Éditeur(s) : Ecole nationale supérieure agronomique de Rennes
Résumé : Describe and gain understanding on fluctuations in animal population over time and space is a central goal of population ecology. This is also crucial to ensure the sustainable management of exploited resources, particularly those with complex population dynamics such as the bluefin tuna. The goal of this work is to collect bluefin tuna catches from the ancestral Mediterranean and Atlantic trap fisheries to (i) characterise long-term fluctuations in bluefin tuna population migrating in the Mediterranean, (ii) analyse their causes et (iii) assess their implications for fisheries management. The bluefin tuna main biological and ecological characteristics are first detailed. Then, the first part presents the trap fishery, and the process of collect and validation of the historical catches. This leads to develop a data base of 54 time-series more than 20 years long, the longest ones spanning about four centuries. Mean historical catches were around 15 000 tons/year ([7 000;25 000]). Time-series are analysed in a second part. Temporal variability of trap catches may be decomposed in three components: 100-year-long periodic fluctuations, 20-year cycles and inter-annual variations. These medium- to long-term fluctuations, representing more than 50% of the variability in the time-series, were synchronous all around the western Mediterranean and adjacent North Atlantic. In contrast, short-term variability was synchronous at a local scale only. It is argued that long-term fluctuations in trap catches could be considered as a proxy for those in abundance, and a synthetic time-series is computed to depict them. Biological and ecological processes that could cause such long-term fluctuations are discussed in a third part. We tested whether long-term fluctuations in Atlantic bluefin tuna might be related to large-scale environmental changes, using long time-series of the North Atlantic Oscillation (NAO), the Length of the Day index (LOD, a proxy of the atmospheric circulation index ACI) and the temperature. Spectral analyses of trap catches, LOD and temperature displayed similar spectra with peak at low frequency, whereas those of the NAO exhibited a broad band spectrum. Regression analyses and tests of correlation did not reveal any clear relationship between trap catches on the one hand and NAO and LOD on the other hand. In contrast, long-term fluctuations in trap catches appear to be negatively and significantly related to long-term trends in temperature. Underlying processes that could explain such a relationship are discussed, with special focus on changes in migration patterns. Finally, implications of such fluctuations in term of fisheries management are discussed in a fourth part. A simulation framework, in which a simulated population dynamics model is coupled with a VPA, is built to test the pertinence of the diagnostic of stock assessment according to different scenarios on fluctuations origins and population status. In the hypothesis of fluctuations linked to variations in the recruitment, VPA appears able to reconstruct the fluctuations but the predictions may be biased if natural fluctuations are not taking into account. In the hypothesis of fluctuations linked to changes in migration pattern, VPA is not able to reconstruct the population dynamics. In a precautionary approach, quotas which follow may be unsuitable in the best case, at worst dangerous if they are defined in comparison with a reference point. The concept of cible reference points, fixe and unique over time, appears not relevant for bluefin tuna; estimate trajectory reference pertinent may prove to be more pertinent.
Décrire et comprendre les fluctuations spatio-temporelles des espèces animales constituent les enjeux majeurs de l'écologie. La question est également cruciale pour réussir la gestion durable des ressources exploitées, en particulier celle du thon rouge, grand pélagique migrateur à la dynamique complexe. L'objectif de ce travail est de collecter les captures historiques de thon rouge par les madragues méditerranéennes et proche atlantiques pour (i) caractériser les fluctuations à long terme de la population migrante en Méditerranée, (ii) étudier leur déterminisme et (iii) évaluer leurs implications en terme de gestion des pêcheries. Après avoir décrit les principales caractéristiques biologiques et écologiques du thon rouge, la première partie présente la pêcherie à la madrague, puis le processus de collecte et de validation des données historiques de captures. Ce dernier conduit à la mise en place d'une base de données de 54 séries de plus de 20 ans, dont les plus longues s'étendent sur près de 4 siècles. Les productions historiques sont estimées à environ 15 000 tonnes/an ([7 000;25 000]). Les séries historiques de captures sont analysées dans la seconde partie. Leur variabilité temporelle peut être décomposée en trois composantes : de larges cycles pseudo-séculaires, des variations périodiques d'une vingtaine d'années et des fluctuations inter-annuelles. Les fluctuations à moyen et long terme, expliquant plus de la moitié de la variance des séries, sont synchrones à l'échelle du bassin méditerranéen occidental et du proche Atlantique. La variabilité inter-annuelle, en revanche, n'est synchrone qu'à une échelle locale. On montre finalement que les fluctuations à long terme des captures peuvent être considérées comme de bons indices des tendances des abondances de la population de thons rouges migrants en Méditerranée. Une série synthétique est construite pour les décrire. Les processus biologiques et écologiques susceptibles d'être à l'origine de ces fluctuations sont discutés dans la troisième partie. L'hypothèse d'un forçage environnemental à grande échelle est testée en utilisant des indices à long terme de l'Oscillation Nord Atlantique (NAO), de la longueur du jour (LOD, un indicateur de l'indice de circulation atmosphérique ACI) et de la température. Les analyses spectrales sur les séries de captures, du LOD et des températures révèlent des spectres similaires, avec un pic sur les basses fréquences, alors que celles sur le NAO conduisent à une large bande spectrale. Les régressions et les tests de corrélations ne montrent aucune relation significative entre les captures par les madragues et le NAO et le LOD. En revanche, les fluctuations à long terme des captures apparaissent significativement et négativement corrélées avec les fluctuations à long terme des températures. Les processus sous-jacents susceptibles d'expliquer une telle relation, en particulier des changements migratoires, sont discutés. Finalement, les implications des fluctuations pour la gestion de la pêcherie sont discutées dans une quatrième partie. Un cadre de simulation, couplant un modèle de dynamique de population à une VPA, est élaboré pour tester la pertinence des diagnostics d'évaluation de stock selon différents scénarios d'origine des fluctuations et d'état de la population. Dans l'hypothèse de fluctuations liées à des variations du recrutement, la VPA apparaît capable de reconstruire les fluctuations mais les prédictions sont biaisées lorsqu'il n'est pas tenu compte des fluctuations naturelles du stock. Dans l'hypothèse de fluctuations liées à des changements migratoires, la VPA est alors incapable de reproduire la dynamique de la population. Dans une approche de précaution, les quotas qui en découlent peuvent se révéler au mieux inappropriés, au pire dangereux s'ils sont définis par rapport à un point de référence. Ce concept de point cible, fixe et unique dans le temps, apparaît inapproprié pour le thon rouge ; estimer des "trajectoires de référence" serait sans doute plus pertinent.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/these-65.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/65/

Éditeur(s) : Wiley-Blackwell
Résumé : The Climate Forecast System Reanalysis (CFSR) provides a wealth of information spanning 1979–2009 for investigation of ocean wind and wave climate. Preprocessing of the data is necessary to remove the dominant seasonal signals and to create time series of semimonthly averaged wind speed and significant wave height over a 0.5° global grid. We perform an empirical orthogonal function (EOF) analysis to extract the dominant space-time patterns. The results for the three major ocean basins show strong zonal structures in the winds and saturation of the swells corroborating prior works with various data sets. We reexamine the CFSR data in the frequency domain to identify periodic signals associated with published climate indices. The Fourier transform of the preprocessed time series generates spectra ranging from 1 month to 15 years period for an EOF analysis. The results demonstrate the spatial structures and periods of climate phenomena. The Arctic Oscillation dominates the Atlantic basin with a broad range of intra-annual signals off the European coasts. The Indian and Pacific Oceans are strongly influenced by inter-annual cycles of the El Niño Southern Oscillation (ENSO) and the Antarctica Oscillation. The Indian Ocean also has strong intra-annual components ranging from 50 to 80 days period. The ENSO proves to be a ubiquitous signal around the globe, and in particular, saturates the Pacific with strong influences in the equatorial region and the Southern Hemisphere Westerlies. A commonality of all basins is that the magnitude and the spatial structure of the intra-annual and inter-annual signals are similar suggesting a wide range of periods in each of the climate cycles examined.
Journal of Geophysical Research: Oceans (21699275) (Wiley-Blackwell), 2014-08 , Vol. 119 , N. 8 , P. 5563-5584

Droits : 2014. American Geophysical Union. All Rights Reserved.
http://archimer.ifremer.fr/doc/00210/32149/30606.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00210/32149/30607.pdf
DOI:10.1002/2013JC009729
http://archimer.ifremer.fr/doc/00210/32149/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
STUDY QUESTION: Do freezing and in vitro culture procedures enhance the expression of proteins involved in apoptotic or autophagic pathways in murine pre-pubertal testicular tissue? SUMMARY ANSWER: IVM strongly modified apoptosis- and autophagy-related relative protein levels in mice testicular tissue whereas the impact of cryopreservation procedures was minimal at the end of the culture. WHAT IS KNOWN ALREADY: In vitro spermatogenesis remains a challenging technical issue as it imposes to find a very close balance between survival and death of germ cell natural precursors (i.e. gonocytes and spermatogonia), which will eventually undergo a complete spermatogenesis close to in vivo conditions. The establishment of efficient culture conditions coupled with suitable cryopreservation procedures (e.g. controlled slow freezing [CSF] and solid surface vitrification [SSV]) of pre-pubertal testicular tissue is a crucial step in the fields of fertility preservation and restoration to improve the spermatic yield obtained in vitro. STUDY DESIGN, SIZE, DURATION: Here, we study cryopreservation procedures (i.e. CSF or SSV) and the impact of culture media compositions. A first set of 66 mouse pre-pubertal testes were directly cultured during 30, 36, 38 and 60 days (D) from 2.5 to 6.5-day-old CD-1 mice to evaluate the impact of time-aspect of culture and to endorse the reverse phase protein microarrays (RPPM) technique as an adapted experimental tool for the field of in vitro spermatogenesis. Ninety others fresh, slow-frozen and vitrified pre-pubertal testes were cultured during 30 days for the principal study to evaluate the impact of cryopreservation procedures before and after culture. Thirty-four testes dissected from 2.5, 6.5, 36.5, 40.5, 42.5 and 62.5 days postpartum (dpp) mice, corresponding to the time frames of spermatogenesis orchestrated in vitro, were used as in vivo controls. PARTICIPANTS/MATERIALS, SETTING, METHODS: After in vitro culture, testicular tissue samples originated from 2.5 or 6.5-day-old CD-1 male mice were analyzed using RPPM. This targeted proteomic technique allowed us to assess the expression level of 29 apoptosis- and autophagy-related factors by normalizing blank-corrected signal values. In addition, morphological analyses (e.g. HES, PAS, TRA98 and CREM) and DNA fragmentation in intra-tubular cells (i.e. terminal deoxynucleotidyl transferase dUTP nick end labeling; TUNEL) were assessed for the distinct experimental conditions tested as well as for in vivo control mouse testes. MAIN RESULTS AND THE ROLE OF CHANCE: A validation of the RPPM procedure in the field of in vitro spermatogenesis was completed with assay and array robustness before a principal study concerning the evaluation of the impact of in vitro culture and cryopreservation procedures. The proportion of elongated spermatids and the total cell number per seminiferous tubule tended to be very different between the in vivo and in vitro conditions (P < 0.05), suggesting the presence of a beneficial regulation on the first spermatogenesis wave by intrinsic apoptosis (Caspase₉) and autophagy (Atg5) factors (P < 0.0003 and r2 = 0.74). Concerning the impact of culture media compositions, a basic medium (BM) composed of αMEM plus 10% KnockOut™ serum replacement and gentamicin supplemented with retinol (Rol) and vitamin E (Vit. E) was selected as the best culture medium for fresh 6.5 dpp tissue cultured during 30D with 27.7 ± 8.10% of seminiferous tubules containing elongated spermatids. Concerning the impact of cryopreservation procedures, SSV did not have any impact on the morphological parameters evaluated after culture in comparison to fresh tissue (FT) controls. The proportion of tubules with elongated spermatids on testicular explants cultured with BMRol+Vit. E was not different between SSV (6.6 ± 1.6%) and CSF (5.3 ± 1.9%); however, round spermatids were observed more frequently for SSV (19 ± 6.2%) than CSF (3.3 ± 1.9%, P = 0.0317). Even if the proportion of TUNEL-positive cells for BMRol+Vit. E was higher at D30 after SSV (4.12 ± 0.26%) than CSF (1.86 ± 0.12%, P = 0.0022) and FT (2.69 ± 0.33%, P = 0.0108), the DNA damages observed at the end of the culture (i.e. D30) were similar to respective 6.5 dpp controls. In addition, the relative protein level expression ratio of an apoptotic factor, the phosphorylated FADD on Fas, was reduced by 64-fold in vitrified testes cultured with BMRol+Vit. E. Furthermore, we found in this study that the StemPro®-34 SFM culture medium supplemented with growth factors (e.g. EGF, bFGF, GDNF and LIF) prevented the differentiation of spermatogonial stem cells in favor of a significant proliferation with a better architectural pattern than in vivo 6.5 dpp controls with an increase of seminiferous tubules area for FT (P = 0.0357) and CSF (P = 0.0317). LIMITATIONS REASONS FOR CAUTION: Despite our promising results, the evaluation of apoptotic- and autophagic-related proteins was studied for a limited amount of proteins and on global testicular tissue. WIDER IMPLICATIONS OF THE FINDINGS: The data presented herein will help to improve apoptotic and autophagic understanding during the first spermatogenic wave. Moreover, our findings illustrate for the first time that, using finely-tuned experimental conditions, a testicular in vitro culture combined with proteomic technologies may significantly facilitate the study of cryopreservation procedures and in vitro culture evaluations. This study may also contribute to improve work on testicular tissues from pre-pubertal and adolescent cancer survivors. STUDY FUNDING/COMPETING INTEREST(S): This study was supported by a Ph.D. grant from the Rouen Normandie Université and a financial support from 'la Ligue nationale contre le cancer' (both awarded to L.D.), funding from Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Agence de la Biomédecine, and co-supported by European Union and Région Normandie. Europe gets involved in Normandie with European Regional Development Fund (ERDF). The authors declare that there is no conflict of interest.
Molecular Human Reproduction

hal-01647081
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01647081
DOI : 10.1093/molehr/gax054
PUBMED : 29040674

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
We present a new 3-D GPS velocity solution for 182 sites for the region encompassing the Western Alps, Pyrenees, and southern France. The velocity field is based on a Precise Point Positioning (PPP) solution, to which we apply a common-mode filter, defined by the 26 longest time series, in order to correct for network-wide biases (reference frame, unmodeled large-scale processes, etc.). We show that processing parameters, such as troposphere delay modeling, can lead to systematic velocity variations of 0.1–0.5 mm yr−1 affecting both accuracy and precision, especially for short (< 5 years) time series. A velocity convergence analysis shows that minimum time-series lengths of  ∼  3 and  ∼  5.5 years are required to reach a velocity stability of 0.5 mm yr−1 in the horizontal and vertical components, respectively. On average, horizontal residual velocities show a stability of  ∼  0.2 mm yr−1 in the Western Alps, Pyrenees, and southern France. The only significant horizontal strain rate signal is in the western Pyrenees with up to 4  ×  10−9 yr−1 NNE–SSW extension, whereas no significant strain rates are detected in the Western Alps (< 1  ×  10−9 yr−1). In contrast, we identify significant uplift rates up to 2 mm yr−1 in the Western Alps but not in the Pyrenees (0.1 ± 0.2 mm yr−1). A correlation between site elevations and fast uplift rates in the northern part of the Western Alps, in the region of the Würmian ice cap, suggests that part of this uplift is induced by postglacial rebound. The very slow uplift rates in the southern Western Alps and in the Pyrenees could be accounted for by erosion-induced rebound.
ISSN: 1869-9529

hal-01395116
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01395116
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01395116/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01395116/file/nguyen2016.pdf
DOI : 10.5194/se-7-1349-2016

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag
Résumé : International audience
The ENE-WSW Autun Shear Zone in the northeastern part of the French Massif Central has been interpreted previously as a dextral wrench fault. New field observations and microstructural analyses document a NE-SW stretching lineation that indicates normal dextral motions along this shear zone. Further east, similar structures are observed along the La Serre Shear Zone. In both areas, a strain gradient from leucogranites with a weak preferred orientation to highly sheared mylonites supports a continuous Autun-La Serre fault system. Microstructural observations, and shape and lattice-preferred orientation document high-temperature deformation and magmatic fabrics in the Autun and La Serre granites, whereas low- to intermediate-temperature fabrics characterize the mylonitic granite. Electron microprobe monazite geochronology of the Autun and La Serre granites yields a ca. 320 Ma age for pluton emplacement, while mica 40Ar-39Ar datings of the Autun granite yield plateau ages from 305 to 300 Ma. The ca. 300 Ma 40Ar-39Ar ages, obtained on micas from Autun and La Serre mylonites, indicate the time of the mylonitization. The ca. 15-Ma time gap between pluton emplacement and deformation along the Autun-La Serre fault system argue against a synkinematic pluton emplacement during late orogenic to postorogenic extension of the Variscan Belt. A ductile to brittle continuum of deformation is observed along the shear zone, with Lower Permian brittle faults controlling the development of sedimentary basins. These results suggest a two-stage Late Carboniferous extension in the northeastern French Massif Central, with regional crustal melting and emplacement of the Autun and La Serre leucogranites around 320 Ma, followed, at 305-295 Ma, by ductile shearing, normal brittle faulting, and subsequent exhumation along the Autun-La Serre transtensional fault system.
ISSN: 1437-3254

insu-00596918
https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-00596918
https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-00596918/document
https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-00596918/file/Article_Morvan_v_INIST.pdf
DOI : 10.1007/s00531-011-0673-z

Éditeur(s) : The National Academy of Sciences of the USA
Résumé : The patterns of variations in fisheries time series are known to result from a complex combination of species and fisheries dynamics all coupled with environmental forcing (including climate, trophic interactions, etc.). Disentangling the relative effects of these factors has been a major goal of fisheries science for both conceptual and management reasons. By examining the variability of 169 tuna and billfish time series of catch and catch per unit effort (CPUE) throughout the Atlantic as well as their linkage to the North Atlantic Oscillation (NAO), we find that the importance of these factors differed according to the spatial scale. At the scale of the entire Atlantic the patterns of variations are primarily spatially structured, whereas at a more regional scale the patterns of variations were primarily related to the fishing gear. Furthermore, the NAO appeared to also structure the patterns of variations of tuna time series, especially over the North Atlantic. We conclude that the patterns of variations in fisheries time series of tuna and billfish only poorly reflect the underlying dynamics of these fish populations; they appear to be shaped by several successive embedded processes, each interacting with each other. Our results emphasize the necessity for scientific data when investigating the population dynamics of large pelagic fishes, because CPUE fluctuations are not directly attributable to change in species' abundance.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (0027-8424) (The National Academy of Sciences of the USA), 2008-04 , Vol. 105 , N. 14 , P. 5420-5425

Droits : 2008 by The National Academy of Sciences of the USA
http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/publication-3984.pdf
DOI:10.1073/pnas.0709034105
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3984/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : L’agriculture aux Antilles, depuis la période coloniale, est orientée vers quelques monocultures, de la canne à sucre à la banane en passant par le coton et le café (Lasserre, 1961). Aux côtés de cette agriculture exportatrice, les agrosystèmes multi-espèces sont aussi très anciens mais ont longtemps fonctionné de façon isolée et sur une base empirique notamment à travers les jardins familiaux ou "jardin créole" (Degras, 2005). De plus en plus, l'intérêt, voire la nécessité d'une diversification professionnelle de l'activité agricole aux Antilles est admise, reconnue voire soutenue compte tenu des impasses agronomiques, environnementales ou économiques L’insularité d’un territoire entraine de nombreux conflits d’usage dans la gestion du capital foncier. La nécessité de terres à bâtir dans un contexte d’augmentation de la population, la nécessité de protection de la forêt tropicale, des forêts marécageuses de mangroves et des zones à proximité des rivières amènent de nombreuses questions en matière d’aménagement et de gestion des territoires surtout lorsqu’ils sont exigus. L’agriculture est un secteur consommateur d’espace et ce pour l’ensemble des productions agricoles Aux Antilles, l’agriculture connaît de lourds héritages avec la prépondérance des cultures destinées à l’exportation et gourmandes en surfaces, la canne à sucre et la banane. La gestion des territoires mais aussi des pratiques agricoles sont très clairement remises en cause depuis la crise médiatique de la chlordécone en 2002 et les années suivantes par les successives interdictions prononcées par arrêtés préfectoraux depuis la crise sociale de 2009 décriant les cultures d’exportation pour leur caractère polluant et intensif et appelant à un retour aux productions locales plus respectueuses de l’environnement. Les systèmes productifs sont sans cesse en évolution. Ces changements sont le reflet des choix productifs effectués par les exploitants et par des pratiques agricoles mises en œuvre. L’analyse du système se fera de manière à identifier les spéculations initiales et leurs évolutions au cours de la dernière décennie. La diffusion spatiale de ces pratiques agricoles ne s’effectue pas linéairement car, dans les systèmes productifs, le phénomène est bien plus complexe dont la compréhension nécessite la prise en compte (i) des interactions entre les acteurs et (ii) de l’aspect temporel. L’émission d’un message informatif évolue dans le temps ainsi que les acteurs et leurs interactions sur le territoire. Même si les agriculteurs sont soumis à des facteurs exogènes communs à l’ensemble de leur exploitation, ils sont tout de même concernés par des influences provenant des réseaux au sein desquels ils sont insérés. Le processus classique de diffusion des pratiques agricoles est résumé par la courbe logistique (Hägerstrand, 1967). Sur le territoire, la situation d’adoption de pratiques n’est pas homogène. Pour une compréhension et une anticipation quant à l’évolution du territoire, l’ensemble des DOM antillais sera sujet à étude. Dans un premier temps, l’analyse des spéculations des systèmes multi-espèces à travers une analyse exploratoire des données permettra de mieux appréhender les dynamiques spatiales perceptibles sur le territoire et ce en fonction du type de production agricole. Pour modéliser la dynamique spatiale de diffusion des choix, il faudra envisager une combinaison de plusieurs approches géographiques pour une meilleure compréhension de la situation et ce en fonction de la complexité du système multi-espèces proposé au sein d’une même exploitation. Il s’agit par la géographie historique de s’intéresser aux changements survenus dans les modèles agricoles au cours du temps en d’étudier l'utilisation des terres agricoles au cours de la dernière décennie (approche diachronique) et la photographie du paysage agricole aux Antilles Françaises (approche synchronique). Ces deux approches synchroniques et diachroniques, révèlent respectivement les corrélations entre plusieurs éléments qui se trouvent dans un même lieu à une période donnée et met l'accent sur les processus de l'activité agricole qui sous-tendent les changements dans les modèles géographiques. La diffusion d’une pratique peut être analysée tout d’abord temporellement (Rogers, 1983) en estimant qu’il n’existe pas de différenciation spatiale dans le phénomène. Dans un deuxième temps, la considération de la dimension spatiale (Hägerstrand, 1967) dans l’étude de la diffusion devient primordiale pour l’étude de diffusion d’une pratique agricole dans des territoires diversifiés même s’ils sont insulaires et exigus. Les processus de diffusion spatiale sont perceptibles à différentes échelles spatiales (Aber, 1972) et il s’agit de déterminer les échelles d’études les plus pertinentes pour clarifier le phénomène : de l’échelle régionale à l’échelle locale (Morrill, 1970). La difficulté est de sélectionner la meilleure échelle pour établir un modèle de diffusion spatio-temporelle (Morrill, 1970). Il s’agira, dans la présente étude, d’opter pour une analyse en « time-geography » (Chardonnel, 2001) à savoir une analyse des réactions des individus dans le temps et l’espace : le comportement des agriculteurs face à leur pratique de 2000 à aujourd’hui et la diffusion spatio-temporelle de ces pratiques agricoles sur le territoire. L’objectif principal de la thèse est de comprendre et de modéliser les processus de diffusion spatiale des pratiques agricoles dans les systèmes productifs multi-espèces aux Antilles françaises. Il s’agira de retracer l’apparition des pratiques agricoles de la dernière décennie des agriculteurs n’ayant pas de mono-spéculation mais développant des systèmes productifs multi-espèces et touchant par conséquent différents secteurs agricoles (banane, canne, élevage, maraîchage…) et tout cela dans une même exploitation agricole. L’enjeu sera d'identifier les différents évènements significatifs survenus et subis par les différentes filières agricoles concernées et les producteurs, évènements marquants intervenus au cours de la période, tant climatiques, parasitaires, qu'organisationnels, structurels, réglementaires, marchands ou sociaux. Chaque agriculteur souhaite faire converger son système de production vers ses objectifs productifs en tenant compte des évolutions contextuelles d’exercice de son activité et ce, en fonction de l’offre technologique disponible dans la période correspondante. Il s’agira d’établir un modèle spatio-temporel de diffusion d’pratiques agricoles en tenant compte des facteurs moteurs et facteurs barrières à l’adoption et en donnant des poids différents aux différents facteurs d’influence. L’adoption de pratiques agricoles dépend de la situation géographique de l’exploitation, de la distance par rapport à l’innovateur : le principal déterminant spatial de l’adoption dans les filières de diversification, moins sujettes à un message technique unilatéral prodigué pour des filières très structurées, est l’effet de « mimétisme » (Girard, 1961). Cette adoption dépend également de l’interconnexion entre les différents acteurs de filière. Ce lien n’est peut-être pas nécessairement lié à la proximité géographique des individus mais à une proximité sociale résultant de l’appartenance à un ou plusieurs réseaux sociaux (Granovetter, 1983). L’accessibilité à l’information et la réaction de l’agriculteur face aux changements de pratiques dépend de son appartenance à un groupe social. Dans des filières très bien structurées (canne à sucre et banane), le message technique diffusé est homogène à toute la population et est influencé grandement par des facteurs exogènes à l’exploitant. La dimension spatiale et les réseaux sociaux sont des facteurs influençant les choix des exploitants et ce selon le type d’exploitations (monoculture ou multi-espèces). Actuellement, il semblerait que ce soit le type d’exploitation (taille et localisation) qui influence le choix de l’exploitation dans l’adoption d’innovation en milieu bananier (Mantran, 2011). A partir des techniques d’exploration des données, on pourra aboutir à la mise au point d’un modèle explicatif de la diffusion d’informations et ce probablement par type de production. Cette étude permettra une meilleure connaissance du territoire et de ses dynamiques spatiales agricoles.
Doctoriales du CEREGMIA
Cayenne, Guyane, France

hal-01458425
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01458425
PRODINRA : 384817

Éditeur(s) : HAL CCSD Lippincott, Williams & Wilkins
Résumé : International audience
BACKGROUND: People in developed countries are widely exposed to low levels of organochlorine pesticides, polychlorinated biphenyls (PCBs), and polybrominated diphenyl ethers (PBDEs). Seafood is a major contributor to PCB exposure. Toxicity of those various pollutants to reproductive and endocrine functions raises questions about possible effects on fertility. We explored whether serum levels of these pollutants and seafood consumption were associated with the fertility of couples enrolled in a French birth cohort (PELAGIE). METHODS: Time-to-pregnancy was investigated in 3,421 pregnant women by asking how many months they had taken to conceive. Levels of 14 organochlorine pesticides, 12 PCBs, and 10 PBDE compounds were measured in cord blood serum from a random subcohort (n = 394). Mercury concentrations measured in maternal hair were considered as a potential coexposure. Fecundability odds ratios (ORs) were estimated from multivariate discrete-time Cox proportional hazard models. RESULTS: Shellfish consumption was associated with longer time-to-pregnancy (fecundability OR ≥twice/week vs. 0.410 µg/L vs. <0.266 µg/L, fecundability OR = 0.46 [0.32-0.66]). In multiple sensitivity analyses, reduced fecundability was most consistently associated with shellfish consumption, p,p'-DDE, total PCBs, PCB153, and PCB187. Models that simultaneously included multiple coexposure factors led to similar conclusions. CONCLUSIONS: Our findings were robust in sensitivity analyses, including analysis restricted to primiparous women. These results suggest that PCBs, p,p'-DDE, and other shellfish contaminants may impair human fertility.
ISSN: 1044-3983

inserm-00826533
http://www.hal.inserm.fr/inserm-00826533
DOI : 10.1097/EDE.0b013e31827f53ec
PUBMED : 23348067

Éditeur(s) : HAL CCSD Seismological Society of America
Résumé : International audience
We present an improvement of the maximum intersection (MAXI) method in which absolute earthquake location is defined by the maximum intersection number of hyperbolic equal differential time (EDT) volumes (one EDT volume being described as all grid nodes satisfying the arrival‐time differences between two stations, ± a tolerance value known as TERR). This 3D technique is well adapted to a strongly heterogeneous environment, avoids the depth versus origin‐time trade‐off (even using P arrivals alone), and objectively filters possible erroneous arrival times. Improvements consist of introducing an iterative multiscale approach on the TERR parameter and conducting a hierarchy of grid discretization to refine the preliminary solution (multigrid algorithm). The outlier cleaning process is strengthened by conducting statistical analyses based on the number of EDT volume intersections per station, rather than on travel‐time residues. Processing two series of synthetic arrival times computed in the 3D seismological configuration of the southernmost Ryukyu subduction zone, offshore Taiwan, allows us to (1) confirm MAXI robustness, even when arrival times are highly disturbed or azimuthal coverage largely reduced, and (2) show that MAXI, by limiting trade‐offs between origin time and depth and between epicentral position and depth, is less affected by a wrong velocity model than a technique that minimizes travel‐time residues. To conclude, we apply the MAXI method to locate earthquakes recorded by the combined Central Weather Bureau of Taiwan (CWB) and the Japanese Meteorological Agency (JMA) networks (1991-2008) within a georealistic a priori 3D P‐velocity model. Hypocenter determinations are selected based on MAXI confidence factors, and earthquake clustering along well‐known tectonic features witnesses hypocenter determination accuracy.
ISSN: 0037-1106

hal-00725227
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00725227
DOI : 10.1785/0120100311

Résumé : The development of large pelagic fishing in the French Antilles is an integral part of a difficult economic situation of the fishing sector in Martinique where this development can seem like a solution to increasingly acute problems. Indeed, for the regulatory authorities as well as for many participants in the sector, it is imperative to find solutions to the lack of profitability of a part of the fishing ships and to confront the regular increase of the share of imports in supplying Martinique with seafood. This question about the possibilities of developing large pelagic fishing is not new since it is already mentioned in the Notice from the Economic and Social Committee of the Martinique Region in 1982. We will not show in this document a detailed analysis of small-scale fishing in Martinique. Since the latter has been abundantly studied by the team of the Caribbean Oceanological and Halieutic Research Centre (PROHC) between 1985 and 1987, we will take up these principal conclusions (with which we are in full agreement) and bring them up to date based on data collected during our mission from 11 to 24 April 1988. The first section devoted to the supply structure (local fishing and imports) will attempt to define under what conditions large pelagic fishing can be developed. The second section will address marketing and demand. Indeed, at the same time as the problems of developing large pelagic fishing, we are faced with the question of the organisation of seafood markets. This organisation is a fundamental issue for the small-scale fishing sector in the French Antilles since its long-term future depends upon it by setting different prices and amounts exchanged according to the structure it is given. We will come to a conclusion on the economic conditions of developing a large pelagic fishery and organising a market, this based on research and study work already done. We will indicate which investigations must be conducted to complete the set of factors for decision support in this area. To perform this assessment, we reconstructed from the long series 1970-1986 (sometimes with significant inadequacies): these are presented as an appendix.
(OCR non controlé) Le développement de la pêche de grands pélagiques dans les Antilles Françaises s'inscrit dans un contexte économique difficile du secteur de la pêche en Martinique où ce développement peut apparaître comme une solution à des problèmes de plus en plus aigus. En effet, pour les autorités de tutelle ainsi que pour de nombreux intervenants dans le secteur, il est impératif de trouver des solutions au manque de rentabilité d'une partie des unités de pêche et de faire face à l'augmentation régulière de la part des importations dans l'approvisionnement de la Martinique en produits de la mer. Cette question sur les possibilités d'un développement de la pêche de grands pélagiques n'est pas nouvelle puisqu'elle est déjà évoquée dans l'Avis du Comité Economique et Social de la Région Martinique en 1982. On ne présentera pas dans ce document une analyse détaillée de la pêche artisanale en Martinique. Celle-ci ayant été abondamment étudiée par l'équipe du Pôle de Recherche Océanologique et Halieutique Caraïbe (PROHC) entre 1985 et 1987, on reprendra ces principales conclusions (avec lesquelles nous sommes en plein accord) en les actualisant à partir des informations recueillies lors de notre mission du 11 au 24 avril 1988. La première section consacrée à la structure d'offre (pêche locale et importations) s'attachera à définir dans quelles conditions peut être développée une pêche de grands pélagiques. Là seconde section traitera de la commercialisation et de la demande. En effet parallèlement aux problèmes de développement d'une pêche de grands pélagiques, se pose la question de l'organisation du marché des produits de la mer. Cette organisation est un enjeu primordial pour le secteur de la pêche artisanale dans les Antilles Françaises puisqu'elle conditionne son avenir à long terme en définissant des prix et des quantités échangées différents suivant la structure qu'on lui donne. On conclura sur les conditions économiques du développement d'une pêche de grands pélagiques et de l'organisation d'un marché, ceci à partir des travaux de recherche et des études déjà réalisés. On indiquera quelles investigations doivent être menées pour compléter l'ensemble des éléments d'aide à la décision dans ce domaine. Pour effectuer cette évaluation, on a reconstituer des séries longues 1970-1986 (parfois avec des carences importantes) : celles-ci sont présentées en annexe.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1988/rapport-2519.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2519/

Éditeur(s) : Agrocampus Ouest
Résumé : The origin of fish stocks variability is a key question in fisheries science. The exploitation indeed has an important effect in terms of biomass reduction, but environmental forcing is of central interest as it affects numerous key biological processes. Recent theoretical results have shown that the nature of the environmental fluctuations, the environmental noise, has important ecological consequences on populations and particularly on their fluctuations. In addition the effects of exploitation, that are not a simple removal of individuals but also profoundly modifies the demography, the structure and the trophic interactions of fish stocks, can interact with environmental effects. Through an extensive analysis of time series we aim at understanding the effects of environmental noise on fish stocks variability, according to their biological characteristics (life-history traits) and their exploitation. A technique of time series comparison allows to propose that the fluctuations of Atlantic large pelagics are inherited from the interaction between environmental effects, endogenous dynamics and exploitation. We then show that the colour of environmental noise affects the variability of time series, its effects depending on the life-history traits of species. Finally, preliminary results on bentho-demersal and pelagic stocks from the North Atlantic suggest that the exploitation increases the sensitivity of fish stocks to the colour of environmental noise and affects their variability, according to their life-history traits.
L'origine de la variabilité des stocks de pêche est une question centrale en halieutique. Si l'exploitation tient un rôle important dans la réduction de biomasse, le forçage environnemental affecte de nombreux processus biologiques clés. Des résultats théoriques récents ont montré que la nature des fluctuations environnementales, la couleur du bruit environnemental, avait des implications écologiques importantes sur les populations et notamment sur leurs fluctuations. De plus, les effets environnementaux peuvent agir en interaction avec l'exploitation qui ne consiste pas en un simple prélèvement d'individus, mais qui modifie profondément la démographie, la structure et les interactions trophiques des stocks. Au travers de l'analyse extensive de séries temporelles, on essaye ici de comprendre les effets de la couleur du bruit environnemental sur la variabilité des stocks en fonction de leurs caractéristiques biologiques (traits d'histoire de vie) et de leur état d'exploitation. Le développement d'une technique de comparaison des séries temporelles permet de proposer que les fluctuations des grands pélagiques de l'Atlantique sont héritées de l'interaction entre effets environnementaux, dynamique interne et dynamique de l'exploitation. On montre ensuite que la couleur du bruit environnemental affecte la variabilité des séries temporelles, mais que son effet dépend des traits d'histoire de vie des espèces. Enfin, des résultats préliminaires sur les stocks bentho-démersaux et pélagiques de l'Atlantique Nord, suggèrent que l'exploitation augmente la sensibilité des stocks à la couleur du bruit environnemental et affecte leur variabilité en fonction de leurs traits d'histoire de vie.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/these-6596.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6596/

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
The Jacupiranga Complex is one of several Meso-Cenozoic alkaline intrusive complexes along the margins of the intracratonic Paraná Basin in southern Brazil. The complex encompasses a wide range of rock-types, including dunites, wehrlites, clinopyroxenites, melteigites-ijolites, feldspar-bearing rocks (diorites, syenites, and monzonites), lamprophyres and apatite-rich carbonatites. While carbonatites have been extensively investigated over the last decades, little attention has been paid to the silicate rocks. This study presents new geochonological and geochemical data on the Jacupiranga Complex, with particular emphasis on the silicate lithotypes. 40Ar/39Ar ages for different lithotypes range from 133.7 ± 0.5 Ma to 131.4 ± 0.5 Ma, while monzonite zircon analyzed by SHRIMP yields a U-Pb concordia age of 134.9 ± 1.3 Ma. These ages indicate a narrow time frame for the Jacupiranga Complex emplacement, contemporaneous with the Paraná Magmatic Province. Most of the Jacupiranga rocks are SiO2-undersaturated, except for a quartz-normative monzonite. Based on geochemical compositions, the Jacupiranga silicate lithotypes may be separated into two magma-evolution trends: (1) a strongly silica-undersaturated series, comprising part of the clinopyroxenites and the ijolitic rocks, probably related to nephelinite melts and (2) a mildly silica-undersaturated series, related to basanite parental magmas and comprising the feldspar-bearing rocks, phonolites, lamprophyres, and part of the clinopyroxenites. Dunites and wehrlites are characterized by olivine compositionally restricted to the Fo83-84 interval and concentrations of CaO (0.13–0.54 wt%) and NiO (0.19–0.33 wt%) consistent with derivation by fractional crystallization, although it is not clear whether these rocks belong to the nephelinite or basanite series. Lamprophyre dikes within the complex are considered as good representatives of the basanite parental magma. Compositions of calculated melts in equilibrium with diopside cores from clinopyroxenites are quite similar to those of the lamprophyres, suggesting that at least a part of the clinopyroxenites is related to the basanite series. Some feldspar-bearing rocks (i.e. meladiorite and monzonite) show petrographic features and geochemical and isotope compositions indicative of crustal assimilation, although this may be relegated to a local process. Relatively high CaO/Al2O3 and La/Zr and low Ti/Eu ratios from the lamprophyres and calculated melts in equilibrium with cumulus clinopyroxene point to a lithospheric mantle metasomatized by CO2-rich fluids, suggesting vein-plus-wall-rock melting mechanisms. The chemical differences among those liquids are thought to reflect both variable contributions of melting resulting from veins and variable clinopyroxene/garnet proportions of the source.
ISSN: 0895-9811

hal-01583547
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01583547
DOI : 10.1016/j.jsames.2017.05.009

Éditeur(s) : Pergamon-elsevier Science Ltd
Résumé : Catch data of large pelagic fish such as tuna, swordfish and billfish are highly variable ranging from short to long term. Based on fisheries data, these time series are noisy and reflect mixed information on exploitation (targeting, strategy, fishing power), population dynamics (recruitment, growth, mortality, migration, etc.), and environmental forcing (local conditions or dominant climate patterns). In this work, we investigated patterns of variation of large pelagic fish (i.e. yellowfin tuna, bigeye tuna, swordfish and blue marlin) in Japanese longliners catch data from 1960 to 2004. We performed wavelet analyses on the yearly time series of each fish species in each biogeographic province of the tropical Indian and Atlantic Oceans. In addition, we carried out cross-wavelet analyses between these biological time series and a large-scale climatic index, i.e. the Southern Oscillation Index (Sol). Results showed that the biogeographic province was the most important factor structuring the patterns of variability of Japanese catch time series. Relationships between the SOI and the fish catches in the Indian and Atlantic Oceans also pointed out the role of climatic variability for structuring patterns of variation of catch time series. This work finally confirmed that Japanese longline CPUE data poorly reflect the underlying population dynamics of tunas. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.
Progress In Oceanography (0079-6611) (Pergamon-elsevier Science Ltd), 2010-07 , Vol. 86 , N. 1-2 , P. 276-282

Droits : 2010 Elsevier B.V. All rights reserved.
http://archimer.ifremer.fr/doc/00011/12231/9029.pdf
DOI:10.1016/j.pocean.2010.04.019
http://archimer.ifremer.fr/doc/00011/12231/

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Human exposure to dechloranes has been evaluated in Western Europe (France) with the analysis of Dechlorane Plus (DP), Dechloranes (Dec) 602, 603 and 604, Chlordene Plus (CP) and Mirex in 48 serum samples collected between 2003 and 2005. While no production source has been identified in Europe until now, detection frequencies for all investigated dechloranes were high, except for Dec 604 which was below detection limit for all samples. The mean DP concentration was 1.40±1.40ng/g lipid weight (lw), lower than levels reported in serum from Chinese population, but higher than levels reported in Canadian human milk. To the best of our knowledge, this is the first time that ∑5dechlorane levels are reported for human serum. A specific pattern of contamination was found (Dec 603>DP>Mirex>Dec 602>CP) compared to other biota samples that have been analyzed from Europe, with Dec 603 as the most abundant dechlorane (mean level: 2.61±2.63ng/g lw). Dec 603 and CP levels were correlated with age and with levels of some bioaccumulative organochlorine pesticides (OCPs). These results indicate that bioaccumulation properties should be further investigated and taken in consideration when assessing human exposure to dechloranes. For comparison purposes, polybrominated diphenyl ether (PBDE) levels were also measured for BDE-47, -99, -100, -153 and -154 in the serum samples. As expected, BDE-47 and BDE-153 were the major congeners with mean levels of 2.06±1.80ng/g lw and 1.39±0.97ng/g lw, respectively. The mean ∑5PBDE levels (4.32±2.99ng/g lw) were in the range typical of Western Europe levels, but lower than the mean ∑5dechlorane levels (6.24±4.16ng/g lw). These results indicate that the attention to dechloranes should be continued if research indicates toxicological concerns.
ISSN: 0160-4120

hal-01004642
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01004642
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01004642/document
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01004642/file/Levelssur dechloranes_and_polybrominated_diphenyl_ethers_accepted.pdf
DOI : 10.1016/j.envint.2013.12.014

Éditeur(s) : Pergamon-elsevier Science Ltd
Résumé : Environmental variables affect many processes of fish biology and their fluctuations are thought to be one of the main factors in variability of fish stocks. Recent work has shown that the variability of the environment in the frequency domain (i.e., the environmental noise) can interact with endogenous processes (e.g., density dependence) and affect fluctuations of animal populations. In this study, we investigate whether fluctuations of large pelagics' time series are affected by environmental noise and whether life-history traits of species modulate this response. By analysing several environmental variables and a large dataset of tuna and billfish catch per unit effort (CPUE) time series from the Atlantic, we show that in environments dominated by long-term fluctuations (i.e., red noise) CPUE time series were less variable and displayed smoother fluctuations. Furthermore, larger, slower-growing and later-maturing species were found to be more sensitive to changes of environmental noise than species with a shorter turnover rate. Our results suggest that environmental noise interacts with fish biology; understanding how it is integrated into biological processes might provide important insights to understand the responses of fish stocks dynamics to exploitation and environmental changes. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.
Progress In Oceanography (0079-6611) (Pergamon-elsevier Science Ltd), 2010-07 , Vol. 86 , N. 1-2 , P. 267-275

Droits : 2010 Elsevier B.V. All rights reserved.
http://archimer.ifremer.fr/doc/00011/12230/9083.pdf
DOI:10.1016/j.pocean.2010.04.025
http://archimer.ifremer.fr/doc/00011/12230/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : The Franceville Basin (2.1 Ga) in southeastern Gabon, hosts a black shale series well preserved (FB Formation) which represents an exceptional example of unmetamorphised Paleoproterozoic sediment strata. This basin includes the protore of one of the largest Mn-oxide laterite ore worldwide, mined by Eramet-Comilog. The aim of this this work is to determine formation conditions of this protore and to characterize the global sedimentary evolution of the FB Formation which include the protore. This 75 m thick protore is constituted of Mn carbonate-rich black shales which represent a potential ore deposit for the future. It was drilled, on the Bangombé plateau, during a recent campaign of 24 boreholes with an average depth of 125 m.Through multidisciplinary study on these cores and key outcrops of the basin, this work focuses on : i) the depositional environment of the Mn-protore and FB Formation ; ii) the processes of formation of the Mn-carbonates at 2.1 Ga and iii) the architecture and distribution of Mn-rich levels of the protore on the Bangombé Plateau.A detailed sedimentological and petrological study allowed us to redefine the division of the FB into nine units, named U1 to U9 from the base to the top. These units show a fine upward cycle up to U5 and a reverse coarse loop until U9. This division leads to a new interpretation to propose an evolution from a shoreface depositional environment controlled by deltaic currents (U1) to an offshore depositional environment with anoxic conditions (U2). In this basin, a system of submarine fan is developed, feeding a network of sand injections (injectites) covering the Bangombé plateau (70 km²) and with a thickness of 150 m affecting U4 to U7, including the Mn-protore. The protore depositional environment formed below the wave base limit (U4, U5 and U6) in a starved basin, controlled by biochemical sedimentation allowed the formation of Mn-carbonates. The end of starved basin, would allow the re-opening of the detrital input into the offshore basin (U7). This basin is then filled by storm bar deposits intersected by deltaic sub-aquatic channels (U8). The U9 unit corresponds to a quiet lagoon environment, allowing the multicellular organism development for the first time on the planet.A geochemical study allowed the characterization of the depositional environment of Mn-carbonates as an anoxic to sub-oxic and alkaline environment. For the first time, we showed that the manganese carbonates, present as bacteriomorph forms, are precipitated from the seawater by the mediated photosynthetic cyanobacterial activity, which allows CO2 / HCO3 depression of the environment and a local increase of pH. The cyanobacterial activity is controlled by the absence of bottom currents, which increase the detrital input. This would stop the activity of the cyanobacteria and thus would lead to the decrease of the Mn-concentration along the protore.Finally, well-log and a sequential correlation analyses allowed us to detail spatial and timing repartition of FB Formation deposit, controlled by a tectono-sedimentary model. We propose two- tectono-sedimentary phases. A first syn-tectonic phase (U1 to U3) controls the depocentres and sedimentation gaps. Turbidite coarse deposits are located in the most subsident part, clay deposits rather on the slope and carbonates on shoals. A second post-tectonic phase (U4 to U7) allows isopach deposits. The Mn-protore formed during the post-tectonic phase. However, it shows a variable thickness due to subsidence to the north of the Bangombé plateau. So, on the Bangombé plateau, Mn-contents increase towards the south, whereas the protore thickness increases towards the NNE. Moreover sand injectites decrease Mn-content in the eastern part of the Bangombé plateau and impact on the economic evaluation of the Mn-carbonates. Currently, the protore is structured by post-sedimentary faults, which lead to a non-continuity of the high Mn levels on the Bangombé plateau.
Le Bassin de Franceville situé au SE du Gabon présente une série de black shales (Formation FB) d'âge Paléoprotérozoïque (2,1 Ga) surmontant les grès de la Formation FA. Ce bassin peu déformé et non métamorphique représente une archive exceptionnelle des processus de dépôt de cette période de l’histoire de la Terre où la vie commence à se développer. En particulier, la Formation FB contient le protore d'un gisement mondial d'oxydes de manganèse exploité par la société Eramet-Comilog. L’objectif de ce travail est de préciser les conditions de formation de ce protore et de le replacer dans l’histoire du remplissage du bassin. Ce protore d'une épaisseur moyenne de 75 m est constitué de carbonates de manganèse ; il a fait l'objet d'une récente campagne de 24 forages carottés d'une profondeur moyenne de 125 m sur le plateau de Bangombé.A travers une approche pluridisciplinaire comprenant l'étude de ces forages et des affleurements clefs du bassin, ce travail porte sur la caractérisation i) de l'environnement de dépôt du protore et des séries qui l'encadrent (du toit du FA au toit du FB) ; ii) du mode de formation des carbonates de Mn à 2,1 Ga et iii) de l'architecture et de la répartition des hautes teneurs en Mn du protore qui représente un gisement potentiel du futur.L’étude pétro-sédimentaire détaillée a permis de distinguer neuf unités (U1 à U9) au sein de la Formation FB organisées suivant un cycle rétrogradant jusqu’à U5 puis progradant jusqu’à U9. Ce découpage montre une évolution du milieu de dépôt depuis un domaine de shoreface contrôlé par des courants deltaïques (U1) évoluant vers des dépôts d’offshore restreint (U2). Ce bassin enregistre ensuite un système de chenaux-levées turbiditiques (U3) qui alimentent un réseau d'injectites reconnu sur l’ensemble du Pl. de Bangombé et qui traverse 150 m de série (U4 à U7) en affectant le protore et ainsi les teneurs en Mn. L'environnement de dépôt du protore (U5 et U6) marque l’isolement du bassin qui devient affamé et contrôlé par une sédimentation biochimique à l’origine du dépôt des carbonates de Mn. L'Unité 7 correspond à la réouverture des apports détritiques en domaine d'offshore supérieur puis en domaine de shoreface dominé par des dépôts de tempêtes et de chenaux sous-aquatiques deltaïques (U8), et enfin lagunaire (U9) dans lequel apparaissent les premiers métazoaires de l’histoire de la planète, suivant une séquence régressive.Une étude géochimique a permis de préciser les conditions de dépôt du protore qui se forme en milieu alcalin anoxique à sub-oxique. Dans ce milieu, nous montrons pour la première fois une précipitation directe des carbonates de Mn sous forme bactériomorphe induite par l'activité photosynthétique des cyanobactéries qui consomment le CO2/HCO3 et conduisent à une augmentation du pH favorable à la formation des carbonates de Mn. L'activité cyanobactérienne est conditionnée par l’absence de courants de fond qui augmentent la turbidité du milieu et stoppent cette dernière.Les corrélations diagraphiques et séquentielles permettent de préciser la répartition spatiale et temporelle du FB permettant ainsi de replacer le protore dans l’histoire tectono-sédimentaire du bassin. Une première phase syn-tectonique (U1 à U3) contrôle l’épaisseur et la mise en place de dépôts turbiditiques dans les parties subsidentes, de dépôts argileux sur les pentes et de dépôt de carbonates sur les hauts-fonds. La seconde phase post tectonique (U4 à U7) permet la mise en place de dépôts relativement isopaques, bien que le protore enregistre une subsidence plus importante au nord du Pl. de Bangombé. On observe ainsi, sur le Plateau de Bangombé, des teneurs en Mn qui augmentent vers le sud alors que l’épaisseur du protore augmente vers le NNE. Postérieurement au dépôt du FB, le protore est structuré par des failles qui le compartimentent en touches de piano limitant ainsi sa continuité sur le Plateau de Bangombé.
https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01621460

tel-01621460
https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01621460
https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01621460/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01621460/file/these_Dubois2017-MnGabon.pdf

Résumé : 1 - Study's goals review The management of Norway Lobster and Hake fisheries can be considered as the most important issue in the Gascogne gulf. Calculation methods used to evaluate prediction variations under various efforts and mesh constraints all pinpoint to the crucial role narrow mesh fishing plays in Hakes' Northern stock status. The involvement of Gascogne gulf Norway Lobster fisheries regarding Hakes over exploitation seems over dimensioned when comparing the size of both of these stocks. Hake stocks spread from Northern Great Britain to Northern Spain, while Norway Lobster stocks are located in the Gascogne gulf's mud flats. The biological solution is well known and consists in globally increasing mesh nets to 80mm which would bring up Hakes yield to its most. It would be unreal to pretend all parties involved in Hake stocks will come to use them. For now, it is mostly an economical issue since many vessels continue on with an exploitation scheme dating from the 60's and fish on coastal mud flats which are the most exploited zones and where their catch is detrimental to juvenile class Hakes and Norway Lobsters. Considering our limited time, this study will cover bio- economical modelisation preparation. You will therefore find a description of fisheries and an exploitation assessment based on 1986's available data. 2 - Accomplished work 2. 1 Fishery description Presenting the problems and preparing ulterior analyses was first and foremost. Norway Lobster vessels supposedly, according to evaluation models used, test immature Hakes in such a manner that all stock exploitation is jeopardized. Norway Lobster distribution is closely linked to the nature of the ocean floor since it can only build its habitat on fine sediment. Hakes' habitat is not as restrictive and is linked to food supply, especially euphausiid shrimps, so they can be found on sandy and sandy-sedimental floors. Norway Lobsters are sought by a fleet of 400 to 450 ships which characteristics widely vary according to their home port. On the northern part, fisheries are close to exploitation ports where Norway Lobsters and miscellaneous catch yield is sufficient to support an older fleet. On the southern part, the structure is diversified and flexibility usually rules, more modern vessels can easily switch their target on a seasonal or daily basis. Globally, Hakes' northern stocks are slightly on the rise. This rise is probably due to global mesh size increase, even if slight and a decrease on fishing effort where immature species are caught. Norway Lobster stocks unloading is stable or slightly lower and yields, as far as northern fishery are concerned, vary and oscillate between ±15 to ±20 % at about an average of 100 kg/day. Biological parameters used in the evaluations for each species are those used in CIEM and CEE work cells. Among those parameters, those describing growth are the greatest. For Hakes, an intermediary growth equation between males and females has been used. For Norway Lobsters, both sexes are treated separately. Simulations were carried out according to 3 types of data: Norway Lobster vessels fishing effort variations. Norway Lobster vessels mesh increase. Norway Lobster vessels fishing effort decrease or mesh increasing go along in the same direction for Hake and Norway Lobster stock production (chart A and B). Lastly, a brief study on results evaluation significance was done to modify: - the size of Hake rejects by Norway Lobster vessels. The range of sizes stays the same but the amount in each class varies according to the same percentage. - Norway Lobsters growth parameters, both values used (L» = 76 mm and k = 0.11 for males, L°° = 56 mm and k = 0.14 for females) representing the "high" hypothesis. In the first case, a 20% error rate for rejects evaluation with 60 mm mesh would only bring a 3% modification rate on global stock production. Those first results are contradicting usual evaluation conclusions and it will be necessary to recalculate by modifying the size class step. In the second case, to decrease L» and increase growth speed, in time production variations remain within usual inter annual fluctuations. In all figure cases, calculations confirming greater yield for in time production through hypothetical mesh size increase to 60 mm, are definitely well founded.
1 - Rappel des buts de l'étude La gestion des pêcheries de merlu et de langoustine peut être considérée comme le problème le plus important du Golfe de Gascogne. Les méthodes de calcul employées pour évaluer les variations de la production sous diverses contraintes d'effort et de maillage mettent toutes l'accent sur le rôle capital des pêcheries à petits maillages sur l'état du stock nord de merlu. Le niveau de responsabilité des pêcheries de langoustine du Golfe de Gascogne dans la surexploitation du merlu semble démesuré eu égard aux dimensions respectives des deux stocks. Le stock de merlu s'étend du Nord des Iles Britanniques au Nord de l'Espagne alors que le stock de langoustine est localisé aux vasièrés du Golfe de Gascogne. La solution biologique du problème est connue et tient à une augmentation généralisée des maillages à 80 mm qui amènerait le rendement du stock de merlu à son maximum. Il serait illusoire de prétendre que tous les acteurs opérant sur le stock de merlu arriveront jamais à l'utiliser. Pour le moment, le problème se pose essentiellement en termes économiques car beaucoup de navires poursuivent un schéma d'exploitation hérité des années 1960 et pèchent sur des vasièrés côtières qui sont les zones les plus exploitées et où ils effectuent leurs captures au détriment des jeunes classes d'âge de merlu et de langoustine. En raison des délais impartis, cette étude constitue la préparation à une modélisation bioéconomique. On y trouvera donc une description des pêcheries et un bilan de l'exploitation sur les données disponibles en 1986. 2 - Travaux effectués 2 . 1 Description de la pêcherie Il s'agissait avant tout de poser les problèmes et de préparer les analyses ultérieures. Les langoustiniers sont présumés, d'après les modèles d'évaluation employés, effectuer sur les immatures de merlu des prélèvements tels qu'ils mettent en danger toute l'exploitation du stock. La distribution de la langoustine est très liée à la nature du fond car elle ne peut construire son terrier que sur des fonds de vase fine. Celle du merlu est beaucoup plus large et inféodée à la recherche de nourriture, crevettes euphausiacées en particulier, on le trouve donc sur les fonds sableux à sablo-vaseux. La langoustine est recherchée par une flottille de 400 à 450 bateaux dont les caractéristiques sont très variables suivant leur appartenance géographique. Au nord, la pêcherie est proche des ports exploitants et les rendements en langoustine et en prise accessoire sont suffisants pour faire vivre une flottille ancienne. Vers le sud, la structure est très diversifiée et la flexibilité est généralement la règle et les navires de construction récente peuvent changer de cible aisément de façon saisonnière ou au cours de la même journée de pêche. Globalement, les débarquements de merlu du stock nord sont en légère hausse. Ce redressement est dû probablement aux augmentations de maillage, même légères, généralisées et à une baisse de l'effort sur les pêcheries où s'effectuent des captures d'immatures. Les débarquements de langoustine sont stables ou en légère baisse et les rendements, au moins sur la pêcherie du nord, varient avec des oscillations de ±15 à ±20 % autour d'une moyenne de 100 kg/jour. Les paramètres biologiques utilisés pour chaque espèce dans les évaluations sont ceux en usage dans les groupes de travail du CIEM et de la CEE. Parmi ces paramètres, ceux décrivant la croissance sont les plus importants. Pour le merlu une équation de croissance intermédiaire entre mâles et femelles a été utilisée. Pour la langoustine les deux sexes sont traitées séparément. Les simulations ont porté sur trois types de données : Variations de l'effort des langoustiniers Augmentation du maillage des langoustiniers La diminution de l'effort des langoustiniers ou L'augmentation de maillage agisse très exactement dans le même sens sur la production des stocks de merlu et de langoustine. Enfin une étude succincte de la sensibilité des résultats des évaluations a été effectuée pour des modifications : - de la composition en taille des rejets de merlu par les langoustiniers. L'étendue des tailles reste la même mais le nombre dans chaque classe varie selon le même pourcentage. des paramètres de croissance de la langoustine, le couple de valeurs utilisées (L» = 76 mm et k = 0.11 pour les mâles, L°° = 56 mm et k = 0.14 pour les femelles) constituant l'hypothèse "haute" Dans le premier cas, une erreur de 20 % sur l'évaluation des rejets pour un cnaillage de 60 mm n'apporterait qu'une modification de 3 % dans la production globale du stock. Ces premiers résultats sont en contradiction avec les conclusions habituelles des évaluations et il sera nécessaire de reprendre les calculs en modifiant le pas des classes de taille. Dans le deuxième cas, pour une diminution de L» et une augmentation de la vitesse de croissance, les variations de la production à terme restent à l'intérieur des fluctuations interannuelles habituelles. Dans tous les cas de figure, les calculs confirmant l'augmentation de la production à terme dans l'hypothèse d'une augmentation de maillage à 60 mm sont d'une robustesse à toute épreuve.

Droits : 1987 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/1987/rapport-1763.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1763/

Éditeur(s) : HAL CCSD American Geophysical Union
Résumé : International audience
This paper presents a multicontinuum approach to model fractal temporal scaling of catchment response in hydrological systems. The temporal scaling of discharge is quantified in frequency domain by the transfer function HðxÞ, which is defined as the ratio between the spectra of catchment response and recharge time series. The transfer function may scale with frequency x as HðxÞ x2b. While the classical linear and Dupuit models predict exponents of b52 and b51, observations indicate scalings with noninteger exponents b. Such behaviors have been described by multifractal models, which, however, often lack a relation to the medium characteristics. We revisit and extend the classical linear Dupuit aquifer models and discuss their physical meanings in the light of the resulting aquifer dynamics. On the basis of these classical models, we derive a multicontinuum approach that provides physical recharge models which are able to explain fractal behaviors with exponents 1=2 < b < 2. Furthermore, this approach allows to link the fractal dynamics of the discharge process to the physical aquifer characteristics as reflected in the distribution of storage time scales. We systematically analyze the catchment responses in the proposed multicontinuum models, and identify and quantify the time scales which characterize the dynamics of the catchment response to recharge.
ISSN: 0043-1397

insu-00952537
https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-00952537
https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-00952537/document
https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-00952537/file/russian.pdf
DOI : 10.1002/2013WR014255

Éditeur(s) : HAL CCSD American Geophysical Union (AGU)
Résumé : International audience
The Ama Drime range located at the transition between the high Himalayan range and south Tibet is a N-S active horst that offsets the South Tibetan Detachment System (STDS). Within the horst, a paragneissic unit, possibly attributed to the upper Himalayan crystalline series, overly the lower Himalayan crystalline series Ama Drime orthogneissic unit containing large metabasite layers and pods that have experienced pressure >= 1.4 GPa. Combining structural analysis with new and published pressure-temperature (P-T) estimates as well as U-Th/Pb, Ar-39/Ar-40 and (U-Th)/He ages, the P-T-deformation-time (P-T-D-t) paths of the main units within and on both sides of the horst are reconstructed. They imply that N-S normal faults initiated prior to 11 Ma and have accounted for a total exhumation <= 0.6 GPa (22 km) that probably occurred in two phases: the first one until similar to 9 Ma and the second one since 6 to 4 Ma at a rate of similar to 1 mm/yr. In the Ama Drime unit, 1 to 1.3 GPa (37 to 48 km) of exhumation occurred after partial melting since similar to 30 Ma until similar to 13 Ma, above the Main Central Trust (MCT) and below the STDS when these two fault systems were active together. The switch from E-W (STDS) to N-S (Ama Drime horst) normal faulting between 13 and 12 Ma occurs at the time of propagation of thrusting from the MCT to the Main Boundary Thrust. These data are in favor of a wedge extrusion or thrust system rather than a crustal flow model for the building of the Himalaya. We propose that the kinematics of south Tibet Cenozoic extension phases is fundamentally driven by the direction and rate of India underthrusting.
ISSN: 0278-7407

hal-00486405
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00486405
DOI : 10.1029/2009TC002551

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : 20 pp
We first analyze some atmospheric parameters measured in 2004 at the top of La Soufrière volcano: wind speed, pressure and temperature. Next, we study the stochastic process of the wind speed modulus which is of interest for prediction of pollution induced by the plume. We fit to the data various models : FARIMA, periodic trend plus multifractional Brownian noise, multifractal continuous cascades. The estimations show that they evoluate during some transition phases in response to environment changes. Thus, we finally suggest, for future works, some settings that should be more appropriate: time series with regime changes and stochastic processes in random environment.
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00165572

hal-00165572
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00165572
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00165572/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00165572/file/Windsouf_v11.pdf