Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
The main results are processed and analysed at two levels: macro and micro. For the macro, it is a comparative analysis of systems of school education and the organization of the PE in Haiti and Martinique based on different elements: the organization of schooling, the major educational reforms, the educational profile of teachers of the first two cycles of the fundamental school and elementary school, PE programs and physical, sports and artistic activities proposed. For the micro, it is a comparative analysis based on the curriculum said (before and after interviews) and the real curriculum (filmed lessons). The distinction between macro-level and micro-level focuses on the contextual component of our study Thus, the macro is interested in the effects of the context and the microphone to the effects of context.
AIESEP 2017 International Conference Cultures, Disciplines, Intercations: Contextualizing Diversity in Physical education
Gosier, France

hal-01649919
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01649919

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : National audience
Congrès National Association Française Urologie
Paris, France

hal-00689742
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00689742

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Le projet METYSS (Messinian Event in the Tyrrhenian from Seismic Study) concerne le bassin tyrrhénien occidental le long de la côte est-sarde et s'intègre dans le cadre d'une étude comparative des marqueurs sismiques de la Crise de Salinité Messinienne (CSM) à l'échelle du bassin méditerranéen. La mer tyrrhénienne est un bassin arrière-arc néogène lié à la subduction calabraise. Le rifting débute sur la marge est-sarde au cours du Tortonien et du Messinien, impliquant au moins localement une contemporanéité des dépôts de la CSM avec les processus de rifting qui segmente la marge en plusieurs sous-bassins. Cette région est donc particulièrement adaptée à la caractérisation et à l'organisation des dépôts messiniens en contexte de tectonique active. L'identification des marqueurs de la CSM et la détermination de leurs caractéristiques spatio-temporelles (faciès, géométrie, distribution et relations) ont été effectuées à partir de l'interprétation de 1200 km de profils sismiques multitraces HR acquis en 2009 lors de la campagne METYSS-1 sur le N/O "Téthys II". L'un des premiers résultats est que l'on retrouve dans cette zone les marqueurs caractéristiques de la CSM, comparables à ceux déjà observés dans le bassin méditerranéen occidental : surfaces d'érosion (MES, TES, BES) et unités messiniennes typiques (UU: Upper Unit; MU: Mobile Unit). La réalisation des cartes de répartition de ces unités sismiques permet d'en déterminer la variabilité spatiale, et notamment d'affiner celle de la couche de sel (MU), par rapport aux données pré-existantes. Ainsi, le long de la partie haute de la marge est-sarde, la rareté de l'unité MU et la présence des UU semblent indiquer que cette zone se situait à une profondeur intermédiaire pendant la crise. Inversement, plus profondément dans le bassin, l'épaisseur importante de la couche de sel sous les UU, témoigne d'une profondeur déjà conséquente de cette zone durant la CSM. On remarque également que dans le secteur nord de la zone d'étude, la répartition de MU est contrainte par les blocs basculés, le sel étant confiné dans les sous-bassins qui segmentent la marge. Dans le secteur sud, la répartition de la couche de sel est plus homogène dans le bassin profond, et est déformée par une tectonique salifère active. A terme, nous souhaitons utiliser les marqueurs de la CSM pour reconstituer les paléo-connexions et paléo-profondeurs des différents bassins de la zone, mais également comprendre les interactions entre tectonique crustale, tectonique salifère, et sédimentation. L'objectif est aussi de restituer l'évolution tectono-sédimentaire de la marge est-sarde depuis 6Ma.
13ème Congrès Français de Sédimentologie
Dijon, France

hal-00657315
https://hal-brgm.archives-ouvertes.fr/hal-00657315

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
The digital world authentic parallel organisation which deeply transforms the classical art organisation held by institutions, galleries, and collectors and that, mainly in the field of contempory art. Through a series of interviews, it reveals a lack of knowledge of this creative and collective energy and a protective reaction against these self appointed experts. The case of the photographer Alain Laboile whose recent fame comes out social network permits to better understand the resistance from official circles. We can say consequently that they resist to any legitimation witch ignore them.
C’est une véritable organisation parallèle des internautes qui se met en place et qui change en profondeur les instances de légitimation traditionnelles du milieu de l’art contemporain sans que les élites ne s’en aperçoivent véritablement ou ne consentent à l'accepter. Les entretiens que nous avons menés auprès des institutions, des galeristes et des collectionneurs, ont mis en évidence une méconnaissance de cette énergie créatrice et collective et une réaction de protection contre ces intrus d’une expertise autodidacte. Le cas du photographe Alain Laboile, dont la notoriété soudaine est née des réseaux sociaux, permet de mieux cerner les résistances des circuits officiels à une légitimation qui les contourne.
Les écosystèmes numériques et la démocratisation informationnelle : Intelligence collective, Développement durable, Interculturalité, Transfert de connaissances
Schoelcher, France

hal-01258283
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01258283
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01258283/document
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01258283/file/Nicole%20DENOIT.pdf

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : The Tyrrhenian Sea is usually interpreted to be a Neogene back-arc basin that opened by continental rifting and oceanic spreading caused by the eastward migration of the Apennine subduction system from Tortonian to Pliocene times. Rifting of the Tyrrhenian Sea started first along the Eastern Sardinian margin during the Tortonian-Messinian times. The " METYSS " project aims at better constraining the relations between crustal tectonics, salt tectonics and sedimentation from Messinian times to present-day. The " METYSS 1 " cruise (2009, R/V "Téthys II"-INSU) allowed us to obtain about 1200 km of high-resolution seismic reflection profiles along the SE Corsican margin, and along the upper and middle parts of the Eastern Sardinian margin, Western Tyrrhenian. This new dataset clearly illustrates that this area has been highly dissected during the rifting stage by N-S trending normal faults delineating ridges and basins, as previously described. The Messinian seismic markers (UU and MU) locally display fan-shaped stratal geometries, but the mechanism responsible for such geometries, i.e., salt tectonics or rifting, has yet to be carefully deciphered. We also mapped the spatial distribution of the mobile salt (MU). The highly variable thickness of the confined salt basins may be related to the initial pre-Messinian basin geometry or to the fact that sediment deposition was syn-rift. Southeastward, salt tectonics appears highly vigorous. More surprisingly, our data demonstrate that some of the major faults have been significantly reactivated during the post-rift period, up to late Quaternary time. Such recent fault activity has been recorded by bathymetric scarps and associated footwall debris flows. Moreover, some of this post-rift deformation can be evidenced within the Plio-Quaternary sequence by a regional unconformity. The post-Miocene deformation style varies greatly between different areas of the margin, and can also be strongly influenced by the presence or absence of mobile Messinian evaporites (MU).
13ème Congrès Français de Sédimentologie
Dijon, France

hal-00657310
https://hal-brgm.archives-ouvertes.fr/hal-00657310

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
Cette conférence porte sur la contextualisation de l’enseignement en tant que processus de prise en compte des effets de contexte (culturel, sociolinguistique, écologique, historique, didactique) dans l’enseignement et l’apprentissage. Ces effets se caractérisent par un décalage entre, d’une part, les prescrits (programmes, instructions officielles…) et, d’autre part, l’environnement et les conceptions des élèves. L’analyse des processus concernés devrait permettre l’élaboration de modèles opérationnels de contextualisation didactique.
Colloque international Contextualisations didactiques : états des lieux, enjeux et perspectives
Le Gosier, Guadeloupe

hal-01535446
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01535446

Éditeur(s) : HAL CCSD Public Library of Science
Résumé : International audience
The common endosymbiotic Wolbachia bacteria influence arthropod hosts in multiple ways. They are mostly recognized for their manipulations of host reproduction, yet, more recent studies demonstrate that Wolbachia also impact host behavior, metabolic pathways and immunity. Besides their biological and evolutionary roles Wolbachia are new potential biological control agents for pest and vector management. Importantly, Wolbachia-based control strategies require controlled symbiont transfer between host species and predictable outcomes of novel Wolbachia-host associations. Theoretically, this artificial horizontal transfer could inflict genetic changes within transferred Wolbachia populations. This could be facilitated through de novo mutations in the novel recipient host or changes of haplotype frequencies of polymorphic Wolbachia populations when transferred from donor to recipient hosts. Here we show that Wolbachia resident in the European cherry fruit fly, Rhagoletis cerasi, exhibit ancestral and cryptic sequence polymorphism in three symbiont genes, which are exposed upon microinjection into the new hosts Drosophila simulans and Ceratitis capitata. Our analyses of Wolbachia in microinjected D. simulans over 150 generations after microinjection uncovered infections with multiple Wolbachia strains in trans-infected lines that had previously been typed as single infections. This confirms the persistence of low-titer Wolbachia strains in microinjection experiments that had previously escaped standard detection techniques. Our study demonstrates that infections by multiple Wolbachia strains can shift in prevalence after artificial host transfer driven by either stochastic or selective processes. Trans-infection of Wolbachia can claim fitness costs in new hosts and we speculate that these costs may have driven the shifts of Wolbachia strains that we saw in our model system.
ISSN: 1932-6203

hal-01544765
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01544765
DOI : 10.1371/journal.pone.0082402

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
L'émergence des nouveaux moyens de communication tels que les blogs, les journaux en ligne ou les réseaux sociaux nous permettent d'aller plus loin dans la compréhension des comportements humains. En effet, ces espaces d'échange publiques sont aujourd'hui fermement ancrés dans nos sociétés modernes et s'avèrent être de puissants capteurs des comportements sociaux et des mouvements d’opinions. Dans ce travail, nous nous intéressons à la diffusion d'informations et cherchons à comprendre quelles sont les conditions dans lesquelles une personne décide de s'exprimer sur un sujet. Nous proposons pour cela un ensemble de mesures qui visent à caractériser les comportements de diffusion. Nos mesures ont été utilisées sur les messages liés à deux événements ayant eu lieu au mois de Janvier 2015: la présentation par Microsoft d'un nouveau casque de réalité virtuelle et l'élection d'un parti politique de gauche radical en Grèce.
Les écosystèmes numériques et la démocratisation informationnelle : Intelligence collective, Développement durable, Interculturalité, Transfert de connaissances
Schoelcher, France

Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess
hal-01258322
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01258322
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01258322/document
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01258322/file/Erick%20STATTNER.pdf

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
This research aim focused onthe interpretation of the action of pupils for two school professors in mathematics and in physical education. The research is in the field of work concerned with the process of didactic contextalisation (Delcroix, Forissier, Anciaux, 2012). It also mobilizes process of the comparative approach (Mercier, Schubauer-Leoni et Sensevy, 2002). Data processed within the limits of this communication were collected by interview of self-confrontation. The results are used to model the interpretive filters according to three axes: the practical epistemology of the professor through the categories of Shulman (1987), forms of inference employed and his organization. Our study allows us to confront, in this model, the specifics or generics, fruits of disciplinary didactics to the effects of the didactic contextualization. We note that the use of contextualization seems to act as a filter (regardless of the teacher or the discipline concerned) constitutive of a profile kind (in the sense of Clot). Finally, at the end of this research, we discuss the contribution of this type of study for the training of teachers by querying the aspect built of these filters in action-context interaction and by validating the legitimacy of this question: "What is happening in the minds of the students"?Clot, Y. et Faïta, D. (2001). Genre et style en analyse du travail. Concepts et méthodes, Travailler, 6, 7-42Delcroix, A., Forissier, T., & Anciaux, F. (2012). Vers un cadre d’analyse opérationnel des phénomènes de contextualisation didactique. Dans F. Anciaux, T. Forissier et LF. Prudent, Contextualisations didactiques (pp. 141-188). Paris : L’harmattan.Mercier, A., Schubauer-Leoni, ML. & Sensevy, G. (2002). Vers une didactique comparée. Revue française de pédagogie, 141, 5-16.Shulman, L. (1987). « Knowledge and teaching : foundations of the new reform ». Harvard Educational Review, vol. 57, n° 1, p. 1-22.
The Caribbean Academy of Sciences 20th GENERAL MEETING AND BIENNIAL CONFERENCE
Deshaies, Guadeloupe

hal-01618424
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01618424

Éditeur(s) : HAL CCSD
Colloque Géodésie-Géophysique L'eau dans tous ses états
Paris, France

insu-00373720
https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-00373720

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
Le forum, instrument de communication écrite et collective, asynchrone et à distance fait partie de l’environnement numérique des étudiants avec une visée pédagogique lors des enseignements, mais aussi informative dans les relations avec l’administration. Outil de liaison dans l’éco-système numérique de l’étudiant, il participe de fait à la transmission d’informations académiques de la part de l’institution même en concurrence avec d’autresoutils (Web, réseaux sociaux). Cette communication a pour objectif de dégager le cadre d’usage de cette transmission, les pratiques développées par les usagers concernés, les services administratifs et les étudiants-eux-mêmes et les détournements discursifs opérés. Elle s’attachera à analyser comment l’information se structure et se construit par le biais des différentes interventions et en quoi l’usage des réseaux sociaux détourne en fait l’échange institutionnel mis en place par des forums.
Les écosystèmes numériques et la démocratisation informationnelle : Intelligence collective, Développement durable, Interculturalité, Transfert de connaissances
Schoelcher, France

hal-01268082
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01268082
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01268082/document
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01268082/file/EUTIC_Charnet-2015_ARTICLE%2B.pdf

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley-VCH Verlag
Résumé : International audience
Bacterial biofilm development is conditioned by complex processes involving bacterial attachment to surfaces, growth, mobility, and exoproduct production. The marine bacterium Pseudoalteromonas sp. strain D41 is able to attach strongly onto a wide variety of substrates, which promotes subsequent biofilm development. Study of the outer-membrane and total soluble proteomes showed ten spots with significant intensity variations when this bacterium was grown in biofilm compared to planktonic cultures. MS/MS de novo sequencing analysis allowed the identification of four outer-membrane proteins of particular interest since they were strongly induced in biofilms. These proteins are homologous to a TonB-dependent receptor (TBDR), to the OmpW and OmpA porins, and to a type IV pilus biogenesis protein (PilF). Gene expression assays by quantitative RT-PCR showed that the four corresponding genes were upregulated during biofilm development on hydrophobic and hydrophilic surfaces. The Pseudomonas aeruginosa mutants unable to produce any of the OmpW, OmpA, and PilF homologues yielded biofilms with lower biovolumes and altered architectures, confirming the involvement of these proteins in the biofilm formation process. Our results indicate that Pseudoalteromonas sp. D41 shares biofilm formation mechanisms with human pathogenic bacteria, but also relies on TBDR, which might be more specific to the marine environment.
ISSN: 1615-9853

hal-00864093
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00864093
DOI : 10.1002/pmic.201100644

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Le projet terre-mer METYSS a pour objectif de comprendre les effets immédiats et différés de la Crise de Salinité Messinienne (CSM) ainsi que les relations tectonique et sédimentation sur la marge est-sarde. Cette marge résulte de l'ouverture de la Mer Tyrrhénienne à partir du Tortonien et jusqu'au Messinien (c. 9 à 5 Ma). Des bassins profonds existaient déjà au Messinien dans le domaine tyrrhénien, comme l'atteste l'identification, à partir des données sismiques, d'épaisses séries évaporitiques messiniennes (Gaullier et al., 2009). Le principal canyon creusé dans la marge est connecté en amont avec le golfe d'Orosei, où affleurent à terre les seuls dépôts pliocènes connus. Dans la région d'Orosei, ces dépôts correspondraient donc potentiellement au remplissage de la partie amont des incisions liées à la CSM, lors de la remise en eau de la Méditerranée, comme c'est le cas en de nombreux endroits du pourtour méditerranéen (Clauzon, 1982). Les investigations de terrain MeTySar-2010 montrent que le principal fleuve actuel, le Cedrino, suit le cours d'une paléovallée qui incise le soubassement granitique et ses altérites. Ces dépôts ont été érodés (au Messinien ?) puis remaniés lors d'une transgression marine. Les microfaunes, présentes dans les faciès marins fins, indiquent un âge Pliocène supérieur (Giresse et al., ce congrès). Cette série marine présente des pendages de l'ordre de 20 à 30 ° qui s'organisent selon une direction NNE-SSW, subparallèle aux structures tectoniques majeures associées au rifting de la marge est-sarde. Le basculement des séries pliocènes est scellé par un ensemble de coulées volcaniques dont les plus anciennes sont datées du Quaternaire ancien. La cartographie et la caractérisation des dépôts mettent en évidence un paléo-relief orienté NNE-SSW qui contrôle la répartition des unités sédimentaires. Ces résultats suggèrent que l'activité tectonique post-messinienne participe au contrôle de l'architecture et de la paléogéographie des séries pliocènes dans ce secteur. Aucune trace de dépôts marins du Pliocène Inférieur, ni de Gilbert deltas s.s. n'a été relevée à terre. La transgression observée au Pliocène supérieur sur cette bordure du bassin implique 1) une position haute de la marge au Pliocène inférieur, et 2) une forte subsidence de ce secteur de la marge au Pliocène moyen. Cette subsidence serait la conséquence de l'activité tectonique post-rift, par ailleurs mise en évidence en mer grâce à deux campagnes récentes (METYSS 1 et 3, Gaullier et al., ce congrès).
13ème Congrès Français de Sédimentologie
Dijon, France

hal-00657307
https://hal-brgm.archives-ouvertes.fr/hal-00657307

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
L'Angélique (Dicorynia guianensis Amsh.) représente environ 35% de laproduction de bois d'oeuvre en Guyane. Cependant, la stratégie de duraminisationdite ‘tardive’ chez cette essence entraîne une grande variabilité de l'épaisseurd'aubier (Fig. 1A) et par conséquent, influence la proportion exploitable de lagrume. La relation entre quantité de bois de coeur et diamètre à 1m30 (DBH) (e.g.Carrodus (1972), Wilkes (1991), Pinto et al. (2004), Wang et al. (2010)), ne permetpas une estimation suffisamment précise de la quantité de duramen et/ou d’aubier.A ce jour, très peu d’études mettent en lien la structure de la couronne et/ou lestatut social de l’individu avec la quantité de duramen (e.g. Pazdrowski et al.(2009), Nawrot et al. (2008)). Or, une grande diversité de structures des couronnesest observable au sein d’une même classe de diamètre (Fig. 1B).Ici, nous proposons une méthode visuelle et rapide de diagnostic architectural desarbres permettant d’améliorer l’estimation de la quantité de duramen dans letronc.
Les 2èmes Journées scientifiques du GDR 3544 « Sciences du bois »
Champs sur Marne, France

Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess
hal-01215800
https://hal-sde.archives-ouvertes.fr/hal-01215800
https://hal-sde.archives-ouvertes.fr/hal-01215800/document
https://hal-sde.archives-ouvertes.fr/hal-01215800/file/Poster%20R.%20Lehnebach%20-%20GDR%20Bois%202013%20Structure%20couronne%20et%20variation%20de%20l%E2%80%99%C3%A9paisseur%20et%20surface%20aubier%20Ang%C3%A9lique.pdf

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé :  
In tropical rainforests, the origin of the interspecific variability in trunk CO2 efflux (Et) and of seasonal variations in Et have not yet been explained. We conducted a study to test which biotic and abiotic determinants would contribute to these variations. Et and a set of wood anatomical and functional characteristics were measured on trees in two habitats (Terra Firme forest vs. seasonal flooded forest) in a Neotropical rainforest over a 18-months' period including a range of climatic and soil water conditions. The large variability in Et (0.33 to 3.15 μmol CO2 m-2 s-1 in Terra Firme forest) was associated with tree diameter and growth respiration (Eg), although maintenance respiration (Em) was the main component of Et. Neither wood properties nor sapflow density were correlated with trunk CO2 efflux. The large seasonal variations in Et were correlated with diameter growth and surface soil water content (SWC). These data underlined the absence of clearly identified biotic determinants, beside growth, to explain the interspecific variability in Et. We emphasized the fast response of growth and maintenance respiration processes to seasonal variations in SWC that potentially has consequences on the carbon cycle in the ecosystem under upcoming climatic changes.
23. New Phytologist Symposium. Carbon cycling in tropical ecosystems
Guangzhou, China

hal-01032199
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032199

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
Mass balances are often used to calculate sediment fluxes in sedimentary basins and denudationrates in adjacent topographies on intermediate to long timescales (from a few tens ofthousand to a million years). In this study, we focus on simple Quaternary catchment–alluvialfan systems in the northern Tian Shan Range and its foreland basin to discuss some ideasabout sediment production, storage, release, and bypass in relatively short (100 km long) sedimentrouting systems. Based on a geometrical reconstruction of the fans, we estimated thevolumes of sediments exported out of the range and deposited in its alluvial piedmont duringthe Middle-Late Pleistocene and the Holocene. This work shows that the two areas clearlypresent evidence of a temporary but significant storage of sediments during the Pleistocene.These sediments were then excavated and delivered farther into the foreland basin during theHolocene. The difference between the volumes of materials released from the range and piedmontareas and the volume stored in the contemporaneous fans downstream indicates thatthe latter did not trap the whole sediment load transported by the rivers. The alluvial fans werebypassed by 27 to 78% of this load toward the downstream alluvial plain. It implies a majorvolumetric partitioning of the deposits between the fans and the alluvial plain, with a sedimentationrate about twenty times higher in the fans than in the plain. However, this volumetricpartitioning might only occur during periods with a very specific hydrological regime suchas the Holocene deglaciation. Eventually, the peculiar sediment storage and release patternwithin the range and piedmont areas during the Pleistocene and Holocene complicates thecalculation of mean paleodenudation rates using either sediment budgets or in situ producedcosmogenic nuclides.
Source to Sink: a long term perspective of sediment budgets and sources characterization, Abstracts
Rennes, France

insu-01406440
https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-01406440

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley-Blackwell
Résumé : International audience
P>Most fault-related pseudotachylytes in the Val Sesia area, Ivrea zone, NW Italian Alps, occur in two areas: near the Canavese Line in the Kinzigite Formation paragneisses and in an elongate belt in the Mafic Complex gabbros away from the Canavese Line. Ar-40/Ar-39 dating indicates that pseudotachylytes from the Kinzigite Formation were formed in the late Eocene, likely during the early stages of the collision between the NW corner of the Adriatic indenter and the European margin. Pseudotachylytes from the Mafic Complex were formed under a transpressive strain regime, as suggested by kinematic indicators, and yield Early Cretaceous (Albian) Ar-40/Ar-39 ages. Their formation is possibly related to shortening during the inception of the tectonic inversion of the Adriatic passive margin.
ISSN: 0954-4879

hal-00617518
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00617518
DOI : 10.1111/j.1365-3121.2011.00994.x

Éditeur(s) : HAL CCSD Public Library of Science
Résumé : International audience
The outer membrane proteins (OMPs) of Gram-negative bacteria play a crucial role in virulence and pathogenesis. Identification of these proteins represents an important goal for bacterial proteomics, because it aids in vaccine development. Here, we have developed such an approach for Ehrlichia ruminantium, the obligate intracellular bacterium that causes heartwater. A preliminary whole proteome analysis of elementary bodies, the extracellular infectious form of the bacterium, had been performed previously, but information is limited about OMPs in this organism and about their role in the protective immune response. Identification of OMPs is also essential for understanding Ehrlichia’s OM architecture, and how the bacterium interacts with the host cell environment. First, we developed an OMP extraction method using the ionic detergent sarkosyl, which enriched the OM fraction. Second, proteins were separated via one-dimensional electrophoresis, and digested peptides were analyzed via nano-liquid chromatographic separation coupled with mass spectrometry (LCMALDI-TOF/TOF). Of 46 unique proteins identified in the OM fraction, 18 (39%) were OMPs, including 8 proteins involved in cell structure and biogenesis, 4 in transport/virulence, 1 porin, and 5 proteins of unknown function. These experimental data were compared to the predicted subcellular localization of the entire E. ruminantium proteome, using three different algorithms. This work represents the most complete proteome characterization of the OM fraction in Ehrlichia spp. The study indicates that suitable subcellular fractionation experiments combined with straightforward computational analysis approaches are powerful for determining the predominant subcellular localization of the experimentally observed proteins.We identified proteins potentially involved in E. ruminantium athogenesis, which are good novel targets for candidate vaccines. Thus, combining bioinformatics and proteomics, we discovered new OMPs for E. ruminantium that are valuable data for those investigating new vaccines against this organism. In summary, we provide both pioneering data and novel insights into the pathogenesis of this obligate intracellular bacterium.
ISSN: 1932-6203

hal-01203402
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01203402
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01203402/document
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01203402/file/2015_Moumene_PLOSONE-1.pdf
DOI : 10.1371/journal.pone.0116758

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
In this paper, we use a multifractal approach based on the computation of two spectrums for image analysis and texture segmentation problems. The two spectrums are the Legendre Spectrum, determined by classical methods, and the Large Deviation Spectrum, determined by kernel density estimation. We propose a way for the fusion of these two spectrums to improve textured image segmentation results. An unsupervised k-means is used as clustering approach for the texture classification. The algorithm is applied on mosaic image built using IKONOS images and various natural textures from the Brodatz album. The segmentation obtained with our approach gives better results than the application of each spectrum separately.
CIARP Proceedings
Cancun, Mexico

hal-00602268
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00602268

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
The fusion of regions from segmentation is often a required step in order to analyze objects in the scene. It allows to group under a same closure property the partitions of an image, which denote the same object. In this way, several studies have been made. Most of the algorithms are based on global information to evaluate the relevance of region combinations and fusion. In this paper, we propose a merging process based on Gestalt vision's theory. The particularity of our method is to preserve photographer's region of interest thanks to the definition of a new criterion based on Di Zenzo gradient. Thus, region fusion preserves photographer's relevant objects of the scene. The performance of the proposed method is evaluated using various natural images, including Berkeley image database and its accuracy is shown.
Color and Imaging Conference
San Jose, CA, United States

hal-00637144
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00637144