Résumé : Monitoring n°28 of the Paluel nuclear power plant takes into account studies conducted between March and September 2005. Impacts on hydrology, microbiology, phytoplankton, zooplankton, fisheries, intertidal phytobenthos and zoobenthos are reported. This power plant has been in operation for twenty two years.
L'étude n°28 du site électronucléaire de Paluel (département de la Seine-Maritime) concerne l'année 2005. Sont étudiés les domaines benthique, halieutique et pélagique. L'année 2005 est la 22ème année de fonctionnement de la Centrale.

Droits : 2006 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/rapport-3814.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3814/

Résumé : La taxonomie des huîtres est longtemps restée basée sur des critères morphologiques tel que la coquille et les organes internes ou sur la répartition géographique. Ces critères se révèlent aujourd'hui peut fiable du fait de la grande plasticité des caractères morphologiques des huîtres en fonction des conditions environnementales, et du transport d'espèce par l'ostréiculture ou accidentellement. La biologie moléculaire et en particulier les marqueurs génétiques sont des outils très utiles pour différencier les espèces. La phylogéographie des huîtres creuses de l'Atlantique Sud a ainsi été étudié grâce à différentes méthodes d'observation du polymorphisme de l'ADN. Ces techniques ont dans un premier temps été appliquées à des fragments mitochondriaux (16S) pui à des fragments nucléaires (ITS). La PCR6RFLP a été utilisée d'une part sur les fragments 16S pour déterminer les haplotypes de 5 nouvelles populations du genre Crassostrea provenant du Sénégal, du Nigeria et du Brésil. Il a été ainsi possible d'identifier une nouvelle population de Crassostrea gasar en Amérique du Sud. Nous nous sommes ensuite intéressés aux polymorphisme pouvant exister entre les différentes populations de C. gasar de part et d'autre de l'Atlantique. Pour cela des fragments nucléaires ITS, à priori plus polymorphes que les fragments mitochondriaux 16S ont été étudiés. Différentes mises au point ont été réalisées afin de révéler un éventuel polymorphisme entre les populations. Toutes les informations recueuillies tendent vers cette hypothèse sans toutefois pouvoir la confirmer. La présence d'une zone de sympatrie entre les espèces C. gasar en Amérique du Sud poste la question de son introduction, soit par l'homme soit accidentellement. Des études complèmenaires sont indispensables, par un échantillonnage plus large, pour évaluer l'étendue de la présence des espèces de part et d'autre de l'océan. Il est également nécessaire de continuer la mise au point sur les marqueurs nucléaires afin de confirmer le polymorphisme suspecté entre les populations C. gasar d'Afrique et d'Amérique. La publication récente d'un article séparant les espèces C. brasiliana et C. rhizophorae pose également la question de la position de C. brasiliana par rapport aux deux espèces que nous avons étudié.

Droits : 2000 Univ. La Rochelle
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14409/11706.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14409/

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Diffusion parameters for HTO, 36Cl−, and 125I− were determined on Upper Toarcian argillite samples from the Tournemire Underground Research Laboratory (Aveyron, France) using the through diffusion technique. The direction of diffusion was parallel to the bedding plane. The purpose of the present study was 3-fold; it was intended (i) to confirm the I− interaction with Upper Toarcian argillite and to verify the effects of initial I− concentration on this affinity, as previously observed by means of radial diffusion experiments, (ii) to highlight any discrepancy between Cl− and I− diffusivity, and (iii) to investigate the effect of an increase of the ionic strength of the solution on the anionic tracers' diffusive behaviour. The results show that the effective diffusion coefficient (De) and diffusion accessible porosity (εa) values obtained with an ionic strength (I.S.) synthetic pore water of 0.01 eq L−1 are: De = 2.35-2.50 × 10−11 m2 s−1 and εa = 12.0-15.0% for HTO, and De = 14.5-15.5 × 10−13 m2 s−1 and εa = 2.5-2.9% for 36Cl−. Because of anionic exclusion effects, anions diffuse slower and exhibit smaller diffusion accessible porosities than HTO, taken as a water tracer. The associated effective diffusion coefficient (De) and rock capacity factor (α) obtained for 125I are: De = 7.00-8.60 × 10−13 m2 s−1 and α = 4.3-7.2%. Such values make it possible to calculate low 125I distribution ratios (0.0057 < RD < 0.0192 mL g−1) which confirm the trend indicating that the 125I rock capacity factor increases with the decrease of the initial I− concentration. Additional through-diffusion experiments were carried out with a higher ionic strength synthetic pore water (I.S. = 0.11 eq L−1). No evolution of HTO diffusion parameters was observed. The anionic tracers' effective diffusion coefficient increased by a factor of two but no clear evolution of their accessible porosity was observed. Such a paradox could be related to the particularly small mean pore size of the Upper Toarcian argillite of Tournemire. The most significant finding of this study is the large discrepancy (factor of two) between the values of the effective diffusion coefficient for 125I and 36Cl. Whatever the ionic strength of the synthetic solution used, 125I exhibited De values two times lower than those of 36Cl. A detailed explanation for this difference cannot be given at present even if a hypothesis based on ion-pairing or on steric-exclusion cannot be excluded. This makes questionable the assumption usually made for quantifying 125I sorption and postulating that 36Cl and 125I would diffuse in the same porosity. In other terms, at Tournemire, 125I sorption could be more pronounced than previously indicated.
ISSN: 0883-2927

hal-00757749
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00757749
DOI : 10.1016/j.apgeochem.2011.12.017

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
BACKGROUND: Thrombophilias are common disorders that increase the risk of pregnancy-associated venous thromboembolism and pregnancy loss and can also increase the risk of placenta-mediated pregnancy complications (severe pre-eclampsia, small-for-gestational-age infants, and placental abruption). We postulated that antepartum dalteparin would reduce these complications in pregnant women with thrombophilia. METHODS: In this open-label randomised trial undertaken in 36 tertiary care centres in five countries, we enrolled consenting pregnant women with thrombophilia at increased risk of venous thromboembolism or with previous placenta-mediated pregnancy complications. Eligible participants were randomly allocated in a 1:1 ratio to either antepartum prophylactic dose dalteparin (5000 international units once daily up to 20 weeks' gestation, and twice daily thereafter until at least 37 weeks' gestation) or to no antepartum dalteparin (control group). Randomisation was done by a web-based randomisation system, and was stratified by country and gestational age at randomisation day with a permuted block design (block sizes 4 and 8). At randomisation, site pharmacists (or delegates) received a randomisation number and treatment allocation (by fax and/or e-mail) from the central web randomisation system and then dispensed study drug to the local coordinator. Patients and study personnel were not masked to treatment assignment, but the outcome adjudicators were masked. The primary composite outcome was independently adjudicated severe or early-onset pre-eclampsia, small-for-gestational-age infant (birthweight <10th percentile), pregnancy loss, or venous thromboembolism. We did intention-to-treat and on-treatment analyses. This trial is registered with ClinicalTrials.gov, number NCT00967382, and with Current Controlled Trials, number ISRCTN87441504. FINDINGS: Between Feb 28, 2000, and Sept 14, 2012, 292 women consented to participate and were randomly assigned to the two groups. Three women were excluded after randomisation because of ineligibility (two in the antepartum dalteparin group and one in the control group), leaving 146 women assigned to antepartum dalteparin and 143 assigned to no antepartum dalteparin. Some patients crossed over to the other group during treatment, and therefore for on-treatment and safety analysis there were 143 patients in the dalteparin group and 141 in the no dalteparin group. Dalteparin did not reduce the incidence of the primary composite outcome in both intention-to-treat analysis (dalteparin 25/146 [17.1%; 95% CI 11.4-24.2%] vs no dalteparin 27/143 [18.9%; 95% CI 12.8-26.3%]; risk difference -1.8% [95% CI -10.6% to 7.1%)) and on-treatment analysis (dalteparin 28/143 [19.6%] vs no dalteparin 24/141 [17.0%]; risk difference +2.6% [95% CI -6.4 to 11.6%]). In safety analysis, the occurrence of major bleeding did not differ between the two groups. However, minor bleeding was more common in the dalteparin group (28/143 [19.6%]) than in the no dalteparin group (13/141 [9.2%]; risk difference 10.4%, 95% CI 2.3-18.4; p=0.01). INTERPRETATION: Antepartum prophylactic dalteparin does not reduce the occurrence of venous thromboembolism, pregnancy loss, or placenta-mediated pregnancy complications in pregnant women with thrombophilia at high risk of these complications and is associated with an increased risk of minor bleeding. FUNDING: Canadian Institutes of Health Research, Heart and Stroke Foundation of Canada, and Pharmacia and UpJohn.
ISSN: 0923-7577

hal-01258557
http://hal.univ-brest.fr/hal-01258557
DOI : 10.1016/S0140-6736(14)60793-5
PUBMED : 25066248

Résumé : Monitoring n°27 of the Paluel nuclear power plant takes into account studies conducted between March and September 2004. Impacts on hydrology, Microbiology, phytoplankton, zooplankton, fisheries, intertidal phytobenthos and zoobenthos are reported. This power plant has been in operation for twenty years.
L'étude n°27 du site électronucléaire de Paluel (département de la Seine-Maritime) concerne l'année 2004. Sont étudiés les domaines benthique, halieutique et pélagique. L'année 2004 est la 21ème année de fonctionnement de la Centrale.

Droits : 2005 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/rapport-1026.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1026/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé :  Diffusion du document : INRA Antilles-Guyane, UMR ECOFOG, F97387 Kourou, Guyane (France)Diplôme : Master Recherche
il s'agit d'un type de produit dont les métadonnées ne correspondent pas aux métadonnées attendues dans les autres types de produit : DISSERTATION
Origin and maintenance of species diversity is one of the main questions in evolutive biology. Species complexes, ie sister species still exchanging genes, are common in tropical forests and contribute to this diversity. This poster describes the organization of the genetic diversity in two closely related tree species, Carapa guianensis and C. procera, which are in sympatry in French Guiana. By using a clustering method based on nuclear markers (Pritchard et al. 2000), 506 trees sampled in French Guiana have been assigned to a species. Interestingly, many individuals harbored intermediate genome and we assigned to an hybrid group. The geographic distribution of these individuals revealed the presence of a contact zone between the two carapa species in the Eastern part of French Guiana. We then analysed genetic diversity at cholroplast genome and revealed a symmetrical gene flow between the two sister species. In addition, hybridization between hybrids and parental species ar likely possible but still need validations thanks to control crosses. Within species, we finally revealed the presence of a departure from the neutral equilibrium in thedirection of a population expansion likely related to Holocene perturbations. This expansion may have contributed to the hybrid zone formation in French Guiana.
L'origine et le maintien de la diversité spécifique des forêts tropicales humides est une question clé en biologie évolutive. Ce travail contribue à améliorer la compréhension de ces mécanismes à travers l'étude de la distribution de la diversité génétique de deux espèces sœurs interfertiles, le Carapa procera et C. guianensis en Guyane. L'assignation botanique des arbres échantillonnés (506) a été effectuée en adoptant une approche moléculaire qui repose sur l'analyse de la répartition des fréquences alléliques de six microsatellites nucléaires (Pritchard et al. 2000). Chaque locus présente des allèles dont les différences de fréquences entre espèces sont importantes, permettant ainsi d'envisager des outils simples de reconnaissances pour ces espèces difficilement identifiables sur la seule base de leurs caractères phénotypiques. Une zone de contact des deux espèces où les phénomènes d'hybridations sont fréquents a par ailleurs été localisée. En associant une analyse de la diversité au niveau du génome chloroplastique sur un sous ensemble d'individus (244), j'ai pu montrer que l'introgression est bidirectionnelle et que les backcross sont possibles. Les flux de gènes entre les deux espèces sont fréquents, et à l'intérieur des espèces, les populations sont peu structurées bien que la différenciation soit significative entre les sites les plus éloignés. Enfin, ce travail met en évidence que les populations de chacune des deux espèces présentent un signal d'expansion de population, avec un signal plus fort pour le C. procera, qui laisse présager une expansion récente, vraisemblablement à l'origine de la zone de contact. L'impact des évènements climatiques et/ou des activités amérindiennes des 10 000 dernières années pourrait expliquer la restriction puis l'expansion de ce genre post pionnier.
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189488

hal-01189488
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189488
PRODINRA : 42333

Résumé : Monitoring n°25 of the Paluel nuclear power plant takes into account studies conducted between March and September 2002. Impacts on hydrology, microbiology, phytoplankton, zooplankton, fisheries, intertidal phytobenthos and zoobenthos are reported. This power plant has been in operation for nineteen years.
L'étude de surveillance n°25 du site électronucléaire de Paluel (département de la Seine-Maritime) concerne l'année 2002. Sont étudiés les domaines benthique, halieutique et pélagique. L'année 2002 est la 19ème année de fonctionnement de la Centrale.

Droits : 2003 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/rapport-1025.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1025/

Résumé : Monitoring n°26 of the Paluel nuclear power plant takes into account studies conducted between March and September 2003. Impacts on hydrology, microbiology, phytoplankton, zooplankton, fisheries, intertidal phytobenthos and zoobenthos are reported. This power plant has been in operation for twenty years.
L'étude de surveillance n°26 du site électronucléaire de Paluel (département de la Seine-Maritime) concerne l'année 2003. Sont étudiés les domaines benthique, halieutique et pélagique. L'année 2003 est la 20ème année de fonctionnement de la Centrale.

Droits : 2004 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/2004/rapport-1029.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1029/

Résumé : Monitoring n° 18 of PENLY nuclear power - plant takes in account studies between March and September 2004. Hydrology, microbiology, phytoplankton, zooplankton and fishing are studied. his power-plant has been in opération for fifteen years.
La surveillance n° 18 sur le site de PENLY couvre la période de mars à septembre 2004. Les domaines étudiés sont l'hydrologie, la microbiologie, le plancton végétal et animal et le domaine halieutique. L'année 2004 est la quinzième année de fonctionnement de la centrale.

Droits : 2005 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/rapport-1030.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1030/

Résumé : Monitoring n° 24 of the Flamanville nuclear power plant takes into account studies conducted between March and September 2006. Impacts on hydrology, microbiology, phytoplankton, zooplankton, fisheries, intertidal phytobenthos and zoobenthos are reported. This power plant has been in operation for twenty-one years.
L’étude de surveillance n° 24 du site électronucléaire de Flamanville (département de la Manche) concerne l’année 2006. Sont étudiés les domaines benthique, halieutique et pélagique. L’année 2006 est la 21è année de fonctionnement de la Centrale de Flamanville.

Droits : 2007 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00005/11639/8297.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00005/11639/

Résumé : Monitoring n°21 of the Flamanville nuclear power plant takes into account studies conducted between March and September 2003. Impacts on hydrology, microbiology, phytoplankton, zooplankton, fisheries, intertidal phytobenthos and zoobenthos are reported. This power plant has been in operation for eighteen years.
L'étude de surveillance n°21 du site électronucléaire de Flamanville (département de la Manche) concerne l'année 2003. Sont étudiés les domaines benthique, halieutique et pélagique. L'année 2003 est la 18è année de fonctionnement de la Centrale.

Droits : 2004 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00002/11363/7936.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00002/11363/

Résumé : Monitoring n°29 of the Paluel nuclear power plant takes into account studies conducted between March and September 2006. Impacts on hydrology, microbiology, phytoplankton, zooplankton, fisheries, intertidal phytobenthos and zoobenthos are reported. This power plant has been in operation for twenty three years.
L'étude n°29 du site électronucléaire de Paluel (département de la Seine-Maritime) concerne l'année 2006. Sont étudiés les domaines benthique, halieutique et pélagique. L'année 2006 est la 23ème année de fonctionnement de la Centrale.

Droits : 2007 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/rapport-3815.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3815/

Résumé : Depuis les années soixante-dix, l’Ifremer réalise les suivis écologique et halieutique des centrales nucléaires implantées sur le littoral maritime, tel que définis dans les arrêtés interministériels. Des changements dans les stratégies de suivi ont été déjà mis en place au moment du passage de la phase de projet à celle de la surveillance, ainsi que dans les années 90, suite à une réflexion sur la pertinence des stratégies qui comptaient déjà une dizaine d’années. La demande EDF d’installer une nouvelle tranche de production à Flamanville mène à demander un changement dans l’arrêté actuel de rejets. Une étude rétrospective des résultats obtenus et de l’évolution du milieu nous permettra de statuer sur le bien-fondé des stratégies actuelles et de les adapter le cas échéant. Le tableau 1 présente une synthèse des paramètres suivis en 2006 en accord avec les arrêtés de rejets thermiques et chlorés. Un tableau de synthèse, réunissant l’ensemble des changements préconisés est présenté à la fin de ce document en annexe.

Droits : 2007 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00004/11501/8071.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00004/11501/

Résumé : Le genre Crassostrea regroupe de nombreuses espèces dont la répartition mondiale s'étend sur une grande partie des régions côtières des basses et moyennes latitudes. La classification des différentes espèces décrites à partir des critères morphologiques et de répartition géographique est aujourd'hui remise en cause dans de nombreux cas par les nouvelles études utilisent les techniques récentes de biologie moléculaire. C'est en particulier grâce à l'apport des séquences génomiques variables, qu'il a été possible de déterminer différentes espèces présentes sur les côtes africaines et américaines (Lapègue & al.). La présence de l'espèce C. gasar, d'abord décrite en Afrique, a ainsi été montré en Amérique. La répartition de cette espèce sur les deux continents laisse supposer que les barrières géographiques on induit une limitation des flux géniques et donc permis une divergence génétique des populations. Pour confirmer cette hypothèse une étude génétique des populations sur 3 populations de chaque continent a donc été réalisée. Elle s'est basée sur le marqueur nucléaire ITS2, séquence non transcrite et variable du génome nucléaire. Il a donc été possible, grâce aux techniques de RFLP (restriction fragments length polymorphisme) de démontrer une forte différenciation génétique entre les deux continents. Cependant le séquençage montre une divergence nucléotidique faible (3%). Ceci laisse supposer qu'il n'y a pas de flux génique entre les deux continents, et que les populations ont divergé récemment. De plus, le polymorphisme intracontinental observé uniquement en Afrique nous laisse supposer les populations américaines seraient originaires d'Afrique. La mise au point du séquençage et la lecture de deux séquences pour des individus de chaque continent a de plus permis de sélectionner de nouvelles enzymes de restriction utilisable en RFLP pour poursuivre l'étude du polymorphisme entre les populations.

Droits : 2001 Univ. La Rochelle, Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14407/11700.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14407/

Éditeur(s) : Université de Tours
Résumé : L 'huître creuse japonaise Crassostrea gigas et portugaise C. angulata ont été respectivement décrites par Thunberg (1793) et Lamarck (1819). Mais les similitudes morphologiques et l 'homogénéité des fréquences allozymiques entre populations ont conduit de nombreux auteurs à proposer l'existence d'une seule et mênle espèce. L'analyse récente d'un gène mitochondrial a pennis de déterminer l'origine asiatique de C. angulata, soulignant l'intérêt de l'étude de la différenciation génétique et phénotypique entre les deux taxons. La notion biologique d'espèce a tout d'abord été examinée. Des croisements de 1ère et 2ème génération ont montré la viabilité et fertilité des hybrides. L'analyse de la compétition spennatique par marqueurs microsatellites ne montre pas d'isolement reproductif, mênle partiel et le séquençage du fragment ITS 1 confirme la forte proximité génétique des deux taxons. Les patrons de différenciation génétique observés par marqueurs microsatellites et mitochondriaux apparaissent sitnilaires. L'origine asiatique de C. angulata est donc confinnée. Le fort niveau de polymorphisme des marqueurs microsatellites explique partiellement les plus faibles valeurs observées de différenciation. Une bimodalité des tailles d'allèles microsatellites entre taxons a pennis le développement d'un nouveau marqueur nucléaire, mettant en évidence des phénomènes d'hybridation naturelle dans la zone du sud de l'Europe où l'activité ostréicole met aujourd'hui les 2 taxons en contact. L'étude de caractères phénotypiques a été réalisée en milieu naturel et contrôlé sur des descendances d'écloserie. Les résultats montrent une meilleure croissance de C. gigas et une période de reproduction plus longue chez C. angulata. Des mesures physiologiques montrent un plus fort taux de respiration du naissain C. gigas, ainsi qu'un temps de filtration supérieur chez les adultes. La différence de croissance entre taxons pourraient donc être expliquée par le temps de filtration et l'effort de reproduction.

Droits : Université de Tours, The author
http://archimer.ifremer.fr/doc/00034/14564/11867.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00034/14564/

Résumé : Les bactéries appartenant au genre Vibrio sont largement répandues en milieu côtier tropical et tempéré. Certaines espèces sont pathogènes pour l'homme, comme Vibrio cholerae 01 et 0139 responsables du choléra, ou V. cholerae non-01/non-0139, V. parahaemolyticus et V. vulnificus impliqués dans de nombreuses pathologies (gastro-entérites, des septicémies et autres infections). En France, le risque associé à la présence de vibrions en milieu marin est mal évalué. Ce rapport fait le bilan des données disponibles sur la contamination littorale et les infections à vibrions en France. Une large place a été consacrée aux études écologiques, réalisées sur les sites d'implantation des centrales nucléaires sur le littoral français. Dans la population, le nombre d'infections est restreint car seules les pathologies graves sont recensées. Il s'agit de cas isolés, le plus souvent immuno-déprimés, enregistrés en été et en automne. Le milieu marin (par contact, baignade ou consommation de produits de la mer) est très souvent cité comme source probable de la contamination. Un petit nombre d'espèces de vibrions est concerné (V. alginolyticus, V. vulnificus, V. parahaemolyticus, V. cholerae non-01/non-0139 et V. hollisae). Dans l'environnement marin, l'espèce dominante est V. alginolyticus ; V. vulnificus et V. parahaemolyticus sont détectés sporadiquement. Le suivi, pendant plus de dix ans, des effets d'un réchauffement artificiel des eaux littorales à Gravelines a souligné des modifications sur les populations de Vibrio marins (présence des Vibrio en hiver, augmentation de la densité bactérienne et de la diversité spécifique). Le développement de techniques de biologie moléculaire devrait permettre une meilleure évaluation du risque sanitaire en quantifiant et en caractérisant les vibrions présents en milieu côtier (stade viable non cultivable, maintien du pouvoir pathogène et virulence des souches présentes).

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00104/21545/19124.pdf
DOI:Ifremer 2002
http://archimer.ifremer.fr/doc/00104/21545/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Diplôme : DEA
il s'agit d'un type de produit dont les métadonnées ne correspondent pas aux métadonnées attendues dans les autres types de produit : DISSERTATION
absent
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189541

hal-01189541
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189541
PRODINRA : 46419

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Designing biodiversity conservation plans requires knowledge on the biogeographic distribution of taxabut also accurate estimates of species richness and diversification processes. However, measuring the phyleticrichness can be biased by the use of inappropriate taxonomical characters, leading to erroneous speciesdelimitation and diversity estimates.This work explores the phyletic richness at several taxonomic levels (generic, specific and intraspecific) ofthe hydrozoan family Aglaopheniidae (Marktanner-Turneretscher, 1890), with a particular focus on the South-Western Indian Ocean. Firstly, using several newly constructed phylogenies based on mitochondrial andnuclear markers, this study reveals that the phyletic diversity of this family is at underestimated by at least 50%:all studied genera are polyphyletic or with doubtful monophyletic status. Then, using several speciesdelimitation methods based on molecular markers, it sheds light on the richness of cryptic diversity of thisfamily, enlightening the potential of using an integrative taxonomic approach on these morphologically simpleorganisms. Finally, the population genetics of an Aglaopheniidae brooding species shows a high populationsstructuring with pervasive pattern of isolation by distance at several geographic scales (several to thousands ofkilometres), implying a potentially high cryptic diversity existing in this family.The results of this work provide new insights on Aglaopheniidae diversity, underlining the potentialinfluence of reproductive mode on the phyletic diversity and diversification processes of brooding hydrozoanbrooders. This thesis further highlights the relevance of using several complementary
La conservation et la gestion sur le long terme de la biodiversité nécessitent une connaissance de larépartition des taxons, mais également une estimation précise de leur diversité spécifique ainsi que desprocessus de spéciation ayant permis leur formation. Cependant, la mesure de la richesse phylétique peut êtrebiaisée par l’utilisation de caractères taxinomiques ne permettant pas de délimiter les espèces de manièreappropriée.Ce travail de thèse propose d’explorer la diversité phylétique à plusieurs niveaux taxinomiques(générique, spécifique et intra-spécifique) des Aglaopheniidae, une famille d’hydrozoaires, notamment présentedans le Sud-Ouest de l’océan Indien. Dans un premier temps, en utilisant des phylogénies basées sur plusieursmarqueurs (mitochondriaux et nucléaires), ce travail démontre que la diversité phylétique de cette famille est,au minimum, sous-estimée de moitié: tous les genres de la famille sont polyphyléthiques ou présentent un statutmonophylétique restant à confirmer. Dans un deuxième temps, l’utilisation de méthodes de délimitationd’espèces basées sur des données moléculaires met en évidence la diversité cryptique très élevée des morphoespècesétudiées, révélant l’intérêt potentiel des protocoles de taxinomie intégrative chez les organismesmorphologiquement simples. Enfin, l’étude de génétique des populations d’une espèce incubatriced’Aglaopheniidae révèle l’importance de la structuration des populations et de l’isolement par la distance chezcette espèce à plusieurs échelles géographiques (de quelques kilomètres à plusieurs milliers), impliquant unepotentielle diversité cryptique extrêmement élevée chez cette famille.L’ensemble des connaissances acquises lors de ce travail de thèse fournit un nouveau regard sur ladiversité de la famille des Aglaopheniidae, soulignant le potentiel impact du cycle de reproduction sur ladiversité phylétique et les processus de spéciation des hydrozoaires incubateurs. Cette thèse met en évidence lapertinence de l’utilisation de plusieurs procédures complémentaires de délimitation d’espèces pour étudier ladiversité des organismes morphologiquement simples.
https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01359424

tel-01359424
https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01359424
https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01359424/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01359424/file/These%20manuscrit%20final.pdf

Résumé : Monitoring n°22 of the Flamanville nuclear power plant takes into account studies conducted between March and September 2004. Impacts on hydrology, microbiology, phytoplankton, zooplankton, fisheries, intertidal phytobenthos and zoobenthos are reported. This power plant has been in operation for nineteen years.
L'étude de surveillance n°22 du site électronucléaire de Flamanville (département de la Manche) concerne l'année 2004. Sont étudiés les domaines benthique, halieutique et pélagique. L'année 2004 est la 19ème année de fonctionnement de la Centrale.

Droits : 2005 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/rapport-1028.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1028/

Résumé : Monitoring n°20 of the Flamanville nuclear power plant takes into account studies conducted between March and September 2002. Impacts on hydrology, microbiology, phytoplankton, zooplankton, fisheries, intertidal phytobenthos and zoobenthos are reported. This power plant has been in operation for seventeen years.
L 'étude de surveillance n°20 du site électronucléaire de Flamanville (département de la Manche) concerne l'année 2002. Sont étudiés les domaines benthique, halieutique et pélagique. L'année 2002 est la 17éme année de fonctionnement de la Centrale.

Droits : 2003 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00002/11362/7935.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00002/11362/