Résumé : The tropical seabass Lates calcarifer was introduced in Tahiti in 1984 and then was domesticated without other introduction. Three successive generations have been obtained in captivity. Tissue samples of the 38 animaIs which represent the total Tahitian broodstock were preserved in alcohol to be genotyped with four microsatellite markers (Yue et al., 2001). Three of four described markers were successfully transferred to the laboratory of genetics of Tahiti (marker LcaM01, LcaM02, LcaM03), as the revelation technology available locally did not allow the use of LcaM04 in routine. The results show that the genetic diversity of the tahitian broodstock is not equivalent of the one of the species, which could be explained by the small size of the founder population, which is consistant with the history of the Tahitian population. The structuration of the 4th generation into several batches obtained from different parents appears to be the minimum management procedure to limit inbreeding.
Le loup tropical Lates calcarifer a été introduit à Tahiti en 1984 puis domestiqué sans apport d'animaux extérieurs. Trois générations successives ont été obtenues en captivité. Des prélèvements de tissus sur les 38 géniteurs qui constituent l'intégralité du stock de reproducteurs tahitiens sont conservés dans l'alcool pour être génotypés à l'aide de quatre marqueurs microsatellites (Yue et al., 2001). Trois des quatre marqueurs décrits ont pu être transférés avec succès au laboratoire de génétique de Tahiti (marqueurs LcaM01, LcaM02, LcaM03), la technique de révélation disponible localement ne permettant pas d'utiliser LcaM04 en routine. Les résultats montrent qu'on ne dispose pas à Tahiti de toute la variabilité génétique de l'espèce, ce qui pourrait s'expliquer, compte tenu de l'histoire de cette population, par un faible nombre de géniteurs fondateurs. La structuration de la 4ème génération en plusieurs lots issus de parents différents apparaît comme la mesure de gestion minimale pour limiter la consanguinité au sein de cette population.

Droits : 2003 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00142/25300/23372.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00142/25300/

Éditeur(s) : EDP Sciences
Résumé : Marine Protected Areas (MPA) are often contemplated as a tool for the sustainable management of exploited resources and ecosystem conservation. This paper proposes an approach to establish a statistical diagnostic of the effects of MPAs on fish assemblages, and define corresponding ecological indicators. This requires choosing relevant variables (abundance, diversity, demographic parameters..) and appropriate statistical methods. The study was based on data from the Abore reef Reserve in New Caledonia. Two sets of methods: 1-inferential linear models (ANOVA, GLM): 2- Partial Least Squares (PLS) methods of regression, were used to test the effects of this MPA. PLS enabled us to test simultaneously within a model, density, species richness, biomass and mean size variables of fish community to retain the most sensitive and relevant ones. Habitat variability was also taken into account in these models. Species were grouped according to several criteria: 1-feeding habit; 2- taxonomy; 3-mobility; 4-adult size; 5-demographic strategy. No significant effect of the opening of the Abore reef to fishing was found for mobility. Feeding habit was the only criterion for which the results from the inferential models and PLS showed a significant effect of reserve status for all variables. Species richness, density, and to a lesser extent mean size, were sensitive to the removal of reserve status. but not biomass. Results from ANOVA and PLS regression were consistent but the latter allows a more holistic approach as it integrates all variables within a single model.
Les Aires Marines Protégées (AMP) sont de plus en plus considérées comme des mesures de gestion alternative permettant à la fois une gestion durable des ressources exploitées et la conservation des écosystèmes. Nous proposons une approche pour définir des indicateurs synthétiques et permettre un diagnostic statistique de l'effet des AMP sur les peuplements. Ce travail passe par le choix de variables pertinentes (abondance, richesse spécifique, paramètres démographiques, etc.) et de méthodes statistiques appropriées. Cette étude a été réalisée sur la réserve du récif Aboré en Nouvelle-Calédonie. Les données issues de deux campagnes scientifiques menées sur ce récif sont utilisées pour tester globalement l'effet des AMP grâce à des modèles linéaires inférentiels (ANOVA, GLM), et par des méthodes de régression PLS (Partial Least Squares). Ces dernières permettent de confronter dans un même modèle quatre variables (densité, richesse, biomasse et taille moyenne des poissons), afin de retenir les plus sensibles et les plus pertinentes pour l'évaluation de l'impact de la réserve. La variabilité de l'habitat est également prise en compte dans la modélisation. Les espèces sont regroupées selon plusieurs critères: 1- le régime alimentaire; 2- la taxonomie; 3- la mobilité; 4- des caractéristiques démographiques; 5- des caractéristiques de taille. Les espèces, quel que soit leur mobilité, n'apparaissent pas affectées par l'ouverture à la pêche du récif Aboré, qu'elles soient sédentaires ou très mobiles. Seul le critère trophique révèle un effet du changement de statut Réserve/Non Réserve pour toutes les variables, à la fois d'après les modèles inférentiels et les régressions PLS. Les résultats des modèles inférentiels et des régressions PLS montrent que la richesse spécifique et la densité sont les variables les plus sensibles à l'impact de l'ouverture à la pêche. La taille moyenne est également bien modélisée sur l'ensemble des résultats mais pas la biomasse. Les résultats d'ANOVA et de régression PLS sont cohérents mais la régression PLS permet d'intégrer toutes les variables dans un même modèle
Aquatic Living Resources (0990-7440) (EDP Sciences), 2004-04 , Vol. 17 , N. 2 , P. 139-149

Droits : EDP Sciences, IFREMER, IRD 2004
http://archimer.ifremer.fr/doc/2004/publication-398.pdf
DOI:10.1051/alr:2004022
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/398/

Éditeur(s) : ICES-CM-1981/K:36
Résumé : Some trawlers from Lorient (France) are fishing for Nephrops at the North of 48th parallel. During the last years, the mesh size of their cod-end changed twice. It increased from 45 mm to 60 mm at the end of year 1978 and to 70 mm at the end of year 1979.'. Whereas the change to 60 mm seems to have no immediate- effect on Nephrops landings, the increase from 60 mm to 70 mm results in a loss in Nephrops landings of 30-40 %. That loss in Nephrops landings goes with an increase in some by-catches species as whiting, cod and hake.
Les langoustiniers Lorientais travaillant au nord du 48ème parallèle ont subi successivement deux augmentations de maillage. Ils sont passés du 45 mm au 60 mm en fin d'année 1978 puis au 70 mm en fin d'année 1979. Alors que le passage au 60 mm ne s'est pas fait sentir, le passage de 60 au 70 mm a provoqué une baisse des rendements en langoustine de 30-40 %. Cette baisse des rendements s'est accompagnée d'une augmentation des rendements de certains poissons comme le merlan, la morue et le merlu.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1981/acte-2345.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2345/

Résumé : This paper aims to establish a comprehensive Iist of exotic species introduced into Atlantic French waters over the last century as well as their origin, and the vectors involved in the process. At least 104 non indigenous species have been recorded in the Atlantic and Channel coastal wa• ters. Among those species, only a few (Bonamia ostreae, Crepidula fornicata) have resulted in highly significant negative impacts and side-effects on the coastal activity. In contrast, the introduction of the Japanese oyster Crassostrea gigas can be considered to be successful, sustaining a large industry counting more than 4,000 companies and 150,000 tons of yearly production. Over the last decade, French and European laws have strenghtened the controls over exotic species introductions, limiting their impacts. These new regulations and increased awareness from the scientific community with regard to coastal industry and biodiversity have reduced significantly the cases of deliberate introduction, while the risk analysis requirement has improved the overall management. However, in spite of these improvements, cases remain significant, mostly by accidental and/or increased vectors of introduction such as the ballast waters and sediment. Moreover, global changes should now be considered as a major issue, Iikely inducing future geographic distribution changes over a large European coastal range. Understanding the invasion population dynamics for exotic species remains a challenging research issue currently addressed by the French INVABIO multidisciplinary program.
Invasive aquatic species of Europe. Distribution, impacts and management. E. Leppäkoski, S. Gollasch & S. Olernin (eds).

Droits : 2002 Kluwer Academie Publishers. Printed in the Netherlands.
https://w3.ifremer.fr/archimer/doc/00000/3100/

Éditeur(s) : Cambridge Univ Press
Résumé : This paper offers a theoritical and empirical model of ecosystem-based fishery management. A multi-species and multi-fleet integrating Lotka-Volterra trophic dynamics as well as production and profit assessments is developed and applied to the coastal fishery of French Guiana. This small-scale fishery constitutes a challenging example with high fish biodiversity, several non-selective fleets and a potentially increasing local food demand due to demographic growth. The dynamic model is calibrated with 13 species and four fleets using monthly catch and effort data from 2006 to 2009. Several contrasted fishing scenarios including status quo, total closure, economic and viable strategies are then simulated. They are compared from the viewpoints of both biodiversity preservation and socioeconomic performance, assuming fixed landing prices and fixed costs. We show that fishing outputs, including food supply and fleet profitability, can be sustained on average but a loss of species cannot be avoided.
Environment And Development Economics (1355-770X) (Cambridge Univ Press), 2013-06 , Vol. 18 , P. 245-269

Droits : Cambridge University Press 2013
http://archimer.ifremer.fr/doc/00124/23483/21311.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00124/23483/21375.pdf
DOI:10.1017/S1355770X13000065
http://archimer.ifremer.fr/doc/00124/23483/

Éditeur(s) : Institut national agronomique Paris Grignon
Résumé : The flat oyster Ostrea edulis L. is the indigenous oyster of the Atlantic as well as the Mediterranean coasts of Europe. Its commercial exploitation dates back to Antiquity but its breeding is now threatened by two parasitic protozoa, among which Bonamia ostreae. Various aspects of the genetics of this species' natural and farmed populations have been studied with the aid of microsatellite markers. At first, the implementation and the screening of two partial genomic libraries made it possible to identify 28 new microsatellite loci. Analysis of the segregation of 12 of these loci and of two enzymatic loci shows that most microsatellite loci are transmitted in a Mendelian way, but some loci have significant segregation distortions. Moreover, seven linkage groups, of which four contain at least two markers, were identified in Ostrea edulis. The genetic variability of three populations selected for one or two generations for resistance to Bonamia ostreae was analysed with the aid of 5 microsatellite loci. In spite of the absence of genealogical data, we have shown that these selected populations were descended from a very low number of founding genitors (from 3 to 15 depending on the population) and for two populations, we were able to reconstruct the genealogy and the relationships between the individuals were identified. These selected populations have, in addition to a very low genetic variability, real and at times high levels of consanguinity. These results have a significant implication for the continuation of the selection programme (consanguinity management, augmentation of genetic variability by introducing wild genitors). The geographical structuring of the genetic variability of natural populations of Ostrea edulis has been analysed with the aid of 5 microsatellite loci on a sampling covering almost the entire distribution area of the species (from Norway to the Adriatic Sea). The results are consistent with those published in the literature and using enzymatic markers. The populations show a low level of differentiation that could correspond to a model of isolation by distance. The Atlantic populations, which have a reduced polymorphism, could be descended from post-glacial recolonisation from Mediterranean populations that had survived the glaciations of the Quaternary Period. The current distribution of flat oyster populations is surely also subject to anthropogenic activities. Finally, the genetic bases of the heterozygosis-growth correlation were studied in a natural population with the aid of enzymatic and microsatellite markers. Although leads favouring the direct contribution of enzymatic loci have been found, biases in the sampling design make it impossible to come to a formal conclusion. However, this study has made it possible to show that the capture of individuals over a short period (around ten days) leads to a sampling of a population descended from a very low number of founding genitors, in contradiction with the generally accepted idea that marine bivalve populations are large panmictic populations with significant, efficient numbers. These results confirm in a natural population the observations of a significant reduction of efficient sizes in hatchery populations.
L'huître plate Ostrea edulis L. est l'huître indigène des côtes européennes aussi bien atlantiques que méditerranéennes. Son exploitation commerciale remonte à l'Antiquité mais son élevage est aujourd'hui menacé par deux protozoaires parasites dont Bonamia ostreae. Différents aspects de la génétique des populations naturelles et cultivées de cette espèce ont été étudiés à l'aide de marqueurs microsatellites. Dans un premier temps, la réalisation et le criblage de deux banques génomiques partielles ont permis l'identification de 28 nouveaux locus microsatellites. L'analyse de la ségrégation de 12 de ces locus et de deux locus enzymatiques montre que la plupart des locus microsatellites sont transmis de façon mendélienne, mais certains locus présentent des distorsions de ségrégation importantes. Par ailleurs, sept groupes de liaison dont quatre contiennent au moins deux marqueurs ont été identifiés chez Ostrea edulis. La variabilité génétique de trois populations sélectionnées depuis une ou deux générations pour une résistance à Bonamia ostreae a été analysée à l'aide de 5 locus microsatellites. Malgré l'absence de données généalogiques, nous avons montré que ces populations sélectionnées étaient issues d'un très faible nombre de géniteurs fondateurs (de 3 à 15 selon les populations) et pour deux populations, la généalogie a pu être reconstituée et les liens de parenté entre les individus ont été identifiés. Ces populations sélectionnées présentent, outre une très faible variabilité génétique, des niveaux de consanguinité réels et parfois élevés. Ces résultats ont une implication importante pour la continuation du programme de sélection (gestion de la consanguinité, augmentation de la variabilité génétique par introduction de géniteurs sauvages). La structuration géographique de la variabilité génétique des populations naturelles d'Ostrea edulis a été analysée à l'aide de 5 locus microsatellites sur un échantillonnage couvrant presque toute l'aire de répartition de l'espèce (de la Norvège à la Mer Adriatique). Les résultats sont cohérents avec ceux publiés dans la littérature et utilisant des marqueurs enzymatiques. Les populations montrent un niveau de différenciation faible qui pourrait correspondre à un modèle d'isolement par la distance. Les populations atlantiques, qui présentent un polymorphisme réduit, pourraient être issues de recolonisation post-glaciaire à partir de populations méditerranéennes ayant survécu aux glaciations du Quaternaire. La répartition actuelle des populations d'huître plate est certainement aussi soumise aux actions anthropiques. Enfin, les bases génétiques de la corrélation hétérozygotie-croissance ont été étudiées dans une population naturelle à l'aide de marqueurs enzymatiques et microsatellites. Bien que des pistes en faveur de la contribution directe des locus enzymatiques aient été trouvées, des biais dans le dispositif expérimental ne permettent pas de conclure de façon formelle. Cependant, cette étude a permis de montrer que le captage d'individus sur une faible période (une dizaine de jours) conduit à l'échantillonnage d'une population issue d'un nombre très réduit de géniteurs fondateurs, en contradiction avec l'idée reçue que les populations de bivalves marins sont de larges populations panmictiques à effectif efficace important. Ces résultats confirment dans une population naturelle les observations de réduction importante des tailles efficaces dans des populations d'écloserie.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1998/these-1919.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1919/

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : A major goal of natural resource managers is to foster and maximize environmentally responsible behavior among resource users. Interpretation is the process of conveying a message to someone to (a) enhance the awareness and appreciation that the person has with their surroundings, and to (b) encourage pro-environmental actions. It is one management tool that can be used to influence the actions or inactions of recreational visitors. Effective interpretation prompts the target audience to take action and provides opportunities for the audience to take action. An understanding of behavior and behavior change guides interpretive efforts so that they are effective in influencing behavior. This paper investigates the application of behavioral principles to test the most effective interpretive messages in influencing snorkeler behavior in Mombasa Marine Park. Key messages were incorporated into a training workshop for all the snorkel boat operators and associated crew enabling them to deliver an interpretation program to their clientele. Results indicate that the introduced interpretation program successfully influenced the behavior of snorkeling clients (i.e. led to more pro-environmental snorkel behavior), and increased visitor satisfaction (largely due to the transfer of information through the guide).
Un objectif majeur de gestionnaires des ressources naturelles est de favoriser et d’optimiser le comportement respectueux de l’environnement parmi les utilisateurs des ressources. L’interprétation est le processus de transmission d’un message à quelqu’un pour (a) accroître la sensibilisation et l’appréciation que la personne de son environnement, et pour (b) encourager les actions pro-environnementales. C’est un outil de gestion qui peut être utilisé pour influencer les actions ou inactions lors des visites de loisirs. Une interprétation efficace oriente les actions du public et lui ouvre des possibilités d’action. Une compréhension du comportement et du changement du comportement guide les efforts d’interprétation afin qu’ils soient plus efficaces dans l’influence du comportement. Cet article étudie l’application des principes comportementaux pour tester l’interprétation la plus efficiente des messages qui influencent le comportement des randonneurs palmés dans le parc marin de Mombasa. Des messages clés ont été incorporés dans un atelier de formation destiné aux exploitants de bateaux de plongée avec tuba et à leur équipage pour formuler un programme d’interprétation à leur clientèle. Les résultats indiquent que le programme d’interprétation mis en place a réussi à influencer le comportement des clients de plongée en apnée (à savoir conduit à un comportement de plongée plus pro-environnement) et à augmenter la satisfaction des visiteurs (en grande partie en raison du transfert de l’information par le guide.
Kenya
Mombasa

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.8840
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/8840

Résumé : The maritime fisheries and mariculture guidance law passed in 1997 specifies that with the perspective of renegotiation of the common fisheries policy in 2002, a report on the special conditions of inshore fisheries be drawn up by the Government. To do so, the Minister of Agriculture and Fisheries entrusted this task to three experts, who are the authors of this report. In accordance with their remit, the situation of fisheries in territorial waters and estuaries of metropolitan France and the four DOM overseas departments ( counties) was examined, in the framework of meetings with professional fishermen, administrations, elected officials and scientific organisations. The first part situates fishing activities in coastal areas within the overall context of French fisheries. The second part provides a detailed report for each seafront (Channel, Atlantic, Mediterranean, West Indies, French Guyana and Reunion Island) on the regulatory framework, fleets, stocks, uses of resources and vulnerable areas of interest for fisheries. The report then analyses the competition within fisheries and with other activities (recreational fishing, extraction of aggregates, tourism, etc.). After these observations, the authors make ten proposals to improve the conditions under which coastal or inshore fisheries are practiced.
La loi d'orientation sur la pêche maritime et les cultures marines votée en 1997 précise que dans la perspective de la renégociation de la politique commune des pêches en 2002, un rapport sur les conditions particulières de l'exercice de la pêche dans la bande côtière sera établi par le Gouvernement. Pour y satisfaire, le Ministre de l'Agriculture et de la Pêche en a confié l'élaboration à trois experts, les auteurs du présent rapport. Conformément à la lettre de mission, la situation de la pêche dans les eaux territoriales et estuaires du territoire métropolitain et des quatre départements d'Outre-Mer a été examinée dans le cadre de rencontres avec les professionnels, les administrations, les élus, les organismes scientifiques. Une première partie permet de situer les activités halieutiques en zone côtière dans le contexte global de la pêche française. La seconde partie est un bilan détaillé par façade (Manche, Atlantique, Méditerranée, Antilles, Guyane, Réunion) du cadre réglementaire, des flottilles, des ressources, des usages de la ressource et des zones sensibles d'intérêt halieutiques. Le rapport analyse ensuite les compétitions au sein de la pêche et avec d'autres activités (pêche récréative, extractions de granulats, tourisme,...). A l'issue de ces différents constats, les auteurs font dix propositions pour améliorer les conditions d'exercice de la pêche en zone côtière.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2000/rapport-1200.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1200/

Résumé : Spiny lobsters are an important component of the coastal fisheries around the Martinique island. This study aimed to assess the contamination by kepone of the two main species Panulirus argus and P. guttatus in the main fishery area laying along the eastern coast of Martinique. The objectives of the study were to describe the distribution of the spiny lobster contamination in the area, to explore possible relationships with some biological parameters such as individual size, sex and colour of tegument, as well as characterize difference of kepone concentration between the muscle and soft flesh of the head, in view of helping the definition of further fishery management measures. The analyses were done from chemical analyses of 125 samples of spiny lobsters gathered from 2008 to 2010 all around the island, and from a specific set of 200 new observations from a specific survey carried out in 2011 in the study area. For both species, the results show a diffusion of the contamination all over the coral shoals, close to contaminated catchment basins, with a strong decrease just outside these areas. For the Caribbean spiny lobster, a strong relationship between kepone concentration and individual size was identified, and less for the Spotted spiny lobster. For the two species, the concentration of kepone found in soft flesh of the head was more than twice as in the muscle. Finally, the difference of contamination between the two species appeared strongly linked with their biology.
La langouste blanche Panulirus argus et la langouste brésilienne P. guttatus représentent environ 25 % du chiffre d’affaires des pêcheurs professionnels de Martinique. Une part très importante des captures de ces espèces proviennent du platier continental de la zone centre-atlantique de l’île. L’étude réalisée en 2011 visait à approfondir les connaissances sur la distribution de la contamination par la chlordécone des langoustes dans la zone centre- atlantique de la Martinique, d’explorer d’éventuelles relations entre cette contamination et des paramètres biologiques des individus comme la taille, le sexe et leur pigmentation tégumentaire, et d’analyser la différence de contamination entre la queue et les chairs molles du céphalothorax, en vue d’aider à la définition de mesures de réglementation de la pêche dans ce secteur. L’étude s’appuie sur un ensemble de 125 échantillons rassemblés de 2008 à 2010 pour les deux espèces autour de la Martinique, complétés par 200 échantillons constitués pour la présente étude dans la zone centre-atlantique en 2011. Le rapport est précédé d’un rappel d’éléments sur la biologie et sur l’état de la pêche des langoustes en Martinique. Pour les deux espèces, l’étude met en évidence une extension de la contamination à l’ensemble du platier corallien au pied des bassins versants contaminés, puis une nette diminution au-delà. Pour la langouste blanche, cette contamination est en relation avec la taille des individus, en liaison avec leur plongée progressive vers le large. Cette relation avec la taille est moins marquée pour la langouste brésilienne, espèce beaucoup plus inféodée aux eaux littorales. Pour les deux espèces, les chairs molles du céphalothorax apparaissent plus de deux fois plus contaminées que le muscle caudal. Les différences de contamination observées entre langouste blanche et la langouste brésilienne sont cohérentes avec les connaissances sur la biologie de chaque espèce.

Droits : Délégation Antilles
http://archimer.ifremer.fr/doc/00088/19971/17638.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00088/19971/

Résumé : Fish aquafarming is an activity that is starting to take off in Martinique as possible diversification of giant river prawn breeding (Macrobrachium Rosenbergii) which debuted in the middle of the 70s. Two species were involved, one freshwater species (the red tilapia or Saint-Pierre) and a marine species (the redfish or red drum). This mission report presents, in the first section, the local conditions of fish aquafarming development in Martinique – the current characteristics of the breeds, the existing production sector and its management. A second section inventories the main operating constraints of this field – technical or market constraints.
(OCR non controlé) L'aquaculture de poisson est une activité en démarrage en Martinique comme diversification possible de l'élevage de la chevrette (Macrobrachium Rosenbergii) débuté au milieu des années 70. Deux espèces sont concernées, une espèce d'eau douce (le tilapia rouge ou Saint-Pierre pays) et une espèce marine (le redfish ou ombrine tropicale). Ce rapport de mission présente dans une première section, les conditions locales de développement de l'aquaculture de poisson en Martinique - les caractéristiques actuelles des élevages, le secteur de production existant et son encadrement-. Une seconde section recense les principales contraintes de fonctionnement de la filière -contraintes techniques ou de marché.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1990/rapport-2421.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2421/

Éditeur(s) : Mercator Ocean
Résumé : Face to the lack of data to assess precisely the spatial distribution of catches and fishing effort and for the environmental characterization of the fishing area, Ifremer has been implemented since 2005 a new project, Recopesca. It consists in fitting out a sample of voluntary fishing vessels with sensors recording data on fishing effort (and at mid-terms catches) and physical parameters such as temperature or salinity. Recopesca aims at setting up a network of sensors, for scientific purposes, to collect data and improve resources assessment and diagnostics on fisheries, and environmental data required for ecosystem-based management initiatives. The challenge was to develop sensors with no trouble for the fishermen, tough enough to be fixed up on fishing gears, self powered and autonomous. Insofar as the sample of targeted vessels intends to be representative of all the metiers and fleets, the sensors are modular and scalable to collect new data. Different sensors have been implemented: (i) a temperature-salinity sensor, able to record physical parameters, depth and duration of immersion, for passive and active gears, and (ii) a specific sensor to record number or length of passive gears. A GPS monitors the position of the vessels and the temperature or salinity profiles and series. Each sensor is equipped with a radio device transferring the data to a receiver on-board, called “concentrator” that sends the data to Ifremer central databases by GPRS. An anti-rolling weigh-scale has been developed and is currently on test to record catches per species and fishing operation. The presentation will show the first data and results of this participative approach.
Mercator Ocean - Quarterly Newsletter (Mercator Ocean), 2010-04 , N. 37 , P. 40-48

Droits : 2010 Mercator Ocean
http://archimer.ifremer.fr/doc/00024/13500/10514.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00024/13500/

Éditeur(s) : Styli 2003. Trente ans de crevetticulture en Nouvelle-Calédonie. Nouméa - Koné, 2-6 juin 2003. 2004. Gorarant C, Harache Y, Herbland A, Mugnier C. Ed. Ifremer, Actes de Colloque, n°38, pp.113-120
Résumé : Two oyster species are currently present along the French coasts : the indigenous European flat oyster (Ostrea edulis), and the Pacific cupped oyster (Crassostrea gigas), that has been introduced from Japan since the beginning of the 70ies. The flat oyster successively suffered from two protozoan diseases during the 60ies and its production decreased from 20 000 tons/year by that time to 1 500 tons/year nowadays. Consequently, the oyster production is principally (99%) based upon the Pacific oyster species with approximately 150 000 tons/year among which 90% are grown from the natural spat. However, the hatchery production of this species is developing and was estimated to 400 to 800 millions spat in 2002. Moreover, strengthened relationships between IFREMER and the 5 commercial hatcheries, that all joined the SYSAAF (Union of the French poultry, shellfish and fish farming selectors), allow to plan for new genetic breeding programs. At the end of the 80ies, IFREMER initiated a genetic breeding program for the resistance of the European flat oyster to the bonamiosis, and obtained strains more tolerant to this disease. After two generations of massal selection, molecular markers had identified a reduced genetic basis in this program. It was then reoriented to an intra-familial selection. However, we were confronted to a zootechnic problem to manage such a scheme and we compromised by an intra-cohorts of families selection scheme managed using molecular markers. The program has now reached the transfer level with experimentation at a professional scale. Concerning the Pacific cupped oyster, and in parallel with the obtaining and the study of polyploids, performance of different Asian cupped oyster strains were compared to the one introduced in France thirty years ago and currently suffering from summer mortalities. The local strain exhibited better performance, certainly based upon a good local adaptation. In other respects, although early growth is a relevant criteria for selection for growth to commercial stage, it is not to be privileged in the context of an oyster producing region with a limited food availability. Contrary, the spat summer mortality became a priority for numerous teams (genetic, physiology, pathology, ecology,...) joined in the MOREST program. The first results showed important survival differences between fullsib and halsib families. They indicate a genetic determinism to this character "survival" and promote for its selection.
Deux espèces d'huîtres sont aujourd'hui présentes sur les côtes françaises : l'huître plate européenne (Ostrea edulis), indigène, et l'huître creuse du Pacifique (Crassostrea gigas), introduite du Japon dans le début des années 1970. L'huître plate a subi coup sur coup, dans les années 1960, deux maladies dues à des protozoaires parasites et sa production est ainsi passée de 20 000 t/an dans les années 1960 à 1500 t/an aujourd'hui en France. Il en résulte que la filière ostréicole française repose quasiment exclusivement (99%) sur la production de l'huître creuse, C. gigas, avec 150 000 tonnes en 2000 dont environ 90% est issu du captage naturel. Cependant, la reproduction de cette espèce en écloserie est actuellement en expansion avec une estimation de 400 à 800 millions de naissains commercialisés en 2002. Des rapports renforcés entre l'IFREMER et les cinq écloseries françaises de la filière ostréicole, qui adhèrent toutes au SYSAAF (SYndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français), permettent désormais d'envisager le développement de nouveaux programmes d'amélioration génétique. A la fin des années 1980, un programme de sélection pour la résistance de l'huître plate à la bonamiose a été initié au sein de l'IFREMER, et a permis d'obtenir des souches plus tolérantes à cette maladie. Après deux générations en sélection massale, les marqueurs moléculaires avaient mis en évidence une base génétique réduite au sein de ce programme qui s'était alors orienté vers une sélection intra-familiale. Devant la lourdeur zootechnique d'un tel schéma, un compromis a été trouvé en réalisant une sélection au sein de cohortes de familles biparentales, la gestion de ces cohortes étant permise par les analyses moléculaires. Le programme est maintenant dans sa phase de transfert, avec des expérimentations à plus grande échelle en partenariat avec la profession. En ce qui concerne l'huître creuse, et en parallèle de l'obtention et l'étude de polyploïdes, les performances de différentes souches d'huîtres creuses provenant d'Asie ont été comparées à celles de la souche introduite en France il y a trente ans, sujette à des mortalités estivales. La souche locale présente de meilleures performances, vraisemblablement grâce à une adaptation bien réalisée. Par ailleurs, bien que l'amélioration de la croissance jusqu'à la taille commerciale s'avère possible par une sélection précoce au stade larvaire, le critère de croissance n'est pas nécessairement à privilégier dans le contexte d'un bassin ostréicole disposant de ressources trophiques limitées. En revanche, les importantes mortalités rencontrées par le naissain en périodes estivales constituent le sujet d'étude prioritaire sur lequel se sont penchées de nombreuses équipes (génétique, physiologie, pathologie, écologie, ...) dans le cadre du grand défi MOREST. Les premiers résultats ont mis en évidence de fortes différences de survie entre des familles biparentales d'animaux indiquant un déterminisme génétique du caractère « survie », et encourageant dans la voie d'une sélection pour ce caractère.

Droits : 2004 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-3491.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3491/

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : L’article présente les différences de perception entre les touristes et les résidents en matière de protection de l’environnement marin et côtier. Il s’appuie sur les résultats des études menées à l’échelle de la Martinique en 2010 dans le cadre de l’évaluation de la valeur économique et sociale des récifs coralliens et écosystèmes associés et à celle de la commune du Prêcheur en 2011 dans le cadre de la mise en place de la réserve marine régionale. Il met en exergue les éléments qui composent les disparités de perception et de souhaits quant aux mesures de gestion des espaces littoraux. Il montre toutefois que la création d’une aire marine protégée dans la commune du Prêcheur emporte l’adhésion de tous.
The article presents the differences in perception between the tourists and residents regarding the protection of the marine and coastal environment. It is based on the results of studies conducted across Martinique in 2010, in the framework of the evaluation of the economic and social value of coral reefs and associated ecosystems, and at the level of the rural community of le Prêcheur in 2011, in the context of the implementation of the regional marine reserve. It highlights the elements that compose the disparities of perception and wishes with respect to coastal areas management measures. It shows, however, that the creation of a marine protected area in the commune of le Prêcheur has the unanimous support of all.
Martinique
Prêcheur

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.9351
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/9351

Éditeur(s) : Inter-Research
Résumé : The Biocean database was designed to collate the extremely large volume of data collected from different deep-sea ecosystem studies conducted by Ifremer's department of 'Environnement Profond' (Deep-Sea Environment). This database comes in a 6-application package: 2 of them are used on research vessels to collect operational data, whereas the others are used to link with a core database back on land. The latter are used to: (1) manage taxonomic nomenclature, (2) monitor the identification of faunal collections, (3) fill in chemical analyses results or measurement data files and (4) add or extract data from the database. Biocean was designed to facilitate ecosystem studies in the deep sea. It represents an important new resource for deep-sea ecologists and will have wide applications in biogeography and biodiversity studies at Ifremer, but also for the international community, as faunal data are linked to the Census of Marine Life information system OBIS (Ocean Biogeographic Information System). Biogeographical analyses of Biocean data recovered through the OBIS portal evidence an evolution in the deep-sea sampling strategies more focused in limited areas and is intended to reveal ecosystems functioning.
Marine Ecology Progress Series (0171-8630) (Inter-Research), 2006-07 , Vol. 316 , P. 215-224

Droits : 2006 Inter-Research
http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/publication-1581.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1581/

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Le groupe de recherche sur les avancées en pneumo-pédiatrie (GRAPP) a élaboré en 2013 des recommandations sur l'utilisation des nouveaux outils diagnostiques dans les infections respiratoires basses de l'enfant de plus de trois mois. Ces recommandations sont présentées ici en un texte court, le texte long est disponible sur le site de la Société française de pédiatrie www.sfpediatrie.com et de la Société pédiatrique de pneumologie et d'allergologie (SP2A) www.sp2a.fr.
ISSN: 0929-693X

hal-00994569
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-00994569
DOI : 10.1016/j.arcped.2014.01.004
PUBMED : 24613479

Éditeur(s) : Edp Sciences S A
Résumé : It is estimated that fish aggregating devices (FADs) are now used for over 40% of world tropical tuna catches, making this technique a major phenomenon for high seas fisheries worldwide, and one that has experienced great expansion over the past three decades. The question of whether the FAD is a good or a bad tool for the exploitation of marine resources depends on many parameters. To respond to this question, it is necessary to distinguish different scales of exploitation (artisanal vs. industrial) and various types of FADs (anchored vs. drifting), but it is also very important to gather more data and conduct further research on this topic to gain a better understanding of the phenomenon and of its impacts. As such, twelve years after the first international conference devoted to FADs, which was held in Martinique (French West Indies), a new multi-scalar global assessment of FAD fisheries development and a review of the progress of research in this field was deemed vital. The latest international conference, "Tuna Fisheries and Fish Aggregating Devices", was held in Tahiti in November 2011, and it was an event that welcomed nearly 150 conference attendees from 40 different countries, three ocean regions, and the Mediterranean. This is an analysis of the relevant literature gathered by the author in the bibliographic database FADBASE. Then, the major issues already addressed by the scientific community are set out, and gaps and research priorities are highlighted for anchored and drifting FADs management.
Aquatic Living Resources (0990-7440) (Edp Sciences S A), 2013-01 , Vol. 26 , N. 1 , P. 25-35

Droits : EDP Sciences, IFREMER, IRD 2013
http://archimer.ifremer.fr/doc/00137/24835/22915.pdf
DOI:10.1051/alr/2013043
http://archimer.ifremer.fr/doc/00137/24835/

Résumé : Since 2000, the exploitation of the deep demersal fish (200-700 m) with the use of electric winches has been increasing in Reunion island ; and this has needed a new appraisal of yields (CPUE) and individual fish sizes, as indicators of the state of the fish stocks. A first survey has been carried out at the first half of 2011, in order to set up the comparison with a previous survey in 2000 on the West coast of Reunion island. Drops of yields and sizes could be pointed out, attesting the overexploitation of the commercial species (Fleury et al 2011). This present report displays the results of a second campaign, carried out in the second half of 2011 all around the island. 32 fishing trips have been conducted which have permitted 251 fishing operations. The overexploitation (i.e. decreasing of yields and fish sizes) has been confirmed in the West of the island, and in a lower stage in the North. Yields are better in the East and the South. As much as in the first survey, the small non commercial sharks (Squalus megalops) could be countered for half of the catches. At the same time, 2 hook sizes have been tested and the small hooks have displayed a better efficiency in number of catches but not in global weight. Various types of bait have been tested and meat of small local pelagic fish (Selar crumenophtalmus and Decapterus macarellus) have appeared to be the most efficient. This report provides helpful indicators for the management of fish stocks which have been poorly surveyed and poorly regulated till now.
Depuis 2000, la pêche aux poissons démersaux profonds (200-700 m) à l'aide de virelignes électriques s'est développée à La Réunion ; et le besoin se faisait sentir d'une évaluation des rendements (CPUE) et des tailles individuelles de capture, indicateurs halieutiques classiques des états de stocks. Une première campagne a été réalisée au 1er semestre 2011 pour établir la comparaison avec une campagne de prospection réalisée en 2000 dans l'ouest de La Réunion. Elle a mis en évidence des baisses marquées des rendements et des tailles de capture, signes d’une surexploitation des espèces commerciales (Fleury et al 2011). Ce rapport présente les résultats d'une 2e campagne de prospection étendue à tout le tour de l'île. 32 marées ont été réalisées permettant la mise à l'eau de 251 filages. La surpêche (baisse des rendements et des tailles de poisson) est confirmée dans l'ouest et à un moindre degré sur la côte nord. Les rendements sont meilleurs dans l'est et le sud. Comme dans la première campagne, les requins zépines (Squalus megalops), non commercialisés à La Réunion, représentent la moitié des captures. Parallèlement, 2 tailles d'hameçons ont été comparées et les petits hameçons ont donné une augmentation du nombre de captures, mais pas du poids global. Des comparaisons ont aussi porté sur les types d'appât et les laizes de petits pélagiques locaux (pêche-cavale et bancloche) se sont révèlées les plus efficaces. Ce rapport fournit des indicateurs utiles à la gestion de stocks jusqu'ici peu suivis, et peu encadrés.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00089/20048/18049.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00089/20048/

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : La création de la Réserve marine régionale du Prêcheur va entrainer la mise en place de mesures de gestion des activités de pêche dans son périmètre. Si, à court terme, les pêcheurs vont subir quelque peu les conséquences négatives de la restriction de leurs pratiques de pêche, ils vont, à moyen et long terme, en tirer des bénéfices substantiels. L’augmentation de biomasse due à l’effet réserve va en effet redynamiser la pêche dans cette zone et faire revivre les pratiques traditionnelles comme la pêche à la ligne, à la piscine ou au jig, abandonnées ces dernières années faute de rendements suffisants.
The creation of regional marine reserve of Prêcheur will lead to the implementation of fisheries management measures within the perimeter of the reserve. From a short-term perspective, fishers will see limitations of their fishing practices. But, from a longer-term perspective, they should gain substantial benefits from these restrictions; the increase of biomass due to the “reserve effect” should lead to increased volumes of catches in fishing areas. It should also lead to an enhancement of traditional practices such as line fishing, jig or “piscine” fishing, which have been abandoned for several years in spite of their lesser impact on marine ecosystems.
Martinique

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.6644
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/6644

Éditeur(s) : Elsevier Sci Ltd
Résumé : Bycatch of endangered marine turtles is a growing issue for the management of all fisheries, including the oceanic purse-seine fishery. The aim of this study was to assess the spatial and temporal variation in bycatch rates of these species in the entire European purse-seine fishery operating in the Atlantic and Indian oceans. The study was based on data collected through observer programs from 1995 to 2011. During that period, a total of 15 913 fishing sets were observed, including 6 515 on Drifting Fish Aggregating Devices (DFADs) and 9 398 on free swimming schools, representing a global coverage of 10.3% and 5.1% of the total fishing activity in the Atlantic and Indian Ocean, respectively. Moreover, from 2003 to 2011, 14 124 specific observations were carried out on DFADs to check turtle entanglement in the net covering DFADs. We found that the purse-seine fishery has a very low impact on marine turtles. We estimated that the annual number of individuals incidentally captured was 218 (SD = 150) and 250 (SD = 157) in the Atlantic and Indian Ocean, respectively, with more than 75% being released alive. The present study also investigated the impact of DFADs; which is considered a key conservation issue for this fishery. Drifting objects may play a key role in aggregating juveniles of marine turtles, implying the need for improving their construction to avoid entanglement (e.g. avoiding nets in the structure); however, based on our study it is not the main source of incidental captures of marine turtles in this fishery.
Biological Conservation (0006-3207) (Elsevier Sci Ltd), 2014-10 , Vol. 178 , P. 74-87

Droits : 2014 Elsevier Ltd. All rights reserved
http://archimer.ifremer.fr/doc/00206/31760/30632.pdf
DOI:10.1016/j.biocon.2014.06.020
http://archimer.ifremer.fr/doc/00206/31760/

Éditeur(s) : Elsevier
Résumé : The ZoNeCo programme, devoted to the evaluation of living and non-living marine resources within the Economic Zone of New Caledonia, illustrates clearly the Marine Benthic Habitats concept. It exhibits the study of the physical environment and disciplines such as geology and physical oceanography. The results acquired in these fields are used as bases to study the presence and the distribution of living species within a given habitat. The knowledge of all the parameters relative to each discipline is a useful guide for the evaluation and the sustainable management of living and nonliving resources.
Le programme ZoNéCo d'évaluation des ressources marines vivantes et non vivantes de la zone économique de Nouvelle-Calédonie illustre clairement le concept d'habitat benthique marin. Il implique l'étude du milieu physique et les disciplines telles que la géologie, la géophysique et l'océanographie physique. Les résultats acquis serviront de base à l'étude de la présence et de la répartition des espèces vivantes dans un habitat considéré. La connaissance de l'ensemble des paramètres relatifs à chacune des disciplines est un guide précieux pour l'évaluation et la gestion harmonieuse des ressources.
Oceanologica Acta (0399-1784) (Elsevier), 1999-11 , Vol. 22 , N. 6 , P. 557-566

Droits : 1999 Ifremer / CNRS / IRD / Editions scientifiques et medicales Elsevier SAS
http://archimer.ifremer.fr/doc/1999/publication-832.pdf
DOI:10.1016/S0399-1784(00)88947-1
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/832/