Résumé : The development of large pelagic fishing in the French Antilles is an integral part of a difficult economic situation of the fishing sector in Martinique where this development can seem like a solution to increasingly acute problems. Indeed, for the regulatory authorities as well as for many participants in the sector, it is imperative to find solutions to the lack of profitability of a part of the fishing ships and to confront the regular increase of the share of imports in supplying Martinique with seafood. This question about the possibilities of developing large pelagic fishing is not new since it is already mentioned in the Notice from the Economic and Social Committee of the Martinique Region in 1982. We will not show in this document a detailed analysis of small-scale fishing in Martinique. Since the latter has been abundantly studied by the team of the Caribbean Oceanological and Halieutic Research Centre (PROHC) between 1985 and 1987, we will take up these principal conclusions (with which we are in full agreement) and bring them up to date based on data collected during our mission from 11 to 24 April 1988. The first section devoted to the supply structure (local fishing and imports) will attempt to define under what conditions large pelagic fishing can be developed. The second section will address marketing and demand. Indeed, at the same time as the problems of developing large pelagic fishing, we are faced with the question of the organisation of seafood markets. This organisation is a fundamental issue for the small-scale fishing sector in the French Antilles since its long-term future depends upon it by setting different prices and amounts exchanged according to the structure it is given. We will come to a conclusion on the economic conditions of developing a large pelagic fishery and organising a market, this based on research and study work already done. We will indicate which investigations must be conducted to complete the set of factors for decision support in this area. To perform this assessment, we reconstructed from the long series 1970-1986 (sometimes with significant inadequacies): these are presented as an appendix.
(OCR non controlé) Le développement de la pêche de grands pélagiques dans les Antilles Françaises s'inscrit dans un contexte économique difficile du secteur de la pêche en Martinique où ce développement peut apparaître comme une solution à des problèmes de plus en plus aigus. En effet, pour les autorités de tutelle ainsi que pour de nombreux intervenants dans le secteur, il est impératif de trouver des solutions au manque de rentabilité d'une partie des unités de pêche et de faire face à l'augmentation régulière de la part des importations dans l'approvisionnement de la Martinique en produits de la mer. Cette question sur les possibilités d'un développement de la pêche de grands pélagiques n'est pas nouvelle puisqu'elle est déjà évoquée dans l'Avis du Comité Economique et Social de la Région Martinique en 1982. On ne présentera pas dans ce document une analyse détaillée de la pêche artisanale en Martinique. Celle-ci ayant été abondamment étudiée par l'équipe du Pôle de Recherche Océanologique et Halieutique Caraïbe (PROHC) entre 1985 et 1987, on reprendra ces principales conclusions (avec lesquelles nous sommes en plein accord) en les actualisant à partir des informations recueillies lors de notre mission du 11 au 24 avril 1988. La première section consacrée à la structure d'offre (pêche locale et importations) s'attachera à définir dans quelles conditions peut être développée une pêche de grands pélagiques. Là seconde section traitera de la commercialisation et de la demande. En effet parallèlement aux problèmes de développement d'une pêche de grands pélagiques, se pose la question de l'organisation du marché des produits de la mer. Cette organisation est un enjeu primordial pour le secteur de la pêche artisanale dans les Antilles Françaises puisqu'elle conditionne son avenir à long terme en définissant des prix et des quantités échangées différents suivant la structure qu'on lui donne. On conclura sur les conditions économiques du développement d'une pêche de grands pélagiques et de l'organisation d'un marché, ceci à partir des travaux de recherche et des études déjà réalisés. On indiquera quelles investigations doivent être menées pour compléter l'ensemble des éléments d'aide à la décision dans ce domaine. Pour effectuer cette évaluation, on a reconstituer des séries longues 1970-1986 (parfois avec des carences importantes) : celles-ci sont présentées en annexe.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1988/rapport-2519.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2519/

Éditeur(s) : Université des Antilles et de la Guyane
Résumé : The need for an integrated approach to fisheries is now widely affirmed, including the FAO, in particular in the context of tropical artisanal fisheries. These small-scale fisheries, often multispecies are very important in terms of production, employment and food security. However these fisheries and the exploited resources are often characterized by a lack of data making difficult their management within an ecosystem approach, and by the ecological and economic system complexities including trophic and technological interactions. This thesis aims to contribute to the development of bioeconomic tools for small tropical fisheries in a sustainable management perspective based on the ecosystem approach. In this perspective, the French Guiana coastal fishery constitutes an interesting case study. The thesis proposes multi-criteria evaluations, complex bioeconomic models and viable management scenarios for this fishery. At first, multivariate statistical analysis suggests a satisfactory overall status of the fishery in terms of sustainability. However, some performance differences are noted within the fishery, particularly at border areas. Also, management improvements are proposed. Then, through bioeconomic modeling, projections of different fishing scenarios show that, in the long-term, the current exploitation level may not be consistent with the future increase of local demand and a loss of biodiversity may occur. A scenario called "co-viability" reconciling ecological, economic and social objectives, with a high probability of achievement is exhibited. Finally, the comparison of optimal behavior in cooperative and non-cooperative conditions, confirms that harvest levels are greater when actors do not cooperate. Furthermore, it is shown that the state of the ecosystem depends on the fishing strategies and the type of interaction between species. Beyond the diagnosis made for the case study, the method is promising in the context of small tropical fisheries, while the co-viability approach allows finding the exploitation conditions under which ecological and socio-economic sustainability are meet, what the conventional fisheries management generally do not allow.
La nécessité d’une approche intégrée des pêches est actuellement largement affirmée, notamment par la FAO, en particulier dans le contexte des pêcheries artisanales tropicales. Ces pêcheries à petites échelles, souvent multi-spécifiques sont très importantes en termes d’emploi et de production, y compris pour la sécurité alimentaire. Néanmoins ces pêcheries et la biodiversité exploitées sont souvent marquées, d’une part, par le manque de données rendant difficile leur gestion dans le cadre d’une approche écosystémique, d’autre part, par la complexité des systèmes écologiques et économiques sous-jacents incluant interactions trophiques et techniques. Cette thèse contribue à la mise au point d’outils bioéconomiques adaptés aux petites pêcheries tropicales dans la perspective d’une gestion durable des pêches fondée sur l’approche écosystémique. Dans cette perspective, la pêcherie côtière en Guyane Française constitue un cas d’étude particulièrement fécond. La thèse propose ainsi des évaluations multi-critères, des modèles bioéconomiques complexes et des scénarios de gestion viable pour cette pêcherie. Dans un premier temps l’analyse statistique multivariée suggère un statut global satisfaisant de la pêcherie en termes de durabilité. Cependant des différences de performance sont notées au sein de la pêcherie, notamment au niveau des zones frontalières. Aussi des améliorations dans le mode de gestion sont proposées. Ensuite, à travers la modélisation bioéconomique, les projections des différents scénarios de pêche montrent qu’à long terme le niveau d’exploitation actuel peut ne pas être en adéquation avec la future augmentation de la demande locale et qu’une perte de biodiversité peut avoir lieu. Un scenario dit de "co-viabilité" conciliant des objectifs à la fois écologique, économique et social, avec une probabilité de réalisation satisfaisante, est mis en exergue. Enfin, la comparaison des comportements optimaux en situation coopératif et non coopératif, montre dans quelle mesure la viabilité est favorisée quand les acteurs coopèrent. Au-delà du diagnostic apporté pour le cas d’étude, la méthode utilisée s’avère prometteuse dans le contexte des petites pêcheries tropicales, tandis que l’approche de co-viabilité permet de trouver les modalités d’exploitation dans le cadre de compromis entre durabilité écologique et socio-économique, ce que les principes de gestion halieutiques traditionnels ne permettent généralement pas.

Droits : 2013 Université des Antilles et de la Guyane
http://archimer.ifremer.fr/doc/00144/25492/23646.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00144/25492/

Éditeur(s) : Elsevier
Résumé : Penaeid shrimp reared in earthen ponds are exposed to sediment, which can, in some instances, induce a stress. In seawater, the osmoregulatory capacity (hyporegulation) is a useful tool to compare the physiological condition of shrimp exposed to various stressors. By keeping some shrimp in cages at different locations of a single pond heterogeneous in terms of sediment quality, it was possible, using osmotic pressure (OP), to identify some locations where the stress was maximum and some others where it was minimum. Simultaneously, sediment samples were taken and analysed in order to evaluate some physico-chemical parameters that could be related to the stress observed in the shrimps kept in the cages. This approach allowed to show a significant positive correlation between the pH of the sediment surface and the shrimp osmotic pressure. This result was confirmed in a study carried out in experimental 70-1 tanks, where osmotic pressure decreased significantly as water pH decreased from 7.0 to 6.5. The methodology developed in this study may be useful to evaluate the stress caused by sediment in shrimp farms. (C) 2004 Elsevier B.V. All rights reserved.
Aquaculture (0044-8486) (Elsevier), 2004-10 , Vol. 240 , N. 1-4 , P. 297-312

Droits : 2004 Elsevier
http://archimer.ifremer.fr/doc/2004/publication-1866.pdf
DOI:10.1016/j.aquaculture.2004.07.001
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1866/

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag (Germany)
Résumé : International audience
The anisotropy of vibrational properties influences the acoustic behaviour of wooden pieces and their dependence on grain angle (GA). As most pieces of wood include some GA, either for technological reasons or due to grain deviations inside trunks, predicting its repercussions would be useful. This paper aims at evaluating the variability in the anisotropy of wood vibrational properties and analysing resulting trends as a function of orientation. GA dependence is described by a model based on transformation formulas applied to complex compliances, and literature data on anisotropic vibrational properties are reviewed. Ranges of variability, as well as representative sets of viscoelastic anisotropic parameters, are defined for mean hardwoods and softwoods and for contrasted wood types. GA-dependence calculations are in close agreement with published experimental results and allow comparing the sensitivity of different woods to GA. Calculated trends in damping coefficient (tanδ) and in specific modulus of elasticity (E′/ρ) allow reconstructing the general tanδ-E′/ρ statistical relationships previously reported. Trends for woods with different mechanical parameters merge into a single curve if anisotropic ratios (both elastic and of damping) are correlated between them, and with axial properties, as is indicated by the collected data. On the other hand, varying damping coefficient independently results in parallel curves, which coincide with observations on chemically modified woods, either “artificially”, or by natural extractives.
Wood Science and Technology

hal-01096868
https://hal-agroparistech.archives-ouvertes.fr/hal-01096868
DOI : 10.1007/S00226-010-0393-8

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Isotopic fractionation of tritium is a highly relevant issue in radiation protection and requires certain radioecological considerations. Sound evaluation of this factor is indeed necessary to determine whether environmental compartments are enriched/depleted in tritium or if tritium is, on the contrary, isotopically well-distributed in a given system. The ubiquity of tritium and the standard analytical methods used to assay it may induce biases in both the measurement and the signification that is accorded to the so-called fractionation: based on an exhaustive review of the literature, we show how, sometimes large deviations may appear. It is shown that when comparing the non-exchangeable fraction of organically bound tritium (neOBT) to another fraction of tritium (e.g. tritiated water) the preparation of samples and the measurement of neOBT reported frequently led to underestimation of the ratio of tritium to hydrogen (T/H) in the non-exchangeable compartment by a factor of 5 % to 50 %. In the present study, corrections are proposed for most of the biological matrices studied so far. Nevertheless, the values of isotopic fractionation reported in the literature remain difficult to compare with each other, especially since the physical quantities and units often vary between authors. Some improvements are proposed to better define what should encompass the concepts of exchangeable and non-exchangeable fractions.
ISSN: 0160-4120

hal-01117744
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01117744
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01117744/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01117744/file/Article%20review%20discrimination%20isotopique-envoy%C3%A9.pdf
DOI : 10.1016/j.envint.2013.12.020

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier Masson
Résumé : International audience
Introduction. - Temocillin is an alternative to treat urinary tract infections with bacteria producing extended spectrum beta-lactamase (ESBL). The objective is to evaluate the use of temocillin in urinary tract infections. Materials and methods. - A systematic review of literature was carried out according to PRISMA criteria. All national and international recommendations have been reviewed regarding the indication of the use of temocillin in urology. Data collection on the use of temocillin in urinary tract infection has been performed from the Cochrane, LILACS and the Medline database. The following keywords were used: temocillin, extended spectrum. beta-lactamase, urinary tract infections, urine, prostate, epididymis, testis, diffusion, pharmacokinetics, pharmacodynamics. The selection was based on the methodology, language of publication (English/French), relevance to the topic and date of publication of the articles collected. The endpoint was to provide exhaustive scientific information allowing urologists to use this antibiotic in febrile urinary infections. Results. - Bacteria producing ESBL has a relatively high susceptible to temocillin, ranging from 61 % to 90 %. These rates would allow its use in probabilistic. The dosage recommended is currently, in the normo-renal patient, 4 g per day by intermittent infusion or continuously after a loading dose of 2g. Some studies argue, particularly in case of difficult clinical situations or obese patients, for administration of high doses (6 g/24 h) rather continuous infusion. There is no evident relationship between high doses and side effects. With an excellent urinary and prostatic diffusion, temocilllin might be recommend for the treatment of ESBL prostatitis. Conclusion. - Temocillin is known to have good urinary and prostatic diffusion. According to our results, this antibiotics is now a reliable alternative for the treatment of documented ESBL urinary tract infections. (C) 2017 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.
ISSN: 1166-7087

hal-01659245
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01659245
DOI : 10.1016/j.purol.2017.07.242
PUBMED : 28869169

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : In 1996 the European Commission Humanitarian Office (ECHO) launched a regional approach for disaster preparedness, focusing in its first phase on Central America, Caribbean and Southeast Asia (including Bangladesh). The first step in this process was the preparation of a «diagnostic study» that involved a situation review of the countries in these regions with regard to their vulnerabilities, disaster preparedness capacities and national plans or policies for disaster management.The Centre for Research on the Epidemiology of Disasters of the Université Catholique de Louvain (UCL) served as ECHO’s principal technical support with the collaboration of other institutions in Europe and the regions.The present «diagnostic report», covering Central America and the Caribbean, has been carried out by the Centre International pour la Formation et les Echanges en Géosciences (CIFEG) under the supervision of Professor Robert D’Ercole (Université de Savoie, Chambéry).Mr. Thierry Lesales (Université des Antilles et de la Guyane) participated closely in the drafting of this report and was actively involved in the field missions with Mr D’Ercole where they met and interviewed numerous national officials, non-governmental organisations and regional and international bodies. Further assistance was provided by Claudine Misson (CRED) for the interviews and information collected in the Dominican Republic. The report also draws from an earlier mission undertaken by Dr. Philippe Masure (BRGM, France), Christian Bugnion (CRED) and Alexandra Angulo (CRED) who undertook some of the preparatory work for the diagnostic study.This report presents an analysis of the disaster preparedness situation in Central America and the Caribbean and provides some preliminary recommendations regarding priorities and future programme direction. As such it remains primarily a descriptive study. It is expected to form the basis for the formulation of the ECHO Disaster Preparedness Action Plan.
En 1996, la Oficina Humanitaria de la Comunidad Europea (ECHO) lanzó la iniciativa de un enfoque regional en materia de preparación a los desastres, concentrándose inicialmente en las regiones de América Central, Caribe y Asia del Sureste (incluyendo a Bangladesh). La primera fase de este proceso fue la preparación de un « diagnóstico» que implicaba un examen de la situación de los países de cada una de estas regiones en relación a la vulnerabilidad, la capacidad de preparación a los desastres y las políticas y planes nacionales en materia de gestión de desastres.El Centre for Research on the Epidemiology of Disasters (CRED), de la Université Catholique de Louvain (UCL), ha sido el principal apoyo técnico de ECHO para esta iniciativa, con la colaboración y asistencia de otras instituciones en Europa y en las regiones arriba mencionadasEl presente informe que cubre América Central y el Caribe, fue realizado por el International Centre for Training and Exchanges in Geosciences (CIFEG), bajo la dirección del Profesor Robert D'Ercole (Université de Savoie).Thierry Lesales (Université des Antilles et de la Guyane) participó de cerca a la realización de este documento y estuvo activamente implicado junto al Profesor D'Ercole en las misiones que se realizaron en varios países. En el curso de estas misiones, se entrevistaron con numerosos representantes de gobiernos nacionales, de ONGs y de organizaciones regionales e internacionales Se contó igualmente con la asistencia de Claudine Misson (CRED), quien realizó la misión en República Dominicana. El informe se basa igualmente en una misión anterior llevada a cabo por Philippe Masure (BRGM, France), Alexandra Angulo (CRED) y Christian Bugnion (CRED), la cual realizó parte del trabajo preparatorio para el diagnóstico.El informe presenta un análisis de la situación en América Central y el Caribe y provee recomendaciones preliminares para las prioridades y dirección del futuro programa. En el marco de la segunda fase, está destinado a servir de base para la formulación del Plan de Acción de Preparación a los Desastres de ECHO.
Depuis 1994, ECHO (Office Humanitaire de la Commission Européenne, devenu le service de la Commission européenne à l’aide humanitaire et à la protection civile) a financé, à l'échelle mondiale, de nombreuses opérations pour la prévention et la préparation aux catastrophes (catastrophes naturelles principalement) Ces financements ont répondu aux demandes d'ONG et d'organisations internationales qui ont-elles-mêmes mis en oeuvre les projets correspondants. Les évaluations de ces opérations ont donné des appréciations positives. Cependant, ECHO souhaite s'impliquer davantage dans la prévention et la préparation aux catastrophes et mieux cibler ses actions pour une plus grande cohérence d'ensemble.Au cours de la réunion du 16 juillet 1996, le Comité d'Aide Humanitaire a approuvé la nouvelle approche régionale proposée par ECHO pour son programme de prévention, d'atténuation et de préparation aux catastrophes, le DIPECHO (Dlsaster Preparedness ECHO), pour la période 1996—1998. Ce programme doit s'appliquer dans un cadre régional en concentrant d'abord ses financements sur des plans d'action dans les Caraïbes, en Amérique Centrale, en Asie du Sud-Est et au Bangladesh. Par ailleurs, au lieu de répondre exclusivement aux demandes de financements spécifiques d'ONG, d'organisations internationales et de gouvernements, ECHO souhaite préparer des plans d'action et déterminer les partenaires les plus appropriés pour une mise en oeuvre dirigée par ECHO même. En outre, le DIPECHO a pour objet de rendre plus efficace l'action de l'ensemble de l'Union Européenne, par une étroite coordination de son action avec celles de la Commission et des Etats Membres. Il est enfin prévu de faire précéder la préparation des plans d'action par une phase de diagnostic au cours de laquelle seront identifiés, pour chaque région, les risques, les structures et politiques de prévention existantes aux niveaux communautaire, national et régional, ainsi que les appuis extérieurs en cours et à venir. L'objectif est non seulement de déterminer les lacunes, mais également d'évaluer la cohérence et l'efficacité des systèmes de réponse dans leur ensemble......Dans ce contexte, une première mission exploratoire a été réalisée du 30 septembre au 12 octobre 1996 dans les Caraïbes et l'Amérique Centrale (quatre pays visités) et a débouché sur un premier rapport (A. Angulo, Ch. Bugnion, Ph. Masure, "Rapport de mission exploratoire dans les Caraïbes ct en Amérique Centrale pour DIPECHO").Ce rapport apporte de nombreuses informations et en particulier:(1) il définit le cadre conceptuel, insistant, à juste titre, sur le fait que la prévention et la préparation doivent être distinguées de l'aide d'urgence et qu'elles font partie d'un processus continu au même titre que le développement ;(2) il présente les principales organisations régionales et internationales, et leurs activités dans le domaine de la prévention et de la préparation;(3) il met en évidence les grands types de besoins et fournit les premières orientations pour le programme DIPECHO......Le présent rapport, constituant le diagnostic proprement dit, fait suite à une deuxième série de missions effectuées dans la même région. Il vise à compléter les apports de la mission exploratoire, notamment par:(a) une analyse des catastrophes et de leurs conséquences:(b) une évaluation comparée des risques dans la région;(c) une analyse détaillée des réalisations et des besoins en matière de réduction des risques et des conséquences des catastrophes naturelles ;(d) un examen des conditions actuelles pour un programme DIPECHO cohérent, réalisable et efficace, avec, en particulier, la prise en compte de l’organisation actuelle de la prévention et de la préparation dans la région et un état des appuis extérieurs ;- des propositions de lignes d'actions prioritaires pour le DIPECHO......Le diagnostic s'est appuyé sur une importante documentation : travaux scientifiques, études et rapports recueillis auprès du CRED-Université Catholique de Louvain, du CIFEG, du DHA, de l’IDNDR, de divers organismes sur le terrain (notamment le centre de documentation de San José au Costa Rica), et d'universités européennes (Université de Savoie. Chambéry, Université de Lausanne). Mais ce sont avant tout les nombreux entretiens menés lors des missions (près de 200) qui ont donné corps au diagnostic.Treize pays Ont été visités entre le 22/01 et le 07/03/1997 :- République Dominicaine (C Misson);- Costa Rica, Guatemala, Nicaragua et Cuba (R. D'Ercole) ;- Antigua, Barbade, Haïti, Jamaïque, Ste-Lucie, St-Maarten, St-Vincent et le Guyana (Th. Lesales).Leur choix a été déterminé en concertation avec ECHO, le CRED-UCL et le CIFEG. Ils ne recouvrent pas l'ensemble des pays qu'il aurait été théoriquement possible de visiter. Cependant, le choix de pays-clés, les contacts établis avec de nombreux organismes de portée régionale et la documentation consultée, ont permis de bâtir un diagnostic d'ensemble......L'étude comporte trois parties.La 1e partie constitue une analyse des catastrophes en termes de bilan et de risque. Il s'agit, à l'aide de cartes, notamment, de montrer les effets des catastrophes naturelles en Amérique Centrale et dans les Caraïbes, de présenter la répartition et la fréquence des aléas naturels et de procéder à une analyse de critères de vulnérabilité. L'objectif est, enfin, de déterminer des niveaux de risque, à l'échelle de la région, compte tenu des dangers naturels et des critères de vulnérabilité.La 2° partie est l'étude des actions entreprises dans la région, ces dernières années, afin de réduire les risques et les conséquences des catastrophes. Cette étude permet de dégager des lacunes et des besoins. Les différentes composantes entrant dans le processus de réduction des catastrophes sont retenues : recherche scientifique et technique, prévention stricto sensu, préparation, information / formation. L'accent est également placé sur les modes actuels d'application des politiques de réduction des risques : de l'approche sectorielle à l'approche intégrée.La 3e partie traite des conditions actuelles pour la mise en oeuvre d'un programme DIPECHO cohérent et efficace. Quatre aspects fondamentaux sont analysés: les particularités régionales et nationales (l'hétérogénéité et ses conséquences); les faiblesses et qualités institutionnelles aux différents échelons géographiques: les caractéristiques des organismes susceptibles de contribuer à la mise en oeuvre du DIPECHO; le rôle actuel et en perspective de la Communauté Européenne et des Etats Membres.Chaque partie comporte une conclusion partielle La conclusion générale reprend les idées force des conclusions intermédiaires ct débouche sur des lignes d'actions prioritaires recommandées pour le DIPECHO......L'étude confiée au CIFEG par le CRED-UCL et ECHO a été coordonnée par Robert D'Ercole (Département de Géographie, Université de Savoie, Chambéry, France). Elle a bénéficié de la collaboration de Thierry Lesales (Département de Géographie, Université des Antilles et de la Guyane, Martinique, France) et de Patrick Pigeon (Département de Géographie, Université de Savoie, Chambéry, France). Ont également contribué à la réalisation de celle étude: Claudine Misson (CRED-UCL, Belgique), Jean-Claude Napias (CIFEG, directeur), Jacques Giri (CIFEG, président), Sylvie Orlyk (CIFEG, secrétariat).
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01196496

hal-01196496
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01196496
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01196496/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01196496/file/D%27Ercole%20et%20al%201997%20Diagnostic%20DIPECHO%20Caraibes%20compressed.pdf

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag
Résumé : International audience
Polarized emittance measurements were acquired for synthetic forsterite, the pure magnesium end member of the olivines group, on the whole infrared spectral range and up to the melting point by using CO2 laser heating. The experimental data, fitted with a semi-quantum dielectric function model, allowed the retrieval of the temperature dependence of the absorption coefficient of forsterite both in the opaque and semi-transparent regions. The analysis of the phonon parameters indicates that the lattice dynamics evolve drastically with increasing temperature. The normal modes involving motions of the magnesium cations located in site 1 are the more impacted, and some of them vanish around 1,200 K. The results confirm that the enhancement of the lattice anharmonicity and the increasing mobility of the magnesium cations are closely linked and are at the origin of the anomalies observed in the evolution of the thermophysical properties. This complete set of spectroscopic data may be a step toward a more precise evaluation of the impact of thermal radiation heat transfer inside systems involving forsterite and quantification of their heat budget.
ISSN: 0342-1791

hal-00817079
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00817079
DOI : 10.1007/s00269-013-0570-z

Éditeur(s) : HAL CCSD Lippincott, Williams & Wilkins
Résumé : International audience
Purpose of review Toxoplasmosis in immunocompromised patients is associated with a high mortality rate. Molecular techniques are important tools to diagnose acute disease in immunocompromised patients, but there are various methods with variable efficiency. Some of them have been validated for the diagnosis of congenital toxoplasmosis, but the impact of their use has not been evaluated in immunocompromised patients. Recent findings Toxoplasmosis is of increasing importance in non-HIV immunocompromised patients. In addition, the picture of disease shows greater severity in South America, both in immunocompetent study participants and in congenitally infected infants. These epidemiological differences could influence the sensitivity of diagnostic methods. This review analyzes recent data on molecular diagnosis and compares them with older ones, in light of progress gained in molecular techniques and of recent epidemiological findings. Most recent studies were conducted in South America and used PCR targeting the B1 gene. PCR on blood could allow diagnosing a significant proportion of patients with ocular toxoplasmosis in Brazil. Summary Quantitative PCR methods with specific probes should be used to improve sensitivity and warrant specificity. Performance of quantitative PCR targeting the repeated 529 bp sequence for the diagnosis of toxoplasmosis in immunocompromised patients needs evaluation in field studies in South America and in western countries.
ISSN: 0951-7375

hal-01390970
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01390970
DOI : 10.1097/QCO.0000000000000275
PUBMED : 27191201

Éditeur(s) : Université Nice Sophia Antipolis
Résumé : The Lesser Antilles is a case study of a very slow subduction (~2 cm/yr) of an old oceanic lithosphere (~84-100 Ma). The region presents a relatively low seismic activity, especially along the interplate contact, and the seismic hazard associated with a possible mega-thrust earthquake is still poorly known. This PhD thesis is a first step toward assessing the ability of the Lesser Antilles subduction zone to produce such a large subduction event. To do so, it aims at constraining the downdip width of the interplate's seismogenic zone. The lack of coverage of permanent seismological stations is a major limitation in the exploration of the Lesser Antilles subduction zone. It is due to the presence of only small aligned islands at far distances from the potentially seismogenic interplate area. Several oceanographic cruises were therefore planned that notably allowed the repeated deployment of ocean bottom seismometers; some of them being left for a few months of background seismicity recording. This thesis specifically focuses on two sets of wide-angle seismic data acquired offshore the Dominica and Martinique islands. From their analysis 3D and 2D tomographic models were produced respectively over the forearc region and across the whole subduction complex. These models constrain the plates' seismic structure as well as their geometry. They allow the discussion of how the imaged structures affect the subduction processes and give a first estimation of the downdip width of the seimogenic zone, defined as the segment of the interplate between the backstop and the upper plate's Moho. The joint interpretation of seismic models and earthquake localizations then refine this first assessment. Epicenter distribution from height months of seismic recording shows indeed that seismicity concentrates within the inner forearc region. The strong velocity gradient that characterize its basement suggests it is denser and more rigid than the more deformable outer forearc basement. The updip limit of the seismogenic zone could then lie arcward of the backstop at the contact of the interplate and the seaward end of the inner forearc crust. At depth, interplate earthquake mechanisms are observed between 35 and 45 km depth and interpreted to have occurred at the downdip limit of the seismogenic zone. The latter could reach a depth over 10,km deeper than the contact of the upper plate's Moho with the interplate, and therefore lie within the mantle wedge. All together, these results imply a large downdip width of the seismogenic zone (~70 km) offshore the Dominica and Martinique islands. Further work is, however, needed in order to fully comprehend the ability of the Lesser Antilles subduction zone to produce a possible mega-thrust earthquake. This would necessitate the evaluation of seismic coupling at the interplate contact and the possible segmentation of the seismogenic zone, for instance, due to the subduction of oceanic ridges.
Les Petites Antilles présentent un contexte géodynamique caractérisé par la subduction à très faible vitesse (~2 cm/an) d'une lithosphère océanique âgée (~84-100 Ma). L'activité sismique y est relativement faible, notamment à l'interplaque, où l'aléa sismique lié à un éventuel séisme de méga-chevauchement reste encore mal contraint. Cette thèse se veut être une première étape dans l'évaluation de la capacité de la zone de subduction des Petites Antilles à générer un tel évènement. Dans ce but, ces travaux tentent d'appréhender l'extension en profondeur du domaine sismogène de l'interplaque. Le manque de couverture des stations sismologiques permanentes est un inconvénient majeur dans l'exploration des Petites Antilles. Il s'explique en raison du peu de terres émergées et de leur éloignement de la zone potentiellement sismogène de l’interplaque. La région a donc fait l'objet de plusieurs campagnes océanographiques qui ont permis, notamment, le déploiement de sismomètres fond de mer (OBS); certains instruments étant restés immergés plusieurs mois afin de procéder à une écoute de la sismicité. Les travaux réalisés au cours de cette thèse se sont focalisés sur deux jeux de données de sismique grand-angle acquis au large des îles de la Dominique et de la Martinique. Leur analyse a permis la construction de modèles tomographiques 3D et 2D respectivement à l'échelle de l'avant-arc et de l'ensemble de la subduction. Ces modèles renseignent sur la structure sismique des plaques en convergence ainsi que sur leur géométrie. Ils permettent de discuter le rôle de la structure dans le fonctionnement de la subduction et d’obtenir une première estimation de l'extension en profondeur de la zone sismogène en considérant la portion de l'interplaque comprise entre le butoir et le Moho de la plaque supérieure. Dans un second temps, l'interprétation conjointe des modèles tomographiques et des localisations des séismes locaux a permis d'affiner cette estimation. Huit mois d'enregistrement de la sismicité montrent en effet une concentration des épicentres dans la région interne de l’avant-arc. Celle-ci présente un socle épais, à fort gradient de vitesse interprété comme plus dense et rigide que le socle de la région externe de l'avant-arc, plus déformable. La limite amont de la zone sismogène pourrait donc se situer en retrait de la position du butoir au contact de l'interplaque et de la limite entre ces deux zones de l'avant-arc. En profondeur, des mécanismes interplaques sont observés entre 35 et 45 km et interprétés comme des marqueurs de la limite aval de la zone sismogène. Cette dernière pourrait donc atteindre une profondeur jusqu'à 10 km supérieure à la limite précédemment évoquée et se trouver, par conséquent, au contact du manteau lithosphérique. L'ensemble de ces résultats suggèrent une extension en profondeur de la zone sismogène (i.e une largeur) de près de 70 km face aux îles de la Dominique et de la Martinique. Ces travaux doivent cependant être poursuivis afin d’évaluer pleinement la capacité de la zone de subduction des Petites Antilles à générer un éventuel séisme de méga-chevauchement. Le taux de couplage à l'interplaque doit être précisé ainsi que sa possible segmentation en lien, par exemple, avec à l'entrée en subduction des rides océaniques.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00172/28335/26628.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00172/28335/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Benzophenone derivatives (BPs) are used as UV filters in many different products. These lipophilic compounds were recently described as ubiquitous contaminant of different compartiments of aquatic systems, including fish. In this study, we evaluated estrogenic activity of ten BPs in a model fish species, the zebrafish (Danio rerio), by combining newly developed in vitro and in vivo models. In vitro, three specific zebrafish reporter gene models expressing zebrafish estrogen receptors (ZfERs) in zebrafish hepatic cell line (ZFL) were used.Estrogenic activity of BPs was quantify in vivo by using a newly developed transgenic zebrafish line that expresses green fluorescent protein (GFP) under the control of the cyp19a1b promoter. The cyp19a1b gene codes for the brain aromatase B that is under the control of estrogens. Vitellogenin (Vtg), a marker of estrogenic compound, was used to assess the potential estrogenic effect of certain BPs in male fish. Five of 10 BPs induced an estrogenic activity on the three models: BP2, THB, BP1, 4BP, while BP and 234 BP were non active. We noted diffrence in BPs ranking depending on the zfER subtypes suggesting ?/? receptor selectivity by certain BPs. By quantifying GFP expression in live zebrafish, we confirm the estrogenic activity of some BP, i.e., BP1, THB, 4BP and 44'BP, as shown by their ability to induce GFP in a concentration-dependent manner. However, the ranking of BPs as a function of their estrogenic activity assay is different between models. For instance, 4BP was the most estrogenic compound in vivo but not in vitro. Differences were also noticed regarding the estrogenic activity of BP2. In vitro, BP2 has strong activity but had no effect on GFP in cyp19a1b-GFP embryo. However, BP2 induced strongly Vtg in male. The lack of estrogenic activity of BP2 in embryo may be related to difference of biodisponibility and/or metabolisation of this compound between embryo and adult fish. Our approach allows to characterize the estrogenic potency of emerging pollutants, using innovative in vitro and in vivo assays within a unique model fish species. The differences observed between assays deserve further studies to characterize the behavior of compounds in the different biological models in term of biodisponibility and metabolism.
1. European Conference on the Replacement, Reduction and Refinement of Animal Experiments in Ecotoxicology
Dübendorf, Switzerland

ineris-00971019
https://hal-ineris.archives-ouvertes.fr/ineris-00971019
INERIS : EN-2012-243

Éditeur(s) : Wiley-blackwell Publishing, Inc
Résumé : Oceanic larvae of the European (Anguilla anguilla) and American (A. rostrata) eels have to cross the Atlantic Ocean from the Sargasso Sea to European or North American coasts before entering continental habitats. In some European rivers, eel recruitment is now < 1% of levels in the 1980s. A better understanding of the effects of anthropogenic pressures and environmental fluctuations on eel larvae and subsequent recruitment is a prerequisite to build efficient management plans. The present paper provides insight into the critical oceanic phase of the eel life cycle with a focus on the duration of the larval migration whose estimates varies between 7 months and more than 2 years in both species. Does this range correspond to a natural variability in larval duration or does it stem from methodological artefacts? We first review the different methods used to estimate the duration of larval migration and critically describe their possible sources of misinterpretation. We then evaluate the consistency of these methods with the current knowledge about the ecology and physiology of eel larvae and the physical oceanography. While a moderate discrepancy in migration duration was found between methods for the American eel, the discrepancy was large in the European eel. In this species, otolith microstructure studies indicated migration durations between 7 and 9 months, while other methods pointed to durations of about 2 years. We show that estimates in favour of a long migration duration seem more robust to methodological caveats than methods estimating short durations of migration.
Fish And Fisheries (1467-2960) (Wiley-blackwell Publishing, Inc), 2010-09 , Vol. 11 , N. 3 , P. 289-306

Droits : 2010 Blackwell Publishing Ltd.
http://archimer.ifremer.fr/doc/00011/12208/9033.pdf
DOI:10.1111/j.1467-2979.2010.00362.x
http://archimer.ifremer.fr/doc/00011/12208/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : This thesis aims to analyze the active tectonics and the seismic hazard for three main cities of NW Iran (Tehran, Tabriz and Zandjan) using morphotectonics and paleoseismology. Within the Tehran capital, we focused our analysis on the Mosha-North Tehran (M-NT) active fault system. Our investigations show that this fault system is mainly dominated by left-lateral faulting. Along the eastern part of the M-NT fault system, we found evidences of at least seven strong (M>7) paleoearthquakes during the past 10 ka (recurrence interval : 1100-1400 yrs). Our study along the central portion of the fault system (in Abali region) suggests that it corresponds probably to the source of the 1830 AD historical earthquake (M=7.1, Io= IX). Within Tabriz region, we studied the SE segment of the North Tabriz fault. We found evidences of at least three strong events, which occurred during the past 33.5 ka. The North Tabriz dextral fault corresponds to the central portion of a fault system (TFS), and contains two fault segments (NW and SE). Our paleoseismological analysis shows a variation of the slip rate, which decreases from NW to SE along the strike-slip fault. The western (Mishu) and eastern (Bozghush) terminations of the fault system correspond to oblique-compression zones. TFS belongs to the eastern portion of a regional fault system (GSKT), linking the active extension within the central part of the collision and the active compression to the East. Finally, we focus on the Zandjan area, where no important historical seismicitiy is recorded. There, based on morphotectonics analysis we discovered a large active fault network, whose southeastern part affects the Zandjan city. To conclude this work, we replace our observations within the general geodynamic framework of the Arabia- Eurasia collision. One of the striking pictures is the occurrence of opposite kinematics along the M-NT (and other range parallel faults within the south Central Alborz) and the North Tabriz fault systems that have the same trend. This shows the rapid variation of the regional stress field in the Northern Iran.
L'objectif de ce mémoire de thèse est l'étude de la tectonique récente et l'évaluation de l'aléa sismique pour trois villes importante, Téhéran, Tabriz et Zandjan, situées dans le nord-ouest de l'Iran. Dans la capitale de l'Iran, Téhéran, nous nous sommes concentrés sur le système de faille active de Mosha-Nord Téhéran. Nos travaux démontrent que ce système est essentiellement décrochant sénestre. Nos analyses paléosismologiques sur la portion est de ce système (dans la vallée de Tar) montrent au minimum les évidences de sept grands événements sismiques (M>7) pendant les derniers 10000 ans (l'intervalle de récurrence est de 1100 à 1400 ans). Les études que nous avons mené dans la partie centrale de ce système (région d'Abali) révèlent qu'il pourrait être la source du dernier événement sismique ayant affecté la ville de Téhéran en 1830 AD. Dans la région de Tabriz, nous nous sommes intéressés au segment SE de la faille décrochante dextre de Nord Tabriz où nous avons trouvé les évidences de trois grands séismes pendant les derniers 33500 ans. Nos études montrent que la faille Nord Tabriz qui est la portion centrale d'un système de faille (TFS) est constituée par deux segments NW et SE dextres. Notre étude paléosismologique suggère une variation de la vitesse qui diminue du NW vers SE le long de ces segments. Les extrémités ouest (Mishu) et est (Bozghush) de ce système correspondent à des zones compressives qui absorbent les déplacements horizontaux sur les segments NW et SE. D'un point de vue général la TFS est une partie d'un système de failles régionales (GSKT) qui relie une zone d'extension active dans la partie centrale de la collision Arabie-Eurasie et une zone de compression active à l'Est. Enfin, à Zandjan qui est une ville située dans une région de lacune sismique, nous avons découvert un important réseau de failles actives. Le tracé sud-est de ce réseau de failles passe par la ville de Zandjan. En conclusion, les localisations et les cinématiques des systèmes de faille étudiés sont discutées dans le cadre géodynamique général de la collision Arabie-Eurasie. On remarquera que la faille majeure de Nord Tabriz qui correspond essentiellement à un décrochement dextre a la même direction NW-SE que les décrochements sénestres présents dans la chaîne de l'Alborz (les failles de : Mosha, Talaghan et Manjil). Cette observation nécessite une variation de la direction de compression entre ces deux régions.
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00539739

tel-00539739
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Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Background: The impact of hepatitis B virus (HBV) genomic variability on the measurement of HBsAg level has been poorly evaluated. Objective: This study was designed to compare the performance of all the available assays measuring HBsAg level in this setting. Study design: A large selection of wild type HBV genotypes (n = 184) and HBsAg strains harboring mutations in the S gene (n = 81) from clinical samples was studied with three HBsAg quantification assays: Architect HBsAg (Abbott), LiaisonXL Murex HBsAg Quant (DiaSorin) and the Elecsys HBsAgII (Roche). Results: The overall percentage of positive results was 99.2% for Abbott, 98.9% for DiaSorin and 98.1% for Roche. Abbott and Roche assays provided an excellent concordance in HBsAg quantification (global mean bias of -0.006 logIU/mL). By contrast, DiaSorin underestimated HBsAg level with values 0.112 logIU/ml and 0.103 logIU/ml lower than Abbott and Roche, respectively. By contrast, DiaSorin slightly over quantified gtC(2.5% over the expected value) while Abbott provided values 6.2% lower than expected and 16.2% lower than what observed for the other genotypes. HBsAg quantitative assays were influenced by HBs protein substitutions irrespective to the genotype but no specific protein pattern that would particularly impair the quantification by one technique has been identified. However, Roche seemed to be particularly impacted by substitutions at 145 residue: 75% of under quantified samples carried a substituted 145 residue. Conclusion: This head-to-head comparison indicates a good correlation between all current systems used to quantify HBsAg but clearly shows an influence of both the genotype and the presence of "a" determinant variants in the absolute quantification of HBsAg. While these discrepancies may not translate into major clinical consequence, they may explain an absence of detection of weak concentration of HBsAg on some systems. (C) 2017 Elsevier B.V. All rights reserved.
ISSN: 1386-6532

hal-01588395
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01588395
DOI : 10.1016/j.jcv.2017.02.001
PUBMED : 28189936

Éditeur(s) : HAL CCSD Paris : Français dans le monde
Résumé : Le n°45 de la revue "recherches et appliications, le français dans le monde" a été coordonné par Evelyne Rosen
International audience
L'approche actionnelle offre de nouvelles perspectives à l'évaluation sommative et certificative, dont les opérateurs européens, les méthodologues et les enseignants s'emparent peu à peu à la suite de théoriciens généralement anglo-saxons. Cependant, s'il est relativement aisé de définir désormais les paramètres fondamentaux des tâches évaluatives, l'analyse des performances qui en résultent nécessite une mise en perspective politique que le recours à des techniques statistiques ne pourra pas résoudre seul.
ISSN: 0994-6632

Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess
halshs-01395782
https://halshs.archives-ouvertes.fr/halshs-01395782
https://halshs.archives-ouvertes.fr/halshs-01395782/document
https://halshs.archives-ouvertes.fr/halshs-01395782/file/Conception_et_validite_de_taches_evaluat.pdf

Résumé : Ce travail de thèse intitulé «Evaluation de marqueurs génétiques du complexe Mycobacterium tuberculosis combinée à l'utilisation d'outils bioinformatiques: apport en épidémiologie et phylogénie de la tuberculose» a consisté en la sélection et l'évaluation de marqueurs minisatellites dans le cadre d'études épidémiologiques et phylogénétiques du bacille tuberculeux, Une première partie a ainsi porté sur l'épidémie de tuberculose en Guadeloupe, Martinique, et Guyane française ainsi que dans un pays continental à faible incidence de tuberculose, la Suède, Les résultats montrent les disparités existant entre les populations de patients tuberculeux des 3 départements français d'Amérique (DFA) ainsi que les similitudes génotypiques existant entre les bacilles tuberculeux. Par ailleurs le rôle majeur joué par les cas d'importation dans l'épidémie de tuberculose a été montré aussi bien dans les DFA qu'en Suède. Nous nous sommes ensuite intéressés à une utilisation optimale des minisatellites pour une meilleure discrimination de la famille génotypique émergeante « Beijing» circulant au Japon (Osaka, Kobe et Okinawa), ainsi qu'en Russie. Nous avons constaté le faible pouvoir discriminant du format classique 12-locus MIRU (Mycobacterial lnterspersed Repetitive Units) et proposons plusieurs nouvelles stratégies de typage basées plusieurs marqueurs minisatellites incluant certains locus hypervariables. Enfin, dans un troisième volet, nous avons étudié la diversité génétique des bacilles tuberculeux circulant actuellement dans la Caraïbe. laquelle semble refléter le passé historique très particulier de cette zone géographique au croisement d'une multitude de peuplements.
This thesis entitled "Evaluation of genetic markers of Mycobacterium tuberculosis combined with the use of bioinformatics tools: input for epidemiology and phylogeny of tuberculosis" deals with the selection and evaluation of minisatellite markers in the context of epidemiological and phylogenetic studies of the tubercle bacillus M. tuberculosis. The first part of the present work has focused on the epidemic of tuberculosis in Guadeloupe, Martinique and French Guiana as well as in a low incidence continental country, i.e Sweden. The results show differences between populations of TB patients in the three French Departments of America and similarities between the genotypes of the circulating tubercle bacilli Moreover, results highlight the important role played by imported cases for TB epidemic the three French departments of America and Sweden. ln a second part, minisatellite markers have been evaluated for a better discrimination of strains of the emerging genotype "Beijing" circulating in Japan (Osaka, Kobe and Okinawa), and Russia. A low discriminatory power of classical format 12-locus MIRU (Mycobacterial lnterspersed Repetitive Units) was observed and new combinations of minisatellites have also been proposed including hypervariable locus. Finally, the genetic diversity of tubercle bacilli circulating in the Caribbean was investigated which currently seem to reflect historical past of this very special region at the intersection of a multitude of cultures and peoples.

http://www.theses.fr/2011AGUY0427/document

Éditeur(s) : EDP Sciences
Résumé : The cost of ecosystem services degradation is a major topic as underlined by the TEEB program (The Economics of Ecosystems and Biodiversity), which proposed an assessment of the costs of policy inaction in the field of biodiversity conservation. In the same vein, the report of the French Centre for Strategic Analysis on the Economic Approach to Biodiversity and Ecosystem Services turns its attention to the value of ecosystem services, suggesting some elements that could help measure the cost of biodiversity degradation. There is however some confusion regarding the notion of cost. Thus, in the case of TEEB the proposed cost assessment translates into monetary terms the loss of potential profits from ecological services. Yet, another way of assessing these costs could be to estimate the investment required to maintain the ecological potential of ecosystems to deliver these services. This latter approach may be considered better suited to the concept of “inaction” proposed by the TEEB report. In addressing this point, the paper attempts to identify the operational implications of these two assessment methods and their links with decision-making. One of our findings is that the economic approach to biodiversity tends to focus systematically on the question of the monetary value of ecosystem services while regulatory texts increasingly consider the cost assessment of maintaining ecosystem services.
La question des coûts de l’érosion des services écologiques est un sujet très important, comme l’a souligné le programme TEEB (The Economics of Ecosystems and Biodiversity), qui a proposé une évaluation des coûts de l’inaction politique dans le domaine de la conservation de la biodiversité. Dans la même veine, le rapport du Centre d’analyse stratégique, intitulé Approche économique de la biodiversité et des services liés aux écosystèmes, s’est intéressé à la question de la valeur des services écosystémiques et a proposé quelques éléments qui permettraient d’évaluer le coût de leur érosion. Il existe cependant une certaine confusion autour de cette notion de coût. Ainsi, dans le cas du TEEB, l’évaluation proposée des coûts traduit en termes monétaires la perte de bénéfices potentiels que les services écologiques perdus auraient pu délivrer à l’horizon 2050. Mais une autre manière d’évaluer ces coûts aurait pu être d’estimer les investissements à réaliser pour maintenir les capacités écologiques des écosystèmes à délivrer ces services. En approfondissant ce point, le présent article permet de souligner les différences entre les implications opérationnelles de ces deux approches, mais aussi leurs connexions avec des processus décisionnels précis. Une de nos conclusions est que l’approche économique de la biodiversité a tendance à se focaliser systématiquement sur la question de la valeur monétaire des services écologiques, alors que l’évaluation des coûts de maintien des potentialités écologiques dont dispose la biodiversité pour délivrer des services écosystémiques semble être aujourd’hui privilégiée dans les textes réglementaires.
Natures Sciences et Sociétés (1240-1307) (EDP Sciences), 2012 , Vol. 20 , P. 16-29

Droits : NSS-Dialogues, EDP Sciences 2012
http://archimer.ifremer.fr/doc/00120/23115/20960.pdf
DOI:10.1051/nss/2012003
http://archimer.ifremer.fr/doc/00120/23115/

Éditeur(s) : HAL CCSD Linnean Society of London
Résumé : Disentangling the impact of landscape features such as rivers and historical events on dispersal is a challenging but necessary task to gain a comprehensive picture of the evolution of diverse biota such as that found in Amazonia. Adenomera andreae, a small, territorial, terrestrial frog species of the Amazonian forest represents a good model for such studies. We combined cytochrome b sequences with 12 microsatellites to investigate the genetic structure at two contrasted spatial scales in French Guiana: along a similar to 6-km transect, to evaluate dispersal ability, and between paired bank populations along a similar to 65-km stretch of the Approuague river, to test the effect of rivers as barriers to dispersal. We observed significant spatial genetic structure between individuals at a remarkably small geographical scale, and conclude that the species has a restricted dispersal ability that is probably tied to its life-history traits. Mitochondrial and microsatellite data also indicate a high level of differentiation among populations on opposite banks of the river, and, in some cases, among populations on the same riverbank. These results suggest that the observed population structure in A. andreae is the result of restricted dispersal abilities combined with the action of rivers and Quaternary population isolation. Given that Amazonia hosts a great portion of anurans, as well as other small vertebrates, that display life-history traits comparable with A. andreae, we argue that our analyses provide new insights into the complex interactions among evolutionary processes shaping Amazonian biodiversity. (c) 2012 The Linnean Society of London, Biological Journal of the Linnean Society, 2012, 106, 356373.
ISSN: 0024-4066

hal-01032422
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032422
DOI : 10.1111/j.1095-8312.2012.01871.x

Éditeur(s) : HAL CCSD Public Library of Science
Résumé : International audience
Growth charts are an essential clinical tool for evaluating a child's health and development. The current French reference curves, published in 1979, have recently been challenged by the 2006 World Health Organization (WHO) growth charts. To evaluate and compare the growth of French children who were born between 1981 and 2007, with the WHO growth charts and the French reference curves currently used. Anthropometric measurements from French children, who participated in 12 studies, were analyzed: 82,151 measurements were available for 27,257 children in different age groups, from birth to 18 years. We calculated and graphically compared mean z-scores based on the WHO and French curves, for height, weight and Body Mass Index (BMI) according to age and sex. The prevalence of overweight using the WHO, the French and International Obesity Task Force definitions were compared. Our population of children was on average 0.5 standard deviations taller than the French reference population, from the first month of life until puberty age. Mean z-scores for height, weight and BMI were closer to zero based on the WHO growth charts than on the French references from infancy until late adolescence, except during the first six months. These differences not related to breastfeeding rates. As expected, the prevalence of overweight depended on the reference used, and differences varied according to age. The WHO growth charts may be appropriate for monitoring growth of French children, as the growth patterns in our large population of French children were closer to the WHO growth charts than to the French reference curves, from 6 months onwards. However, there were some limitations in the use of these WHO growth charts, and further investigation is needed.
ISSN: 1932-6203

hal-01134193
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01134193
DOI : 10.1371/journal.pone.0120806
PUBMED : 25761138
PUBMEDCENTRAL : PMC4356547

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley
Résumé : International audience
Well-designed and effectively managed networks of marine reserves can be effective tools for both fisheries management and biodiversity conservation. Connectivity, the demographic linking of local populations through the dispersal of individuals as larvae, juveniles or adults, is a key ecological factor to consider in marine reserve design, since it has important implications for the persistence of metapopulations and their recovery from disturbance. For marine reserves to protect biodiversity and enhance populations of species in fished areas, they must be able to sustain focal species (particularly fishery species) within their boundaries, and be spaced such that they can function as mutually replenishing networks whilst providing recruitment subsidies to fished areas. Thus the configuration (size, spacing and location) of individual reserves within a network should be informed by larval dispersal and movement patterns of the species for which protection is required. In the past, empirical data regarding larval dispersal and movement patterns of adults and juveniles of many tropical marine species have been unavailable or inaccessible to practitioners responsible for marine reserve design. Recent empirical studies using new technologies have also provided fresh insights into movement patterns of many species and redefined our understanding of connectivity among populations through larval dispersal. Our review of movement patterns of 34 families (210 species) of coral reef fishes demonstrates that movement patterns (home ranges, ontogenetic shifts and spawning migrations) vary among and within species, and are influenced by a range of factors (e.g. size, sex, behaviour, density, habitat characteristics, season, tide and time of day). Some species move <0.1–0.5 km (e.g. damselfishes, butterflyfishes and angelfishes), <0.5–3 km (e.g. most parrotfishes, goatfishes and surgeonfishes) or 3–10 km (e.g. large parrotfishes and wrasses), while others move tens to hundreds (e.g. some groupers, emperors, snappers and jacks) or thousands of kilometres (e.g. some sharks and tuna). Larval dispersal distances tend to be <5–15 km, and self-recruitment is common. Synthesising this information allows us, for the first time, to provide species, specific advice on the size, spacing and location of marine reserves in tropical marine ecosystems to maximise benefits for conservation and fisheries management for a range of taxa. We recommend that: (i) marine reserves should be more than twice the size of the home range of focal species (in all directions), thus marine reserves of various sizes will be required depending on which species require protection, how far they move, and if other effective protection is in place outside reserves; (ii) reserve spacing should be <15 km, with smaller reserves spaced more closely; and (iii) marine reserves should include habitats that are critical to the life history of focal species (e.g. home ranges, nursery grounds, migration corridors and spawning aggregations), and be located to accommodate movement patterns among these. We also provide practical advice for practitioners on how to use this information to design, evaluate and monitor the effectiveness of marine reserve networks within broader ecological, socioeconomic and management contexts.
ISSN: 1464-7931

Droits : http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/
hal-01334353
https://hal-univ-perp.archives-ouvertes.fr/hal-01334353
https://hal-univ-perp.archives-ouvertes.fr/hal-01334353/document
https://hal-univ-perp.archives-ouvertes.fr/hal-01334353/file/Green_et_al-2015-Biological_Reviews.pdf
DOI : 10.1111/brv.12155