Éditeur(s) : HAL CCSD Réseau « Développement durable et territoires fragiles »
Résumé : The Green and Blue infrastructure (Trame verte et bleue –TVB) is a new conservation policy tool based on the notions of ecological network and corridor. The introduction of this new instrument through the French Grenelle environment commitments brings about some change in the spatial strategy of the conservation policy. Beyond the identification of priority conservation areas, ecological planning of all the territory is concerned. The TVB’s implementation process establishes the connection of multi and nested decisional and action levels. It thus creates specific situations of complexity and uncertainty that require innovation and perpetual change of governance. The study of the Auvergne region case through the adaptive governance analytical framework highlights the potential fruitful role of Regional nature parks in such dynamics of change and learning. Mots-clés : aménagement durable des territoires, biodiversité, réseau écologique, corridor écologique, gouvernance adaptative, socio-écosystème, trame verte et bleue Keywords : Sustainable landplaning, Biodiversity, Ecological network, Adaptive governance, socio-ecosystem
La Trame verte et bleue (TVB), nouveau dispositif d’action publique visant à enrayer la perte de biodiversité traduit un renouvellement des référentiels de justification des politiques de conservation et de leur stratégie territoriale. Il s’agit d’intégrer la planification écologique dans l’aménagement de l’ensemble du territoire. Le processus de territorialisation de la TVB met en rapport de multiples niveaux de décision et d’action imbriqués. Il crée de ce fait des configurations inédites de complexité et d’incertitude et implique des innovations en termes de gouvernance que le cadre analytique de la gouvernance adaptative permet d’appréhender. En nous appuyant sur l’exemple du Parc Naturel Régional des Volcans d’Auvergne, nous analysons le rôle que ces institutions sont susceptibles de jouer dans ces dynamiques de changement et d’apprentissage socio-technique et politique qui conditionnent une mise en œuvre effective de la TVB.
ISSN: 1772-9971

hal-01195370
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01195370
DOI : 10.4000/developpementdurable.9675
PRODINRA : 269288

Éditeur(s) : Inter-Research
Résumé : The spatial structure of demersal fish assemblages on the continental shelf of the NW Mediterranean Sea was examined on a large scale between the Straits of Gibraltar and the Gulf of Lions. In contrast to its predominant role in the spatial distribution of species composition, described worldwide, it seems depth has only a limited effect on the distribution patterns of the total abundance and diversity of demersal fishes. In addition, evidence is provided for the division of the whole study area into 3 geographical fish assemblages. The influence of Atlantic inputs and the semi-permanent Almena-Oran hydrographic front play a key role in defining the Alboran Sea as a specific fish fauna area. Moreover, the clear differentiation between 2 distinct assemblages in the Gulf of Lions and the Catalan Sea could be partly linked to the North Balearic front. These results contribute to the current debate on the definition of spatial units for the purpose of demersal fisheries management. They also stress the complexity of developing an ecosystem approach which deals simultaneously with species composition and biodiversity aspects of ecosystems management.
Marine Ecology Progress Series (0171-8630) (Inter-Research), 2005-08 , Vol. 297 , P. 245-257

Droits : Inter-Research 2005
http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/publication-3623.pdf
DOI:10.3354/meps297245
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3623/

Éditeur(s) : Elsevier Science Bv
Résumé : Academia and management agencies show a growing interest for ecosystem-based fishery management (EBFM). However, the way to operationalize this approach remains challenging. The present paper illustrates how the concepts of stochastic co-viability, which accounts for dynamic complexities, uncertainties, risk and sustainability constraints, can be useful for the implementation of EBFM. In the present case, this concept is used to identify fishing strategies that satisfy both ecological conservation and economic sustainability in a multi-species, multi-fleet context. Economic Viability Analysis (EVA) and the broader Co-Viability Analysis (CVA), are proposed to expand the usual Population Viability Analysis (PVA) and precautionary approach. An illustration is proposed, using data on the fisheries of Bay of Biscay (France) exploiting the stocks of nephrops and hake. Stochastic simulations show how CVA can guarantee both ecological (stock) and economic (profit) sustainability. Using 2008 as a baseline, the model is used to identify fishing efforts that ensure such co-viability. (C) 2012 Elsevier B.V. All rights reserved.
Ecological Economics (0921-8009) (Elsevier Science Bv), 2012-03 , Vol. 75 , P. 32-42

Droits : 2012 Elsevier Science Bv
http://archimer.ifremer.fr/doc/00074/18571/16153.pdf
DOI:10.1016/j.ecolecon.2012.01.005
http://archimer.ifremer.fr/doc/00074/18571/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
La gestion de projets multi-acteurs est très complexe, eu égard aux cycles de vie de plus en plus courts des concepts et technologies, aux nouvelles normes réglementaires auxquelles les acteurs ne peuvent se soustraire, et à l’augmentation du nombre de parties prenantes, qui travaillent de manière cloisonnée.Pour relever ces défis, comment gérer la complexité de ces projets et les profils des différents acteurs ? Plus précisément, comment les faire collaborer efficacement afin d’optimiser les échanges, les remontées d’information et les arbitrages ?A travers une recherche-intervention (David, 2000) menée sur une période de plus de trois ans, nous analysons les pratiques d’un groupe d’entreprises réunies autour d’un projet fédérateur. Ce dernier, intitulé « Forest Initiative », rassemble les compétences de partenaires d’affaires dans le but de développer de nouveaux modèles d’aménagement agricole. Afin de mener à bien ce projet, les parties prenantes ont crée un modèle d’affaires innovant : un Ecosystème d’Affaires (EA). Il s’agit de rassemblements d’entreprises et d’acteurs provenant de secteurs d’activités différents, liés de façon formelle ou non, qui ont tous intérêt à promouvoir leurs standards technologiques respectifs pour garder leur leadership (Moore,1996).En liant les champs des EA et de la gestion de projet, notre recherche aboutit à proposer une nouvelle voie d’exploration pour la compréhension de la conduite de projets complexes au sein de groupes d’entreprises.
84e congrès de l'Association Francophone pour le Savoir (ACFAS)
MONTREAL, Canada

hal-01314738
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01314738

Éditeur(s) : GFP : Groupe Français des Pesticides
Extrait de : "Protection des cultures et santé environnementale : héritages et conceptions nouvelles" : congrès, le 26 mai 2014. Université des Antilles et de la Guyane
Description : Les résultats de cette analyse montrent que des approches globales, non ciblées peuvent permettre de discriminer des groupes d'individus exposés à des mélanges complexes de pesticides à faibles doses. Les modifications subtiles du métabolome, si elles ne peuvent être considérées, a priori, comme des effets néfastes, indiquent néanmoins que des voies métaboliques peuvent être modifiées par une exposition à des pesticides à faibles doses.
Siècle(s) traité(s) : 21
Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
Permalien : http://www.manioc.org/fichiers/V14219
V14219

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : Les mutations continues de l’environnement culturel des habitants de Guyane favorisent une prise de conscience des attentes des populations locales et de leur demande sociale en matière de lecture publique. Cela devrait à terme susciter l’émergence d’un public « avisé » malgré l’influence de la tradition orale. Par conséquent, face à la complexité du terrain sociologique, il est nécessaire de modifier les stratégies des acteurs et de les adapter aux réalités sociales et à la vie quotidienne des populations concernées. Pour atteindre ces objectifs, sur quelles représentations sociales peuvent reposer les interventions des acteurs ? Cette question trouvera sa réponse dans une perception objective de la réalité sociale des populations locales.
The ongoing evolutions of the cultural environment of Guianese people promote awareness of the expectations of local people and their social demand for public reading. This should eventually lead to the emergence of a public informed despite the influence of oral tradition. Therefore, given the complexity of the sociological field, it is necessary to change the players' strategies and adapt to social realities and daily lives of the people concerned. What social representations should the performances of actors be based on in order to reach these objectives? The answer to that question will be found thanks to an objective look at the social reality of the local populations.
Guyane française

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.7870
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/7870

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé :   Diplôme : DEA
il s'agit d'un type de produit dont les métadonnées ne correspondent pas aux métadonnées attendues dans les autres types de produit : DISSERTATION
Tropical rainforests are complex ecosystems, rarely investigated from ground-level. The canopy, highest part of the cover, can on the other hand be studied by several remote sensing tools. The aim of this study is to assess in what way the canopy is related to the forest structure below and the forest dynamic. We looked for correlation between the canopy texture (crown size) observed from aerial photographs and various parameters of the forest (spatial and demographic structure, forest dynamic, floristic structure). We worked on the Paracou experimental device, in French Guiana, at two different scales. 1- At a local scale (6.5 ha ; scale of the photographs 1: 4 000), we demarcated six sub-plots with big crowns in the canopy and six with small crowns. 2- At a forest scale (approximately one hundred ha ; scale of the photograph 1: 25 000), we compared 2 forest plots: one with a rough canopy texture and one with a smooth canopy texture. We found that the size of the crowns in the canopy do not express the same characteristics of the fore according to the scale of study : at the local scale, difference in crown size means a difference in basal area but not in density, while at the forest scale it is the opposite. Several hypotheses related to the sylvigenetic cycle, the floristic structure or the nature of the substratum are suggested to explain these results.
Les forêts tropicales humides (FTH) sont des écosystèmes complexes difficiles à étudier depuis le sol. Leur canopée, partie supérieure du couvert, est en revanche abordable par divers outils de télédétection. Cette étude vise à déterminer en quoi la structure de la canopée est le reflet de la structure forestière sous-jacente et de la dynamique spatio-temporelle qui s'y exerce. Nous avons donc recherché des corrélations, entre la texture de canopée (taille des couronnes) vue sur des photographies aériennes, et différents paramètres de la forêt sous-jacente (structure spatiale et démographique, dynamique forestière, structure floristique). Ce travail a été abordé sur le dispositif expérimental forestier de Paracou, en Guyane Française, à 2 échelles différentes. 1- A l'échelle de la parcelle (6,5 ha ; photographies au 1: 4 000), nous avons délimité des placettes à grosses couronnes en canopée et des placettes à petites couronnes. 2- A l'échelle du massif forestier (une centaine d'ha ; photographies IGN au 1: 25 000) nous comparons une parcelle de texture de canopée, grossière et une parcelle de texture fine. Le résultat principal de notre étude est que la taille des couronnes en canopée ne reflète pas les mêmes caractéristiques du couvert selon l'échelle de l’étude : à l'échelle de la parcelle, des différences de taille de couronnes traduisent des différences de surface terrière mais pas de densité, tandis qu'à l'échelle du massif forestier c'est l'inverse. Plusieurs hypothèses, invoquant des différences dans le stade sylvigénétique, la composition floristique ou la nature du substrat des placettes ou parcelles comparées, sont proposées pour expliquer ces résultats.
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189180

hal-01189180
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189180
PRODINRA : 12184

Éditeur(s) : HAL CCSD Ecole nationale du génie rural
Résumé :  
absent
ISSN: 0035-2829

hal-01032010
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032010

Éditeur(s) : HAL CCSD Frontiers Media
Résumé : International audience
The Anopheles midgut hosts diverse bacterial communities and represents a complex ecosystem. Several evidences indicate that mosquito midgut microbiota interferes with malaria parasite transmission. However, the bacterial composition of salivary glands and ovaries, two other biologically important tissues, has not been described so far. In this study, we investigated the dynamics of the bacterial communities in the mosquito tissues from emerging mosquitoes until 8 days after a blood meal containing Plasmodium falciparum gametocytes and described the temporal colonization of the mosquito epithelia. Bacterial communities were identified in the midgut, ovaries, and salivary glands of individual mosquitoes using pyrosequencing of the 16S rRNA gene. We found that the mosquito epithelia share a core microbiota, but some bacteria taxa were more associated with one or another tissue at a particular time point. The bacterial composition in the tissues of emerging mosquitoes varied according to the breeding site, indicating that some bacteria are acquired from the environment. Our results revealed temporal variations in the bacterial community structure, possibly as a result of the mosquito physiological changes. The abundance of Serratia significantly correlated with P. falciparum infection both in the midgut and salivary glands of malaria challenged mosquitoes, which suggests that interactions occur between microbes and parasites. These bacteria may represent promising targets for vector control strategies. Overall, this study points out the importance of characterizing bacterial communities in malaria mosquito vectors.
ISSN: 1664-302X

hal-01546162
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01546162
DOI : 10.3389/fmicb.2015.01500

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : Les atteintes récurrentes et aggravées à la biodiversité et aux écosystèmes naturels, dans les zones ultrapériphériques d’outre-mer en particulier, appellent et justifient aujourd’hui une protection adaptée et renforcée des espaces naturels fragiles, sensibles, ou convoités, dont les richesses écologiques sont particulièrement menacées. Les espaces insulaires et archipélagiques du bassin de la Caraïbe n’échappent pas à la problématique gestionnaire complexe issue de la dialectique des exigenc...

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/3558

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : La mer des Caraïbes abrite une diversité de biotopes littoraux qui favorisent l’installation de trois écosystèmes - les récifs coralliens, les mangroves et les herbiers – riches et complexes. On y trouve également d’autres formations uniques tels les stromatolithes ou les trous bleus. Des conditions climatiques et océanographiques homogènes permettent à l’ensemble du bassin Caraïbe de constituer une unité sur les plans floristique et faunistique. Cette unité n’exclut pas une diversité biologique exceptionnelle avec notamment des espèces endémiques à la zone ; ce qui confère aux côtes des pays caribéens un intérêt écologique, paysager et scientifique certain. La reconnaissance sur le plan international et régional de l’importance de la Mer des Caraïbes mais aussi de sa fragilité a permis au milieu marin caribéen d’acquérir son statut de patrimoine naturel.En plus des services écosystémiques qu’elle rend (ressources halieutiques, protection des littoraux…), la Mer des Caraïbes constitue un atout indéniable dans le cadre du développement touristique de la zone aussi bien par le balnéaire que, plus récemment, par l’écotourisme. Ce dernier s’appuie généralement sur des aires marines protégées et doit permettre un développement durable des îles.A partir d’une étude de cas, le parc marin de Saba, l’objectif de cette étude est d’analyser les rapports entre patrimoine naturel marin et l’écotourisme, ainsi que les impacts économiques, sociaux et environnementaux de la mise en valeur de ces ressources.
The Caribbean Sea is home to a diversity of coastal habitats that support the installation of three rich and complex ecosystems - coral reefs, mangroves and seagrasses -. There are also other unique formations such as stromatolites or blue holes. Oceanographic and climatic conditions allow homogeneous throughout the Caribbean basin to form a unit in terms of flora and fauna. This unit does not exclude an exceptional biological diversity, including species endemic to the area, which give the coasts of the Caribbean countries an ecological, landscape and some science. Recognition on the international and regional importance of the Caribbean Sea but also its fragile marine environment has allowed the Caribbean to gain its status as a natural heritage.In addition to the ecosystem services it render (fisheries, coastal protection ...), the Caribbean Sea is a definite asset in the development of tourism in the area by the seaside as well as, more recently, ecotourism. The latter is generally based on marine protected areas and should facilitate the sustainable development of islands.From a case study, the Saba Marine Park, the objective of this study is to analyze the relationship between natural heritage and marine ecotourism, as well as economic, social and environmental development of these resources.
Saba

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.5487
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/5487

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : Understanding the pattern in spatial distribution of soil microbial processes is critical to understand the environmental factors that regulate them as well as to scale up these processes to ecosystem. Soil samples from a I ha tropical rainforest plot (Paracou, French Guiana) were analyzed according a nested sampling approach using different separation distances ranging from 0.4 to 40 m. The variability of substrate induced respiration (SIR) and of denitrification enzyme activity (DEA) was characterized in relation to various soil properties (total C and N contents, NIRS related index of soil organic matter quality, SOMQ and index of tree influence potential, IP). The variability of SIR and DEA was higher than that of environmental properties. The patterns of accumulated variance as a function of distance varied among the soil properties. The variability of SIR and DEA mainly occurred at small (1 m) scale (and at the 10-40 m-scales for SIR), probably reflecting the quality of litter input that results of the influence of local assemblage of different tree species, though changes in the soil N and C contents. Indeed, total soil C and N contents explained the microbial properties at every scale. Coefficients of codispersion showed that neither SOMQ nor IP did correlate with SIR and DEA, and confirmed that total C and N contents explained microbial properties in a scale dependent and complex manner. Such spatial dependency underlines the importance of soil heterogeneity in this tropical forest with implications for sampling strategies when studying the microbial processes and their response to disturbances. (C) 2012 Elsevier B.V. All rights reserved.
ISSN: 0016-7061

hal-01032409
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032409
DOI : 10.1016/j.geoderma.2012.12.009

Éditeur(s) : Université Aix Marseille
Résumé : La surexploitation des ressources halieutiques a conduit à une crise majeure du secteur de la pêche professionnelle. Dans ce contexte, les pêcheries artisanales, et notamment les pêcheries aux petits métiers côtiers, apparaissent comme des modes d’exploitation potentiellement durables des ressources côtières. La diversité des engins utilisés et des espèces ciblées rend néanmoins complexe le suivi de cette composante importante de la pêche professionnelle. L’activité de pêche artisanale reste ainsi très peu évaluée en Méditerranée, et notamment à l’échelle d’une Aire Marine Protégée (AMP). Les AMP sont pourtant de plus en plus utilisées comme des outils de gestion de ces pêcheries, les effets des différentes mesures de gestion mises en place étant à même de bénéficier aux pêcheurs professionnels. A l’heure où le nombre d’AMP se multiplie, il apparaît alors nécessaire pour les gestionnaires comme pour les scientifiques de disposer d’indicateurs permettant de suivre l’activité de pêche professionnelle sur le territoire d’une AMP, et d’évaluer les effets de la gestion sur cette activité. Un protocole d’enquête pour le suivi de la pêche artisanale aux petits métiers côtiers a ainsi été mis en place entre juillet 2009 et juin 2010 au sein du Parc Marin de la Côte Bleue (PMCB), AMP méditerranéenne française comprenant deux réserves marines d’âge et de taille différents. Les données récoltées ont permis d’identifier sept métiers principaux pratiqués par les pêcheurs du PMCB, et de les caractériser par un groupe d’espèces cibles, un engin, un territoire et une période de pêche. L’effort de pêche et les captures ont alors pu être estimés à partir de ces métiers. Sur le territoire de la Côte Bleue, 3 512 sorties de pêche et 4 645 opérations de pêche ont été réalisées par les 30 bateaux actifs lors de la période d’étude, avec 9 500 km de filets calés. Au total, environ 140 tonnes de captures ont été débarquées dans les 6 ports du PMCB. Si l’ensemble du territoire de la Côte Bleue est fréquenté par les pêcheurs professionnels, la répartition de l’effort de pêche est hétérogène et dépend notamment des habitats présents ainsi que de la proximité des ports d’attache. La présence des réserves marines influe également sur cette répartition. Les deux indicateurs développés dans cette étude montrent par contre que l’effet d’attraction varie selon la réserve marine et selon les espèces ciblées. La perception par les pêcheurs de l’effet des réserves dépend également des espèces ciblées, de même que leur activité sur les zones adjacentes aux réserves, et leur ancienneté dans l’activité. Les perceptions des pêcheurs soulignent l’acceptation sociale du PMCB par ces usagers. L’ensemble des résultats montre ainsi que l’activité de pêche professionnelle aux petits métiers côtiers présente au sein du PMCB s’inscrit dans la démarche de pêche côtière durable promue par les gestionnaires. Ce travail de thèse fournit une liste de métriques et d’indicateurs pouvant être utilisés pour le suivi et l’évaluation d’une pêcherie aux petits métiers côtiers au sein d’une AMP. Cette liste doit néanmoins faire l’objet d’un suivi temporel, afin de valider l’efficacité des indicateurs à détecter des changements dans la pêcherie comme dans l’écosystème. L’ensemble des activités de pêche, et notamment l’activité de pêche récréative, doit être pris en compte pour évaluer les pressions et les impacts présents sur le territoire du PMCB.

Droits : 2012 Ifremer, Université Aix-Marseille
http://archimer.ifremer.fr/doc/00100/21103/18729.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00100/21103/

Éditeur(s) : Université de Bretagne Occidentale
Résumé : Archaea are micro-organisms present in all ecosystems, but are majoritary present in extremophilic environments. Hyperthermophilic Archaea, as Pyrococcus abyssi, are permanently exposed at temperature which can increase the rate of spontaneous DNA damage. It is probable that hyperthermophilic Archaea possess efficient molecular mechanism to duplicate, maintain and stabilize their genomes. The aim of this project was to investigate the interaction network involved in the process of DNA replication and DNA repair. The methodological approach consists in the coupling of pull-down with mass spectrometry identification of interacting partners. A preliminary interaction network was identified that was composed of new proteins as well as unsuspected interactions between known components of DNA replication machinery. The main results consist in: (1) the nuclease Pab2263, which interacts with PCNA, is a novel player in DNA metabolism. (2) PCNA is likely part of a macrocomplex with the ubiquitary proteins Mre11 and Rad50 suggesting a role of this complex in the repair of double strand break in connection with a replication fork. (3) Fen1 and DNA primase interact physically and can collaborate in vitro to resolve intermediate step of the base excision repair pathway. These results enhance our understanding of DNA repair process in Archaea.
Les Archaea sont des micro-organismes rencontrés dans tous les écosystèmes, mais qui apparaissent comme majoritaires dans les environnements dits extrêmes. Les archaea hyperthermophiles, comme Pyrococcus abyssi sont en permanence exposées à des températures qui peuvent augmenter le taux de dommages de l'ADN, pourtant, le taux de mutations spontanés chez ces micro-organismes est similaire à celui des espèces modèles mésophiles. Il est ainsi probable que les hyperthermophiles possèdent des systèmes particulièrement efficaces pour dupliquer, maintenir et stabiliser leur génome. L'objectif de ce projet était d'explorer le réseau d'interaction impliqué dans les processus de réplication et de réparation de l'ADN. L'approche méthodologique mise en oeuvre a consisté à coupler la capture de partenaires d'interaction par pull-down avec leur identification par spectrométrie de masse. J'ai pu ainsi mettre en évidence, au sein l'extrait cellulaire de P. abyssi, un réseau préliminaire reliant des protéines de la maintenance génomique. Nous avons non seulement mis en évidence de nouvelles protéines impliquées probablement dans des mécanismes de réparation, mais également des nouvelles interactions non suspectées entre des composants déjà caractérisés. Les principaux résultats sont les suivants : (1) La nucléase Pab2263, partenaire du PCNA, est un nouvel acteur du métabolisme de l'ADN. (2) Le PCNA forme un macrocomplexe avec les protéines ubiquitaires Mre11 et Rad50 suggérant un rôle de ce complexe dans la réparation des cassures double brin de l'ADN lors de la réplication. (3) Les protéines Fen1 et l'ADN primase interagissent physiquement et peuvent collaborer in vitro pour résoudre une étape intermédiaire de la voie de réparation par excision de base. Ces résultats enrichissent notre compréhension des processus de réparation de l'ADN chez les archées.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/these-3722.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3722/

Éditeur(s) : Université des Antilles et de la Guyane
Résumé : Les mutations continues de l’environnement culturel des habitants de Guyane favorisent une prise de conscience des attentes des populations locales et de leur demande sociale en matière de lecture publique. Cela devrait à terme susciter l’émergence d’un public « avisé » malgré l’influence de la tradition orale. Par conséquent, face à la complexité du terrain sociologique, il est nécessaire de modifier les stratégies des acteurs et de les adapter aux réalités sociales et à la vie quotidienne des populations concernées. Pour atteindre ces objectifs, sur quelles représentations sociales peuvent reposer les interventions des acteurs ? Cette question trouvera sa réponse dans une perception objective de la réalité sociale des populations locales.
The ongoing evolutions of the cultural environment of Guianese people promote awareness of the expectations of local people and their social demand for public reading. This should eventually lead to the emergence of a public informed despite the influence of oral tradition. Therefore, given the complexity of the sociological field, it is necessary to change the players' strategies and adapt to social realities and daily lives of the people concerned. What social representations should the performances of actors be based on in order to reach these objectives? The answer to that question will be found thanks to an objective look at the social reality of the local populations.

urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.4460
http://etudescaribeennes.revues.org/4460

Éditeur(s) : HAL CCSD CRC Press
Résumé : Among the ecosystem services provided by forests, wood provisioning takes a central position. Wood and derived products have played a critical role in the evolution of human kind and demand for raw material is increasing in a foreseeable future. Wood is used for energy production, construction and a wide variety of products for which different properties are required. Anatomical, chemical and physical properties of wood are determined through a complex process called xylogenesis controlled by internal and external signals and occurring during the life of the tree. In this chapter we describe i/how wood is formed and ii/the different factors controlling this developmental process with emphasis on the molecular machinery involved, iii/the functions of wood and iv/the biotechnology approaches developed to improve wood biomass production and properties genetically.
Tree Biotechnology

ISBN : 978-1466597143
hal-01032436
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032436

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley/Blackwell
Résumé : International audience
Photosynthetic eukaryotes have a critical role as the main producers in most ecosystems of the biosphere. The ongoing environmental metabarcoding revolution opens the perspective for holistic ecosystems biological studies of these organisms, in particular the unicellular microalgae that often lack distinctive morphological characters and have complex life cycles. To interpret environmental sequences, metabarcoding necessarily relies on taxonomically curated databases containing reference sequences of the targeted gene (or barcode) from identified organisms. To date, no such reference framework exists for photosynthetic eukaryotes. In this study, we built the PhytoREF database that contains 6490 plastidial 16S rDNA reference sequences that originate from a large diversity of eukaryotes representing all known major photosynthetic lineages. We compiled 3333 amplicon sequences available from public databases and 879 sequences extracted from plastidial genomes, and generated 411 novel sequences from cultured marine microalgal strains belonging to different eukaryotic lineages. A total of 1867 environmental Sanger 16S rDNA sequences were also included in the database. Stringent quality filtering and a phylogeny-based taxonomic classification were applied for each 16S rDNA sequence. The database mainly focuses on marine microalgae, but sequences from land plants (representing half of the PhytoREF sequences) and freshwater taxa were also included to broaden the applicability of PhytoREF to different aquatic and terrestrial habitats. PhytoREF, accessible via a web interface (http://phytoref.fr), is a new resource in molecular ecology to foster the discovery, assessment and monitoring of the diversity of photosynthetic eukaryotes using high-throughput sequencing.
ISSN: 1755-098X

hal-01149047
http://hal.upmc.fr/hal-01149047
http://hal.upmc.fr/hal-01149047/document
http://hal.upmc.fr/hal-01149047/file/Decelle_2015_PhytoREF.pdf
DOI : 10.1111/1755-0998.12401

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
As climate change continues to impact socio-ecological systems, tools that assist conservation managers to understand vulnerability and target adaptations are essential. Quantitative assessments of vulnerability are rare because available frameworks are complex and lack guidance for dealing with data limitations and integrating across scales and disciplines. This paper describes a semi-quantitative method for assessing vulnerability to climate change that integrates socio-ecological factors to address management objectives and support decision-making. The method applies a framework first adopted by the Intergovernmental Panel on Climate Change and uses a structured 10-step process. The scores for each framework element are normalized and multiplied to produce a vulnerability score and then the assessed components are ranked from high to low vulnerability. Sensitivity analyses determine which indicators most influence the analysis and the resultant decision-making process so data quality for these indicators can be reviewed to increase robustness. Prioritisation of components for conservation considers other economic, social and cultural values with vulnerability rankings to target actions that reduce vulnerability to climate change by decreasing exposure or sensitivity and/or increasing adaptive capacity. This framework provides practical decision-support and has been applied to marine ecosystems and fisheries, with two case applications provided as examples: (1) food security in Pacific Island nations under climate-driven fish declines, and (2) fisheries in the Gulf of Carpentaria, northern Australia. The step-wise process outlined here is broadly applicable and can be undertaken with minimal resources using existing data, thereby having great potential to inform adaptive natural resource management in diverse locations.
ISSN: 0308-597X

hal-01380403
https://hal-univ-perp.archives-ouvertes.fr/hal-01380403
DOI : 10.1016/j.marpol.2016.09.024

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley
Résumé : International audience
Our understanding of the contribution of interspecific interactions to functional diversity in nature lags behind our knowledge of spatial and temporal patterns. Although two-species mutualisms are found in all types of ecosystems, the study of their ecological influences on other community members has mostly been limited to third species, while their influence on entire communities remains largely unexplored. 2. We hypothesized that mutualistic interactions between two respective ant species and an epiphyte mediate the biological traits composition of entire invertebrate communities that use the same host plant, thereby affecting food webs and functional diversity at the community level. 3. Aechmea mertensii (Bromeliaceae) is both a phytotelm ('plant-held water') and an ant-garden epiphyte. We sampled 111 bromeliads (111 aquatic invertebrate communities) associated with either the ant Pachycondyla goeldii or Camponotus femoratus. The relationships between ants, bromeliads and invertebrate abundance data were examined using a redundancy analysis. Biological traits information for invertebrates was structured using a fuzzy-coding technique, and a co-inertia analysis between traits and abundance data was used to interpret functional differences in bromeliad ecosystems. 4. The vegetative traits of A. mertensii depended on seed dispersion by C. femoratus and P. goeldii along a gradient of local conditions. The ant partner selected sets of invertebrates with traits that were best adapted to the bromeliads' morphology, and so the composition of the biological traits of invertebrate phytotelm communities depends on the identity of the ant partner. Biological traits suggest a bottom-up control of community structure in C. femoratus-associated phytotelmata and a greater structuring role for predatory invertebrates in P. goeldii-associated plants. 5. This study presents new information showing that two-species mutualisms affect the functional diversity of a much wider range of organisms. Most biological systems form complex networks where nodes (e. g. species) are more or less closely linked to each other, either directly or indirectly, through intermediate nodes. Our observations provide community-level information about biological interactions and functional diversity, and perspectives for further observations intended to examine whether large-scale changes in interacting species/community structure over broad geographical and anthropogenic gradients affect ecosystem functions.
ISSN: 0269-8463

hal-00817509
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00817509

Éditeur(s) : HAL CCSD Public Library of Science
Résumé : International audience
The Black Rat (Rattus rattus) spread out of Asia to become one of the world's worst agricultural and urban pests, and a reservoir or vector of numerous zoonotic diseases, including the devastating plague. Despite the global scale and inestimable cost of their impacts on both human livelihoods and natural ecosystems, little is known of the global genetic diversity of Black Rats, the timing and directions of their historical dispersals, and the risks associated with contemporary movements. We surveyed mitochondrial DNA of Black Rats collected across their global range as a first step towards obtaining an historical genetic perspective on this socioeconomically important group of rodents. We found a strong phylogeographic pattern with well-differentiated lineages of Black Rats native to South Asia, the Himalayan region, southern Indochina, and northern Indochina to East Asia, and a diversification that probably commenced in the early Middle Pleistocene. We also identified two other currently recognised species of Rattus as potential derivatives of a paraphyletic R.rattus. Three of the four phylogenetic lineage units within R. rattus show clear genetic signatures of major population expansion in prehistoric times, and the distribution of particular haplogroups mirrors archaeologically and historically documented patterns of human dispersal and trade. Commensalism clearly arose multiple times in R. Rattus and in widely separated geographic regions, and this may account for apparent regionalism in their associated pathogens. Our findings represent an important step towards deeper understanding the complex and influential relationship that has developed between Black Rats and humans, and invite a thorough re-examination of host-pathogen associations among Black Rats.
PLoS ONE

ird-00714383
http://hal.ird.fr/ird-00714383
http://hal.ird.fr/ird-00714383/document
DOI : 10.1371/journal.pone.0026357
IRD : fdi:010055548