Éditeur(s) : EDP Sciences
Résumé : Bonamiosis is a parasitic disease (causative agent: Bonamia ostreae) affecting the European flat oyster Ostrea edulis, responsible for a drastic decline in its aquaculture production. Selective breeding programs for resistance to bonamiosis have been undertaken to counter this disease. In the present study, a 6-month cohabitation challenge experiment was performed in order to transmit the disease from wild oysters injected with the parasite to two tested families of oysters (20 and 8-month old at the beginning of the experiment, with different genetic backgrounds) originating from a selective breeding program developed by IFREMER in France. Mortalities were checked daily and ventricular heart smears were performed on dying or moribund oysters to detect the level of infection by B. ostreae. Mortality started after 4 months of cohabitation in the tested oysters. The cumulative mortalities after 6 months were 58% for the wild oysters, 9% for Family 1 (20-month old) and 20% for Family 2 (8-month old). In the dying oysters, the parasite could be detected in 67% of the wild oysters, 68% of Family 1 and 89% of Family 2. It was detected in only 11% of the surviving oysters of Family 2. The mortality and the level of infection by the parasite were significantly higher in Family 2 than in Family 1. Our results demonstrate that prespawning oysters as young as 1 year-old can become infected with the parasite and, most importantly, can die from bonamiosis. This result is inconsistent with the commonly accepted critical age of 2 years-old for the disease development. Additionally, no clear relationship between shell length and level of infection was observed. We also review the different methods for infection of the European flat oyster O. edulis with B. ostreae under experimental conditions and their main results.
La bonamiose est une maladie parasitaire (agent causal : Bonamia ostreae) affectant l'huître plate européenne Ostrea edulis, responsable d'un déclin drastique de sa production aquacole. Des programmes de sélection pour la résistance à la bonamiose ont été entrepris pour contrer cette maladie. Dans cette étude, une expérience de 6 mois d'infection par cohabitation a été réalisée de manière à transmettre la maladie à partir d'huîtres sauvages injectées avec le parasite vers deux familles testées d'huîtres (âgées de 20 et 8 mois en début d'expérience, avec des origines génétiques différentes) issues du programme de sélection développé par IFREMER en France. Les mortalités ont été vérifiées quotidiennement et des frottis de coeur ventriculaire réalisés sur les huîtres mortes ou moribondes pour détecter le niveau d'infection par B. ostreae. La mortalité a commencé chez les huîtres testées après 4 mois de cohabitation. Les mortalités cumulées après 6 mois étaient de 58 % chez les huîtres sauvages, 9 % chez la Famille 1 (âgées de 20 mois) et 20 % chez la Famille 2 (âgées de 8 mois). Chez les huîtres mourantes, le parasite a pu être détecté chez 67 % des huîtres sauvages, 68 % de la Famille 1 et 89 % de la Famille 2. Il n'a pu être détecté que chez 11 % des huîtres survivantes de la Famille 2. La mortalité et le niveau d'infection par le parasite étaient significativement plus élevés chez la Famille 2 que chez la Famille 1. Nos résultats démontrent que des huîtres âgées de un an peuvent devenir infectées par le parasite et surtout, peuvent mourir de bonamiose. Ce résultat contraste avec l'âge critique de développement de la maladie communément accepté de 2 ans. De plus, aucune relation claire entre la longueur de la coquille et le niveau d'infection n'a été observée. Nous faisons également la revue des différentes méthodes d'infection de l'huître plate européenne O. edulis avec B. ostreae en conditions expérimentales et leurs principaux résultats.
Aquatic Living Resources (0990-7440) (EDP Sciences), 2008-12 , Vol. 21 , P. 423-439

Droits : EDP Sciences, IFREMER, IRD 2008
http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/publication-4783.pdf
DOI:10.1051/alr:2008053
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4783/

Éditeur(s) : Elsevier
Résumé : The gametogenic cycle and the reproductive effort of the blacklip pearl oyster, Pinctada margaritifera, cultivated in Takapoto lagoon were studied for a 1-year period (March 1997-April 1998) by bimonthly observations of gonadal sections, dry tissue weights and gonadal index in a population of pearl oyster composed of three age-groups. pearl oysters attained sexual maturity in the end of their first year (height approximate to 40 mm), implying that P. margaritifera is a late-maturing species in comparison with other Pteriidae. This species was also confirmed to be a marked protandrous successive hermaphrodite in culture, with 100 % of males at first maturity and 75 % in older pearl oyster (height > 120 mm). The general pattern of gametogenic activity, fairly synchronous in both sexes, was comparable with that of other tropical bivalves: reproduction occurs continuously throughout the year with a maximal activity during the warm season (November-May). No resting period was observed. Quantitative growth data showed that P. margaritifera exhibits an annual synchronised polymodal spawning pattern, with two spawning peaks in age-group I (height approximate to 70 mm) and five in age-groups II (height approximate to 100 mm) and III (height approximate to 120 mm). Spawning was sometimes incomplete, nevertheless a clear relationship between gamete production (P-R, g) and size (height H, mm) was obtained: P-R = 5.26 x 10(-7) H-2.91 (R-2 = 0.99, p < 0.05). Estimation of P-R was used to calculate the annual reproductive effort in P. margaritifera. Reproductive effort (%) was similar to those calculated for temperate species and showed a progressive increase with the age of pearl oyster, from 7 % in age-group I to 38 % in age-group III. This study showed that, in a fairly stable tropical environment such as the Takapoto lagoon, P. margaritifera is a multiple spawner, which uses an opportunistic reproductive strategy, allowing investment all year around, of any surplus energy into gamete production. Surplus energy is ensured by the high pumping rates developed by this non-symbiotic bivalve to succeed in low seston conditions. (C) 2000 Ifremer/Cnrs/Inra/Ird/Cemagref/Editions scientifiques et medicales Elsevier SAS.
Le cycle et l'effort de reproduction de l'huître perlière à lèvres noires, Pinctada margaritifera, cultivée dans le lagon de Takapoto, ont été étudiés sur une période annuelle (de mars 1997 à avril 1998), par un suivi bimensuel des stades de maturation et des indices gonadiques, sur une population en élevage composée de trois groupes d'âge (1, 2 et 3 ans). Cette étude a confirmé que P. margaritifera est une espèce qui se reproduit tardivement par rapport aux autres Ptériidés (elle atteint sa maturité sexuelle à la fin de sa première année, pour une hauteur approximative de 40 mm). Par ailleurs, elle présente, en élevage, une protandrie marquée (100 % de mâles à première maturité, 75 % pour des huîtres âgées de trois ans). Le schéma général de sa gamétogenèse, relativement synchrone dans les deux sexes, est comparable à celui des autres bivalves tropicaux : la reproduction est quasiment continue (aucune période de repos sexuel) avec une activité accrue en saison chaude (de novembre à mai). L'analyse des variations du poids de la gonade suggère l'existence de deux pics d'émission de gamètes chez les huîtres de un an et cinq pics chez les huîtres de 2 et 3 ans (cycle de reproduction de type polymodal). Bien que ces émissions de gamètes soient parfois incomplètes, une relation entre la production de gamètes (PR, en g) et la taille de l'huître perlière (hauteur, H, en mm) a été établie : PR = 5,26 x 10-7 H2,91 (R2 = 0,99, p < 0,05). Ces résultats ont permis de calculer l'effort de reproduction de P. margaritifera à Takapoto et sur un bilan annuel : il augmente avec l'âge de l'huître perlière de 7 % pour le groupe d'âge I à 38% pour le groupe d'âge III. Ces valeurs annuelles sont similaires à celles calculées chez les bivalves de milieux tempérés. Cette étude a donc montré que, dans un environnement tropical assez stable tel que celui du lagon de Takapoto, P. margaritifera présente une reproduction continue, avec plusieurs pics d'émission de gamètes par an. Cette stratégie « opportuniste » permet l'investissement, de tout surplus d'énergie en production de gamètes, tout au long de l'année. Malgré la faible concentration du milieu en nourriture, ces surplus d'énergie sont assurés par les fortes capacités de filtration développées par cette espèce tropicale non-symbiotique.
Aquatic Living Resources (0990-7440) (Elsevier), 2000 , Vol. 13 , N. 1 , P. 37-48

Droits : 2000 Ifremer/Cnrs/Inra/Ird/Cemagref/Éditions scientifiques et médicales Elsevier SAS
http://archimer.ifremer.fr/doc/2000/publication-1391.pdf
DOI:10.1016/S0990-7440(00)00135-2
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1391/

Éditeur(s) : GFP : Groupe Français des Pesticides
Extrait de : "Protection des cultures et santé environnementale : héritages et conceptions nouvelles" : congrès, le 26 mai 2014. Université des Antilles et de la Guyane
Description : Les effets d'un mélange de pesticides représentatif des eaux des bassins ostréicoles à des concentrations proches de celles retrouvées dans l'environnement, ont été étudiées pour déterminer si ce mélange pouvait affecter le niveau de sensibilité des huîtres creuses vis-à-vis de l'infection à OsHV1.
Siècle(s) traité(s) : 21
Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
Permalien : http://www.manioc.org/fichiers/V14195
V14195

Éditeur(s) : Université de La Rochelle, Ecole doctorale Gay Lussac
Résumé : The thesis work is part of the very current issue on mass mortality outbreaks affecting Pacific oyster, C. gigas, spat and juveniles and questions about the involvement of pesticides in this phenomenon. The first part of this thesis was devoted to study the effects of pesticides on hemocyte parameters in the Pacific oyster (in vitro and in vivo). The immunomodulator effect of selected pesticides (alone or in mixture) has been explored principally through flow cytometry. The second part concerned the study of the effects of a pesticides mixture on OsHV-1 itself. No direct effects have been reported on the viral particles in presence of the pollutants. Moreover, pesticide effects on Pacific oysters were also explored through experimental pathology assays after treatment of animals with a polluant mixture. Results showed that pesticide treated oysters appeared more susceptible to the viral infection in experimental conditions. The third part concerned the study of autophagy in the Pacific oyster, C. gigas. The publication of the complete genome in 2012 has opened up new possibilities for the study of innate immunity in this species. The study of autophagy for the first time in oysters consisted in a first step in the in silico search for genes involved in this pathway and the corresponding proteins by Western blotting. Then, the role of this important process in innate immunity has been explored through reproduction infections tests with or without modulators of autophagy. Results showed that autophagy appeared as involved in defence mechanisms against viral and bacterial infection in Pacific oysters.
Le travail de thèse s’inscrit dans la problématique très actuelle des mortalités massives de naissain et de juvéniles d’huîtres creuses, C. gigas, et des questionnements autour de l’implication des pesticides dans ce phénomène. La première partie de la thèse a été consacrée à l’étude des effets de pesticides sur les capacités hémocytaires de l’huître creuse (in vitro et in vivo). L’effet immunomodulateur des xénobiotiques sélectionnés (seul ou en mélange) a été exploré principalement au travers de la cytométrie en flux. La deuxième partie de la thèse a concerné l’étude des effets d’un mélange de pesticides sélectionnés sur le virus OsHV-1 et l’infection qu’il induit chez l’huître creuse. Les effets des pesticides sur le virus lui-même ont été évalués. Les expériences réalisées non pas permis de mettre en évidence dans les conditions testées, de dégradation des particules virales en présence des polluants. D’autre part, leurs effets sur les huîtres elles-mêmes ont été explorés après traitement des animaux avec un mélange de pesticides lors d’essais de pathologie expérimentale. Il a ainsi pu être montré que des huîtres préalablement comtaminées par un mélange de pesticides à des concentrations retrouvées dans l’environnement semblaient être plus sensibles à l’infection virale. La troisième partie de la thèse a concerné l’étude de l’autophagie chez l’huître creuse, C. gigas. La publication du génome complet de cette espèce en 2012 a ouvert de nouvelles possibilités pour étudier l'immunité innée. L’étude de l’autophagie réalisée pour la première fois chez l’huître creuse a consisté lors d’une première étape en la recherche in silico de gènes impliqués dans cette voie et des protéines correspondantes par western blotting. Puis, le rôle de ce processus important dans l’immunité innée a été exploré au travers d’essais de reproduction d’infections en présence ou non de modulateurs de l’autophagie. Les résultats obtenus semblent montrer que l’autophagie soit un processus important pouvant être impliqué dans les capacités de défense de l’huître creuse vis-à-vis d’infections virales et bactériennes.

Droits : 2014 Université de La Rochelle
http://archimer.ifremer.fr/doc/00226/33740/32149.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00226/33740/

Éditeur(s) : Styli 2003. Trente ans de crevetticulture en Nouvelle-Calédonie. Nouméa - Koné, 2-6 juin 2003. 2004. Gorarant C, Harache Y, Herbland A, Mugnier C. Ed. Ifremer, Actes de Colloque, n°38, pp.113-120
Résumé : Two oyster species are currently present along the French coasts : the indigenous European flat oyster (Ostrea edulis), and the Pacific cupped oyster (Crassostrea gigas), that has been introduced from Japan since the beginning of the 70ies. The flat oyster successively suffered from two protozoan diseases during the 60ies and its production decreased from 20 000 tons/year by that time to 1 500 tons/year nowadays. Consequently, the oyster production is principally (99%) based upon the Pacific oyster species with approximately 150 000 tons/year among which 90% are grown from the natural spat. However, the hatchery production of this species is developing and was estimated to 400 to 800 millions spat in 2002. Moreover, strengthened relationships between IFREMER and the 5 commercial hatcheries, that all joined the SYSAAF (Union of the French poultry, shellfish and fish farming selectors), allow to plan for new genetic breeding programs. At the end of the 80ies, IFREMER initiated a genetic breeding program for the resistance of the European flat oyster to the bonamiosis, and obtained strains more tolerant to this disease. After two generations of massal selection, molecular markers had identified a reduced genetic basis in this program. It was then reoriented to an intra-familial selection. However, we were confronted to a zootechnic problem to manage such a scheme and we compromised by an intra-cohorts of families selection scheme managed using molecular markers. The program has now reached the transfer level with experimentation at a professional scale. Concerning the Pacific cupped oyster, and in parallel with the obtaining and the study of polyploids, performance of different Asian cupped oyster strains were compared to the one introduced in France thirty years ago and currently suffering from summer mortalities. The local strain exhibited better performance, certainly based upon a good local adaptation. In other respects, although early growth is a relevant criteria for selection for growth to commercial stage, it is not to be privileged in the context of an oyster producing region with a limited food availability. Contrary, the spat summer mortality became a priority for numerous teams (genetic, physiology, pathology, ecology,...) joined in the MOREST program. The first results showed important survival differences between fullsib and halsib families. They indicate a genetic determinism to this character "survival" and promote for its selection.
Deux espèces d'huîtres sont aujourd'hui présentes sur les côtes françaises : l'huître plate européenne (Ostrea edulis), indigène, et l'huître creuse du Pacifique (Crassostrea gigas), introduite du Japon dans le début des années 1970. L'huître plate a subi coup sur coup, dans les années 1960, deux maladies dues à des protozoaires parasites et sa production est ainsi passée de 20 000 t/an dans les années 1960 à 1500 t/an aujourd'hui en France. Il en résulte que la filière ostréicole française repose quasiment exclusivement (99%) sur la production de l'huître creuse, C. gigas, avec 150 000 tonnes en 2000 dont environ 90% est issu du captage naturel. Cependant, la reproduction de cette espèce en écloserie est actuellement en expansion avec une estimation de 400 à 800 millions de naissains commercialisés en 2002. Des rapports renforcés entre l'IFREMER et les cinq écloseries françaises de la filière ostréicole, qui adhèrent toutes au SYSAAF (SYndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français), permettent désormais d'envisager le développement de nouveaux programmes d'amélioration génétique. A la fin des années 1980, un programme de sélection pour la résistance de l'huître plate à la bonamiose a été initié au sein de l'IFREMER, et a permis d'obtenir des souches plus tolérantes à cette maladie. Après deux générations en sélection massale, les marqueurs moléculaires avaient mis en évidence une base génétique réduite au sein de ce programme qui s'était alors orienté vers une sélection intra-familiale. Devant la lourdeur zootechnique d'un tel schéma, un compromis a été trouvé en réalisant une sélection au sein de cohortes de familles biparentales, la gestion de ces cohortes étant permise par les analyses moléculaires. Le programme est maintenant dans sa phase de transfert, avec des expérimentations à plus grande échelle en partenariat avec la profession. En ce qui concerne l'huître creuse, et en parallèle de l'obtention et l'étude de polyploïdes, les performances de différentes souches d'huîtres creuses provenant d'Asie ont été comparées à celles de la souche introduite en France il y a trente ans, sujette à des mortalités estivales. La souche locale présente de meilleures performances, vraisemblablement grâce à une adaptation bien réalisée. Par ailleurs, bien que l'amélioration de la croissance jusqu'à la taille commerciale s'avère possible par une sélection précoce au stade larvaire, le critère de croissance n'est pas nécessairement à privilégier dans le contexte d'un bassin ostréicole disposant de ressources trophiques limitées. En revanche, les importantes mortalités rencontrées par le naissain en périodes estivales constituent le sujet d'étude prioritaire sur lequel se sont penchées de nombreuses équipes (génétique, physiologie, pathologie, écologie, ...) dans le cadre du grand défi MOREST. Les premiers résultats ont mis en évidence de fortes différences de survie entre des familles biparentales d'animaux indiquant un déterminisme génétique du caractère « survie », et encourageant dans la voie d'une sélection pour ce caractère.

Droits : 2004 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-3491.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3491/

Éditeur(s) : Actes du IIIème Congrès International des Sociétés Françaises de Malacologie. Les mollusques dans la recherche actuelle, La Rochelle, France, 24-27 juin 2003
Résumé : We analysed a few aspects of oyster culture in New Caledonia. Oyster culture there is not very important, one farm producing 30 tonnes of Japanese oysters per year and the other one, 3 tonnes of rock oysters. Mangrove oyster deposits are traditionally exploited, and this exploitation lead to a decrease of the densities and biomasses observed in the most exploited estuaries. On the four monitored sites, the maximum size observed is comprised between 7.2 to 10 cm, for a mode comprised between 3.6 and 4.8 cm. Densities go from 31 to 251 oysters and biomasses, from 0.751 to 2.553 kg/m2. Regulations focus on the minimum collection size (6 cm) and a fishing prohibition period of 8 months. Based on our observations, we suggest that these dispositions be maintained. We also suggest that a fishing licence for professional fishermen be created, and that leisure fishing be maintained.
On a analysé quelques aspects de l'exploitation des huîtres en Nouvelle Calédonie. La conchyliculture y est faiblement présente, une ferme produisant 30 tonnes par an d'huîtres japonaises et une autre, 3 tonnes d'huîtres de rocher. Les gisements d'huître de palétuvier font l'objet d'une exploitation traditionnelle, qui a conduit à l'affaiblissement des densités et des biomasses observées dans les estuaires les plus exploités. Dans les quatre sites échantillonnés, la taille maximale observée allait de 7,2 à 10 cm, pour un mode compris entre 3,6 et 4,8 cm. Les densités allaient de 31 à 251 huîtres et les biomasses, de 0,751 à 2,553 kg/m2 . Les mesures réglementaires en vigueur concernent la taille minimale de capture (6 cm), et une période de fermeture de la pêche de 8 mois. Les observations faites suggèrent de maintenir ces dispositions. Il est également proposé de créer une licence de pêche pour des pêcheurs professionnels, et de maintenir une pêche de loisir.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-6527.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6527/

Résumé : Le laboratoire IFREMER "Génétique Aquaculture et Pathologie" (GAP) (La Tremblade et Bouin) a entrepris des actions de recherche sur ces différents points. L'Unité de Recherche en Génétique, en collaboration avec tous les membres du Réseau Génétique Mollusques (REGEMO), a axé une partie de ses travaux sur l'acclimatation et l'hybridation de différentes espèces du genre Crassostrea. Ces recherches ont débuté avec le soutien du Conseil Général de Charente-Maritime depuis 1992 sur des essais d'acclimatation de C. virginica, l'huître creuse américaine. En prolongement de cette étude, l'URGE a proposé à la région Poitou-Charentes un programme de recherche plus vaste sur l'ensemble des espèces d'huîtres creuses.

Droits : 1995 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15515/12902.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15515/

Éditeur(s) : Union des Océanographes de France
Résumé : The worms Polydora. damage the oysters, Crassostrea gigas, by foraging the shell, training the formation of galleries and chambers with mud. The IFREMER'S REMORA network which has in charge to survey the oysters Crassostrea gigas in France, has showed an increase of the infestation of oysters since 1993 (first year of the network). The study had for goal first to estimate the spatial and temporal variations of the infestation of the oysters in 1999, by using two methods: the infestation index, the number of worms by individual and a quality index, the Polydora Index (IP varies from 0 to 1) which is based on 5 classes of the oysters quality (from 0 to 4) in relation to the aspect of the valves
Les vers Polydora détériorent les huîtres creuses, Crassostrea gigas, par perforation de la coquille, entraînant la formation de galeries et de chambres à vase. Le réseau IFREMER /REMORA de suivi des huîtres creuses en France a mis en évidence une progression de l'infestation dans les huîtres depuis 1993 (année de démarrage du réseau). L'étude a pour objectif d'évaluer les variations spatio-temporelles de l'infestation des huîtres de 1999, en comparant deux méthodes : un indice d'infestation, le nombre de vers par huître ; et un indice de qualité, l'Indice Polydora (IP variant de 0 à 1) qui repose sur la qualité des huîtres réparties en 5 classes (de 0 à 4) en fonction de l'aspect des valves.
Journal de Recherche Océanographique (Union des Océanographes de France), 2001

Droits : 2001 Union des Océanographes de France
http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/publication-2447.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2447/

Éditeur(s) : ISTPM
Résumé : This paper is a part of a study concerned with shellfish culture in France. Before presenting improvements in technique, the author gives fundamentals of the biology of oyster and mussels taxonomy and anatomy, respiration, feeding, reproduction, growth, predators and diseases.
SOMMAIRE ------------------ L'HUITRE ------------------ INTRODUCTION CHAPITRE I. TAXONOIVIIE ET ANATOMIE DES HUITRES 1. Taxonomie des huîtres vivant dans ie monde Introduction et rappel historique Les genres (Pycnodonta, Crassostrea, Ostrea) Les principales espèces et leur répartition dans le monde 2. Anatomie de l'huître La coquille Le corps BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE II - LE TRANSPORT DE L'EAU ET LA RESPIRATION 1. Le transport de l'eau . Mécanisme Méthodes de mesure du courant de transnort Quantités d'eau transportées 2. La respiration 3. L'anaérobiose . BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE III. ALIMENTATION ET VERDISSEMENT DES COQUILLAGES 1. Alimentation des coquillages Anatomic des « coquillages » et leur alimentation 1. La collecte des particules alimentaires 2. L'appareil digestif: et la digestion Besoins alimentaires 1. Besoins quantitatifs 2. Nature des aliments. Besoins qualitatifs Conclusion générale 2. Le verdissement Le verdissement. Biologie de Navicula ostrearia La navicule des huîtres, agent du verdissement Le verdissement dans les claires L'écologie des claires en rapport avec la définition du verdissement Données récentes sur la genèse du verdisîsement La navicule bleue de l'huître : ultrastructure du frustule, cytologie, développement . . Derniers résultats sur les conditions d'apparition et de maintien du verdissement en cultures in vitro et en claires Conclusion BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE IV. - LA REPRODUCTION Généralités Anatomie des organes de reproduction La sexualité des huîtres La ponte Incubation et émission des larves Fécondité Rythmes sexuels, influence du milieu Les rythmes Périodicité et durée des émissions de gamètes Influence du milieu OEufs et larves Influence de l'environnement sur la vie larvaire Métamorphose et fixation BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE V. LES ENNEMIS DE L'HUITRE ET DE L'OSTREICULTURE Les prédateurs Le ver plat, Stylochus sp Les bigorneaux perceurs Autres gastéropodes prédateurs Les pieuvres Les crustacés Les échinodevmes Les poissons Les oiseaux Les compétiteurs Animaux Végétaux Le chambrage BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE VI. - MALADIES ET MORTALITES 1. Maladies parasitaires Parasites divers Grégarines Trématodes Cestodes Copépodes Maladies à caractère endémique ou épidémique Les viroses Les champignons La maladie des branchies Les flagellés ; Hexamita sp Les haplosporidies La maladie de la glande digestive de l'huître plate et son agent, Marteilia refringens La maladie de Malpèque 2. Mortalités d'origines diverses Variations excessives de la température Variations excessives de la salinité Eutrophisation Mortalités du Belon Mortalité massive de la baie de Matsushima BIBLIOGRAPHIE ------------------ LA MOULE ------------------ TaxonoiTiie La coquille Le corps Alimentation. Croissance. Engraissement La filtration Mécanisme . . . . Action de la température, de la salinité et de l'oxygène dissous Durée journalière Vitesse de filtration Les éléments nutritifs La digestion La croissance L'engraissement La reproduction Glande génitale et sexe Evolution de la gonade Description des phénomènes Facteurs influençant l'évolution de la gonade Emission des produits génitaux Description du phénomène Facteurs influençant l'émission des produits génitaux Vie larvaire Développement de la larve, sa métamorphose Taille des larves Comportement des larves Action de différents facteurs sur la vie des larves Fixation Résumé Les ennemis Prédateurs Compétiteurs Parasites Causes diverses de mortalité BIBLIOGRAPHIE
Revue des Travaux de l'Institut des Pêches Maritimes (0035-2276) (ISTPM), 1976-06 , Vol. 40 , N. 2 , P. 149-346

Droits : Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/1976/publication-1796.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1796/

Résumé : La taxonomie des huîtres est longtemps restée basée sur des critères morphologiques tel que la coquille et les organes internes ou sur la répartition géographique. Ces critères se révèlent aujourd'hui peut fiable du fait de la grande plasticité des caractères morphologiques des huîtres en fonction des conditions environnementales, et du transport d'espèce par l'ostréiculture ou accidentellement. La biologie moléculaire et en particulier les marqueurs génétiques sont des outils très utiles pour différencier les espèces. La phylogéographie des huîtres creuses de l'Atlantique Sud a ainsi été étudié grâce à différentes méthodes d'observation du polymorphisme de l'ADN. Ces techniques ont dans un premier temps été appliquées à des fragments mitochondriaux (16S) pui à des fragments nucléaires (ITS). La PCR6RFLP a été utilisée d'une part sur les fragments 16S pour déterminer les haplotypes de 5 nouvelles populations du genre Crassostrea provenant du Sénégal, du Nigeria et du Brésil. Il a été ainsi possible d'identifier une nouvelle population de Crassostrea gasar en Amérique du Sud. Nous nous sommes ensuite intéressés aux polymorphisme pouvant exister entre les différentes populations de C. gasar de part et d'autre de l'Atlantique. Pour cela des fragments nucléaires ITS, à priori plus polymorphes que les fragments mitochondriaux 16S ont été étudiés. Différentes mises au point ont été réalisées afin de révéler un éventuel polymorphisme entre les populations. Toutes les informations recueuillies tendent vers cette hypothèse sans toutefois pouvoir la confirmer. La présence d'une zone de sympatrie entre les espèces C. gasar en Amérique du Sud poste la question de son introduction, soit par l'homme soit accidentellement. Des études complèmenaires sont indispensables, par un échantillonnage plus large, pour évaluer l'étendue de la présence des espèces de part et d'autre de l'océan. Il est également nécessaire de continuer la mise au point sur les marqueurs nucléaires afin de confirmer le polymorphisme suspecté entre les populations C. gasar d'Afrique et d'Amérique. La publication récente d'un article séparant les espèces C. brasiliana et C. rhizophorae pose également la question de la position de C. brasiliana par rapport aux deux espèces que nous avons étudié.

Droits : 2000 Univ. La Rochelle
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14409/11706.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14409/

Résumé : En France, ainsi que dans de nombreux autres pays, l'histoire de l'ostréiculture est émaillée d'une succession de phases de développement, de surexploitation et d'apparition de maladies qui perturbent lourdement la profession. Depuis la disparition massive de l'huître portugaise, Crassostrea angulata, victime entre 1969 et 1971 d'une épidémie virale et l'effondrement de l'élevage de l'huître plate Ostrea edulis dû à deux parasitoses, la marteiliose et la bonamiose, l'ostréiculture française connaît actuellement une situation de monoculture de l'huître creuse japonaise Crassostrea gigas, suite à l'introduction de l'espèce entre 1971 et 1975 (Grizel & al. 1991). Pour tenter de remédier à cette situation de monoculture, qui reste une des inquiétudes majeures des professionnels, la région Poitou-Charentes a apporté une aide financière pour la création d'un "conservatoire de souches", implanté dans les locaux du Laboratoire Génétique, Aquaculture et Pathologie de La Tremblade. Les principaux objectifs sont d'étudier les possibilités d'acclimatation des huîtres étrangères dans les eaux françaises afin de diversifier la production ou de préparer une éventuelle substitution à C. gigas en cas d'épizootie majeure, de développer des hybrides intra et inter-spécifiques au sein du genre Crassostrea (performants en ce qui concerne la résistance aux maladies parasitaires, la croissance et la fertilité) et enfin d'effectuer une étude de la différenciation génétique (intra et inter spécifique).

Droits : 1997 Univ. La Rochelle, the author, Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14380/11670.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14380/

Éditeur(s) : Conseil International pour l'Exploration de la Mer (CIEM), C. M. 1975/K: 21
Résumé : Following our aim of developing oyster culture in French Guyana and studying the different options available to increase a stock of new oyster species, we were lead to search for possible parasites in Crassostrea rhizophorae. These oysters from the French Guyanese coasts host some gregarine Nematopsis sp. spores, characterized by Comps, Grizel and Tige (1972). Through this work, we conducted some experimental infestation trials between Crassostrea rhizophorae spats parasited by these spores and the most common crab on metropolitan farms Carcinus maenas.
Poursuivant les objectifs de développement de l'ostréiculture en Guyane et étudiant les possibilités d'accroissement d'un stock constitué de nouvelles espèces d'huîtres, nous avons été amenés à rechercher d'éventuels parasites chez Crassostrea rhizophorae. Ces huîtres des côtes de la Guyane française abritent des spores de Grégarines, Nematopsis sp. mises en évidence par COMPS, GRIZEL et TIGE (1972). Au cours de ce travail nous avons réalisé des essais d'infestations expérimentales entre du naissain de Crassostrea rhizophorae parasité par ces spores et le crabe le plus répandu sur les parcs à huîtres métropolitains, Carcinus maenas.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1975/acte-6290.PDF
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6290/

Résumé : Actions menées de 1994 à 1998 au sein du conservatoire de souches : 1. Résultats des importations, acclimatation et hybridation. a) Rappel des conditions d'introduction de nouvelles souches. L'importation de toute espèce est conditionnée par les résultats d'une enquête préliminaire dont l'objet est de rechercher les exigences écologiques de l'espèce et la situation épidémiologique dans son milieu d'origine. Le travail du LGP et de ses partenaires a été partagé en différentes actions: 1. Recherche de contacts dans divers pays étrangers, en vue de l'importation d'huîtres présentant des caractéristiques intéressantes. 2. Importation : L'importation se fait selon les normes du CIEM (Conseil International pour l'Exploration de la Mer) : contrôles pathologiques sur les lots d'animaux importés, confinement en salle de quarantaine des géniteurs avec stérilisation systématique des eaux de rejet, sacrifice des géniteurs après la production de la première génération. 3. Production d'une première descendance: La ponte est également réalisée en salle de quarantaine. Des contrôles pathologiques auront lieu tout au long de l'élevage. 4. Contrôle des performances : ils se font, dans un premier temps, uniquement au laboratoire avec stérilisation des eaux de rejet. Cette caractérisation intègre différentes approches : résistance aux parasites présents dans le milieu français, caractères quantitatifs (poids, taille, rendement, vitesse de croissance), polymorphisme enzymatique ou ADN, tests physiologiques (mesure de la respiration, du rendement d'assimilation ... ). 5. Hybridation: Des hybridations entre espèces ont été tentées, avec contrôle par marqueurs génétiques. 6. Conservatoire de souches : Les générations F1 des différentes espèces ont systématiquement été conservées. Une salle a été spécialement équipée au LGP dans cet objectif.

Droits : 1998 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15520/12907.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15520/12922.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15520/

Éditeur(s) : Actes Symposium, Bordeaux, France, 8-14 septembre 1981, pp 389-395
Résumé : Estimations of algal growth potential (AGP) of oyster-pond waters have been made by the use of bioassays and nutrient analysis. Data obtained demonstrated that nitrogen is the nutrient Iimiting AGP and that an important part of algal biomass is supported by organic nutrients. Such an uptake ranges from 0.6 to 30.7 µg-at.I-1 nitrogen ; which represents up to six times the total amount of inorganic nitrogen taken up. U.V oxydation and subsequent chemical analysis shown DON concentrations in oyster-pond waters varied with oyster presence or absence: values recorded were 10-40 µg-at N.I-1 when oysters were not present, and up to 50-60 µg-at N.I-1 when oysters were covering the bottom of the pond. The oyster Crassostrea gigas was demonstrated to excrete 77-93 % DON, versus 10-33 % N-NH4; urea excretion often represented three folds the NH4 excretion. The capability to take up organic nutrients varies with algal species ; the diatom Navicula ostrearia appeared to be the most efficient one.
L'utilisation de tests biologiques dans l'étude de la fertilité des eaux de claires ainsi que l'analyse chimique des réserves en sels nutritifs des mêmes eaux montrent qu'une part importante de la biomasse micro-algale peut être produite dans ces bassins, par assimilation par les cellules de substances organiques dissoutes. Ainsi, pour l'azote, des estimations indirectes aboutissent à des quantités de cet élément assimilé sous forme organique variant entre 0,6 et 30,7 µg-at.I-1 selon les modes d'évaluation, les espèces et l'origine des eaux, c'est-à-dire jusqu'à six fois les quantités d'ions minéraux prélevés par les algues. Ces valeurs sont tout à fait en concordance avec les teneurs en azote organique dissous effectivement présentes dans les eaux de claires: entre 10 et 40 µg-at.I-1 et jusqu'à 50 à 60 µg-at.I-1 dans les bassins où des huîtres sont immergées. On ne peut donc exclure une relation entre ces fortes valeurs en azote organique dissous et les huîtres. D'ailleurs, il est démontré que l'huître Crassostrea gigas peut excréter 77 à 93 % de rejets azotés sous forme organique, l'ammoniaque n'en représentant que 10 à 33 % et la quantité d'urée excrétée atteignant jusqu'à trois fois celle d'ammoniaque. L'utilisation de ces formes organiques de l'azote par les algues des claires varie avec les espèces; Navicula ostrearia semble être la mieux adaptée à ce type d'assimilation.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1981/acte-2946.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2946/

Éditeur(s) : Actes Journées Conchylicoles, Ifremer Nantes, 3-4 avril 2001
Résumé : Mangrove oysters include various species that are also present on different coasts. In the southern part of the Atlantic Ocean, Crassostrea rhizophorae has been observed along the southern coast of America and Crassostrea gasar along the western coast of Africa. Fifteen populations of these oysters were sampled from these two geographic areas. Their polymorphism was studied on the 16S mitochondrial fragment both by par sequencing and RFLP analysis. Some samples' caryotype were also analysed. Two haplotypes were identified: C. gasar was found in Africa, but also for the first time in South America, whereas C. rhizophorae was only found on the coasts of South America.
Les huîtres de mangrove englobent plusieurs espèces qui sont présentes sur différentes côtes. Dans la partie sud de l'Océan Atlantique, Crassostrea rhizophorae a été décrite le long des côtes sud américaines et Crassostrea gasar le long des côtes ouest africaines. Quinze populations de ces huîtres ont été échantillonnées dans ces deux zones géographiques. Leur polymorphisme a été étudié sur le fragment mitochondrial 16S par séquençage et analyse en RFLP, le caryotype de certains échantillons a aussi été examiné. Deux haplotypes ont été identifiés: le type C. gasar a été trouvé en Afrique, mais aussi pour la première fois en Amérique du Sud, alors que le type C. rhizophorae a été rencontré seulement sur les côtes d'Amérique du Sud.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/acte-3278.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3278/

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier Masson
Résumé : International audience
The present study tested different sounds that could disturb eagle rays (Aetobatus ocellatus) during their foraging activities at Moorea, French Polynesia. Results showed that artificial white sound and single-frequency tones (40 Hz, 600 Hz or 1 kHz) did not have an effect on rays (at least 90% of rays continued to forage over sand), while playbacks of boat motor sound significantly disturbed rays during foraging activity (60% exhibited an escape behaviour). Overall, our study highlighted the negative effect of boat noises on the foraging activity of eagle rays. These noises produced by boat traffic could, however, have some positive effects for marine aquaculture if they could be used as a deterrent to repel the eagle rays, main predators of the pearl oysters.
Notre étude teste différents types de sons qui pourraient perturber les raies-aigles (Aetobatus ocellatus) pendant leur prise de nourriture dans le lagon de Moorea, en Polynésie française. Les résultats montrent que le bruit artificiel blanc ou des fréquences uniques (40 Hz, 600 Hz ou 1 kHz) n’ont aucun effet sur les raies (au moins 90 % des raies continuent de se nourrir dans le sable), tandis que l’enregistrement d’un moteur de bateau les perturbe significativement dans cette activité (60 % des individus ont un comportement de fuite). Notre étude met ainsi en évidence l’effet négatif des bruits anthropogéniques sur les activités de nourrissage des raies-aigles. Ces bruits produits par les bateaux pourraient néanmoins avoir un effet positif pour l’aquaculture marine s’ils pouvaient être utilisés comme répulsifs des raies, principaux prédateurs de l’huître perlière.
ISSN: 1631-0691

Droits : http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/
hal-01297683
https://hal-univ-perp.archives-ouvertes.fr/hal-01297683
https://hal-univ-perp.archives-ouvertes.fr/hal-01297683/document
https://hal-univ-perp.archives-ouvertes.fr/hal-01297683/file/1-s2.0-S1631069116000020-main.pdf
DOI : 10.1016/j.crvi.2016.01.001

Résumé : Il existe à l'état sauvage deux espèces d'huîtres aux Antilles, Ostrea frons et Crassostrea rhizophorae. Toutes deux se reproduisent tout au long de l'année et constituent en différents endroits des gisements d'importance variable. La première appartient à la catégorie des "plates" et vit dans la zone infralittorale mais sa taille excessivement réduite, 4 cm de diamètre au plus, ne permet pas de l'exploiter. La seconde que l'on range parmi les "creuses", constitue d'importants gisements dans la zone de balancement des marées, principalement au niveau des racines-échasses des palétuviers d'où son nom d'huître de palétuvier. Sa taille, son aspect et son goût font qu'élle est cueillie et consommée depuis longtemps. En 1971, des recherches ont été entreprises par le laboratoire ISTPM de la Martinique en vue de créer une activité ostréicole aux Antilles. Les premières études menées jusqu'en 1975 sur l'huître de palétuvier locale ont permis de constater la médiocrité persistante des résultats des élevages expérimentaux ; ceci a conduit à orienter les travaux sur l'implantation d'espèces étrangères, en commençant par l'huître japonaise Crassostrea gigas. En 1976 les essais d'acclimatation ont intéressé l'huître plate Ostrea edulis, importée de Bretagne, l'huître de palétuvier Crassostrea rhizophorae provenant de Guyane, ainsi qué les moules Mytilus edulis et Mytilus galloprovincialis. Après avoir rappelé brièvementquelques caractéristiques de l'huître de palétuvier des Antilles,nous décrirons les essais d'élevage réalisés avec ce coquillage local puis ceux effectués avec des espèces étrangères.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00046/15699/13101.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00046/15699/

Éditeur(s) : Académie des Sciences
Résumé : Along the French Guiana coast, mainly in the Monsinéry River, there are populations of natural oysters belonging to the species Crassostrea rhizophorae (Guilding). Within the scope of the growth of oyster farming in Guiana, we researched possible parasites of these oysters that are still little studied. This work, conducted based on living and set samples, allowed us to highlight the presence of nematops spores.
Sur la côte de la Guyane française, principalement dans la rivière de Montsinéry existent des populations d'huîtres naturelles appartenant à l'espèce Crassostrea rhizophorae (Guilding). Dans le cadre du développement de l'ostréiculture en Guyane, nous avons recherché des parasites éventuels de ces huîtres encore peu étudiées. Ce travail mené à partir d'échantillons vivants et fixés nous a permis de mettre en évidence la présence de spores nématopsidiennes.
Comptes Rendus Académie Sciences Paris (Académie des Sciences), 1972-09 , Vol. 275 , N. 15 , P. 1693-1695

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1972/publication-3008.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3008/

Résumé : This study is inserted within the research project Risco, which aims at understanding the causes of oysters mortalities in the bay of Quiberon, since 2006. The objective was to test the feasability of an automatic segmentation of sonar images devoted to the distinction of molluscs (oysters and crepidulas) and sedimentary substrate. The method tested was of the type "segmentation dirigée basée région", implemented on the software SonarScope. It could be applied successfully only on muddy sediment where it succeeded to identify the shellfish sectors with negligeable error. However the distinction between oysters and crepidulas proved to be very delicate. A generalization to other sectors of the bay will be attempted.
Dans le cadre du projet RISCO sur la compréhension des facteurs de mortalité d'huîtres en Baie de Quiberon (France), l'objectif du stage était de tester la possibilité d'une segmentation automatique d'imagerie sonar en vue de distinguer les faciès coquilliers (huîtres et crépidules) du substrat sédimentaire. La méthode testée était de type « segmentation dirigée basée région » implémentée sous le logiciel SonarScope. Cette approche testée uniquement en secteur vaseux s'est montrée capable de détecter sans confusion les secteurs coquilliers. La distinction entre crépidules et huîtres s'est par contre avérée pour le moment très délicate. Une généralisation a d'autres secteurs sédimentaires de la Baie reste à menée.

Droits : 2011 Ifremer, UBS
http://archimer.ifremer.fr/doc/00128/23946/21911.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00128/23946/

Résumé : Le but de ce programme pathologie est de rechercher et d'étudier les agents pathogènes connus et inconnus chez les mollusques bivalves marins, plus particulièrement chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, afin d'identifier d'éventuels agents causant des mortalités, de proposer des mesures prophylactiques et de définir des conditions zootechniques permettant aux professionnels de limiter l'impact des maladies sur leur cheptel. La présence de maladies, chez les mollusques bivalves marins dont l'impact socio économique peut être catastrophique pour les productions conchylicoles, et l'accroissement des échanges de produits d'aquaculture entre les pays de la CEE et avec les pays tiers nécessitent le renforcement des recherches dans les domaines de la pathologie. En particulier, du fait du mono élevage de l'huître japonaise, Crassostrea gigas, en France, il semble aujourd'hui indispensable d'effectuer des contrôles zoosanitaires réguliers chez cette espèce. Ces travaux ont d'autant plus d'importance qu'aujourd'hui, devant les pathologies rencontrées, les professionnels restent extrêmement démunis (traitements inapplicables ou inexistants). Dans ce cadre, la promptitude du diagnostic ainsi que l'acquisition de données épidémiologiques et biologiques concernant les agents pathogènes impliqués sont les meilleurs moyens d'éviter leur dissémination chez les mollusques bivalves marins. Les travaux entrepris dans ce cadre par l'URPIG, semblent d'autant plus indispensables qu'il n'existait pas jusqu'à ces dernières années de pathologies identifiées chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, sur le littoral français. Cependant depuis 1991, sont apparus dans certaines écloseries françaises des épisodes de mortalité sur des larves de cette espèce. Il a été possible de détecter un virus apparenté à la famille des Herpesviridae par ses caractères morphologiques (NICOLAS et al., 1992) et de démontrer sa pathogénicité pour les larves (LE DEUFF et al., 1994). Par ailleurs, en 1993, 1994 et 1995, un virus de même type, a été observé en association à de fortes mortalités sur différents lots de naissain de la même espèce, originaires d'écloseries et de captage naturel. Par ailleurs, en 1993, suite à l'observation d'anomalies au niveau des branchies chez des huîtres creuses provenant de Charente Maritime et du bassin d'Arcachon associées à de médiocres performances de croissance, il a été entrepris des analyses de divers échantillons, en histologie classique et en microscopie électronique à transmission. Ces examens ont permis de révéler la présence au niveau des branchies, chez un nombre non négligeable d'animaux, d'un microorganisme de type chlamydien (RENAULT and COCHENNEC, 1995). Il a également été possible, chez cette même espèce, de détecter la présence d'un organisme de type rickettsien au niveau des branchies (RENAULT, COCHENNEC and CHOLLET, 1995).

Droits : 1995 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15453/12828.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15453/