Résumé : After a period of rapid development of the sites (an increase in both reared surface area and production), tropical shrimp aquaculture is currently being faced with critical problems due to economical and ecological constraints. In many countries with favourable conditions for shrimp aquaculture such as indonesia or Vietnam, sites are often badly selected and/or over-exploited. This conducts to sorne extent to decreases or collapses in the production due to the difficulty in predicting the maximum production capacity of the sites. Furthermore, it appears that production sustainability depends on many factors among which socio-economy and ecolo gy are of prime importance. The STD3 project titled « Assessment of tropical shrimp aquaculture impact on the environment in tropical countries using hydrobiology, ecology and remote sensing as helping tools for diagnosis )) was initiated in 1994, with the aim to study the sustainability of marine shrimp aquaculture in tropical areas, main! y Indonesia and Vietnam, through the following tasks: (i) improve site selection and study the impact of aquaculture on marine environments presenting a variable sensitivity to organic sewage, (ii) analyse the socio-economical aspects and profitability of the aquaculture industry and of common resources (iii) use remote sensing and geographical data bases for diagnosis and monitoring of site degradation (iv) reinforce the capacity of Asian scientists through training. Severa! aquaculture sites have been investigated in the Lampung region (South Sumatra, Indonesia), the Mekong delta (Vietnam) and on the West coast of New-Caledonia, providing a large range of typical ecosystems encountered in Asia and in the Pacifie, from coralline sites to coastal plains with mangrove and deltaic areas. The study concerned the spatial structure and seasonal influence of these ecosystems, the temporal variation during the course of the project (3 years) and the relation between the ecological structure and farm productions. Remote sensing provides a synoptic vision over large land expanses. Severa! scenes were processed for landuse mapping using conventional classification techniques. Concerning water quality assessment, a general relation for the Java sea was found between image and field data in terms of total suspended matter. Applying this relation to a new site in Sumatra has provided an initial approach to water type and, together with land use mapping, a preliminary assessment of the suitability of the area to shrimp aquaculture development. Socio-economic research has been focused on the identification ofneeds for collective action, including public policy, in the perspective of shrimp farming sustainability. The main concern is in the regulation of shrimp farming intensification and extensification at the scale of coastal ecosystemic entities in a common property resource management perspective. The common considered here is coastal water quality. Comparing the local development profiles and the institutional grounds for the design and implementation of collective management rules shows that variables such as land tenure system, farm owner socio-economic profile, social homogeneity or heterogeneity of the farmers are key factors to analyse the potential for sustainability. The defmition of water quality and the possible means to ensure its collective management are discussed. The main conclusion is that the economie incentives to farming development are strong but there is no significant difference among traditional, semi-intensive and intensive systems in terms of economie efficiency or wealth distribution. The description of the functioning of the different kinds of ecosystems make it possible to give an advice concerning the positioning of the activity inside the ecosystem, and furthermore to have a reference state in order to determine the impact of the activity on the coastal environnement. This impact can be summarized as an increase in the concentration of total suspended matt€?r, of particulate organic matter and of sulfate reducing bacterias. This organic ma~.er is either issued from rearing activities or from telluric origine, due to mangrove eradication when building the ponds. An evaluation of the relationship existing between productivity and characteristics of each ecosystem bas been conducted by correlating ecological indicators data (concentration of total suspended matter, particulate organic matter, chlorophyll, percentage of pheopigments in total pigments and cyanobacteria and sulfatereducing bacteria in water and sediments) with the average production of the farms. This comparison lead to the compilation of a scale of observed production integrating the range of these environmental parameters with shrimp production levels, bound to facilitate the positioning of shrimp farming in relation with the confmement leve! of each ecosystem. Lastly, ali geographie data originated from the various compartments of the study have been geo-referenced and loaded into a geographical information system. This allows to display any query made on spatial variables and their related statistical data, including the ir variations over the last few years and to reveal patterns and phenomena otherwise not obvious.
Le programme mis en oeuvre par la DRV (Paris, CREMA-L'Houmeau, DELIAO Brest, COP Tahiti, GIE/RA Nouvelle Calédonie), dans le cadre d'un projet européen STD3 «(Sciences et Technique au Service du Développement», en collaboration avec l'Université de Montpellier II, l'Ecole Nationale d'Agronomie de Rennes, l'ITC (Hollande), l'Institut Océanographique de Nha Trang (Vietnam), le BADC de Jepara et le BPPT de Jakarta (Indonésie), avait pour but la mise au point de méthodes permettant d'améliorer la sélection des sites ainsi que le suivi du développement et de l'impact de l'aquaculture des crevettes Péneides en milieu tropical pour éviter la surexploitation. Quatre axes de recherche ont été défmis : a) identifier la nature et quantifier les rejets de déchets issus de ce type d'aquaculture, b) définir les caractéristiques écologiques des écosystèmes susceptibles d'accueillir l'activité aquacole et suivre leur évolution sous l'influence des rejets, c) déterminer l'influence de la gestion des fermes et des ressources (aspects économiques) sur les performances de productivité, d) déterminer la capacité de la télédétection comme outil de diagnostic d'impact à l'échelle de la région, e) mener un programme de formation d'étudiants et jeunes chercheurs Vietnamiens et Indonésiens.

Droits : 1998 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00132/24357/22357.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00132/24357/

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : Cet article présente une évaluation des bénéfices de la protection par le Conservatoire du littoral et ses partenaires des mangroves de Guyane, Guadeloupe, Martinique, Mayotte et Saint-Martin. Il détaille l’évaluation des services écosystémiques des mangroves sur ces territoires, puis développe des projections pour l’évolution de leurs surfaces en présence ou en absence de protection par le Conservatoire du littoral et ses partenaires. Évaluation et projections ont permis d’estimer les conséquences économiques de cette protection sur 25 ans. Les bénéfices calculés de cette protection sont compris entre 33 000 €/ha et 51 000 €/ha pour les mangroves soumises à des pressions anthropiques importantes. Le maintien des services de régulation correspond à 90 % de cette valeur, surtout pour la capacité des mangroves à épurer les eaux continentales, à protéger et stabiliser la côte et à participer à la régulation du climat global en séquestrant du carbone. Ces résultats objectivent la place des mangroves dans l’économie locale du littoral outre-mer et offrent un plaidoyer pour l’acquisition et la protection des espaces les plus vulnérables par le Conservatoire du littoral et ses partenaires. Les limites inhérentes aux méthodologies utilisées s’appliquent ici : ces évaluations permettent de capter les valeurs d’usage des écosystèmes, mais ne prennent pas en compte la totalité des valeurs de biodiversité, telles que les valeurs de non-usage ou les aspects liés aux espèces remarquables des mangroves. Toutefois, les résultats de ce travail permettent de donner des estimations réalistes à considérer comme des bornes inférieures de la valeur totale des écosystèmes et de leur protection.
This article presents a valuation of the benefits brought by the protection of mangroves from the Conservatoire du littoral and its partners in French Guiana, Guadeloupe, Martinique, Mayotte and Saint Martin. We detail a contextualized mangroves’ ecosystem services valuation, then develop projections regarding the evolution of their surfaces whether they are protected or not. It was then possible to estimate the economic impacts of 25 years of mangroves protection. When human pressure is high, those benefits range from 33 000 €/ha to 51 000 €/ha. About 90% of this value is due to the conservation of regulating services, such as water treatment capacity, coastal protection and global climate mitigation through carbon sequestration. Our results objectify the importance of mangrove ecosystems in oversea coastal territories’ local economy, and provide advocacy and guidance for the protection strategy of the Conservatoire du littoral and its partners. The methodology we used has inherent limitations one should consider: the ecosystem services valuation focuses on use values and excludes most non-use or intrinsic values, which could also be important for mangroves regarding their remarkable biodiversity. However, our results supply a realistic valuation to be understood as a lower boundary for the total value of oversea mangroves and for the benefits of their protection.
Guadeloupe
Guyane française
Martinique
Mayotte
Saint-Martin

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.10485
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/10485

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : La Martinique possède 55 km2 de récifs coralliens, 50 d’herbiers et 20 de mangroves. Ces trois écosystèmes produisent des biens et services dont la valeur est estimée à quelque 250 millions d’euros par an. Près de 60 % de cette valeur est issue des usages directs liés aux activités récréatives (plongée, excursion, récréation balnéaire) induites pour l’essentiel par le tourisme et celles liées à la pêche (professionnelle et de plaisancière). Les services écosystémiques (assimilés aux usages indirects) tels que la protection des côtes, l’absorption/séquestration de carbone, la production de biomasse de poissons et l’épuration de l’eau sont conséquents puisque leur valeur annuelle s’élève à 94 millions € soit 38 % de la valeur totale. La valeur de ce qui a trait au non-usage des récifs, herbiers et mangroves (lié à la volonté de transmettre un patrimoine écologique pour l’essentiel ou encore à la satisfaction de savoir que les récifs sont en bon état) se traduit par une création de valeur de l’ordre de 10 millions €/an. Les herbiers et les mangroves contribuent le plus (par km2) à la création de valeur (respectivement 2,16 millions €/km2, 1,87 million €/km2 contre 1,78 million €/km2 pour les récifs). Ils doivent donc bénéficier de mesures de protection et surtout de valorisation au même titre que les récifs coralliens qui font déjà l’objet d’une attention particulière.
Martinique possesses 55 km2 of coral reefs, 50 of sea grass and 20 of mangroves. These three ecosystems produce services for a value estimated at 250 millions € per year. About 60% of this value originates from directs uses such as recreational activities (diving, excursions, beach activities, etc.) induce by tourism and fishery. Ecosystem services (indirect uses) such as coastal protection, carbon sequestration, biomass production and water purification are significant since their sum value reaches annually 94 millions € (38% of the total economic value). Non-use value links to the improvement of the health of coastal ecosystem is estimated to 10 millions € per year. At the ecosystem level, sea grass and mangrove contribute the more (per km2) to the wealth creation (respectively 2,16 millions €/km2, 1,87 million €/km2 against 1,78 million €/km2 for the reefs). They need therefore to benefit from protection and management measures in the same magnitude than the reefs already received.
Martinique

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.4410
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/4410

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley
Résumé : International audience
Microalgae in the division Haptophyta play key roles in the marine ecosystem and in global biogeochemical processes. Despite their ecological importance, knowledge on seasonal dynamics, community composition and abundance at the species level is limited due to their small cell size and few morphological features visible under the light microscope. Here, we present unique data on haptophyte seasonal diversity and dynamics from two annual cycles, with the taxonomic resolution and sampling depth obtained with high-throughput sequencing. From outer Oslofjorden, S Norway, nano- and picoplanktonic samples were collected monthly for 2years, and the haptophytes targeted by amplification of RNA/cDNA with Haptophyta-specific 18S rDNA V4 primers. We obtained 156 operational taxonomic units (OTUs), from c. 400.000 454 pyrosequencing reads, after rigorous bioinformatic filtering and clustering at 99.5%. Most OTUs represented uncultured and/or not yet 18S rDNA-sequenced species. Haptophyte OTU richness and community composition exhibited high temporal variation and significant yearly periodicity. Richness was highest in September-October (autumn) and lowest in April-May (spring). Some taxa were detected all year, such as Chrysochromulina simplex, Emiliania huxleyi and Phaeocystis cordata, whereas most calcifying coccolithophores only appeared from summer to early winter. We also revealed the seasonal dynamics of OTUs representing putative novel classes (clades HAP-3-5) or orders (clades D, E, F). Season, light and temperature accounted for 29% of the variation in OTU composition. Residual variation may be related to biotic factors, such as competition and viral infection. This study provides new, in-depth knowledge on seasonal diversity and dynamics of haptophytes in North Atlantic coastal waters. See also the Perspective by Massana
ISSN: 0962-1083

hal-01545321
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01545321
DOI : 10.1111/mec.13160

Éditeur(s) : HAL CCSD Tecpar
Résumé : International audience
The general structure and organization of the shallow water (<1.5 m) fish assemblages were studied in two southern Brazilian ecosystems, a bay and a lagoon, under different marine or continental influences. The abiotic factors were measured to define the hydrology of the sites and the biotic descriptors were evaluated to characterize the assemblage structures. Transparency, salinity and organic matter were the abiotic factors which best distinguished the sites. A total richness of 69 species was observed. Ecological guilds, density, diversity and evenness indices values were different in each site. Hydrodynamism and geomorphology determined the structure and the organization of the fish assemblages in these shallow waters. It was observed that variations in the hydrological attributes generated by the marine or continental water movements are able to alter the conditions in the lagoon more quickly and at more regular frequencies than those in the bay.
ISSN: 1516-8913

hal-00753018
https://hal.univ-antilles.fr/hal-00753018
https://hal.univ-antilles.fr/hal-00753018/document
https://hal.univ-antilles.fr/hal-00753018/file/BRAZILIAN_2010.pdf

Éditeur(s) : EDP Sciences
Résumé : The WFD monitoring requirements for surface waters were adapted to the coastal area with the selection of the relevant parameters to qualify the maritime ecosystems, with appropriate strategies of sampling. Ifremer and Cemagref for the fish indicator in the estuarine waters, are in charge of the elaboration of the monitoring programme in coastal waters (surveillance monitoring and operational monitoring). Ifremer has elaborated technical recommendations for the monitoring of the biological (benthic and phytoplanctonic) and chemical elements, according to many years of observations by the french monitoring networks (RNO, Rephy, Rinbio, RSL, Rebent). These recommendations were established within experts groups They clarify the parameters, the analytical methods, and the strategies of sampling for the classification of the water bodies in five ecological classes and two chemical classes. The work on the relevant indicators of the ecological status still goes on, in relation with the 2006 european intercalibration exercise. Available data and future data will be used in order to set the borders between the classes of high, good, and moderate status, before the monitoring programme starts. Data sets have to be completed to set the borders and to assess the ecological status of water bodies.
Houille Blanche - Revue internationale de l'eau (0018-6368) (EDP Sciences), 2006-07 , N. 4 , P. 68-74

Droits : © Société Hydrotechnique de France 2006
http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/publication-3530.pdf
DOI:10.1051/lhb:200604011
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3530/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : The Manche-à-Eau lagoon, brackish water ecosystem is subject to tide, trade winds and hurricanes. The 2004 map (IGN) is covered of a 90 m aside square, to place 37 spots in a GIS and to limit them on the field with a GPS. From aerial photos, the outlines drawing allows morphological follow up since 1950. Depth is measured at 1437 spots with bathymetric perch and prob. Stream direction is established during stream and ebb tide using ribbon fixed to the spot and a compass. Water volumes at low and high tide allow calculating the water renewal rate, at each tide. The mapping follow-up shows outlines and island stabilization because of the “shield effect” and soil (root peat), small islands aggregation/disaggregation depending of hurricanes passing. The present bathymetry shows the lagoon filling and the channels digging. General streams are subject to trade-winds (SSE-NNW) andthe tide movement to and fro. The up and down water generates a stream channel situated along the outlines and around dips and sandbanks. Water renewal volume (14.8 %) at each tide, combined with an active and various hydrodynamism tends to improve the water quality in this system.
Evolución Morfológica de la Laguna del Manglar Manche-à-EAU (Guadalupe, Antilles Francesas) de 1950 a 2004, y su batimetría eb 2007La laguna del Manche-à-Eau, ecosistema de agua salobre está sometido a la marea, a los alisios y a los huracanes. El mapa IGN de 2004 está dividido según una malla de 90 m para colocar 37 puntos en un SIG y limitarlos in situ con un GPS. Según las fotografías aéreas, el dibujo de los contornos hace posible el seguimiento morfológico desde 1950. La profundidad se mide en 1437 puntos con una pértiga y una sonda batimétrica. La orientación de las corrientes se establece en el mar y en el reflujo con catavientos fijados en los puntos, y una brújula. Las masas de agua entrantes y salientes permiten el cálculo del volumen de agua renovado durante cada marea. El seguimiento cartográfico muestra una estabilización de los contornos y de la isla debido al “efecto de escudo” y al suelo (turba de raíz), y una agregación/desagregación de los islotes según el paso de los huracanes. De acuerdo a la batimetría actual, se constatan el relleno de la laguna y la excavación de los canales. Las corrientes generales son controladas en superficie por los alisios, vientos de SSE-NNO y por el vaivén de la marea. Los movimientos ascendentes y descendentes de agua generan corrientes profundas a lo largo de los bordes y alrededor de depresiones y bajos. El volumen de agua renovado durante cada marea (14,8%) combinado al hidrodinamismo activo y variado tiende a vivificar este ecosistema.
La lagune de la Manche-à-Eau, écosystème d’eau saumâtre est soumis à la marée, aux alizés et aux ouragans. La carte IGN de 2004 est quadrillée selon une maille de 90 m pour placer 37 points dans un SIG et les borner sur le terrain avec un GPS. D’après les photographies aériennes, le dessin des contours rend possible le suivi morphologique depuis 1950. La profondeur est mesurée à 1437 points avec une perche et une sonde bathymétrique. L’orientation des courants est établie au flot et au jusant avec des penons fixés aux points, et une boussole. Les masses d’eau entrantes et sortantes permettent le calcul du volume d’eau renouvelé à chaque marée. Le suivi cartographique montre, une stabilisation des contours et de l’île due à « l’effet bouclier » et au sol (tourbe racinaire), et une agrégation/désagrégation des îlots selon le passage des ouragans. D’après la bathymétrie actuelle, le comblement de la lagune et le creusement des chenaux sont constatés. Les courants généraux sont gouvernés en surface par les alizés, vent de SSE-NNO et par le va-et-vient de la marée. Les descentes et remontées d’eau obligent ceux-ci à emprunter en profondeur les passages situés le long des berges et autour des dépressions et des hauts-fonds. Le volume d’eau renouvelé à chaque marée (14,8 %) combiné à l’hydrodynamisme actif et varié tend à vivifier cet écosystème.
Proceedings of the 61st Gulf and Caribbean fisheries institute
Le Gosier, Guadeloupe, France

hal-01600092
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01600092
PRODINRA : 384819

Éditeur(s) : Gauthier-Villars
Résumé : Four planktonic coastal ecosystems from the western Channel to the southern part of the North Sea have been compared. The characteristics of the south of the North Sea are a very high planktonic biomass with an annual maximum value of 45 mg C m-3 h-1 for primary production, a maximum of 11 mg m-3 for Chlorophyll a and 60 mg C m-3 for zooplanktonic biomass (expressed in term of carbon weight), linked with an oscillating ecosystem. In the western Channel primary production shows an annual maximum value of 8 mg C m-3 h-1, die chlorophyll a, a maximum of 2.5 mg m-3 and zooplanktonic carbon weight of 14 mg C m-3 linked to a greater inertia in the system. Turnover is faster in the north. Trophic efficiency ratios have been calculated and linked to hydrodynamic conditions and currents. The impacts of a thermal perturbation from a nuclear power plant effluent (DT 11-degrees - 15-degrees-C) applied to ecosystems are compared.
Oceanologica Acta (0399-1784) (Gauthier-Villars), 1993 , Vol. 16 , N. 5-6 , P. 661-670

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00100/21130/18750.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00100/21130/

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : La création d’une réserve marine au nord de la Martinique, dans la commune du Prêcheur, a donné lieu à une évaluation de la valeur économique des écosystèmes marins et côtiers (EMC) de la zone d’étude. La valeur économique totale (VET) obtenue est de l’ordre de 58 millions d’euros, soit près de 12 millions d’euros par km2. Cette valeur correspond à la somme des valeurs liées aux différents usages directs (pêche, excursion et plongée encadrée, pour l’essentiel), soit près de 3 millions d’euros, aux usages indirects provenant des services écologiques (protection côtière, séquestration carbone, production de biomasse et épuration des eaux, pour l’essentiel), soit environ 200 000 euros, et, à la valeur de non-usage associée à l’existence des écosystèmes et à la transmission de ce patrimoine naturel aux générations futures en dehors d’un quelconque usage présent et futur, soit près de 55 millions d’euros. La création de la réserve devrait engendrer une augmentation de cette valeur en améliorant les services écologiques et les usages ludiques.
The creation of a marine reserve in the north-western part of Martinique, located in the area of Prêcheur, has led to an economic valuation of marine and coastal ecosystems. The total economic value (TEV) has been estimated to about 58 million Euros annually, almost 12 million Euros by km². This value stands for the sum of values associated to: i) direct uses (fishing, diving, beach leisure, etc.) for almost 3 million Euros; ii) indirect uses originating from ecological services (water treatment and nutrient cycling, biomass productivity, carbon sequestration) for 200,000 Euros; and iii) non-uses associated to the existence and bequest to next generation of the natural capital without any consideration of use for about 55 million Euros. The creation of the marine reserve should lead to an increase of this value through an enhancement of ecological services of ecosystems and the non-extractive uses such as tourism and marine leisure.
Martinique

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.6620
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/6620

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Manque : organisateur de la manifestation - éléments/proceedings
With the new data on bathymetry, currentology, in this ecosystem and the abiotic variables studied from February to May 2007, a review of the Manche-à-Eau’s biological zonation recently stated from the fishassemblage is proposed. The water volume turnover at each tide (14,8%) twice a day combined with an active and various hydrodynamism contribute to vivify the lagoon andprovide information for a better interpretation of the Well-Being Index values and the populational parameters gradients of the fish assemblage. During the studied period, no gradient is observed with the abiotic variables. The water characteristics are homogene-ous verywhere in the lagoon, in the water column and whatever the period studied (temperature: 30,02°C; salinity: 36,16 ‰; pH:8,29; turbidity: 6,10 mg/L; conductivity: 5,51S/m; dissolved oxygen: 7,18mg/L; dissolved solids: 32,78g/Ll; osmolarity:1021,7milliosmoles). A revised biological zonation of the Manche-à-Eau lagoon is pro-posed. According to the quality observed, it is made of three zones, instead four, from II to IV: the zone II is more spread at South and narrow along the island, the zone III occupies the geater part of the ecosystem and the zone IV centered on the two main depressions at South and West, on the shallows and its North-West border and the end of the sector enclaved at South-West.
Con los nuevos datos sobre batimetría y la corrientología en este ecosistema y las variables abióticas estudiadas de febrero a mayo del 2007, se propone una revisión de la zonación biológica recientemente establecida en cuanto a la agrupación de peces del Manche-à-Eau. El volumen de agua renovada dos veces al día en cada marea (14.8%) combinado a un hidrodinamismo activo y variado contribuyen a verificar la laguna, y aportan elementos para una mejor interpretación de los valores de los índices de buen estado y de los diferentes parámetros poblacionales de la ictiofáuna presente. Durante el período estudiado no se observó ningúngradiente con los parámetros abióticos. Las características del agua son homogéneas a lo largo de toda la laguna. En la columna de agua en cualquiera de los períodos considerados (temperatura: 30,02°C; salinidad: 36,16 ‰; pH: 8,29; turbidez: 6,10 mg/L;conductividad: 5,51 S/m; oxígeno disuelto: 7,18 mg/L; sólidos disueltos: 32,78g/L; osmolaridad: 1021,7miliosmoles). Se propone una zonación biológica rectificada. De acuerdo a la calidad observada, esta, está compuesta por tres zonas en lugar de cuatro: de II a IV, la zona II está mas dispersa al sur y es mas estrecha a lo largo de la isla, la zona III domina la mayor parte del ecosistema y lazona IV está centrada en las dos principales depresiones al sur y al oeste, las zonas someras y en su borde al noroeste al igual que del sector enclavado al suroeste.
Avec les nouvelles données sur la bathymétrie et la courantologie de cet écosystème et les paramètres physicochimiques étudiés entre février et mai 2007, c’est une actualisation de la zonation biologique établie récemment à partir de l’assemblage de poissons y séjournant qui est proposée dans cette étude. En effet, le volume d’eau renouvelé deux fois par jour à chaque marée (14,8%) combiné à un hydrodynamisme actif et varié contribuent à vivifier la lagune, et apportent des éléments pour une meilleure interprétation des valeurs des indices de bien-être et des gradients des paramètres populationnels de l’ichtyofaune présente. Durant la période étudiée, aucun gradient n’est observé avec les paramètres abiotiques. La caractéristique des eaux est homogène partout dans la lagune, sa colonne d’eau et aux différentes périodes considérées (température : 30,02°C ; salinité : 36,16 ‰ ; pH : 8,29 ; turbidité : 6,10 mg/L ; conductivité : 5,51 S/m ; oxygène dissous : 7,18 mg/L ; solides dissous : 32,78g/L ; osmolarité : 1021,7milliosmoles). Une zonation biologique rectifiée est proposée. Plus conforme à la qualité observée, elle est composée de trois zones, au lieu de quatre, allant de II à IV: la zone II un peu plus étendue au Sud et plus étroite le long de l’île, une zone III dominante sur l’ensemble de la lagune, et une zone IV centrée sur les deux principales dépressions au Sud et à l’Ouest, le haut-fond et sa bordure au Nord-Ouest ainsi que le fond du secteur enclavé au Sud-Ouest.
Proceedings of the 61st Gulf and Caribbean Fisheries Institute
Le Gosier, Guadeloupe, France

hal-01600920
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01600920
PRODINRA : 384820

Éditeur(s) : Springer
Résumé : The French Atlantic coast contains large highly productive intertidal mudflats that are colonised by juveniles of numerous flatfish species, including the common sole (Solea solea, L.). These ecosystems are also heavily exploited by the shellfish farming industry. Intensive bivalve culture is associated with substantial biodeposition (1-6 t-dw ha(-1) day(-1)), which directly or indirectly contributes to increase exopolysaccharide (EPS) concentrations at the interface between water column and seabed. EPS are long-chain molecules organised into colloids, which influence rheological properties of water, particularly viscosity. Increased water viscosity had consequences for ventilatory activity of juvenile flatfish, whereby the minimal pressure required to ventilate the medium increases directly with EPS concentration. Moreover, the critical EPS concentration ([EPS](crit)) at which water was no longer able to flow through the branchial basket ranged from almost nil to over 30 mg l(-1), depending on species and size. [EPS](crit) was lower in small individuals and individuals from species with high metabolic rates (turbot and plaice). These differences may depend upon gill and bucco-branchial cavity morphometrics. The ventilatory workload of sole increased with viscosity to a maximum at 2 mg EPS l(-1). Viscosity might, therefore, be a limiting factor for flatfish post larvae, which colonise the intertidal mudflats, depending upon their size and species. EPS concentrations in the field can reach 15 mg l(-1). A selective effect is conceivable but remains to be estimated in the field.
Marine Biology (0025-3162) (Springer), 2007-09 , Vol. 152 , N. 4 , P. 803-814

Droits : 2007 Springer
http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/publication-2801.pdf
DOI:10.1007/s00227-007-0731-z
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2801/

Résumé : Les forêts côtières inondables (FCI) des régions tropicales et subtropicales remplissent des fonctions écologiques nécessaires aux écosystèmes marins côtiers situés en aval et aux populations humaines vivant à proximité Aux Antilles, les mangroves et les forêts marécageuses à Pterocarpus officinalis sont structurés par des espèces ligneuses qui ont développé des adaptations particulières à la salinité, à l’inondation et aux substrats meubles sur lesquels elles reposent. Dans des contextes climatiques à forte saisonnalité, les saisons sèches prolongées entraînent de fortes variations de la salinité et du niveau de la nappe, que le changement climatique devrait amplifier. Les modèles climatiques de la région Caraïbe prévoient des saisons sèches plus sèches liées à une baisse des précipitations de 20 à 50 %. Or, la question des capacités de résistance et d’acclimatation des espèces ligneuses des FCI à des variations saisonnières marquées de leur environnement édaphique a été peu traitée dans la littérature scientifique.L’objectif de ce travail de thèse a été double. Il s’est agi, d'une part, de caractériser la structure et la croissance de faciès de végétation représentatifs des FCI antillaises et de mettre en évidence leurs déterminants. A cet effet, des individus adultes, des espèces ligneuses dominantes des FCI, (Avicennia germinans, Laguncularia racemosa, Pterocarpus officinalis, Rhizophora mangle), dans cinq faciès de végétation sur le gradient terre-mer, ont été suivis sur l'île de Grande-Terre (Guadeloupe). D’autre part, les effets de variations salines extrêmes sur la croissance et l’écophysiologie de ces quatre espèces ont été évalués au stade plantule par une expérience en conditions contrôlées.A travers cette étude, il a été montré que les différences de salinité et de fertilité entre les stationspermettent d’expliquer la composition et la structure des peuplements de FCI. Cette étude a égalementmontré que P. officinalis peut se maintenir dans une gamme de salinité plus large que ne l'indiquait lalittérature.Dans le contexte des Antilles où les marnages sont faibles, la saisonnalité du climat entraine des variations saisonnières importantes d’un ensemble de descripteurs édaphiques tels que le niveau de la nappe, la salinité du sol, le pH et le potentiel RedOx. L’inondation et la salinité des sols sont fortement corrélées aux variations mensuelles des précipitations. Les périodes sèches sont accompagnées de salinités élevées et d’une baisse du niveau de la nappe allant jusqu’à l’exondation des sols dans toutes les stations suivies. Les stress environnementaux liés à la saisonnalité entrainent une baisse de la production primaire. L’accroissement cambial mensuel des individus est fortement corrélé avec les précipitations et l’intensité du vent. Dans les stations de mangrove, la sècheresse édaphique régule la production primaire des palétuviers. En forêt marécageuse, la part de la sècheresse atmosphérique semble plus importante pour expliquer la production de P. officinalis. Aussi, les sècheresses édaphique et atmosphérique doivent être prises en compte toutes deux pour modéliser efficacement la croissance des peuplements des FCI.Lors de la saison sèche, le stress le plus important est le stress hydrique, lié à la diminution de la teneur en eau du sol et à l’augmentation de la salinité, qui entraine des contraintes physiologiques sur les palétuviers (ajustements stomatiques, pertes de surface foliaire et de conductivité hydraulique). Le stress ionique, lié à la toxicité des ions Na+ et Cl-, permet aussi d’expliquer une partie de la contrainte sur l’assimilation en carbone. En saison sèche, l’aération des sols ne se traduit pas par une amélioration des performances de croissance chez toutes les espèces. Aussi, la croissance cambiale maximale de toutes les espèces de FCI est réalisée en saison des pluies lorsque la salinité est faible et les niveaux d’inondation élevés.
In tropical and subtropical regions, flooded coastal forests provide essentials goods and services to local communities. In the Antilles, mangrove forests and the Pterocarpus officinalis swamp forest host tree species that are adapted to salinity, flooding and loose substrates. In areas were climatic seasonality is strong, dry seasons lead to strong fluctuations of soil salinity and water table level ; that climate change is likely to make stronger again. Climate model for the Caribbean project drier dry seasons with a decease of 20 to 50 % in annual rainfall amounts. However, resistance and acclimation ability of flooded coastal forest’s species to strong environmental fluctuations still remain poorly studied.This thesis aims two objectives. On the one hand, it aims to characterize the forest structure and monthly growth of vegetation structures representative of the Antillean flooded coastal forests and to highlight their determinants. In this respect, adult trees of the four dominant species of local flooded coastal forest (Avicennia germinans, Laguncularia racemosa, Pterocarpus officinalis, Rhizophora mangle), in five stations along a sea – land gradient were monitored on the Grande-Terre island (Guadeloupe). On the other hand, the effects of salinity variation patterns and salinity levels on growth performances and physiology of seedlings from the four same species were investigated through a greenhouse experiment.This study shows that differences among average salinity and soil fertility explain the vegetation structure of flooded coastal forest. It also extents, in the literature, the range of salinity in which P. officinalis can stand at the tree stage.In the Antilles were tidal range is small, climate seasonality lead to strong edaphic seasonal variations in water table level, soil salinity, pH and RedOx potential. Flooding and soil salinity are strongly correlated to monthly rainfall amounts: dry periods lead to high salinity and to a decrease in water table level under the soil surface. Seasonal environmental stresses lead to a decrease of primary production. Cambial growth was strongly correlated to monthly precipitation and average wind speed. In mangrove stations, edaphic drought determines primary production of mangrove trees, when, in swamp forest stations, atmospheric drought determines an important part of P. officinalis’ primary production.During the dry season, water stress is the more important environmental stress, both by the decrease in soil humidity and the increase in soil salinity, and leads to physiological strains (stomatal adjustment, loss of leaf area and hydraulic conductivity) for mangrove trees. Ionic toxicity of ions Na+ and Cl- also explains a part of the strain on carbon assimilation. During the dry season, re oxygenation of soils via low water table level does not lead to an increase of physiological traits. Thus, maximum cambial growth of all species is observed during the rainy season, when salinity is low and water table level is high.Flooded coastal forest’s species do not have the same ability to recover after a dry episode. In all the studied stations, A. germinans’ cambial growth rises back as soon as the rainy season starts, when, for one station, cambial growth of L. racemosa and R. mangle stay null during the three first month of the rainy season. This low ability to recover after a dry episode is correlated to a stronger impact of the dry season on the physiological traits of these two species.The greenhouse experiment shows that salinity variation patterns are to be taken into consideration for explaining seedlings’ growth and salinity tolerance. A stronger salinity increase impacts the growth of all the studied species; a punctual drop of salinity highlights that flooded coastal forest’s species differ in ability to take advantage of a low salinity episode. These results are coherent with field observations as cambial growth was fairly explained by monthly precipitation.

http://www.theses.fr/2013AGUY0674/document

Éditeur(s) : Elsevier Science Bv
Résumé : A Lagrangian approach based on a physical-biogeochemical modeling was used to compare the potential transfer of cadmium (Cd) from natural and anthropogenic sources to plankton communities (Cd-uptake) in the NorthWest African upwelling. In this region, coastal upwelling was estimated to be the main natural source of Cd while the most significant anthropogenic source for marine ecosystem is provided by phosphate industry. In our model experiment, Cd-uptake (natural or anthropogenic) in the North-West African upwelling is the result of an interplay between the Cd dispersion (by advection processes) and the simulated biological productivity. In the Moroccan waters, advection processes limit the residence time of water masses resulting in a low natural Cd-uptake by plankton communities while anthropogenic Cd-uptake is high. As expected, the situation is reversed in the Senegalo-Mauritanian upwelling where natural Cd-uptake is higher than anthropogenic Cd-uptake. Based upon an estimate of Cd sources, our modeling study shows, unexpectedly, that the anthropogenic signal of potential Cd-bioaccumulation in the Moroccan upwelling is of the same order of magnitude as the natural signal mainly present in the Senegalo-Mauritanian upwelling region. A comparison with observed Cd levels in mollusk and fishes, which shows overall agreement with our simulations, is confirming our estimates.
Science Of The Total Environment (0048-9697) (Elsevier Science Bv), 2015-02 , Vol. 505 , P. 870-888

Droits : 2014 Elsevier B.V. All rights reserved.
http://archimer.ifremer.fr/doc/00252/36310/35200.pdf
DOI:10.1016/j.scitotenv.2014.10.045
http://archimer.ifremer.fr/doc/00252/36310/

Éditeur(s) : EDP Sciences
Résumé : Martinique is a French overseas department whose economy relies heavily on agriculture. Organochlorine pesticides, mainly chlordecone, were used for banana cultivation to eradicate banana weevil over a period of 40 years. Chlordecone is chemically stable,and has a strong affinity for fatty tissues. It is therefore able to bioaccumulate in animals and thereby represent a threat to ecosystems and man. Soils from banana plantations in Martinique are heavily contaminated with chlordecone. Possible transfer of these molecules from agricultural watersheds to the aquatic environment and the organisms that live in it is feared. The hypothesis that ecosystems of Martinique might be highly contaminated with this organochlorine pesticide was investigated. Chlordecone levels were measured in various freshwater and marine species. Data show a heavy contamination of many carnivorous and detritivorous species (fish and prawns). Concentrations measured in wild or farmed tilapia are among the highest ever reported in the literature. Some coastal species (fish and lobster) were also found to be contaminated, although to a lesser extent. Given the biogeochemical behavior of chlordecone, the most likely route of contamination is food. Detected concentrations in marine organisms are below the tolerated limits established by authorities. however. the impact of other sources of exposure, namely, contaminated water and root vegetables, remains to be investigated.
Aquatic Living Resources (0990-7440) (EDP Sciences), 2006-04 , Vol. 19 , N. 2 , P. 181-187

Droits : EDP Sciences, IFREMER, IRD 2006
http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/publication-1662.pdf
DOI:10.1051/alr:2006016
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1662/

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : Understanding the pattern in spatial distribution of soil microbial processes is critical to understand the environmental factors that regulate them as well as to scale up these processes to ecosystem. Soil samples from a I ha tropical rainforest plot (Paracou, French Guiana) were analyzed according a nested sampling approach using different separation distances ranging from 0.4 to 40 m. The variability of substrate induced respiration (SIR) and of denitrification enzyme activity (DEA) was characterized in relation to various soil properties (total C and N contents, NIRS related index of soil organic matter quality, SOMQ and index of tree influence potential, IP). The variability of SIR and DEA was higher than that of environmental properties. The patterns of accumulated variance as a function of distance varied among the soil properties. The variability of SIR and DEA mainly occurred at small (1 m) scale (and at the 10-40 m-scales for SIR), probably reflecting the quality of litter input that results of the influence of local assemblage of different tree species, though changes in the soil N and C contents. Indeed, total soil C and N contents explained the microbial properties at every scale. Coefficients of codispersion showed that neither SOMQ nor IP did correlate with SIR and DEA, and confirmed that total C and N contents explained microbial properties in a scale dependent and complex manner. Such spatial dependency underlines the importance of soil heterogeneity in this tropical forest with implications for sampling strategies when studying the microbial processes and their response to disturbances. (C) 2012 Elsevier B.V. All rights reserved.
ISSN: 0016-7061

hal-01032409
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032409
DOI : 10.1016/j.geoderma.2012.12.009

Éditeur(s) : Université de Bretagne Occidentale
Résumé : The negative impact of the man on the environment unquestionably increases. The coastal environment as a whole is the maritime environment which is the most exposed to man-made eutrophication. For instance, nitrate loads to coastal waters off Brittany (France) have increased 10 times (from 3 to s 30mg L-1NO3) during the four last decades. Eutrophication of this coastal zone is now a recurrent problem, more and more worrying. This eutrophication exhibits two main forms : " green tides ", which are caused by local proliferations and stranding of green macro-algae (particularly the Ulva species) in nitrogen-enriched areas ; phytoplanktonic blooms, which are responsible for coloured water events, toxic species can be present (Pseudo-Nitzschia, Alexandrium, Dinophysis), and induce banning of shellfish consumption. The objectives of this study are to assess the respective role of various rivers (especially the Loire and the Vilaine) in the eutrophication of the Brittany shelf ecosystem and test the impact of nitrogen enrichment in the triggering of Pseudo-Nitzchia toxicity. For these purposes, a coupled hydrodynamical/ biogeochemical 3D model has been developed and validated against past measured time-series and satellite images. After a brief analysis of primary production over the Brittany shelf under different conditions, we show a description of the real time adaptation of this model. Daily results are currently presented in real time on www.previmer.org web site. The inability of the model to correctly simulate near shore phytoplankton is worsened in this model by the fact that the turbidity field used is a climatological one, made by satellite images averaged on a decadal basis. First, near shore pixels of satellite images are scarcely reliable, secondly a climatological mean cannot represent the sudden bursts or drops of the real turbidity, highly dependent on the actual sea-state : this can explain also why the model at this moment fails to reproduce a sudden bloom occurring in a short period of sunny and calm weather. The simulated Pseudo-Nitzschia biomass and induced risk of toxicity in the water column cannot really be validated offshore, because monitoring measurements are available only near the coast, and deal only with toxicity in benthic filter feeders. To get temporarily rid of that problem, an interesting improvement would be to add to the operational model the bio-accumulation of toxin in the shellfishes : simulated concentrations in shellfish fresh would become directly comparable with usual measurements of the monitoring networks. Our model points out the important impact of Loire river loads on the primary production on the western and southern Brittany. This result is crucial for administrations in charge of reducing the terrestrial loadings responsible for eutrophication, because it can delay reduction programs on small tributaries until the main input from the Loire has been significantly reduced. A question arises, about the reliability of the haline stratification in the model, because the horizontal extent of the Loire plume will be enhanced by a stronger stratification.
L'eutrophisation des milieux marins côtiers, de plus en plus importante, représente un des impacts majeurs des activités humaines sur l'environnement. Les phénomènes d'eutrophisation sont en constante augmentation ; ces dernières décennies ont vu le nombre de sites touchés augmenter de par le monde. La bande côtière bretonne est particulièrement concernée par ce phénomène. L'eutrophisation s'y manifeste de deux façons : "Des phénomènes de marée vertes, très localisées, qui sont provoqués par la croissance excessive et l'échouage de macro-algues du genre Ulva dans ces zones riches en azote ; Des blooms de phytoplancton à l'origine des phénomènes d'eaux colorées, qui peuvent aussi provoquer des interdictions de consommation de coquillages lorsque les espèces mises en jeu sont toxiques (Pseudo-Nitzschia, Alexandrium, Dinophysis). L'objectif de ce travail est multiple : il vise à mettre en évidence et à comprendre l'impact et le rôle des apports en nutriments sur la production primaire et l'eutrophisation des milieux côtiers. Ce travail a aussi pour ambition l'identification et la compréhension des causes des phénomènes d'eutrophisation et permettre ainsi d'apporter des solutions ou des pistes d'amélioration. En n, il a aussi un objectif de prévision à court terme de l'état biologique sur la zone. Pour atteindre ces objectifs, un modèle en temps réel a été mis en oeuvre. Les résultats de simulations numériques et de mesures satellitaires sont présentés sur internet : www.previmer.org. L'outil principal de ce travail est un modèle couplé physique/biogéochimie. La partie hydrodynamique est fournie par le code Mars3D (3D hydrodynamical Model for Application at Regional Scale) développé à IFREMER. Au code hydrodynamique Mars3D est couplé le modèle des cycles de l'azote, du phosphore et du silicium d'IFREMER. Le modèle couplé permet de simuler en 3 dimensions et de manière dynamique les courants, le brassage horizontal et vertical, les champs de température et de salinité, mais aussi les principaux cycles de nutriments, reproduisant ainsi les conditions déterminantes de la production primaire. La croissance des algues est modélisée, et nous permet de voir l'influence des panaches de dilution des principales rivières bretonnes sur leur croissance. Les diffcultés du modèle à correctement simuler les concentrations en phytoplancton près des zones côtières, sont probablement dues à l'utilisation d'une climatologie de concentration en matière en suspension fondée sur des données satellitaires. Tout d'abord, les pixels côtiers des images satellitaires sont entachés d'erreurs, ensuite une climatologie n'est pas capable de représenter les apports soudains des fleuves lors des crues. Cela peut expliquer l'incapacité du modèle a représenter certains blooms liés à des périodes ensoleilées et calmes. A ce modèle de base nous avons ajouté un genre spécifique de phytoplancton : le genre Pseudo-Nitzschia. Certaines espèces de Pseudo-Nitzschia sont réputées toxiques. En effet, ce phytoplancton a la capacité de synthétiser une toxine : l'acide domoïque. Cette toxine est responsable du syndrome ASP (Amnesic Shellfish Poisoning). Le modèle reproduit globalement les mêmes zones de toxicité que les mesures du REPHY, et donne des résultats encourageants. L'étude montre que la Loire influence une large partie de la bande côtière bretonne ; son panache remonte jusqu'au nord de la mer d'Iroise, et contribue pour une grande part à l'enrichissement du sud et de l'ouest de la Bretagne. Le traçage de l'azote en provenance de la Loire au sein des cycles biogéochimiques nous a permis de quantifier cet enrichissement.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12603/9481.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12603/

Éditeur(s) : HAL CCSD National Academy of Sciences
Résumé : International audience
Diatoms (Bacillariophyta) constitute one of the most diverse and ecologically important groups of phytoplankton. They are considered to be particularly important in nutrient-rich coastal ecosystems and at high latitudes, but considerably less so in the oligotrophic open ocean. The Tara Oceans circumnavigation collected samples from a wide range of oceanic regions using a standardized sampling procedure. Here, a total of similar to 12 million diatom V9-18S ribosomal DNA (rDNA) ribotypes, derived from 293 size-fractionated plankton communities collected at 46 sampling sites across the global ocean euphotic zone, have been analyzed to explore diatom global diversity and community composition. We provide a new estimate of diversity of marine planktonic diatoms at 4,748 operational taxonomic units (OTUs). Based on the total assigned ribotypes, Chaetoceros was the most abundant and diverse genus, followed by Fragilariopsis, Thalassiosira, and Corethron. We found only a few cosmopolitan ribotypes displaying an even distribution across stations and high abundance, many of which could not be assigned with confidence to any known genus. Three distinct communities from South Pacific, Mediterranean, and Southern Ocean waters were identified that share a substantial percentage of ribotypes within them. Sudden drops in diversity were observed at Cape Agulhas, which separates the Indian and Atlantic Oceans, and across the Drake Passage between the Atlantic and Southern Oceans, indicating the importance of these ocean circulation choke points in constraining diatom distribution and diversity. We also observed high diatom diversity in the open ocean, suggesting that diatoms may be more relevant in these oceanic systems than generally considered.
ISSN: 0027-8424

hal-01545320
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01545320
DOI : 10.1073/pnas.1509523113

Éditeur(s) : Université de Bretagne Occidentale
Résumé : Study of mineral suspended particulate matter (SPM) is essential to understand ecosystem dynamics. SPM influences light penetration which is closely related to primary production and carries pollutants and nutrients within the water masses. This work aims to study near-surface mineral SPM dynamics in the English Channel using two complementary methods: remote-sensing by satellites and numerical modelling. Firstly, MODIS and MERIS satellite images processed by the IFREMER semi-analytical algorithm and describing non-algal SPM, are analysed to build three statistical models which are able to estimate near-surface SPM using simple variables, e.g., tidal coefficient, significant wave height and mean chlorophyll-a concentration. Secondly, the three-dimensional hydrosedimentary model ROMS (Regional Ocean Modeling System) is applied in the English Channel. It considers tidal forcing along open boundaries, wind stress at the sea-surface, wave-current interactions in the bottom boundary layer and realistic heterogeneous bottom sediments. Results of the more sophisticated statistical model is also used to impose SPM concentrations at open boundaries. Sensitivity tests on SPM boundary conditions show the importance of prescribing realistic sediment concentrations to improve the model predictions. Biological influences on mineral SPM are also tested using settling velocity and critical shear stress for erosion which vary with seasons. Both statistical and numerical models highlight and locate respective influences of tide, waves and biology on mineral SPM. Numerical predictions indicate that near-surface SPM is mainly composed of silts (>70%). Near-surface suspended silts come largely from seabed resuspension alongshore in the Eastern Channel and from the open boundaries of our limited-area coastal model at the West of Cotentin Peninsula and offshore. Near-surface SPM variations are investigated at semi-diurnal, neap-spring tidal cycle time scales and during a wave event. Finally, dynamics of sediments in the turbidity maximum zone around the Isle of Wight is examined depending on hydrodynamical conditions in order to distinguish the role played by advection and local erosion/settling processes in this area. Keywords: Suspended particulate matter, satellite, remote-sensing, modelling, English Channel, sediments, turbidity, tide, wave
L'étude des matières en suspension (MES) minérales est essentielle pour comprendre le fonctionnement des écosystèmes en Manche : les MES influencent la pénétration de la lumière dans la colonne d'eau, paramètre clé pour la production biologique, et sont susceptibles de transporter des polluants et nutriments. Lors de ce travail, la dynamique des MES minérales de surface en Manche est étudiée à l'aide de deux méthodes complémentaires : l'observation par satellite et la modélisation numérique tridimensionnelle. Dans un premier temps, les images satellite MODIS et MERIS, traitées par l'algorithme semi-analytique développé par l'IFREMER et représentant les MES non-algales de surface, sont analysées afin d'élaborer trois modèles statistiques permettant d'estimer la MES de surface en fonction de variables basiques telles que le coefficient de marée, la hauteur significative des vagues et la concentration moyenne en chlorophylle-a. Dans un deuxième temps, le modèle hydrosédimentaire multiclasse tridimensionnel ROMS (Regional Ocean Modeling System) est implémenté en Manche. Il prend en considération le forçage par la marée aux frontières ouvertes, la contrainte exercée par le vent à la surface de la mer, l'interaction houle-courant en couche limite de fond et l’hétérogénéité spatiale réaliste du lit sédimentaire. Les résultats du modèle statistique le plus sophistiqué sont également utilisés pour forcer la concentration en MES aux frontières ouvertes du domaine de calcul. Des tests de sensibilité sur les conditions limites montrent l'importance de considérer de manière réaliste les sédiments entrant en Manche par les frontières ouvertes lors de la modélisation numérique. L'influence de la biologie sur les MES minérales est testée en utilisant une formulation de la vitesse de chute et de la contrainte critique d'érosion variant saisonnièrement. Grâce à ces deux outils associés, les influences respectives de la marée, de la houle et de la biologie sur les MES minérales sont mises en avant et localisées en Manche. Le modèle numérique prédit que les MES de surface sont composées principalement de silts (>70%). Les silts en suspension en surface proviennent majoritairement du lit sédimentaire près des côtes en Manche orientale et des frontières ouvertes du domaine de calcul à l'ouest de la presqu'île du Cotentin et au large en Manche centrale et orientale. Les variations des MES de surface sont ensuite étudiées aux échelles des cycles de marée semi-diurnes, vive-eau/morte-eau et autour d'un épisode de houles. Enfin, l'évolution de la concentration de sédiments dans la zone de forte turbidité autour de l'île de Wight peut être analysée suivant les conditions hydrodynamiques afin d'évaluer les rôles respectifs des processus locaux d'érosion/dépot et d'advection dans la génération de ces turbidités remarquables. Mots-clés : Matière en suspension, télédétection, satellite, modélisation, Manche, sédiments, turbidité, marée, houle

Droits : 2013 UBO
http://archimer.ifremer.fr/doc/00157/26783/24884.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00157/26783/

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Background : Biological communities are normally composed of a few abundant and many rare species. This pattern is particularly prominent in microbial communities, in which most constituent taxa are usually extremely rare. Although abundant and rare subcommunities may present intrinsic characteristics that could be crucial for understanding community dynamics and ecosystem functioning, microbiologists normally do not differentiate between them. Here, we investigate abundant and rare subcommunities of marine microbial eukaryotes, a crucial group of organisms that remains among the least-explored biodiversity components of the biosphere. We surveyed surface waters of six separate coastal locations in Europe, independently considering the picoplankton, nanoplankton, and microplankton/mesoplankton organismal size fractions.Results : Deep Illumina sequencing of the 18S rRNA indicated that the abundant regional community was mostly structured by organismal size fraction, whereas the rare regional community was mainly structured by geographic origin. However, some abundant and rare taxa presented similar biogeography, pointing to spatiotemporal structure in the rare microeukaryote biosphere. Abundant and rare subcommunities presented regular proportions across samples, indicating similar species-abundance distributions despite taxonomic compositional variation. Several taxa were abundant in one location and rare in other locations, suggesting large oscillations in abundance. The substantial amount of metabolically active lineages found in the rare biosphere suggests that this subcommunity constitutes a diversity reservoir that can respond rapidly to environmental change.Conclusions : We propose that marine planktonic microeukaryote assemblages incorporate dynamic and metabolically active abundant and rare subcommunities, with contrasting structuring patterns but fairly regular proportions, across space and time.
ISSN: 0960-9822

hal-01149637
http://hal.upmc.fr/hal-01149637
http://hal.upmc.fr/hal-01149637/document
http://hal.upmc.fr/hal-01149637/file/Logares_et_al_CurrentBiol_accepted.pdf
DOI : 10.1016/j.cub.2014.02.050

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : The tourism industry has realized that the goals to protect the environment and goals of the economy are often not compatible. Thus countries such as Jamaica whose principal economic earner is tourism are seeking methods to green their national accounts and policies. However livelihood socioeconomic systems of the local population often conflict with sustainable policies. Furthermore these livelihood systems to eke out a living are often not regulated and fall outside the formal structures of governance, and sustainable regulation systems and policies. This article examines this Pandora’s Box within the context of Jamaica, Cockpit country with a focus on water, as natural resource used by both the tourist sector and the local population.
L'industrie du tourisme a réalisé que les objectifs de protection de l'environnement et les objectifs de l'économie ne sont souvent pas compatibles. Ainsi, des pays comme la Jamaïque dont le principal soutien économique est le tourisme économique sont à la recherche de méthodes écologiques de leurs comptes et les politiques nationales. Systèmes de subsistance Cependant socio-économiques de la population locale sont souvent en conflit avec les politiques de développement durable. En outre, ces systèmes de subsistance pour gagner leur vie sont souvent pas réglementés et tombent en dehors des structures formelles de gouvernance et des systèmes de régulation et des politiques durables. Cet article examine cette boîte de Pandore dans le cadre de la Jamaïque, pays de cockpit en mettant l'accent sur l'eau, ressource naturelle utilisée à la fois par le secteur du tourisme et de la population locale.
Jamaïque

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.5297
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/5297