Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag
Résumé : International audience
The objective of this study is to assess the association of clinical manifestations of systemic sclerosis (SSc) with the absolute count of circulating blood monocyte subpopulations according to their membrane expression of CD16. Forty-eight consecutive patients fulfilling the 2013 ACR/EULAR classification criteria for SSc were included in this cross-sectional study. CD16+ monocyte absolute count was defined by flow cytometry and confronted to the clinical characteristics of SSc patients. Twenty-three healthy donors (HD) were randomly selected for comparison. SSc patients had an increased number of total circulating blood monocytes compared to HD (p < 0.001). The CD16- subpopulation absolute count was increased in SSc patients compared to HD (p < 0.001) but was similar in limited SSc (lSSc) and diffuse SSc (dSSc). On the contrary, the CD16+ population absolute count was increased in dSSc compared to both HD and lSSc patients (dSSc 0.071 Giga/L (+/- 0.034) vs HD 0.039 Giga/L (+/- 0.030), p < 0.01, and dSSc 0.071 Giga/L (+/- 0.034) vs lSSc 0.048 Giga/L (+/- 0.024), p < 0.05). The CD16+ monocyte subpopulation absolute count was significantly correlated with the severity of skin fibrosis evaluated by the modified Rodnan skin score (p < 0.001). The CD16+ monocyte subpopulation was also associated with pulmonary fibrosis (p < 0.05), with the severity of the restrictive ventilatory defect evaluated by total lung capacity (p < 0.05) and with the pulmonary function impairment reflected by diffusing capacity of the lungs for carbon monoxyde measures (p < 0.01). These results suggest that CD16+ monocytes are associated with the main fibrotic manifestations of SSc and their role in the pathogenesis of fibrosis in this autoimmune disorder should therefore be further considered.
ISSN: 0770-3198

hal-01560150
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01560150
DOI : 10.1007/s10067-017-3597-6
PUBMED : 28293753

Résumé : La conchyliculture connaît depuis une trentaine d'années une progression régulière de ses productions à travers le monde. Elle représente une activité économique importante avec plus de 240 000 tonnes de coquillage produit annuellement en France. Cependant le développement de cette activité peut être limité par des mortalités parfois massives dues à des maladies infectieuses. L'augmentation des productions peut être expliquée par l'amélioration des méthodes d'élevage grâce à une meilleure connaissance de la biologie des bivalves et des processus physiologiques liés à leur reproduction : l'apparition de l'élevage larvaire en écloserie a permis de pallier le caractère aléatoire et souvent insuffisant du captage naturel. Ces nouvelles techniques ont permis d'acquérir une certaine indépendance vis-à-vis des pontes naturelles, mais ont entraîné une augmentation des transferts d'animaux entre les bassins conchylicoles, une augmentation des densités de mollusques et le développement d'une espèce cible par bassin. Ces actions ont contribué à l'apparition et à la dissémination de nouvelles maladies entraînant de très fortes pertes pour la conchyliculture. De plus, la palourde, comme tous les mollusques marins, présente des caractéristiques biologiques qui laissent peu de possibilités d'actions pour protéger une production vis-à-vis de maladies infectieuses: la culture de ces espèces en milieu ouvert rend tout traitement impossible du fait des quantités de substance à utiliser, et de la forte probabilité de contamination des animaux. Cette méthode peut être appliquée dans le cas d'élevages intensifs : écloseries, nurseries. Le système immunitaire des mollusques est primitif, ils ne possèdent pas de lymphocytes B et lymphocytes T, ce qui empêche toute réponse immune spécifique et rend la vaccination impossible. L'absence d'anticorps spécifique complique la recherche d'agent pathogène, celle-ci n'est possible que par un diagnostic direct, essentiellement réalisé grâce à l'histologie ou à la microscopie.

Droits : 2006 IUT La Rochelle, Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14457/11759.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14457/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Cell signaling contains the whole biological mecanisms allowing the response of a cell to its microenvironnement in an adapted way. Many extremely intertwinned biological reactions are involved in a network that behaves as a complex system. The understanding of cell response requires the development of data acquisition technics and methods to formalize data into models. This point is the main drive of this thesis. We present here two approaches in order to analyse different granularities of cell signaling. In the first one, we used differential model to study the role of a new component of TGF-β canonical pathway. In the second one, we explored the combinatorial complexity of cell signaling, developing a discrete formalism based on guarded transitions. In this approach, we interpreted the whole database Pathway Interaction Database into a single unified model of signal transduction. Simulation and analysis methods, such as reachability and invariance research, have been developed. The interests are presented through an application on cell cycle regulation by cell signaling, and a global analysis on the regulation of genes compared to experimental data.
La signalisation cellulaire regroupe l'ensemble des mécanismes biologiques permettant à une cellule de répondre de façon adaptée à son microenvironnement. Pour ce faire, de nombreuses réactions biologiques entrent en jeux avec un important enchevêtrement, créant ainsi un réseau dont le comportement s'apparente à un système complexe. Le compréhension de la réponse cellulaire à une stimulation passe par le développement conjoint des techniques d'acquisition de données, et des méthodes permettant de formaliser ces données dans un modèle. C'est sur ce dernier point que s'inscrivent les travaux exposés dans cette thèse. Nous présentons ici deux approches visant à répondre à des questions de natures différentes sur la signalisation cellulaire. Dans la première nous utilisons un modèle différentiel pour étudier le rôle d'un nouvel interactant dans la voie canonique du TGF-beta. Dans la seconde nous avons exploré la combinatoire de la signalisation cellulaire en développant un formalisme discret basé sur les transitions gardées. Cette approche regroupe l'interprétation de la base de données Pathway Interaction Database dans un unique modèle dynamique de propagation du signal. Des méthodes de simulations et d'analyses inspirées des techniques de vérification de modèles telles que l'atteignabilité et l'invariance ont été développées. En outre, nous avons étudié la régulation du cycle cellulaire en réponse à la signalisation, ainsi que la régulation des gènes de notre modèle en comparaison avec des données d'expressions.
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00926487

Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess
tel-00926487
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00926487
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00926487/document
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00926487/file/AndrieuxThese.pdf

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
Objective To guide nosology and classification of patients with eosinophilic granulomatosis with polyangiitis (EGPA) based on phenotype and presence or absence of ANCA. Methods Organ manifestations and ANCA status were retrospectively analyzed based on the presence or not of predefined definite vasculitis features or surrogates of vasculitis in patients asthma, eosinophilia, and at least one systemic organ manifestation attributable to systemic disease. Results The study population included 157 patients (mean age 49.4 ± 14.1), with a follow-up of 7.4 ± 6.4 years. Patients with ANCA (31%) more frequently had weight loss, myalgias, arthralgias, biopsy-proven vasculitis, glomerulonephritis on biopsy, hematuria, leukocytoclastic capillaritis and/or eosinophilic infiltration of arterial wall on biopsy, and other renal disease. A total of 41% of patients had definite vasculitis manifestations (37%) or strong surrogates of vasculitis (4%), of whom only 53% had ANCA. Mononeuritis multiplex was associated with systemic vasculitis (p = 0.005) and with the presence of ANCA (p < 0.001). Overall, 59% of patients had polyangiitis as defined by definite vasculitis, strong surrogate of vasculitis, mononeuritis multiplex, and/or ANCA with at least one systemic manifestation other than ENT or respiratory. Patients with polyangiitis had more systemic manifestations including arthralgias (p = 0.02) and renal disease (p = 0.024), had higher peripheral eosinophilia (p = 0.027), and a trend towards less myocarditis (p = 0.057). Using predefined criteria of vasculitis and surrogates of vasculitis, ANCA alone were found to be insufficient to categorise patients with vasculitis features. Conclusion We suggest a revised nomenclature and definition for EGPA and a new proposed entity referred to as hypereosinophilic asthma with systemic (non vasculitic) manifestations. © 2016 Elsevier B.V.
Autoimmunity Reviews

hal-01467544
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01467544
DOI : 10.1016/j.autrev.2016.09.018
PUBMED : 27671089

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
Leishmania parasites induce an immunomodulation by subverting the host immune response towards a CD4(+) Th2 lymphocytic cell response that favors parasite persistence. Here, we report that after successful treatment of visceral leishmaniasis due to Leishmania infantum, an immune reconstitution syndrome revealing hip septic arthritis was associated with a switch from Th2 towards a Th1 cytokine profile, and a decrease in the level of immunomodulating factors, such as soluble HLA-G and indoleamine 2,3-dioxygenase (IDO) activity. We then measured IDO activity in a cohort of 39 patients and uninfected control subjects. Results showed significantly enhanced IDO activity in patients with visceral Leishmania infection, compared with uninfected control subjects (P < 0.001), but also compared with treated patients (P < 0.05). A decrease in IDO activity could constitute a relevant biomarker for the restoration of the immune response during visceral leishmaniasis.
Innate Immunity

inserm-00818884
http://www.hal.inserm.fr/inserm-00818884
DOI : 10.1177/1753425912473170
PUBMED : 23413147

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
A prospective study on randomized patients was conducted to determine how morphokinetic parameters are altered in embryos grown in sequential versus global culture media. Eleven morphokinetic parameters of 160 single embryos transferred were analyzed by time lapse imaging involving two University-affiliated in vitro fertilization (IVF) centers. We found that the fading of the two pronuclei occurred earlier in global (22.56±2.15 hpi) versus sequential media (23.63±2.71 hpi; p=0.0297). Likewise, the first cleavage started earlier at 24.52±2.33 hpi vs 25.76±2.95 hpi (p=0.0158). Also, the first cytokinesis was shorter in global medium, lasting 18±10.2 minutes in global versus 36±37.8 minutes in sequential culture medium (p <0.0001). We also observed a significant shortening in the duration of the 2-cell stage in sequential medium: 10.64 h±2.75 versus 11.66 h±1.11 in global medium (p=0.0225) which suggested a faster progression of the embryos through their first mitotic cell cycle. In conclusion, morphokinetic analysis of human embryos by Time lapse imaging reveals significant differences in five kinetic variables according to culture medium. Our study highlights the need to adapt morphokinetic analysis accordingly to the type of media used to best support human early embryo development.
Annales de Biologie Clinique

hal-01579406
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01579406
DOI : 10.1684/abc.2017.1259
PUBMED : 28751285

Éditeur(s) : HAL CCSD National Institute of Environmental Health Sciences (NIEHS) National Institute of Environmental Health Sciences
Résumé : International audience
Long-term exposure to persistent pollutants with hormonal properties (endocrine-disrupting chemicals, EDCs) may contribute to the risk of prostate cancer (PCa). However, epidemiological evidence remains limited. We investigated the relationship between PCa and plasma concentrations of universally widespread pollutants, in particular p,p'-dichlorodiphenyl dichloroethene (DDE) and the non-dioxin like polychlorinated biphenyl congener 153 (PCB153). We evaluated before treatment 576 men with newly diagnosed PCa and 655 controls in Guadeloupe (French West Indies). Exposure was analyzed according to case-control status. Associations were assessed by unconditional logistic regression analysis, controlling for confounding factors. Missing data were handled by multiple imputation. We estimated a significant positive association between DDE and PCa (adjusted odds ratio [OR] 1.53; 95% CI 1.02, 2.30 for the highest versus lowest quintile of exposure; PTrend = 0.01). PCB153 was inversely associated with PCa (OR 0.30; 95% CI 0.19, 0.47 for the highest versus lowest quintile of exposure values; PTrend < 0.001). Also, PCB153 was more strongly associated to low-grade than high grade PCa. Associations of PCa with DDE and PCB153 were in opposite directions. This may reflect differences in the mechanisms of action of these EDCs, and although our findings need to be replicated in other populations, they are consistent with complex effects of EDCs on human health.
ISSN: 0091-6765

hal-01118553
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01118553
DOI : 10.1289/ehp.1408407
PUBMED : 25493337

Éditeur(s) : HAL CCSD American Society for Microbiology
Résumé : International audience
Toxoplasmosis is a life-threatening infection in immunocompromised patients (ICPs). The definite diagnosis relies on parasite DNA detection, but the incidence and burden of disease are ill-known in HIV-negative patients. A three-year retrospective study was conducted in 15 reference laboratories from the network of the French National Reference Center for Toxoplasmosis, to record the frequency of Toxoplasma DNA detection in ICPs, to review the molecular methods used for diagnosis and the prevention measures implemented in transplant patients. During the study period, out of 31,640 PCR performed in ICPs, 610 were positive (323 patients). Blood (n=337), cerebrospinal fluid (n=101) and aqueous humor (n=100) samples were more frequently positive. Chemoprophylaxis schemes in transplant patients differed between centers. PCR follow-up of allogeneic hematopoietic stem-cell transplant (allo-HSCT) patients was implemented in 8/15 centers. Data from 180 patients (13 centers) were further analyzed regarding clinical setting and outcome. Only 68/180 (38%) patients were HIV+; the remaining 62% consisted in 72 HSCT, 14 solid-organ transplants, and 26 miscellaneous immunodeficiencies. Cerebral toxoplasmosis and disseminated toxoplasmosis were most frequently observed in HIV and transplant patients, respectively. Of 72 allo-HSCT patients with a positive PCR, 23 were asymptomatic; all were diagnosed in centers performing systematic blood PCR follow-up, and received specific treatment. Overall survival of allo-HSCT patients at two months was better in centers with PCR follow-up than in other centers (p<0.01). This study provides updated data on the frequency of toxoplasmosis in HIV-negative ICPs and suggests that regular PCR follow-up of allo-HSCT patients could guide pre-emptive treatment and improve outcome.
ISSN: 0095-1137

hal-01134189
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01134189
DOI : 10.1128/JCM.03282-14
PUBMED : 25762774

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Mon document "Titres et travaux" contient 5 articles au format éditeur.
Mes premiers travaux de recherche, me permettant de soutenir une thèse de doctorat en décembre 1999, ont été effectués au sein du laboratoire du professeur Bernard GRANDCHAMP (unité 409 de l'INSERM) sous la direction du docteur Marie-Christine LECOMTE. Mon travail s'est intégré dans l'étude fonctionnelle et structurale de certains domaines des spectrines érythroïdes et non érythroïdes, principalement le site de tétramérisation et le domaine SH3. Concernant la tétramérisation de la spectrine érythroïde j'ai identifié les régions minimales nécessaires et suffisantes pour former le tétramère puis j'ai mis en évidence une relation entre certaines mutations de la spectrine associées à des anomalies membranaires du globule rouge et la sévérité du défaut de formation du tétramère. J'ai ensuite identifié plusieurs ligands du domaine SH3 de la spectrine non érythroïde. L'un d'entre eux m'a permis de définir une régulation de la protéolyse ciblée de cette spectrine faisant intervenir un mécanisme de phosphorylation/déphosphorylation. Ma formation initiale fut donc celle d'un biochimiste que j'ai étendue peu à peu vers la biologie moléculaire et la biologie cellulaire.
Puis, souhaitant acquérir les connaissances nécessaires au développement de modèles murins, j'ai décidé d'effectuer mon stage post-doctoral à l'Institut COCHIN (unité 567 de l'INSERM) dans une équipe co-dirigée par le docteur Sophie VAULONT et le professeur Axel KAHN. Je me suis ainsi familiarisé avec la souris comme « outil » de recherche (gestion d'un élevage, établissement de nouvelles lignées, génotypage, phénotypage). Je travaillais initialement sur le métabolisme du glucose mais j'ai complètement réorienté ma thématique de recherche au bout d'un an pour finalement identifier et caractériser une hormone, l'hepcidine, contrôlant l'homéostasie du fer.
J'ai été nommé chargé de recherche de grade 2 dans l'unité 409 de l'INSERM en octobre 2002 pour y développer une souche de souris exprimant une spectrine non érythroïde résistante à des mécanismes de protéolyse ciblée. Il s'agit donc toujours d'appréhender certaines fonctions des spectrines mais dans un contexte in vivo. En janvier 2005 j'ai intégré l'unité 665 de l'INSERM dirigée par Yves COLIN afin de poursuivre ce projet. Aujourd'hui, je suis chargé de recherche de grade 1.
Le chapitre scientifique de ce mémoire est divisé en deux parties distinctes : la première traite de mon travail sur la spectrine tandis que la seconde porte sur l'hepcidine. Chaque partie est composée d'une introduction au sujet suivie d'un résumé des travaux que j'ai effectués et/ou dirigés.
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00285035

Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess
tel-00285035
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00285035/document
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00285035/file/HDR_Titre_et_travaux_-_Gael_Nicolas.pdf