Éditeur(s) : Elsevier
Résumé : This paper examines the fishing of blackfin tuna (Thunnus atlanticus) around Fish Aggregating Devices (FADs) in Martinique (French West Indies). It is based on the compared analysis of catches from monthly experimental fishing surveys and sampling of commercial landings. The data collected in these two different ways allowed comparison of blackfin tuna length frequencies. A large part of the commercial landings were made up of young immature tuna with a fork length of less than 40 cm, whereas the experimental longline catches were mainly made up of fish with a fork length ranging between 55 and 75 cm. We give evidence that these discrepancies were mostly due to the fishing technique used. Indeed, contrarily to the experimental surveys, Martinican fishermen only fish during daytime and usually on the surface by trolling. This way, fishermen do not have access to the largest fish, which are found deeper. Out results suggested that a new fishing technique such as vertical longlining, could improve commercial catches of big blackfin tuna under FADs. (C) 2000 Ifremer/CNRS/INRA/IRD/Cemagerf/Editions scientifiques et medicales Elsevier SAS.
Aquatic Living Resources (0990-7440) (Elsevier), 2000-07 , Vol. 13 , N. 4 , P. 259-262

Droits : 2000 Ifremer/CNRS/INRA/IRD/Cemagref/Éditions scientifiques et médicales Elsevier SAS
http://archimer.ifremer.fr/doc/2000/publication-1392.pdf
DOI:10.1016/S0990-7440(00)01056-1
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1392/

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : Cette étude ouvre une réflexion sur les enjeux d’intégration sociale autour de la lecture dans le territoire de la Guyane française. Les handicaps socioéconomiques du développement de la lecture sont particulièrement importants dans ce département français. La Guyane n’appartient pas à une société de lecture ; c’est une société d’oralité déchirée entre la modernité par la lecture et l’écriture et la tradition par l’oralité. L’étude propose daller au-delà du simple diagnostic pour envisager des stratégies de développer destinées à populariser la lecture dans ce département, par exemple avec le développer de la lecture publique à partir de biblio/pirogue pour répondre à l’isolement des populations. Dans cette société marquée par l’importante proportion d’illettrisme et d’analphabétisme, et la faible pratique de la lecture, l’égalité d’accès à la lecture est défi pour l’avenir de ce territoire.
This study opens a discussion on issues of social integration around reading in the territory of French Guiana. The socio-economic handicaps the development of reading are particularly important in this department french. The Guyana who does not belong to a reading society, is an oral society torn between modernity by reading and writing and oral tradition. The studies propose to go beyond the simple diagnosis to consider development strategies designed to popularize reading in this department, for example with the development of the public reading from library on a boat to meet the isolation of populations. In this society marked by the large proportion of illiteracy and illiteracy, and low practice of reading, equal access to reading is challenge for the future of this territory.
Guyane française

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.1012
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/1012

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
In this paper we present a microfluidic architecture dedicated to the study of Red Blood Cells (RBCs) deformability in microchannel smaller than the cell shape (biconcave disc of 7-8 μm in diameter) and cell capability to pass through slits separated by a gap value down to 2 μm, acting as a filter. This device is use in the context of RBCs disorders affecting their deformability, which is analysed versus number of cells trapped in the filter. This device can be seen as mimicking the human spleen. Microfabrication of the chip is based on polydimethylsiloxane (PDMS) associated to a two level thick photoresist mould (SU8). One level is used for microfluidic access with a 25 μm thickness towards the studied zone. The second level concerns the mimicking zones where RBCs flow through 5 μm down to 2 μm-wide slits acting like a mechanical filter. This level has a thickness of 5 μm. Devices have been tested on RBCs having specific disorder on their mechanical elasticity in order to validate the design principle. Two cases are presented in this paper: a.) Sickle RBCs inducing cell rigidity at two levels b.) Parasitized RBCs by Plasmodium falciparum. On both cases, we clearly show that deformability of RBCs influences the capability to pass through small slits (down to 2um) and thus is in relation with the pathology stage. This spleen-like microfluidic chip mimicking the RBCs filtering function is a promising tool for the exploration of RBC disorders combined with mechanical alterations.
4th European Conference on Microfluidics
Limerick, Ireland

hal-01113061
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01113061

Éditeur(s) : HAL CCSD Montpellier : CIRAD
Résumé :  
Afin d'assurer l'aménagement durable de la Guyane, il convient de mettre en place une surveillance du territoire. En effet, dans la forêt tropicale humide qui couvre 96 % de la superficie de ce département et s'avère difficilement accessible, beaucoup d'activités restent mal connues et certaines sont même exercées illégalement. C'est souvent le cas de l'orpaillage qui, lorsqu'il est illicite, dégrade le milieu naturel et pollue fortement les rivières, du fait de l'utilisation de techniques inadaptées et des conditions précaires inhérentes aux chantiers clandestins. La surveillance des activités d'orpaillage, légales ou illégales, est du ressort du gestionnaire forestier en charge du respect de la loi sur l'ensemble des forêts. L'Onf-Guyane a pour mission de gérer ce vaste territoire qui représente environ 7,5 millions d'hectares. Actuellement, la recrudescence des conflits provoqués par les exploitations illégales exige des moyens opérationnels de surveillance. Cet article propose une technique qui fait appel à l'imagerie satellitaire optique. Malgré l'ennuagement important de ces régions équatoriales, l'imagerie satellitaire est fiable. L'obtention régulière d'informations constitue un atout pour la gestion du territoire guyanais.
ISSN: 0006-579X

hal-01032180
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032180

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : La prolifération récente des résidences secondaires, observée récemment sur la côte Pacifique Sud du Nicaragua, s’inscrit dans une perspective de développement ayant trait à l’hébergement touristique. Or, le caractère immobilier prédominant de ce type d’hébergement, ainsi que les modes de consommation de ces résidents temporaires nous mettent en garde quant aux risques socioéconomiques et environnementaux encourus par les communautés autochtones. Parmi ces risques, notons les problèmes découlant de l’amplitude des variations saisonnières, de privatisation et de destruction des espaces naturels, ainsi que les perspectives de pérennisation des retombées économiques à moyen et long terme. Les auteurs de cet article remettent donc en question les prouesses attribuées à ce secteur d’activité et invitent à considérer des alternatives de développement durable du tourisme plus respectueuses des territoires d’accueil.
In recent years, there has been a proliferation of second home developments on attractive coastal regions of Central and South America. Based on the assumed benefits of second home tourism to regional economies, public authorities - accompanied by private investors – have capitalised on this sector as part of their tourism development strategies. This paper first examines the nature of recent second home tourism developments and then presents the socio-economic and environmental impacts of this phenomenon as experienced by local communities on the South Pacific Coast of Nicaragua. The main impacts include conflicts with local and indigenous communities over land use and ownership, seasonal and low-income employment generation, an increased burden on municipal budget to provide public infrastructure, and environmental degradation. It is argued that the second home tourism sector, strongly driven by private real estate investors, fails to generate tourism activities which are expected to sustain community development. Furthermore, this study indicates that municipalities concentrating on the second home tourism segment may deprive themselves of access to resources for more sustainable forms of tourism activities.
Amérique centrale
Nicaragua

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.3869
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/3869

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley/Blackwell
Résumé : International audience
Photosynthetic eukaryotes have a critical role as the main producers in most ecosystems of the biosphere. The ongoing environmental metabarcoding revolution opens the perspective for holistic ecosystems biological studies of these organisms, in particular the unicellular microalgae that often lack distinctive morphological characters and have complex life cycles. To interpret environmental sequences, metabarcoding necessarily relies on taxonomically curated databases containing reference sequences of the targeted gene (or barcode) from identified organisms. To date, no such reference framework exists for photosynthetic eukaryotes. In this study, we built the PhytoREF database that contains 6490 plastidial 16S rDNA reference sequences that originate from a large diversity of eukaryotes representing all known major photosynthetic lineages. We compiled 3333 amplicon sequences available from public databases and 879 sequences extracted from plastidial genomes, and generated 411 novel sequences from cultured marine microalgal strains belonging to different eukaryotic lineages. A total of 1867 environmental Sanger 16S rDNA sequences were also included in the database. Stringent quality filtering and a phylogeny-based taxonomic classification were applied for each 16S rDNA sequence. The database mainly focuses on marine microalgae, but sequences from land plants (representing half of the PhytoREF sequences) and freshwater taxa were also included to broaden the applicability of PhytoREF to different aquatic and terrestrial habitats. PhytoREF, accessible via a web interface (http://phytoref.fr), is a new resource in molecular ecology to foster the discovery, assessment and monitoring of the diversity of photosynthetic eukaryotes using high-throughput sequencing.
ISSN: 1755-098X

hal-01149047
http://hal.upmc.fr/hal-01149047
http://hal.upmc.fr/hal-01149047/document
http://hal.upmc.fr/hal-01149047/file/Decelle_2015_PhytoREF.pdf
DOI : 10.1111/1755-0998.12401

Résumé : Cet atlas de sensibilité du littoral aux pollutions marines a été produit dans le cadre du projet "Elaboration des Atlas Polmar et DCE" confié par l'Etat (DEAL - La Réunion) au laboratoire universitaire LETG-Brest Géomer de Brest en lien avec la délégation IFREMER océan Indien. Le dispositif spécifique Polmar constitue un volet spécifique du dispositif opérationnel ORSEC départemental. Théoriquement révisé tous les cinq ans, il doit notamment fournir "un inventaire précis et hiérarchisé des zones à protéger en priorité". Etabli sous la forme d'un atlas de sensibilité des littoraux, annexe obligatoire du dispositif spécifique Polmar-Terre, cet inventaire est un document synthétique d'aide à la décision dans le contexte préparatoire et opérationnel de la lutte anti-pollution. L'opération confiée au laboratoire LETG-Brest Géomer, s'est organisée en 3 phases : •Phase 1 : Inventaire des données pertinentes pour produire l’atlas de sensibilité. Cette étape a consisté tout particulièrement à rassembler et à exploiter l’information géographique produite et diffusée par les services de l’Etat et par ses partenaires dans le cadre de leurs missions sur le littoral. Des données complémentaires ont également été recherchées dans la documentation ou sur le terrain. L'inventaire reprend la méthodologie développée pour la production des atlas de Haute et de Basse Normandie dans le cadre de la MIMEL. Pour chaque jeu de données, le travail a consisté à identifier les sources (propriétaires et contacts), les formats, les modalités d'acquisition, de diffusion et de mise à jour. Les données disponibles ont ensuite été collectées et structurées conformément aux principes d'archivages et de catalogages normalisés par la directive européenne INSPIRE pour les infrastructures de données. •Phase 2 : Structuration de l’information géographique. L’ensemble des données et des informations exploitées ou produites a été intégré dans le serveur de cartographie SEXTANT et ainsi mis à disposition de l'ensemble des partenaires, afin d'améliorer l'approche globale et partagée des milieux marins et littoraux. Le SIG créé permettra de garantir une mise à jour en continu de l'atlas de l'île de La Réunion. Sa pérennité nécessitera cependant une démarche partenariale et la mise en oeuvre d'un suivi. •Phase 3 : Exploitation de l’information géographique pour produire l’atlas de sensibilité du littoral réunionnais. L’atlas de sensibilité a été produit dans un format numérique accessible à partir de la Base de Données SEXTANT Remata de l'Ifremer. A terme, il sera intégré au serveur de cartographie CARMEN permettant d’accéder aux données employées pour la production des atlas afin de pouvoir éditer à la demande des cartes au contenu et à l’échelle personnalisés. L’intérêt de cette version numérique réside également dans sa capacité de diffusion largement accrue. Une version PDF de l’atlas et son édition papier ont également été préparées. Une déclinaison numérique sur un portail Sextant dédié (http://www.ifremer.fr/sextant/fr/web/POLMAR_REUNION) a été développé par la Délégation Ifremer Océan Indien. L'intérêt majeure de cette version WEB et de garantir une réactualisation immédiate des cartes de l'ATLAS dès qu'une mise à jour de données sera effective sur Sextant.

Droits : 2012 Ifremer, DEAL La Réunion - Direction de l'Environnement, de l'Aménagement et du Logement, IUEM, UBO
http://archimer.ifremer.fr/doc/00144/25479/23632.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00144/25479/

Éditeur(s) : HAL CCSD Oxford University Press (OUP)
Résumé : International audience
DNA sequencing technology is becoming more accessible to a variety of researchers as costs continue to decline. As researchers begin to sequence novel transcriptomes, most of these data sets lack a reference genome and will have to rely on de novo assemblers. Making comparisons across assemblies can be difficult: each program has its strengths and weaknesses, and no tool exists to comparatively evaluate these data sets. We developed software in R, called Sequence Comparative Analysis using Networks (SCAN), to perform statistical comparisons between distinct assemblies. SCAN uses a reference data set to identify the most accurate de novo assembly and the ``good'' transcripts in the user's data. We tested SCAN on three publicly available transcriptomes, each assembled using three assembly programs. Moreover, we sequenced the transcriptome of the oomycete Achlya hypogyna and compared de novo assemblies from Velvet, ABySS, and the CLC Genomics Workbench assembly algorithms. One thousand one hundred twenty-eight of the CLC transcripts were statistically similar to the reference, compared with 49 of the Velvet transcripts and 937 of the ABySS transcripts. SCAN's strength is providing statistical support for transcript assemblies in a biological context. However, SCAN is designed to compare distinct node sets in networks, therefore it can also easily be extended to perform statistical comparisons on any network graph regardless of what the nodes represent.
ISSN: 0737-4038

hal-01544800
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01544800
DOI : 10.1093/molbev/mst087

Éditeur(s) : HAL CCSD Presses polytechniques et universitaires romandes, Publisher of the EPFL Press
Résumé : Chacun peut observer dans le monde réel l’omniprésence de systèmes complexes constitués de nombreux éléments en interaction et dont les caractéristiques globales ne peuvent se réduire à celles de leurs composants : ce sont par exemple les cellules d’un organisme vivant, les colonies de fourmis, les écosystèmes, ou encore les systèmes économiques, l’Internet et les réseaux sociaux. Dans le futur, nos sociétés devront relever l’immense défi scientifique et technologique qui consiste à comprendre ces systèmes pour les adapter, les contrôler et les modéliser. Au travers d’exemples choisis sans complication inutile, les auteurs proposent une introduction par la pratique aux systèmes complexes. Leur méthode repose sur la conviction que toute compréhension suppose un acte d’expérience; l’ouvrage est composé d’ateliers où il s’agit de simuler une dynamique collective à partir de sa modélisation orientée-agent. Les étudiants, les enseignants, les créateurs et plus largement toute personne avide de développer sa culture et d’actualiser ses connaissances tireront parti de cet ouvrage pluridisciplinaire accessible à un large public.
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01284628

ISBN : 978-2-88074-991-0
hal-01284628
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01284628

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley
Résumé : International audience
OBJECTIVE: The aim of the study was to assess whether HIV infection is associated with a higher risk of invasive cervical cancer (ICC). METHODS: We conducted a region-wide, population-based observational cohort study of 1232 HIV-infected women over the age of 15 years in Guadeloupe, a French Caribbean archipelago, during the period 1999-2006. The observed numbers of incident cases of cervical intraepithelial neoplasia (CIN) and ICC were compared with the expected numbers of cases based on the incidence rates for the general population, and the standardized incidence ratios (SIRs) and 95% confidence intervals (CIs) were calculated. RESULTS: The incidence rate of CIN was higher in the HIV-infected women than in the general population for all grades (SIR 10.1, 95% CI 6.8-14.6 for CIN grade 1; SIR 9.9, 95% CI 6.1-15.3 for CIN grade 2; and SIR 5.2, 95% CI 3.4-7.7 for CIN grade 3). However, no increase in the risk of ICC was observed (SIR 1.7, 95% CI 0.3-4.9). CONCLUSIONS: Despite an increase in the occurrence of cervical cancer precursors, no increase in the risk of cervical cancer was found in a population of HIV-infected women who receive treatment for their infection and have access to ICC prevention services.
ISSN: 1464-2662

hal-00682744
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00682744
DOI : 10.1111/j.1468-1293.2011.00939.x
PUBMED : 21819528

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : En Haïti, l’accès difficile à des services spécialisés et la rareté des hôpitaux psychiatriques amènent l’aggravation des problèmes d’adaptation (IESM-OMS, 2011 ; Lecomte et Raphaël, 2010a; Nicolas et al.,). Certains services d’intervention tentent de répondre aux besoins complexes des enfants de la rue, comme par exemple le Centre d’accueil de Delmas 3. Au Québec, le modèle psychoéducatif guide les interventions spécialisées auprès de jeunes ayant des troubles de comportements. Le présent projet de recherche vise d’une part à évaluer si une approche collaborative favoriserait la pérennité d’un programme d’intervention en Haïti et d’autre part si le modèle psychoéducatif pourrait répondre aux besoins du milieu d’intervention du Centre d’accueil de Delmas. Pour favoriser la mobilisation des partenaires, le projet met de l’avant une méthode qualitative et collaborative (Hamel, Cousineau et Vézina, 2010). D’abord, une formation adaptée aux besoins du milieu a été présentée aux intervenants. Ensuite, l’équipe de recherche et les intervenants du centre d’accueil ont animé des activités psychoéducatives. Ce projet pilote a montré qu’une approche collaborative favorise la participation et le niveau de satisfaction de tous les acteurs impliqués. Cette expérience a également permis de constater que le modèle psychoéducatif pourrait être utilisé dans les centres d’accueil en Haïti. En effet, ce modèle permet d’adapter la réponse aux besoins des personnes selon les caractéristiques des milieux (Renou, 2005).
In Haiti, accessibility to specialized services and the lack of psychiatric hospitals exacerbates adaptation problems (Lecompte and Raphael 2010a; Nicolas et al, 2012; WHO-AIMS, 2011). The health professionals at the Centre d’accueil de Delmas 3 respond to the complex needs of young street children. In Quebec, several evidence-based intervention models have shaped our clinical practice for young children with behavior disorders. In fact, rehabilitation interventions are based on the psychoeducational model. The current research project had two goals: 1) Examine whether a collaborative approach would facilitate and ensure that the implementation of an intervention program would be ongoing and long-lasting in Haiti; 2) Explore whether the psychoeducational model could respond to the needs of a Haitian youth center. Qualitative methods were used to bring together partners in the research (Hamel, Cousineau and Vézina, 2010). First, educators followed a two days training developed to respond the specific needs. Second, interventions were implemented by researchers in collaboration with the stakeholders. This pilot project has shown that a collaborative approach encourages training and the level of participants' satisfaction. Futher, this experience showed that the psychoeducational model could very well fit the needs of a Haitian youth center. The psychoeducative model can yield responses adapted to the needs of people accounting for the characteristics of the environment (Renou, 2005).
Haïti

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.10295
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/10295

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience

Background. Projections of medical demography show a decrease of number of doctors who practice in a rural setting and a low amount of general practitioners’ facilities.

Aim. To explore residents’ career choices and to determine their terms to settle in rural areas.
Methods. Qualitative study by groups interviews in five French cities with total of 33 residents. Thematic analysis was performed using the NVivo® software.
Results. Personal life strongly influenced residents’ career choices with a strong desire of free time. Residents considered working among a team rather than in a traditional group practice. They were interested by a practice in rural setting but countryside perceived as too far from urban centres and lacking of access to services. They also imagined the practice conditions as difficult and solitary. Many residents intended practicing in a “semi-rural” setting, the description of which could match with a significant part of the rural area.
Conclusion. If this declared craze for practice in “semi-rural” setting was confirmed, forecasts for some rural areas could be relativized. Public authorities’ attention should then be focused on rural areas far from urban centres and on territories characterized by lonesome medical practice.

Contexte. Les projections en termes de démographie médicale montrent une diminution du nombre de médecins exerçant en zone rurale, avec un faible nombre d’installations.
Objectif. Explorer les souhaits d’exercice des internes et recueillir leurs conditions pour exercer en zone rurale.
Méthode. Étude qualitative par entretiens collectifs dans cinq villes de France auprès de 33 internes. L’analyse thématique a été réalisée à l’aide du logiciel NVivo®.
Résultats. La vie personnelle influençait fortement les souhaits d’exercice, avec un désir de préserver du temps libre. Les internes envisageaient un exercice en équipe, au-delà de l’exercice de groupe traditionnel. Ils étaient intéressés par l’exercice en milieu rural, mais le territoire rural leur apparaissait sans accès aux services et très éloigné des pôles urbains. Ils se représentaient également des conditions d’exercice difficiles et solitaires. De nombreux internes se projetaient dans un exercice en « semi-rural », dont la description pourrait correspondre à une partie non négligeable de l’espace rural.
Conclusion. Si cet engouement déclaré pour l’exercice en semi-rural venait à se confirmer, ces projections concernant certaines zones rurales pourraient être relativisées. L’attention des pouvoirs publics devrait alors se concentrer sur les zones rurales éloignées des pôles urbains et les territoires marqués par un exercice médical solitaire prédominant.

ISSN: 0998-3953

hal-01654623
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01654623
OKINA : ua16504

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : In the past the Caribbean was restricted to offering elitist tourist activities, but over the last three decades it has to a large extent opened its doors to international tourism. The advent of mass tourism has been accompanied by a redistribution of the tourism functions and flows within the region. The significant growth in tourism, although essential to the economies of the Caribbean islands, has given rise to a number of issues, the first being the necessity to examine the multiplier effect from tourism revenue within these externally-dependent economies. Next there is both the question of access to resources and the closing of tourist sites in a context where local communities are focusing on coastlines to develop their own numerous tourism and recreational activities. These developments will inevitably require us to consider environmental issues and the sustainability of today’s predominant tourism activities.
Longtemps limité à des pratiques touristiques élitistes, l’espace caribéen s’est largement ouvert au tourisme international au cours des trois dernières décennies. L’avènement du tourisme de masse s’est accompagné d’une redistribution des flux et de fonctions touristiques dans cette région. Les enjeux, qui accompagnent l’importance croissante du fait touristique, essentiel pour les économies des îles caribéennes, sont de plusieurs ordres : tout d’abord, il convient de s’interroger sur les effets d’entraînement des revenus du tourisme dans le cadre de ces économies extraverties. Se pose également la question de l’accès aux ressources et de la fermeture des lieux touristiques, dans un contexte où les sociétés locales développent aussi leurs propres pratiques touristiques et récréatives ; autant d’usages qui se polarisent sur des ressources littorales et doivent nous interpeller sur les enjeux environnementaux et la durabilité des pratiques touristiques qui prévalent aujourd’hui
Caraïbes

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.4713
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/4713

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : El Caribe colombiano ha experimentado un acelerado proceso de urbanización y desarrollo turístico en los últimos 50 años. Solo en una ciudad como Cartagena de Indias (la ciudad turística por excelencia de Colombia), datos referidos al periodo noviembre 2009 – enero 2015, mostraron un incremento en la llegada de turistas cercano al 20%. Después de un gran número de encuestas realizadas alrededor del mundo, se encontró que los parámetros en que se basan los turistas a la hora de preferir una playa son: i) la seguridad, ii) el paisaje, iii) calidad del agua, iv) basuras, v) instalaciones. El paisaje es uno de los recursos costeros y por lo tanto su evaluación es una herramienta importante para los gestores y planificadores del litoral a la hora de la realización de planes de conservación, protección, desarrollo y manejo. Este trabajo se basa en la evaluación del valor paisajístico de las playas que constituyen la base de la economía de muchas ciudades costeras en el mundo y en especial de la zona central de litoral Caribe colombiano. Un problema importante en la evaluación del paisaje es la incapacidad de algunas metodologías de reflejar correctamente las percepciones de la gente, debido al alto peso que tienen algunos aspectos subjetivos (p. ej. altura de una geoforma).En este trabajo se presenta la evaluación del paisaje realizada para la zona central de Caribe colombiano (37 playas de los departamentos de Sucre, Bolívar y Atlántico) utilizando la lógica matemática y matrices ponderadas (fuzzy logic mathematics - parameter weighting matrices) las cuales permiten disminuir la subjetividad y cuantificar con exactitud la incertidumbre. Para la evaluación se utilizó una lista de chequeo que está conformada por 26 parámetros, 18 físicos (acantilados, playas, plataformas rocosas, dunas, características de los valles, forma del relieve, mareas, paisaje costero, color del agua y restos de vegetación), y 8 antropogénicos (ruido, basura, descarga de aguas residuales, grado de modificación y de construcción del medio, tipos de acceso, línea del horizonte y estructuras antrópicas). Los parámetros fueron calificados en una escala de 1 a 5 (presencia/ausencia o poca/alta calidad) y, con el fin de cuantificar la incertidumbre y excesos derivados de la subjetividad que pudo haber tenido la evaluación de los parámetros, se utilizó la lógica difusa (fuzzy logic). A la par, un sistema de matrices, se empleó para asignar valores de peso de acuerdo a las preferencias y prioridades de los usuarios. Como resultado de estos análisis lógico-estadísticos se obtuvo un valor (D) el cual resume la evaluación del paisaje en 5 clases que van desde la CLASE 1 (zona litoral sumamente atractiva) hasta la CLASE 5 (playas urbanas muy poco atractivas). De los 37 sectores estudiados, ninguno puede ser considerado como una zona litoral sumamente atractiva, mientras que 15 corresponden a zonas litorales urbanas poco atractivas, el resto de las playas (22) se ubicó entre las clases 2, 3 y 4. Los resultados obtenidos son útiles para los gestores costeros en la medida que, aunque no es posible mejorar los aspectos naturales de la clasificación, si es posible mejorar muchos de los parámetros antropogenicos y, de esta forma, hacer que una playa mejore su clasificación y sea paisajísticamente más atractiva.
In the past few years, the Colombian Caribbean coast has experienced rapid tourism development which has not been accompanied with a similar increase in urbanization facilities. For example, the city of Cartagena de Indias (the most famous tourist destination of Colombia), data related to November 2009 – January 2015 period, showed an increase of 20% in tourist arrivals. A large number of surveys developed in Europe found that the most critical parameters for tourists, when they choose a beach, are: i) security, ii) scenery, iii) water quality, iv) litter, v) facilities. Scenery is one of the most significant coastal resources. Therefore, its evaluation is a valuable tool for coastal managers when developing conservation and protection plans. This proposal provides coastal scenery assessment of 37 beaches along the North Colombian Caribbean littoral by analysing 26 physical and human factors. Results were weighted (not all parameters have equal weight) and subjected to fuzzy logic mathematics in order to reduce recorder judgment subjectivity. The sites were categorised into five classes; Class 1 locations had top grade scenery; Class 5 poor scenery. Of the 37 sectors studied, currently none can be considered as an extremely attractive coastal area (class1), while 15 were unattractive urban coastal areas (class 5), the rest of the beaches (22) placed in classes 2, 3 and 4. Classification of analysed sites depends on the geological setting and degree of human occupation. The technique opens new perspectives for analysis of the potential for coastal tourism development in natural areas and scenic quality improvement of current tourist developed areas. Concerning coastal management issues, emphasis should be given to the upgrading of human parameters eliminating litter and sewage evidence, vegetation debris and enhancing beach nourishment works. This proposal can help in moving some locations from their present status to a higher one.
Caraïbes
Colombie

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.9326
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/9326

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
This study constitutes one of the few works conducted on the colonization of recent lava flows by fish communities in coral reef environment. It attempted to describe the mechanisms of colonization and environmental variables infuencing the structure of communities on the lava flows of the Piton de la Fournaise volcano at Reunion Island. It also proposed some hypotheses on the mechanisms of selection and speciation of endemic species of thesouthwestern Indian Ocean region, particularly diversified on the most recent lava flows of the Piton de la Fournaise, and provided a model of distribution of environmental and fish assemblage variables in four homogeneous patterns of colonization (landscapes) retained within the study area. The results showed fish community structure strongly related to measured environmental variables, of which depth, width of the island shelf, age of the lava flow and distance to the most recent lava flow were the most influential. It also appeared that the maximum endemic species richness was measured on the shallower stations, with narrow insular shelf, located on recent lava flows, near the lava flow from the eruption of 2007 (latest volcanic event). These characteristics define a harsh environment, to which endemic species seem well-adapted due in particular to their strong demographic and dietary flexibility. Finally, the patterns of colonization were characterized by significantly different environmental variables. The four homogeneous areas, defined by two geomorphological features, basalt blocks and drop-offs, nested within two locations, inside and outside the volcanic enclosure (current caldera), hosted fish communities whose dominant diets mainly depend on the nature, the abundance and the accessibility of available food resources. Overall, the study highlights that during early stages of ecological succession, site selection by fish communities is highly dependent on environmental constraints, specially of volcanic origin, but the physical habitat selection (geomorphology, substrate rugosity, percentage of soft substrate) seems to have littleimportance, while at least on the trophic structure and the distribution of endemic species.
ISSN: 0022-0981

hal-01253768
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01253768
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01253768/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01253768/file/Pinault%20et%20al.%20-%202014%20-%20Fish%20community%20structure%20in%20relation%20to%20environmen_hal.pdf
DOI : 10.1016/j.jembe.2014.06.005

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Carbonation of peridotite is a widespread process in nature, with emerging societal and environmental implications through geological storage of CO2. We studied the micro- and nano-scale structures associated with the carbonation of peridotite pervaded by a CO2-rich water and the induced changes of its hydrodynamic properties. Focused ion beam (FIB) nanotomography was coupled with scanning electron microscopy (SEM) and transmission electron microscopy (TEM) observations. An experimental sample of dunite core percolated by a CO2-rich fluid (pCO2 = 11 MPa) at 160 °C was compared with a naturally carbonated sample from the Atlantic Ridge (Exp. IODP 304). Results of the 8-days percolation experiment show continuous alteration of olivine into magnesite locally associated with a poorly crystalline serpentine-type mineral referred to as proto-serpentine. The experiment is also characterized by an overall decrease in rock porosity (from 7.7 to 6.4%) and permeability (from 8.5 × 10− 16 to 1.7 × 10− 16 m2). The primary inter-granular porosity (1 to 10 μm) is progressively filled with magnesite, leading to the overall decrease of permeability. At the same time, a secondary small-scale porosity (10 nm to 1 μm) is created at the tip of the dissolution features along the (010) cleavage planes of olivine grains. Carbonate crystals grow within these etch-pit structures behind the dissolution front. Dissolution and precipitation occur at a relative rate that maintains the secondary porosity over the timescale of the experiment (i.e. carbonate growth has to be the slowest one). This process is interpreted as an interface coupled dissolution-precipitation mechanism of olivine carbonation. Proto-serpentine is only formed in highly reduced flow areas, such as small olivine etch-pits (10 to 500 nm wide), which are more isolated from CO2 input. SEM-FIB analyses show the 3D preferential orientation of the dissolution-precipitation planes within a given olivine grain. It suggests the formation of lateral connections between the etch-pits (infra-micrometric “channels”) providing access to reactants and removing reaction products at the reaction sites. The experimental results show that olivine dissolution and magnesite precipitation converge to a quasi-steady state resulting in a constant carbonation rate controlled by reaction kinetics and not by mass transfer for this flow regime. The system self-regulates, independently of the porosity change at least during this incipient stage of olivine carbonation. Similar textures are observed in natural samples collected at 170 m-depth in the vicinity of veinlets driving late fluids down into the cooling oceanic lithosphere. This suggests that similar mechanisms are active in nature and can play an important role in the late, low temperature alteration stages of fractured peridotite. These results also highlight the critical role of nm-scale spatial arrangement of dissolution and precipitation features on mass transfers and on the sustainability of olivine carbonation through coupled dissolution-precipitation processes.
ISSN: 0009-2541

hal-01684733
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01684733
DOI : 10.1016/j.chemgeo.2017.11.013

Éditeur(s) : HAL CCSD Oxford University Press (OUP)
Résumé : International audience
The nature of factors governing the tempo and mode of protein evolution is a fundamental issue in evolutionary biology. Specifically, whether or not interactions between different sites, or epistasis, are important in directing the course of evolution became one of the central questions. Several recent reports have scrutinized patterns of long-term protein evolution claiming them to be compatible only with an epistatic fitness landscape. However, these claims have not yet been substantiated with a formal model of protein evolution. Here, we formulate a simple covarion-like model of protein evolution focusing on the rate at which the fitness impact of amino acids at a site changes with time. We then apply the model to the data on convergent and divergent protein evolution to test whether or not the incorporation of epistatic interactions is necessary to explain the data. We find that convergent evolution cannot be explained without the incorporation of epistasis and the rate at which an amino acid state switches from being acceptable at a site to being deleterious is faster than the rate of amino acid substitution. Specifically, for proteins that have persisted in modern prokaryotic organisms since the last universal common ancestor for one amino acid substitution approximately ten amino acid states switch from being accessible to being deleterious, or vice versa. Thus, molecular evolution can only be perceived in the context of rapid turnover of which amino acids are available for evolution.
ISSN: 0737-4038

hal-01544755
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01544755
DOI : 10.1093/molbev/msu318

Éditeur(s) : University of Chicago Press
Résumé : In hypoxia, gray mullet surface to ventilate well-oxygenated water in contact with air, an adaptive response known as aquatic surface respiration (ASR). Reflex control of ASR and its behavioral modulation by perceived threat of aerial predation and turbid water were studied on mullet in a partly sheltered aquarium with free surface access. Injections of sodium cyanide (NaCN) into either the bloodstream ( internal) or ventilatory water stream ( external) revealed that ASR, hypoxic bradycardia, and branchial hyperventilation were stimulated by chemoreceptors sensitive to both systemic and water O-2 levels. Sight of a model avian predator elicited bradycardia and hypoventilation, a fear response that inhibited reflex hyperventilation following external NaCN. The time lag to initiation of ASR following NaCN increased, but response intensity ( number of events, time at the surface) was unchanged. Mullet, however, modified their behavior to surface under shelter or near the aquarium edges. Turbid water abolished the fear response and effects of the predator on gill ventilation and timing of ASR following external NaCN, presumably because of reduced visibility. However, in turbidity, mullet consistently performed ASR under shelter or near the aquarium edges. These adaptive modulations of ASR behavior would allow mullet to retain advantages of the chemoreflex when threatened by avian predators or when unable to perceive potential threats in turbidity.
Physiological and Biochemical Zoology (1522-2152) (University of Chicago Press), 2005-09 , Vol. 78 , N. 5 , P. 744-755

Droits : 2005, The University of Chicago
http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/publication-637.pdf
DOI:10.1086/432143
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/637/

Résumé : L’étude présentée ici s’inscrit dans la logique du programme de reconnaissance des zones économiques exclusives françaises initié par l’Ifremer vers la fin des années quatre-vingt. Elle est relative à la ZEE du golfe de Gascogne dont la reconnaissance a été achevée en 1997. Elle comporte un ensemble de documents cartographiques offrant une vision inédite de toute la partie nord du golfe et un texte, que les auteurs ont souhaité rendre accessible à la plus grande majorité, faisant état de connaissances générales sur la zone ainsi que de certains nouveaux apports.

Droits : 2000 Ifremer éd.
http://archimer.ifremer.fr/doc/00071/18199/15767.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00071/18199/

Éditeur(s) : HAL CCSD InTech
Résumé : Le livre est en accès libre. The book is in open access
New Frontiers in Graph Theory

hal-00743343
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00743343
DOI : 10.5772/35046