Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley
Résumé : International audience
Pathogenic agents can be very hard to detect, and usually they do not cause illness for several hours or days. To improve the speed and the accuracy of detection tests and satisfy the needs of early diagnosis, molecular biology methods such as PCR are now used. However, selecting a proper target gene and designing good primers is often not easy. We present a dedicated website, http://patho-genes.org, where we provide every sequence, functional annotation, published primer and relevant article for every annotated gene of major pathogenic bacterial species listed as key agents to be used for a bioterrorism attack. Each published primer was analysed to determine its melting temperature, its specificity and its coverage (i.e. its sensitivity against every allele of its target gene). Data generated have been organized in the form of data sheet for each gene, which are available through multiple browser panels and query systems.
ISSN: 1751-7915

hal-01546181
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01546181
DOI : 10.1111/j.1751-7915.2012.00353.x

Éditeur(s) : Lugdun. Batavorum : apud Franciscum Hackium Amsterdam : Elzevier
Résumé : "Titre gravé sur cuivre (f. *1) suivi du faux-titre imprimé (f. *2) : "Guilielmi Pisonis, M. D. Lugduno-Batavi, de medicina Brasiliensi libri quatuor: I. De aëre, aquis, & locis. II. De morbis endemiis. III. De venenatis & antidotis. IV. De facultatibus simplicium. Et Georgii Marcgravii de Liebstad, misnici germani, historiæ rerum naturalium Brasiliæ, libri octo: quorum tres priores agunt de plantis. Quartus de piscibus. Quintus de avibus. Sextus de quadrupedibus & serpentibus. Septimus de insectis. Octavus de ipsa regione, & illius incolis. Cum appendice de Tapuyis, et Chilensibus. Joannes de Laet, Antwerpianus, in ordinem digessit & annotationes addidit, & varia ab auctore omissa supplevit & illustravit". - La 2e partie est précédée du faux-titre : "Georgii Marcgravii de Liebstad, misnici germani, historiæ rerum naturalium Brasiliæ, libri octo: quorum tres priores agunt de plantis. Quartus de piscibus. Quintus de avibus. Sextus de quadrupedibus, et serpentibus. Septimus de insectis. Octavus de ipsa regione, & illius incolis. Cum appendice de Tapuyis, et Chilensibus. Joannes de Laet, Antwerpianus, in ordinem digessit & annotationes addidit multas, & varia ab auctore omissa supplevit & illustravit". - Épître dédicatoire au comte Maurice de Nassau Edition originale. - Frontispice gravé sur cuivre par Theodor Matham. - 436 bois dans le texte, d'après Georg Marcgrave et Albert Eckhout Imprimé à Leyde par Bonaventure et Abraham Elzevier, d'après Rahir. Sig. *6, A-P4, Q2 ; -4, A-Oo4, Pp2. - Demi reliure basane, 19e siècle. - Cachet de l'Académie royale de Bordeaux. - Cachet de la bibliothèque de la Ville de Bordeaux Borba de Moraes II, 675-6. - Garrison-Morton 5303. - Nissen BBI 1553. - Nissen IVB 589. - Rahir 1077. - Sabin 63028. - Willems 1068"
Siècle(s) traité(s) : 17
Droits : Domaine public
Provenance : Ville de Bordeaux. Bibliothèque municipale
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/BBX17010
BBX17010

Éditeur(s) : Paris : F. Alcan
Siècle(s) traité(s) : 19
Droits : Domaine public
Provenance : Archives territoriales de Guyane
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/FRA11188
FRA11188

Éditeur(s) : Londres ; Paris : P.-F. Didot jeune
Siècle(s) traité(s) : 18
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Guyane. Bibliothèque Alexandre-Franconie
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/FRA11054
FRA11054

Éditeur(s) : Paris : chez la Veuve Piget
Siècle(s) traité(s) : 18
Droits : Domaine public
Provenance : Archives territoriales de Guyane
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/GAD11005
GAD11005

Éditeur(s) : Paris : Laurent d'Houry
Siècle(s) traité(s) : 18
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Martinique. Bibliothèque Schoelcher
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/SCH13253
SCH13253

Éditeur(s) : Paris : Amyot
Résumé : Récit de voyage du capitaine Canot à bord d'un négrier
Siècle(s) traité(s) : 19
Droits : Domaine public
Provenance : Fondation Clément
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/FCL18004
FCL18004

Éditeur(s) : Paris : Emile Larose, Libraire-Editeur
Siècle(s) traité(s) : 20
Provenance : Archives départementales de Guadeloupe
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/ADG18123
ADG18123

Éditeur(s) : Lyon : Jean Pillehotte
Résumé : "Date de naissance de Garcia da Orta approximative. Le traité de Christoval Acosta et chacun des deux livres de Nicolás Monardes ont une page de titre particulière. Privilège du 11 février 1600. Achevé d'imprimer le 27 juin 1602. - Figure gravée sur bois - Marque aux titres Sig. ã8, A-Aaa8, Bbb2 (pagination 367-368 répétée; f. Ii5 et Ss8 non compris dans la pagination; p. 720 chiffrée 711)"
Siècle(s) traité(s) : 17
Droits : Domaine public
Provenance : Ville de Bordeaux. Bibliothèque municipale
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/BBX17002
BBX17002

Éditeur(s) : Basse-Terre : Imp. du Gouvernement
Siècle(s) traité(s) : 17
Provenance : Archives départementales de Guadeloupe
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/ADG18130
ADG18130

Éditeur(s) : HAL CCSD Nakanishi Printing Co
Résumé : International audience
In Vibrio cholerae, the etiological agent of cholera, most of the virulence genes are located in two pathogenicity islands, named TCP (Toxin-Co-regulated Pilus) and CTX (Cholera ToXins). For each V. cholerae pathogenicity gene, we retrieved every primer published since 1990 and every known allele in order to perform a complete in silico survey and assess the quality of the PCR primers used for amplification of these genes. Primers with a melting temperature in the range 55-60 degrees C against any target sequence were considered valid. Our survey clearly revealed that two thirds of the published primers are not able to properly detect every genetic variant of the target genes. Moreover, the quality of primers did not improve with time. Their lifetime, i.e. the number of times they were cited in the literature, is also not a factor allowing the selection of valid primers. We were able to improve some primers or design new primers for the few cases where no valid primer was found. In conclusion, many published primers should be avoided or improved for use in molecular detection tests, in order to improve and perfect specificity and coverage. This study suggests that bioinformatic analyses are important to validate the choice of primers.
ISSN: 1342-6311

hal-01546178
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01546178
DOI : 10.1264/jsme2.ME11317

Éditeur(s) : Paris : Dufart père
Siècle(s) traité(s) : 19
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Martinique. Bibliothèque Schoelcher
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/SCH13038
SCH13038

Éditeur(s) : Basse-Terre : Imp. du Gouvernement
Siècle(s) traité(s) : 17
Provenance : Archives départementales de Guadeloupe
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/ADG18129
ADG18129

Éditeur(s) : Paris : chez André Cailleau
Résumé : Nouvelle édition

Droits : Domaine public
Provenance : Archives territoriales de Guyane
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/GAD11002
GAD11002

Éditeur(s) : Paris : Victor Bunel
Résumé : "In-4° à 2 col., 403 p., fig., portrait, fig. au titre. On a joint, derrière la p. de titre, une "Notice historique sur les anciennes galères", de 4 p. n. ch. et non signée ainsi que le "Catalogue des ouvrages publiés dans [les 14 premiers vol. de] "l'Omnibus", journal illustré paraissant 2 fois par semaine" et parmi lesquels figurent des oeuvres de P. Zaccone"
Siècle(s) traité(s) : 19
Droits : Domaine public
Provenance : Conseil départemental de la Guadeloupe. La Médiathèque Caraïbe
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/LAM17002
LAM17002

Éditeur(s) : Ministère de la marine et des colonies
Résumé : Description des plantes des colonies françaises.
Siècle(s) traité(s) : 18
Droits : Domaine public
Provenance : Fondation Clément
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/FCL18019
FCL18019

Éditeur(s) : Paris : Firmin Didot Frères
Extrait de : L'Univers : histoire et description de tous les peuples
Résumé : La page de titre indique le titre complet du recueil : "Chili, Paraguay, Uruguay, Buenos-Ayres [Texte imprimé] / par M. César Famin.... Patagonie, Terre-du-Feu et archipel des Malouines / par M. Frédéric Lacroix. Iles diverses des trois Océans et régions circompolaires / par M . le commandeur Bory de Saint-Vincent... et par M. Frédéric Lacroix" ; seule la partie médiane est ici reproduite.
Siècle(s) traité(s) : 19
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Guyane. Bibliothèque Alexandre-Franconie
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/FRA11274-1
FRA11274-1

Éditeur(s) : Paris : Imprimerie nationale
Résumé : An V-VII : 22 sept. 1797 - 22 sept. 1799
Siècle(s) traité(s) : 18
Droits : Domaine public
Provenance : Communauté d'agglomération de La Rochelle. Médiathèque Michel-Crépeau
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/MMC16051-2
MMC16051-2

Éditeur(s) : [S.l.] : [s.n.]
Siècle(s) traité(s) : 20
Provenance : Archives départementales de Guadeloupe
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/ADG18171
ADG18171

Éditeur(s) : [S.l.] : Imprimerie Crété de l'arbre
Siècle(s) traité(s) : 20
Droits : Domaine public
Provenance : Collectivité territoriale de Guyane. Bibliothèque Alexandre-Franconie
Permalien : http://www.manioc.org/patrimon/FRA11058
FRA11058