Éditeur(s) : Pêche thonière et dispositifs de concentration de poissons, Caribbean-Martinique, 15-19 Oct 1999 15-19 octobre 1999
Résumé : Payao is a traditional concept, which has been successfully commercialized to increase the landings of several species valuable to the country's export and local industries. It has become one of the most important developments in pelagic fishing that significantly contributed to increased tuna production and expansion of purse seine and other fishing gears. The introduction of the payao in tuna fishing in 1975 triggered the rapid development of the tuna and small pelagic fishery. With limited management schemes and strategies, however, unstable tuna and tuna-like species production was experienced in the 1980s and 1990s. In this paper, the evolution and development of the payao with emphasis on the technological aspect are reviewed. The present practices and techniques of payao in various parts of the country, including its structure, ownership, distribution, and fishing operations are discussed. Monitoring results of purse seine/ringnet operations including handline using payao in Celebes Sea and Western Luzon are presented to compare fishing styles and techniques, payao designs and species caught. The fishing gears in various regions of the country for harvesting payao are enumerated and discussed. The inshore and offshore payaos in terms of sea depth, location, designs, fishing methods and catch composition are also compared. Fishing companies and fisherfolk associations involved in payao operation are presented to determine extent of utilization and involvement in the municipal and commercial sectors of the fishing industry. The issues and problems concerning the use of payao, and its biological, economic impact as well as management aspect are presented. Recommendations are given for future research and actions.

Droits : Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00042/15284/12670.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00042/15284/

Éditeur(s) : Remote Sensing and Geographic Information Systems for the Pacific: Report of the Working Group Meeting on Regional Co-operation in Applications of Remote Sensing and Geographic Information Systems Technology for the Pacific, 18-22 March 1991, Suva, Fiji. ST/ESCAP/998.
Résumé : Once the specific geographical context of French Polynesia and its needs about the use of results od Remote Sensing and Geographic Information have been presented and situated, the strategy used and developped both by the territory of French Polynesia and Ifremer in partnership is introduced. It comprises four parts and tries, by involving directly the end users, to make known the use of data of the high technology tools represneted bu Space Remote Sensing and Geographic Information Systems. Several types of the products are proposed and regional extrapolation plans are offered consequently.
Après avoir présenté et situé le contexte géographique spécifique à la Polynésie française et ses besoins en résultats de la télédétection et de l'information géographique, on présente la stratégie mise en place en partenariat entre le Territoire de Polynésie Française et Ifremer. Celle-ci comprend quatre axes et cherche, en impliquant directement les utilisateurs finaux, à faire mieux connaître l'utilisation des données des outils de haute technologie que sont la télédétection spatiale et les Systèmes d'Information Géographiques. Plusieurs types de produits dérivés sont présentés et des plans d'extrapolation régionale sont offerts en conséquence.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00143/25437/23590.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00143/25437/

Résumé : Les espaces naturels protégés sont aujourd’hui à l‘échelle mondiale l’une des principales politiques publiques mises en œuvre pour faire face à la destruction des écosystèmes. Leur nombre a beaucoup augmenté ces dernières années et les modes d’action qu’ils recouvrent se sont considérablement diversifiés. Pour autant, les écosystèmes continuent à se dégrader, et l’efficacité de ces dispositifs est souvent remise en cause. Cette thèse vise à analyser les facteurs influant sur l’efficacité des espaces protégés pour la conservation d’écosystèmes amazoniens encore peu dégradés. Elle étudie pour cela la mise en œuvre de dispositifs relevant de doctrines de gestion de l’environnement différentes, basées sur (i) la limitation réglementaire maximale des activités humaines impactantes pour les écosystèmes, (ii) la gestion des ressources par des populations locales ou traditionnelles ou (iii) la mise en place d’une gestion forestière durable sur des terres publiques. Nous nous plaçons dans une posture comparative entre la Guyane (France) et l’Amapá (Brésil), territoires partageant une frontière commune, principalement matérialisée par le fleuve Oyapock. La comparaison internationale entre ces deux régions présentant une couverture exceptionnelle en espaces protégés, dans des conditions écologiques et géographiques relativement similaires, nous permet d’observer l’influence du contexte historique et sociopolitique sur les modes de prise en charge de la gestion de l’environnement par les aires protégées. Nous nous sommes basés sur une approche constructiviste, appuyée sur une production de données principalement qualitatives (entretiens semi-directifs, analyse de documents, observation participante…). Nous avons ainsi procédé à une déconstruction critique des dispositifs « aires protégées », permettant de mettre en lisibilité les enjeux environnementaux qu’ils portent, et d’analyser l’efficacité environnementale des stratégies mises en œuvre. Cette analyse s’est articulée autour d’une lecture à la fois diachronique et multiscalaire des processus de gestion.Nous montrons que la mise en place des espaces protégés de Guyane et d’Amapá a été portée par des coalitions d’acteurs structurées autour de doctrines de gestion, c’est à dire de conceptions partagées des conditions de mise en œuvre d’une « bonne gestion environnementale ». Les dispositifs créés ont hérité des ressources stratégiques d’action et de la légitimité de ces coalitions. Les coalitions porteuses de la création des espaces protégés en Amapá sont fortement articulées aux mouvements sociaux et environnementaux plus généraux de l’Amazonie brésilienne, notamment pour les revendications socio-environnementales émergeant à la sortie de la période dictatoriale. En Guyane française, les espaces naturels protégés sont principalement la résultante de compromis entre d’une part une volonté d’exemplarité de l’action de la France en Amazonie, et d’autre part une recherche de minimisation des conflits avec les acteurs politiques locaux.
Nowadays, natural protected areas are one of the main public policies implemented at the international level in order to prevent the destruction of ecosystems. During the last decades, they became very numerous, and mobilized more and more diversified modes of action. However, natural ecosystems continue to deteriorate, and the effectiveness of protected areas is often questioned. The aim of this thesis was to analyse the factors influencing the effectiveness of protected areas in a context of Amazonian ecosystems that are still well preserved. We observed the implementation of environmental management arrangement (protected areas) that are based on various doctrines: (i) the strong limitation of all harmful human activities through legislation; (ii) the management of resources by local or traditional populations; and (iii) the implementation of sustainable forest management on public lands. We adopted a comparative approach between Guyana (France) and Amapá (Brazil), territories that share a common border, mainly identifiable by the Oyapock River. These two territories present quite similar ecological and geographical conditions, and both have an exceptional coverage of protected areas. Therefore this international comparison allowed us to observe the influence of the historical and socio-political context on the implementation of protected areas. We used a constructivist approach, mainly based on qualitative data (semi-structured interviews, document analysis, participant observation...). We effected a critical deconstruction of "protected areas" management arrangements in order to make their environmental objectives intelligible, and we analysed the environmental effectiveness of the strategies implemented. This analysis was based on a diachronic and multiscalar lecture of management processes. We show that the establishment of protected areas in Guiana and Amapá was led by coalitions of actors structured around management doctrines, i.e. shared conceptions of "good environmental management". Management arrangements created inherited the strategic resources of action and the legitimacy of these coalitions. In Amapá, coalitions were strongly articulated with wider social and environmental movements of the Brazilian Amazon, especially in the case of socio-environmental claims rising at the end of the dictatorship. In French Guiana, the natural protected areas are mainly the result of compromise between the French willingness to serve as an example in the Amazon region, and the minimisation of conflicts with local politicians.

http://www.theses.fr/2014AGUY0744/document

Éditeur(s) : HAL CCSD Public Library of Science
Résumé : International audience
Pre-association of CD95 at the plasma membrane is mandatory for efficient death receptor signaling. This homotrimerization occurs through self-association of an extracellular domain called the pre-ligand assembly domain (PLAD). Using novel molecular and cellular tools, we confirmed that CD95-PLAD is necessary to promote CD95 multimerization and plays a pivotal role in the transmission of apoptotic signals. However, while a human CD95 mutant deleted of the previously described PLAD domain (amino acids 1 to 66) fails to interact with its wild-type counterpart and trigger autonomous cell death, deletion of amino acids 1 to 42 does not prevent homo- or hetero (human/mouse)-oligomerization of CD95, and thus does not alter transmission of the apoptotic signal. Overall, these findings indicate that the region between amino acids 43 to 66 corresponds to the minimal motif involved in CD95 homotypic interaction and is necessary to convey an efficient apoptotic signal. Interfering with this PLAD may represent a new therapeutic strategy for altering CD95-induced apoptotic and non-apoptotic signals.
ISSN: 1932-6203

hal-00873708
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00873708
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00873708/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00873708/file/Precise_Mappingsur the_CD95-accepted.pdf
DOI : 10.1371/journal.pone.0046236

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : En développant, à partir de 1984, un Centre touristique Intégralement Planifié dans une localité de la côte Pacifique de l’état d’Oaxaca, l’État mexicain entendait impulser un développement économique dans une région périphérique et pauvre du pays. Basé sur l’expropriation d’une portion du territoire communal, le processus engendre un certain nombre de résistances au sein des communautés locales. Le centre touristique est aujourd’hui un espace fragmenté, reflet et conséquence des inégalités sociales et des conflits sociaux. Depuis une perspective de géographie sociale, cet article cherche à mettre en lumière les conflits et compromis sociaux qui traversent la société locale. L’appropriation de l’espace, les luttes de pouvoir et les stratégies développées par les différents acteurs seront les entrées privilégiées pour interroger un modèle de planification, « par le haut », ignorant trop souvent les réalités sociales à l’échelle locale.
Since 1984, the Mexican government has tried to stimulate the economy in a poor and peripheral area of the country. They aimed to do so by developing an Integrally Planed Resort (CIP, in Spanish) in a community, located in the Oaxaca state on the Pacific coast. Being based on the expropriation of some parts of the communal territory, this process created some remittances among the local communities. Today, this resort is still a fragmented space and reflects social inequalities and social conflicts. From a social geographical perspective, this article aims to show the social conflicts and social compromises among the local society. Space appropriation, power battles and strategies developed by the different actors, will be the main tools to investigate this planning model. In this model, the government too often has ignored social realities on the local scale.
Al crear, a partir de 1984, un Centro turístico Integralmente Planeado en un poblado de la costa del estado de Oaxaca, el gobierno mexicano pretendió impulsar el desarrollo económico de una región periférica y marginada del país. Basado en la expropiación de una parte del territorio municipal, dicho proceso genera resistencias entre las comunidades locales. Hoy en día, el centro turístico es un espacio fragmentado, reflejo y consecuencia de las desigualdades sociales y conflictos. Desde una perspectiva de geografía social, el presente artículo buscará destacar los conflictos y compromisos sociales que atraviesan la sociedad local. La apropiación del espacio, las luchas de poder y las estrategias desarrolladas por los diferentes actores serán los enfoques privilegiados para cuestionar un modelo de planeación “vertical”, que suele ignorar las realidades sociales a nivel local.
Mexique

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.4069
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/4069

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : Cet article pose la problématique des processus de développement touristique au niveau de la Petite-Côte sénégalaise et leurs conséquences sur l’environnement socioculturel et économique des populations locales. Nous avons observé une occupation anarchique des milieux côtiers, très convoités pour leurs intérêts touristiques et économiques, alors qu’ils constituent des écosystèmes fragiles, sensibles à l’action des agents anthropiques. C’est ainsi que nous avons d’abord fait un état des lieux pour voir les enjeux au niveau de la planification et de l’aménagement touristique de la Petite-Côte. Nous avons analysé ensuite les conséquences en vue de proposer des stratégies pour un développement durable en prenant en compte les particularités du territoire au niveau local, régional et national dans un contexte mondialisé. En outre, il s’agit dans cette contribution de décrire et de décrypter le rapport certes étroit, mais extrêmement nourricier entre tourisme et développement local en analysant comment le tourisme impacte-t-il le processus de développement et vice-versa.
This article puts the problem of the processes of tourist development at the level of the Senegalese Little-coast and their consequences on the sociocultural and economic background of the local populations. We observed an anarchy occupation of coastal environments, very desired for their tourist and economic interests, while they constitute fragile ecosystems, sensitive to the action of the anthropological agents. This is the way we made at first a current situation to see the stakes at the level of the planning and of the tourist development of the Little-coast. We analyzed then the consequences to propose strategies for a sustainable development by taking into account the peculiarities of the territory at the local, regional and national level in a globalized context. Besides, it is a question in this article of describing and deciphering the relationship, certainly, narrow but extremely feeder between tourism and local development by analyzing how the tourism impacts on the process of development and vice versa.
Petite-Côte
Sénégal

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.6736
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/6736

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : Explorer les questions portant sur la relation entre identitaire et développement dans le contexte post-colonial, c’est aussi mettre en relief les stratégies identitaires des petits États dans la zone américano-caraïbe. Dans l’île de la Dominique, les personnalités des secteurs politique, économique, culturel et éducatif interrogées en 2004 sur cette problématique, font émerger, à travers leurs discours, une conception du progrès fondée sur la cohérence entre identitaire et développement. Eclaircir le rôle de la diaspora dans le projet culturel et économique de la jeune nation dominiquaise (1978), c’est se demander en quoi les returnees peuvent contribuer à l’évolution des représentations idéologiques du progrès dans les anciennes colonies en quête légitime d’un bien-être. L’article souligne cette préoccupation du troisième millénaire à laquelle est confrontée l’humanité : comment mettre au service de l’épanouissement des hommes et des femmes les avancées de la science et de la technologie afin d’assurer avant tout leur mieux-être.
To explore the relations between identity and development in a post-colonial context, also means to put into perspective small states identity strategies in the Caribbean region. In the Commonwealth of Dominica, personalities from the political, economical, cultural and educational sectors interviewed in 2004 on this issue, proposed through their views, an idea of progress based on the coherence between identity and development. To shed light on the role of the diaspora in the cultural and economic project of the young Dominican nation (1978), is to ask how returnees can contribute to the evolution of ideological representations of progress in former colonies which are legitimately seeking welfare. The article focuses on that concern of the third millennium which humankind has to face: how can science and technological advancement be used for the development of men and women in order to first and foremost secure their welfare?
Dominique
Caraïbes

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.4654
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/4654

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : La prolifération récente des résidences secondaires, observée récemment sur la côte Pacifique Sud du Nicaragua, s’inscrit dans une perspective de développement ayant trait à l’hébergement touristique. Or, le caractère immobilier prédominant de ce type d’hébergement, ainsi que les modes de consommation de ces résidents temporaires nous mettent en garde quant aux risques socioéconomiques et environnementaux encourus par les communautés autochtones. Parmi ces risques, notons les problèmes découlant de l’amplitude des variations saisonnières, de privatisation et de destruction des espaces naturels, ainsi que les perspectives de pérennisation des retombées économiques à moyen et long terme. Les auteurs de cet article remettent donc en question les prouesses attribuées à ce secteur d’activité et invitent à considérer des alternatives de développement durable du tourisme plus respectueuses des territoires d’accueil.
In recent years, there has been a proliferation of second home developments on attractive coastal regions of Central and South America. Based on the assumed benefits of second home tourism to regional economies, public authorities - accompanied by private investors – have capitalised on this sector as part of their tourism development strategies. This paper first examines the nature of recent second home tourism developments and then presents the socio-economic and environmental impacts of this phenomenon as experienced by local communities on the South Pacific Coast of Nicaragua. The main impacts include conflicts with local and indigenous communities over land use and ownership, seasonal and low-income employment generation, an increased burden on municipal budget to provide public infrastructure, and environmental degradation. It is argued that the second home tourism sector, strongly driven by private real estate investors, fails to generate tourism activities which are expected to sustain community development. Furthermore, this study indicates that municipalities concentrating on the second home tourism segment may deprive themselves of access to resources for more sustainable forms of tourism activities.
Amérique centrale
Nicaragua

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.3869
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/3869

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : Cet article se réfère à ce que certains auteurs nomment, au Brésil, «nouveaux territoires» qui, depuis les débats lors de la Constituante fédérale de 1988, ont pris place, totalement ou partiellement, dans les circonscriptions tels qu’un État, une Commune, un District. Ce texte aborde deux types de réserves de conservation environnementale: une « réserve extractiviste » conquise par des populations rurales riveraines au confluent des fleuves Xingu et Amazone; et une « réserve marine» de populations rurales côtières – les deux à l’État du Pará. Au Brésil comme en Europe, ces initiatives ont visé un meilleur mode de vie et le développement des populations locales et, éventuellement, par surplus, régionales ou nationales. Au Brésil, ces objectifs ont été liés au droit à l’usage collectif des forêts, des bois, des cours d’eau et des mangroves. À des degrés différents, ces territoires sont issus de luttes pour la défense des ressources qui étaient la source de la subsistance de leurs habitants, de leur mode de vie et culture, en un mot, leur patrimoine – contre la pénétration d’« étrangers » venus d’ailleurs en dépit de la loi et de la légitimité: entreprises du bois, de grands élevages et de pêche. Ce texte cherche à confronter, au niveau de l’analyse sociologique, des intérêts de groupes, des acteurs, des stratégies des uns et des autres et de leurs perspectives pour les actuelles et futures générations.
This article refers to what some writers call, in Brazil, "new territories". Since the debates during the Federal Constitution elaboration, in 1988, they have been implemented, wholly or partly, within the jurisdiction of a state, a municipality, or a district. This paper addresses two types of environmental conservation reserves: an "extractive reserve" conquered by rural people at the confluence of the rivers Xingu and Amazon; and a "marine reserve" of rural populations on the northern coast of Brazil - both in the federal state of Pará. In Brazil as in Europe, these initiatives aim at better living standards and collective development of local populations. In Brazil, these have been linked to the respect of their collective rights to use the forests, wood, water streams and mangroves. To varying degrees, these territories result from struggles in defense of natural resources that were source of livelihood, lifestyle and culture of the inhabitants, in short, their heritage – against the invasion of "foreigners", timber companies, large farms and fishers. This text contrasts, through sociological analysis, the interest groups, the stakeholders, the challenges and their development prospects vis-à-vis the present and future generations.
Brésil

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.8854
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/8854

Éditeur(s) : HAL CCSD Oxford University Press (OUP)
Résumé : International audience
Ocean loading effects cause 3-D displacements large enough to affect space geodesy measurements either at the subdiurnal periods or at longer time scales by the means of spurious signals. GPS measurements, in turn, could provide local improvements of the models in coastal areas if their ability to precisely monitor such rapid displacements is assessed. In this paper, we use 105 days of continuous GPS measurements collected in 2004 in the French Brittany and Cotentin region to investigate: (1) the precision achieved by the GPS analysis on measuring 3-D subdiurnal displacements and amplitude and phase of the tidal constituents, (2) the quality of the most recent ocean tide model FES2004 in such a complex coastal context. Indeed, in this area, tide amplitudes are among the largest in the world (up to 16 cm of loading displacements on the vertical component) and are believed to show strong shallow-water tides. From a state of the art GPS analysis using the scientific GAMIT software over 2-h sessions, we test two independent strategies for the realization of the reference frame. The position time series are then compared with the displacements predicted by the FES2004 model applied on an elastic Earth model. The two sets of results are consistent with each other at the same level of agreement than with the predicted displacements, namely 3–5 mm on the horizontal components, 10 mm on the vertical. This assesses the capability of this technique for measuring 3-D ocean tide loading deformation. We validate the FES2004 model in the Brittany area, even though it slightly (2–7 mm) underestimates the three components amplitudes. With a harmonic analysis of the observed position time series, we obtain nevertheless an agreement at a submillimetre level for the M2, N2, O1, Q1 tidal constituents and at a millimetre level for the K1 and S2 tidal constituents. Moreover, we can extract a significant M4 load signal at the 95 per cent confidence level from the GPS time series at the stations located in the Mont St Michel area. The detection of other shallow-water constituents would be helpful to understand the amplitude deficit between the FES2004 predicted and GPS observed displacements.
ISSN: 0956-540X

insu-00335909
https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-00335909
https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-00335909/document
https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-00335909/file/Vergnolle_GJI_08_revised.pdf
DOI : 10.1111/j.1365-246X.2008.03734.x

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
The western margin of the Gulf of Mexico (Veracruz State, Mexico) displays an extensive Neogene gravitational system, whereby the Neogene siliciclastic sediments are detached from underlying Mesozoic carbonates along decollement surface in Oligocene underpressured clays. Rapidly subsiding half-grabens develop above the footwall associated with major listric faults, whereas mini-basins develop in the deepest parts of the slope, in conjunction with the growth of west-verging compressional features. Between the high-angle normal faults in the west and the thrust anticlines in the east, a wide roll-over structure has grown progressively, resulting in a major topographic break in the morphology of the slope profile. Coupled forward kinematic modelling (Thrustpack) and stratigraphic modelling (Dionisos), calibrated against seismic profiles and two key nearshore wells, have been applied to representative regional transects across the margin, in order to quantify the vertical (subsidence) and horizontal (gravitational) deformations, and to discuss the impact of various key parameters on the distribution of debris flow depositions. These simulations are compared with data from distant ODP wells and discussed in the scope of current exploration strategies in both the US and Mexican portions of the Gulf of Mexico basin.
ISSN: 0040-1951

hal-00424595
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00424595
DOI : 10.1016/j.tecto.2008.06.017

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley
Résumé : International audience
Facts -The capacity to exercise is markedly reduced in hot environments. -High humidity imposes further physiological strain on the body. -The combination of exercise and hot environments increases the risk of heat illness and heatstroke. Recommendations for players -Fluid intake should be sufficient to restrict body mass loss to o2% of the pre-exercise mass. -A minimum of 1-2 weeks of acclimatization should be undertaken before playing in a hot environment. Recommendations for organizers -Perform pre-participation screenings before competing in the heat. -Watch at-risk individual (e.g. sickle cell trait, vascular disease) and observe signs and symptoms if WBGT > 28°C. -Add additional fluid breaks and foresee medical coverage if WBGT > 30°C. -Reconsider event if WBGT > 32°C. Future research should investigate -The optimal cooling strategies prior and during sporting activities, i.e., halftime in football games. -The influence of acclimatization on football performance. -The impact of heat on decision making in players and match officials. -The impact of heat on spectators from cooler regions.
ISSN: 0905-7188

hal-00706256
https://hal.univ-antilles.fr/hal-00706256

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer
Résumé : International audience
We isolated and characterized 16 polymorphic microsatellite loci for Lytocarpia brevirostris (Aglaophe- niidae), a hydrozoan common in the tropical Indo-Pacific region. Four to 34 alleles per locus were detected at the Indo-Pacific scale. At the population level, observed (Ho) and expected (He) heterozygosities ranged across 0.100–0.625 and 0.097–0.597, respectively. Three markers showed significant deviation from Hardy–Weinberg equi- librium, all of them presenting null alleles. Linkage dis- equilibrium was detected in three pairs of loci among 120. These primers provide powerful tools for studying popu- lation genetic diversity and the implication of life cycle strategies on population differentiation in tropical hydro- zoans. This will be valuable for the conservation of coral reefs biodiversity and the design of marine protected areas.
ISSN: 1877-7252

hal-01185722
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01185722
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01185722/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01185722/file/Postaire%20et%20al.%20-%202015%20-%20Isolation%20and%20characterisation%20of%2016%20microsatellit_hal.pdf
DOI : 10.1007/s12686-014-0407-1

Résumé : Ce travail de thèse intitulé «Evaluation de marqueurs génétiques du complexe Mycobacterium tuberculosis combinée à l'utilisation d'outils bioinformatiques: apport en épidémiologie et phylogénie de la tuberculose» a consisté en la sélection et l'évaluation de marqueurs minisatellites dans le cadre d'études épidémiologiques et phylogénétiques du bacille tuberculeux, Une première partie a ainsi porté sur l'épidémie de tuberculose en Guadeloupe, Martinique, et Guyane française ainsi que dans un pays continental à faible incidence de tuberculose, la Suède, Les résultats montrent les disparités existant entre les populations de patients tuberculeux des 3 départements français d'Amérique (DFA) ainsi que les similitudes génotypiques existant entre les bacilles tuberculeux. Par ailleurs le rôle majeur joué par les cas d'importation dans l'épidémie de tuberculose a été montré aussi bien dans les DFA qu'en Suède. Nous nous sommes ensuite intéressés à une utilisation optimale des minisatellites pour une meilleure discrimination de la famille génotypique émergeante « Beijing» circulant au Japon (Osaka, Kobe et Okinawa), ainsi qu'en Russie. Nous avons constaté le faible pouvoir discriminant du format classique 12-locus MIRU (Mycobacterial lnterspersed Repetitive Units) et proposons plusieurs nouvelles stratégies de typage basées plusieurs marqueurs minisatellites incluant certains locus hypervariables. Enfin, dans un troisième volet, nous avons étudié la diversité génétique des bacilles tuberculeux circulant actuellement dans la Caraïbe. laquelle semble refléter le passé historique très particulier de cette zone géographique au croisement d'une multitude de peuplements.
This thesis entitled "Evaluation of genetic markers of Mycobacterium tuberculosis combined with the use of bioinformatics tools: input for epidemiology and phylogeny of tuberculosis" deals with the selection and evaluation of minisatellite markers in the context of epidemiological and phylogenetic studies of the tubercle bacillus M. tuberculosis. The first part of the present work has focused on the epidemic of tuberculosis in Guadeloupe, Martinique and French Guiana as well as in a low incidence continental country, i.e Sweden. The results show differences between populations of TB patients in the three French Departments of America and similarities between the genotypes of the circulating tubercle bacilli Moreover, results highlight the important role played by imported cases for TB epidemic the three French departments of America and Sweden. ln a second part, minisatellite markers have been evaluated for a better discrimination of strains of the emerging genotype "Beijing" circulating in Japan (Osaka, Kobe and Okinawa), and Russia. A low discriminatory power of classical format 12-locus MIRU (Mycobacterial lnterspersed Repetitive Units) was observed and new combinations of minisatellites have also been proposed including hypervariable locus. Finally, the genetic diversity of tubercle bacilli circulating in the Caribbean was investigated which currently seem to reflect historical past of this very special region at the intersection of a multitude of cultures and peoples.

http://www.theses.fr/2011AGUY0427/document