des politiques de conservation et de leur stratégie territoriale. Il s'agit d'intégrer la planification écologique dans l'aménagement de l'ensemble du territoire. Le processus de territorialisation de la TVB met en rapport de multiples niveaux de décision et d'action imbriqués. Il crée de ce fait des configurations inédites de complexité et d'incertitude et implique des innovations en termes de gouvernance que le cadre analytique de la gouvernance adaptative permet d'appréhender. En nous appuyant sur l'exemple du Parc Naturel Régional des Volcans d'Auvergne, nous analysons le rôle que ces institutions sont susceptibles de jouer dans ces dynamiques de changement et d'apprentissage socio-technique et politique qui conditionnent une mise en œuvre effective de la TVB.
Développement durable et territoire, Nouvelle édition originale

ISBN : 978-2-7574-0157-6
hal-00979599
https://hal-agroparistech.archives-ouvertes.fr/hal-00979599

Éditeur(s) : Paris : chez Desenne Paris : chez Moutardier Paris : chez de Bure
Description : Jacques-François Dutrône de La Couture, a été envoyé par le Ministre de la Marine à Saint Domingue afin d'augmenter la productivité des habitations de canne à sucre. L'auteur lui-même qualifie les innovations qu'il apporte de passage de l'art du sucrier à l'industrie du sucre. Son ouvrage présente dans une première partie une description détaillée de la canne à sucre et de son suc, et dans une seconde partie de son exploitation et de son extraction. Il donne ainsi de nouveaux moyens techniques sur le raffinage, la cristallisation, les fourneaux ou encore les chaudières, mais aussi sur une organisation du travail plus rationnel.
Siècle(s) traité(s) : 18
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Guyane. Bibliothèque Alexandre-Franconie
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/HASH0125680c1a5a4bcd50197a30
HASH0125680c1a5a4bcd50197a30