Éditeur(s) : HAL CCSD Ecole nationale du génie rural
Résumé :  
La forte diversité d'espèces arborescentes observées en forêts tropicales représente à la fois une source permanente de questionnements scientifiques et une contrainte forte pour améliorer les connaissances du fonctionnement de l'écosystème forestier. Les hypothèses avancées pour expliquer le maintien de cette diversité sont légion. Elles s'opposent sur la nature déterministe ou stochastique des mécanismes maintenant cette forte diversité. En pratique et pour mieux aborder les problèmes posés, cette diversité peut être simplifiée en regroupant les espèces présentant des similitudes dans leur comportement écologique. L'article présente quelques-unes des théories du maintien de la diversité et une synthèse des approches utilisées pour regrouper les espèces en illustrant chacun de ces thèmes par des travaux réalisés en Guyane.
ISSN: 0035-2829

hal-01032095
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032095

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : Le débat théorique sur les migrations et la famille connait une ambivalence allant du postulat de la migration comme une logique « individualiste » et de distanciation de la famille à celui de la migration vue comme une stratégie de survie portée par le réseau familial. C’est dans le but de contribuer à ce débat que le présent texte aborde l’analyse du processus migratoire sous l’angle des stratégies déployées par les migrants « Hloua » de la côte béninoise. Quatre dimensions ont particulièrement retenu notre attention : la prise de décision, le financement et l’organisation du voyage, l'intégration dans le milieu d’accueil, et les rapports maintenus avec le milieu d'origine.L’analyse s’appuie sur les récits de migration collectés auprès de migrants de retour ou de membres de familles restés au village, ceci dans le cadre d’une enquête plus large sur la pauvreté et les stratégies de survie dans le milieu de la pêche artisanale (Avloh, Ayiguinnou et Agoué) au Bénin. Cette analyse de récit a été complétée par des analyses de type quantitatif sur la fréquence des recours pour l’organisation et la prise de décision, la fréquence de recours pour l’insertion résidentielle et professionnelle, et le montant des envois de fonds. Les résultats montrent la place centrale du réseau familial le long du processus migratoire depuis la prise de décision, l’organisation du voyage, le « confiage » de la femme et des enfants du migrant, à l’établissement résidentiel et l’insertion professionnelle dans le milieu d’accueil. Ce réseau organise et structure efficacement le phénomène migratoire en intervenant lors des étapes décisives. Cependant, une fois insérés, les rapports maintenus avec le réseau familial se limitent pour la plupart à une solidarité affective, caractérisée par des contacts téléphoniques ou transferts de message et quelques envois de fonds largement en deçà des attentes. Ce qui fait dire de plus en plus que le migrant diminue le capital social de la famille sans pour autant y contribuer de façon substantielle sur le plan financier : Un paradoxe qui pourrait bien trouver son explication dans les recherches futures sous une perspective dynamique des migrations.
The theoretical debate on migration and family is ambivalent. Migration can be seen from an “individualist’’ and distant logic of the family or, on the other hand, migration can be viewed as a strategy of survival for the family network. It is in the objective of contributing to this debate, the present article will analyze the migration process from a migrant strategy perspective, more specifically from the perspective of the “Hloua” migrants off the Benin coast. Four dimensions are of particular interest: the decision making process, the cost and organization of the trip, integration in the host community and the maintenance of relations with the host community. Within a large scale research on poverty and the strategies of survival of artisan fishing (Avloh, Ayiguinnou et Agoué) in Bénin, the present analysis is based on migration stories collected from returning migrants or from family members still living in the village. This story analysis has been completed with quantitative analyses on the frequency of the use of organization and decision making, the frequency of the use of residential and professional insertion, and the amount of remittances. The results show the central place of family ties during the migratory process from the start of the decision making process, the travel planning, the entrusting of the women and children of the migrant, to the residential establishment and the professional insertion in the host society. This network organizes and structures efficiently the migratory phenomenon by intervening during the decisive steps. However, once inserted, the connections maintained with the family network are limited for the majority to an affective solidarity characterized by telephone contacts or message transfers, and sometimes remittances sent back largely lower to the family’s expectations. This results more and more in the migrant diminishing the social capital of the family without always contributing in some substantially way on the financial side. A paradox which could find its explanation in future researches under a perspective of migrations’ dynamics.
Bénin

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.5785
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/5785

Éditeur(s) : John Wiley & Sons Ltd
Résumé : 1. The development of macroalgae to the detriment of corals is now one of the major threats to coral reefs. Herbivorous fishes are partly responsible for algal regulation on coral reefs and their overexploitation favours the shift from scleractinian coral-dominated systems towards macroalgae-dominated systems. 2. Marine protected areas (MPAs) that have been established worldwide may benefit coral reefs through the maintenance of high densities of herbivorous fishes which regulate algal growth. 3. The paper assesses whether small MPAs in the Caribbean are able to enhance herbivorous fish stock and by controlling macroalgae help to maintain reef ecosystems. A visual census using band-transects was undertaken around Guadeloupe island where marine reserves have been in place since 1979. The effects of MPAs on both benthic communities and herbivorous fishes are examined. 4. Inside MPAs, herbivorous fish biomass was almost twice as high as outside MPAs and macroalgal cover was significantly lower. Fish size class distributions revealed that large individuals occurred mainly inside MPAs and that few male individuals were found outside MPAs. Copyright (C) 2010 John Wiley & Sons, Ltd.
Aquatic Conservation-marine And Freshwater Ecosystems (1052-7613) (John Wiley & Sons Ltd), 2010-07 , Vol. 20 , N. 5 , P. 516-524

Droits : 2010 John Wiley & Sons, Ltd.
http://archimer.ifremer.fr/doc/00011/12214/9551.pdf
DOI:10.1002/aqc.1118
http://archimer.ifremer.fr/doc/00011/12214/

Éditeur(s) : HAL CCSD Oxford University Press (OUP)
Résumé : International audience
Gravitropism is necessary for plants to control the orientation of their axes while they grow in height. In woody plants, stem re-orientations are costly because they are achieved through diameter growth. The functional diversity of gravitropism was studied to check if the mechanisms involved and their efficiency may contribute to the differentiation of height growth strategies between forest tree species at the seedling stage. Seedlings of eight tropical species were grown tilted in a greenhouse, and their up-righting movement and diameter growth were measured during three months. Morphological, anatomical and biomechanical traits were measured at the end of the survey. Curvature analysis was used to analyse the up-righting response along the stems. Variations in stem curvature depend on diameter growth, size effects, the increase in self-weight, and the efficiency of the gravitropic reaction. A biomechanical model was used to separate these contributions. Results showed that (1) gravitropic movements were based on a common mechanism associated to similar dynamic patterns, (2) clear differences in efficiency (defined as the change in curvature achieved during an elementary diameter increment for a given stem diameter) existed between species, (3) the equilibrium angle of the stem and the anatomical characters associated to the efficiency of the reaction also differed between species, (4) the differences in gravitropic reaction were related to the light requirements: heliophilic species, compared to more shade-tolerant species, had a larger efficiency and an equilibrium angle closer to vertical. This suggests that traits determining the gravitropic reaction are related to the strategy of light interception and may contribute to the differentiation of ecological strategies promoting the maintenance of biodiversity in tropical rain forests.
ISSN: 0022-0957

hal-00797023
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00797023
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00797023/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00797023/file/Functional_diversity_gravitropic_Almeras_al.pdf

Résumé : Depuis maintenant plus de trois ans, l'équipe IFREMER de Martinique travaille à la mise au point technique de l'élevage de l'ombrine subtropicale (Sciaenops ocellata), dans des conditions intensives. En matière de reproduction, l'équipe IFREMER a engagé dès 1987, une opération de transfert de la technologie Américaine de maturation et ponte grace au contrôle environnemental de la température et de la photopériode. Près de 50 millions d'oeufs ont été produits en 1989, à partir de 5 femelles de 5 à 6 kg. En terme d'alevinage, les "résidus d'expérimentation", ont été de 12.000, 18.000, 9.ooo et 89.000 alevins sevrés (1 à 2g), respectivement pour les années 1987, 88, 89 et 1990. En 1990, l'objectif principal de démonstration de la faisabilité de la technique d'alevinage en intensif a été atteint avec succès à travers trois élevages "pilotes" sucessifs aux taux de survie moyen, à 2 grammes, de 14%, 15% et 24%.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00081/19190/16785.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00081/19190/

Éditeur(s) : University of Tasmania, Université de Bretagne Occidentale
Résumé : Empirical evidence and the theoretical literature both point to stock sustainability and the protection of marine biodiversity as important fisheries management issues. Decision-support tools are increasingly required to operationalize the ecosystem-based approach to fisheries management. These tools need to integrate (i) ecological and socio-economic drivers of changes in fisheries and ecosystems; (ii) complex dynamics; (iii) deal with various sources of uncertainty; and (iv) incorporate multiple, rather than single objectives. The stochastic co-viability approach addresses the trade-offs associated with balancing ecological, economic and social objectives throughout time, and takes into account the complexity and uncertainty of the dynamic interactions which characterize exploited ecosystems and biodiversity. This thesis proposes an application of this co-viability approach to the sustainable management of mixed fisheries, using two contrasting case studies: the French Bay of Biscay (BoB) demersal mixed fishery and the Australian Northern Prawn Fishery (NPF). Both fisheries entail direct and indirect impacts on mixed species communities while also generating large economic returns. Their sustainability is therefore a major societal concern. A dynamic bio-economic modelling approach is used to capture the key biological and economic processes governing these fisheries, combining age- (BoB) or size- (NPF) structured models of multiple species with recruitment uncertainty, and multiple fleets (BoB) or fishing strategies (NPF). Economic uncertainties relating to input and output prices are also considered. The bioeconomic models are used to investigate how the fisheries can operate within a set of constraints relating to the preservation of Spawning Stock Biomasses (BoB) or Spawning Stock Size Indices (NPF) of a set of key target species, maintenance of the economic profitability of various fleets (BoB) or the fishery as a whole (NPF), and limitation of fishing impacts on the broader biodiversity (NPF), under a range of alternative scenarios and management strategies. Results suggest that under a status quo strategy both fisheries can be considered as biologically sustainable, while socio-economically (and ecologically in the NPF case) at risk. Despite very different management contexts and objectives, viable management strategies suggest a reduction in the number of vessels in both cases. The BoB simulations allow comparison of the trade-offs associated with different allocations of this decrease across fleets. Notably, co-viability management strategies entail a more equitable allocation of effort reductions compared to strategies aiming at maximizing economic yield. In the NPF, species catch diversification strategies are shown to perform well in controlling the levels of economic risk, by contrast with more specialized fishing strategies. Furthermore analyses emphasize the importance to the fishing industry of balancing global economic performance with inter-annual economic variability. Promising future developments based on this research involve the incorporation of a broader set of objectives including social dimensions, as well as the integration of ecological interactions, to better address the needs of ecosystem-based approaches to the sustainable harvesting of marine biodiversity.
L’objectif général de la thèse est de modéliser les principaux processus biologiques et économiques régissant des pêcheries multi-espèces et multi-flottilles afin de proposer des stratégies viables pour la gestion durable de ces pêcheries mixtes, dans un contexte stochastique et multiobjectif. Plus spécifiquement, cette thèse utilise des analyses de co-viabilité stochastique pour étudier les arbitrages entre des objectifs contradictoires de gestion (conservation, et viabilité économique et sociale) des pêcheries mixtes. Deux pêcheries mixtes sont analysées dans cette thèse: la pêcherie française mixte démersale du golfe de Gascogne et la pêcherie crevettière australienne du Nord (NPF). Ces deux pêcheries sont multi-espèces, et utilisent des stratégies multiples de pêche, induisant des impacts directs et indirects sur les écosystèmes. Cette thèse propose une application de la co-viabilité stochastique à ces deux cas, en prenant en compte leur histoire, leur contexte socio-politique et les différences dans les stratégies et objectifs de gestion. Les résultats suggèrent que le status quo peut être considéré comme une stratégie biologiquement durable mais socio économiquement à risque dans les deux pêcheries (ainsi qu’à risque écologique dans le cas de la pêcherie australienne). Les simulations réalisées pour le golfe de Gascogne permettent de comparer les arbitrages associés à différentes réductions de capacités par flottille et de montrer qu’il existe des solutions de gestion permettant la co-viabilité du système (viabilité biologique des différentes espèces considérées et viabilité socio-économique des flottilles) contrairement à des stratégies de gestion mono-spécifiques ou basées sur la maximisation de la rente. Dans la pêcherie crevettière australienne, l’analyse montre que les stratégies de diversification permettent de limiter le risque économique contrairement aux stratégies plus spécialisées.

Droits : UBO, Univ. Tasmania
http://archimer.ifremer.fr/doc/00206/31731/30134.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00206/31731/

Éditeur(s) : HAL CCSD National Academy of Sciences
Résumé : International audience
The integration of foreign genetic information is central to the evolution of eukaryotes, as has been demonstrated for the origin of the Calvin cycle and of the heme and carotenoid biosynthesis pathways in algae and plants. For photosynthetic lineages, this coordination involved three genomes of divergent phylogenetic origins (the nucleus, plastid, and mitochondrion). Major hurdles overcome by the ancestor of these lineages were harnessing the oxygen-evolving organelle, optimizing the use of light, and stabilizing the partnership between the plastid endosymbiont and host through retargeting of proteins to the nascent organelle. Here we used protein similarity networks that can disentangle reticulate gene histories to explore how these significant challenges were met. We discovered a previously hidden component of algal and plant nuclear genomes that originated from the plastid endosymbiont: symbiogenetic genes (S genes). These composite proteins, exclusive to photosynthetic eukaryotes, encode a cyanobacterium-derived domain fused to one of cyanobacterial or another prokaryotic origin and have emerged multiple, independent times during evolution. Transcriptome data demonstrate the existence and expression of S genes across a wide swath of algae and plants, and functional data indicate their involvement in tolerance to oxidative stress, phototropism, and adaptation to nitrogen limitation. Our research demonstrates the ``recycling'' of genetic information by photosynthetic eukaryotes to generate novel composite genes, many of which function in plastid maintenance.
ISSN: 0027-8424

hal-01544793
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01544793
DOI : 10.1073/pnas.1517551113

Éditeur(s) : Styli 2003. Trente ans de crevetticulture en Nouvelle-Calédonie. Nouméa - Koné, 2-6 juin 2003. 2004. Gorarant C, Harache Y, Herbland A, Mugnier C. Ed. Ifremer, Actes de Colloque, n°38, pp.113-120
Résumé : Two oyster species are currently present along the French coasts : the indigenous European flat oyster (Ostrea edulis), and the Pacific cupped oyster (Crassostrea gigas), that has been introduced from Japan since the beginning of the 70ies. The flat oyster successively suffered from two protozoan diseases during the 60ies and its production decreased from 20 000 tons/year by that time to 1 500 tons/year nowadays. Consequently, the oyster production is principally (99%) based upon the Pacific oyster species with approximately 150 000 tons/year among which 90% are grown from the natural spat. However, the hatchery production of this species is developing and was estimated to 400 to 800 millions spat in 2002. Moreover, strengthened relationships between IFREMER and the 5 commercial hatcheries, that all joined the SYSAAF (Union of the French poultry, shellfish and fish farming selectors), allow to plan for new genetic breeding programs. At the end of the 80ies, IFREMER initiated a genetic breeding program for the resistance of the European flat oyster to the bonamiosis, and obtained strains more tolerant to this disease. After two generations of massal selection, molecular markers had identified a reduced genetic basis in this program. It was then reoriented to an intra-familial selection. However, we were confronted to a zootechnic problem to manage such a scheme and we compromised by an intra-cohorts of families selection scheme managed using molecular markers. The program has now reached the transfer level with experimentation at a professional scale. Concerning the Pacific cupped oyster, and in parallel with the obtaining and the study of polyploids, performance of different Asian cupped oyster strains were compared to the one introduced in France thirty years ago and currently suffering from summer mortalities. The local strain exhibited better performance, certainly based upon a good local adaptation. In other respects, although early growth is a relevant criteria for selection for growth to commercial stage, it is not to be privileged in the context of an oyster producing region with a limited food availability. Contrary, the spat summer mortality became a priority for numerous teams (genetic, physiology, pathology, ecology,...) joined in the MOREST program. The first results showed important survival differences between fullsib and halsib families. They indicate a genetic determinism to this character "survival" and promote for its selection.
Deux espèces d'huîtres sont aujourd'hui présentes sur les côtes françaises : l'huître plate européenne (Ostrea edulis), indigène, et l'huître creuse du Pacifique (Crassostrea gigas), introduite du Japon dans le début des années 1970. L'huître plate a subi coup sur coup, dans les années 1960, deux maladies dues à des protozoaires parasites et sa production est ainsi passée de 20 000 t/an dans les années 1960 à 1500 t/an aujourd'hui en France. Il en résulte que la filière ostréicole française repose quasiment exclusivement (99%) sur la production de l'huître creuse, C. gigas, avec 150 000 tonnes en 2000 dont environ 90% est issu du captage naturel. Cependant, la reproduction de cette espèce en écloserie est actuellement en expansion avec une estimation de 400 à 800 millions de naissains commercialisés en 2002. Des rapports renforcés entre l'IFREMER et les cinq écloseries françaises de la filière ostréicole, qui adhèrent toutes au SYSAAF (SYndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français), permettent désormais d'envisager le développement de nouveaux programmes d'amélioration génétique. A la fin des années 1980, un programme de sélection pour la résistance de l'huître plate à la bonamiose a été initié au sein de l'IFREMER, et a permis d'obtenir des souches plus tolérantes à cette maladie. Après deux générations en sélection massale, les marqueurs moléculaires avaient mis en évidence une base génétique réduite au sein de ce programme qui s'était alors orienté vers une sélection intra-familiale. Devant la lourdeur zootechnique d'un tel schéma, un compromis a été trouvé en réalisant une sélection au sein de cohortes de familles biparentales, la gestion de ces cohortes étant permise par les analyses moléculaires. Le programme est maintenant dans sa phase de transfert, avec des expérimentations à plus grande échelle en partenariat avec la profession. En ce qui concerne l'huître creuse, et en parallèle de l'obtention et l'étude de polyploïdes, les performances de différentes souches d'huîtres creuses provenant d'Asie ont été comparées à celles de la souche introduite en France il y a trente ans, sujette à des mortalités estivales. La souche locale présente de meilleures performances, vraisemblablement grâce à une adaptation bien réalisée. Par ailleurs, bien que l'amélioration de la croissance jusqu'à la taille commerciale s'avère possible par une sélection précoce au stade larvaire, le critère de croissance n'est pas nécessairement à privilégier dans le contexte d'un bassin ostréicole disposant de ressources trophiques limitées. En revanche, les importantes mortalités rencontrées par le naissain en périodes estivales constituent le sujet d'étude prioritaire sur lequel se sont penchées de nombreuses équipes (génétique, physiologie, pathologie, écologie, ...) dans le cadre du grand défi MOREST. Les premiers résultats ont mis en évidence de fortes différences de survie entre des familles biparentales d'animaux indiquant un déterminisme génétique du caractère « survie », et encourageant dans la voie d'une sélection pour ce caractère.

Droits : 2004 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-3491.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3491/

Éditeur(s) : 10 th Meeting of the World Mariculture Society. Honolulu, January 1979
Résumé : Three shrimp species, Penaeus monodon, P. stylirostris (Panama and Mexican strains) and P. vannamei have matured and spawned in captivity at the Centre Océanologique du Pacifique (COP) laboratory. The shrimp, originally stocked as juveniles or postlarvae, were reared to adult size in tanks and ponds and have completed the cycle: F3 generation for P. monodon, F2 for P. stylirostris (Panama strain) and P. vannamei and F1 for P. stylirostris (Mexican strain). Maturation occurs naturally under our rearing conditions or is induced by unilateral eyestalk ablation. Details are given on mating behavior, ovarian development, number of spawnings, egg viability and maintenance of captive brood stock. Partial results so far obtained for P. monodon and P. stylirostris clearly show a reared brood stock could sustain a commercial hatchery. [NOT CONTROLLED OCR]

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1979/acte-4423.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4423/

Éditeur(s) : HAL CCSD Frontiers Media
Résumé : The disease, Heartwater, caused by the Anaplasmataceae E. ruminantium, represents a major problem for tropical livestock and wild ruminants. Up to now, no effective vaccine has been available due to a limited cross protection of vaccinal strains on field strains and a high genetic diversity of Ehrlichia ruminantium within geographical locations. To address this issue, we inferred the genetic diversity and population structure of 194 E. ruminantium isolates circulating worldwide using Multilocus Sequence Typing based on lipA, lipB, secY, sodB, and sucA genes. Phylogenetic trees and networks were generated using BEAST and SplitsTree, respectively, and recombination between the different genetic groups was tested using the PHI test for recombination. Our study reveals the repeated occurrence of recombination between E. ruminantium strains, suggesting that it may occur frequently in the genome and has likely played an important role in the maintenance of genetic diversity and the evolution of E. ruminantium. Despite the unclear phylogeny and phylogeography, E. ruminantium isolates are clustered into two main groups: Group 1 (West Africa) and a Group 2 (worldwide) which is represented by West, East, and Southern Africa, Indian Ocean, and Caribbean strains. Some sequence types are common between West Africa and Caribbean and between Southern Africa and Indian Ocean strains. These common sequence types highlight two main introduction events due to the movement of cattle: from West Africa to Caribbean and from Southern Africa to the Indian Ocean islands. Due to the long branch lengths between Group 1 and Group 2, and the propensity for recombination between these groups, it seems that the West African clusters of Subgroup 2 arrived there more recently than the original divergence of the two groups, possibly with the original waves of domesticated ruminants that spread across the African continent several thousand years ago.
ISSN: 2235-2988

hal-01594501
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01594501
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01594501/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01594501/file/paper_MLST_ER_2016_%7B51027B58-C2C7-41C8-9746-BD8A9F387C87%7D.pdf
DOI : 10.3389/fcimb.2016.00111

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag
Résumé : The diversity and functional identity of organisms are known to be relevant to the maintenance of ecosystem processes but can be variable in different environments. Particularly, it is uncertain whether ecosystem processes are driven by complementary effects or by dominant groups of species. We investigated how community structure (i.e., the diversity and relative abundance of biological entities) explains the community-level contribution of Neotropical ant communities to different ecosystem processes in different environments. Ants were attracted with food resources representing six ant-mediated ecosystem processes in four environments: ground and vegetation strata in cropland and forest habitats. The exploitation frequencies of the baits were used to calculate the taxonomic and trophic structures of ant communities and their contribution to ecosystem processes considered individually or in combination (i.e., multifunctionality). We then investigated whether community structure variables could predict ecosystem processes and whether such relationships were affected by the environment. We found that forests presented a greater biodiversity and trophic complementarity and lower dominance than croplands, but this did not affect ecosystem processes. In contrast, trophic complementarity was greater on the ground than on vegetation and was followed by greater resource exploitation levels. Although ant participation in ecosystem processes can be predicted by means of trophic-based indices, we found that variations in community structure and performance in ecosystem processes were best explained by environment. We conclude that determining the extent to which the dominance and complementarity of communities affect ecosystem processes in different environments requires a better understanding of resource availability to different species.
ISSN: 0029-8549

hal-01606497
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01606497
DOI : 10.1007/s00442-016-3741-z
PRODINRA : 407457

Résumé : New Artemia strain from Russia are now available on the market. They have been evaluated by comparison with Artemia from Great Salt Lake which are routinely used at the LAC hatchery,. Five criteria were compared and all of them were in favour of the American strain with 191 833 nauplii per gram while the Russian ones only gave 102 667 nii per gram. Another important criteria when using Artemia was hatching time which turned out to be longer for the Russian.
Des Artemia d’origine russe sont maintenant disponibles sur le marché. La comparaison avec des Artemia du Grand Lac Salé habituellement utilisées est effectuée afin de déterminer les caractéristiques de cette nouvelle marque d’Artemia. Sur les 5 critères testés, l’avantage est nettement en faveur de la souche américaine avec 191 833 nauplii par gramme contre 102 667 pour la souche russe. Le temps d’éclosion des Artemia russes semble relativement plus long, c’est donc un paramètre à considérer lors de l’utilisation de cette souche.

Droits : 2004 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00119/23005/20836.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00119/23005/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Joint inversions are now commonly used in Earth Sciences. They have been developed to better understand Earth structure since they provide more constraints on the inverted parameters. We propose a new process to simultaneously invert several data sets in order to better image 3-D crustal and upper mantle structures. Our inversion uses 3 kind of data which present a good complementarity : (1) P receiver functions to provide Moho depth variations, (2) teleseismic delay times of P waves to retrieve velocity anomalies in the crust and upper mantle, (3) gravity anomalies to image density variations at lithospheric scale. In our scheme, receiver functions are first inverted. The resulting Moho depths are then interpolated and incorporated as a priori information into the joint inversion of teleseismic delay times and gravity anomalies process. In our new approach, we perform a model space search for Moho variations, P-velocity and density structure to find acceptable fit to the three data sets. In order to preferentially sample the good data fit region, we chose the Neighborhood algorithm of Sambridge to optimistically survey the model space. We model the delay times with a 3-D raytracing using velocity nodes evenly spaced and linked with density nodes via a linear relationship. This relationship can evolve through depth, simulating its pressure dependance. We test our scheme on synthetic examples, and apply the method in a continental rifting region where deformation processes are complex and badly known. This joint inversion thus provides more constraints on the inverted parameters, and allows us to better image crust - mantle interactions in the case of the Hangai dome (Central Mongolia). Indeed, in this area, we expect an asthenospheric upwelling to dynamically support the topography, but we image a density - velocity anomaly in the lower crust. The effects on topography and the origin (composition vs. thermal) of this anomaly are still under debate.
Les inversions conjointes sont maintenant communément utilisées en Sciences de la Terre. Elles ont été développées afin d'améliorer notre connaissance et compréhension de la structure interne de la Terre puisqu'elles apportent de plus en plus de contraintes sur les paramètres inversés. Dans cette thèse, nous proposons un nouveau processus d'inversion conjointe qui prend en compte trois paramètres différents et qui mène à l'obtention d'un modèle lithosphérique tridimensionnel. Notre méthode utilise trois types de données gravimétriques et sismologiques qui présentent une bonne complémentarité : (1) Les fonctions récepteur P afin d'obtenir les variations de profondeur du Moho, (2) les délais de temps d'arrivées P des téléséismes pour retrouver les anomalies de vitesse dans la croûte et le manteau supérieur, (3) les anomalies gravimétriques qui donnent accès aux variations de densité à l'échelle lithosphérique. Dans le schéma d'inversion proposé, nous inversons d'abord les fonctions récepteur. Les variations de profondeur du Moho qui en résultent sont alors interpolées puis incorporées comme information a priori dans le processus d'inversion conjointe gravimétrie - tomographie télésismique. Que ce soit pour les fonctions récepteur ou pour la partie conjointe, notre méthode d'inversion se base sur un algorithme de recherche afin de trouver la structure qui minimise l'écart aux trois types de données. Nous avons opté pour l'algorithme de voisinage qui présente l'avantage de concentrer sa recherche dans les régions qui minimisent l'écart aux données sans toutefois abandonner les autres régions afin de limiter les risques de convergence vers un minimum local. Nous utilisons un modèle 3-D constitué de noeuds de vitesse afin de modéliser les délais de temps. Ces noeuds de vitesse sont liés aux noeuds de densité grâce à une relation linéaire entre vitesse et densité. Cette relation peut évoluer avec la profondeur de manière à simuler les effets dus aux variations de pression. Nous avons réalisé plusieurs tests synthétiques afin d'évaluer le comportement de notre nouvelle méthode. Ils ont permis de montrer que les variations du Moho ainsi que les anomalies de vitesse et densité sont bien retrouvées. Ils ont également montré l'importance de la prise en compte de ces trois types de données dans un même schéma d'inversion, notamment en ce qui concerne la faculté de discerner les variations d'interfaces des anomalies volumiques. Nous avons ensuite appliqué la méthode dans une région continentale en phase de rifting où les processus de déformation sont complexes et mal connus. Notre nouvelle méthode a apporté davantage de contraintes sur les paramètres inversés et a permis d'obtenir un modèle correctement résolu de la croûte et du manteau supérieur sous le dôme de Hangai (Mongolie Centrale). Une anomalie asthénosphérique sous le dôme est souvent invoquée pour expliquer sa topographie élevée mais c'est une anomalie (en vitesse et densité) crustale (croûte inférieure) qui s'exprime dans nos modèles. Ses effets sur la topographie et son origine (compositionnelle et/ou thermique) sont encore débattus et nécessiteraient des études plus poussées (paramétriques, VP =VS, ...).
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00783524

tel-00783524
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00783524
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00783524/document
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00783524/file/Basuyau2011.pdf

Résumé : La banane plantain (Musa paradisiaca) est l’aliment de base de millions de personnes dans le monde et sa culture génère des revenus permanents pour un grand nombre d’agriculteurs, dans des plantations de taille petite ou moyenne. Comme dans d’autres régions tropicales, la culture du plantain en Guadeloupe et en Haïti est soumise à de fortes contraintes parasitaires aussi bien telluriques (i.e. du sol : nématodes phytoparasites et charançon du bananier) qu’aériennes (Cercosporiose noire notamment). Les moyens de lutte conventionnels reposent sur l’usage de produits de synthèse dont les effets néfastes sur l’environnement (sols, eaux, animaux) comme sur la santé humaine ne sont plus supportables. Il est donc urgent de réfléchir à des solutions agro-écologiques permettant de rétablir les équilibres biologiques, de maintenir une bonne qualité des sols et une production optimale dans les systèmes de culture plantains. C’est le but de ce travail de thèse qui couple la réalisation d’un diagnostic agro-écologique dans des parcelles paysannes, et le test d’alternatives agro-écologiques en milieu semi-contrôlé. Pour ce faire, une typologie des systèmes de culture plantains a été réalisée à l’issue d’une enquête agro-environnementale dans les deux zones d’étude. Elle a permis de sélectionner 23 parcelles en Guadeloupe et 12 en Haïti dans lesquelles un diagnostic agro-écologique a été conduit. Sur la base de ce diagnostic et de la recherche d’alternatives agro-écologiques à l’usage des produits chimiques, une expérimentation au champ a été mise en place en Guadeloupe en station de recherche, permettant le test de trois pratiques culturales innovantes pour le plantain (seules et combinées), à savoir : i) l’introduction d’une plante de service Paspalum notatum pour la gestion des adventices et la réduction de l’utilisation d’herbicides ; ii) l’apport de vermicompost pour le contrôle des nématodes phytoparasites inféodés au bananier plantain et la fertilisation de celui-ci ; iii) l’utilisation de plants sains PIF (Plants Issus de Fragments de tiges) indemnes de nématodes et de larves de charançon du bananier. La typologie des systèmes de culture plantains révèle que : i) en Guadeloupe les précédents : jachère, ananas et banane plantain sont prédominants avec un niveau d’intensification faible (apports d’intrants chimiques faibles et peu fréquents) ou élevé (apports d’intrants chimiques élevés et plus fréquents) ; ii) en Haïti, les précédents : jachère, banane plantain et manioc prédominent avec un niveau d’intensification faible ou nul (apport d’intrants inexistant). Les résultats du diagnostic agro-écologique montrent que, i) lorsque le niveau d’intensification est faible, les bananeraies plantains pérennes et le précédent-ananas permettent de maintenir une bonne qualité du sol et une bonne régulation des parasites telluriques ; ii) lorsque le niveau d’intensification est fort, les populations d’ingénieurs du sol diminuent drastiquement, alors que le cortège parasitaire tellurique augmente sans que cela n’affecte l’obtention de bons niveaux de rendement instantannés (parcelles précédées d’ananas ou d’une jachère principalement) ; iii) en absence totale de fertilisation, il résulte une diminution de l’activité biologique du sol mais aussi du rendement du plantain, exacerbé par le choix des précédents-culturaux (manioc ou banane plantain) en lien avec les contraintes pédoclimatiques et la maladie des raies noires (Cercosporiose noire) causée par Mycosphaerella fijiensis, notamment au sein des parcelles Haïtiennes ; iv) la succession plantain/plantain est la plus pénalisante vis-à-vis de la culture du plantain, car quelque soit le niveau d’intensification, le rendement reste relativement faible, en lien avec une dégradation de l’état sanitaire, comparativement aux autres précédents.
Plantain (Musa paradisiaca) is the staple food of millions of people worldwide and its cropping generates ongoing revenues for many farmers who are planting small or medium size areas. As in other tropical regions, plantain cultivation in Guadeloupe and Haiti is under heavy parasitic constraints terrestrial (plant-parasitic nematodes and banana weevil) as well as aerial (black Sigatoka in particular). Conventional means of control based on the use of synthetic products which adverse effects on the environment (soil, water, animals ...) as on human health are not bearable any more. It is thus urgent to think about agroecological solutions allowing to restore the biological balances, to maintain good soil quality and optimal plantain cropping systems.This is the ultimate goal of this thesis which couples the realization of an agroecological diagnosis in peasants’ plots, and the test of agroecological alternatives in semi-controlled conditions. To do this, a typology of plantain cropping systems was carried out from an agrienvironmental survey in the two study areas. It allowed to select 23 plots in Guadeloupe and 12 in Haiti in which an agroecological diagnosis was implemented. Based on this diagnosis and the research of agroecological alternatives to the use of chemicals, a field experiment was set up in Guadeloupe, in an experimental station allowing the test of three innovative practices for plantain cultivation (alone and combined), namely : i) the introduction of a cover-crop Paspalum notatum for weed control while reducing the use of herbicides ; ii) the input of worms’ compost to control plant-parasitic nematodes specific to plantain and to fertilize it ; iii) the use of healthy “PIF” plants (plants issued from stem fragments) free from telluric pests (nematodes and weevil’s larvaes).The typology of plantains cropping systems shows: i) in Guadeloupe the previous crops are: fallow pineapple and plantain predominate with a low level of intensification (low and infrequent chemical inputs) or high (high and frequent chemical inputs); ii) in Haiti, the previous crops are: fallow, plantain and cassava predominate with a low level or no intensification at all (no inputs). The results of the agroecological analysis show that : i) when the level of intensification is low, perennial plantain and pineapple as previous crops help maintaining a good soil quality and a good regulation of the telluric pests ; ii) when the level of intensification is strong, the soil engineers drastically reduce, while the density of telluric parasites increases without affecting good levels of instantaneous yields (plots where the previous crop is pineapple or mostly fallow) ; iii) when the fertilization is totally missing, it decreases the biological activity of the soil furthermore the plantain yields, exacerbated by the choice of the previous crop (cassava or plantain), in connection with soils and climate constraints and the black Sigatoka caused by Mycosphaerella fijiensis, especially in the Haitian plots ; iv) the crop succession plantain/plantain is the most critical regarding the plantain’s cropping, because whatever the level of intensification, the yields remain relatively low in connection with a degradation of the health state, compared to other previous crops.The driving of an experiment in a research station shows that on the scale of one year, the three tested innovative practices allow maintaining a good soils quality. Healthy plants "PIF" have a better health state (absence of plant parasitic nematodes in the roots) which helps a significant increase of the yields. Cover-crop P. notatum helps the weeds and the soil pests control and favors the improvement of soil biological activity and plantain yields. Worms’ compost contributes to the maintenance of a better soils quality while allowing the regulation of the populations of plant-parasitic nematodes of the plantains.

http://www.theses.fr/2014AGUY0758/document

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Given the technological development of embedded satellite sensors, the potential of available satellite images increases so that the question now arises of their most efficient exploitation possible. This is the purpose of the CARTAM-SAT project to fluidize the processing workflow from satellite images to users. The thesis is part of this framework.Processing operations relating to images have evolved over the years. Low-resolution images were processed by a so-called pixel approach while the high-resolution has allowed the development of a so-called object approach. The latter focuses on analysing not about the isolated pixels, but about groups of pixels representative of concrete objects on the ground. Thus, in principle, these are groups of pixels with a domain-specific remote sensing semantics.Along with satellite imagery, knowledge representation has evolved. The standards of representation have benefited from the expansion of the web to give rise to standards like OWL. This one is widely based on description logics that allow the use of automated reasoners able to infer implicit knowledge.This thesis is at the junction of these two sciences and provides an ontological approach for analysing satellite images. The aim is to formalize different types of knowledges and conceptualizations implicitly used by image processing programs and by remote sensing experts, and then reasoning automatically on an image description to obtain one semantic interpretation.This general principle may have numerous technical variations. The implementation consisted in a prototype combining a satellite image analysis library and an ontology-based reasoner. The implementation proposed in the thesis allows to explore four technical variations of the principle that lead to discussions on the complementarity of pixel and object analysis paradigms, the representation of some of the spatial relations and the role of knowledge in relation to processing.
Étant donnée l'évolution technologique des capteurs embarqués à bord des satellites, le potentiel d'images satellitaires accessible s'accroît de telle manière que se pose maintenant la question de son exploitation la plus efficace possible. C'est l'objectif du projet CARTAM-SAT que de fluidifier la chaîne de traitement depuis les satellites jusqu'aux utilisateurs des images. La thèse s'inscrit dans ce cadre. Les traitements relatifs aux images ont évolué au cours des années. Les images basse résolution étaient traitées par une approche dite pixel alors que la haute résolution a permis le développement d'une approche dite objet. Cette dernière s'attache à analyser non plus des pixels isolés, mais des groupes de pixels représentatifs d'objets concrets sur le terrain. Ainsi, en principe, ces groupes de pixels sont dotés d'une sémantique propre au domaine de la télédétection. La représentation des connaissances a évolué parallèlement aux images satellitaires. Les standards de représentation ont profité de l'expansion du web pour donner naissance à des standards comme OWL. Celui-ci repose en grande partie sur les logiques de description qui permettent l'utilisation de raisonneurs automatiques capables d'inférer une connaissance implicite.Cette thèse se place à la jonction de ces deux sciences et propose une approche ontologique d'analyse des images satellitaires. Il s'agit de formaliser différents types de connaissances et de conceptualisations implicitement utilisés par les logiciels de traitement d'image et par les experts en télédétection, puis de raisonner automatiquement sur la description d'une image pour en obtenir une interprétation sémantique.Ce principe général est susceptible de nombreuses déclinaisons techniques. La mise en œuvre a consisté en la réalisation d'un prototype alliant une bibliothèque d'analyse d'images satellitaires et un raisonneur basé sur les ontologies. L'implémentation proposée dans la thèse permet d'explorer quatre déclinaisons techniques du principe qui mènent à des discussions sur la complémentarité des paradigmes d'analyse pixel et objet, la représentation de certaines relations spatiales et la place de la connaissance par rapport aux traitements.
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00998692

NNT : 2013MON20059
tel-00998692
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Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Nous publions ici le texte d'une communication faite par Jean-Pierre Sainton, historien, le 16 janvier 1993, dans le cadre d'un séminaire organisé par l'UGTG (Union Générale des Travailleurs de la Guadeloupe) sur le thème « Histoire du mouvement ouvrier et du syndicalisme en Guadeloupe ». Le mouvement syndical en Guadeloupe n'apparaît qu'à la fin du 19ème siècle dans le cadre d'une société libérée des rapports sociaux esclavagistes qui avaient caractérisé la formation sociale guadeloupéenne deux siècles durant. Pourtant ce mouvement syndical va très rapidement, en l'espace d'une dizaine d'années, couvrir le pays noir, ouvrier et prolétarien, (pour reprendre l'expression de Légitimus) d'organisations collectives du monde du travail, un développement somme toute en phase avec le mouvement mondial de structuration d'organisations ouvrières, qui en Europe, en Amérique et dans le reste du monde verront l'éclosion du syndicalisme ouvrier. De ce point de vue le mouvement syndical de Guadeloupe était loin d'être en retard. Il sera même pour une colonie essentiellement agricole, particulièrement précoce et dynamique si l'on le compare à nombre de pays apparemment plus évolués, où les rapports capitalistes et les luttes ouvrières s'inscrivaient depuis un certain temps déjà dans la réalité sociale. Là, n'est pas le seul caractère original du mouvement syndical de la Guadeloupe. Cette précocité et ce dynamisme s'expliquent pour une grande part par la forte volonté associative des descendants d'esclaves, à une génération près, qui dans le cadre de la société post-esclavagiste chercheront et trouveront des formes spécifiques d'organisation pour, à la fois, mieux résister à la misère et par-achever le mouvement d'émancipation entamé en 1848 par l'abolition de l'esclavage. 141 Aux sources du mouvement syndical Trois facteurs nous semblent conditionner et expliquer [apparition et les caractères propres du mouvement syndical en Guadeloupe ; C ' est d ' une part l'impératif besoin d ' organisation de la niasse (les travailleurs, plus exactement des « petits » dans le cadre d'une société achevant sa mutation économique et sociale. C'est aussi la vivacité et la persistance des traditions des confréries nègres, héritées de la période esclavagiste comme source d'inspiration culturelle et seule expérience concrète de formes tolérées de regroupement collectif. C'est enfin, de façon plus précise, la loi de 1884 rendant possible et légale l'apparition des syndicats et l'influence concomitante du mouvement associatif venu d'Europe. Considérons de façon plus détaillée, ces trois facteurs. Les années 1860 vont marquer le tournant technologique de l'économie sucrière ; l'échec des tentatives de modernisation de l'habitation-sucrerie a favorisé l'accélération du mouvement de centralisation de la production sucrière et la constitution d'usines centrales. Ce mouvement de concentration est favorisé par la baisse des prix du sucre à partir de 1873, conséquence de la surproduction sur le marché en Europe et sur le marché français. Malgré l'ouverture du marché américain aux sucres bruts guadeloupéens qui prolonge de quelques années la survie du système de l'habitation, ce système traditionnel asphyxié financièrement, incapable de se moderniser et d'être concurrentiel en maintenant ses cadres traditionnels, ne survit pas à la grande crise sucrière de surproduction qui commence en 1884. Dès 1895, on note que le sucre brut d'habitation n'est plus côté sur la place de Pointe à Pitre. Le sucre brut d'habitation traditionnelle ne sera plus guère produit qu'à Marie-Galante. En Guadeloupe et en Grande-Terre, les dernières habitations-sucreries qui avaient résisté au premier mouvement de concentration foncière de la période post-esclavagiste finissent par être absorbées à leur tour ou se transforment en distilleries. La mort de l'habitation-sucrerie, coeur, symbole et raison d'être du système signifiait par là-même, dès cette époque, la mort du système colonial d'exploitation tel qu'il avait fonctionné deux siècles durant. Dès cette époque également, on peut noter que le colonialisme français, occupé à la conquête coloniale et à la mise en valeur de vastes espaces qu'il s'octroie en Afrique en Asie, ne semble plus être en mesure de proposer une politique coloniale de substitution suivie et cohérente pour une colonie par ailleurs largement intégrée à son propre système politique. Le nouveau paysage économique de la fin du 19"' e siècle se st r ucture donc en quatre espaces différenciés ; 142 L
Etudes guadeloupéennes

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hal-01613970
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Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Detrital zircons in metasedimentary rocks attributed to three different complexes in the Central and Pernambuco-Alagoas domains of the Borborema Province, northeastern Brazil, were dated by LA-ICP-MS. Two samples from each of the following complexes were analyzed: Sertania and Surubim, in the Central Domain, and Rio Una, in the Pernambuco-Alagoas Domain. One sample of the Sertania Complex yielded only Paleoproterozoic zircons, whereas Neoproterozoic zircons predominate in the other, with the youngest zircon indicating deposition after 642 Ma. One of the samples of the Surubim Complex yielded, again, only Paleoproterozoic concordant zircon ages. In the other sample, although Paleoproterozoic zircons predominate, ages vary from the Mesoarchean to the Neoproterozoic. The age of the youngest zircon in this latter sample indicates deposition after 850 Ma and an overgrowth on an Archean grain yielded an age of 623 +/- 6 Ma (2 sigma), interpreted as the age of peak metamorphism. The two samples of the Rio Una Complex yielded predominantly detrital zircons with ages in the ranges 2.2-2.1 Ga and 1.7-1.6 Ga. In this complex, the youngest detrital zircon suggests deposition after 917 Ma and metamorphic zircons indicate peak metamorphic conditions between 600 Ma and 617 Ma.;The results of this study, together with available data from the literature, allow the following conclusions: (a) The Sertania Complex is a Neoproterozoic sequence, and not Paleoproterozoic, as previously thought; (b) The similarity in lithological associations, detrital zircon populations and C isotope signature between the Sertania and Surubim complexes suggest that they belong to the same lithostratigraphic unit; (c) Although the Rio Una Complex can be older than the Sertania/Surubim Complex, the lack of zircons younger than 900 Ma can also result from insufficient sampling or absence of young rocks alongside the drainage system that collected detritus to this complex: (d) The regional metamorphism related to the Brasiliano Orogeny attained its climax at 630-600 Ma; (e) The age spectra of detrital zircons require their derivation from erosion of rocks formed not only during known geological events in the Borborema Province and in the nearby Sao Francisco/Congo Craton, but also from the Amazonian Craton, suggesting accumulation in an intracratonic setting within a preexisting large continent: (f) The short timespan between deposition and orogenic deformation may explain the overall medium- to high-temperature metamorphism due to maintenance, in the subsequent compressional event, of the elevated geothermal gradients produced during broad-scale lithosphere extension.
ISSN: 0301-9268

hal-00443856
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00443856
DOI : 10.1016/j.precamres.2009.09.009

Résumé : In the aim of diversification for small fisheries, a survey has been conducted in 2000 by the Regional Fisheries Committee and the French Institute for Exploitation of the Sea (Ifremer) between 200 and 600 m deep, in the West of Reunion Island. Potential commercial fish stocks have been found out. Numerous professional and recreational fishermen have bought equipment in order to exploit this resource (electric winches). But deep demersal fish is a fragile resource due mainly to low growth and late sexual maturation. Face to this increasing pressure upon a fragile resource, a new survey has been carried out by Ifremer in 2011, with use of the same fishing sites, material and method than in 2000. Results displayed in this report are compared to those of 2000. It turned out that yields of commercial species have decreased in an alarming way (over 90%) together with the fish sizes, data which exhibit a stock overfishing. The only catches of the non commercial species (small squale "Zépine" Squalus megalops) appear comparable to 2000. This survey has now to be confirmed all around Reunion Island.
Dans la perspective de diversifier la petite pêche réunionnaise, une campagne de prospection a été réalisée en 2000 par le Comité Régional des Pêches Maritimes (CRPM) et l'Institut Français de Recherche pour L'Exploitation de la Mer (Ifremer) sur des fonds de 200 à 600 m, dans l'ouest de l'île de La Réunion. Elle a montré l'existence de stocks commercialement intéressants. De nombreux pêcheurs, professionnels et plaisanciers se sont équipés en moulinets électriques pour exploiter ces ressources. Cependant les poissons démersaux profonds représentent une ressource fragile du fait, notamment, de leur croissance lente et de leur reproduction tardive. Face à cette augmentation de la pression de pêche sur une ressource fragile, une nouvelle campagne expérimentale a été menée en 2011 par l'Ifremer, en utilisant les mêmes sites de pêche, le même matériel et la même méthodologie qu’en 2000. Les résultats présentés dans ce rapport sont comparés avec ceux de la campagne de 2000. Il s’avère que les rendements en espèces commerciales ont diminué de façon très nette (plus de 90%) ainsi que la taille des poissons capturés, données caractéristiques d'une surexploitation des stocks. Seules les captures de requins zépines (Squalus megalops) non commercialisées à La Réunion restent comparables à celles de 2000. Il convient maintenant de valider ces résultats tout autour de l'île de La Réunion.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00050/16100/13643.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00050/16100/

Résumé : Les mécanismes à l’origine du maintien de la forte diversité locale des arbres des forêts tropicales humides constituent encore une énigme pour les scientifiques. Cette thèse a pour but d’étudier et de comprendre certains facteurs biotiques et abiotiques qui influencent l’assemblage des communautés des forêts tropicales humides d’Amazonie. A l’aide d’une approche empirique conduite dans les forêts tropicales de Guyane française et du Loreto au Pérou, de nombreuses expériences de terrain ont été mises en place dans le but d’apporter des éléments de réponse sur les mécanismes impliqués dans le maintien de la diversité des communautés d’arbres et d’insectes des forêts amazoniennes. Dans un premier temps, cette thèse permet de souligner l’importance des pressions biotiques exercées sur les communautés d’arbres. En effet, les communautés d’insectes peuvent influencer la composition des communautés d’arbres le long d’un gradient environnemental conduisant à des compromis entre la défense et la croissance. Ces compromis ou tradeoff permettent de maintenir la coexistence des espèces de forêts tropicales humides en favorisant la spécialisation des arbres à leur habitat (Chapitre 1, Annexe 3). Cependant, de nombreux facteurs peuvent engendrer des variations dans les compromis d’allocation exhibés par les plantes, ce qui peut compliquer la validité de ces résultats. Dans ce sens, nous avons souligné l’influence du rôle de la cascade trophique et l’existence chez certaines espèces d’arbres de stratégies d’évitement des insectes (Chapitre 2). Dans un second temps, nous avons montré que les filtres environnementaux et les distances géographiques favorisent un fort turnover de la composition des arthropodes des forêts tropicales (chapitre 3, Annexe 2). Les résultats de cette étude ont des implications fondamentales sur les mécanismes qui expliquent la structuration des communautés d’insectes herbivores. Nous avons souligné l’importance de l’interaction des communautés des insectes herbivores et de leurs plantes associées. De plus, des prédictions sont présentées sur le degré de spécialisation des insectes à leur plante-hôte (Annexe 3), notamment sur les implications possibles dans les compromis d’allocation chez les plantes. Finalement, des perspectives de recherche sont proposées en vue de poursuivre ces travaux de recherche, et notamment des extensions de mes expériences vers d’autres régions tropicales et tempérées et l’intégration de la phylogénie pour comprendre des mécanismes de coévolution entre communautés d’arbres et insectes. Nous proposons également une intégration des résultats de cette thèse dans les stratégies locales et régionales de conservation des forêts tropicales du bassin amazonien.
The mechanisms underlying the maintenance of local diversity of trees in tropical rainforests remain under debate. This dissertation aims to study and understand some biotic and abiotic factors that may influence both tree and insect community assembly in lowland tropical forests of Amazonia. I used an empirical approach to study communities of trees and insects in tropical forests of French Guiana and Peru, to address the extent to which insect herbivores contribute to the turnover of tree species across strong environmental gradients. In Chapter 1, I studied how herbivorous insect communities can influence the composition of tree communities along an environmental gradient by reinforcing tradeoffs between defense and growth that promote habitat specialization (Chapter 1, Appendix 3). The complicated variation in the patterns of growth and defense from this study led me to pursue further observations of an alternative plant defense strategy of time-avoidance of herbivores, which I examined in detail in Chapter 2. I found evidence for coordinated leaf production in some tree species that was consistent with the satiation of herbivores, suggesting that multiple interactions between plants and their herbivores may be responsible for patterns of habitat specialization in trees. In the second part of the dissertation, I examined insect herbivore communities in detail to test for turnover in species composition across geographic and environmental gradients. In Chapter 3, I present evidence for substantial beta-diversity in arthropod communities throughout lowland Amazonian forests. In the discussion I propose research perspectives to complete this research, including the extension of observations to compare tropical and temperate regions and the integration of molecular phylogenetics information to study coevolution of plant lineages and their insect herbivores. I conclude with suggestions for the integration of the results of this thesis in local and regional strategies for the preservation and conservation of tropical forests in the Amazon basin.

http://www.theses.fr/2013AGUY0582/document

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : The forests of French Guiana occupy a central part of the region’s potential resource base, but as yet remain almost completely unexploited. This stems from the forestry industry struggling to valorize wood stocks of a high diversity with an extremely heterogeneous distribution. Indeed, identifying essences for future propagation is an issue of both environmental and socio-economic importance for the region. Bagassa guianensis Aubl. and Cordia alliodora (Ruiz & Pav.) Oken. go against conventional models, in that they display the life history characteristics of rapid growth and wood of high quality, and thus are species of high potential for future plantations. Firstly, our study of growth characteristics reveals a defined strategy half way between long-lived species and pioneer species. It is the variability of basic density of wood which is a key trait allowing for such a development, favoring rapid growth in initial years whilst allowing for tree longevity. Secondly, the analysis of a range of wood properties (shrinkage, modulus of elasticity, durability) in relation to tree growth confirms the technologic quality of the two species. It also enables the emergence of new results like the effect of extractives on wood stability, the control of growth as a result of basic density variation, the evolution of leaf traits throughout tree development or the improvement of trunk maintenance thanks to interlocked grain. The knowledge gained in relation to the developmental traits of these two species, and to the quality of their wood allows for the elaboration of plantation projects and what will be required for their success. The results of this study can orientate future studies on novel species for commercialization in French Guiana.
La ressource forestière en Guyane occupe une place maîtresse au sein de la région et est encore majoritairement préservée, mais la filière bois parvient difficilement à valoriser la biodiversité locale en raison de l’hétérogénéité de la ressource. Identifier les essences à planter demain représente aujourd’hui un enjeu à la fois environnemental, économique et social pour la Guyane. Bagassa guianensis Aubl. et Cordia alliodora (Ruiz & Pav.) Oken. vont à l’encontre des modèles usuels en associant vitesse de croissance et qualité du bois et sont identifiées comme prometteuses pour la plantation. Dans un premier temps, l’étude de la dynamique de croissance des deux espèces révèle un modèle écologique singulier, à la fois pionnières et longévives. La variabilité de l’infradensité dans l’arbre est l’élément clé qui permet un tel développement, favorisant une croissance rapide dans les premières années tout en assurant la longévité de l’individu. Dans une seconde partie, l’analyse d’un large panel de propriétés du bois (retrait, module, durabilité) en lien avec le développement de l’arbre confirme les qualités technologiques des deux espèces et permet l’émergence de résultats novateurs tels que le rôle des extractibles sur le retrait, le contrôle de la croissance grâce aux variations d’infradensité, l’évolution des traits foliaires au cours de l’ontogénie ou encore la mise en place de contrefil dans l’arbre pour assurer son maintien. La connaissance acquise vis-à-vis du mode de développement de ces deux espèces et des facteurs influençant la qualité de leur bois permet aujourd’hui de définir avec plus de précision le cadre d’un projet de plantation et les conditions de son succès. Les résultats de cette étude permettent finalement d’orienter la recherche de nouvelles espèces d’avenir pour la plantation en Guyane.
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01430243

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NNT : 2015YANE0002
tel-01430243
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