Résumé : Arsenic levels of in the marine environment are high in comparison with other contaminants. Over the past twenty years, a large number of arsenic organic compounds have been identified in the water, sediments and living species. This document constitutes a synthesis of current knowledge on arsenic sources, and contamination levels, on its biogeochemical cycle as well as its toxic effects on human and marine fauna. This paper highlights in particular the effects of phosynthesis on arsenic speciation and its distribution throughout the marine environment. Problems of toxicity in the case of certain phyto- and zooplankton species are identified. Bioaccumulation in seaweeds, molluscs and fishes is documented as well, with special attention to the species encountered in the French coastal waters.
Les niveaux de présence de l'arsenic en milieu marin sont élevés comparativement à d'autres contaminants. Depuis une vingtaine d'années, de nombreux composés organiques de l'arsenic ont été identifiés dans l'eau, les sédiments et les espèces vivantes. Le présent document constitue une synthèse des connaissances sur les sources et les niveaux de contamination, le cycle biogéochimique, les effets toxiques pour l'homme et les espèces marines. L'accent est mis notamment sur les effets de la photosynthèse sur la spéciation de cet élément et sur sa distribution dans le milieu. Les problèmes de toxicité pour certaines espèces phyto- et zooplanctonniques sont identifiés. La bioaccumulation chez les algues, les mollusques et les poissons est bien documentée, avec une attention particulière pour les espèces présentes dans les eaux côtières françaises.

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http://archimer.ifremer.fr/doc/1993/rapport-1448.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1448/

Résumé : The report presents a survey of marine related activities in France, highlighting recent past trends, present situation and future outlook. The commercial sector includes marine resource exploitation, manufacturing branches and services. The public sector includes the Navy, State services, environmental protection and research. A summary identifies the main factors in the development of marine activities.
Le rapport présente un panorama des activités liées à la mer en France en mettant en évidence la conjoncture récente, la situation actuelle et les perspectives. Le secteur industriel comprend l'exploitation des ressources marines, le manufacturier, les services. Le secteur public comprend la Marine nationale, l'intervention publique, la protection de l'environnement, la recherche. Une synthèse dégage les principaux facteurs d'évolution des activités maritimes.

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http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/rapport-3919.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/sup-3919.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3919/

Résumé : Depuis 2008, la filière ostréicole française fait face à des mortalités très importantes touchant les naissains d’huîtres creuses, Crassostrea gigas. Répondant aux missions qui lui sont assignées, l’Ifremer a rapidement lancé, en synergie avec ses partenaires et l’interprofession, des travaux visant à décrire précisément le phénomène, à progresser dans la compréhension de ses causes, et à étudier quelles pouvaient être les contributions à apporter pour une aide à la gestion du phénomène et à la mise en oeuvre de pistes de sorties de crise. Le 18 janvier 2012, l’Ifremer a organisé, avec le soutien du Ministère de l’Agriculture, de l’Alimentation, de la Pêche, de la Ruralité et de l’Aménagement du Territoire, une journée d’information et d’échanges dédiée à cette problématique pour : présenter une synthèse les connaissances acquises à l’Ifremer depuis 4 ans ; présenter les dernières avancées et les perspectives, les projets en cours et à venir ; donner une large place à l’échange entre les différents participants. Cette journée a réuni les ministères, les représentants de la profession conchylicole, les centres techniques régionaux conchylicoles, les laboratoires agréés et reconnus, des organismes de recherche et des universités partenaires. Ce document retrace les interventions et les échanges qui se sont déroulés pendant cette journée d’information.

Droits : Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00084/19574/17196.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00084/19574/

Résumé : Le Réseau Hydrologique Littoral Normand (RHLN) pérenne a été approuvé en 2007 par ses partenaires, avec le triple objectif (1) de maintenir le suivi de la qualité des masses d’eau et évaluer leur niveau d’eutrophisation en réponse aux réglementations (Directive Nitrate, OSPAR, DCE), (2) de poursuivre la réflexion sur la définition des indicateurs DCE, puis (3) de développer les connaissances et de fournir des données à la modélisation. Ce rapport réalise la synthèse des résultats obtenus en 2008 première année de la mise en oeuvre du RHLN pérenne. L’analyse des cycles hydrobiologiques observés au sein des différentes masses d’eau normandes en 2008 a permis de mettre en évidence le caractère analogue de cette année 2008 du point de vue météorologique par rapport à l’année 2007. Malgré cela, les précipitations n’ont pas entrainé d’apports de nutriments aussi importants qu’en 2007 le long des côtes normandes dont les stocks sont restés modérés. Cependant, les périodes de carence en azote, phosphore ou silice dans le milieu ont été de nouveau très limitées, ce qui aurait pu favoriser la croissance du phytoplancton tout au long de la période productive. Or, comme en 2007, les niveaux de biomasses chlorophylliennes sont restés relativement faibles. L’évaluation du niveau d’eutrophisation (ou plus précisément de dystrophie) des masses d’eaux normandes au moyen des indicateurs retenus dans le cadre de la DCE, a permis de conclure que sur les 19 masses d’eau suivies dans le cadre du RHLN 2008 : 14 peuvent être classées en « très bon état » (dont deux par extrapolation) ; 2 en « bon état » ; et 5 en « état moyen », au vue des indicateurs actuellement validés pour l’élément de qualité « Phytoplancton », combiné à celui des « Conditions physico-chimiques » pour l’évaluation de l’état écologique des masses d’eau.

Droits : Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00006/11730/8404.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00006/11730/

Résumé : Shouldn't Earth, the human planet, be called the algae planet? First appearing 3.5 billion years ago, algae have always been objective allies of life and humans. Brought about by algae, oxygen and the ozone layer allowed plant and animal life to develop in oceans and on continents. They offer spawning grounds and feeding grounds for marine fauna....
La Terre, dite planète des hommes, n'est-elle pas en réalité celle des algues? Présentes il y a 3,5 milliards d'années, elles ont toujours été les alliées objectives de la vie et des hommes. Nous leur devons l'oxygène et la couche d'ozone qui ont permis la vie végétale et animale en mer et sur les continents. Elles servent de frayères et de nourriceries à la faune marine. Les algues ont toujours été offertes à l'homme pour sa nourriture et les besoins les plus divers. Algues brunes, vertes, rouges fournissent les substances, alginates, carraghénanes, agars, que l'industrie adapte à des usages innombrables entrant de plus en plus dans la vie moderne, qu'il s'agisse de matériaux courants (textiles, papiers, films, peintures), de toutes sortes d'aliments pour l'homme ou les animaux d'élevage, de médicaments, de produits de beauté,... La transformation des algues est parmi les secteurs les plus performants et les plus innovants de l'industrie moderne. L'avenir est prometteur pour les antibiotiques, antivirus et anticoagulants qu'elles contiennent. / Mais, les peuplements naturels ne suffisent plus à satisfaire cette demande. Il a fallu recourir à la culture des algues. Plus de 530 000 hectares y sont consacrés, 900 000 algoculteurs y travaillent dans 200 000 entreprises familiales, 250 usines conditionnent les produits. L'algoculture est la branche la plus forte de l'aquaculture. Cet ouvrage fait l'inventaire des méthodes utilisées dans le monde, surtout en Extrême-Orient, au moment où l'on passe de la culture toute simple à celle gérée par ordinateur, en un temps où il apparaît de plus en plus que l'algoculture pourrait être une des sources de cette énergie propre dont l'humanité aura immanquablement besoin. Cette synthèse s'adresse non seulement aux scientifiques qui y trouveront un point des connaissances màis à tous ceux, algoculteurs, industriels, aménageurs, écologistes, qui tireront le meilleur parti de cette somme d'expériences. Qui s'intéresse aux algues y trouve un livre de base. [OCR NON CONTRÔLE]

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http://archimer.ifremer.fr/doc/1992/rapport-4402.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4402/

Résumé : The general study, scheduled from 1984 to 1986, aims at providing a judgement about the fisheries in the Celtic Sea. This area has been chosen because it is frequented by EEC vessels with, for the time being, a large majority of French vessels. Activities there are easier to monitor than anywhere else as coastal fisheries are little developed in the area. The final product will consist of a certain number of hypotheses about the planning strategies that could be implemented in the Celtic Sea. The main idea is, firstly, to conduct analytical studies, stock by stock, in order then, to synthesize them into a model integrating the interactions between fleets in relation to their target species. A bio-economical model, deriving from the latter, will enable the simulation of the consequences of the current planning procedures on the management of stocks and vessels.
L'étude générale, programmée de 1984 à 1986, vise à fournir un avis sur les pêcheries de Mer Celtique. Cette zone a été choisie car elle est fréquentée par les flottilles de la CEE avec cependant, pour le moment, une dominante française quasi exclusive. Les activités qui s'y exercent peuvent être cernées plus facilement que partout ailleurs car les pêcheries côtières sont très peu développées. Le produit final consistera dans la présentation d'un certain nombre d'hypothèses sur les stratégies d'aménagement adaptables à la Mer Celtique. La voie choisie consiste, dans un premier temps, dans des études analytiques, stock par stock, puis dans leur synthèse dans un modèle intégrant les interactions entre flottilles en relation en particulier avec la recherche des espèces-cibles. Un modèle bio-économique, dérivé du précédent, permettra de simuler les conséquences des procédures habituelles d'aménagement sur la gestion des stocks et des flottilles.

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http://archimer.ifremer.fr/doc/1985/rapport-3671.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3671/

Éditeur(s) : Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes
Résumé : Long-line fishing has been growing on the island of La Réunion since the beginning of the 1990s. The target species is the swordfish (Xiphias gladius), fished mainly in the tropical waters surrounding the island between longitudes 45 degree E and 60 degree E, and latitudes 17 degree S and 27 degree S. From 1998 to 2000, a finalised research programme enabled the collection of precise data concerning the lines' positions and the parameters of the fishing efforts: 3,602 nettings were thus informed by the catches (in numbers of individuals caught) and 12 descriptive variables of the effort. In parallel with this collection effort, satellite maps that described the ocean's landscape of this region of the Indian Ocean exploited by La Réunion's fisheries were made available to sailors and scientists. Extractions from these environmental variables were made at the fishing lines' positions, which allowed us to propose 20 variables describing the environmental conditions of swordfish catches applied to the nettings. In an early part of this study, after a descriptive analysis and a first selection of the variables, we used several GAM (Generalised Additive Models) to model the respective effects of effort and environmental variables on the variability of swordfish catches. We thus highlighted the predominance of factors linked to fishermen (fishing effort) on oceanographic factors in the explanation of this variability. Following these results, a summary on the biology and ecology of the swordfish was proposed in order to draw up hypotheses on the characteristics of this species' population in the Indian Ocean. The aspects linked to the individual behaviour and movements of the population were particularly highlighted. In a latter part of this study and in order to complete the empirical approach by an exploratory constructivist approach, we proposed a modelling tool in order to simulate the possible movements of individuals within the oceanic landscape described by the available satellite maps. After reading in the literature about the various forms of modelling the movements of the large pelagics, we developed an original computer modelling architecture of the multi-agent type that made it possible to manipulate in a dynamic way the satellite maps (and derived products), the individual movements of "animats" whose behaviours were based on this environmental information, and agents that clarify the process of long-line fishing in a geographical way. The computer model that was implemented (MUFINS, for MUlti-Fish INdian ocean Simulator) was next used by calibrating the behaviour of the animats on the real data originally from the analysis of commercial catches proposed in the first part, using robust techniques based on fuzzy logic. The results of the simulations were compared, on the one hand, with the large-scale hypotheses of movement proposed in the first part, and, on the other hand, to swordfish catches both real and corrected for the effect of the fishing effort modelled by the GAM models. Even if the results of these simulations in this study do not allow for proposing convincing interpretations of the underlying processes, the MUFINS tool showed its ability to address questions associated with the swordfish's behaviour in the tropical oceanic landscape and to the effects of scale transfers between the individual level and the collective level. We now envisage its use in a more operational framework, as an interface for dialogue between fishermen and scientists with a goal of sustainable management of the resource.
La peche palangriere s'est developpee a l'ile de La Reunion depuis le debut des annees 1990. L'espece cible est l'espadon (Xiphias gladius), principalement exploite dans les eaux tropicales autour de l'ile entre les longitudes 45 degree E et 60 degree E, et les latitudes 17 degree S et 27 degree S. De 1998 a 2000, un programme de recherche finalisee a permis de collecter des informations precises concernant les positions des lignes et les parametres de l'effort de peche : 3602 filages sont ainsi renseignes par les captures (en nombre d'individus captures) et 12 variables descriptives de l'effort. En parallele de cet effort de collecte, des cartes satellitales ont pu etre mises a la disposition des marins et des scientifiques, decrivant le paysage oceanique de cette region de l'ocean Indien exploitee par la pecherie reunionnaise. Des extractions de ces variables environnementales ont ete effectuees aux positions des lignes de peche, nous permettant de proposer 20 variables descriptives des conditions environnementales de captures d'espadon appliquees aux filages. Dans une premiere partie de ce travail, apres une analyse descriptive et une premiere selection des variables, on a modelise par plusieurs modeles GAM (Generalized Additive Models) les effets respectifs des variables d'effort et des variables environnementales sur la variabilite des captures d'espadon. On a ainsi mis en evidence la predominance des facteurs lies aux pecheurs (effort de peche) sur les facteurs oceanographiques dans le caractere explicatif de cette variabilite. A la suite de ces resultats, une synthese sur la biologie et l'ecologie de l'espadon a ete proposee afin de degager des hypotheses sur les caracteristiques de la population de cette espece dans l'ocean Indien. Les aspects lies au comportement individuel et aux deplacements de la population ont ete particulierement mis en evidence. Dans une deuxieme partie de ce travail et afin de completer l'approche empirique par une approche constructiviste exploratoire, nous avons propose un outil de modelisation afin de simuler les deplacements possibles d'individus au sein du paysage oceanique decrit par les cartes satellitales disponibles. Apres avoir passe en revue dans la litterature les differentes formes de modelisation des deplacements des grands, pelagiques, nous avons developpe une architecture originale de modelisation informatique de type multi-agents permettant de manipuler de maniere dynamique les cartes satellitales (et les produits derives), les mouvements individuels < d'animats >, dont les comportements sont bases sur cette information environnementale, et des agents qui explicitent le processus de capture palangriere de maniere geographique. Le modele informatique ainsi implemente (MUFINS, pour MUlti-Fish INdian ocean Simulator) a ensuite ete utilise en calibrant les comportements des animats sur les donnees reelles issues de l'analyse des captures commerciales proposee en premiere partie, a partir de techniques robustes basee sur la logique floue. Les resultats des simulations ont ete confrontes d'une part aux hypotheses de deplacement a grande echelle proposees en premiere partie, et d'autre part aux captures d'espadon reelles et corrigees de l'effet de l'effort de peche modelise par les modeles GAM. Meme si les resultats de simulations presentes dans ce travail ne permettent pas de proposer d'interpretations convaincantes des processus sous-jacents, l'outil MUFINS a demontre son aptitude a aborder les questions liees au comportement de l'espadon dans le paysage oceanique tropical et aux effets des transferts d'echelle entre le niveau individuel et le niveau collectif. On envisage desormais son utilisation dans un cadre plus operationnel, comme interface de dialogue entre les pecheurs et les scientifiques a des fins de gestion durable de la ressource.

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http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/these-2592.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2592/

Résumé : This synthesis, outcome from the reconstitution of chronological series of catches, replaces this economical activity in its human and climatic context, including society facts, wars and ships evolution
Cette synthèse, le résultat d'une reconstitution de séries chronologiques de pêches, remet cette activité économique dans son contexte humain et climatique, y compris l'évolution des faits de société, des guerres et des bateaux.

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http://archimer.ifremer.fr/doc/1995/rapport-1446.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1446/

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier Masson
Résumé : International audience
Depuis quelques années, l'expression " perturbateur endocrinien " fait partie du langage commun scientifique et populaire. Cette expression fait référence aux substances chimiques, d'origine anthropique ou naturelle, susceptibles de générer des effets nocifs sur la santé humaine et animale par le biais de leurs propriétés hormonales. Mais la définition même des perturbateurs endocriniens fait encore l'objet de discussions. De très nombreux processus physiologiques font intervenir des systèmes de communication hormonale. Les substances chimiques pouvant interférer avec ces systèmes sont très diverses. Les systèmes endocriniens sont multiples. De ce fait, les conséquences sanitaires potentielles peuvent être très variées. À ce jour et à quelques rares exceptions, les conséquences délétères des expositions aux perturbateurs endocriniens sur la santé humaine n'ont pas été prouvées. La science qui s'est développée autour des perturbateurs endocriniens présente des contours particulièrement larges et flous. Cette science en pleine évolution est donc soumise à de nombreuses incertitudes, Cependant, sur le plan strictement scientifique, c'est une opportunité d'accroître les connaissances du fonctionnement des systèmes endocriniens et de leurs pathologies. Sur un plan sociétal, c'est l'occasion de s'interroger sur les activités de l'homme et sur ses conséquences néfastes sur sa santé, son devenir et son environnement.
ISSN: 1775-8785

hal-00671943
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00671943

Résumé : La banane plantain (Musa paradisiaca) est l’aliment de base de millions de personnes dans le monde et sa culture génère des revenus permanents pour un grand nombre d’agriculteurs, dans des plantations de taille petite ou moyenne. Comme dans d’autres régions tropicales, la culture du plantain en Guadeloupe et en Haïti est soumise à de fortes contraintes parasitaires aussi bien telluriques (i.e. du sol : nématodes phytoparasites et charançon du bananier) qu’aériennes (Cercosporiose noire notamment). Les moyens de lutte conventionnels reposent sur l’usage de produits de synthèse dont les effets néfastes sur l’environnement (sols, eaux, animaux) comme sur la santé humaine ne sont plus supportables. Il est donc urgent de réfléchir à des solutions agro-écologiques permettant de rétablir les équilibres biologiques, de maintenir une bonne qualité des sols et une production optimale dans les systèmes de culture plantains. C’est le but de ce travail de thèse qui couple la réalisation d’un diagnostic agro-écologique dans des parcelles paysannes, et le test d’alternatives agro-écologiques en milieu semi-contrôlé. Pour ce faire, une typologie des systèmes de culture plantains a été réalisée à l’issue d’une enquête agro-environnementale dans les deux zones d’étude. Elle a permis de sélectionner 23 parcelles en Guadeloupe et 12 en Haïti dans lesquelles un diagnostic agro-écologique a été conduit. Sur la base de ce diagnostic et de la recherche d’alternatives agro-écologiques à l’usage des produits chimiques, une expérimentation au champ a été mise en place en Guadeloupe en station de recherche, permettant le test de trois pratiques culturales innovantes pour le plantain (seules et combinées), à savoir : i) l’introduction d’une plante de service Paspalum notatum pour la gestion des adventices et la réduction de l’utilisation d’herbicides ; ii) l’apport de vermicompost pour le contrôle des nématodes phytoparasites inféodés au bananier plantain et la fertilisation de celui-ci ; iii) l’utilisation de plants sains PIF (Plants Issus de Fragments de tiges) indemnes de nématodes et de larves de charançon du bananier. La typologie des systèmes de culture plantains révèle que : i) en Guadeloupe les précédents : jachère, ananas et banane plantain sont prédominants avec un niveau d’intensification faible (apports d’intrants chimiques faibles et peu fréquents) ou élevé (apports d’intrants chimiques élevés et plus fréquents) ; ii) en Haïti, les précédents : jachère, banane plantain et manioc prédominent avec un niveau d’intensification faible ou nul (apport d’intrants inexistant). Les résultats du diagnostic agro-écologique montrent que, i) lorsque le niveau d’intensification est faible, les bananeraies plantains pérennes et le précédent-ananas permettent de maintenir une bonne qualité du sol et une bonne régulation des parasites telluriques ; ii) lorsque le niveau d’intensification est fort, les populations d’ingénieurs du sol diminuent drastiquement, alors que le cortège parasitaire tellurique augmente sans que cela n’affecte l’obtention de bons niveaux de rendement instantannés (parcelles précédées d’ananas ou d’une jachère principalement) ; iii) en absence totale de fertilisation, il résulte une diminution de l’activité biologique du sol mais aussi du rendement du plantain, exacerbé par le choix des précédents-culturaux (manioc ou banane plantain) en lien avec les contraintes pédoclimatiques et la maladie des raies noires (Cercosporiose noire) causée par Mycosphaerella fijiensis, notamment au sein des parcelles Haïtiennes ; iv) la succession plantain/plantain est la plus pénalisante vis-à-vis de la culture du plantain, car quelque soit le niveau d’intensification, le rendement reste relativement faible, en lien avec une dégradation de l’état sanitaire, comparativement aux autres précédents.
Plantain (Musa paradisiaca) is the staple food of millions of people worldwide and its cropping generates ongoing revenues for many farmers who are planting small or medium size areas. As in other tropical regions, plantain cultivation in Guadeloupe and Haiti is under heavy parasitic constraints terrestrial (plant-parasitic nematodes and banana weevil) as well as aerial (black Sigatoka in particular). Conventional means of control based on the use of synthetic products which adverse effects on the environment (soil, water, animals ...) as on human health are not bearable any more. It is thus urgent to think about agroecological solutions allowing to restore the biological balances, to maintain good soil quality and optimal plantain cropping systems.This is the ultimate goal of this thesis which couples the realization of an agroecological diagnosis in peasants’ plots, and the test of agroecological alternatives in semi-controlled conditions. To do this, a typology of plantain cropping systems was carried out from an agrienvironmental survey in the two study areas. It allowed to select 23 plots in Guadeloupe and 12 in Haiti in which an agroecological diagnosis was implemented. Based on this diagnosis and the research of agroecological alternatives to the use of chemicals, a field experiment was set up in Guadeloupe, in an experimental station allowing the test of three innovative practices for plantain cultivation (alone and combined), namely : i) the introduction of a cover-crop Paspalum notatum for weed control while reducing the use of herbicides ; ii) the input of worms’ compost to control plant-parasitic nematodes specific to plantain and to fertilize it ; iii) the use of healthy “PIF” plants (plants issued from stem fragments) free from telluric pests (nematodes and weevil’s larvaes).The typology of plantains cropping systems shows: i) in Guadeloupe the previous crops are: fallow pineapple and plantain predominate with a low level of intensification (low and infrequent chemical inputs) or high (high and frequent chemical inputs); ii) in Haiti, the previous crops are: fallow, plantain and cassava predominate with a low level or no intensification at all (no inputs). The results of the agroecological analysis show that : i) when the level of intensification is low, perennial plantain and pineapple as previous crops help maintaining a good soil quality and a good regulation of the telluric pests ; ii) when the level of intensification is strong, the soil engineers drastically reduce, while the density of telluric parasites increases without affecting good levels of instantaneous yields (plots where the previous crop is pineapple or mostly fallow) ; iii) when the fertilization is totally missing, it decreases the biological activity of the soil furthermore the plantain yields, exacerbated by the choice of the previous crop (cassava or plantain), in connection with soils and climate constraints and the black Sigatoka caused by Mycosphaerella fijiensis, especially in the Haitian plots ; iv) the crop succession plantain/plantain is the most critical regarding the plantain’s cropping, because whatever the level of intensification, the yields remain relatively low in connection with a degradation of the health state, compared to other previous crops.The driving of an experiment in a research station shows that on the scale of one year, the three tested innovative practices allow maintaining a good soils quality. Healthy plants "PIF" have a better health state (absence of plant parasitic nematodes in the roots) which helps a significant increase of the yields. Cover-crop P. notatum helps the weeds and the soil pests control and favors the improvement of soil biological activity and plantain yields. Worms’ compost contributes to the maintenance of a better soils quality while allowing the regulation of the populations of plant-parasitic nematodes of the plantains.

http://www.theses.fr/2014AGUY0758/document

Résumé : Le présent rapport est constitué de six parties. Dans la 1ère partie, nous donnons quelques généralités introductives sur la mangrove, et plus spécifiquement sur la mangrove de Nouvelle-Calédonie, ainsi que sur notre site d’étude. La 2nde partie est consacrée à l’évaluation de la biodiversité végétale ainsi qu’à la caractérisation de la structure de la formation de mangrove étudiée. La 3ème partie est consacrée à l’étude de la géochimie des sédiments de mangrove, cette section est divisée en 2 sous-parties, l’une concernant les formes azotées, l’autre concernant le carbone et les métaux lourds. La 4ème partie concerne l’étude des assemblages meïobenthiques, qui réagissent fortement à des perturbations de type organique. La 5ème partie est dédiée à la crevetticulture et à l’inventaire de solutions de gestion des effluents. Cette partie comprend quatre sections. La 1ère section a pour vocation de présenter les caractéristiques de la filière crevettière de Nouvelle-Calédonie. La 2nde section donne les caractéristiques des effluents crevettiers. La 3ème section est le résultat des recherches bibliographiques sur les moyens de gestion des effluents. Enfin la 4ème section est une discussion de faisabilité sur ces moyens de gestion. La 6ème partie de ce rapport, intègre les aspects sociologiques des connaissances et des perceptions des éleveurs à propos de la mangrove et des effluents. Dans la synthèse générale de ce rapport, nous proposerons dans un premier temps des conclusions à propos de la géochimie des sédiments des sédiments de mangrove et des différents facteurs forçants. Dans un second temps, nous serons amenés à prendre en compte les résultats de l’étude sociologique dans le but de mener une réflexion sur les différents moyens de gestion des effluents applicables en Nouvelle-Calédonie.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00198/30917/29288.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00198/30917/

Résumé : In the booming context of shrimp culture in French Caledonia, some research actions need to be considered in order (i) to make sure this production will not impact the quality and biodiversity of the coastal environment it is contingent upon (ii) for the field to highlight, based on objective bases, its good "environmental image", for an efficient commercialization of its products. In the framework of the MOM project, a number of actions have been carried out: Action 1: A bibliographical synthesis of the impact of shrimp culture on coastal environment has been conducted, taking into account the works carried out throughout the world and in French Caledonia in order to draw the main issues the Territory will have to deal with. It seems necessary to start with an assessment of the future and the impact of the effluents on the coastal environment. Action 2: With this aim in mind, one or more indicators, among the lagoon's environmental variables, of the influence of the farms' rejects on the coastal environment, have been searched for. The first results are presented in this report. Action 3: In parallel, a long-term program taking into account the different aspects of the problem in its entirety and complexity has been defined in relation with our partners in French Caledonia. With this aim in mind, a symposium entitled "Ecosystems and shrimp culture", organised by the Ifremer in French Caledonia, with the support of the IRD, was held in Nouméa from June 22nd to June 24th, 2005. This symposium enabled the drawing out of the research perspective on the benthos, on the functioning of the lagoon ecosystem, and on the evolution of the mangrove swamps subjected to organic matter inflows from farms.
Dans un contexte d'essor de la filière crevette de Nouvelle Calédonie, des actions de recherche doivent être envisagées (i) pour assurer que cette production n'hypothéquera pas la qualité de l'environnement littoral et sa biodiversité dont elle dépend et (ii) pour que la filière puisse mettre en avant, sur des bases objectives, son image «environnementalement correcte» garante de la bonne commercialisation de son produit. Dans le cadre de ce projet MOM, plusieurs actions ont été menées : Action 1 : Une synthèse bibliographique de l'impact de l'aquaculture de crevettes sur l'environnement littoral a été réalisée en prenant en compte les travaux conduits à travers le monde et en Nouvelle-Calédonie afin de dégager les principales problématiques concernant le Territoire. Il apparaît nécessaire comme première priorité d'être capable d'évaluer le devenir et l'impact des effluents sur l'environnement littoral. Action 2 : A ce titre, un travail de recherche d'un ou de plusieurs indicateurs, parmi les variables environnementales du lagon, de l'influence des rejets aquacoles sur l'environnement littoral a été mené. Les premiers résultats sont présentés dans ce rapport. Action 3 : Parallèlement, il a été défini en relation avec nos partenaires présents en Nouvelle-Calédonie un programme pluriannuel prenant en compte les différents aspects du problème dans sa globalité et sa complexité. Pour cela, un séminaire intitulé « Écosystèmes et crevetticulture » organisé par l'Ifremer en Nouvelle-Calédonie avec le soutien de l'IRD s'est tenu à Nouméa du 22 au 24 juin 2005. Ce séminaire a permis d'élaborer des perspectives de recherche sur le benthos, sur le fonctionnement de l'écosystème lagon et sur l'évolution des mangroves soumis à des apports de matière organique issus des élevages.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/rapport-6593.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6593/

Résumé : This study aims to integrate the problems associated with port development and related activities in an economic monitoring programme that surveys all the activities associated with the marine environment. The economic monitoring programme in this sector also includes studying coastal spatial planning. This type of study concerns the creation and remodelling of sites that involve investments. We can consider two types of coastal spatial planning: one which integrates port development, tourism, aquaculture and fisheries and one that deals with the marine environment (Abric, 1989). Economic surveys of port development on French coasts supposes that the problem of identifying information sources have been resolved and the sectors and the activities that should be accounted for have been characterised. In what follows, the limits of available information and the problems pertaining to the proposed classification of activities according to statistical nomenclature will be discussed. The absence of structured and localised data is aggravated in certain cases by the rules of confidentiality. In light of these difficulties, the first part of this report is devoted to the inventory of general information sources and to the characterisation of existing data. As information forms the basis of any economic monitoring programme, it is necessary to know where, how and by whom information is processed and the limits that one comes up against. This report does not pretend to be exhaustive given the deadlines and the duration of this study. The second part of this report constitutes a summary of the recent trends discerned in terms of port development, from a legal, as well as economic and financial, point of view. This study should be considered as the first step to establishing a basis for a more in-depth study.
Cette étude a pour but d'intégrer les problèmes d'aménagement portuaire et les activités qui y sont liées dans un suivi conjoncturel de l'ensemble des activités économiques en relation avec le milieu maritime. Le suivi conjoncturel de ce secteur économique passe aussi par l'étude de l'aménagement physique du littoral. Celui-ci concerne la création et le remodelage de sites impliquant des investissements. On peut considérer deux types d'aménagements physiques -l'aménagement du littoral : portuaire, touristique, aquacole, halieutique; -l'aménagement du mineur marin (Abric, 1989). Un suivi conjoncturel de l'aménagement portuaire du littoral français, suppose en préalable la résolution du problème de l'identification des sources d'information et la caractérisation des secteurs et activités en prendre en compte. On verra par la suite les limites de l'information disponible et les problèmes afférents a la classification des activités selon les nomenclatures statistiques proposées. L'absence de données structurées et localisées est aggravée dans certains cas par des règles de confidentialité. Du fait de ces difficultés, la première partie de ce rapport est consacrée au recensement des sources d'information générale et à la caractérisation des données existantes. L'information étant à la base de tout suivi conjoncturel, il convient en effet d'être en mesure de savoir où, par qui et comment elle est traitée et les limites auxquelles on se heurte. Ce rapport ne peut prétendre à l'exhaustivité compte tenu des délais et de la période d'exécution de cette étude. La seconde partie constitue une première synthèse sur les évolutions récentes saisies en termes d'aménagements portuaires, tant d'un point de vue juridique qu'économique et financier. Cette étude est à considérer comme une première étape destinée à poser les bases pour une étude plus approfondie. [OCR NON CONTRÔLE]

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1992/rapport-4169.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4169/

Résumé : La drépanocytose est une hémoglobinopathie aux formes et aux sévérités cliniques très hétérogènes qui affectent de nombreux organes chez les patients touchés. Pour cette raison le terme de syndrome drépanocytaire majeur est généralement employé. Tous les syndromes drépanocytaires majeurs ont en commun une mutation ponctuelle du gène β-globine appelée mutation βs . Cette mutation βs conduit à la synthèse de la protéine d'hémoglobine S (HbS) caractérisée par sa capacité à polymériser dans sa forme désoxygénée. La polymérisation de l'HbS est l'élément déclencheur de la falciformation du globule rouge et conduit à de nombreuses altérations hématologiques et hémorhéologiques. Ces dernières sont à l'origine de troubles de l'hémodynamique, de l'oxygénation sanguine et de la perfusion tissulaire en oxygène. Il en résulte de nombreuses complications aigues (crise vaso-occlusive, accident vasculaire cérébral, syndrome thoracique aigu etc.) et/ou chroniques (glomérulopathie, ostéonécrose de la tête fémorale etc.) causés par un défaut d'oxygénation des tissus.
Sickle cell anemia is a hemoglobinopathy forms and severities very heterogeneous clinical affecting many organs in affected patients. For this reason the term major sickle cell syndrome is generally used. All major sickle cell syndromes have a common point mutation in the gene called β-globin mutation βs. This βs mutation leads to the synthesis of the protein hemoglobin S (HbS) is characterized by its ability to polymerize in its deoxygenated form. The polymerization of HbS is the trigger for the sickling of red blood cells and leads to many Hematological and hemorheological. These are at the origin of disorders hemodynamics, blood oxygenation and tissue perfusion with oxygen. This results in many acute complications (vaso-occlusive crisis, stroke, acute chest syndrome, etc..) And / or chronic (glomerulopathy, osteonecrosis of the femoral head etc.). Caused by a defect of tissue oxygenation.

http://www.theses.fr/2012AGUY0563/document

Résumé : This report makes the synthesis of the works and the results acquired thanks to the development of the project Pace-Net (2010-2013) registered in the 7th framework program of the European Commission aiming to create a scientific and technological network between Europe and the Pacific in front of main common stakes. These concern the biodiversity and the environmental management, the climate change, the energy, the water, the agriculture and the forest, the natural risks, the fisheries and aquaculture and the trans-cutting approaches
Ce rapport effectue la synthèse des travaux et des résultats acquis à la faveur du développement du projet Pace-Net (2010-2013) inscrit dans le 7 ème programme cadre de la Commission Européenne et visant à faire naître un réseau scientifique et technologique entre l'Europe et le Pacifique face aux grands enjeux posés. Ceux-ci concernent la biodiversité et la gestion environnementale, le changement climatique, l’énergie, l’eau, l’agriculture et la forêt, les risques naturels, la pêche et de l’aquaculture et les approches intégratrices.

Droits : Pace-Net Network - All rights reserved
http://archimer.ifremer.fr/doc/00204/31488/29898.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00204/31488/

Éditeur(s) : Pêche thonière et dispositifs de concentration de poissons, Caribbean-Martinique, 15-19 Oct 1999
Résumé : This summary tackles the development of fisheries in the Caribbean using fads. It highlights the principal causes which explain why, in spite of more than thirty years of experimenting, fishing on fads has not developed as much as had been hoped. Whereas the deep-sea production of pelagic fish by the continental countries of the region has considerably increased since the early eighties, that of the Lesser Antilles has grown more slowly. Anchored fads have given the boats of the small-scale fisheries from three islands (Guadeloupe, Martinique and Curacao) access to these pelagic resources. The various modes of development and management of the fads observed in each island are described. The first available data are used to provide some indications of the effects of the various strategies implemented and the changes induced by this new fishing technique.Original Abstract: Cette synthese concerne la region Atlantique Centre-Ouest (FAO 31) mais elle aborde principalement le developpement des DCP ancres de la zone Caraibe. Trois sites principaux font l'objet d'un developpement particulier ; il s'agit des iles pour lesquelles l'activite de peche professionnelle est actuellement effective autour des DCP : la Guadeloupe, la Martinique et Curacao. L'introduction de DCP dans l'Atlantique Centre-Ouest est signalee pour la premiere fois en 1969, a Panama City (Floride). Il s'agit alors de dispositifs cotiers. Les especes ciblees sont des petits poissons pelagiques. Au debut des annees quatre-vingt, l'implantation de DCP ancres autour des petits etats insulaires de la Caraibe pour la peche des grands poissons pelagiques est consideree comme une priorite par les scientifiques reunis lors du 36e congres du Gulf and Caribbean Fisheries Institute (GCFI). Beaucoup d'experiences DCP conduites dans la region ont permis de conclure a une bonne efficacite agregative quels que soient les choix technologiques operes (DCP lourds ou legers). Malgre cela, tres peu d'iles tirent actuellement benefice de l'avantage que procurent les DCP pour l'exploitation des ressources en grands pelagiques frequentant leurs eaux. Les problemes de transfert et les difficultes a passer de la phase experimentale a la phase operationnelle sont probablement a l'origine de ce paradoxe. Le developpement d'une reelle cooperation regionale sur le theme devrait permettre, aux petits etats insulaires notamment, de mieux profiter des migrations des grands poissons pelagiques dans leurs eaux.

Droits : Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00042/15279/12665.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00042/15279/

Résumé : This catalogue deals mainly with common phytoplanktonic species found in the Channel. It is part of a bibliographical survey on pelagos and benthos. The main idea was to gather the largest possible amount of data on the eco-physiology of each species. To do so, studies were conducted in the main marine region where the species had been found and analysed. We focused on several reference ecological studies conducted in the coastal Channel, on the E.D.F. sites, by the C.N.E.X.O., the I.S.T.P.M. and some university laboratories. A great attention was also paid to the studies on seasonal cycles carried out in laboratories in Plymouth, Helgoland and in the Irish zones. (unverified OCR)
Ce catalogue se rapporte essentiellement aux espèces phytoplanctoniques les plus courantes et abondantes en Manche; il s'insère dans une synthèse bibliographique générale concernant le pélagos et le benthos. Nous nous sommes proposés de rassembler le plus grand nombre de données sur l'éco-physiologie de chaque espèce. Pour ce faire, les recherches se sont déroulées dans les principales régions maritimes où l'espèce avait été rencontrée et étudiée. Plus particulièrement, notre attention s'est portée sur les études écologiques de référence effectuées en Manche Littorale sur les sites E.D.F. par le C.N.E.X.O., l'I.S.T.P.M, et les laboratoires universitaires; d'importance aussi, furent les études de cycles saisonniers effectuées au laboratoire de Plymouth, d'Helgoland, et dans les zones irlandaises. OCR NON CONTROLE

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1984/rapport-3701.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3701/

Résumé : L’HTLV-1 est l’agent étiologique de la TSP/HAM et de l’ATL. La TSP/HAM est une méningomyélite chronique d’évolution lente et progressive. La charge provirale HTLV-1 est corrélée à l’évolutivité de la maladie. La protéine virale Tax module la synthèse et la fonction de multiples protéines de la prolifération et de la survie des lymphocytes T infectés. L’expression virale n’est pas toujours détectable in vivo. Une modulation épigénétique par inhibiteurs d’HDAC a été proposée. Des travaux dans le modèle du BLV et in vitro dans l’infection à HTLV-1 ont conforté ce concept et conduit à un essai thérapeutique évaluant le VPA dans le traitement de la TSP/HAM, qui n’a pas montré d’impact sur la charge provirale. Nous nous sommes intéressés à l’effet du VPA sur les lymphocytes T CD4+ en culture, cibles du virus HTLV-1. L’expression du génome viral, surtout la balance entre les protéines Tax et HBZ a été étudiée avec ou sans VPA. Son expression serait corrélée à la charge provirale et à l’évolution de la TSP/HAM. Nous montrons qu’un tiers des cellules CD4+ infectées expriment Tax. Cette proportion augmente sous VPA. La détection de la protéine p19 est augmentée sous VPA. La stimulation par le VPA de la transcription sens du génome viral a été confirmée par quantification des messagers Tax et Gag alors que l’expression d’HBZ se trouve réprimée sous VPA. Les données cinétiques d’expression spontanée d’HBZ montrent l’existence d’un rétrocontrôle négatif exercé par HBZ sur l’expression de Tax et des gènes structuraux. Influer sur l’expression d’HBZ ouvre une voie nouvelle pour le traitement des maladies associées à HTLV-1.
HTLV-1 is the etiological agent of HAM/TSP and ATL. TSP/HAM is a chronic meningomyelitis with a course being slow and progressive. HTLV-1 proviral load correlates with disease progression. Tax protein modulates the synthesis and function of proteins involved in the regulation of infected T-lymphocytes proliferation and survival. Viral expression is not always detectable in vivo. An epigenetic modulation by the use of HDAC inhibitors has been proposed. A study in the BLV model and an in vitro study in a HTLV-1 infection have lead to a therapeutic assay in order to assess VPA in the treatment of HAM/TSP. This assay did not show any impact on the proviral load. We evaluated the impact of VPA treatment on viral genome expression in cultured lymphocytes, especially the balance between Tax and HBZ. A third of provirus-positive CD4+ T cells spontaneously became Tax-positive. The estimation rose up to two-thirds of Tax-positive infected cells when VPA was added. VPA enhanced Gag p19 protein release. VPA treatment enhanced and prolonged Tax mRNA expression, while it blocked HBZ expression. Our data are consistent with the hypothesis of a feed-back loop coordinating Tax and HBZ expression. Modulation of HBZ expression may impact the net outcome of VPA treatment on HTLV-1-infected cell proliferation and survival.

http://www.theses.fr/2011AGUY0403

Résumé : Les attines sont des fourmis champignonnistes dans la zone allant des Etats-Unis à l'Argentine en passant par la Caraïbe. Les dégâts causés par ces ravageurs sont considérables et estimés à plusieurs millions de dollars par an. Elles sont de ce fait considérées comme l'un des premiers fléaux de l'agriculture de la zone (Cameron & Riggs, 1985 ; Fowler et al., 1986). En Guadeloupe, la "fourmi manioc" (Acromyrmexoctospinosus Reich) cause de nombreux dommages, aussi bien pour l'agriculture que dans les milieux naturels. Les dégâts occasionnés par ces fourmis ont nécessité l'utilisation de pesticides de synthèse. pour tenter de les combattre. La dangerosité de ces substances pour les milieux naturels et anthropisés ainsi que pour la santé publique est un contexte favorable à l'exploration de nouvelles pistes telles que l'utilisation de plantes à usages phytosanitaires. L'objet principal de cette thèse consiste à savoir si on peut déceler à partir de l'ethnopharmacologieTRAMIL des usages permettant de combattre cette fourmi et son symbiote fongique, Leucocoprinuss 'gongylophorus (Heim) MoeIler. Les protocoles retenus et présentés dans ce travail permettent d'observer les effets des usages de plantes choisis sur la survie et le comportement des insects et sur la croissance du symbiote. Ils ont été sélectionnés pour leur potentialité à mettre en évidence les différents types d'effets des extraits végétaux (insecticide par contact, insectifuge, toxique par ingestion, fongistatique ou fongicide). Six usages traditionnels issus de cinq plantes sont testés sur la fourmi: Mammea americana L., Nerium oleander L., Nicotiana tabacum L., Rollinia mucosa (Jacq.) Baill. et Trichilia pallida Sw. Cinq autres usages traditionnels sont testés sur le champignon : Allium cepa L., Allium sativum L., Lycopersicom esculentum Mill., Manihot esculenta Crantz et Senna alata (L.) Roxb. Les resultants obtenus permettent de dégager quelques pistes de lutte intéressantes contre ce ravageur.
Leaf-cutting ants are fungus-growing ants.Their geographie distribution ranges from southern United States to northern Argentina, incIuding the West Indies, Economic losses due to these ants were estimated at several million dollars per year. The latter statement makes they are considered as one of the most important pest species of the agricultural productions (Cameron & Riggs, 1985 ; Fowler et al., 1986). In (Guadeloupe, the most important invasive pest species which caused important losses in forests, gardens and field crops is 'cassava ant' (Acromyrmex octospinosus Reich). These huge losses required to use, synthetic chemical pesticides to control these leaf-cutting ants, the consequence of which is, irreversible' injuries on environment and on human health. As a matter of fact, this situation has prompted an increasing interest in alternative methods for pest control like plants with pesticide used. The main objective of this thesis is to know if traditional ethnopharmacological TRAMIL uses could help to fight against this ant and against the symbiotic fungus, Leucocoprinus gongylophorus (Heim) . Moeller. Methods used and presented in this work aIIowed to observe effects of selected plant uses on mortality and insect's behavior. The protocols performed were selected for their potentiality to detect the different types of insecticidal effects (contact toxicity, repellent effect, toxicity by ingestion, fungicidal or fungistatic). Six traditional plant uses of five plants were tested on the ant : Mammea americana L., Nerium oleander L., Nicotiana tabacum L.,Rollinia mucosa (Jacq) Baill. and Trichilia pallida Sw.Five other plants uses were tested on the fungus:Allium cepa L.,Lycopersicon esculentum Mill.,Manihot esculenta Crantz and Senna alata (L.) Roxb.The obtained résults provide us with some interesting trails to fight against this pest.

http://www.theses.fr/2011AGUY0469/document

Résumé : The use of acoustical systems in various human activities in the ocean (industry, defence, science) raises the issue of their impact upon marine mammals populations. Several serious accidents linked to the use of naval sonars led the military, industrial and scientific communities to investigate the potential dangers of their own activity. This report aims at identifying the risks for the cetaceans linked to the use of acoustic and seismic systems currently used for oceanographic science. The analysis proposed here stays within the frame of bibliography synthesis and elementary modelling, and brings no new scientific elements on the topic. An overview of the status of cetacean populations is given first, with a summary of the possible acoustical threats. Risks are classified and described, insisting on the cases of massive stranding events. The present status of knowledge about auditory characteristics of cetaceans is summarised, and the definition of an objective threshold for acoustical risk is discussed ; the usually-admitted values are finally retained, despite of their evident limitations. The report presents also the emission characteristics of the various acoustic and seismic systems used in oceanographic, emphasising the ones operated by Ifremer; for the potentially harmful ones (according to the currently-used criteria) a model is proposed for the radiated acoustical intensity field, giving the extent of risk areas. This analysis concludes to the harmlessness of most systems, excepted heavy seismics and at a lesser degree low-frequency multibeam echosounders. Finally a variety of possible mitigation measures are presented and discussed; the regulations imposed by some countries are detailed. The report finally recommends both short-term measures aimed at limiting the potential risks, and longer-term actions for participating in the general effort of scientific and technological research in this field.
L'emploi des systèmes acoustiques dans les diverses activités humaines en milieu océanique (industrielles, de défense, scientifiques) pose le problème de leur impact sur les populations de mammifères marins. L'évidence de plusieurs événements graves liés à l'utilisation de sonars navals a amené les communautés militaires, industrielles et scientifiques à s'interroger sur les dangers potentiels de leurs propres activités. Le présent rapport tente de cerner les risques, pour les Cétacés, liés à l'emploi des systèmes acoustiques et sismiques couramment mis en oeuvre pour la recherche océanographique. L'analyse proposée ici reste à un niveau de synthèse bibliographique et de modélisation élémentaire, et n'offre pas d'éléments scientifiques nouveaux sur la question. On commence par donner un panorama de la situation des populations de cétacés et des agressions sonores qui les menacent. Les risques acoustiques sont répertoriés et décrits, en insistant sur les cas avérés d'échouages massifs. L'état actuel de connaissances sur les caractéristiques auditives des cétacés est résumé, et la définition d'un seuil objectif de risque acoustique est discutée ; on retient par défaut les valeurs de seuils généralement admises actuellement, en dépit de leurs limitations évidentes.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/rapport-2390.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2390/