![]() | Apport d'un programme de génétique à une filière de production aquacole : l'exemple de l'ostréiculture Auteur(s) : Lapegue, Sylvie Bedier, Edouard Goyard, Emmanuel Degremont, Lionel Baud, Jean-pierre Gerard, Andre Goulletquer, Philippe Boudry, Pierre Éditeur(s) : Styli 2003. Trente ans de crevetticulture en Nouvelle-Calédonie. Nouméa - Koné, 2-6 juin 2003. 2004. Gorarant C, Harache Y, Herbland A, Mugnier C. Ed. Ifremer, Actes de Colloque, n°38, pp.113-120 Résumé : Two oyster species are currently present along the French coasts : the indigenous European flat oyster (Ostrea edulis), and the Pacific cupped oyster (Crassostrea gigas), that has been introduced from Japan since the beginning of the 70ies. The flat oyster successively suffered from two protozoan diseases during the 60ies and its production decreased from 20 000 tons/year by that time to 1 500 tons/year nowadays. Consequently, the oyster production is principally (99%) based upon the Pacific oyster species with approximately 150 000 tons/year among which 90% are grown from the natural spat. However, the hatchery production of this species is developing and was estimated to 400 to 800 millions spat in 2002. Moreover, strengthened relationships between IFREMER and the 5 commercial hatcheries, that all joined the SYSAAF (Union of the French poultry, shellfish and fish farming selectors), allow to plan for new genetic breeding programs. At the end of the 80ies, IFREMER initiated a genetic breeding program for the resistance of the European flat oyster to the bonamiosis, and obtained strains more tolerant to this disease. After two generations of massal selection, molecular markers had identified a reduced genetic basis in this program. It was then reoriented to an intra-familial selection. However, we were confronted to a zootechnic problem to manage such a scheme and we compromised by an intra-cohorts of families selection scheme managed using molecular markers. The program has now reached the transfer level with experimentation at a professional scale. Concerning the Pacific cupped oyster, and in parallel with the obtaining and the study of polyploids, performance of different Asian cupped oyster strains were compared to the one introduced in France thirty years ago and currently suffering from summer mortalities. The local strain exhibited better performance, certainly based upon a good local adaptation. In other respects, although early growth is a relevant criteria for selection for growth to commercial stage, it is not to be privileged in the context of an oyster producing region with a limited food availability. Contrary, the spat summer mortality became a priority for numerous teams (genetic, physiology, pathology, ecology,...) joined in the MOREST program. The first results showed important survival differences between fullsib and halsib families. They indicate a genetic determinism to this character "survival" and promote for its selection. Deux espèces d'huîtres sont aujourd'hui présentes sur les côtes françaises : l'huître plate européenne (Ostrea edulis), indigène, et l'huître creuse du Pacifique (Crassostrea gigas), introduite du Japon dans le début des années 1970. L'huître plate a subi coup sur coup, dans les années 1960, deux maladies dues à des protozoaires parasites et sa production est ainsi passée de 20 000 t/an dans les années 1960 à 1500 t/an aujourd'hui en France. Il en résulte que la filière ostréicole française repose quasiment exclusivement (99%) sur la production de l'huître creuse, C. gigas, avec 150 000 tonnes en 2000 dont environ 90% est issu du captage naturel. Cependant, la reproduction de cette espèce en écloserie est actuellement en expansion avec une estimation de 400 à 800 millions de naissains commercialisés en 2002. Des rapports renforcés entre l'IFREMER et les cinq écloseries françaises de la filière ostréicole, qui adhèrent toutes au SYSAAF (SYndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français), permettent désormais d'envisager le développement de nouveaux programmes d'amélioration génétique. A la fin des années 1980, un programme de sélection pour la résistance de l'huître plate à la bonamiose a été initié au sein de l'IFREMER, et a permis d'obtenir des souches plus tolérantes à cette maladie. Après deux générations en sélection massale, les marqueurs moléculaires avaient mis en évidence une base génétique réduite au sein de ce programme qui s'était alors orienté vers une sélection intra-familiale. Devant la lourdeur zootechnique d'un tel schéma, un compromis a été trouvé en réalisant une sélection au sein de cohortes de familles biparentales, la gestion de ces cohortes étant permise par les analyses moléculaires. Le programme est maintenant dans sa phase de transfert, avec des expérimentations à plus grande échelle en partenariat avec la profession. En ce qui concerne l'huître creuse, et en parallèle de l'obtention et l'étude de polyploïdes, les performances de différentes souches d'huîtres creuses provenant d'Asie ont été comparées à celles de la souche introduite en France il y a trente ans, sujette à des mortalités estivales. La souche locale présente de meilleures performances, vraisemblablement grâce à une adaptation bien réalisée. Par ailleurs, bien que l'amélioration de la croissance jusqu'à la taille commerciale s'avère possible par une sélection précoce au stade larvaire, le critère de croissance n'est pas nécessairement à privilégier dans le contexte d'un bassin ostréicole disposant de ressources trophiques limitées. En revanche, les importantes mortalités rencontrées par le naissain en périodes estivales constituent le sujet d'étude prioritaire sur lequel se sont penchées de nombreuses équipes (génétique, physiologie, pathologie, écologie, ...) dans le cadre du grand défi MOREST. Les premiers résultats ont mis en évidence de fortes différences de survie entre des familles biparentales d'animaux indiquant un déterminisme génétique du caractère « survie », et encourageant dans la voie d'une sélection pour ce caractère. Droits : 2004 Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-3491.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3491/ | Partager Voir aussi Growth Selection Genetic breeding Genetic Ostrea edulis Crassostrea gigas Oysters Croissance Sélection Amélioration génétique Télécharger |
![]() | Diversity of Vibrio spp. isolated at ambient environmental temperature in the Eastern English Channel as determined by pyrH sequencing Auteur(s) : Tall, Amadou Hervio-heath, Dominique Teillon, Anna Boisset-helbert, C. Delesmont, R. Bodilis, J. Touron-bodilis, A. Éditeur(s) : Wiley-blackwell Résumé : Aims To describe the diversity of the culturable mesophilic and potentially pathogenic vibrios isolated at 22 and 37 degrees C on TCBS medium, in September 2009 from seawater and surface sediments. Methods and Results q-PCR assays previously selected for the identification of bacterial strains isolated at 37 degrees C were used in combination with the partial sequencing of two housekeeping genes, pyrH and toxR, to identify 315 strains isolated at 22 degrees C. The great majority of the 37 degrees C strains was identified by q-PCR assays, (five of the six species) with the predominance of Vibrio alginolyticus (85 center dot 9%) and V.harveyi (10 center dot 7%). The human pathogens V.parahaemolyticus and V.cholerae were rarely detected (two strains each). The 22 degrees C strains were successfully identified by the phylogeny analysis of pyrH and toxR genes, revealing 20 Vibrio species, with the predominance of the clam pathogen V.celticus (36 center dot 8%). The Splendidus and the Harveyi groups represented the main Vibrio group at 22 degrees C (80%) and 37 degrees C (99 center dot 5%), respectively. Conclusions The combination of q-PCR assays and the sequencing of pyrH and toxR genes highlighted two different Vibrio communities at 22 and 37 degrees C both dominated by pathogenic species for marine organisms. Significance and Impact of the Study The sequencing of the pyrH gene revealed to be a valuable tool to identify environmental Vibrio spp. strains isolated at 22 degrees C, as 92 center dot 3% of them were identified in this study. Journal Of Applied Microbiology (1364-5072) (Wiley-blackwell), 2013-06 , Vol. 114 , N. 6 , P. 1713-1724 Droits : 2013 The Society for Applied Microbiology http://archimer.ifremer.fr/doc/00144/25502/24832.pdf DOI:10.1111/jam.12181 http://archimer.ifremer.fr/doc/00144/25502/ | Partager Voir aussi coastal environment culturable Vibrio spp diversity pyrH and toxR genes partial sequencing Télécharger |
![]() | La pêche au vivaneau en Guyane française Auteur(s) : Prevost, Etienne Résumé : Traditionally fished by line and conical fishing basket by Venezuelan ships, the red snapper resource off the coast of French Guyana (fish belonging to the Lutjanidae family) has been experiencing intensive fishing since 1984-85 due to the boom in classic fishing techniques and the development of trawl fishing.
The study evaluates the situation of this resource's potential: biology, sampling data, bio-statistics (size and sex), size-weight relationship of the three species, specific composition of the catches, describes fishing devices and prospecting, pinpoints fishing spots, gives a distribution of the Venezuelan and Martinique fishing effort.
Traditionnellement exploitée à la ligne à main et à la nasse par les navires vénézuéliens, la ressource en vivaneaux au large de la Guyane française (poissons appartenant à la famille des Lutjanidae) subit depuis 1984-85 une exploitation intense par l'accroissement des techniques de pêche classiques et le développement d'une pêcherie au chalut. L'étude fait le point sur les potentialités de cette ressource : biologie, données de l'échantillonnage, bio-statistique (taille et sexes), relation taille-poids des 3 espèces, composition spécifique des captures, décrit les engins de pêche et prospection, localise les lieux de pêche, donne une répartition de l'effort de pêche vénézuélien et chalutier martiniquais. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1986/rapport-2646.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2646/ | Partager Voir aussi bow net trawl fishing line Franch Guyana Lutjanidae Guyane chalut nasse ligne engin de pêche Télécharger |
![]() | Les sparides des cotes nord-ouest africaines Auteur(s) : Bonnet, Marc Éditeur(s) : ISTPM Résumé : The Thalassa, a ship of the Institute of Fishing, carried out two trawling campaigns off the coasts of Rio de Oro, Mauritania and Senegal. The first one took place in November and December 1962; it extended from Cape Juby to Tamxat (17°20'N). The second, directed more towards the south, reached the Fosse de Cayar Submarine Canyon, near Cape Verde; it occurred in March and April 1968. These operations represent in total 100 trawl passes between latitudes 15° and 28°N and depths of 10 to 800 metres. These two campaigns' overall data are introduced incidentally. The data recorded here are exclusively about the twenty species of sparidae harvested. They concern the geographic and bathymetric distribution, frequency and numbers, size and sex. There emerge certain comments on the animal life, biology and fishing. In some cases, it seemed worthwhile to emphasise the morphological differences that make it possible to distinguish among them species at times very closely related. La « Thalassa », navire de l'Institut des Pêches, a effectué deux campagnes de chalutage au large des côtes du Rio de Oro, de la Mauritanie et du Sénégal. La première a eu lieu en novembre et décembre 1962; elle s'est étendue du cap Juby à Tamxat (17°20'N). La seconde, plus orientée vers le sud, a atteint la fosse de Cayar, à proximité du cap Vert; elle s'est déroulée en mars et avril 1968. Ces opérations représentent au total cent traicts de chalut qui se répartissent entre les latitudes 15° et 28°N et les profondeurs de 10 à 800 m. Les données d'ensemble de ces deux campagnes sont présentées par ailleurs. Celles consignées ici concernent exclusivement les vingt espèces de sparidés récoltées. Elles ont trait à la répartition géographique et bathymétrique, la fréquence et l'abondance, la taille et le sexe. Il s'en dégage certaines remarques sur la faunistique, la biologie et la pêche. Dans certains cas il a paru intéressant de souligner les différences morphologiques qui permettent de distinguer, entre elles, des espèces parfois très voisines.(OCR non controlé) Revue des Travaux de l'Institut des Pêches Maritimes (0035-2276) (ISTPM), 1969-03 , Vol. 33 , N. 1 , P. 97-116 Droits : Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/1969/publication-3156.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3156/ | Partager |
![]() | Sur un sporozoaire parasite de Crassotrea rhizophorae (Guilding) Auteur(s) : Comps, Michel Grizel, Henri Tige, Gilbert Éditeur(s) : Académie des Sciences Résumé : Along the French Guiana coast, mainly in the Monsinéry River, there are populations of natural oysters belonging to the species Crassostrea rhizophorae (Guilding). Within the scope of the growth of oyster farming in Guiana, we researched possible parasites of these oysters that are still little studied. This work, conducted based on living and set samples, allowed us to highlight the presence of nematops spores. Sur la côte de la Guyane française, principalement dans la rivière de Montsinéry existent des populations d'huîtres naturelles appartenant à l'espèce Crassostrea rhizophorae (Guilding). Dans le cadre du développement de l'ostréiculture en Guyane, nous avons recherché des parasites éventuels de ces huîtres encore peu étudiées. Ce travail mené à partir d'échantillons vivants et fixés nous a permis de mettre en évidence la présence de spores nématopsidiennes. Comptes Rendus Académie Sciences Paris (Académie des Sciences), 1972-09 , Vol. 275 , N. 15 , P. 1693-1695 Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1972/publication-3008.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3008/ | Partager |
![]() | Influence of the mode of macrofauna-mediated bioturbation on the vertical distribution of living benthic foraminifera: First insight from axial tomodensitometry Auteur(s) : Bouchet, Vincent Sauriau, Pierre-guy Debenay, J.p. Mermillod-blondin, F Schmidt, S Amiard, J.c. Dupas, B Éditeur(s) : Elsevier Résumé : We investigated the influence of bioturbation by macrofauna on the vertical distribution of living (stained) benthic foraminifera in marine intertidal sediments. We investigated the links between macrofaunal bioturbation and foraminiferal distribution, by sampling from stations situated on a gradient of perturbation by oyster-farming, which has a major effect on benthic faunal assemblages. Sediment cores were collected on the French Atlantic coast, from three intertidal stations: an oyster farm, an area without oysters but affected by oyster biodeposits, and a control station. Axial tomodensitometry (CT-scan) was used for three-dimensional visualization and two-dimensional analysis of the cores. Biogenic structure volumes were quantified and compared between cores. We collected the macrofauna, living foraminifera, shells and gravel from the cores after scanning, to validate image analysis. We did not investigate differences in the biogenic structure volume between cores. However, biogenic structure volume is not necessarily proportional to the extent of bioturbation in a core, given that many biodiffusive activities cannot be detected on CT-scans. Biodiffusors and larger gallery-diffusors were abundant in macrofaunal assemblage at the control station. By contrast, macrofaunal assemblages consisted principally of downward-conveyors at the two stations affected by oyster farming. At the control station, the vertical distribution of biogenic structures mainly built by the biodiffusor Scorbicularia plana and the large gallery-diffusor Hediste diversicolor was significantly correlated with the vertical profiles of living foraminifera in the sediment, whereas vertical distributions of foraminifera and downward-conveyors were not correlated at the station affected by oyster farming. This relationship was probably responsible for the collection of foraminifera in deep sediment layers (> 6 cm below the sediment surface) at the control station. As previously suggested for other species, oxygen diffusion may occur via the burrows built by S. plana and H. diversicolor, potentially increasing oxygen penetration and providing a favorable microhabitat for foraminifera in terms of oxygen levels. By contrast, the absence of living foraminifera below 6 cm at the stations affected by oyster farming was probably associated with a lack of biodiffusor and large gallery-diffusor bioturbation. Our findings suggest that the effect of macrofaunal bioturbation on the vertical distribution of foraminiferal assemblages in sediments depends on the effects of the macrofauna on bioirrigation and sediment oxidation, as deduced by Eh values, rather than on the biogenic structure volume produced by macrofauna. The loss of bioturbator functional diversity due to oyster farming may thus indirectly affect infaunal communities by suppressing favorable microhabitats produced by bioturbation. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology (0022-0981) (Elsevier), 2009-03 , Vol. 371 , N. 1 , P. 20-33 Droits : 2009 Elsevier B.V. All rights reserved. http://archimer.ifremer.fr/doc/2009/publication-6146.pdf DOI:10.1016/j.jembe.2008.12.012 http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6146/ | Partager Voir aussi Macrofauna Living foraminifera Interspecific interaction CT scan Bioturbating modes Biogenic structures Télécharger |
![]() | Marqueurs microsatellites chez l'huître plate Ostrea edulis l. : caractérisation et applications à un programme de sélection pour une résistance au parasite Bonamia ostreae et à l'etude de populations naturelles Auteur(s) : Launey, Sophie Éditeur(s) : Institut national agronomique Paris Grignon Résumé : The flat oyster Ostrea edulis L. is the indigenous oyster of the Atlantic as well as the Mediterranean coasts of Europe. Its commercial exploitation dates back to Antiquity but its breeding is now threatened by two parasitic protozoa, among which Bonamia ostreae. Various aspects of the genetics of this species' natural and farmed populations have been studied with the aid of microsatellite markers. At first, the implementation and the screening of two partial genomic libraries made it possible to identify 28 new microsatellite loci. Analysis of the segregation of 12 of these loci and of two enzymatic loci shows that most microsatellite loci are transmitted in a Mendelian way, but some loci have significant segregation distortions. Moreover, seven linkage groups, of which four contain at least two markers, were identified in Ostrea edulis. The genetic variability of three populations selected for one or two generations for resistance to Bonamia ostreae was analysed with the aid of 5 microsatellite loci. In spite of the absence of genealogical data, we have shown that these selected populations were descended from a very low number of founding genitors (from 3 to 15 depending on the population) and for two populations, we were able to reconstruct the genealogy and the relationships between the individuals were identified. These selected populations have, in addition to a very low genetic variability, real and at times high levels of consanguinity. These results have a significant implication for the continuation of the selection programme (consanguinity management, augmentation of genetic variability by introducing wild genitors). The geographical structuring of the genetic variability of natural populations of Ostrea edulis has been analysed with the aid of 5 microsatellite loci on a sampling covering almost the entire distribution area of the species (from Norway to the Adriatic Sea). The results are consistent with those published in the literature and using enzymatic markers. The populations show a low level of differentiation that could correspond to a model of isolation by distance. The Atlantic populations, which have a reduced polymorphism, could be descended from post-glacial recolonisation from Mediterranean populations that had survived the glaciations of the Quaternary Period. The current distribution of flat oyster populations is surely also subject to anthropogenic activities. Finally, the genetic bases of the heterozygosis-growth correlation were studied in a natural population with the aid of enzymatic and microsatellite markers. Although leads favouring the direct contribution of enzymatic loci have been found, biases in the sampling design make it impossible to come to a formal conclusion. However, this study has made it possible to show that the capture of individuals over a short period (around ten days) leads to a sampling of a population descended from a very low number of founding genitors, in contradiction with the generally accepted idea that marine bivalve populations are large panmictic populations with significant, efficient numbers. These results confirm in a natural population the observations of a significant reduction of efficient sizes in hatchery populations. L'huître plate Ostrea edulis L. est l'huître indigène des côtes européennes aussi bien atlantiques que méditerranéennes. Son exploitation commerciale remonte à l'Antiquité mais son élevage est aujourd'hui menacé par deux protozoaires parasites dont Bonamia ostreae. Différents aspects de la génétique des populations naturelles et cultivées de cette espèce ont été étudiés à l'aide de marqueurs microsatellites. Dans un premier temps, la réalisation et le criblage de deux banques génomiques partielles ont permis l'identification de 28 nouveaux locus microsatellites. L'analyse de la ségrégation de 12 de ces locus et de deux locus enzymatiques montre que la plupart des locus microsatellites sont transmis de façon mendélienne, mais certains locus présentent des distorsions de ségrégation importantes. Par ailleurs, sept groupes de liaison dont quatre contiennent au moins deux marqueurs ont été identifiés chez Ostrea edulis. La variabilité génétique de trois populations sélectionnées depuis une ou deux générations pour une résistance à Bonamia ostreae a été analysée à l'aide de 5 locus microsatellites. Malgré l'absence de données généalogiques, nous avons montré que ces populations sélectionnées étaient issues d'un très faible nombre de géniteurs fondateurs (de 3 à 15 selon les populations) et pour deux populations, la généalogie a pu être reconstituée et les liens de parenté entre les individus ont été identifiés. Ces populations sélectionnées présentent, outre une très faible variabilité génétique, des niveaux de consanguinité réels et parfois élevés. Ces résultats ont une implication importante pour la continuation du programme de sélection (gestion de la consanguinité, augmentation de la variabilité génétique par introduction de géniteurs sauvages). La structuration géographique de la variabilité génétique des populations naturelles d'Ostrea edulis a été analysée à l'aide de 5 locus microsatellites sur un échantillonnage couvrant presque toute l'aire de répartition de l'espèce (de la Norvège à la Mer Adriatique). Les résultats sont cohérents avec ceux publiés dans la littérature et utilisant des marqueurs enzymatiques. Les populations montrent un niveau de différenciation faible qui pourrait correspondre à un modèle d'isolement par la distance. Les populations atlantiques, qui présentent un polymorphisme réduit, pourraient être issues de recolonisation post-glaciaire à partir de populations méditerranéennes ayant survécu aux glaciations du Quaternaire. La répartition actuelle des populations d'huître plate est certainement aussi soumise aux actions anthropiques. Enfin, les bases génétiques de la corrélation hétérozygotie-croissance ont été étudiées dans une population naturelle à l'aide de marqueurs enzymatiques et microsatellites. Bien que des pistes en faveur de la contribution directe des locus enzymatiques aient été trouvées, des biais dans le dispositif expérimental ne permettent pas de conclure de façon formelle. Cependant, cette étude a permis de montrer que le captage d'individus sur une faible période (une dizaine de jours) conduit à l'échantillonnage d'une population issue d'un nombre très réduit de géniteurs fondateurs, en contradiction avec l'idée reçue que les populations de bivalves marins sont de larges populations panmictiques à effectif efficace important. Ces résultats confirment dans une population naturelle les observations de réduction importante des tailles efficaces dans des populations d'écloserie. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1998/these-1919.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1919/ | Partager |
![]() | Les scorpaenidae de l'Atlantique et de la méditerranée. première note. le genre scorpaena Auteur(s) : Cadenat, Jean Éditeur(s) : ISTPM Résumé : The Atlantic and Mediterranean members of the scorpaenidae family have always triggered numerous discussions about their reciprocious congenialities. Back in the (recent) days when the number of species known on the French coasts was still fairly low, the belonging of one species to such or such genus, as Helicolenus (Sebastes) dactylopterus DELAROCHE or Scorpaena maderensis Cuvier and Valenciennes, has been the subject of numerous articles of which the authors' conclusions might differ from one another, and even today light is still far from being shed on those topics. The difficulties met in the determination of scorpaenidae: similar general appearance, subtle differences, impossibility of comparing the samples with the types, incomplete or misinterpreted descriptions, have lead scientists to make hasty determinations resulting in: an even more complicated synonymy and incorrect data about the biogeography of the species. Thereby, the rockfish named Scorpaena rubellio by JORDAN and GUNN (I) is considered as a synonymous of S. maderensis Cuvier Valenciennes by J. R. NORMAN (2), and of S. porcus Linné by H. W. FOWLER (3). Likewise, the dispersion area of S. scrofa in Guinea, Niger and Sainte-Hélène, is caused by its confusion with other species such as S. stephanica, S. angolensis and S. scrofina. (unverified OCR) Les représentants de la famille des Scorpénidés dans l'Atlantique et la Méditerranée ont toujours donné lieu à de nombreuses discussions au sujet de leurs affinités réciproques. A l'époque encore récente où le nombre des espèces connues des côtes de France était encore très réduit, la place dans tel ou tel genre d'espèces telles que Helicolenus (Sebastes) dactylopterus DELAROCHE ou Scorpaena maderensis Cuvier et Valenciennes, par exemple, ont provoqué des séries d'articles où les conclusions des auteurs successifs n'étaient pas toujours concordantes, et aujourd'hui encore la lumière est loin d'être faite sur bien des points. Les difficultés que l'on rencontre dans la détermination des Scorpénidés : grande ressemblance générale, différences parfois difficiles à saisir, impossibilité de comparer les échantillons d'étude aux types, obligation de se contenter de descriptions incomplètes .ou mal interprétées, ont trop souvent entraîné les chercheurs à des déterminations trop hâtives ayant comme résultats : de compliquer la synonymie et de fausser plus ou moins complètement les données acquises sur la biogéographie d'une espèce. C'est ainsi que la Scorpène appelée Scorpaena rubellio par JORDAN et GUNN (Il est considérée comme synonyme de S. maderensis Cuvier Valenciennes par J. R. NORMAN (2), et de S. porcus Linné par H. W. FOWLER (3). De même l'extension de l'aire de dispersion de S. scrofa en Guinée, au Niger et à Sainte-Hélène, est due à des confusions avec des espèces différentes telles que S. stephanica, S. angolensis et S. scrofina. (OCR non contrôlé) Revue des Travaux de l'Institut des Pêches Maritimes (0035-2276) (ISTPM), 1943 , Vol. 13 , N. 1-4 Droits : Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/1943/publication-3420.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3420/ | Partager |
![]() | Le stock de Lambi (Strombus gigas, L.) en Martinique : analyse de la situation 1986-1987, modélisation de l'exploitation, options d'aménagement Auteur(s) : Rathier, I Rathier, I Éditeur(s) : Université de Bretagne Occidentale Résumé : The stock of Lambi, Strombus gigas (gastropod: strombidae), coastal benthic resource, has been exploited artisanally since the prehistoric period in Martinique. Nowadays, three lines of work exploit the species: free diving, nets (since the middle of the century) and scuba diving since 1985. This report presents the activity of each line of work, surveyed directly from 1986 to 1987: fishing zones and resource allocation, production, effort and performance, detail of catches (by length). The socio economic characteristics of the lambi fishermen are studied. The significant production of leisure fishing is also estimated. The decrease in the production and performance, as well as the lowering of the size of the first catch for about thirty years show that the stock is overexploited. The biological phenomenon of the stock: growth of the shell (length and shell lip), growth in weight, acquiring of sexual maturity, natural mortality are studied. The factors of mortality through fishing are estimated by class of length for the current exploitation regime by pseudo-cohort analysis. If the results confirm that the stock is overexploited, the level of overexploitation of the stock cannot be specified because of the presence of a number of lipped adults not yet too exploited in water deeper than 20 metres. The analysis of the dynamic process of the exploited population indicates two ways to the production of the stock: the forcing of the recruitment and the regulation of the exploitation regime. The lack of economic profitability of the production of juveniles over 30 mm and the difficulties raised by their collection in their natural habitat lead to the rationalization of the exploitation. The production and performance (by recruits) simulations performed for different exploitation regimens indicate that the only two conceivable options are the introduction of a minimum catch size, i.e. lambi with forming lip, and the regulation of the fishing effort. The socio-economic implications of the introduction of the determined management measures show that their applicability level is very low, because of the Martinique fishermen polyactivity, their low socio-economic level and mostly because of the free access to the resource. As a consequence, it is suggested to create new professional structures with a wide jurisdiction, in order to locally manage the marine areas, their use and their resources. (unverified OCR) Le stock de lambi, Strombus gigas (gastéropode: strombidae), ressource benthique côtière, est exploitée artisanalement depuis l'époque préhistorique en Martinique. Trois métiers exploitent actuellement l'espèce: plongée libre, filets (depuis le milieu du siècle) et plongée en scaphandre autonome depuis 1985. Ce rapport présente l'activité de chaque métier, suivie de 1986 à 1987 par une enquête directe: zones de pêche et allocation de la ressource, productions, efforts et rendements, composition en longueur des captures. Les caractéristiques socioéconomiques des pêcheurs de lambi sont étudiées. La production d'une pêche plaisancière non négligeable est estimée. La diminution de la production, des rendements et l'abaissement de la taille de première capture depuis une trentaine d'années révèlent que le stock est surexploité. Les phénomènes biologiques du stock: croissance de la coquille (longueur et pavillon), croissance en poids, acquisition de la maturité sexuelle, mortalité naturelle sont étudiés. Les coefficients de mortalité par pêche sont estimés par classe de longueur pour le régime d'exploitation actuel par l'analyse de pseudo-cohorte. Si les résultats confirment l'état surexploité du stock, le niveau de surexploitation ne peut être précisé en raison de l'existence d'adultes pavillonnés encore peu exploités sur les fonds de plus de 20 mètres. L'analyse des processus dynamiques de la population exploitée indique deux voies pour restaurer la production du stock: le forçage du recrutement et la régulation du régime d'exploitation. Le manque de rentabilité économique de l'élevage des juvéniles au-delà de 30 mm et les difficultés pour leur collecte dans le milieu naturel conduisent à rechercher la rationalisation de l'exploitation. Les simulations de la production et du rendement par recrue réalisées pour différents régimes d'exploitation indiquent que seule la mise en place d'une taille minimale de capture, i.e le lambi au pavillon en formation, et une régulation de l'effort de pêche sont envisageables. Les implications socio-économiques de la mise en oeuvre des mesures de gestion déterminées montrent que leur niveau d'applicabilité est très faible, en raison de la polyactivité des pêcheurs martiniquais, de leur faible niveau socioéconomique et surtout, du régime de libre accès à la ressource. Aussi, il est proposé la création de nouvelles structures professionnelles aux compétences larges, qui permettraient, pour chacun des bourgs, une gestion locale de l'espace marin, des usages et des ressources. OCR NON CONTRÔLE Droits : 1993 UBO http://archimer.ifremer.fr/doc/1993/these-3751.PDF http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3751/ | Partager |
![]() | Etude d'une gestion optimale des pecheries de langoustines et de poissons demersaux en mer Celtique Auteur(s) : Laurec, Alain Charuau, Anatole Perodou, Jean-bernard Nedelec, Daniel Biseau, Alain Durand, Jean-louis Rivoalen, Jean-jacques Dupouy, Herve Résumé : The general study, scheduled from 1984 to 1986, aims at providing a judgement about the fisheries in the Celtic Sea. This area has been chosen because it is frequented by EEC vessels with, for the time being, a large majority of French vessels. Activities there are easier to monitor than anywhere else as coastal fisheries are little developed in the area. The final product will consist of a certain number of hypotheses about the planning strategies that could be implemented in the Celtic Sea. The main idea is, firstly, to conduct analytical studies, stock by stock, in order then, to synthesize them into a model integrating the interactions between fleets in relation to their target species. A bio-economical model, deriving from the latter, will enable the simulation of the consequences of the current planning procedures on the management of stocks and vessels. L'étude générale, programmée de 1984 à 1986, vise à fournir un avis sur les pêcheries de Mer Celtique. Cette zone a été choisie car elle est fréquentée par les flottilles de la CEE avec cependant, pour le moment, une dominante française quasi exclusive. Les activités qui s'y exercent peuvent être cernées plus facilement que partout ailleurs car les pêcheries côtières sont très peu développées. Le produit final consistera dans la présentation d'un certain nombre d'hypothèses sur les stratégies d'aménagement adaptables à la Mer Celtique. La voie choisie consiste, dans un premier temps, dans des études analytiques, stock par stock, puis dans leur synthèse dans un modèle intégrant les interactions entre flottilles en relation en particulier avec la recherche des espèces-cibles. Un modèle bio-économique, dérivé du précédent, permettra de simuler les conséquences des procédures habituelles d'aménagement sur la gestion des stocks et des flottilles. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1985/rapport-3671.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3671/ | Partager Voir aussi monk cuckoo ray blue whiting cod hake ling common dab data bases fishing statistics French fisheries Télécharger |
![]() | Évaluation, scénarios et viabilité écologique et économique des pêcheries côtières tropicales : application au cas de la Guyane française ; Evaluation and ecological-economic scenarios of tropical coastal fisheries : the case of the french guiana Auteur(s) : Cissé, Abdoul Ahad Auteurs secondaires : Antilles-Guyane Célimène, Fred Résumé : La nécessité d'une approche intégrée des pêches est actuellement largement affirmée, notamment par la FAO, en particulier dans le contexte des pêcheries artisanales tropicales. Ces pêcheries à petites échelles, souvent multi-spécifiques sont très importantes en termes d'emploi et de production, y compris pour la sécurité alimentaire. Néanmoins ces pêcheries et la biodiversité exploitées sont souvent marquées, d'une part, par le manque de données rendant difficile leur gestion dans le cadre d'une approche écosystémique, d'autre part, par la complexité des systèmes écologiques et économiques sous-jacents incluant interactions trophiques et techniques.Cette thèse contribue à la mise au point d'outils bioéconomiques adaptés aux petites pêcheries tropicales dans la perspective d'une gestion durable des pêches fondée sur l'approche écosystémique. Dans cette perspective, la pêcherie côtière en Guyane Française constitue un cas d'étude particulièrement fécond. La thèse propose ainsi des évaluations multi-critères, des modèles bioéconomiques complexes et des scénarios de gestion viable pour cette pêcherie.Dans un premier temps l'analyse statistique multi-variée suggère un statut global satisfaisant de la pêcherie en termes de durabilité. Cependant des différences de performance sont notées au sein de la pêcherie, notamment au niveau des zones frontalières. Aussi des améliorations dans le mode de gestion sont proposées. Ensuite, à travers la modélisation bioéconomique, les projections des différents scénarios de pêche montrent qu'à long terme le niveau d'exploitation actuel peut ne pas être en adéquation avec la future augmentation de la demande locale et qu'une perte de biodiversité peut avoir lieu. Un scénario dit de « co-viabilité » conciliant des objectifs à la fois écologique, économique et social, avec une probabilité de réalisation satisfaisante, est mis en exergue. Enfin, la comparaison des comportements optimaux en situation coopératif et non coopératif, montre dans quelle mesure la viabilité est favorisée quand les acteurs coopèrent. Au-delà du diagnostic apporté pour le cas d'étude, la méthode utilisée s'avère prometteuse dans le contexte des petites pêcheries tropicales, tandis que l'approche de « co-viabilité » permet de trouver les modalités d'exploitation dans le cadre de compromis entre durabilité écologique et socio-économique, ce que les principes de gestion halieutiques traditionnels ne permettent généralement pas. The need for an integrated approach to fisheries is now widely affirmed, including the FAO, in particular in the context of tropical artisanal fisheries. These small-scale fisheries, often multispecies are very important in terms of production, employment and food security. However these fisheries and the exploited resources are often characterized by a lack of data making difficult their management within an ecosystem approach, and by the ecological and economic system complexities including trophic and technological interactions.This thesis aims to contribute to the development of bioeconomic tools for small tropical fisheries in a sustainable management perspective based on the ecosystem approach. In this perspective, the French Guiana coastal fishery constitutes an interesting case study. The thesis proposes multi-criteria evaluations, complex bioeconomic models and viable management scenarios for this fishery. At first, multivariate statistical analysis suggests a satisfactory overall status of the fishery in terms of sustainability. However, some performance differences are noted within the fishery, particularly at border areas. Also, management improvements are proposed. Then, through bioeconomic modeling, projections of different fishing scenarios show that, in the long term, the current exploitation level may not be consistent with the future increase of local demand and a loss of biodiversity may occur. A scenario called "co-viability" reconciling ecological, economic and social objectives, with a high probability of achievement is exhibited. Finally, the comparison of optimal behavior in cooperative and non-cooperative conditions, confirms that harvest levels are greater when actors do not cooperate. Furthermore, it is shown that the state of the ecosystem depends on the fishing strategies and the type of interaction between species. Beyond the diagnosis made for the case study, the method is promising in the context of small tropical fisheries, while the co-viability approach allows finding the exploitation conditions under which ecological and socio-economic sustainability are meet, what the conventional fisheries management generally do not allow. http://www.theses.fr/2013AGUY0620/document | Partager |
![]() | Taxonomie et virulence de vibrions pathogènes d'huîtres creuses Crassostrea gigas Auteur(s) : Le Roux, Frédérique Résumé : As the emergence of new vibriosis in the European Atlantic coasts has been associated with mass mortalities of molluscs cuasing important economic losses, the project obectives are to provide knowledge and operational tools to evaluate the impact of vibriosis on farmed japenese oyster Crassostrea gigas. Facing the diversity of Vibrio species associated to bivalve disease outbreaks, the difficulties of identification and the detemrination of their pathogenic abilities we propose a double approach to correlate phenotype/geneotype of a bacteria with risk of disease : 1) by genotyping we will evaluate if specific strains are associated with disease. 2) by evaluating likely virulence mechanisms implicated in pathogenesis, we will characterise the genes involved. Therefore, new diagnostic test should be used in an epizootiological study to evaluate the importance of these emerging pathogens in farmed bivalves and will be supplied for further exploitation in aquaculture.
Les vibrioses sont les infections bactériennes les plus courantes chez les espèces marines d'intérêt aquacole. Certaines espèces sont pathogènes et ont été associées à d'importantes pertes économiques pour l'industrie aquacole dans le monde. L'objectif principal de mon projet de recherche est de développer des outils diagnostiques pertinents permettant d'évaluer l'impact des vibrioses dans des élevages d'huîtres creuses Crassostrea gigas. Le problème majeur est l'extraordinaire diversité des espèces appartenant à ce genre bactérien, compliquant considérablement leur caractérisation en terme de spéciation et de virulence. Nous développons une double approche pour corréler le phénotype et le génotype de pathogènes potentiels par : 1) une clarification taxonomique des souches de vibrions nous déterminons si certaines espèces sont systématiquement associées à de maladies; 2) une caractérisation des mécanismes de virulence, nous recherchons les gènes supports de la pathogénie. Les marqueurs génétiques ou de virulence mis au point pourront alors être utilisés pour une étude épidémiologique de ces maladies. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/2004/these-3699.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3699/ | Partager Voir aussi Taxonomie Marqueur génétique Pathogène Génotype Phénotype Crassotrea gigas Huître Vibrioses Diagnostique Télécharger |
![]() | Marine crustacean farming: present status and perspectives Auteur(s) : Laubier, Annie Laubier, Lucien Éditeur(s) : EDP Sciences Résumé : For centuries, several species of prawns and crabs have been raised from wild-caught juveniles in coastal brackish-water fish ponds in various countries of south east Asia. The Indonesian "tambaks" are well known examples of such traditional practices. In western countries, since the turn of the century, advances of marine biology and fast increase of marine fisheries enabled the development of large-scale production and release of larval stages of American and European lobsters in a fruitless attempt to restock natural populations. After the Second World War, the increasing demand for crustaceans in United States and Japan was satisfied by opening new prawn fisheries all over the world. A major breakthrough was achieved with the development of hatchery technologies for the penaeid prawn Penaeus japonicus (Hudinaga, 1942 in Japan) and the caridean prawn Macrobrachium rosenbergii (Ling, 1969 in Malaysia), which occurred during the first decades of the second half of this century. Together with the increasing market demand in developed countries for sea food, this led to a considerable interest of both public agencies and private investors in marine shrimp and prawn culture. In western countries, a large number of pioneering commercial ventures, often based on assumptions not scientifically founded, failed. Nevertheless, the aquaculture production of prawns mainly based on wild-caught juveniles increased in South-East Asia and Central America during the 1980s. This overall positive trend should not hide important failures which occurred at a local scale, such as the Taiwanese crisis of 1988 due principally to environmental degradation, resulting in severe disease problems and a near collapse of the farming activity. Following the early period of hatchery technology development, the major scientific achievements were related to food requirements and formulation of compound diets for larvae, juveniles and adults and to a better knowledge of diseases caused by bacteria and several viruses which have been identified from hatcheries and intensive farming ponds. Additional new technological advances have emerged from recent research in the fields of physiology (endocrinology) and genetics. By far, the major part of the world production of marine crustaceans relies on penaeid prawns and, to a lesser extent, on Macrobrachium species. However, some other species of marine crustaceans have potential for aquaculture. The economic aspects of marine crustacean aquaculture should be considered together with those of the fishing industry: market prices are rather similar, depending on the quality of the product. The balance between market demand and production is an important constraint which, in turn, establishes the success of prawn farming. Since the early 1980s, crustacean aquaculture has increased tremendously in both Asia and America: the world production for 1991 approximated 700,000 tons, with more than 600,000 tons from penaeid prawn culture. Pendant des siècles, quelques espèces de crevettes et de crabes ont été élevées à partir d'individus juvéniles capturés dans le milieu naturel, dans des bassins à poissons d'eau saumâtre de différents pays d'Asie du Sud-Est. Les « tambaks » indonésiens sont des exemples bien connus de ces pratiques traditionnelles. Dans les pays occidentaux, depuis le début du siècle, les progrès réalisés en biologie marine et la croissance rapide des pêches maritimes ont permis le développement de la production à grande échelle de stades larvaires des homards européen et américain, dans une vaine tentative de reconstitution des stocks naturels. Après la Seconde Guerre mondiale, la demande croissante des Etats-Unis et du Japon a été satisfaite par l'ouverture de nouvelles pêcheries de crevettes dans l'océan mondial. Un progrès décisif a été réalisé avec la mise au point des techniques d'écloserie pour la crevette Pénaeidé Penaeus juponicus (Hudinaga, 1942 au Japon) et la crevette Caridé Macrobrachium rosenbergii (Ling, 1969 en Malaisie), qui sont apparues au cours des premières décennies de la seconde moitié de ce siècle. Parallèlement à la demande croissante du marché des pays développés pour les produits de la mer, ce résultat s'est traduit par un intérêt considérable porté à l'élevage des crevettes marines de la part des institutions de recherche et des investisseurs. Dans les pays occidentaux, un grand nombre de tentatives d'élevage commerciales, fondées sur des considérations non scientifiquement établies, ont échoué. Néanmoins, la production aquacole de crevettes reposant sur la capture d'animaux juvéniles dans la nature, s'est développée en Asie du Sud-Est et en Amérique Centrale au cours des années 1980. Cette tendance globalement positive ne doit pas dissimuler les faillites importantes qui se sont produites à l'échelle locale, comme la crise des élevages de Taiwan en 1988, causée principalement par une dégradation de l'environnement, entraînant l'apparition de problèmes pathologiques sévères et une disparition presque totale de l'activité d'élevage. Après la période pionnière du développement de la technologie d'écloserie, les principaux acquis scientifiques concernent les besoins alimentaires et la formulation d'aliments composés pour les larves, les jeunes et les adultes, et une meilleure connaissance des maladies bactériennes et virales qui interviennent dans les écloseries et les fermes d'élevage intensif. De nouveaux progrès techniques complémentaires ont vu le jour à la suite de recherches dans les domaines de la physiologie (endocrinologie) et de la génétique. De loin, la majeure partie de la production mondiale de Crustacés marins repose sur les crevettes Pénaeidés et, dans une moindre mesure, sur des espèces de Macrobrachium. Cependant, quelques autres espèces de Crustacés marins intéressent potentiellement l'aquaculture. Les aspects économiques de l'aquaculture de crustacés marins doivent être considérés avec ceux de l'industrie des pêches maritimes : les prix du marché sont à peu près les mêmes, et dépendent de la qualité du produit. Le rapport entre la demande du marché et la production est une contrainte importante qui à son tour, détermine les conditions du succès de l'élevage de crevettes. Depuis le début des années 1980, l'aquaculture de crustacés a augmenté considérablement en Asie et en Amérique : la production mondiale pour 1991 avoisine 700 000 tonnes, avec plus de 600 000 tonnes provenant des élevages de crevettes Pénaeidés. Aquatic Living Resources (0990-7440) (EDP Sciences), 1993-10 , Vol. 6 , N. 4 , P. 319-329 Droits : IFREMER-Gauthier-Villars, 1993 http://archimer.ifremer.fr/doc/00190/30119/28587.pdf DOI:10.1051/alr:1993033 http://archimer.ifremer.fr/doc/00190/30119/ | Partager Voir aussi Crustacés crevettes crabes homards aquaculture exploitation Penaeidae Crustaceans shrimps prawns Télécharger |
![]() | Comparaison des captures des grands poissons pelagiques en Martinique avec ou sans DCP Auteur(s) : Laurans, Martial Taquet, Marc Reynal, Lionel Lagin, Alain-sabin Éditeur(s) : Pêche thonière et dispositifs de concentration de poissons, Caribbean-Martinique, 15-19 Oct 1999 Résumé : In recent years, the use of fads in Martinique has evolved from an experimental stage to a productive one. This transformation results in the pitching up of operational device park by the regional fishery committee. Nevertheless, this technical change in fishing practices is not implemented in a homogeneous way all around the island; some differences exist especially between the Atlantic and the Caribbean coasts. From surveys carried out during an annual cycle on two main landing sites, this study describes the pelagic fishing activity around fads and in the open sea. A comparison of fishing strategies adopted in different places as well as an analysis of the results obtained by the fishing units in terms of species (size of catches and daily yields) allow to describe the progress made in the implementation adoption of this new fishing practice. For several fishermen, fishing around fads has become an exclusive job, practised all year round. For others, fads is used in addition to traditional fishing activity on flotsam, "Miquelon" fishing and keeps a seasonal character.Original Abstract: Au cours des recentes annees, l'utilisation des DCP en Martinique est passee du stade experimental au stade operationnel. Cette mutation se traduit par la prise en charge du parc de dispositifs operationnels par le comite regional des peches. Toutefois, l'adoption de cette nouvelle technique d'exploitation ne s'effectue pas de facon homogene dans toutes les communes de l'ile, des differences existent notamment entre les cotes Atlantique et Caraibe. A partir d'enquetes effectuees pendant un cycle annuel, sur deux principaux points de debarquement, cette etude decrit l'activite de peche des poissons pelagiques avec ou sans DCP. Une comparaison des strategies de peche developpees dans les differents sites ainsi qu'une analyse des resultats obtenus par les unites de peche en termes d'especes, de taille des captures, de rendement journalier permettent de decrire la progression differenciee de l'adoption de cette nouvelle activite halieutique. Pour certains pecheurs, la peche sous DCP est devenue un metier exclusif, pratique tout au long de l'annee. Pour d'autres, le DCP est utilise en complement de l'activite traditionnelle de peche sous bois derivants, " peche a Miquelon ", et conserve un caractere saisonnier. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/00042/15298/12657.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00042/15298/ | Partager |
![]() | Osmoregulation pattern and salinity tolerance of the white shrimp Litopenaeus vannamei (Boone, 1931) during post-embryonic development Auteur(s) : Chong-robles, Jennyfers Charmantier, Guy Boulo, Viviane Lizarraga-valdez, Joel Enriquez-paredes, Luis M. Giffard-mena, Ivone Éditeur(s) : Elsevier Science Bv Résumé : The euryhaline white shrimp Litopenaeus vannamei lives in both coastal and oceanic areas through ontogeny. Its osmoregulation pattern and variations in its tolerance to salinity are partially known from several studies under different experimental conditions (developmental stages, salinities and acclimation procedures). Although L. vannamei is recognized as one of the most euryhaline penaeid species, with adults and juveniles exhibiting an hyper-hypo-osmoregulatory pattern and being able to tolerate a wide salinity range, little is known on larval and early postlarval strategies to cope with salinity fluctuations. In order to establish their euryhalinity range and to fully understand the ontogenetic changes in L. vannamei osmoregulatory pattern, we evaluated the effect of six salinities (5, 10, 20, 32, 45 and 60 psu) on 17 developmental stages by directly exposing them to experimental salinities and conducting observations during the next 48 hours. At 5 hours post osmotic shock (hps), all developmental stages survived (> 20%) in 20, 32 and 45 psu. The euryhalinity and osmoregulation pattern changed at some developmental stages of L. vannamei. The hyper-hypo osmoregulatory pattern exhibited by Juvenile and Adult appears to be established early in the first post-larval stage PL1 (ontogenetic osmoregulation pattern type 3), with higher tolerance to salinity variations observed in PL2, PL4 and PL22 suggesting that L. vannamei shows a progressive increase in the efficiency of osmoregulatory mechanism following last metamorphosis. Aquaculture (0044-8486) (Elsevier Science Bv), 2014-02 , Vol. 422 , P. 261-267 Droits : 2013 Elsevier B.V. All rights reserved. http://archimer.ifremer.fr/doc/00169/28068/26283.pdf DOI:10.1016/j.aquaculture.2013.11.034 http://archimer.ifremer.fr/doc/00169/28068/ | Partager |
![]() | Re-assessing the French small-scale coastal fisheries: from fleet activity to economic performance Auteur(s) : Daures, Fabienne Van Iseghem, Sylvie Demaneche, Sebastien Leblond, Emilie Brigaudeau, Cecile Guyader, Olivier Berthou, Patrick Éditeur(s) : ICES 2008 Annual Science Conference, 22-26 september 2008, HALIFAX, CANADA Résumé : While the majority of small-scale coastal fisheries are found in developing nations, a considerable number exist in developed nations as well. Indeed, small-scale fisheries are strongly represented in all European Union (EU) Member States, 81% and 87% of the EU 25 whole fleet is composed of vessels less than 12 and 15 meters long respectively. In 2000, European regulation established a fisheries data collection framework including economic information requirements in order to provide the scientific basis for the implementation of the Common Fisheries Policy. This paper presents the methodology designed to collect the relevant economic data and characterize the status of the French fleets from an economic perspective. Based on stratified sampling plan including the following of small-scale fleets, data collection by field survey is based on a single questionnaire for all the fleets, whatever the size of the vessel, the gear used, the fishing area or the species targeted. It provides a large data set including earnings and costs but also capital, employment, fishing activity figures. Statistical analysis through a revenue model gives the basis for a re-assessing of the small-scale fisheries contribution to national production. Economic indicators such as gross added value, revenues, and direct employment are derived from the data set. The significant role of small scale fisheries in the French fishing sector is established and the impact of the rising fuel costs in fisheries is discussed. Droits : 2008 ICES http://archimer.ifremer.fr/doc/00059/16998/14500.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00059/16998/ | Partager Voir aussi Data collection sampling schemes economic data indicator revenue model small-scale fisheries Télécharger |
![]() | Complexity in trophic structure and stability in a modelled West African estuary Auteur(s) : Villanueva, Ching-maria Diouf, P.s. Albaret, J.-j. Moreau, J. Éditeur(s) : J.-J. SYMOENS Résumé : Un modèle Ecopath de l'estuaire du Sine-Saloum (Sénégal) comportant au total 37 groupes fonctionnels a été appliqué dans la présente étude en vue de déterminer les faits essentiels de ce système aquatique. La grande biodiversité spécifique des poissons de l'écosystème peut y jouer un rôle en assurant son intégrité, spécialement en présence de facteurs de stress, bien qu'il ait été observé que ce n'est pas entièrement le cas. Les résultats montrent qu'un autre facteur de mitigation est le niveau des forces d'interaction entre les groupes fonctionnels. La stabilité est accrue par des relations plus faibles et des pyramides plus courtes et plus larges. Bien que différentes questions se posent concernant les facteurs conduisant à la stabilité d'un système, les méthodes et les façons de les approcher devraient envisager d'en situer les résultats dans le contexte d'une théorie écologique plus large. An Ecopath model of the Sine Saloum estuary (Senegal) with a total of 37 functional groups is used in this study to determine the key features of this aquatic system. The high fish species biodiversity in the ecosystem may play a role of ensuring its integrity, especially in the presence of stress, though it was observed that this is not entirely the case. Results show that another mitigating factor is the level of interaction strengths between functional groups. Stability is improved by weaker connectance as well as shorter and fatter pyramids. Though differing issues arise with respect to questions driving a system's stability, methods and approaches should consider placing results in the context of a broader ecological theory. Coastal Ecosystems of West-Africa Biological Diversity-Resources-Conservation (J.-J. SYMOENS), 2005 , P. 15-26 Droits : J.-J. SYMOENS http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/publication-2554.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2554/ | Partager Voir aussi Stabilité des systèmes Sénégal Omnivorie Estuaire Ecosystème côtier Ecopath Biodiversité Afrique de l'Ouest West Africa System Stability Télécharger |
![]() | The concept of population in clonal organisms: mosaics of temporally colonized patches are forming highly diverse meadows of Zostera marina in Brittany Auteur(s) : Becheler, Ronan Diekmann, O. Hily, Christian Moalic, Yann Arnaud-haond, Sophie Éditeur(s) : Wiley-blackwell Publishing, Inc Résumé : Seagrasses structure some of the world's key coastal ecosystems presently in decline due to human activities and global change. The ability to cope with environmental changes and the possibilities for shifts in distribution range depend largely on their evolvability and dispersal potential. As large-scale data usually show strong genetic structure for seagrasses, finer-grained work is needed to understand the local processes of dispersal, recruitment and colonization that could explain the apparent lack of exchange across large distances. We aimed to assess the fine-grained genetic structure of one of the most important and widely distributed seagrasses, Zostera marina, from seven meadows in Brittany, France. Both classic population genetics and network analysis confirmed a pattern of spatial segregation of polymorphism at both regional and local scales. One location exhibiting exclusively the variety 'angustifolia' did not appear more differentiated than the others, but instead showed a central position in the network analysis, confirming the status of this variety as an ecotype. This phenotypic diversity and the high allelic richness at nine microsatellites (2.33-9.67 alleles/locus) compared to levels previously reported across the distribution range, points to Brittany as a centre of diversity for Z. marina at both genetic and phenotypic levels. Despite dispersal potential of several 100 m, a significant pattern of genetic differentiation, even at fine-grained scale, revealed 'genetic patchiness'. Meadows seem to be composed of a mosaic of clones with distinct origins in space and time, a result that calls into question the accuracy of the concept of populations for such partially clonal species. Molecular Ecology (0962-1083) (Wiley-blackwell Publishing, Inc), 2010-06 , Vol. 19 , N. 12 , P. 2394-2407 Droits : 2010 Blackwell Publishing Ltd http://archimer.ifremer.fr/doc/00006/11690/8499.pdf DOI:10.1111/j.1365-294X.2010.04649.x http://archimer.ifremer.fr/doc/00006/11690/ | Partager |
![]() | Campagne de prospection de poissons démersaux profonds réalisée autour de La Réunion en 2011 Auteur(s) : Fleury, Pierre-gildas Evano, Hugues Le Ru, Loic Résumé : Since 2000, the exploitation of the deep demersal fish (200-700 m) with the use of electric winches has been increasing in Reunion island ; and this has needed a new appraisal of yields (CPUE) and individual fish sizes, as indicators of the state of the fish stocks. A first survey has been carried out at the first half of 2011, in order to set up the comparison with a previous survey in 2000 on the West coast of Reunion island. Drops of yields and sizes could be pointed out, attesting the overexploitation of the commercial species (Fleury et al 2011). This present report displays the results of a second campaign, carried out in the second half of 2011 all around the island. 32 fishing trips have been conducted which have permitted 251 fishing operations. The overexploitation (i.e. decreasing of yields and fish sizes) has been confirmed in the West of the island, and in a lower stage in the North. Yields are better in the East and the South. As much as in the first survey, the small non commercial sharks (Squalus megalops) could be countered for half of the catches. At the same time, 2 hook sizes have been tested and the small hooks have displayed a better efficiency in number of catches but not in global weight. Various types of bait have been tested and meat of small local pelagic fish (Selar crumenophtalmus and Decapterus macarellus) have appeared to be the most efficient. This report provides helpful indicators for the management of fish stocks which have been poorly surveyed and poorly regulated till now. Depuis 2000, la pêche aux poissons démersaux profonds (200-700 m) à l'aide de virelignes électriques s'est développée à La Réunion ; et le besoin se faisait sentir d'une évaluation des rendements (CPUE) et des tailles individuelles de capture, indicateurs halieutiques classiques des états de stocks. Une première campagne a été réalisée au 1er semestre 2011 pour établir la comparaison avec une campagne de prospection réalisée en 2000 dans l'ouest de La Réunion. Elle a mis en évidence des baisses marquées des rendements et des tailles de capture, signes d’une surexploitation des espèces commerciales (Fleury et al 2011). Ce rapport présente les résultats d'une 2e campagne de prospection étendue à tout le tour de l'île. 32 marées ont été réalisées permettant la mise à l'eau de 251 filages. La surpêche (baisse des rendements et des tailles de poisson) est confirmée dans l'ouest et à un moindre degré sur la côte nord. Les rendements sont meilleurs dans l'est et le sud. Comme dans la première campagne, les requins zépines (Squalus megalops), non commercialisés à La Réunion, représentent la moitié des captures. Parallèlement, 2 tailles d'hameçons ont été comparées et les petits hameçons ont donné une augmentation du nombre de captures, mais pas du poids global. Des comparaisons ont aussi porté sur les types d'appât et les laizes de petits pélagiques locaux (pêche-cavale et bancloche) se sont révèlées les plus efficaces. Ce rapport fournit des indicateurs utiles à la gestion de stocks jusqu'ici peu suivis, et peu encadrés. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/00089/20048/18049.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00089/20048/ | Partager Voir aussi Petite pêche côtière Poissons démersaux profonds moulinet électrique La Réunion océan Indien Télécharger |
![]() | Prionospio salzi sp.nov., un spionidien (annelide polychète) des côtes méditerranéennes d'Israël Auteur(s) : Laubier, Lucien Éditeur(s) : Israel Science Journals Résumé : This work is based upon a collection of Annelida Polychaeta assembled from the Mediterranean Coast of Israel during an ecological experiment on fouling. The present paper describes a new species of spionid, Prionospio salzi sp.nov. Some morphological and biological peculiarities lead to the conclusion that all specimens of P.salzi are old larvae. The systematic position of this species within the large genus Prionospio is considered. [NOT CONTROLLED OCR] Israel Journal of Zoology (Israel Science Journals), 1970 , Vol. 19 , N. 4 , P. 183-190 Droits : Israel Science Journals http://archimer.ifremer.fr/doc/1970/publication-4879.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4879/ | Partager |