Éditeur(s) : CRILLASH : Centre de Recherches Interdisciplinaires en Lettres, Langues, Arts et Sciences Humaines
Extrait de : "Repérage et prise en charge des difficultés d'apprentissage des langues" : journée d'étude, le 8 mars 2012. CRILLASH
Description : Mme Fafard nous présente une thématique autour de l'apprentissage des langues vivantes à l'école. Quelle place pour les langues vivantes à l'école élémentaire en France et en Europe ? Et qu'en est-il en Martinique ? Combien de langues étrangères y sont pratiquées ? A quel rythme ? Quels outils sont utilisés : manuels scolaires, CD, DVD, visioconférence, baladodiffusion, Web 2.0 (blogs, réseaux sociaux?), TBI (tableau blanc interactif).
Siècle(s) traité(s) : 21
Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
Permalien : http://www.manioc.org/fichiers/V12205
V12205

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
Tsavorite is exclusively hosted in the Neoproterozoic Metamorphic Mozambique Belt (NMMB). The gemstone mines, widespread between Kalalani (Tanzania) and Mgama Ridge (Kenya), define a continuous corridor over a hundred kilometers in length. The tsavorite is hosted by a metasedimentary sequence defined as the Kurase tsavorite-bearing metasediments (Kurase-TB metasediments) that also hosts rubies. These metasediments underwent amphibolite-facies metamorphism and are surrounded by granulitic gneisses that are also of sedimentary origin (the Kurase high-temperature gneisses). All these rocks lie below the Kasigau Group, a unit dominated by granulite-facies metamagmatic rocks.To constrain the timing of events that led to this peculiar occurrence of tsavorite, we have performed geochronological analyses of thin sections and of separated grains of zircon, monazite, and rutile using LA-ICP-MS and ID-TIMS, as well as 40Ar/39Ar of muscovite and phlogopite from various lithologies. The results show that the different terranes were metamorphosed synchronously between 620–580 Ma but under different P-T strain conditions. The Kurase-HT gneisses and the rocks from the Kasigau Group are highly strained and underwent granulite-facies metamorphism with abundant partial melting and emplacement of felsic melts between 620 and 600 Ma. Textural observations also underlined a late regional water flux controlling the occurrence of V-free muscovite and monazite mineralizations at 585 Ma. The latter event can be related to the activity of the Galana shear zone, in the east. The Kurase-TB metasediments escaped strain and partial melting. They record amphibolite-facies conditions with static heating, since initial sedimentary structures were locally preserved. The age of the tsavorite mineralization was inferred at 600 Ma from metamorphic zircon rims and monazite from the closest host-rocks, sampled in the mines. Hence, tsavorite crystallization occurred statically at the end of the metamorphic event, probably when the temperature and the amount of volatiles were at maximum levels.Conversely, the ruby formed by local metasomatism of felsic dikes and isolated ultramafic bodies. The rubies are older and zircons and monazites from a ruby-bearing felsic dike (plumasite) were dated at 615 Ma. Finally, data from rutile and micas indicate a global cooling below 430 °C of the whole region between 510 and 500 Ma.
The Canadian Mineralogist

hal-01616037
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01616037
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01616037/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01616037/file/JEM.pdf
DOI : 10.3749/canmin.1700019

Éditeur(s) : HAL CCSD Oxford University Press (OUP)
Résumé : International audience
OBJECTIVES: Tracheobronchial stenosis (TBS) is noted in 12-23% of patients with granulomatosis with polyangiitis (GPA), and includes subglottic stenosis and bronchial stenosis. We aimed to analyse the endoscopic management of TBS in GPA and to identify factors associated with the efficacy of endoscopic interventions. METHODS: We conducted a French nationwide retrospective study that included 47 patients with GPA-related TBS. RESULTS: Compared with patients without TBS, those with TBS were younger, more frequently female and had less frequent kidney, ocular and gastrointestinal involvement and mononeuritis multiplex. Endoscopic procedures included 137 tracheal and 50 bronchial interventions, mainly endoscopic dilatation, local steroid injection and conservative laser surgery, and less frequently stenting. After the first endoscopic procedure, the cumulative incidence of endoscopic treatment failure was 49% at 1 year, 70% at 2 years and 80% at 5 years. Factors significantly associated with a higher cumulative incidence of treatment failure were a shorter time from GPA diagnosis to endoscopic procedure [hazard ratio (HR) 1.08 (95% CI 1.01, 1.14); P = 0.01] and a bronchial stenosis [HR 1.96 (95% CI 1.28, 3.00); P = 0.002]. A prednisone dose ≥30 mg/day at the time of the procedure was associated with a lower cumulative incidence of treatment failure [HR 0.53 (95% CI 0.31, 0.89); P = 0.02]. CONCLUSION: TBS represents severe and refractory manifestations with a high rate of restenosis. High-dose systemic CSs at the time of the procedure and increased time from GPA diagnosis to bronchoscopic intervention are associated with a better event-free survival. In contrast, bronchial stenoses are associated with a higher rate of restenosis than subglottic stenosis.
ISSN: 1462-0324

hal-01155105
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01155105
DOI : 10.1093/rheumatology/kev129
PUBMED : 26001634

Éditeur(s) : HAL CCSD Centers for Disease Control and Prevention
Résumé : International audience
We report 20 cases of extensively drug-resistant tuberculosis managed in France. Treatment was individualized and included bedaquiline and linezolid for most patients and surgery in 8 patients. At last follow-up (22 months), 19 patients had achieved conversion from positive to negative on culture testing. These promising results of comprehensive management obtained in a small series deserve confirmation.
ISSN: 1080-6040

hal-01294307
http://hal.upmc.fr/hal-01294307
http://hal.upmc.fr/hal-01294307/document
http://hal.upmc.fr/hal-01294307/file/15-1130.pdf
DOI : 10.3201/eid2203.151130

Résumé : La tuberculose (TB), maladie infectieuse contagieuse, est causée par une mycobactérie appartenant au complexe Mycobacterium tuberculosis (MTBC). Malgré de nombreuses campagnes de vaccination par le BCG (Bacilles de Calmette et Guérin) et les traitements antituberculeux, on observe une réémergence de la maladie depuis les années 80. Ce bouleversement s’explique par la coïnfection avec le virus du VIH/SIDA, la désorganisation des systèmes de santé et par l’apparition des bactéries résistantes aux principaux antibiotiques antituberculeux. Dans ce contexte une meilleure connaissance des mouvements et de l’évolution des clones circulants du bacille tuberculeux permettrait de détecter plus rapidement et de façon plus pertinente l’émergence d’épidémies. Le contrôle et la surveillance de la maladie représentent des moyens essentiels pour lutter contre l’expansion mondiale de la tuberculose. C’est ainsi que l’unité de la Tuberculose et des Mycobactéries de l’Institut Pasteur de la Guadeloupe (IPG) a mis en place une base de données de profils génotypiques pour l’étude de l’épidémiologie globale de la tuberculose. Dans le cadre de cette thèse, nous décrirons les méthodes de bioinformatique qui ont été utilisées pour la gestion et l’exploitation de la 6ème version (SITVIT2) de cette base de données des génotypes pour mieux comprendre l’évolution et la dissémination mondiale du bacille tuberculeux. Cette base intègre aussi plusieurs marqueurs moléculaires tels que les MIRU-VNTRs (« mycobacterial interspersed repetitive units-variable number of tandem repeats ») et le Spoligotype43 servant à mieux décrire et identifier les familles de profils génotypiques du MTBC. La banque de données SITVIT2 ne cesse d’évoluer, et elle contient actuellement des informations épidémiologiques sur 111 635 isolats cliniques. Cette base de données est consultable en ligne à l’adresse suivante : http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT2/. Nous avons également réalisé une base de données nommée SITVITBovis qui est dédiée à la tuberculose bovine. Cette base de données sera accessible à l’adresse : http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT_Bovis/. Parallèlement au développement et à la gestion des bases de données, ce travail de thèse s’est appuyé sur plusieurs études épidémiologiques et phylogéographiques mettant en corrélation les données disponibles sur la résistance aux médicaments ou les caractéristiques démographiques (dont le sexe, l’âge, le statut VIH, et l’origine du patient). Notre initiative de recherche permet ainsi d’améliorer la caractérisation phylogénétique détaillée des lignées du MTBC, ainsi que l’épidémiologie des clones en circulation, afin d’élaborer une cartographie géographique des isolats cliniques prédominants pour les bacilles tuberculeux principalement impliqués dans la maladie, à l’échelle nationale, régionale et mondiale. La superposition ultérieure de ces cartes avec des données sociopolitiques, économiques et démographiques obtenues auprès de Systèmes d’information géographique (SIG) ont permis de dresser un portrait précis des disparités actuelles par pays ou sous-région. Cette thèse représente une importante collaboration avec plusieurs équipes de chercheurs travaillant également dans le domaine de l’épidémiologie moléculaire de la tuberculose. L’objectif à long terme de ce travail, est d’optimiser la structure de la base, et de pérenniser l’enrichissement de celle-ci (notamment par l’automatisation et la facilité de la saisie de données). Une représentation optimale et une meilleure accessibilité des données de la base conforteraient les efforts faits pour le contrôle et la surveillance de la TB dans monde.
Tuberculosis (TB) is a contagious infectious disease caused by mycobacteria belonging to the Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC). Despite numerous campaigns of vaccination by the BCG (Bacillus Calmette-Guérin) vaccine, and TB treatments, there was a resurgence of the disease since the 80s. This disruption is due to coinfection with HIV/AIDS, disorganization of health systems and the emergence of bacteria resistant to anti-TB drugs. In this context, a better understanding of the movements and changes of circulating clones of tubercle bacilli would detect faster and more relevant emerging epidemics. The control and monitoring of the disease are essential means to fight against the worldwide spread of tuberculosis. Thus the TB and Mycobacteria unit of the Pasteur Institute of Guadeloupe (IPG) has developed a database of genotypic profiles for the study of global epidemiology of tuberculosis.In this thesis, we discuss the Bioinformatical methods that have been used for the management and development of the 6th version (SITVIT2) of this database of genotypes to better understand the evolution and global dissemination of the tubercle bacillus. The database also includes several molecular markers such as MIRU-VNTRs (mycobacterial interspersed repetitive units- variable number of tandem repeats) and Spoligotype43 allowing a better description and identification of the families of genotypic profiles of Mycobacterium tuberculosis complex. SITVIT2 database is constantly evolving, and it currently contains epidemiological information on 111,635 clinical isolates. This database is available online at the following address: http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT2/. We also developed a database named "SITVITBovis", which is dedicated to bovine tuberculosis. This database will be accessible at: http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT_Bovis/.Alongside the development and management of databases, this work was based on several epidemiological and phylogeographic studies correlating data on drug resistance or demographic characteristics (including sex, age, HIV status, and the origin of the patient). Our research initiative is thus focused to further improve in depth phylogenetic characterization of MTBC lineages, as well as the epidemiological analysis of circulating clones to generate evidence-based geographical mapping of predominant clinical isolates of tubercle bacilli causing the bulk of the disease both at country and regional level. Further superposition of these maps with socio-political, economical and demographical available through Geographic Information Systems (GIS) allows to have a precise view of prevailing disparities at the level of country or sub-region. This thesis represents an important collaboration with several researchers teams also working in the field of molecular epidemiology of tuberculosis.The long-term goal of this work is to further optimize the database structure, and sustain enriching it (including automation and ease of data entry). Optimum performance and accessibility of data in the database would reinforce efforts to control and surveillance of TB in the world.

http://www.theses.fr/2014AGUY0791/document

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley-Blackwell: No OnlineOpen
Résumé : International audience
Eight chemically defined, naturally occurring compounds were extracted from the tropical flora of the Caribbean island of Guadeloupe: pilocarpine, an alkaloid from Pilocarpus racemosus; heraclenol and isomeranzin, coumarins from Triphasia trifolia; lochnerin, an indole alkaloid from Rauwolfia biauriculata; ibogaine and voacangine, indole alkaloids from Tabernaemontana citrifolia; texalin, an oxazole from Amyris elemifera; and canellal, a sesquiterpene dialdehyde from Canella winterana. An essential oil fraction from Canella winterana was also tested. The antimycobacterial activity of these substances was tested against Mycobacterium tuberculosis, M. avium and M. kansasii using the Middlebrook 7H11 agar medium, the Bactec 460-TB radiometric methodology, and determination of bacterial viable counts. Three compounds, namely ibogaine, voacangine and texalin, showed antimycobacterial activity. Investigations on the structure-modification and structure-activity relationships of these compounds may help determine new targets for future drug development.
FEMS Immunology and Medical Microbiology

pasteur-00931155
https://hal-riip.archives-ouvertes.fr/pasteur-00931155
PUBMED : 9626931

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
We present a chronological (K-Ar), petrologic and geochemical study (major and trace elements, Sr-Nd isotopes) of Middle Miocene (ca. 16-14 Ma) calc-alkaline rocks (basalts to andesites) extruded in the present-day back-arc region of Central Patagonia (Zeballos Volcanic Sequence (ZVS), 47 S). This magmatism started shortly after mafic plutonism ceased in the arc region (ca. 16 Ma, 200 km west), and ended ca. 2 My before the onset of voluminous slab tear-related back-arc alkaline basaltic magmatism (ca. 12 to Pliocene). The studied calc-alkaline rocks have a typical subduction-related signature (high LILE/HFSE ratios, depletion in Nb, Ta and Ti; Ba/La >20; Ta/Hf <1.5; (Sr-87/Sr-86)(o)=0.70366-0.70402, epsilon(Nd)=+0.1-+3.8). Major and trace elements contents are consistent with their evolution by closed system fractional crystallization of a presumed parental liquid similar in composition to the most basic rock of the suite. Moreover, a strong subducted sediment imprint is recognized (increasing Th/HFSE and decreasing Ce/Pb during differentiation). However, these rocks show striking similarities with volcanic complexes emplaced above areas where a gently dipping slab occurs (high K contents; similar LREE/HREE, Nb/Zr, Ba/Nb; Th/Hf; Th/Ta, Ta/Hf<0.3), particularly the present-day Andean flat-slab region and the Neuquen Basin during the Late Miocene. A comprehensive tectono-magmatic model is here presented to explain the generation and extrusion of these calc-alkaline magmas during the Middle Miocene. The development of a transient low-angle subduction and the resulting eastward migration of the volcanic front are then proposed. Mixing between stored remnants of calc-alkaline magmatism and later primitive alkaline melts is envisioned as the most likely process accounting for the transitional signature (i.e., intermediate between calc-alkaline and alkaline, La/Nb >I; TiO2 <2 wt%) of some basalts extruded synchronously with genuine alkaline lavas in the Neogene Patagonian Plateau Lavas province.
Volcanismo calcoalcalino durante el Mioceno Medio en Patogonia Central (47°S): petrogenesis e implicaciones en la dinamica de placas. En este trabajo se presenta un estudio cronologico (K-Ar), petrologico y geoquimico (elementos mayores y trazas, isotopos de Sr-Nd) de rocas calcoalcalinas (basaltos a andesitas) del Mioceno Medio (16-14 Ma) que ocurren en una posicion de trasarco en Patagonia Central (47°S; Secuencia Volcanica Zeballos, SVZ). Este magmatismo comenzo poco despees de que el plutonismo mafico cesara en la region bajo el arco (ca. 16 Ma, 200 km al oeste), y termino ca. 2 My antes del comienzo de un voluminoso evento magmatico basaltico alcalino desarrollado en el trasarco, relacionado con ventanas astenosfericas, que continuo hasta el Pleistoceno. Las rocas calcoalcalinas estudiadas tienen una quimica tipicamente relacionada con procesos de subduccion (altas razones LILE/HFSE, empobrecimientos en Nb, Ta y Ti; Ba/La>20; Ta/Hf l,5; (87Sr/86Sr)0=0,70366-0,70402, End~O,1±3,8); y sus contenidos de elementos mayores y trazas son consistentes con una evolucion por cristalizacion fraccionada, en un sistema cerrado, desde un liquido parental de composicion similar a la de la roca mas basica del conjunto analizado. Se reconoce, ademas, la influencia de sedimentos subductados en la composicion de estos magmas (aumento de la razon Tb/HFSE y disminucion de la razon Ce/Pb durante la diferenciacion). Sin embargo, estas rocas muestran importantes similitudes composicionales con las de complejos volcanicos emplazados sobre areas donde ocurre subduccion de bajo angulo (altos contenidos de K, similares razones LREF/HREE, Nb/Zr, Ba/Nb; TblHf; TblTa, Ta/Hf O,3), particularmente rocas de la actual region de subduccion plana en Chile central-Argentina y de la cuenca de Neuquen durante el Mioceno Superior. Se propone aqui un modelo tectono-magmatico que explica la generacion y extension de magmas calcoalcalinos en una posicion de trasarco durante el Mioceno Medio en Patagonia mediante el desarrollo de un fenomeno transiente de subduccion de bajo angulo y el consiguiente desplazamiento hacia el este del frente volcanico. Ademas, la mezcla entre remanentes de este magmatismo calcoalcalino almacenados en la corteza y fundidos alcalinos posteriores, provenientes de la astenosfera, se presenta como el proceso responsable de la generacion de la signatura transicional (i.e., intermedia entre calcoalcalina y alcalina, La/Nb>1; TiO2 2 wt%) reconocida en algunos basaltos que ocurren contemporaneamente con otros puramente alcalinos en la provincia de las Lavas Neogenas de Plateau de la Patagonia.
ANDEAN GEOLOGY

insu-00561888
https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-00561888
DOI : 10.5027/andgeo2010-678

Résumé : Ce travail de thèse intitulé «Evaluation de marqueurs génétiques du complexe Mycobacterium tuberculosis combinée à l'utilisation d'outils bioinformatiques: apport en épidémiologie et phylogénie de la tuberculose» a consisté en la sélection et l'évaluation de marqueurs minisatellites dans le cadre d'études épidémiologiques et phylogénétiques du bacille tuberculeux, Une première partie a ainsi porté sur l'épidémie de tuberculose en Guadeloupe, Martinique, et Guyane française ainsi que dans un pays continental à faible incidence de tuberculose, la Suède, Les résultats montrent les disparités existant entre les populations de patients tuberculeux des 3 départements français d'Amérique (DFA) ainsi que les similitudes génotypiques existant entre les bacilles tuberculeux. Par ailleurs le rôle majeur joué par les cas d'importation dans l'épidémie de tuberculose a été montré aussi bien dans les DFA qu'en Suède. Nous nous sommes ensuite intéressés à une utilisation optimale des minisatellites pour une meilleure discrimination de la famille génotypique émergeante « Beijing» circulant au Japon (Osaka, Kobe et Okinawa), ainsi qu'en Russie. Nous avons constaté le faible pouvoir discriminant du format classique 12-locus MIRU (Mycobacterial lnterspersed Repetitive Units) et proposons plusieurs nouvelles stratégies de typage basées plusieurs marqueurs minisatellites incluant certains locus hypervariables. Enfin, dans un troisième volet, nous avons étudié la diversité génétique des bacilles tuberculeux circulant actuellement dans la Caraïbe. laquelle semble refléter le passé historique très particulier de cette zone géographique au croisement d'une multitude de peuplements.
This thesis entitled "Evaluation of genetic markers of Mycobacterium tuberculosis combined with the use of bioinformatics tools: input for epidemiology and phylogeny of tuberculosis" deals with the selection and evaluation of minisatellite markers in the context of epidemiological and phylogenetic studies of the tubercle bacillus M. tuberculosis. The first part of the present work has focused on the epidemic of tuberculosis in Guadeloupe, Martinique and French Guiana as well as in a low incidence continental country, i.e Sweden. The results show differences between populations of TB patients in the three French Departments of America and similarities between the genotypes of the circulating tubercle bacilli Moreover, results highlight the important role played by imported cases for TB epidemic the three French departments of America and Sweden. ln a second part, minisatellite markers have been evaluated for a better discrimination of strains of the emerging genotype "Beijing" circulating in Japan (Osaka, Kobe and Okinawa), and Russia. A low discriminatory power of classical format 12-locus MIRU (Mycobacterial lnterspersed Repetitive Units) was observed and new combinations of minisatellites have also been proposed including hypervariable locus. Finally, the genetic diversity of tubercle bacilli circulating in the Caribbean was investigated which currently seem to reflect historical past of this very special region at the intersection of a multitude of cultures and peoples.

http://www.theses.fr/2011AGUY0427/document

Résumé : Les études écologiques sont maintenant considérées comme prometteuses en raison de leur capacité à intégrer dans un même modèle autant des facteurs individuels que populationnels. Le mouvement récent de l’open data pourrait jouer un rôle important dans la pérennisation des démarches multidisciplinaires. Cette thèse montre que l’association des méthodes écologiques aux données publiques permet d’éclairer sous un angle nouveau des problématiques des maladies infectieuses.En Guyane Française, des méthodes écologiques dites de séries temporelles couplées aux données climatiques libres ont contribué à une meilleure compréhension du rôle du climat sur la dynamique de la transmission du paludisme, de la leishmaniose cutanée ainsi que de l’histoplasmose disséminée. L’utilisation de méthodes écologiques sur des données libres de la littérature scientifique concernant la séroprévalence toxoplasmose dans les populations humaines a permis d’identifier les principaux facteurs influençant le niveau de séroprévalence globale et indirectement du risque de toxoplasmose congénital associé. L’association de données onusiennes à des méthodes écologiques a permis de montrer qu’une prévalence importante d’ascaridiose est associée à une réduction par 10 de l’incidence du paludisme et l’impact significatif de la corruption sur la mortalité juvéno-infantile et sur les résistances aux anti-tuberculeux. Ces études montrent que l’association des méthodes écologiques aux données publiques permet d’éclairer sous un angle nouveau des problématiques des maladies infectieuses. Ce type d‘étude fournit la flexibilité nécessaire à l’étude des interactions complexes des nombreux déterminants de la santé.
Ecological studies are now considered promising because of their ability to integrate as well as individual factors than populational ones in the same model. The recent open data movement could play an important role in the sustainability of multidisciplinary approaches. The studies developed in this thesis show that the combination of ecological methods with open data could give original results in the issues of infectious diseases.In French Guiana, ecological methods called time series, coupled with open climate data, have contributed to a better understanding of the role of climate on the dynamics of malaria, cutaneous leishmaniasis and disseminated histoplasmosis. The use of ecological methods with open data from the scientific literature concerning toxoplasmosis seroprevalence in human populations has permitted to identify the main factors influencing the level of overall seroprevalence and indirectly to estimate the associated risk of congenital toxoplasmosis.The combination of UN data to ecological methods has shown that a high prevalence of ascariasis is associated with a reduction from 10 in the incidence of malaria and that corruption has a significant impact on child mortality and resistance to TB.The various studies developed in this thesis show that the combination of ecological methods to public data sheds a new light on the issues of infectious diseases. This type of study provides the flexibility to study the complex interactions of many determinants of health.

http://www.theses.fr/2011AGUY0482/document