Éditeur(s) : GFP : Groupe Français des Pesticides GFP : Groupe Français des Pesticides GFP : Groupe Français des Pesticides
Extrait de : "Protection des cultures et santé environnementale : héritages et conceptions nouvelles" : congrès, le 26 mai 2014. Université des Antilles et de la Guyane
Résumé : Suite à une analyse bibliographique de l'intégration des effets des pratiques agricoles sur les transferts de pesticides dans 17 modèles agro-hydrologiques, nous avons sélectionné et adapté les modules de différents modèles préexistants afin de produire un modèle agro-hydrologique adapté aux conditions de l'horticulture volcanique tropicale : WATPPASS. Le modèle WATPPASS synthétise donc les connaissances sur le fonctionnement agro-hydrologique des bassins versants et simule les effets des pratiques agricoles sur les processus mis en cause dans les transferts de pesticides.
Suite à une analyse bibliographique de l'intégration des effets des pratiques agricoles sur les transferts de pesticides dans 17 modèles agro-hydrologiques, nous avons sélectionné et adapté les modules de différents modèles préexistants afin de produire un modèle agro-hydrologique adapté aux conditions de l'horticulture volcanique tropicale : WATPPASS. Le modèle WATPPASS synthétise donc les connaissances sur le fonctionnement agro-hydrologique des bassins versants et simule les effets des pratiques agricoles sur les processus mis en cause dans les transferts de pesticides.
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V14177
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Éditeur(s) : INRA : Institut National de la Recherche Agronomique Université des Antilles. Service commun de la documentation INRA : Institut National de la Recherche Agronomique Université des Antilles. Service commun de la documentation
Extrait de : 52e congrès annuel de la Société caribéenne des plantes alimentaires / 52nd annual meeting of the Caribbean food crops society (CFCS), du 10 au 16 juillet 2016. INRA, CFCS
Description : The importance of longevity as an economically trait gives a picture of the flock efficiency and adaptation in a particular environment. A study was conducted in the experimental herd of Creole goats at INRA in Guadeloupe in order to test environmental (year and season at first kidding, age at first kidding and weight at first mating as well as genetic (index of resistance, sire) factors that affect longevity of does. Lifetime data set of 387 Creole does, reared at pasture all year long, was recorded over a period of 11 years (2001-2012). Does were bred for reproduction at 11months of age. Three mating periods were organized per year, corresponding to 3 climatic seasons, using buck effect. Data were analyzed using survival models (Survival Kit 6.1). The average age for culling was 5.03 years. The culling rate was higher for goats between 2 and 3 years (17 and 24%) and then gradually decreased. Year and season at first kidding did not have a long term influence on does? longevity; neither does age at first kidding. In contrast, weight at first mating had a significant effect and it can be recommended to farmers to mate primiparous goats heavier than 17 kg. Heritability was estimated to 0.16 allowing some genetic progress. No significant correlation was shown with the genetic breeding value of resistance to gastrointestinal parasitism. This study gave indications to breeders to improve their female flock management and increase does? longevity. L'importance de la longévité comme trait économique donne une image de l'efficacité et de l'adaptation de troupeau dans un environnement particulier. Une étude a été entreprise dans le troupeau expérimental de chèvres créoles à l'AICN en Guadeloupe afin d'examiner ambiant (l'année et la saison d'abord badiner, âge d'abord badiner et poids d'abord joindre aussi bien que (index de résistance, de père) les facteurs génétiques affectez dont la longévité fait. L'ensemble de données de vie du Créole 387 fait, élevé au pâturage tout au long de l'année, a été enregistré pendant 11 ans (2001-2012). Fait ont été multipliés pour la reproduction à 11months d'âge. Trois périodes d?accouplement ont été organisées par an, correspondant à 3 saisons climatiques, utilisant l'effet de mâle. Des données ont été analysées utilisant des modèles de survie (trousse de survie 6,1). L'âge moyen pour cueillir était de 5,03 ans. Le taux de cueillage était plus haut pour des chèvres entre 2 et 3 ans (17 et 24%) et alors graduellement diminué. L'année et la saison à premier badiner n'ont pas eu une influence à long terme sur la longévité des does ; ni l'un ni l'autre ne vieillit d'abord badiner. En revanche, le poids au premier accouplement a eu un effet significatif et il peut recommander aux agriculteurs de joindre les chèvres primipares des que 17 kilogrammes plus lourds. L'héritabilité a été estimée à 0,16 permettant du progrès génétique. Aucune corrélation significative n'a été montrée avec la valeur d'élevage génétique de la résistance au parasitisme gastro-intestinal. Cette étude a donné des indications aux éleveurs afin d'améliorer la gestion féminine de troupeau et d'augmenter la longévité de ces dernières.
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V16262
V16262

Éditeur(s) : INRA : Institut National de la Recherche Agronomique CIRAD : Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement Université des Antilles. Service commun de la documentation
Extrait de : 52e congrès annuel de la Société caribéenne des plantes alimentaires / 52nd annual meeting of the Caribbean food crops society (CFCS), du 10 au 16 juillet 2016. INRA, CFCS
Description : Acknowledging the contribution of agriculture to global changes and its negative impacts on the environment, it is now seen as unavoidable for it to participate to the ecological transition. This research aims to understand the performativity of legal texts. This performativity does not only reveal the institutions? approach of the model to implement. It also aims to change, in the meantime, the reality (Ambroise et al., 2015). The objective of this research is to stress the importance of concepts? definitions in policies implementation when agricultural system reframing is at stake, and to highlight an uncertain use of words may produce. However, little attention is given to the choice of terms concerning the definition of a greener agriculture in official texts: terms are often mixed up without any clarification. Applying content analysis to official documents, we provide an analytical grid to grasp in what extent the unclear use of words and what they namely designate, lead to ambiguous policies eluding aspects of the concept of agroecology underlined by researchers or associations. We also shed light on the local appropriation process of the concept and its specification in the French Indies. Reconnaissant la contribution de l'agriculture aux changements globaux et à ses impacts négatifs sur l'environnement, on le voit maintenant comme inévitable pour qu'il participe à la transition écologique. Objectifs de ces recherches pour comprendre le performativity des textes juridiques. Ce performativity indique non seulement l'approche des établissements du modèle à l'instrument. Il vise également à changer, dans le même temps, la réalité (Ambroise et autres, 2015). L'objectif de cette recherche est de souligner l'importance des définitions des concepts dans l'exécution de politiques quand le système agricole reframing est en jeu, et accentuer une utilisation incertaine des mots peut produire. Cependant, peu d'attention est accordée au choix des termes au sujet de la définition d'une agriculture plus verte en textes officiels : des termes sont souvent mélangés sans n'importe quelle clarification. S'appliquant à l'analyse du contenu aux documents officiels, nous fournissons une grille analytique à la prise dans quelle ampleur l'utilisation peu claire des mots et ce qu'ils à savoir indiquent, mènent aux politiques ambiguës éludant des aspects du concept de l'agroécologie souligné par des chercheurs ou des associations. Nous avons également jeté la lumière sur le processus local d'appropriation du concept et de ses spécifications dans les Antilles françaises.
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V16255

Éditeur(s) : INRA : Institut National de la Recherche Agronomique Université des Antilles. Service commun de la documentation University of Florida
Extrait de : 52e congrès annuel de la Société caribéenne des plantes alimentaires / 52nd annual meeting of the Caribbean food crops society (CFCS), du 10 au 16 juillet 2016. INRA, CFCS
Description : Papaya ringspot virus (PRSV) has been a major factor inhibiting the expansion of papaya production in South Florida, USA. The University of Florida has developed a transgenic papaya line X17-2, which is tolerant to PRSV and is suitable for commercial production. The expected yield improvement can be as high as 380%. In spite of the yield potential, some fruit growers may be skeptical about adopting this improved GM cultivars for a variety of reasons. Consequently, a probit model with data from a survey of likely producers was used to identify those factors that may influence the adoption of the new technology. The results indicate that education level, farm size, and income derived from agriculture were among the factors likely to increase adoption of the technology. The findings suggest that a targeted education program will go a far way in increasing rate of adoption of the technology. Le virus de tache annulaire de papaye (PRSV) a été un facteur important empêchant l'expansion de la production de papaye en Floride du sud, Etats-Unis. L'université de la Floride a développé une ligne transgénique X17-2 de papaye, qui est tolérante à PRSV et convient à la production commerciale. L'amélioration prévue de rendement peut être aussi haute que 380%. Malgré le potentiel de rendement, quelques arboriculteurs peuvent être sceptiques au sujet d'adopter ceci les cultivars améliorés de GM pour des raisons diverses. En conséquence, un modèle de probit avec des données d'une enquête des producteurs probables a été employé pour identifier ces facteurs qui peuvent influencer l'adoption de la nouvelle technologie. Les résultats indiquent que le niveau d'éducation, la taille de ferme, et le revenu dérivé de l'agriculture étaient parmi les facteurs vraisemblablement pour augmenter l'adoption de la technologie. Les résultats suggèrent qu'un programme éducatif visé aille une manière lointaine dans le taux croissant d'adoption de la technologie.
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V16254

Éditeur(s) : IRD : Institut de Recherche pour le Développement Université des Antilles et de la Guyane
Extrait de : "Projet CARIBSAT, système caribéen d'information environnementale" : conférence, le 21 mars 2013. Université des Antilles et de la Guyane
Description : L'intervention débute en pointant l'accentuation de l'érosion des sols sur les bassins versants, à cause de l'occupation du sol et des activités anthropiques. Une partie de ces particules érodées se retrouve à l'exutoire littoral, influant sur la qualité des eaux de mer, et donc sur la santé des récifs coralliens. Il faudrait donc pouvoir modéliser le transit de matière des bassins versants aux zones côtières. Pour ce faire, plusieurs étapes sont prévues : classification de l'occupation du sol par des images satellites SPOT5, développement d'un modèle de sensibilité à l'érosion, élaboration d'indicateurs spatialisés sur les bassins versants et à leur exutoire.
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V13092

Éditeur(s) : Université des Antilles AREBio Groupe de recherche BIOSPHERES : BIOlogie, Sciences Physiques & Humaines pour les énergies Renouvelables, l
Extrait de : 1er colloque international BIOSPHERES, du 18 au 20 juin 2019. Université des Antilles
Description : La biodiversité de la Martinique, bien que faisant partie des points chauds de la diversité mondiale, n'a donné lieu qu'à peu de travaux de recherche. Or, cette richesse naturelle inestimable est vectrice de retombées économiques dans les domaines de l'agro-alimentaire, de l'environnement et de la santé. Ainsi, la valorisation des agro-ressources en lien avec la recherche dans le domaine de la nutrition-santé est une priorité de la stratégie politique du développement régional, orientant en ce sens, certains programmes menés par les organismes de recherche du territoire. L'intervenante a sélectionné comme modèle le goyavier, arbre dont les bienfaits thérapeutiques traditionnels sont reconnus dans toutes ses parties constitutives (feuilles, écorce, racines, fleurs, fruits) (MARCELIN et al., 2015). Dans sa présentation, elle s'intéresse au fruit et décrit l'organisation de la filière qui, depuis près de 30 ans, fait de l'innovation l'un des axes majeurs de son développement et de sa pérennité. Aussi, sous son impulsion, des travaux de recherche fondamentale et appliquée sont réalisés sur l'agronomie, la biochimie et la transformation du fruit.

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V19073

Éditeur(s) : GFP : Groupe Français des Pesticides
Extrait de : "Protection des cultures et santé environnementale : héritages et conceptions nouvelles" : congrès, le 26 mai 2014. Université des Antilles et de la Guyane
Description : L'étude conduite sur une année hydrologique met en évidence les différents processus expliquant la réponse hydrologique à l'échelle du bassin versant de la rivière Pérou et caractérise les voies de circulation de la CLD depuis les sols jusqu'aux eaux de rivières. Elle souligne la nécessité de considérer l'écoulement de surface, sub-surfacique et de profondeur dont l'importance varie selon les zones du bassin. Finalement, cette représentation du fonctionnement hydrologique du bassin ouvre des perspectives quant à la modélisation de la dynamique de contamination des eaux à la CLD.
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V14171

Éditeur(s) : GFP : Groupe Français des Pesticides GFP : Groupe Français des Pesticides GFP : Groupe Français des Pesticides
Extrait de : "Protection des cultures et santé environnementale : héritages et conceptions nouvelles" : congrès, le 26 mai 2014. Université des Antilles et de la Guyane
Description : Concentrées sur une problématique sols, aucune étude d'envergure visant la composante microbienne et focalisant la contamination dans les rivières n'a été développée à ce jour. Les biofilms épilithiques qui sont en interaction permanente avec le milieu aquatique dans les rivières constituent un modèle intéressant pour aborder de nombreuses questions liées à la fois à l'écologie de ces écosystèmes insulaires tropicaux, à leur rôle potentiel de sentinelles capables de refléter la qualité du milieu et à leur capacité d'épuration. De plus l'impact de la molécule sur cette composante des écosystèmes lotiques n'a jamais été évalué. Une étude préliminaire sur des dispositifs de collecte de biofilm immergés dans les eaux de la rivière du Pérou (commune de Capesterre, Guadeloupe), à deux stations représentatives d'une eau de très bonne qualité et d'une eau sous parcelles bananières et chargée en pesticides (très majoritairement chlordécone) a montré des différences dans l'organisation des communautés bactériennes.
Siècle(s) traité(s) : 21
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V14180
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Éditeur(s) : HAL CCSD Society for Range Management
Résumé : Grasslands and agroecosystems occupy one-third of the terrestrial area, but their contribution to the global carbon cycle remains uncertain. We used a set of 316 site-years of CO(2) exchange measurements to quantify gross primary productivity, respiration, and light-response parameters of grasslands, shrublands/savanna, wetlands, and cropland ecosystems worldwide. We analyzed data from 72 global flux-tower sites partitioned into gross photosynthesis and ecosystem respiration with the use of the light-response method (Gilmanov, T. G., D. A. Johnson, and N. Z. Saliendra. 2003. Growing season CO(2) fluxes in a sagebrushsteppe ecosystem in Idaho: Bowen ratio/energy balance measurements and modeling. Basic and Applied Ecology 4:167-183) from the RANGEFLUX and WORLDGRASSAGRIFLUX data sets supplemented by 46 sites from the FLUXNET La Thuile data set partitioned with the use of the temperature-response method (Reichstein, M., E. Falge, D. Baldocchi, D. Papale, R. Valentini, M. Aubinet, P. Berbigier, C. Bernhofer, N. Buchmann, M. Falk, T. Gilmanov, A. Granier, T. Grunwald, K. Havrankova, D. Janous, A. Knohl, T. Laurela, A. Lohila, D. Loustau, G. Matteucci, T. Meyers, F. Miglietta, J.M. Ourcival, D. Perrin, J. Pumpanen, S. Rambal, E. Rotenberg, M. Sanz, J. Tenhunen, G. Seufert, F. Vaccari, T. Vesala, and D. Yakir. 2005. On the separation of net ecosystem exchange into assimilation and ecosystem respiration: review and improved algorithm. Global Change Biology 11: 1.424-1439). Maximum values of the quantum yield (alpha = 75 mmol.mol(-1)), photosynthetic capacity (A(max) = 3.4 mg CO(2) . m(-2).s-1), gross photosynthesis (P(g,max) = 1.16 g CO(2) . m(-2).d(-1)), and ecological light-use efficiency (epsilon(ecol) = 59 mmol . mol(-1)) of managed grasslands and high-production croplands exceeded those of most forest ecosystems, indicating the potential of nonforest ecosystems for uptake of atmospheric CO(2). Maximum values of gross primary production (8 600 g CO(2) . m(-2).yr(-1)), total ecosystem respiration (7 900 g CO(2) . m(-2).yr(-1)), and net CO(2) exchange (2 400 g CO(2) . m(-2).yr(-1)) were observed for intensively managed grasslands and high-yield crops, and are comparable to or higher than those for forest ecosystems, excluding some tropical forests. On average, 80% of the nonforest sites were apparent sinks for atmospheric CO(2), with mean net uptake of 700 g CO(2) . m(-2).yr(-1) for intensive grasslands and 933 g CO(2) . m(-2).d(-1) for croplands. However, part of these apparent sinks is accumulated in crops and forage, which are carbon pools that are harvested, transported, and decomposed off site. Therefore, although agricultural fields may be predominantly sinks for atmospheric CO(2), this does not imply that they are necessarily increasing their carbon stock.
ISSN: 1550-7424

hal-01190754
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01190754
DOI : 10.2111/rem-d-09-00072.1
PRODINRA : 214043

Éditeur(s) : Sage Publications
Résumé : It is becoming increasingly clear that humans impact marine ecosystems and their biodiversity to a very considerate degree, and evidence of the scale of impact is growing. An enabling factor for this has been a change in focus from local-level studies to increased emphasis on meta-analysis of global or regional-level analysis of fisheries' impact, Results include the facts that the world's total fish catches have been decreasing over the last decade or more; that larger, predatory fishes (table fish) are becoming increasingly scarcer; and that we are appropriating the ocean shelves' primary productivity to the same level as we are for terrestrial ecosystems. Ecosystems are being eroded in countries throughout the world, and though one might get the impression from the IUCN Red List that it is mainly a developed-country problem, it is alarming that the impact of severe overfishing may be on an even larger scale for developing countries. We describe aspects of the risks overfishing poses to marine ecosystems, and point out how ecosystem approaches to fisheries can be used to evaluate the potential impact of alternative fishing policy scenarios.
Il devient de plus en plus clair que les activités humaines altèrent les écosystèmes marins et leur biodiversité à un degré considérable, et les preures de l'échelle des impacts anthropiques s'accumulent. Un des facteurs déterminants de cette prise de conscience réside dans le changement d'échelle des études de l'impact des pêches qui sont passées d'un niveau local à un niveau global ou régional au travers d'études de type méta-analyse. Les résultats obtenus les plus évocateurs incluent le fait que la totalité des captures mondiales de poissons a diminué pendant la dernière décennie ou plus; que les grands prédateurs (l'essentiel des poissons "de table") deviennent de plus en plus rares; et que nous nous approprions la productivité primaire des plateaux continentaux au même titre que nous nous sommes appropriés celle des écosystèmes terrestres. Les écosystèmes sont érodés dans les pays du monde entier, et bien que la liste rouge de l'IUCN laisse penser que c'est principalement le problème des pays développés, il est alarmant de constater que l'impact de la surpêche excessive pourrait être une échelle bien plus grande encore pour les pays en voie de développement. Nous décrivons certains aspects des risques que pose la surpêche pour les écosystèmes marins, et mettons en exergue comment l'approche écosystémique des pêches peut être employée pour évaluer l'impact potentiel de scénarios alternatifs de règlementation des pêches.
Social Science Information (0539-0184) (Sage Publications), 2007-03 , Vol. 46 , N. 1 , P. 67-86

Droits : 2007 Sage Publications
http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/publication-6123.pdf
DOI:10.1177/0539018407073656
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6123/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
Many countries are legally obliged to embrace ecosystem-based approaches to fisheries management. Reductions in bycatch and physical habitat damage are now commonplace, but mitigating more sophisticated impacts associated with the ecological functions of target fisheries species are in their infancy. Here we model the impacts of a parrotfish fishery on the future state and resilience of Caribbean coral reefs, enabling us to view the tradeoff between harvest and ecosystem health. We find that the implementation of a simple and enforceable size restriction of >30 cm provides a win:win outcome in the short term, delivering both ecological and fisheries benefits and leading to increased yield and greater coral recovery rate for a given harvest rate. However, maintaining resilient coral reefs even until 2030 requires the addition of harvest limitations (<10% of virgin fishable biomass) to cope with a changing climate and induced coral disturbances, even in reefs that are relatively healthy today. Managing parrotfish is not a panacea for protecting coral reefs but can play a role in sustaining the health of reefs and high-quality habitat for reef fisheries.
http://hal.univ-reunion.fr/hal-01369752

hal-01369752
http://hal.univ-reunion.fr/hal-01369752
DOI : 10.1073/pnas.1601529113

Résumé : The management of marine fish stocks has stayed non-spatial, considering spatial distributions and their consequences on demography as implicit. But the impacts of climate change and the anthropisation of habitats now require to consider spatial procedures explicitly. The work presented here starts with the question of evaluating population abundance, which requires the modelling of spatial distributions (section 1). Then an ecological understanding of the multi-scale nature of distributions is investigated (section 2). Last, we study how demographic population dynamics depends on the spatial organisation of life cycles (section 3). In this work, the approach has been to combine data acquisition at sea with statistical characterisation and modelling. The application of geostatistics to fisheries survey data provided a solution to abundance evaluation and mapping for many different survey designs. A variety of models were implemented (stationary, non-stationary, non-linear, multivariate, spatio-temporal), depending on the statistical characteristics of the data and the problem posed. Sampling bias were identified by combining different survey methods. New procedures for assessing stocks based on indicators including spatial ones were developed, which prepared for ecosystem assessments. (...)
La gestion des stocks de poissons marins est longtemps restée a-spatiale, considérant implicites les mécanismes d’organisation spatiale qui soutiennent la distribution géographique des ressources et leur dynamique démographique. Mais l’impact du changement climatique et l’anthropisation des habitats nécessitent d’en tenir compte explicitement. Partant de questions d’évaluation qui ont nécessité la modélisation des distributions spatiales (section 1), le déterminisme écologique de ces distributions a ensuite été abordé à différentes échelles (section 2) puis ont été envisagées les conséquences de l’organisation spatiale sur la dynamique démographique des populations (section 3). L’approche scientifique suivie intègre l’acquisition de données à la mer, la caractérisation statistique et la modélisation. L’application de la géostatistique aux données des campagnes halieutiques permet de proposer une solution à l’estimation d’abondance et la cartographie pour une variété de plans d’échantillonnage. Différents modèles sont mis en oeuvre (stationnaires, non-stationnaires, non-linéaires, multivariés, spatio-temporels) en fonction du comportement des données et du problème posé. Des biais d’échantillonnage sont identifiés en combinant différentes méthodes d’échantillonnage. Des procédures nouvelles d’évaluation de stocks à partir d’indicateurs dont des indicateurs spatiaux sont développées, qui préparent à l’évaluation des écosystèmes. (...)

Droits : Ifremer, UPMC
http://archimer.ifremer.fr/doc/00013/12410/9197.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00013/12410/

Éditeur(s) : Université de Bretagne Occidentale
Résumé : Study of mineral suspended particulate matter (SPM) is essential to understand ecosystem dynamics. SPM influences light penetration which is closely related to primary production and carries pollutants and nutrients within the water masses. This work aims to study near-surface mineral SPM dynamics in the English Channel using two complementary methods: remote-sensing by satellites and numerical modelling. Firstly, MODIS and MERIS satellite images processed by the IFREMER semi-analytical algorithm and describing non-algal SPM, are analysed to build three statistical models which are able to estimate near-surface SPM using simple variables, e.g., tidal coefficient, significant wave height and mean chlorophyll-a concentration. Secondly, the three-dimensional hydrosedimentary model ROMS (Regional Ocean Modeling System) is applied in the English Channel. It considers tidal forcing along open boundaries, wind stress at the sea-surface, wave-current interactions in the bottom boundary layer and realistic heterogeneous bottom sediments. Results of the more sophisticated statistical model is also used to impose SPM concentrations at open boundaries. Sensitivity tests on SPM boundary conditions show the importance of prescribing realistic sediment concentrations to improve the model predictions. Biological influences on mineral SPM are also tested using settling velocity and critical shear stress for erosion which vary with seasons. Both statistical and numerical models highlight and locate respective influences of tide, waves and biology on mineral SPM. Numerical predictions indicate that near-surface SPM is mainly composed of silts (>70%). Near-surface suspended silts come largely from seabed resuspension alongshore in the Eastern Channel and from the open boundaries of our limited-area coastal model at the West of Cotentin Peninsula and offshore. Near-surface SPM variations are investigated at semi-diurnal, neap-spring tidal cycle time scales and during a wave event. Finally, dynamics of sediments in the turbidity maximum zone around the Isle of Wight is examined depending on hydrodynamical conditions in order to distinguish the role played by advection and local erosion/settling processes in this area. Keywords: Suspended particulate matter, satellite, remote-sensing, modelling, English Channel, sediments, turbidity, tide, wave
L'étude des matières en suspension (MES) minérales est essentielle pour comprendre le fonctionnement des écosystèmes en Manche : les MES influencent la pénétration de la lumière dans la colonne d'eau, paramètre clé pour la production biologique, et sont susceptibles de transporter des polluants et nutriments. Lors de ce travail, la dynamique des MES minérales de surface en Manche est étudiée à l'aide de deux méthodes complémentaires : l'observation par satellite et la modélisation numérique tridimensionnelle. Dans un premier temps, les images satellite MODIS et MERIS, traitées par l'algorithme semi-analytique développé par l'IFREMER et représentant les MES non-algales de surface, sont analysées afin d'élaborer trois modèles statistiques permettant d'estimer la MES de surface en fonction de variables basiques telles que le coefficient de marée, la hauteur significative des vagues et la concentration moyenne en chlorophylle-a. Dans un deuxième temps, le modèle hydrosédimentaire multiclasse tridimensionnel ROMS (Regional Ocean Modeling System) est implémenté en Manche. Il prend en considération le forçage par la marée aux frontières ouvertes, la contrainte exercée par le vent à la surface de la mer, l'interaction houle-courant en couche limite de fond et l’hétérogénéité spatiale réaliste du lit sédimentaire. Les résultats du modèle statistique le plus sophistiqué sont également utilisés pour forcer la concentration en MES aux frontières ouvertes du domaine de calcul. Des tests de sensibilité sur les conditions limites montrent l'importance de considérer de manière réaliste les sédiments entrant en Manche par les frontières ouvertes lors de la modélisation numérique. L'influence de la biologie sur les MES minérales est testée en utilisant une formulation de la vitesse de chute et de la contrainte critique d'érosion variant saisonnièrement. Grâce à ces deux outils associés, les influences respectives de la marée, de la houle et de la biologie sur les MES minérales sont mises en avant et localisées en Manche. Le modèle numérique prédit que les MES de surface sont composées principalement de silts (>70%). Les silts en suspension en surface proviennent majoritairement du lit sédimentaire près des côtes en Manche orientale et des frontières ouvertes du domaine de calcul à l'ouest de la presqu'île du Cotentin et au large en Manche centrale et orientale. Les variations des MES de surface sont ensuite étudiées aux échelles des cycles de marée semi-diurnes, vive-eau/morte-eau et autour d'un épisode de houles. Enfin, l'évolution de la concentration de sédiments dans la zone de forte turbidité autour de l'île de Wight peut être analysée suivant les conditions hydrodynamiques afin d'évaluer les rôles respectifs des processus locaux d'érosion/dépot et d'advection dans la génération de ces turbidités remarquables. Mots-clés : Matière en suspension, télédétection, satellite, modélisation, Manche, sédiments, turbidité, marée, houle

Droits : 2013 UBO
http://archimer.ifremer.fr/doc/00157/26783/24884.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00157/26783/

Éditeur(s) : Wiley
Résumé : This paper investigates some economic consequences of creating a marine reserve on both fishing and ecotourism, when the range of controllability of fishing effort is limited and the impact of the reserve on ecosystem is considered. The issue is illustrated by the example of creating a no-take zone in part of a region where fishing is managed through a limited entry license system, and which is inhabited by two interacting stocks: a stock of prey (fish) and a stock of predators (seals). While the former is targeted by commercial fishing, the latter is not subject to harvest but is a potential basis for a commercial non-extractive activity (seal watching). Analysis is conducted with the help of a bioeconomic model combining the features of marine reserve modeling and of multispecies modeling. Following a description of the model, results of several simulation runs are presented. These show that creating a marine reserve has more complex economic implications than predicted in studies focused exclusively on one stock and/or commercial fisheries. More specifically, the model shows that the dynamics of the two interacting stocks reduces the benefits of the no-take zone for the fishing industry, while it makes the creation of this zone provide an opportunity for the development of ecotourism. Due to this dynamics, the model suggests that the optimal size of the reserve is larger when ecotourism is taken into account along with fishing activities.
Natural Resource Modeling (1939-7445) (Wiley), 2002-12 , Vol. 15 , N. 4 , P. 387–411

Droits : 2002 Rocky Mountain Mathematics Consortium
http://archimer.ifremer.fr/doc/00244/35506/34010.pdf
DOI:10.1111/j.1939-7445.2002.tb00095.x
http://archimer.ifremer.fr/doc/00244/35506/

Résumé : The brown shrimp Penaeus subtilis growth parameters has been studied by a lot of biologist since the fisheries of the three Guyana and Brazil has been created. The following through of the French Guyana’s fisheries had hallowed us to have an important database about shrimp boat lending. This atabase had permit us to fine the values used for predictive models helped by software like FISAT 2 in this case. This database had permit us to follow the evolution of the growth parameters along the fifteen last years. This study had given us different results which are interesting. First, the L∞ values used by the COPACO workshop (Isaac et al, 1992) are under evaluated and the K values aren’t. in a second time, the K values of the female brown shrimp are decreasing in a significant way since 1989, this case is not the male’s one. At last, we haven’t fond a link between meteorological variation in French Guyana (rainfall, river’s flow, sunshine) or biological data (biomass, density) and the K variations. A ecosystemic model feasibility study had been done for the French Guyana littoral. The data that are existing in the literature aren’t sufficient to build a model of this ecosystem. Future studies will perhaps provide the data that are missing to realize a first model
Les paramètres de croissance de la crevette Penaeus subtilis ont été étudiés par de nombreux auteurs depuis la création de la pêcherie sur le bouclier des Guyanes. Cependant le suivi permanent de cette pêcherie a permis d’avoir une base de données importante sur les débarquements des crevettiers et ainsi de chercher à affiner les estimations utilisées dans les modèles d’évaluation avec l’aide de logiciel prévus à cet effet comme FISAT 2 utilisé ici. Ces données peuvent permettre aussi de suivre l’évolution de ces paramètres au fil des années.Il ressort de cette étude plusieurs résultats intéressants. En premier lieu, les valeurs de L∞utilisées par le groupe de travail de la COPACO (Isaac et al, 1992) sont sous-évaluées et les valeurs de K ne le sont pas forcément. En second lieu, le K des femelles présente une tendance à la diminution sur les quinze dernières années (1989 – 2003), ce qui ne semble pas être le cas des mâles. Enfin, nous ne pouvons rattacher facilement les variations de K enregistrées à aucune donnée météorologique ne concernant que la Guyane (pluviosité, débit des fleuves, insolation), ni à certaines données biologiques (biomasse, densité). La faisabilité d’un modèle écosystémique du littoral a aussi été étudiée. Il en ressort que dans l’état actuel des connaissances sur l’écosystème du littoral guyanais la réalisation d’un modèle n’est pas possible. Mais des campagnes d’études à venir pourraient permettre de recueillir suffisamment de données pour pouvoir dresser un premier modèle.

Droits : 2004 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00077/18859/16433.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00077/18859/

Éditeur(s) : Universite Montpellier II
Résumé : Since 1980, the expansion of a green macro-alga: Valonia aegagropila (C Agardh) is observed in Salses-Leucate lagoon (France). It is currently distributed in the north of the lagoon with important biomasses (40 gDW/m²) eroding the cover of Zostera noltii. The free form of the alga can be transported with the surface or bottom currents depending on seasons. It multiplies mainly by vegetative reproduction. There are few studies on the ecophysiological capacities of V. aegagropila. This work tries to answer why (physiological adaptation) and how (mechanical process of transport) the alga invaded the lagoon, with an approach including observations, experiments in controlled environment and biological and hydrodynamic models. The growth capacities depend on temperature and light intensities, the nutrients absorption rates and internal nitrogen and phosphorus internal quotas were measured and modelled using a Droop model based on internal quota. Vertically transport was studied with laboratory experiments and measurements of biomass transport were made into the lagoon. The biological model (growth, vertical transport, mortality) was coupled to the MARS 3D hydrodynamic model with a meshgrid of 160m. The results show an adaptation of the alga to low availability of phosphorus and an annual growth of biomass controlled by the availability of nutrient during winter. The alga seems to occupy the whole zones where growth is optimal and the risk of invasion of the southern part of the lagoon is limited. This work opens on research prospects on an ecological model (confronting physiological capacities and competition of V. aegagropila, Zostera noltii, green algae and primary production), new physiological experiments, ecological observations and potential valorisation of V. aegagropila.
Depuis 1980, est observée dans l'étang de Salses-Leucate l'expansion d'une macro-algue verte : Valonia aegagropila (C. Agardh). En 2004, elle était présente sur la presque totalité de la moitié nord de la lagune avec des biomasses importantes (jusqu'à 600 gPS/m²). L'algue envahit et érode également la couverture d'herbiers garant de la biodiversité, de la productivité et de la stabilité de l'écosystème. V. aegagropila se reproduit essentiellement de manière végétative (fragmentation des thalles) et possède la particularité de retenir de l'oxygène de la photosynthèse dans sa structure sphérique. Cet oxygène piégé lui donne la possibilité de mouvement sur la verticale et d'être transportée dans le domaine par les courants. Les conditions physico-chimiques de l'étang présentent de fortes variations saisonnières en salinité, en température et en turbidité, ainsi que des apports nutritifs faibles : la production primaire est principalement limitée par le phosphore. Il existe malheureusement peu d'informations sur V. aegagropila ainsi que trop peu de connaissances sur son écophysiologie. Elle semble vivre dans des milieux plutôt oligotrophe dans des régions tropicales à sub-tropicales. Ce travail basé sur une approche d'observations de terrain, d'expérimentations en milieu contrôlé (en laboratoire) et de modélisation des processus, a permis d'une part d'explorer les capacités adaptatives physiologiques de V. aegagropila aux conditions environnementales de l'étang et d'autre part de mettre à jour les modes de fonctionnement de la dynamique spatio-temporelle de la population. Les capacités de croissance ont été mesurées sur un large spectre de température et de lumière. Les capacités d'absorption des sels nutritifs dans l'eau et les facultés de l'algue à stocker l'azote et le phosphore dans ses tissus ont également été étudiées. D'autre part, un modèle de dynamique des populations a été conceptualisé puis développé. Les processus pris en compte dans ce modèle sont la croissance de l'algue (modèle à quota interne), la flottabilité de l'algue et la mortalité par surdensité. Ces processus ont été paramétrés en majeure partie par des expérimentations réalisées en laboratoire. Ce modèle 0D a par la suite était couplé au modèle hydrodynamique MARS3D (modèle Ifremer) mis en place sur la lagune de Salses-Leucate, utilisant deux grilles de calcul (160m ou de 80m de résolution). Les simulations réalisées permettent d'appréhender les capacités spatio-temporelles de la croissance de l'algue dans l'étang, le turnover annuel de la biomasse totale et les attracteurs de biomasse du système sous différents évènements météorologiques. Ces résultats sont comparés avec les répartitions cartographiques de la population observées in situ en 1999 et 2004 et des flux de biomasses mesurés au cours d'observations de terrain entre juin 2003 et septembre 2004. L'ensemble des résultats montre d'une part une adaptation de l'algue à évoluer dans un milieu pauvre en phosphore et d'autre part une croissance annuelle de la biomasse totale qui est principalement contrôlée par les apports hivernaux en sels nutritifs dans la lagune. Les résultats des simulations montrent également que V. aegagropila semble occuper à présent la majeure partie des zones favorables à sa croissance. Il est également montré que si sa capacité de mouvement peut favoriser la dispersion d'individus dans la lagune et accélérer la croissance de la population pour de faibles biomasses initiales, cette même capacité de mouvement joue plutôt un rôle de régulation de la population lorsque la biomasse totale devient importante. On peut penser que le risque de colonisation de l'herbier à zostère de la partie sud de la lagune (bassin de Salses) est limité. Ce travail ouvre enfin des perspectives de recherche sur l'amélioration du modèle de dynamique des populations de l'espèce, sur de nouvelles expérimentations à réaliser ou encore sur la surveillance écologique du milieu. Des propositions sont faites pour concevoir un modèle écologique confrontant les capacités physiologiques des macrophytes (algues vertes, Valonia et zostères) afin d'apréhender les phénomènes de compétitions et les modes de fonctionnement du réseau trophique de la lagune de Salses- Leucate. Des pistes sur la valorisation de la matière algale de V. aegagropila sont enfin proposées.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/these-2453.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2453/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Integrating ecological connectivity into marine ecosystem management and planning is important, especially in a global context of severe fish stocks depletion and growing habitat degradation. Environmental tools such as Marine Protected Areas have been proposed to protect biodiversity, restore damaged ecosystems, sustain fisheries, and rebuild overexploited stocks. The effectiveness of marine protected areas depends in part on the maintenance of connectivity between marine populations, linked by ecological processes such as larval dispersal. In this thesis, we applied a biophysical model driven by ocean currents derived from satellite altimetry to evaluate connectivity between Western Indian Ocean reefs and across the current MPA system in the Mediterranean Sea. We applied different methods of analysis such as graph-theoretic and clustering. In the Western Indian Ocean, marine connectivity analyses show that the number of connections between reefs increases with fish pelagic larval duration. It also highlights a low connectivity across the region and a high interconnectivity within several regions (Mozambique Channel, Mascarene archipelago). In the Mediterranean Sea, connectance is globally low at the regional scale. This connectance is more important in Western than Eastern Mediterranean. Moreover, the marine connectivity analyses revealed high domestic connectivity rates. Depending on the study area, priority reefs or sites for MPA implementation are proposed. Finally, implications for transboundary marine policies and regional cooperation are discussed.
Intégrer les connaissances sur la connectivité écologique dans la gestion des écosystèmes marins est essentiel, surtout dans un contexte d'appauvrissement des ressources marines et de dégradation des habitats côtiers à l'échelle mondiale. Des outils environnementaux, tels que les Aires Marines Protégées ont été mises en œuvre pour protéger la biodiversité, restaurer les écosystèmes endommagés, soutenir les pêcheries et reconstituer les stocks surexploités. Leur efficacité dépend en partie du maintien de la connectivité entre les populations marines, assurée à travers divers processus écologiques dont la dispersion larvaire. Dans le cadre de ce travail de thèse, un modèle biophysique intégrant des données de courants, issues de mesures d'altimétrie par satellite, a été utilisé pour évaluer la connectivité entre les récifs de l'océan Indien d'une part, et à travers le réseau d'AMP de Méditerranée d'autre part. Différentes méthodes d'analyse ont été utilisées, telles que la théorie des graphes et le clustering. Dans l'océan Indien occidental, l'analyse des connectivités marines montre que le nombre de connexions entre les récifs augmente avec la durée de vie larvaire des poissons. Elle met également en évidence une faible connectivité à l'échelle de la région, mais une forte inter-connectivité au sein de plusieurs sous-régions (Canal du Mozambique, Mascareignes). En Méditerranée, la connectance est globalement faible à l'échelle régionale, bien que plus importante dans le bassin occidental que le bassin oriental. L'analyse des connectivités marines montre également un taux de connectivité élevé à l'échelle d'un même pays. Selon le cas d'étude, une liste de récifs ou de sites prioritaires dans la mise en œuvre des AMP a été proposée. Enfin, les implications de ces résultats en termes de politiques transfrontalières et de coopération régionale sont discutées.
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01269631

NNT : 2015LARE0003
tel-01269631
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01269631
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01269631/document
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01269631/file/2015lare0003_ECrochelet.pdf

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : This paper provides a review of ecosystems modelling within the Caribbean using the Ecopath approach and software tools. The review is not intended to provide a direct comparison of the modelled ecosystems attributes and performance, as this would require having access to the models and the data sets used to build the models. Rather, a general comparison is made of the outputs of the models and the various authors’ descriptions of ecosystem attributes.
L’article présente une revue des écosystèmes marins et des ressources halieutiques de la zone Caraïbe en utilisant l’approche Ecopath pour la modélisation des interactions au sein des écosystèmes. En dépit des nombreuses recherches déjà réalisées, la modélisation des écosystèmes marins de la Caraïbe est parcellaire et nécessite des investigations conséquentes.
Caraïbes

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.4529
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/4529

Éditeur(s) : Copernicus Gesellschaft Mbh
Résumé : Deep-sea bivalves found at hydrothermal vents, cold seeps and organic falls are sustained by chemosynthetic bacteria which ensure part or all of their carbon nutrition. These symbioses are of prime importance for the functioning of the ecosystems. Similar symbioses occur in other bivalve species living in shallow and coastal reduced habitats worldwide. In recent years, several deep-sea species have been investigated from continental margins around Europe, West Africa, East America, the Gulf of Mexico, and from hydrothermal vents on the Mid-Atlantic Ridge. In parallel, numerous more easily accessible shallow marine species were studied. We here provide a summary of the current knowledge available on chemosymbiotic bivalves in the area ranging west-to-east from the Gulf of Mexico to Marmara Sea, and north-to-south from the Arctic to the Gulf of Guinea. Characteristics of symbioses in 51 species from the area are summarized for each of the five bivalve families documented to harbor chemosynthetic symbionts (Mytilidae, Vesicomyidae, Solemyidae, Thyasiridae and Lucinidae), and compared among families with special emphasis on ecology, life cycle, and connectivity. Chemosynthetic symbioses are a major adaptation to ecosystems and habitats exposed to reducing conditions, yet relatively little is known regarding their diversity and functioning apart from a few "model species" on which effort has focused over the last 30 yr. In the context of increasing concern about biodiversity and ecosystems, and increasing anthropogenic pressure on Oceans, we advocate for a better assessment of bivalve symbioses diversity in order to evaluate the capacities of these remarkable ecological and evolutionary units to withstand environmental change
Biogeosciences (1726-4170) (Copernicus Gesellschaft Mbh), 2013 , Vol. 10 , N. 5 , P. 3241-3267

Droits : Author(s) 2012. CC Attribution 3.0 License.
http://archimer.ifremer.fr/doc/00133/24417/22431.pdf
DOI:10.5194/bg-10-3241-2013
http://archimer.ifremer.fr/doc/00133/24417/

Éditeur(s) : HAL CCSD MDPI
Résumé : International audience
Malaria remains one of the most common vector-borne diseases in the world and the definition of novel control strategies can benefit from the modeling of transmission processes. However, data-driven models are often difficult to build, as data are very often incomplete, heterogeneous in nature and in quality, and/or biased. In this context, a knowledge-based approach is proposed to build a robust and general landscape-based hazard index for malaria transmission that is tailored to the Amazonian region. A partial knowledge-based model of the risk of malaria transmission in the Amazonian region, based on landscape features and extracted from a systematic literature review, was used. Spatialization of the model was obtained by generating land use and land cover maps of the cross-border area between French Guiana and Brazil, followed by computing and combining landscape metrics to build a set of normalized landscape-based hazard indices. An empirical selection of the best index was performed by comparing the indices in terms of adequacy with the knowledge-based model, intelligibility and correlation with P. falciparum incidence rates. The selected index is easy to interpret and successfully represents the current knowledge about the role played by landscape patterns in malaria transmission within the study area. It was significantly associated with P. falciparum incidence rates, using the Pearson and Spearman correlation coefficients (up to 0.79 and 0.75, respectively; p-value < 0.001), and the linear regression coefficient of determination (reaching 0.63; p-values < 0.001). This study establishes a spatial knowledge-driven, landscape-based hazard malaria index using remote sensing that can be easily produced on a regular basis and might be useful for malaria prediction, surveillance, and control. Keywords: remote sensing; land use and land cover; landscape metric; knowledge-based hazard modeling; malaria; cross-border area between French Guiana and Brazil
ISSN: 2072-4292

hal-01355255
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01355255/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01355255/file/010066865.pdf
IRD : fdi:010066865