Éditeur(s) : HAL CCSD Ecole nationale du génie rural
Résumé :  
Les forêts hétérogènes guyanaises sont des milieux complexes dont la gestion passe par la compréhension de leur organisation (structure spatiale, horizontale et verticale et diversité spécifique) et de leur dynamique. Dans ce contexte, l'étude des stratégies de développement et d'occupation de l'espace des arbres permet de mieux comprendre comment les différentes espèces exploitent et structurent l'hétérogénéité du milieu. Depuis une trentaine d'années, les travaux menés en architecture végétale ont permis d'établir un contexte méthodologique et conceptuel pour étudier la structure globale de l'arbre et pour comprendre les mécanismes morphologiques qui lui ont donné naissance. Après une présentation de concepts majeurs d'architecture végétale, cet article expose les méthodes employées pour quantifier la structure des arbres et les approches permettant d'intégrer les critères architecturaux dans un diagnostic à l'échelle du peuplement.
ISSN: 0035-2829

hal-01032084
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032084

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : il s'agit d'un type de produit dont les métadonnées ne correspondent pas aux métadonnées attendues dans les autres types de produit : ACTIVITY_REPORT
Understanding genomic evolution in wild populations is of particular importance because evolution is a central process in our understanding of populations’ history and their future response to global changes. In addition to fundamental knowledge, the study of populations’ evolution has wide applications such as conservation/restoration genetics or epidemiology. Indeed, genetic diversity is the ‘fuel’ for populations’ evolution and adaptation to new conditions, and estimating the extent and the geographic structure of genetic diversity, as well as identifying the evolutionary forces behind (demography, gene flow, and adaptation) are thus major challenges in the current context of global changes. [br/]A particular attention is currently devoted to the process of genetic divergence in wild populations, with emphases on gene flow, local adaptation, and their interactions. Indeed, adaptation in wild populations is supported in many species by many kinds of experiments based on both quantitative phenotypic traits and molecular data. However, the processes governing populations’ evolution are poorly understood in the tropical rainforest of Amazonia, and the relative influence of neutral and adaptive processes are continuously discussed. [br/]I am a young scientist interested in the process of genomic divergence in wild (tree) populations. I aimed at understanding how evolution structures the genetic diversity and governs molecular divergence in wild populations, with particular emphases on gene flow and local adaptation. During five years as a young scientist, I worked on answering the following questions, focusing on two tree species occupying vulnerable areas: mainly [i]Eperua falcata[/i] in Amazonia and, to a lesser extent, [i]Abies alba[/i] in the Mediterranean area.[br/][u]Scientific questions:[/u][br/]- Which evolutionary drivers are responsible of the structure of genetic diversity in wild populations occupying wide areas? This question was addressed at different geographical scales: from large (regional) to very local (microgeographic) scales. [br/]- What is the relative influence of neutral (gene flow, inbreeding) and adaptive drivers in the process of genetic divergence?[br/]- Is microgeographic adaptation possible in spite of extensive gene flow between populations occupying the extreme boundaries of an ecological gradient? [br/]- What is the extent of natural selection in the (whole) genome of wild populations? [br/][br/]My research work is at the interface between three promising disciplines: Evolutionary genomics (i.e. the study of populations evolution and the evolutionary drivers behind), Bioinformatics (i.e. the treatment of next-generation data), and Bayesian modelling (i.e. the empirical calibration of complex mechanistic model). I intend to take advantage of the recent advances in sequencing and informatic technologies to bring up to date the field of ecological genetics and evolutionary biology, by developing modern research strategies to study the process of genomic divergence in wild populations.
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01204218

hal-01204218
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01204218
PRODINRA : 286326

Siècle(s) traité(s) : 16
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Guyane. Bibliothèque Alexandre-Franconie
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/FRA11053
FRA11053

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé :   Diplôme : DEA
il s'agit d'un type de produit dont les métadonnées ne correspondent pas aux métadonnées attendues dans les autres types de produit : DISSERTATION
Tropical rainforests are complex ecosystems, rarely investigated from ground-level. The canopy, highest part of the cover, can on the other hand be studied by several remote sensing tools. The aim of this study is to assess in what way the canopy is related to the forest structure below and the forest dynamic. We looked for correlation between the canopy texture (crown size) observed from aerial photographs and various parameters of the forest (spatial and demographic structure, forest dynamic, floristic structure). We worked on the Paracou experimental device, in French Guiana, at two different scales. 1- At a local scale (6.5 ha ; scale of the photographs 1: 4 000), we demarcated six sub-plots with big crowns in the canopy and six with small crowns. 2- At a forest scale (approximately one hundred ha ; scale of the photograph 1: 25 000), we compared 2 forest plots: one with a rough canopy texture and one with a smooth canopy texture. We found that the size of the crowns in the canopy do not express the same characteristics of the fore according to the scale of study : at the local scale, difference in crown size means a difference in basal area but not in density, while at the forest scale it is the opposite. Several hypotheses related to the sylvigenetic cycle, the floristic structure or the nature of the substratum are suggested to explain these results.
Les forêts tropicales humides (FTH) sont des écosystèmes complexes difficiles à étudier depuis le sol. Leur canopée, partie supérieure du couvert, est en revanche abordable par divers outils de télédétection. Cette étude vise à déterminer en quoi la structure de la canopée est le reflet de la structure forestière sous-jacente et de la dynamique spatio-temporelle qui s'y exerce. Nous avons donc recherché des corrélations, entre la texture de canopée (taille des couronnes) vue sur des photographies aériennes, et différents paramètres de la forêt sous-jacente (structure spatiale et démographique, dynamique forestière, structure floristique). Ce travail a été abordé sur le dispositif expérimental forestier de Paracou, en Guyane Française, à 2 échelles différentes. 1- A l'échelle de la parcelle (6,5 ha ; photographies au 1: 4 000), nous avons délimité des placettes à grosses couronnes en canopée et des placettes à petites couronnes. 2- A l'échelle du massif forestier (une centaine d'ha ; photographies IGN au 1: 25 000) nous comparons une parcelle de texture de canopée, grossière et une parcelle de texture fine. Le résultat principal de notre étude est que la taille des couronnes en canopée ne reflète pas les mêmes caractéristiques du couvert selon l'échelle de l’étude : à l'échelle de la parcelle, des différences de taille de couronnes traduisent des différences de surface terrière mais pas de densité, tandis qu'à l'échelle du massif forestier c'est l'inverse. Plusieurs hypothèses, invoquant des différences dans le stade sylvigénétique, la composition floristique ou la nature du substrat des placettes ou parcelles comparées, sont proposées pour expliquer ces résultats.
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189180

hal-01189180
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189180
PRODINRA : 12184

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley
Résumé : International audience
Le but de cette étude est de relier les variations des descripteurs de structure (densité du peuplement, surface terrière, biomasse aérienne) et de dynamique (croissance des arbres, taux de mortalité et de recrutement, flux de biomasse) de la forêt tropicale à la surface des parcelles forestières et à l'intervalle de temps entre les inventaires forestiers. Un jeu de données provenant d'un large réseau de parcelles recensé tous les 2 ans sur une période de 16 ans a été utilisé pour développer et paramétrer un nouveau modèle statistique de prédictions des coefficients de variations pour chacun des descripteurs étudiés. Plus de 90 % de la variabilité de ces coefficients de variation est prédit par un modèle statistique qui inclut la taille de la parcelle et l'intervalle de temps entre les inventaires. Tous les descripteurs de structure de la forêt varient de moins de 10% pour des parcelles de taille supérieure à 2 ha. Parmi les descripteurs de la dynamique forestière, le flux sortant de biomasse aérienne est le plus variable. Cinq parcelles de 6.25 ha sont nécessaires pour estimer sa moyenne, sur une période 16 ans, avec une erreur de 20 % sur la moyenne. Ceci contraste avec un flux entrant de biomasse aérienne, via la croissance et le recrutement, relativement constant. La croissance des arbres est remarquablement bien estimée avec moins de 15 % de variabilité pour une parcelle de 2 ha recensée tous les 2 ans. Ce travail fournit une méthode facile de quantification des limitations des jeux de données utilisés pour estimer les descripteurs de structure et de dynamique forestière. Ceci est un prérequis indispensable à l'analyse des effets du changement global sur les forêts tropicales.
ISSN: 0006-3606

hal-01093212
https://hal-agroparistech.archives-ouvertes.fr/hal-01093212
DOI : 10.1111/j.1744-7429.2010.00644.x

Éditeur(s) : Paris : Agence générale des colonies
Siècle(s) traité(s) : 20
Droits : Domaine public
Provenance : Archives territoriales de Guyane
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/GAD12017
GAD12017

Date de création : 1892-01-01

Éditeur(s) : Paris : Lecène et H. Oudin
Siècle(s) traité(s) : 19
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Guyane. Bibliothèque Alexandre-Franconie
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/FRA11045
FRA11045

Éditeur(s) : HAL CCSD Ecole nationale du génie rural
Résumé :  
En Guyane française où les sols sont généralement acides et pauvres en éléments minéraux, la forêt est caractérisée par sa plurispécificité. Une approche de type écologique a montré, dans les racines des principales espèces forestières, la dominance d'endomycorhizes à structure intracellulaire particulière : des hyphes de type Paris, spiralé. Leur rôle dans l'acquisition du phosphore a été étudié expérimentalement chez deux Césalpiniacées. Les semis d'Angélique, Dicorynia guianensis Amshoff, sont très dépendants, pour leur croissance et leur teneur en phosphore, des mycorhizes à mycélium spiralé ; ce type de mycélium représente plus de 90 % de la colonisation fongique. Par contre, les semis de Wapa (Eperua falcata Aublet) forment également des mycorhizes mais ces dernières améliorent le statut phosphaté et sont sans effet sur la croissance de cette espèce. Ces résultats contribuent à la compréhension du rôle des symbioses endomycorhiziennes dans le processus de régénération naturelle et ouvrent des perspectives de recherche quant à leur intervention éventuelle dans le maintien de la diversité forestière.
ISSN: 0035-2829

hal-01032211
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032211
DOI : 10.4267/2042/5820

Éditeur(s) : Paris : Challamel Ainé
Siècle(s) traité(s) : 19
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Martinique. Bibliothèque Schoelcher
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/SCH13182
SCH13182

Éditeur(s) : HAL CCSD Public Library of Science
Résumé : International audience
We conducted a survey along three belt transects located at increasing distances from the coast to determine whether a non-random arboreal ant assemblage, such as an ant mosaic, exists in the rainforest on the Masoala Peninsula, Madagascar. In most tropical rainforests, very populous colonies of territorially dominant arboreal ant species defend absolute territories distributed in a mosaic pattern. Among the 29 ant species recorded, only nine had colonies large enough to be considered potentially territorially dominant; the remaining species had smaller colonies and were considered non-dominant. Nevertheless, the null-model analyses used to examine the spatial structure of their assemblages did not reveal the existence of an ant mosaic. Inland, up to 44% of the trees were devoid of dominant arboreal ants, something not reported in other studies. While two Crematogaster species were not associated with one another, Brachymyrmex cordemoyi was positively associated with Technomyrmex albipes, which is considered an invasive species-a non-indigenous species that has an adverse ecological effect on the habitats it invades. The latter two species and Crematogaster ranavalonae were mutually exclusive. On the other hand, all of the trees in the coastal transect and at least 4 km of coast were occupied by T. albipes, and were interconnected by columns of workers. Technomyrmex albipes workers collected from different trees did not attack each other during confrontation tests, indicating that this species has formed a supercolony along the coast. Yet interspecific aggressiveness did occur between T. albipes and Crematogaster ranavalonae, a native species which is likely territorially dominant based on our intraspecific confrontation tests. These results suggest that the Masoala rainforest is threatened by a potential invasion by T. albipes, and that the penetration of this species further inland might be facilitated by the low density of native, territorially dominant arboreal ants normally able to limit its progression.
ISSN: 1932-6203

hal-00817444
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00817444
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00817444/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00817444/file/Dejean2010_Spatial.pdf
DOI : 10.1371/journal.pone.0009319

Éditeur(s) : Paris : Librairie Hachette et Cie
Siècle(s) traité(s) : 19
Provenance : Archives départementales de Guadeloupe
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/ADG18175
ADG18175

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag
Résumé : The patterns of the distribution of fungal species and their potential interactions with trees remain understudied in Neotropical rainforests, which harbor more than 16,000 tree species, mostly dominated by endomycorrhizal trees. Our hypothesis was that tree species shape the non-mycorrhizal fungal assemblages in soil and litter and that the diversity of fungal communities in these two compartments is partly dependent on the coverage of trees in the Neotropical rainforest. In French Guiana, a long-term plantation and a natural forest were selected to test this hypothesis. Fungal ITS1 regions were sequenced from soil and litter samples from within the vicinity of tree species. A broad range of fungal taxa was found, with 42 orders and 14 classes.Significant spatial heterogeneity in the fungal communities was found without strong variation in the species richness and evenness among the tree plots. However, tree species shaped the fungal assemblages in the soil and litter, explaining up to 18 % of the variation among the communities in the natural forest.These results demonstrate that vegetation cover has an important effect on the structure of fungal assemblages inhabiting the soil and litter in Amazonian forests, illustrating the relative impact of deterministic processes on fungal community structures in these highly diverse ecosystems.
ISSN: 0095-3628

hal-01595373
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01595373
DOI : 10.1007/s00248-016-0839-0
PRODINRA : 395655
PUBMED : 27645139

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag
Résumé : International audience
We explored the relationship between soil processes, estimated through soil respiration (Rsoil), and the spatial variation in forest structure, assessed through the distribution of tree size, in order to understand the determinism of spatial variations in Rsoil in a tropical forest. The influence of tree size was examined using an index (Ic) calculated for each tree as a function of (1) the trunk cross section area and (2) the distance from the measurement point. We investigated the relationships between Ic and litterfall,root mass and Rsoil, respectively. Strong significant relationships were found between Ic and both litterfall and root mass. Rsoil showed a large range of variations over the 1-ha experimental plot, from 1.5 to 12.6 gC m−2 d−1. The best relationship between Ic and Rsoil only explained 17% of the spatial variation in Rsoil. These results support the assumption that local spatial patterns in litter production and root mass depend on tree distribution in tropical forests. Our study also emphasizes the modest contribution of tree size distribution-which is mainly influenced by the presence of the biggest trees (among the large range size of the inventoried trees greater than 10 cm diameter at 1.30 m above ground level or at 0.5 m above the buttresses)-in explaining spatial variations in Rsoil.
ISSN: 0032-079X

hal-00797064
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00797064

Éditeur(s) : HAL CCSD Ecole nationale du génie rural
Résumé :  
La conservation des ressources génétiques forestières garantit le maintien d'une diversité élevée, donc l'adaptation des espèces forestières tropicales aux conditions écologiques actuelles et futures. Elle nécessite d'élaborer des stratégies appropriées à l'aménagement des forêts et, pour cela, d'appréhender tout d'abord le niveau et la structure de la diversité génétique, de comprendre et prévoir ensuite sa dynamique. C'est dans cet esprit qu'une collaboration a été entreprise entre la Guyane française et le Brésil, malgré les différences existant entre les deux systèmes de gestion. À partir de résultats sur les parcelles expérimentales de Paracou (Guyane) et Tapajós (Brésil), un ensemble intégré d'outils a été élaboré, allant d'une base de données et d'utilitaires cartographiques jusqu'à un modèle de simulation de la dynamique des structures génétiques et à un logiciel de gestion.
ISSN: 0035-2829

hal-01032246
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032246

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Diffusion du document : INRA Documentation de Centre, Domaine de Duclos, 97170 Petitt-Bourg (Guadeloupe, France) Diplôme : DEA
il s'agit d'un type de produit dont les métadonnées ne correspondent pas aux métadonnées attendues dans les autres types de produit : DISSERTATION
Basralocus (Dicorynia guianensis Amshoff, Caesalpiniaceae), first timber exploited species in French Guyana, shows a spatial aggregative distribution. In order to characterize Basralocus clump organisation, many approaches were used : the study of different forest variables (total height, diameter at breast height, .... j, a spatial analysis studied by population splitting in 3 classes according to their diameters at breast height and an architectural analysis. To evaluate the pertinence of different approach, 2 clump structures, located on control and logged plots,are compared. The trees of the logged clump have a smaller height and diameter. a slender habit, a taller crown and a better growth than the control. These 2 clumps stand out by a different number of mature trees and different types of spatial distribution of juvenile trees around them are possible. The opening of the environment by forestry provokes a Jump rejuvenation by the presence of numerous unbranched young trees. The architectural analysis helps to detect a large expression variability in growth strategies which can be reflected by different architectural vigours. The combination between forest variables, spatial and architectural analysis results could suggest a dynamic evolution of these 2 clumps.
L'Angélique (Dicorynia guianensis Amshoff, Caesalpiniaceae), première espèce exploitée Pour le bois d'oeuvre en Guyane française, a une répartition spatiale de type agrégatif. Afin de caractériser la structure d’un agrégat d'Angélique, plusieurs approches sont utilisées: une étude des différents paramètres dendrométriques (hauteur totale, diamètre à 1.30 m....j. une analyse spatiale réalisée en découpant la population des individus en 3 classes de diamètre bien distinctes et une analyse architecturale. Afin de valider la pertinence de ces approches, 2 agrégats, l'un en parcelle témoin et l'autre en parcelle exploitée pour le bois d'oeuvre, sont comparés. Ainsi, les arbres de l'agrégat exploité ont une hauteur et un diamètre plus petit, un port plus élancé, un houppier plus grand et une meilleure croissance. Ces 2 agrégats se distinguent par un nombre variable de semenciers et différents types de répartition spatiale des juvéniles autour de ceux-ci sont possibles. L'ouverture du milieu par l'exploitation forestière provoque un rajeunissement de l'agrégat souligné par la présence de nombreux individus jeunes non ramifiés. L'analyse architecturale permet de déceler une grande variabilité d'expression dans le développement qui se traduit par différentes vigueurs architecturales. En combinant les résultats des analyses dendrométrique, spatiale et architecturale, une évolution dynamique de la structure de ces 2 agrégats est proposée.
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189192

hal-01189192
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189192
PRODINRA : 13161

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : In the tropical rainforest of Amazonia, the factors driving the evolution of tree species remain poorly understood, and the relative influence of neutral and adaptive processes is continuously debated. In particular, local habitat patchiness draws much attention, as profound changes in the structure and composition of forest communities occur among micro-habitats. Thus, micro-environmental variations related to topography have frequently been invoked as drivers of adaptive radiation leading to sympatric speciation in Neotropical trees. On one hand, the hypothesis of local adaptation has never been investigated at the intra-specific level, i.e. within species currently undergoing population differentiation; on the other hand, many tree species are genetically structured over local scales due to neutral processes, mainly limited gene flow (caused by restricted pollen and seed dispersal). In this study, I used populations of a common tree species of the Guiana Shield - Eperua falcata (Fabaceae) - to study how neutral and adaptive processes shape the distribution of genetic diversity across forest landscapes characterized by local micro-habitat patchiness. I asked three main questions by combining both phenotypic (quantitative genetics) and molecular (population genetics) approaches: 1) How is the genetic diversity structured in forest landscapes of French Guiana? 2) Which evolutionary drivers are relevant to explain the structure of genetic diversity at local scale? 3) Does local adaptation contribute to structure genetic diversity within continuous populations?
En forêt tropicale humide Amazonienne, les facteurs gouvernant l'évolution des espèces d'arbres restent peu connus et continuellement débattus. En particulier, les micro-variations environnementales attirent beaucoup d'attention car elles induisent de profondes modifications de structure et composition des communautés. Les variations micro-environnementales associées à la topographie ont couramment été évoquées comme facteur de radiations adaptatives chez les espèces d'arbres. Cependant, l'hypothèse de l'adaptation locale n'a jamais été testée au niveau intra-spécifique chez les arbres de forêt amazonienne alors que l'on sait que la diversité génétique des arbres tropicaux est couramment structurée à faibles échelles spatiales par des processus neutres (en particulier du fait de restrictions de flux de gènes). Dans cette étude, j'ai étudié le processus de différentiation génétique d'une espèce d'arbre (Eperua falcata, Fabaceae) dans les paysages forestiers de Guyane française grâce à la combinaison d'une approche phénotypique (génétique quantitative) et d'une approche moléculaire (génétique des populations). Je me suis attachée à répondre à trois questions principales : 1) Comment se distribue la diversité génétique dans les paysages forestiers de Guyane française ? 2) Quelles forces évolutives sont impliquées dans le processus de différentiation génétique à faible échelle spatiale ? 3) Est-ce que le processus d'adaptation locale contribue à structurer la diversité génétique à faible échelle spatiale ?
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00967318

NNT : 2013LORR0188
tel-00967318
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00967318
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00967318/document
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00967318/file/THESE_Louise_Brousseau.pdf

Éditeur(s) : Gand : Imprimerie Victor Van Doosselaere
Siècle(s) traité(s) : 19
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Guyane. Bibliothèque Alexandre-Franconie
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/FRA11120
FRA11120

Éditeur(s) : Paris : Gauthier-Villars et Cie
Siècle(s) traité(s) : 20
Droits : Domaine public
Provenance : Archives territoriales de Guyane
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/GAD12018
GAD12018

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Séminaire de Synthèse du Projet FPPSM "Forêts, Parcs, Pauvreté au Sud de Madagascar"
A Madagascar, la déforestation mobilise toutes les recherches, mais il manque encore une base de données complète, référencée et réactualisable sur les dynamiques forestières. Une solution est la valorisation d'images satellitaires multidates qui, de ce fait, sont issues de capteurs différents en termes de résolution spatiale, radiométrique et temporelle (Spot, Landsat, Modis). Ces données géolocalisées sont volumineuses, elles doivent être normalisées puis stockées et finalement traitées. Face à l'hétérogénéité des données et traitements, l'interopérabilité des ressources est assurée par le standard ISO (International Standard Organisation) et la spécification OGC (Open Geospatial Consortium). Le traitement de séries chronologiques de la couverture forestière exige un outil réutilisable qui s'adapte à de nouvelles données satellitaires : des chaînes de traitement pour les données simples, des workflows pour les gros volumes de données. La modélisation du workflow est illustrée par la construction de sa base de connaissance en utilisant un contexte de travail.
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01370017

hal-01370017
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01370017
IRD : fdi:010066424

Éditeur(s) : Paris : Madame Huzard
Siècle(s) traité(s) : 19
Droits : Domaine public
Provenance : Archives territoriales de Guyane
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/GAD11034
GAD11034