Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
The occurrence of cyanobacterial blooms is drastically increasing in temperate countries and drinking water resources are threatened. As a result, cyanotoxins should be considered in water treatment to protect human health. This study presents a state of the art on cyanotoxins in water and their behaviour towards chlorination, a common drinking water disinfection process. Chlorination efficiency on cyanotoxins alteration depends on pH, chlorine dose and oxidant nature. Microcystins and cylindrospermopsin are efficiently transformed by chlorine, with respectively 6 and 2 by-products identified. In addition, chlorination of microcystins and cylindrospermopsin is associated with a loss of acute toxicity. Even though they have been less investigated, saxitoxins and nodularins are also altered by chlorine. For these toxins, no by-products have been identified, but the chlorinated mixture does not show acute toxicity. On the contrary, the fact that anatoxin-a has a very slow reaction kinetics suggests that this toxin resists chlorination.
ISSN: 0041-0101

hal-01122372
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01122372
DOI : 10.1016/j.toxicon.2009.10.028
PUBMED : 19874838

Éditeur(s) : HAL CCSD Nature Publishing Group
Résumé : While Amazonian forests are extraordinarily diverse, the abundance of trees is skewed strongly towards relatively few 'hyperdominant' species. In addition to their diversity, Amazonian trees are a key component of the global carbon cycle, assimilating and storing more carbon than any other ecosystem on Earth. Here we ask, using a unique data set of 530 forest plots, if the functions of storing and producing woody carbon are concentrated in a small number of tree species, whether the most abundant species also dominate carbon cycling, and whether dominant species are characterized by specific functional traits. We find that dominance of forest function is even more concentrated in a few species than is dominance of tree abundance, with only ≈1% of Amazon tree species responsible for 50% of carbon storage and productivity. Although those species that contribute most to biomass and productivity are often abundant, species maximum size is also influential, while the identity and ranking of dominant species varies by function and by region.
ISSN: 2041-1723

hal-01204225
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01204225
DOI : 10.1038/ncomms7857
PRODINRA : 305614
PUBMED : 25919449

Éditeur(s) : HAL CCSD MDPI
Résumé : International audience
Hand disinfection with alcohols-based hand rubs (ABHRs) are known to be the most effective measure to prevent nosocomial infections in healthcare. ABHRs contain on average 70% by weight of one or more alcohols. During the hand rubbing procedure, users are exposed to these alcohols not only through dermal contact, but also via inhalation, due to the physical and chemical properties of alcohols volatilizing from alcoholic solutions or gels into the air. Ethanol ingestion is well known to increase risks of several diseases (affecting the pancreas, liver, cardiovascular system…), but there is a lack of knowledge about the effects of exposure to other alcohols (including n- or isopropanol) via inhalation and dermal contact, despite the worldwide use of ABHRs. This work aims at discussing possible health effects related to unintentional alcoholization (via inhalation and dermal contact) from professional ABHR usage to suggest the need for more research in this area (but not to question the value of ABHRs). Based upon an average of 30 hand rubbings per healthcare professional per day, it can be assumed that a healthcare worker may be exposed to a maximum 5,500 mg/m(3) per work shift, five times above the recommended occupational time weighted average limit. Thus, in order to answer the question posed in the title, studies on spatial and temporal variability of alcohol emission from ABHRs in real world situations and studies on certain high risk individuals are needed.
ISSN: 1660-4601

hal-01122305
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01122305
PUBMED : 20948945
DOI : 10.3390/ijerph7083038
PUBMEDCENTRAL : PMC2954566

Résumé : Le présent rapport est constitué de six parties. Dans la 1ère partie, nous donnons quelques généralités introductives sur la mangrove, et plus spécifiquement sur la mangrove de Nouvelle-Calédonie, ainsi que sur notre site d’étude. La 2nde partie est consacrée à l’évaluation de la biodiversité végétale ainsi qu’à la caractérisation de la structure de la formation de mangrove étudiée. La 3ème partie est consacrée à l’étude de la géochimie des sédiments de mangrove, cette section est divisée en 2 sous-parties, l’une concernant les formes azotées, l’autre concernant le carbone et les métaux lourds. La 4ème partie concerne l’étude des assemblages meïobenthiques, qui réagissent fortement à des perturbations de type organique. La 5ème partie est dédiée à la crevetticulture et à l’inventaire de solutions de gestion des effluents. Cette partie comprend quatre sections. La 1ère section a pour vocation de présenter les caractéristiques de la filière crevettière de Nouvelle-Calédonie. La 2nde section donne les caractéristiques des effluents crevettiers. La 3ème section est le résultat des recherches bibliographiques sur les moyens de gestion des effluents. Enfin la 4ème section est une discussion de faisabilité sur ces moyens de gestion. La 6ème partie de ce rapport, intègre les aspects sociologiques des connaissances et des perceptions des éleveurs à propos de la mangrove et des effluents. Dans la synthèse générale de ce rapport, nous proposerons dans un premier temps des conclusions à propos de la géochimie des sédiments des sédiments de mangrove et des différents facteurs forçants. Dans un second temps, nous serons amenés à prendre en compte les résultats de l’étude sociologique dans le but de mener une réflexion sur les différents moyens de gestion des effluents applicables en Nouvelle-Calédonie.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00198/30917/29288.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00198/30917/

Éditeur(s) : HAL CCSD Landes Bioscience
Résumé : International audience
In 2008 we published the first set of guidelines for standardizing research in autophagy. Since then, research on this topic has continued to accelerate, and many new scientists have entered the field. Our knowledge base and relevant new technologies have also been expanding. Accordingly, it is important to update these guidelines for monitoring autophagy in different organisms. Various reviews have described the range of assays that have been used for this purpose. Nevertheless, there continues to be confusion regarding acceptable methods to measure autophagy, especially in multicellular eukaryotes. A key point that needs to be emphasized is that there is a difference between measurements that monitor the numbers or volume of autophagic elements (e.g., autophagosomes or autolysosomes) at any stage of the autophagic process vs. those that measure flux through the autophagy pathway (i.e., the complete process); thus, a block in macroautophagy that results in autophagosome accumulation needs to be differentiated from stimuli that result in increased autophagic activity, defined as increased autophagy induction coupled with increased delivery to, and degradation within, lysosomes (in most higher eukaryotes and some protists such as Dictyostelium) or the vacuole (in plants and fungi). In other words, it is especially important that investigators new to the field understand that the appearance of more autophagosomes does not necessarily equate with more autophagy. In fact, in many cases, autophagosomes accumulate because of a block in trafficking to lysosomes without a concomitant change in autophagosome biogenesis, whereas an increase in autolysosomes may reflect a reduction in degradative activity. Here, we present a set of guidelines for the selection and interpretation of methods for use by investigators who aim to examine macroautophagy and related processes, as well as for reviewers who need to provide realistic and reasonable critiques of papers that are focused on these processes. These guidelines are not meant to be a formulaic set of rules, because the appropriate assays depend in part on the question being asked and the system being used. In addition, we emphasize that no individual assay is guaranteed to be the most appropriate one in every situation, and we strongly recommend the use of multiple assays to monitor autophagy. In these guidelines, we consider these various methods of assessing autophagy and what information can, or cannot, be obtained from them. Finally, by discussing the merits and limits of particular autophagy assays, we hope to encourage technical innovation in the field.
Autophagy

hal-00735751
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00735751
PUBMED : 22966490

Résumé : Le statut de département français fait de l’île de la Martinique une des régions ultra périphériques (RUP) de l’Union européenne. L’activité des navires de pêche qui exploitent sa ZEE s’inscrit dans le cadre de la politique commune des pêches de l’Union européenne, et la gestion des ressources partagées avec d’autres pays s’exerce dans le cadre des organisations internationales de pêche afférentes. Avec 1098 navires de pêche dont 1074 de moins de 10 mètres, la flotte de la Martinique représentait en 2009 16% de la flotte française. L’absence de données halieutiques depuis les évaluations de Gobert en 1989 a été identifiée à de nombreuses reprises comme un élément critique pour le suivi de l’évolution des activités de pêche et des ressources exploitées, ainsi que pour la définition de politiques de gestion durable de ce secteur économique. L’objectif de cette étude pilote était de tester la mise en place d’un système d’informations relatif aux activités de pêche maritime en Martinique, et d’étudier les conditions scientifiques et techniques d’une pérennisation d’un tel dispositif. Ce projet mené sur la période 2008-2010 avait pour objectif d’une part de consolider les connaissances en termes d’effort de pêche, de captures et de suivi socio-économique des différentes composantes de la pêche martiniquaise, et d’autre part de réaliser des synthèses sous forme d’indicateurs à destination des partenaires du projet (Direction des pêches maritimes et de l’aquaculture, Conseil régional de Martinique, Comité régional des pêches maritimes et des élevages marins de Martinique). Ce travail a été mené considérant le contexte particulier de la pêche martiniquaise qui cumule les difficultés inhérentes à une pêcherie artisanale en milieu tropical : utilisation de nombreux engins, exploitation à partir d’une centaine de ports/abris une ressource très diversifiée, débarquement de faibles quantités de produits à toutes heures de la journée, faible disponibilité des patrons, très polyvalents dans leur activité en mer comme à terre, pour remplir des documents statistiques. Le projet a permis de tester différentes méthodes d’enquêtes dans les ports et de sondages téléphoniques utilisables dans ce contexte. La confrontation de ces méthodes et de leurs résultats a permis de mettre en évidence certains biais associés à la difficulté de respecter les règles du tirage statistique des unités d’échantillonnage. Il est ainsi apparu que les enquêtes sur les points de débarquement pouvaient surévaluer l’effort de pêche et les débarquements. En effet, ces enquêtes méconnaissent les navires inactifs parqués hors des ports. De plus, les retours de pêche avec des prises faibles ou nulles échappent en partie aux observateurs en raison de la brièveté du séjour du patron dans le port au terme de sa marée. Des sondages téléphoniques couvrant une période de sept jours ont été menés, afin de prendre en compte le cycle hebdomadaire d’organisation de la pêche et de la commercialisation du poisson. Ces sondages permettent de s’affranchir des contraintes spatiales (éloignement et mauvaise accessibilité de certains lieux de débarquement) et temporelles (fin de semaine, jours fériés, débarquements de nuit), dans la mesure où ils peuvent être établis sur la base d’un registre complet des patrons-armateurs. Au cours de l’étude pilote, le plan d’échantillonnage a pu être suivi à 70 % (navires tirés au hasard figurant dans le plan). Dans 27 % des cas, l’observateur a du substituer l’unité d’échantillonnage, selon les règles imposées par le plan. En outre 2 % des sondages prévus au plan n’ont pas pu être réalisés en raison d’un refus. L’inconvénient majeur attribué à la méthode des sondages téléphoniques est l’impossibilité de vérifier les déclarations de personnes interviewées. Une comparaison entre ces déclarations et des pesées effectuées par les observateurs sur les points de débarquement a permis de décrire les divergences entre les deux modes de collecte des données. Cette analyse a également montré que si la collecte des données au débarquement offre la garantie d’une observation directe, elle peut également manquer une partie du produit de la pêche : langoustes déposées en vivier en pleine eau avant l’entrée dans le port, poisson non débarqué pour satisfaire la commande d’un client, lots de poissons remis aux haleurs de sennes de plage, débarquement sur un premier point avant le site enquêté, etc. Il est apparu qu’une collecte de données fiables ne peut se faire sans une bonne information des professionnels et leur participation volontaire à l’établissement des statistiques. La collecte des données dans un cadre qui garantit l’anonymat du pêcheur est également une condition inhérente à la réussite d’un observatoire. Par ailleurs, bon nombre d’informations portant par exemple sur l’activité en mer (dimension des engins, temps de pose, zone de pêche, etc.) invérifiables sur le lieu de débarquement peuvent être recueillies dans des conditions analogues par téléphone. Pendant la réalisation du projet pilote, 90,4 % des pêcheurs contactés par téléphone ont répondu sans réticence aux observateurs. Ceux qui ont refusé de répondre ou qui n’ont jamais décroché le téléphone (erreur de numéro ou refus) représentent 3 % des patrons-armateurs des navires figurant au fichier flotte national. Les pêcheurs qui n’ont pas régulièrement répondu aux observateurs représentent 6,6 % des effectifs. Pour valider les données collectées par enquêtes téléphoniques, leurs résultats ont été comparés par différentes méthodes à ceux des enquêtes au débarquement en vue d’identifier et de quantifier des biais éventuels. Aucune surévaluation ou sous-évaluation systématique par les enquêtes téléphoniques n’a été décelée au cours de ces travaux, certaines valeurs pouvant être plus élevées et d’autres moins. Les écarts non formellement expliqués ont été considérés comme une sous-évaluation par les enquêtes téléphoniques. Ceux-ci s’élèveraient à 20 % pour l’estimation du nombre de sorties et à 30 % pour celle des prises par sortie. Malgré la prise en compte de ces écarts, les estimations faites en 2009 et 2010 indiquent une régression des débarquements et de l’effort de pêche depuis l’évaluation réalisée en 1987 par le Pôle de recherche océanographique et halieutique Caraïbes. Un second niveau de validation a consisté à vérifier cette décroissance de la pêche en confrontant les informations obtenues par la présente étude pilote à des données d’origines différentes : étude des comportements alimentaires par l’Institut de veille sanitaire, étude de la consommation des ménages par l’INSEE, évolution des données d’importation des Douanes, données de vente de matériel de pêche par la coopérative d’avitaillement des pêcheurs de la Martinique (COOPEMAR). Toutes ces données font ressortir une baisse de la consommation de poisson par habitant depuis la fin des années 1980 et une augmentation des importations de produits de la mer. La pêche martiniquaise n’étant pas exportatrice, ces données donnent également un signal de diminution de la pêche martiniquaise au cours des 25 dernières années. Les données collectées à l’occasion de cette étude pilote suggèrent que la régression de la pêche martiniquaise au cours des dernières décennies serait le résultat de deux causes majeures : - la surpêche des ressources de fond sur le plateau insulaire. Ces ressources subissent une forte pression de pêche, entre autres de la part des pêcheurs les plus âgés qui n’ont plus les capacités physiques de pratiquer une activité loin des côtes. Un quart des patrons-armateurs ont aujourd’hui l’âge de la retraite et relèvent près de la moitié des nasses mouillées sur le plateau insulaire. Ces pêcheurs à l’activité peu flexible sont contraints de la poursuivre en raison de la faiblesse de leur pension de retraite. Une réduction de la pression de pêche sur le plateau insulaire par le départ effectif de ces pêcheurs favoriserait certainement, après quelques années, un retour à la situation décrite il y a 25 ans, qui permettait un débarquement annuel d’espèces issues du plateau insulaire d’environ 1 000 tonnes de plus que la production actuelle. - la concurrence des importations, en particulier des produits congelés, est certainement en partie la cause de la régression de la pêche des pélagiques hauturiers, malgré le développement des dispositifs de concentration de poissons (DCP) qui sont à l’origine d’environ 30 % des débarquements de la pêche de l’île. Face aux importations, la commercialisation de la pêche locale est encore peu structurée avec plus de 49 sites de vente répartis sur le territoire, généralement peu achalandés en raison des faibles prises irrégulières des pêcheurs artisans. Les espaces de vente sont encore peu équipés et rarement aux normes. C’est ainsi que plus de quarante pour cent des tables de vente sont en bois. Plusieurs options sont actuellement examinées pour améliorer la fiabilité et la précision des données collectées par le SIH sans augmenter leurs coûts de collecte. Le traitement des données collectées sur quelques années permettra d’affiner les critères de stratification de la population afin d’améliorer la précision des données. Compte tenu de l’éparpillement des points de débarquement et de la faible fréquence de sortie des navires de pêche, une optimisation du travail de terrain des observateurs doit être faite. L’objectif de ces enquêtes de terrain doit être de : - servir de témoin pour la validation des enquêtes téléphoniques. Pour cela, il faudra rechercher les sousensembles communs aux enquêtes téléphoniques et aux observations sur le terrain afin qu’ils soient comparables ; - disposer d’une composition spécifique et en taille des débarquements qui soit si possible représentative de l’ensemble des débarquements ou au moins d’une part significative qui pourrait servir d’indicateur de l’évolution de la pêche et des ressources exploitées. Afin d’optimiser les déplacements des observateurs sur le terrain, les données des enquêtes téléphoniques peuvent être utilisées pour identifier par semestre les 50 à 100 sites et tranches horaires de cinq heures au sein desquels les fréquences de retours de pêche sont les plus élevées. L’étude pilote a montré que, par ce procédé, le nombre de retours échantillonnés s’élève en moyenne à 3,5. Les échantillonnages biologiques des débarquements permettant de décrire leur composition spécifique et en taille sont réalisés par photographie lorsque l’engin utilisé capture un grand nombre d’espèces différentes (nasses, filets de fond, senne de plage...). Par ce procédé, il est possible de réduire la durée des échantillonnages de près de trois quarts du temps nécessaire aux mensurations directes, et ainsi de moins gêner le débarquement et la vente du poisson. Ce procédé permet également d’avoir une traçabilité des échantillonnages; il offre notamment la possibilité de revenir sur les identifications en cas de doute. Cette méthode, aujourd’hui bien rodée, devrait permettre d’améliorer la qualité des travaux sur la biodiversité de la faune marine.

Droits : 2013 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00156/26762/24850.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00156/26762/