Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : Le cantonnement de pêche est un outil administratif et juridique français employé pour la gestion de la ressource halieutique et la réglementation de la pêche sur un site marin défini. Cet outil a été mis en place à la Martinique (Petites Antilles) en 1999, à la demande des marins-pêcheurs confrontés à la raréfaction des stocks de poissons au sein de la bande côtière. Les autorités compétentes sur le milieu marin ont installé ce dispositif sur huit zones réparties autour de l’île (de la côte Atlantique à la côte Caraïbes). Le cantonnement de pêche reste peu documenté scientifiquement à ce jour, en dehors d’inventaires ichtyologiques réalisés par des scientifiques-biologistes. Il est donc opportun de retracer les étapes de la mise en place de cet outil et d’analyser les premiers résultats et les enjeux.
Cantonment fishing is a French legal and administrative tool used to manage fisheries resources and the regulation of fishing on marine site defined. This tool was developed in Martinique (Lesser Antilles) in 1999, at the request of fishermen facing depletion of fish stocks in the coastal strip. The competent authorities on the marine environment have installed this device on eight areas spread around the island (the Atlantic coast to the Caribbean coast). Cantonment fishing is little scientifically documented to date, apart from fishery surveys conducted by scientists-biologists. It is therefore appropriate to retrace the steps of the development of this tool and analyze the first results and challenges.
Martinique

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.6800
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/6800

Résumé : Depuis octobre 1992 une étude est conduite pour analyser les mécanismes de recrutement du stock de crevettes pénéïdes (Pelloeus subtilis) du plateau guyanais. En effet, le cycle de cette espèce étant très court, ces mécanismes conditionnent directement les rendements de la flottille industrielle crevettière guyanaise. Les variabilités intra et inter-annuelles du recrutement sont considérées comme très fortes, aussi une optimisation de la gestion de cette pêcherie passe par une meilleure compréhension de ces mécanismes et notamment de leurs facteurs de variation. Cette étude s'intègre dans un programme de coopération régionale entre l'IFREMER et le Ministère de l'Agriculture, de l'Elevage et des Pêches du Surinam financé par des fonds FEDER et du FIC, et elle est menée par l'IFREMER dans la Zone Economique française et le laboratoire du Département des pêches du Surinam sur le plateau de ce pays. Ce programme prévoit une série de huit campagnes en mer qui seront conduites en parallèle par chacun des deux laboratoires Français et Surinamien sur les plateaux de Guyane (campagnes RESUBGUY) et du Surinam (campagnes RESUBSUR) afin d'analyser le phénomène de recrutement sur la plus large échelle possible d'observation (plateau guyano-surinamien). Deux campagnes annuelles ont été programmées pour chaque pays, en mai et en octobre. La périodicité de ces campagnes est fonction des résultats des travaux conduits par l'IFREMER et l'ORSTOM sur la phase pré-recrutée de Penaeus subtilis qui ont mis en évidence deux principales périodes annuelles distinctes de recrutement (avril-mai; septembre-octobre). Cette campagne est la troisième de la série initiée en octobre 1992. L'étude n'est pas limitée à l'examen des seules captures de crevettes Penaeus subtilis, puisqu'elle inclue également l'analyse de la composition des prises accessoires des crevettiers. Les "by-catches" considérées dans ce travail sont surtout représentées par la crevette "sea-bob", Xiphopenaeus kroyeri, ainsi que par les principales espèces de poissons d'intérêt commercial (ou ayant une forte probabilité de le devenir dans un futur proche). Enfin, une attention particulière a aussi été portée sur les captures accidentelles de tortues marines afin d'en estimer l'importance réelle.

Droits : 1993 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00070/18148/15707.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00070/18148/

Résumé : Le cycle biologique du priucipal stock de crevettes pénéïdes (Penaeus subtilis) exploité sur le plateau continental guyanais est court (18 mois environ). Les variabilités intra et inter annuelles de l'abondance des individus appartenant aux différentes composantes des premières phases du cycle (larves, post-larves, juvéniles) sont très fortes, ce phénomène étant exacerbé par le double changement de milieu au cours du cycle, passage d'un habitat en eau salée à celui en eau douce puis retour au précédent. La pêcherie de la flottille crevettière guyanaise est ainsi basée sur un stock au renouvellement rapide et variable, aussi l'optimisation de sa gestion implique une meilleure compréhension des mécanismes de recrutement des crevettes et notamment de ses variabilités spatio-temporelles, intra et inter annuelles. Ainsi, depuis octobre 1992 une étude est conduite pour analyser ce mécanisme de recrutement Elle s'intègre dans un programme de coopération régionale entre l'IFREMER et le Ministère de l'Agriculture, de l'Elevage et des Pêches du Surinam financé par des fonds FEDER et du FIC, et elle est menée par l'IFREMER dans la Zone Economique française et le laboratoire du Département des pêches du Surinam sur le plateau surinamien. Ce programme prévoit une série de huit campagues en mer qui seront conduites en parallèle par chacun des deux laboratoires Français et Surinamien sur les plateaux de Guyane (campagues RESUBGUY) et du Surinam (campagnes RESUBSUR) afin d'analyser le phénomène de recrutement sur la plus large échelle possible d'observation (plateau guyano~urinaruien). Deux campagues annuelles ont été programmées pour chaque pays, en mai et en octobre. La périodicité de ces campagues est fonction des résultats des travaux conduits par l'IFREMER et l'ORSTOM sur la phase pré-recrutée de Penaeus subtilis qui ont mis en évidence deux principales périodes annuelles distinctes de recrutement (avril-mai; septembre-octobre). Cette étude n'est pas limitée pas à l'examen des seules captures de crevettes Penaeus subtilis, puisqu'elle inclue également l'analyse de la composition des prises accessoires des crevettiers. Les "by-catches" considérées dans ce travail sont surtout représentées par la crevette "sea-bob", Xiphopenaeus kroyeri, ainsi que par les principales espèces de poissons d'intérêt commercial (ou ayant une forte probabilité de le devenir dans un futur proche). Enfin, une attention particulière a aussi été portée sur les captures accidentelles de tortues marines afin d'en estimer l'importance réelle.

Droits : 1993 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00070/18155/15710.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00070/18155/

Résumé : La pêche illégale, non déclarée et non règlementée (INN) constitue partout dans le monde une menace pour la viabilité des pêcheries et pour la gestion et la conservation des ressources halieutiques et de la diversité biologique marine (FAO, 2007). En Union Européenne, tout est mis en œuvre pour combler les lacunes permettant aux opérateurs contrevenants de tirer profit de leurs activités: La Guyane, bien que Française constitue un cas particulier. La pêche y est le troisième secteur productif et malgré une croissance démographique importante, on n’y constate pas de surpêche (au sens halieutique). Cependant, la durabilité de la pêche y a été souvent remise en question par les professionnels ces dernières années à cause de la pêche illégale des pays frontaliers. Ce rapport présente les premiers résultats d’une quantification de cette pêche illégale, sur la base des données recueillies par la Marine nationale et la Gendarmerie maritime. Cette étude servira également pour affiner les estimations de stock, notamment le stock d’Acoupa rouge, dans le cadre du projet DEPECHE (Développement durable de la pêche côtière en Guyane : potentiel économique et bio-écologique).

Droits : 2012 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00114/22522/20202.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00114/22522/

Éditeur(s) : Actes du 6e colloque national BRG, La Rochelle, 2-3-4 octobre 2006
Résumé : Previous studies have shown heritable variation in larval developmental traits in the Pacific oyster Crassostrea gigas. In order to study the genetic consequences of production of oyster larvae in hatcheries, two factors, specific to hatcheries, were examined: the effect of discarding the smallest larvae (i.e. culling) and the effect of temperature (20°C versus 26°C). A mixed-family approach was used in order to infer the genetic composition of larval populations and family assignment, limiting possible environmental bias and allowing the study of a relatively large number of families using a limited number of larval tanks. Our results show that three multiplexed highly polymorphic microsatellite markers are a powerful tool for family assignment and, consequently, for the study of bivalve larvae genetics. Culling, by selective sieving of the smallest larvae is an advantageous practice at a phenotypic scale as it reduced variance in larval size, variance of developmental rate and time to settlement. Culling of 50% of the larval population only led to 15% less spat, showing a positive phenotypic correlation between larval growth and settlement success. However, culling represents a substantial risk for diversity loss, because it increases the variance of reproductive success among parental oysters. The effective population sizes of early settling cohorts of settlement were lower than those of later ones. Our results show that the settlement of slow growing larvae significantly contributes to minimizing the variability of reproductive success and therefore to maximizing genetic diversity. These results corroborate the low estimations of variability of broodstocks sampled in several French commercial hatcheries, relative to natural populations. The genetic composition of the larval population and the resulting spat was significantly different between the two tested temperatures, revealing genotype x environment interaction for survival. Similarly, genotype x environment interaction was also observed for larval growth as a higher temperature exerted a positive influence on the expression of genetic variability for this trait. Consequently, we can conclude that a temperature of 26°C coupled with culling, to common practice in oyster hatcheries, is likely to amplify the selection pressure for fast growing larvae. To test for this hypothesis, we compared larval developmental traits in the progeny of a hatchery broodstock closed for 7 generations, with the progeny of wild oysters and the two possible hybrids. Our results show that selection of fast growing larvae can counteract presumed inbreeding depression, due to higher mean relatedness among hatchery broodstock than in the wild. Genetic effects of intensive rearing conditions at larval stage are significant and should be taken into account in hatchery practices, especially in terms of genetic diversity management.
Afin d'étudier les conséquences génétiques des pratiques de production en écloserie d'huître creuse, deux facteurs ont été examinés : l'élimination des petites larves et la température. Nos résultats montrent que l'assignation de parenté par marqueurs microsatellites est un outil performant pour les études génétiques en phase larvaire de familles élevées en mélange. Bien qu'avantageux d'un point de vue phénotypique, le tamisage sélectif représente un risque de perte de diversité. La fixation des larves à croissance lente permet en effet de minimiser la variabilité du succès reproducteur et de fait, de maximiser la variabilité génétique. Ces résultats corroborent les estimations de variabilité sur les stocks d'écloseries françaises où l'on constate une diversité allélique inférieure à celle de populations issues du milieu naturel. La température exerce également une influence sur la précocité de l'expression de la variabilité génétique pour la croissance larvaire. Ainsi une température élevée associée à une procédure de tamisage peut amplifier l'effet sélectif. Enfin, la sélection de larves à croissance rapide semble démontrée, s'opposant à la dépression de consanguinité présumée. Les conditions d'élevage peuvent donc avoir un effet génétique significatif qui devrait être pris en considération dans les pratiques d'écloserie, notamment dans la gestion de la diversité génétique.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/acte-1505.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1505/

Résumé : Since 2000, the exploitation of the deep demersal fish (200-700 m) with the use of electric winches has been increasing in Reunion island ; and this has needed a new appraisal of yields (CPUE) and individual fish sizes, as indicators of the state of the fish stocks. A first survey has been carried out at the first half of 2011, in order to set up the comparison with a previous survey in 2000 on the West coast of Reunion island. Drops of yields and sizes could be pointed out, attesting the overexploitation of the commercial species (Fleury et al 2011). This present report displays the results of a second campaign, carried out in the second half of 2011 all around the island. 32 fishing trips have been conducted which have permitted 251 fishing operations. The overexploitation (i.e. decreasing of yields and fish sizes) has been confirmed in the West of the island, and in a lower stage in the North. Yields are better in the East and the South. As much as in the first survey, the small non commercial sharks (Squalus megalops) could be countered for half of the catches. At the same time, 2 hook sizes have been tested and the small hooks have displayed a better efficiency in number of catches but not in global weight. Various types of bait have been tested and meat of small local pelagic fish (Selar crumenophtalmus and Decapterus macarellus) have appeared to be the most efficient. This report provides helpful indicators for the management of fish stocks which have been poorly surveyed and poorly regulated till now.
Depuis 2000, la pêche aux poissons démersaux profonds (200-700 m) à l'aide de virelignes électriques s'est développée à La Réunion ; et le besoin se faisait sentir d'une évaluation des rendements (CPUE) et des tailles individuelles de capture, indicateurs halieutiques classiques des états de stocks. Une première campagne a été réalisée au 1er semestre 2011 pour établir la comparaison avec une campagne de prospection réalisée en 2000 dans l'ouest de La Réunion. Elle a mis en évidence des baisses marquées des rendements et des tailles de capture, signes d’une surexploitation des espèces commerciales (Fleury et al 2011). Ce rapport présente les résultats d'une 2e campagne de prospection étendue à tout le tour de l'île. 32 marées ont été réalisées permettant la mise à l'eau de 251 filages. La surpêche (baisse des rendements et des tailles de poisson) est confirmée dans l'ouest et à un moindre degré sur la côte nord. Les rendements sont meilleurs dans l'est et le sud. Comme dans la première campagne, les requins zépines (Squalus megalops), non commercialisés à La Réunion, représentent la moitié des captures. Parallèlement, 2 tailles d'hameçons ont été comparées et les petits hameçons ont donné une augmentation du nombre de captures, mais pas du poids global. Des comparaisons ont aussi porté sur les types d'appât et les laizes de petits pélagiques locaux (pêche-cavale et bancloche) se sont révèlées les plus efficaces. Ce rapport fournit des indicateurs utiles à la gestion de stocks jusqu'ici peu suivis, et peu encadrés.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00089/20048/18049.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00089/20048/

Résumé : SODACAL prawn farm which was set up as a pilot farm for the development of a prawn industry in New Caledonia, saw its production exponentially rise from 1984 to 1992 (to 400 t/year, then experienced a sharp drop in 1993 (250 t/year) which carried on until 1997, and finally rose back to a stabilizing level around 400 t/year until 1999. The study analyses the difficulties observed before and during the drop of production. Among them, mortality outbreaks, other biological perturbations (benthic mat clearing and crab and fish mortality) and focus on the noxious state of the bottom (reduced and smelling sulfide hydrogen). It particularly shows that Syndrome 93 outbreaks could be observed on this farm from 1990. The analysis highlights the particular climatic conditions in New Caledonia from 1990 to 1995 (drought) and their potential impact on the production. The development of this very particular process of physical and topographic differential evolution of the pond bottom under wind action (accumulation and digging) and its consequences on pond preparation is explained. This work takes a close look at the grow-out management : age and quality of post larvae, pond stocking with pre-grown animals, feed characteristics and management, water exchange management and pumping capacity, strategy on density and size of harvested animals. The results have been assessed using a distinctive tool, the "survival differential", allowing inter-pond comparisons within a site, inter-farms comparisons over pluri-annual periods of time. >From the commented farm results over a 20 year period, we could distinguish the principal factors responsible for the drop of grow-out capacity of some ponds. We have outlined a conceptual description of the different parameters leading to the decrease of survival, an epidemiological scenario and a synoptic table of the history of events and their relative severity. The study draws the hypothesis of a cumulative effect of positive factors, which could have led back to satisfying production results: a physical and biochemical restoration of pond bottoms, a modified and standardized grow-out management, an appropriate pumping capacity and the come back of adequate climatic conditions. This case study illustrates the concept of « flexibility » of the farming capacity and the sustainability of prawn farming in New Caledonia. The clear objective of this 20 year historic investigation was to get relevant information, in order to improve the understanding on the "summer syndrome" which hits two farms at the moment, and to participate in the hypothesis under study by the DAC (2005). We also tried to make the new farmers aware of the fragility of the pond ecosystem, and give some common-sense advices in the hope that such problems will not happen again in other places.
La ferme de SODACAL, conçue à l'origine comme une ferme de démonstration pour le développement d'une filière d'aquaculture exportatrice de crevettes en Nouvelle-Calédonie a connu une phase de croissance exponentielle de sa production de 1984 à 1992 (jusqu'à 400 t/an), puis une chute brutale en 1993 (250 t/an) qui s'est prolongée jusqu'en 1997 et enfin une reprise à partir de 1998 pour arriver à une stabilisation autour de 420 t/an depuis 1999. L'étude inventorie les dysfonctionnements observés avant et pendant la crise de production. Parmi ceux-ci sont évoqués les épisodes de mortalité de crevettes, d'autres désordres biologiques (décollements de tapis benthique et « hécatombes » de crabes et de poissons), l'état délétère des fonds (sédiments réduits et odeur d'hydrogène sulfuré). Elle permet notamment de montrer que des épisodes de mortalité typiques du Syndrome 93 pouvaient être observés sur cette ferme dès 1990. L'étude met en évidence les conditions climatiques remarquables qui ont sévi en Nouvelle-Calédonie de 1990 à 1995 (sécheresse) et leur impact probable sur les élevages. La genèse du phénomène très particulier d'évolution physique et topographique des fonds des bassins par l'effet du vent (accumulation et creusement) et des conséquences sur la préparation des bassins est explicitée. Ce travail aborde la gestion zootechnique : l'âge et la « qualité » des post larves, la pratique des ensemencements à partir d'animaux pré grossis, la gestion de l'alimentation et la nature de la provende, le contrôle du renouvellement d'eau et la capacité de pompage, le choix des densités et du calibre des animaux récoltés. Les résultats ont pu être évalués à travers un outil original «le différentiel de survie », permettant des comparaisons inter-bassins au sein du site, inter-fermes à des périodes pluri annuelles distinctes. A partir des résultats commentés de la ferme obtenus sur 20 années, on a pu distinguer les principaux facteurs qui ont provoqué cette chute d'aptitude culturale de certains bassins. Un schéma conceptuel des différents paramètres ayant conduit à la baisse des survies, un scénario épidémiologique ainsi qu'un tableau synoptique de la chronologie des évènements et de leur relative sévérité sont esquissés. Le rapport ébauche l'hypothèse d'un cumul de causes favorables qui ont permis le retour à des résultats zootechniques satisfaisants : une réhabilitation physique et biochimique des fonds de bassins, une zootechnie modifiée et standardisée, une capacité de pompage adéquate et une climatologie de nouveau favorable. Cette étude de cas permet ainsi d'illustrer les notions d « élasticité » de l'aptitude culturale et de durabilité de la crevetticulture en Nouvelle-Calédonie. Le but de cette enquête historique sur 20 ans est l'acquisition d'informations pertinentes permettant d'améliorer la compréhension du « Syndrome d'été » qui affecte actuellement deux fermes de production et ainsi aider à compléter le scénario hypothétique avancé par le Dac (2005). Enfin, au travers de cet historique, on a cherché également à sensibiliser les nouveaux opérateurs de la filière sur la fragilité de l'écosystème-bassin et présenter quelques conseils de bon sens pour éviter que de tels phénomènes ne se reproduisent ailleurs.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/rapport-718.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/718/

Résumé : Le mérou géant, Epinephelus itajara, espèce en danger critique d’extinction au niveau mondial, est présent dans les eaux turbides et saumâtres de la Guyane française où l’espèce est exploitée par une pêcherie côtière. Dans la partie est du plateau continental guyanais, les mérous géants se localisent autour de tous les sites rocheux marins où ils se répartissent en fonction de la profondeur et du faciès (éboulis ou tombant). Les analyses des isotopes stables du carbone et de l’azote suggèrent qu’environ 30 % des mérous géants < 115 cm présents sur ces sites rocheux, proviendraient des mangroves alentours. Les analyses de contenus stomacaux révèlent un changement ontogénétique du régime alimentaire. Les petits individus (< 90 cm) s’alimentent principalement de Crustacés puis intègrent progressivement les poissons à leur alimentation jusqu’à devenir essentiellement piscivores au-delà de 140 cm. La population de Guyane est principalement composée d’individus juvéniles : seulement 8,5 % des individus capturés en Guyane a plus de 6 ans. Ces jeunes mérous sont très territoriaux durant les 4-5 premières années de leur vie puis ne sont plus retrouvés sur les sites rocheux. Le devenir de ces juvéniles est incertain, soit ils sont pêchés, soit ils migrent vers d’autres sites ou vers les agrégations de reproduction. Cependant, les mérous géants ne semblent pas se reproduire en Guyane. Il est possible que les conditions environnementales (forte turbidité et température) ne favorisent pas le développement gonadique, ce qui engendrerait une omission totale de reproduction. Le suivi par tags satellite suggère que les mérous géants migrent dans le sens des courants marins vers Trinidad-et-Tobago, potentiellement pour la reproduction. Aucun mouvement vers le Brésil n’a été mis en évidence bien que les stocks de mérous géants du Brésil et de Guyane semblent liés. En effet, ces deux stocks évoluent conjointement avec un déclin des populations au début des années 90. Le maintien de la population de mérou géant en Guyane se ferait grâce à l’apport de larves des sites d’agrégation du Brésil par le courant marin. La mortalité totale des mérous géants (0,65) est aussi élevée au sein de la réserve marine ainsi que sur les sites de pêche. Cela suggère que l’interdiction de pêche à la réserve n’est pas respectée et que les grands individus quittent la réserve pour des sites plus spacieux. En supposant que la population de mérous géants adultes a été réduite à cause de la pêche, une protection régionale des individus > 150 cm doit être instaurée afin de régénérer le stock d’individus matures. Il semble nécessaire de développer une politique de gestion internationale de l’espèce, surtout entre la Guyane et le Brésil, afin de conserver les populations de mérous géants d’Amérique du Sud.
The critically endangered Goliath Grouper, Epinephelus itajara, is found in the turbid and brackish waters of French Guiana, where the species is subject to a coastal fishery. Goliath Grouper populations inhabit all rocky habitats and exhibit increasing abundance with depth. Around 30% of individuals less than 115 cm may derive from the abundant mangrove habitat along the french Guiana coast. There is a ontogenetic shift of the diet, primarily crustacivorous, individuals >140 cm become piscivorous. The Goliath Grouper population in French Guiana is composed primarily og juvelines. The fate of the juvelines is unknonw, some may be caught in the fishery, others may move to other habitat. No evidence of spawning or gonadal readiness was found in french Guiana. it is possible that environmental conditions (high turbidity and temperature) are not conducive to reproductive activity. Goliath Grouper may migrate down current from French Guiana to Trinidad and Tobago or further. No movement of Goliath Grouper was found against the current toward Brazil. French Guiana juveniles may be derived from spawns occuring off Brazil. Calculated total mortality of Goliath Grouper off French Guiana is high (0.65) in both fished and protected areas suggesting that illegal fishing is occuring within the protected area, or that emigration rates are high. Assuming that the adult population of Goliath Grouper in French Guiana has been reduced due to fishing, protection of spawning-size adults (larger than about 150 cm TL) should be instated.

http://www.theses.fr/2014AGUY0721/document

Résumé : By looking at the common thread between 4 programs* in which the IFREMER Palavas (34, Languedoc-Roussillon region in France) station took part, this report show the evolution over 20 years in the perception of the pathology of farmed fish, and of the sea bass in particular (Dicentrarchus labrax). During the 1990’s farming techniques became sufficiently reliable to enable to distinguish between problems of a zootechnical nature and those with a pathological origin. In anticipation of future illnesses, the necessary tools and monitoring were implemented in order to study the immune system of the sea bass. These methods arose from the recent creation of anti-immunoglobin monoclonal probes in the sea bass. These techniques, together with others, served to search for a solution to the nodavirus epidemic which struck in1996. In the absence of a cure for this virus, the research focused on knowledge of the virus, its epidemiology and vaccine development. Despite interesting scientific results, the solution withheld to curb the Nodavirus epidemic was zootechnical. This pragmatic outcome catalysed reflections on the role of pathology, leading to notions of health, animal well-being and image. Management choices in the health of farmed fish stocks became a parameter, amongst others, included in a global commercial and farming policy. * Définition des critères d’évaluation de l’immunocompétente chez le loup et le turbot. UMR1 Université Montpellier II IFREMER ; Nodavirus disease of cultured marine fish in Europe. FAIR PL98 4036 EU; Recherche de moyens de dépistage et prévention de la nodavirose du bar. ANVAR 9804041J ; Welfare and Health in Sustainable Aquaculture WEALTH. E.U N°501984.
En prenant comme fil conducteur les travaux de 4 programmes* auxquels a participé la station IFREMER de Palavas (34), ce rapport montre l’évolution sur 20 ans de la perception de la pathologie des poissons d’élevages et du loup en particulier (Dicentrarchus labrax). Dans les années 1990 les techniques d’élevages devinrent suffisamment fiables pour permettre de distinguer les problèmes d’origines zootechniques de ceux d’origines pathologiques. En prévision des futures maladies potentielles, les outils d’étude et de suivi du système immunitaire spécifique du loup furent mis en place. Ils découlaient de la création récente de sondes monoclonales anti-immunoglobulines de loup. Ces techniques, couplées à d’autres, servirent à chercher une solution à l’épidémie de nodavirose des années 1996. En l’absence de traitement pour un virus l’accent fut mis sur la connaissance du virus, de son épidémiologie et de la vaccination. Bien que les résultats scientifiques furent très satisfaisants la solution trouvée pour juguler l’épidémie de Nodavirose fut zootechnique. Cette issue pragmatique catalysa une réflexion sur le rôle de la pathologie qui maturait depuis plusieurs années et qui déboucha sur la notion de santé, de bien être des animaux et d’image. Les choix de gestion de la santé des cheptels devinrent un paramètre, parmi d’autres, s’incluant dans d’une politique globale d’élevage et commerciale * Définition des critères d’évaluation de l’immunocompétente chez le loup et le turbot. UMR1 Université Montpellier II IFREMER ; Nodavirus disease of cultured marine fish in Europe. FAIR PL98 4036 EU; Recherche de moyens de dépistage et prévention de la nodavirose du bar. ANVAR 9804041J ; Welfare and Health in Sustainable Aquaculture WEALTH. E.U N°501984.

Droits : 2013 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00167/27866/26103.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00167/27866/26105.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00167/27866/26106.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00167/27866/

Résumé : Le cycle biologique du principal stock de crevettes pénéïdes (Penaeus subtilis) exploité sur le plateau continental guyanais est court (18 mois environ). Les variabilités intra et inter annuelles de l'abondance des individus appartenant aux différentes composantes des premières phases du cycle (larves, post-larves, juvéniles) sont considérées comme très fortes, ce phénomène étant exacerbé par le double changement de milieu au cours du cycle, passage d'un habitat en eau salée à celui en eau douce, puis retour au premier. La pêcherie de la flottille crevettière guyanaise est ainsi basée sur un stock au renouvellement rapide et variable, aussi l'optimisation de sa gestion implique une meilleure compréhension des mécanismes de recrutement des crevettes et notamment leur facteurs de variation. Ainsi, depuis octobre 1992 une étude est conduite pour analyser ces mécanismes de recrutement. Elle s'intègre dans un programme de coopération régionale entre l'IFREMER et le Ministère de l'Agriculture, de l'Elevage et des Pêches du Surinam financé par des fonds FEDER et du FIC, et elle est menée par l'IFREMER dans la Zone Economique Exclusive française et par le laboratoire du Département des pêches du Surinam sur le plateau surinamien. Le programme prévoit une série de huit campagnes en mer qui seront conduites en parallèle par chacun des deux laboratoires Français et Surinarnien sur les plateaux de Guyane (campagnes RESUBGUY) et du Surinam (campagnes RESUBSUR) afin d'analyser le phénomène de recrutement sur la plus large échelle possible d'observation (plateau guyano-surinamien). Deux campagnes annuelles ont été programmées pour chaque pays, en mai et en octobre. La périodicité de ces campagnes est fonction des résultats des travaux conduits par l'IFREMER et l'ORSTOM sur la phase pré-recrutée de Penaeus subtilis qui ont mis en évidence deux principales périodes annuelles distinctes de recrutement (avril-mai; septembre-octobre). Cette campagne est la quatrième de la série initiée en octobre 1992. L'étude n'est pas limitée à l'examen des seules captures de crevettes Penaeus subtilis, puisqu'elle incluse également l'analyse de la composition des prises accessoires des crevettiers. Les "by-catches" considérées dans ce travail sont surtout représentées par la crevette "sea-bob", Xiphopenaeus kroyeri, ainsi que par les principales espèces de poissons d'intérêt commercial (ou ayant une forte probabilité de le devenir dans un futur proche). Enfin, une attention particulière a également été portée sur les captures accidentelles de tortues marines afin d’en estimer l’importance réelle.

Droits : 1994 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00076/18750/16321.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00076/18750/

Résumé : Genetic consequences of production of Pacific oyster larval in hatchery: drift and selective pressures related to rearing practices. In order to study the genetic consequences of production of oyster larvae in hatcheries, two factors were examined: the effects of discarding the smallest larvae (i.e. culling) and temperature effects. A mixed-family approach was used in order to infer the genetic composition of the larval population. The results show that high polymorphic microsatellite-based family assignment is a powerful tool for the study of bivalve larvae genetics. Culling by selective sieving is an advantageous practice at a phenotypic scale, but also represents a substantial risk for diversity loss if parentage assignment is not introduced as a breeding practice. Settlement of slow growing larvae contributes to minimizing the variability of reproductive success and therefore to maximizing genetic diversity. These results corroborate the lower estimations of variability made on broodstocks from French commercial hatcheries relative to natural populations. Temperature exerts an influence on the expression of genetic variability for larval growth. A temperature of 26°C, coupled with culling could amplify the selective effect. Furthermore, selection of fast growing larvae has proven to counteract inbreeding depression at this stage. Genetic effects of intensive rearing conditions are significant and should be taken into account in hatchery practices, especially in terms of genetic diversity management.
Afin d'étudier les conséquences génétiques des pratiques de production de larves en écloserie d'huître creuse, deux facteurs ont été examinés : l'effet de l'élimination des plus petites larves et l'effet de la température. Une approche de familles élevées en mélange a été utilisée afin d'avoir accès à l'information génétique au stade larvaire. Les résultats obtenus montrent que l'assignation de parenté basée sur des marqueurs microsatellites hautement discriminants est un outil performant pour les études génétiques en phase larvaire. Bien qu'avantageuse d'un point de vue phénotypique, la pratique de tamisage sélectif représente un risque substantiel de perte de diversité si cette pratique n'est pas associée à une assignation de parentée par empreintes génétiques. La fixation des larves à croissance lente permet de minimiser la variabilité du succès reproducteur et de fait, de maximiser la variabilité génétique. Ces résultats corroborent les estimations de variabilité sur les stocks d'écloseries commerciales françaises où l'on constate une diversité allélique inférieure à celle de populations issues du milieu naturel. La température exerce également une influence sur la précocité de l'expression de la variabilité génétique pour la croissance larvaire. Ainsi une température élevée (26°C) associée à une procédure de tamisage peut amplifier l'effet sélectif. Enfin, la sélection de larves à croissance rapide semble démontrée, s'opposant à la dépression de consanguinité présumée en phase larvaire. Les conditions d'élevage peuvent donc avoir un effet génétique significatif qui devrait être pris en considération dans les pratiques d'écloserie, notamment dans la gestion de la diversité génétique.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/rapport-1459.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1459/

Résumé : Les objectifs de la missions étaient les suivants: PROJET TORTUES MARINES : (i) Prospection des îles de la côte ouest malgache pour récolter des échantillons génétiques de tortues verte et imbriquée dont l’analyse pourrait apporter des éléments essentiels dans la compréhension des liens qu’il existe entre le stock nord et sud de cette de cette zone ; (ii) finaliser la campagne de prélèvement génétique sur les immatures de tortues vertes présent dans le lagon de Juan de Nova PROJET ENTOMOLOGIE : (i) Inventaire de l’entomofaune et des autres arthropodes ; (ii) l’étude de l’écologie et de la biogéographie des îles éparses, à travers l’étude des phénomènes de spéciation et des réseaux trophiques ; (iii) constituer une collection de référence au Muséum d’Histoire Naturelle, support indispensable aux études ultérieures PROJET DE FILM : Afin de valoriser les activités scientifiques menées dans les îles Eparses depuis plusieurs années maintenant, Kélonia, le Muséum d’Histoire Naturel de La Réunion et l’Ifremer ont souhaité financer un film sur l’importance de la protection des îles éparses dans le cadre de la conservation de la biodiversité, conservation qui n’est possible que grâce à leur gestion par les Terre Australes et Antarctiques Françaises (TAAF).

Droits : 2007 Ifremer, Kélonia
http://archimer.ifremer.fr/doc/00244/35518/34023.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00244/35518/

Résumé : The tropical seabass Lates calcarifer was introduced in Tahiti in 1984 and then was domesticated without other introduction. Three successive generations have been obtained in captivity. Tissue samples of the 38 animaIs which represent the total Tahitian broodstock were preserved in alcohol to be genotyped with four microsatellite markers (Yue et al., 2001). Three of four described markers were successfully transferred to the laboratory of genetics of Tahiti (marker LcaM01, LcaM02, LcaM03), as the revelation technology available locally did not allow the use of LcaM04 in routine. The results show that the genetic diversity of the tahitian broodstock is not equivalent of the one of the species, which could be explained by the small size of the founder population, which is consistant with the history of the Tahitian population. The structuration of the 4th generation into several batches obtained from different parents appears to be the minimum management procedure to limit inbreeding.
Le loup tropical Lates calcarifer a été introduit à Tahiti en 1984 puis domestiqué sans apport d'animaux extérieurs. Trois générations successives ont été obtenues en captivité. Des prélèvements de tissus sur les 38 géniteurs qui constituent l'intégralité du stock de reproducteurs tahitiens sont conservés dans l'alcool pour être génotypés à l'aide de quatre marqueurs microsatellites (Yue et al., 2001). Trois des quatre marqueurs décrits ont pu être transférés avec succès au laboratoire de génétique de Tahiti (marqueurs LcaM01, LcaM02, LcaM03), la technique de révélation disponible localement ne permettant pas d'utiliser LcaM04 en routine. Les résultats montrent qu'on ne dispose pas à Tahiti de toute la variabilité génétique de l'espèce, ce qui pourrait s'expliquer, compte tenu de l'histoire de cette population, par un faible nombre de géniteurs fondateurs. La structuration de la 4ème génération en plusieurs lots issus de parents différents apparaît comme la mesure de gestion minimale pour limiter la consanguinité au sein de cette population.

Droits : 2003 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00142/25300/23372.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00142/25300/

Éditeur(s) : ICCAT, Madrid (Spain)
Résumé : Cette étude intègre simultanément les données de la pêcherie palangrière de l'Atlantique Nord Central (prises annuelles en nombre par classes d'âge à partir des échantillonnages de la pêcherie japonaise) et les données de la pêcherie de surface franco-espagnole de l'Atlantique Nord-Est (prises annuelles en nombre par classes d'âge à partir des échantillonnages de la pêcherie française). L'analyse des cohortes sur ces données conduit à des estimations de Fi et de tailles de cohortes au recrutement et la sortie de la pêche de surface, puis au recrutement de la pêcherie palangrière. Le recoupement et le recouvrement de ces résultats permettent de construire une série de Fi et, à partir des données de Mi extraites d'autres études, d'appliquer les modèles classiques de rendement pondéral par recrue. L'analyse est menée parallèlement sur le rendement pondéral par recrue et la fécondité du stock. Le développement et l'emploi de modèles et programmes originaux de gestion tenant des divers techniques et engins de pêche (multi-arts de pêche, "multi-gear") permettent de tirer des conclusions sur les effets respectifs des deux pêcheries : palangre sur les adultes et surface sur les jeunes. [OCR NON CONTRÔLE]
ICCAT/CICTA Recueil de Documents Scientifiques (ICCAT, Madrid (Spain)), 1974 , Vol. 4 , P. 619-651

Droits : ICCAT, Madrid (Spain)
http://archimer.ifremer.fr/doc/1974/publication-5469.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/5469/

Résumé : The maritime fisheries and mariculture guidance law passed in 1997 specifies that with the perspective of renegotiation of the common fisheries policy in 2002, a report on the special conditions of inshore fisheries be drawn up by the Government. To do so, the Minister of Agriculture and Fisheries entrusted this task to three experts, who are the authors of this report. In accordance with their remit, the situation of fisheries in territorial waters and estuaries of metropolitan France and the four DOM overseas departments ( counties) was examined, in the framework of meetings with professional fishermen, administrations, elected officials and scientific organisations. The first part situates fishing activities in coastal areas within the overall context of French fisheries. The second part provides a detailed report for each seafront (Channel, Atlantic, Mediterranean, West Indies, French Guyana and Reunion Island) on the regulatory framework, fleets, stocks, uses of resources and vulnerable areas of interest for fisheries. The report then analyses the competition within fisheries and with other activities (recreational fishing, extraction of aggregates, tourism, etc.). After these observations, the authors make ten proposals to improve the conditions under which coastal or inshore fisheries are practiced.
La loi d'orientation sur la pêche maritime et les cultures marines votée en 1997 précise que dans la perspective de la renégociation de la politique commune des pêches en 2002, un rapport sur les conditions particulières de l'exercice de la pêche dans la bande côtière sera établi par le Gouvernement. Pour y satisfaire, le Ministre de l'Agriculture et de la Pêche en a confié l'élaboration à trois experts, les auteurs du présent rapport. Conformément à la lettre de mission, la situation de la pêche dans les eaux territoriales et estuaires du territoire métropolitain et des quatre départements d'Outre-Mer a été examinée dans le cadre de rencontres avec les professionnels, les administrations, les élus, les organismes scientifiques. Une première partie permet de situer les activités halieutiques en zone côtière dans le contexte global de la pêche française. La seconde partie est un bilan détaillé par façade (Manche, Atlantique, Méditerranée, Antilles, Guyane, Réunion) du cadre réglementaire, des flottilles, des ressources, des usages de la ressource et des zones sensibles d'intérêt halieutiques. Le rapport analyse ensuite les compétitions au sein de la pêche et avec d'autres activités (pêche récréative, extractions de granulats, tourisme,...). A l'issue de ces différents constats, les auteurs font dix propositions pour améliorer les conditions d'exercice de la pêche en zone côtière.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2000/rapport-1200.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1200/

Résumé : La pêche au poisson rouge connaît un essor spectaculaire en Guyane depuis quelques années, parallèlement à une demande croissante du marché antillais pour ce produit, L'appellation vivaneau ou poisson rouge, regroupe un certain nombre de genres et d'espèces de la famille des Lutjanidés, présents dans toute la région des Caraïbes. Il semble que le plateau guyanais, pour avoir depuis longtemps attiré des pêcheurs étrangers, soit particulièrement intéressant par ses rendements élevés en ces espèces et également par l'absence de ciguatera, Actuellement, cette ressource est exploitée en Guyane dans le cadre des règlements communautaires et notamment sous le régime de licences délivrées aux pays tiers par 26 unités, à savoir 25 navires vénézuéliens travaillant à la ligne, la nasse ou la palangre, et 1 chalutier martiniquais. Depuis le début des années 80, les tonnages mis à terre en Guyane augmentent et font du vivaneau la seconde ressource halieutique hauturière du département, après la crevette. Dans le cadre du développement régional , l'Ifremer a donc entrepris un programme de recherche sur les potentialités réelles en poisson rouge de la zone Economique Exclusjve (ZEE) de manière à proposer rapidement des mesures appropriées de gestion des stocks et d'aménagement de la pêcherie. Dans un premier temps, ce rapport qui finalise une convention conclue entre le Conseil Régional de la Guyane et I'IFREMER, vise à faire un état des connaissances biologiques et un bilan de la situation actuelle de la pêcherie.

Droits : 1988 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00087/19811/17452.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00087/19811/

Résumé : Après la réalisation du projet de recherche DMX1 (Indicateurs biologiques et écologiques pour une gestion durable des stocks de poissons DéMersauX profonds d’intérêt halieutique à La Réunion), un second projet de recherche DMX2 va débuter en 2014. L'un des intérêts de ce projet est d'obtenir des premiers résultats de croissance des espèces profondes de l'île de la Réunion. Dans le cadre de la préparation de cette étude de croissance, des essais de faisabilité d’estimation de l’âge ont été réalisés sur des otolithes de vivaneau rubis (Etelis carbunculus) par le pôle national de sclérochronologie de l’Ifremer de Boulogne-sur-Mer. Les échantillons ont été prélevés par l’Ifremer de la Réunion en 2013 (David Roos). Ce rapport de faisabilité a permis de montrer que les otolithes entiers d'Etelis montrent des structures, tout comme la méthode de brûlage sans apporter toutefois de gain dans l'interprétation des structures. Il faut néanmoins noter qu’il s’agit ici de petits individus, qu’il serait donc loin d’être exclus que cette méthode présente ses limites avec des individus de plus grandes tailles étant donnée la difficulté de lisibilité du bord marginal de l’otolithe. De même, les résultats obtenus à partir des coupes transversales sont peu concluants. Le long du plus grand axe de lecture, il est possible de retrouver les structures identifiées lors de l’observation de l’otolithe in toto par un jeu de polissage long et laborieux. Quant à l’axe d’interprétation situé le long du sulcus comme stipulé dans la bibliographie, celui-ci révèle un nombre de structures important, difficilement imputable à une formation calcique annuelle. Cependant, ces premiers tests peuvent être aisément améliorés avec, tout d’abord, une identification précise de l’espèce concernée, ainsi qu’un un nombre d'échantillons plus important, représentatif de l’étendue en taille du vivaneau rubis. Il sera important, avant d'estimer l'âge de cette espèce, de valider la périodicité de formation des structures de façon à interpréter ces structures comme anneaux de croissance annuels et ensuite d'établir un schéma d'interprétation reproductible des différents types de structures existantes.

Droits : 2014 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00180/29160/27568.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00180/29160/