Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag (Germany)
Résumé :  
We present a plant trait database covering autecology for rain forest trees of French Guiana. The database comprises more than thirty traits including autecology (e.g., habitat associations and reproductive phenology), wood structure (e.g., density and tension characteristics) and physiology at the whole plant (e.g., carbon and nitrogen isotopes) and leaf level (e.g., specific leaf area, photosynthetic capacity). The current database describes traits for about nine hundred species from three hundred genera in one hundred families. For more than sixty species, data on twelve morphological and ecophysiological traits are provided for individual plants under different environmental conditions and at different ontogenetic stages. The database is thus unique in permitting intraspecific analyses, such as the effects of ontogenetic stages or environmental conditions on trait values and their relationships.
Annals of Forest Science

hal-01032196
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032196
DOI : 10.1051/forest:2007058

Éditeur(s) : HAL CCSD Ecole nationale du génie rural
Résumé :  
En Guyane française où les sols sont généralement acides et pauvres en éléments minéraux, la forêt est caractérisée par sa plurispécificité. Une approche de type écologique a montré, dans les racines des principales espèces forestières, la dominance d'endomycorhizes à structure intracellulaire particulière : des hyphes de type Paris, spiralé. Leur rôle dans l'acquisition du phosphore a été étudié expérimentalement chez deux Césalpiniacées. Les semis d'Angélique, Dicorynia guianensis Amshoff, sont très dépendants, pour leur croissance et leur teneur en phosphore, des mycorhizes à mycélium spiralé ; ce type de mycélium représente plus de 90 % de la colonisation fongique. Par contre, les semis de Wapa (Eperua falcata Aublet) forment également des mycorhizes mais ces dernières améliorent le statut phosphaté et sont sans effet sur la croissance de cette espèce. Ces résultats contribuent à la compréhension du rôle des symbioses endomycorhiziennes dans le processus de régénération naturelle et ouvrent des perspectives de recherche quant à leur intervention éventuelle dans le maintien de la diversité forestière.
ISSN: 0035-2829

hal-01032211
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032211
DOI : 10.4267/2042/5820

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : The forests of French Guiana occupy a central part of the region’s potential resource base, but as yet remain almost completely unexploited. This stems from the forestry industry struggling to valorize wood stocks of a high diversity with an extremely heterogeneous distribution. Indeed, identifying essences for future propagation is an issue of both environmental and socio-economic importance for the region. Bagassa guianensis Aubl. and Cordia alliodora (Ruiz & Pav.) Oken. go against conventional models, in that they display the life history characteristics of rapid growth and wood of high quality, and thus are species of high potential for future plantations. Firstly, our study of growth characteristics reveals a defined strategy half way between long-lived species and pioneer species. It is the variability of basic density of wood which is a key trait allowing for such a development, favoring rapid growth in initial years whilst allowing for tree longevity. Secondly, the analysis of a range of wood properties (shrinkage, modulus of elasticity, durability) in relation to tree growth confirms the technologic quality of the two species. It also enables the emergence of new results like the effect of extractives on wood stability, the control of growth as a result of basic density variation, the evolution of leaf traits throughout tree development or the improvement of trunk maintenance thanks to interlocked grain. The knowledge gained in relation to the developmental traits of these two species, and to the quality of their wood allows for the elaboration of plantation projects and what will be required for their success. The results of this study can orientate future studies on novel species for commercialization in French Guiana.
La ressource forestière en Guyane occupe une place maîtresse au sein de la région et est encore majoritairement préservée, mais la filière bois parvient difficilement à valoriser la biodiversité locale en raison de l’hétérogénéité de la ressource. Identifier les essences à planter demain représente aujourd’hui un enjeu à la fois environnemental, économique et social pour la Guyane. Bagassa guianensis Aubl. et Cordia alliodora (Ruiz & Pav.) Oken. vont à l’encontre des modèles usuels en associant vitesse de croissance et qualité du bois et sont identifiées comme prometteuses pour la plantation. Dans un premier temps, l’étude de la dynamique de croissance des deux espèces révèle un modèle écologique singulier, à la fois pionnières et longévives. La variabilité de l’infradensité dans l’arbre est l’élément clé qui permet un tel développement, favorisant une croissance rapide dans les premières années tout en assurant la longévité de l’individu. Dans une seconde partie, l’analyse d’un large panel de propriétés du bois (retrait, module, durabilité) en lien avec le développement de l’arbre confirme les qualités technologiques des deux espèces et permet l’émergence de résultats novateurs tels que le rôle des extractibles sur le retrait, le contrôle de la croissance grâce aux variations d’infradensité, l’évolution des traits foliaires au cours de l’ontogénie ou encore la mise en place de contrefil dans l’arbre pour assurer son maintien. La connaissance acquise vis-à-vis du mode de développement de ces deux espèces et des facteurs influençant la qualité de leur bois permet aujourd’hui de définir avec plus de précision le cadre d’un projet de plantation et les conditions de son succès. Les résultats de cette étude permettent finalement d’orienter la recherche de nouvelles espèces d’avenir pour la plantation en Guyane.
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01338281

tel-01338281
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01338281
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01338281/document
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01338281/file/Th%C3%A8se%20Julie%20Bossu.pdf

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag
Résumé : In order to analyze the large-scale structure of the genome of Norway spruce (Picea abies Karst.), a pseudo-testcross genetic linkage map was built using markers of six different types, belonging to the low (amplified fragment length polymorphisms, simple sequence repeats) or high (sequence-specific amplified polymorphisms, inter-retrotransposon amplified polymorphisms) copy-number fraction of the genome, and including expressed region-derived markers (expressed sequence tag polymorphisms). Twenty seven and 23 linkage groups of at least four markers were obtained for the female and the male parent maps, respectively. A subset of these linkage groups coalesced into 13 bi-parental linkage groups through markers shared between the two maps. This map was used to investigate the frequency of each marker type over chromosomes and the distribution of marker types relative to each other, using autocorrelation techniques. Our results show that, while the composition of chromosomes is homogeneous, low- and high-copy-number markers tend to occupy separate regions of the linkage groups, and that expressed sequences are preferentially associated with microsatellites and separated from retrotransposons. These results indicate that the spatial structure of Norway spruce chromosomes is not homogeneous
ISSN: 1614-2942

hal-01032033
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032033
DOI : 10.1007/s11295-005-0012-2

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag
Résumé : Tangential strains were measured with strain gauges at the surface of xylem and inner bark of saplings of Cryptomeria japonica D. Don. and Fagus silvatica L. during a pressurization test. The test consists in submitting the whole sapling to an artificially imposed hydrostatic pressure of increasing magnitude. The elastic response of the stems was found linear both at the surface of xylem and inner bark. A simple geometric model allows to compute radial strains in each tissue from tangential strain data. Inside inner bark, radial strains are much larger than tangential strains, because tangential strains are restrained by the core of wood. The material compliance of each tissue was computed as the ratio between the radial strain and the pressure that caused it. The material compliance of xylem is much lower than that of inner bark, but, as its thickness is much larger, its contribution to the apparent behavior of the stem is not negligible. Computation of material compliances by this pressurization test provides information about the specific behavior of each tissue in response to hydrostatic pressure. This can be used to estimate and interpret the calibration factor linking the water status of the plant to the apparent strain measured at its surface.
ISSN: 0931-1890

hal-01031900
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01031900
DOI : 10.1007/s00468-006-0061-7

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé :  
For a comprehensive evaluation of human influences on the genetic system, the simulation model EGO-GENE was developed. The model combines population genetic and population dynamic processes with forest growth models. The dynamics of genetic structures (single locus and multilocus genotypes up to 200 loci) can be simulated. Spatial and temporal genetic dynamics are included in the model. Overlapping or separated generations can be created and different modes of mating systems can be implemented. The model can be run with empirical and fictitious input data. The simulated genetic structures can be directly analysed with established genetic analysis programmes. An example demonstrates the use of the model far validation of interactions among components of the mating system. Another example demonstrates the applicability of the model in decision-making for seed sampling strategies. The genetic differences between the adult trees and the harvested seeds and the danger of genetic drift regarding to different seed sampling strategies are investigated by use of the genetic distance and the reproductively effective population size.
Silvae genetica

hal-01032083
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032083

Éditeur(s) : HAL CCSD Ecole nationale du génie rural
Résumé : En annexes : 10 photographies (vue aérienne du bourg de Maripasoula en 2001, brûlis d'abattis à Loka, plantation et usages du manioc, parcelle de culture d'arachide,...)
Mal connue et souvent anathématisée, l'agriculture itinérante sur brûlis doit être considérée comme une stratégie de subsistance, de populations rurales et forestières, qui est autorégénérante et adaptée aux contraintes édaphiques, économiques et agronomiques. Elle diffère de l'agriculture pionnière par ses logiques économiques et ses incidences agro-écologiques qui affectent et entretiennent différemment la fertilité des milieux. L'article décrit les modalités d'utilisation de la forêt par cette forme d'agriculture au sein de quatre communautés amérindiennes et bushinenge de Guyane. Leur agriculture, principalement tournée vers l'autoconsommation des produits cultivés, doit aujourd'hui faire face à des contraintes spatiales et économiques dont l'importance varie suivant les situations. Celles-ci induisent des changements techniques et des adaptations au sein des organisations sociales dont les impacts sur l'espace forestier diffèrent sensiblement. L'article considère les systèmes agricoles comme des éléments importants de gestion de la biodiversité et il s'interroge sur les limites écologiques de ces systèmes, en particulier lorsque, sous l'effet de la croissance urbaine, des plans de développement et de facteurs sociétaux, la présence humaine augmente et les pratiques agraires s'intensifient.
ISSN: 0035-2829

hal-01032163
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032163

Éditeur(s) : HAL CCSD INRA/EDP Sciences
Résumé : 11 ref.
absent
ISSN: 0003-4312

hal-01032357
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032357

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag
Résumé :  
Quantitative genetic diversity is a fundamental component of the interaction between natural populations and their environment. In breeding programmes, quantitative genetic studies on tropical trees have so far focused on fast-growing, light-demanding species, but no information exists on shade-tolerant, slow-growing species. For this study, 27 3-year-old open-pollinated families of the Neotropical shade-tolerant rainforest tree Sextonia rubra were measured in semicontrolled conditions for 20 morphological, growth, and photosynthesis traits; the effect of genetic relatedness, habitat of provenance, and mother tree status on seedling traits was analysed. Nine traits displayed significant genetic effects, while mother tree status and habitat effects were not significant (P>0.05) for an y trait. Estimated heritability varied between 0.14 and 0.28, with growth-related traits having the highest values. Additive genetic variation correlated positively with nonheritable variation, suggesting that ecological-evolutionary factors increasing or decreasing additive genetic variance may also affect nonheritable variation in the same direction. Our results suggest that quantitative genetic variability should be taken into account in ecological studies on, and in the management of, natural tropical rainforests; further research is needed to investigate genetic × environment interactions, in particular from the point of view of the genetic response of shade-tolerant plant species to variations in light availability.
ISSN: 1614-2942

hal-01032145
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032145
DOI : 10.1007/s11295-009-0251-8

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag/EDP Sciences
Résumé : Four populations of Norway spruce (Picea abies Karst.) were screened using nine nuclear microsatellite markers (three trinucleotides and six dinucleotides) and four chloroplast markers (all mononucleotides). Marker classes were compared for their variability, mutation rate and ability to detect differentiation between stands. Dinucleotide markers proved to be the most variable group and chloroplast stretches the least variable, with differences in mutation rate between the former and the latter spanning over two orders of magnitude. Variability correlated to the number of repeats but not to the absolute length of the microsatellite region. The different marker classes were combined with two different measures of genetic distance in order to investigate the performance of markers and evolutionary models for the study of genetic variation in natural populations of Norway spruce. Weir and Cockeram's F$_{rm ST}$ generally performed better in this clear-cut, four-population model study. Chloroplast haplotypes turned out to be the most sensitive marker system, being able to differentiate populations and to detect differences in genetic variability between sub-regions.
ISSN: 1286-4560

hal-01032048
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032048
DOI : 10.1051/forest:2006029

Éditeur(s) : HAL CCSD INRA/EDP Sciences
Résumé : absent
ISSN: 0003-4312

hal-01032371
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032371

Éditeur(s) : HAL CCSD Ecole nationale du génie rural
Résumé :  
La forte diversité d'espèces arborescentes observées en forêts tropicales représente à la fois une source permanente de questionnements scientifiques et une contrainte forte pour améliorer les connaissances du fonctionnement de l'écosystème forestier. Les hypothèses avancées pour expliquer le maintien de cette diversité sont légion. Elles s'opposent sur la nature déterministe ou stochastique des mécanismes maintenant cette forte diversité. En pratique et pour mieux aborder les problèmes posés, cette diversité peut être simplifiée en regroupant les espèces présentant des similitudes dans leur comportement écologique. L'article présente quelques-unes des théories du maintien de la diversité et une synthèse des approches utilisées pour regrouper les espèces en illustrant chacun de ces thèmes par des travaux réalisés en Guyane.
ISSN: 0035-2829

hal-01032095
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032095

Éditeur(s) : HAL CCSD Ecole nationale du génie rural
Résumé :  
Cet article vise à montrer que, depuis les premiers essais de sylviculture interventionniste en forêt tropicale humide, les approches ont évolué et ont permis de mettre en lumière les réactions des peuplements forestiers à certains types d'actions sylvicoles : exploitation forestière et éclaircie. L'effet stimulant de ces interventions sur la dynamique forestière et sur la reconstitution des stocks exploitables en forêt a été montré sur tous les dispositifs expérimentaux installés en forêt tropicale, et en particulier sur ceux de Guyane. Il existe cependant des limites : l'ouverture excessive, que l'on a évaluée à Paracou à l'équivalent de l'élimination de plus de un tiers de la surface terrière initiale, n'a plus d'effet sur la croissance tandis qu'elle favorise l'invasion des peuplements par des espèces pionnières et héliophiles sans intérêt commercial ; l'effet des ouvertures est limité dans le temps d'où l'intérêt, lorsque l'on ne peut pratiquer d'éclaircie complémentaire aux exploitations, de ne pas opter pour des durées de rotation trop longues. Il est alors crucial d'utiliser l'exploitation comme un véritable outil sylvicole et en particulier de limiter au maximum les dégâts causés au peuplement résiduel : les auteurs présentent les enjeux et les modalités de l'exploitation à faible impact pour la Guyane.
ISSN: 0035-2829

hal-01032159
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032159

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag
Résumé : Active mechanisms of re-orientation are necessary to maintain the verticality of tree stems. They are achieved through the production of reaction wood, associated with circumferential variations of three factors related to cambial activity: maturation strain, longitudinal modulus of elasticity (MOE) and eccentric growth. These factors were measured on 17 mature trees from different botanical families and geographical locations. Various patterns of circumferential variation of these factors were identified. A biomechanical analysis based on beam theory was performed to quantify the individual impact of each factor. The main factor of re-orientation is the circumferential variation of maturation strains. However, this factor alone explains only 57% of the re-orientations. Other factors also have an effect through their interaction with maturation strains. Eccentric growth is generally associated with heterogeneity of maturation strains, and has an important complementary role, by increasing the width of wood with high maturation strain. Without this factor, the efficiency of re-orientations would be reduced by 31% for angiosperms and 26% for gymnosperms. In the case of angiosperms, MOE is often larger in tension wood than in normal wood. Without these variations, the efficiency of re-orientations would be reduced by 13%. In the case of gymnosperm trees, MOE of compression wood is lower than that of normal wood, so that re-orientation efficiency would be increased by 24% without this factor of variations.
ISSN: 0931-1890

hal-01031825
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01031825
DOI : 10.1007/s00468-005-0407-6

Éditeur(s) : HAL CCSD Montpellier : CIRAD
Résumé :  
Le projet STREK (Développement des techniques sylvicoles pour la régénération des forêts humides exploitées de l'Est-Kalimantan) avait pour objectif de proposer des règles de gestion en vue d'une productivité durable des forêts de cette région, principaux pourvoyeurs de l'industrie du bois en Indonésie. Le projet s'est déroulé de 1989 à 1996. Dans la concession de PT INHUTANI I à Berau, deux sites d'étude, de 1 000 ha chacun, ont été choisis. Sur le premier site, exploité en 1978-1979, six parcelles de 4 ha chacune ont été installées pour appliquer des traitements sylvicoles avec deux parcelles-témoins. Sur le second site, localisé en forêt primaire jusqu'en 1991, 12 parcelles de 4 ha chacune ont été matérialisées. On a choisi trois parcelles-témoins et mis en oeuvre trois traitements d'exploitation avec trois répétitions : deux techniques d'exploitation à faible impact (EFI) avec deux limites de diamètre (> 50 et > 60 cm) et la dernière appelée "conventionnelle". Tous les arbres de diamètre ≥ 10 cm ont été mesurés, numérotés et cartographiés à l'échelle de 1:200. Une base de données portant sur 40 000 arbres a été créée où la botanique, la typologie et la pédologie sont présentes. La création de cette base de données est la première étape avant de pousser plus loin l'étude de la croissance et de la productivité des arbres.
ISSN: 0006-579X

hal-01032164
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032164

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag/EDP Sciences
Résumé :  
On 10 trees from 10 species of French Guyana tropical rainforest in a clear active process of restoring verticality growth strains were measured in situ in order to determine the occurrence of tension wood within samples. Wood specimens were cut in the vicinity of the growth strains measurements in order to measure some mechanical and physical properties. As suspected, tensile growth strains was very much higher in tension wood zone, because longitudinal modulus of elasticity was slightly higher. Longitudinal shrinkage was also much higher in tension wood than in opposite wood.
ISSN: 1286-4560

hal-01032110
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032110
DOI : 10.1051/forest:2007027

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag/EDP Sciences
Résumé : International audience
Chlorophyll meters such as the SPAD-502 offer a simple, inexpensive and rapid method to estimate foliar chlorophyll content. However, values provided by SPAD-502 are unitless and require empirical calibrations between SPAD units and extracted chlorophyll values. * Leaves of 13 tree species from the tropical rain forest in French Guiana were sampled to select the most appropriate calibration model among the often-used linear, polynomial and exponential models, in addition to a novel homographic model that has a natural asymptote.* The homographic model best accurately predicted total chlorophyll content (μg cm−2) from SPAD units (R2 = 0.89). Interspecific differences in the homographic model parameters explain less than 7% of the variation in chlorophyll content in our data set. * The utility of the general homographic model for a variety of research and management applications clearly outweighs the slight loss of model accuracy due to the abandon of the species' effect.
ISSN: 1286-4560

Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess
hal-00883628
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00883628
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00883628/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00883628/file/hal-00883628.pdf
DOI : 10.1051/forest/2010020

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé :  
The within-population spatial structure of genetic diversity is shaped by demographic processes, including historical accidents such as forest perturbations. Information drawn from the analysis of the spatial distribution of genetic diversity is therefore inherently linked to demographic-historical processes that ultimately determine the fate of populations. All adult trees and saplings in a 1.4-ha plot within a mixed Norway spruce (Picea abies [L.] Karst) stand were characterised by means of chloroplast (paternally inherited) markers, and a large sub-sample of these were genotyped at mitochondrial (maternally inherited) molecular markers. These data were used to analyse the spatial distribution of genetic variation and to compare the patterns corresponding to the two marker types. The plot presented non-homogeneous local stem density in the younger cohorts, and the indirect effect of this source of variation on the spatial genetic structure was investigated. Results suggest that (i) spatially limited seed dispersal induced patchiness in genotype distribution, while pollen flow had a homogenising effect; (ii) deviations from random spatial structure were stronger in the demographically most stable portions of the stand, while they were weaker where sudden bursts of regeneration occurred; (iii) spatially overlapping adult and sapling cohorts displayed the same spatial genetic structure (stronger on stable areas, weaker in portions of the stand undergoing events of intense regeneration), which was substantiated by the influence of local demographic processes. Regeneration dynamics as modulated by demography thus influences the distribution of genetic diversity within the stand both in the younger life stages and in the adult population.
ISSN: 0378-1127

hal-01032063
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032063
DOI : 10.1016/j.foreco.2008.03.023

Éditeur(s) : HAL CCSD Oxford University Press (OUP): Policy B - Oxford Open Option B
Résumé : absent
ISSN: 0829-318X

hal-01031083
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01031083

Éditeur(s) : HAL CCSD Montpellier : CIRAD
Résumé :  
Vu du dessus, la forêt apparaît très compacte et il est souvent difficile d’identifier avec précision les différents types de formation forestière. La méthode de mesure utilisant les photographies hémisphériques a été choisie afin de caractériser finement l’hétérogénéité spatiale présente dans le continuum de la canopée.
ISSN: 0006-579X

hal-01137118
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01137118
PRODINRA : 47373