Éditeur(s) : Cambridge : Harvard University Press
Extrait de : Dry-season studies of cane homoptera at Soledad, Cuba (p. 22)
Résumé : Dessin
Siècle(s) traité(s) : 20
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IHE140100024i1

Éditeur(s) : Université de Guyane GEPOG : Groupe d'Etude et de Protection des Oiseaux de Guyane
Description : Sylvain Uriot présente les caractéristiques et les particularités des rapaces nocturnes de Guyane.

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V16194

Éditeur(s) : ADJC : Ansanm Doctorants Jeunes Chercheurs
Extrait de : 3e journée d'études scientifiques des jeunes doctorants. "Patrimoines naturels, socio-économiques et culturels des territoires insulaires : quel avenir ?", le 17 mai 2017. Université des Antilles
Description : Carine Precheur, docteure en biologie de la conservation à l'Université des Antilles présente ses recherches sur la viabilité de la population des puffins d'Audubon et de la conséquence des changements climatiques sur la survie de ces oiseaux dans la Caraïbe.

Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
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V17144

Éditeur(s) : Université des Antilles AREBio Groupe de recherche BIOSPHERES : BIOlogie, Sciences Physiques & Humaines pour les énergies Renouvelables, l'Environnement & la Santé
Extrait de : 1er colloque international BIOSPHERES, du 18 au 20 juin 2019. Université des Antilles
Description : Les 18,19 et 20 Juin, le groupe de recherche BIOSPHERES (Biologie, Sciences Physiques & Humaines pour les énergies Renouvelables, l'Environnement & la Santé) de l'Université des Antilles Pôle Martinique et l'association AREBio, ont organisé leur 1er Colloque International Biosphères (CIB) destiné à présenter des travaux de recherche en lien avec des thématiques de la santé. Pour cette première édition, ils ont eu le plaisir de recevoir des acteurs venus de la Caraïbe, des Etats-Unis et de l'Hexagone qui ont exposé leurs sujets de recherche autour de quatre grands thèmes : Biodiversité végétale et santé Biodiversité marine et santé Humain/environnement et santé Energie/environnement et économie Ce colloque s'est adressé aussi bien aux universitaires, institutionnels, professionnels de santé, socio-professionnels qu'au grand public. L'occasion a été donnée de mettre en exergue les études actuelles menées sur la connaissance et la valorisation de notre biodiversité en vue de l'élaboration de produits à bénéfice santé, les recherches en cours sur l'impact de substances naturelles nuisibles comme les sargasses ou la chlordécone, ou encore les nouvelles avancées en terme de développement durable pour la préservation de notre santé.

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V19061

Éditeur(s) : GFP : Groupe Français des Pesticides GFP : Groupe Français des Pesticides GFP : Groupe Français des Pesticides GFP : Groupe Français des Pesticides
Extrait de : "Protection des cultures et santé environnementale : héritages et conceptions nouvelles" : congrès, le 26 mai 2014. Université des Antilles et de la Guyane
Résumé : L'intérêt récent des citoyens pour les conséquences des usages passés et actuels des pesticides liés à la forte activité agricole et aux utilisations par les collectivités et les particuliers, a conduit les autorités publiques à donner de nouveaux moyens pour les études scientifiques à la fois sous les aspects analytiques et biologiques. Ainsi des progrès significatifs ont été enregistrés sur la connaissance des expositions, sur les conséquences épidémiologiques, sur la compréhension des mécanismes d'action et des effets des mélanges.
L'intérêt récent des citoyens pour les conséquences des usages passés et actuels des pesticides liés à la forte activité agricole et aux utilisations par les collectivités et les particuliers, a conduit les autorités publiques à donner de nouveaux moyens pour les études scientifiques à la fois sous les aspects analytiques et biologiques. Ainsi des progrès significatifs ont été enregistrés sur la connaissance des expositions, sur les conséquences épidémiologiques, sur la compréhension des mécanismes d'action et des effets des mélanges.
L'intérêt récent des citoyens pour les conséquences des usages passés et actuels des pesticides liés à la forte activité agricole et aux utilisations par les collectivités et les particuliers, a conduit les autorités publiques à donner de nouveaux moyens pour les études scientifiques à la fois sous les aspects analytiques et biologiques. Ainsi des progrès significatifs ont été enregistrés sur la connaissance des expositions, sur les conséquences épidémiologiques, sur la compréhension des mécanismes d'action et des effets des mélanges.
Siècle(s) traité(s) : 21
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V14215
V14215
V14215
V14215
V14215

Éditeur(s) : HAL CCSD American Society for Microbiology
Résumé : International audience
A rapid and specific high-performance liquid chromatography method with UV detection (HPLC-UV) for the simultaneous determination of 12 beta-lactam antibiotics (amoxicillin, cefepime, cefotaxime, ceftazidime, ceftriaxone, cloxacillin, imipenem, meropenem, oxacillin, penicillin G, piperacillin, and ticarcillin) in small samples of human plasma is described. Extraction consisted of protein precipitation by acetonitrile. An Atlantis T3 analytical column with a linear gradient of acetonitrile and a pH 2 phosphoric acid solution was used for separation. Wavelength photodiode array detection was set either at 210 nm, 230 nm, or 298 nm according to the compound. This method is accurate and reproducible (coefficient of variation [CV] < 8%), allowing quantification of beta-lactam plasma levels from 5 to 250 μg/ml without interference with other common drugs. This technique is easy to use in routine therapeutic drug monitoring of beta-lactam antibiotics.
ISSN: 0066-4804

hal-00875271
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00875271
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00875271/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00875271/file/Simultaneous_Determination-accepted.pdf
PUBMED : 21788467

Éditeur(s) : EDP Sciences
Résumé : The reproductive dynamics of swordfish (Xiphias gladius) was investigated from catches of the Reunion Island-based longline swordfish fishery between 19-25 degrees S and 48-54 degrees E. Thus, 1727 swordfish (size range 75-289 cm, lower jaw-to-fork length, LJFL) were sampled on board commercial fishing vessels during the period of May 1998 to January 2001. Reproductive activity was assessed using macroscopic gonad characteristics, trends of gonadal indexes for both sexes, oocyte size-frequency distributions and microscopic investigation of oocyte development stages. Size at first maturity (L-50) for female and male swordfish was estimated in Indian Ocean for the first time. L50 was estimated at 170 cm and 120 cm (LJFL) for females and males, respectively. Spawning occurred from October to April in the vicinity of Reunion Island where sex ratio of caught populations fluctuated seasonally. The seasonal changes in sex ratio and the incidence of larger individuals at the beginning of the spawning season provide some preliminary indications of synchronized movements of swordfish between spawning grounds and neighboring regions. Our results add significantly to knowledge about the reproductive biology of swordfish in the southwestern Indian Ocean. An overview of the available information on reproductive biology and dynamics of swordfish in Indian Ocean and eastern Pacific indicated that spawning activity is localized in discrete areas, and showed that there is incomplete information on spawning grounds in this extended area.
La dynamique de la reproduction est étudiée chez des espadons (Xiphias gladius) capturés dans l'océan Indien, entre 19–25 °Sud et 48–54 °Est, par les palangriers de l'île de La Réunion. Ainsi, 1727 espadons de tailles comprises entre 75 et 289 cm (de l'extrémité de la mâchoire inférieure à la fourche caudale) ont été échantillonnés à bord de navires professionnels, de mai 1998 à janvier 2001. La reproduction est évaluée en analysant : les caractéristiques macroscopiques des gonades, l'évolution des indices gonadiques des deux sexes, les distributions de fréquence de taille des ovocytes et le développement des ovocytes au niveau microscopique. La taille à première maturité sexuelle (L50) des espadons de l'océan Indien est estimée pour la première fois ; elle atteint 170 cm pour les femelles et 120 cm pour les mâles. La saison de ponte s'étend d'octobre à avril aux abords de l'île tandis que le sexe-ratio fluctue de façon saisonnière. Les variations saisonnières du sexe-ratio et l'apparition de grands individus au début de la saison de ponte suggèrent des déplacements d'espadons entre cette zone de ponte et les régions voisines. Nos résultats apportent des informations fondamentales sur la biologie de la reproduction de l'espadon dans le sud-ouest de l'océan Indien. L'analyse de la bibliographie concernant biologie et la dynamique de la reproduction de l'espadon dans l'océan Indien et dans le Pacifique Est indique que l'activité de ponte est très localisée et que la connaissance des aires de pontes est encore incomplète dans cette région étendue.
Aquatic Living Resources (0990-7440) (EDP Sciences), 2009 , Vol. 22 , N. 1 , P. 45-58

Droits : 2009 EDP Sciences
http://archimer.ifremer.fr/doc/2009/publication-6353.pdf
DOI:10.1051/alr/2009007
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6353/

Éditeur(s) : CRPLC : Centre de Recherche sur les Pouvoirs Locaux dans la Caraïbe
Extrait de : "Gouvernance du développement durable et de la biodiversité" : séminaire, le 26 avril 2013. Université des Antilles et de la Guyane
Siècle(s) traité(s) : 21
Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
Permalien : http://www.manioc.org/fichiers/V13226
V13226

Éditeur(s) : GFP : Groupe Français des Pesticides
Extrait de : "Protection des cultures et santé environnementale : héritages et conceptions nouvelles" : congrès, le 26 mai 2014. Université des Antilles et de la Guyane
Description : Le flétrissement bactérien (Ralstonia solanacearum) est une maladie dévastatrice des cultures maraîchères qui sévit principalement en zone tropicale. En Martinique, le flétrissement bactérien affecte les solanacées (tomate) et les cucurbitacées. La situation phytosanitaire est aggravée par la dissémination de l'écotype émergent de R. solanacearum (Phyl IIB/seq4NPB) qui contourne les principales sources de résistance des solanacées. Les stratégies de lutte contre cette maladie doivent être envisagées en combinant différentes méthodes (prophylactiques et culturales). De nombreuses études font état du potentiel des Alliacées en tant que plantes biofumigantes et assainissantes. Le potentiel de biodésinfection des sols avec Allium fistulosum (cive antillaise) a été étudié en conditions contrôlées via son utilisation sous forme d'extraits naturels et en conditions réelles via son introduction en précédent cultural. Cette étude révèle que la biodésinfection des sols maraîchers avec l'oignon-pays est une méthode de biocontrôle efficace pour la gestion du flétrissement bactérien de la tomate à la Martinique.
Siècle(s) traité(s) : 21
Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
Permalien : http://www.manioc.org/fichiers/V14246
V14246

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag
Résumé : International audience
PURPOSE: Dairy farming is a risk factor for the development of chronic obstructive pulmonary disease (COPD). We assessed the prevalence of farming-induced COPD (FI-COPD) using a new screening device, and we analyzed symptoms and occupational risk factors. METHODS: We performed on-site screening study of bronchial obstruction using an electronic mini-spirometer (EMS) on an entire population of dairy farmers (n = 147) from two villages in Brittany, France. Suspected bronchial obstruction (FEV1/FEV6 <0.8) was confirmed with standardized lung function tests (FEV1/FVC ≤0.7). We assessed past medical histories, respiratory symptoms, and occupational tasks of subjects with bronchial obstruction; asthmatics were defined as atopic and/or reversible; smoking-induced COPD patients were defined as non-reversible, non-atopic with smoking histories (≥5 PY); and FI-COPD patients were defined as non-reversible, non-atopic, and non-smokers. RESULTS: Using the EMS, 30.6% (n = 45) of dairy farmers were suspected of bronchial obstruction and underwent standardized spirometry. The FEV1/FEV6 ratio and FEV1/FVC ratio were in good agreement (r² = 0.66, P < 0.0001). The prevalence of confirmed bronchial obstruction was 9.5% (n = 14), which included 4 asthmatics, 3 smoking-induced COPD subjects, and 7 FI-COPD subjects. All the COPD patients were GOLD Stage II, and none were aware of their respiratory disease. Foddering duration was significantly higher in FI-COPD subjects compared with non-obstructive subjects, with 44 versus 17 min/day, respectively. CONCLUSIONS: The EMS was a convenient mean of screening for bronchial obstruction, especially in on-site settings, and allowed us to diagnose FI-COPD in a non-spontaneously complaining dairy farmer population. Foddering was considered a significant risk factor.
ISSN: 0340-0131

hal-00872929
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00872929
DOI : 10.1007/s00420-011-0708-6
PUBMED : 21986906

Éditeur(s) : CRILLASH : Centre de Recherches Interdisciplinaires en Lettres, Langues, Arts et Sciences Humaines
Extrait de : "Patrimonialisation et développement dans la Caraïbe et les Amériques" : colloque international, du 2 au 4 mars 2011. Université des Antilles et de la Guyane
Description : Parmi les processus de patrimonialisation, l'intelligibilité et la connaissance du passé révèle des formes par lesquelles une nation et un état se projette dans l'avenir. Ce fût ainsi le cas pour le site de Teotihuacán au Mexique où à l'aide d'une archéologie systématique, des politiques ont conforté l'identité mexicaine en la réconciliant avec sa genèse. En effet, des courants intellectuels pensent déterminer et améliorer les relations entre territoires et populations par l'anthropologie, la géographie et la biologie.
Siècle(s) traité(s) : 20
Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
Permalien : http://www.manioc.org/fichiers/V12040
V12040

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag
Résumé : International audience
The purpose of this investigation was to characterize the management and prognosis of severe Pneumocystis jirovecii pneumonia (PJP) in human immunodeficiency virus (HIV)-negative patients. An observational cohort study of HIV-negative adults with PJP documented by bronchoalveolar lavage (BAL) through Gomori-Grocott staining or immunofluorescence, admitted to one intensive care unit (ICU) for acute respiratory failure, was undertaken. From 1990 to 2010, 70 patients (24 females, 46 males) were included, with a mean age of 58.6 ± 18.3 years. The mean Simplified Acute Physiology Score (SAPS)-II was 36.9 ± 20.4. Underlying conditions included hematologic malignancies (n = 21), vasculitis (n = 13), and solid tumors (n = 13). Most patients were receiving systemic corticosteroids (n = 63) and cytotoxic drugs (n = 51). Not a single patient received trimethoprim-sulfamethoxazole as PJP prophylaxis. Endotracheal intubation (ETI) was required in 42 patients (60.0 %), including 38 with acute respiratory distress syndrome (ARDS). In-ICU mortality was 52.9 % overall, reaching 80.9 % and 86.8 %, respectively, for patients who required ETI and for patients with ARDS. In the univariate analysis, in-ICU mortality was associated with SAPS-II (p = 0.0131), ARDS (p < 0.0001), shock (p < 0.0001), and herpes simplex virus (HSV) or cytomegalovirus (CMV) on BAL (p = 0.0031). In the multivariate analysis, only ARDS was associated with in-ICU mortality (odds ratio [OR] 23.4 [4.5-121.9], p < 0.0001). PJP in non-HIV patients remains a serious disease with high in-hospital mortality. Pulmonary co-infection with HSV or CMV may contribute to fatal outcome.
ISSN: 0934-9723

inserm-00872789
http://www.hal.inserm.fr/inserm-00872789
DOI : 10.1007/s10096-012-1730-7
PUBMED : 22930407

Éditeur(s) : Université du Littoral Côte d'Opale (Dunkerque)
Résumé : In the Bay of Biscay and Celtic Sea waters, hake is considered as genetically homogeneous and form a unique stock with identical meristic characteristics. The vertebral mean vary from 50,68 (vertebrae) during the first year of life to 51,11 (vertebrae) for adults. 0-group Merluccius display a rapid growth with significant interannual variability (0.71 mm.day-1 in 2001 versus 0.74 mm.day-1 in 2002). The spawning period occurs in April and the average length on the firth January following the hatching is of 17.3 cm (first seasonal check / increment on the sagittal otolith is located about 0.143 cm from the nucleus). At the end of the first year of life the average length is about 24 cm. The longevity of the species is important and growth parameters (L = 138,24 cm ; K = 0,132) explain natural mortality coefficient of M = 0.21. No difference for growth between male and female has been observed for this stock. The ratio total weight / eviscerated weight is equal to Fc = 1,086. Both male and female have same spatial and bathymetric distribution. Juveniles are found in deep waters (< 17 cm length) and move to coastal waters where they display an average length of (33 cm length). Longer individuals are found in nursery areas where they feed and grow then move to deeper areas to spawn. Nursery areas are numerous and located in the Celtic Sea and in the bay of Biscay. In the bay of Biscay, disturbances resulted from hydrondynamics affect the settlement on the nursery grounds particularly in the southern part of the bay. Diet composition varies with age. Juveniles feed mainly on crustaceans (Euphausia kroni). At the length of 23 cm, individuals feed strictly on fishes. Sizes of preys are proportional with sizes of predators and preys are composed mainly of species that feed and reproduce close to the bottom. Cannibalism has been observed for this specie, and increases with age notably in the northern part of the bay of Biscay and in the Celtic Sea. Main preys are 0-group juveniles. This specie is assumed to be a passive predator catching its preys when they come to feed in the bottom. Although they are punctual, these results have been obtained after studies on the evolution of sizes during the first year of life (daily increments measurements) and on the spawning period parameters (back-calculating). Average length on the firth January following hatching and the position of the first seasonal check on the otolith are based on observations of the sizes on the firth January following hatching (obtained with growth rates and spawning period parameters). The results are similar to those described in previous studies, nevertheless they have to be confirmed with growth and diet composition analyses. A long term study appear essential to determine biological and ecological parameters of this species for sustainable management of the stock.
Les alertes quant à la surexploitation du stock de merlu européen sont nombreuses et récurrentes. Seulement l'estimation du niveau réel de l'état du stock a toujours posé des problèmes du fait de certaines lacunes dans la connaissance de la biologie et de l'écologie de cette espèce. Dans les eaux du golfe de Gascogne et de la mer Celtique, le merlu européen fait partie de la même population génétique et possède les mêmes caractéristiques meristiques. Sa moyenne vertébrale est de 50,68 durant sa première année de vie et évolue pour se stabiliser à 51,11 chez l'adulte. La croissance du merlu durant sa première année de vie et très rapide mais présente une variabilité interannuelle significative (0,71 mm .J-1 en 2001 et 0,74 mm .J-1 en 2002). Sa période de ponte maximale se déroule au mois d'avril et sa longueur au premier janvier suivant sa naissance est de 17,3 cm (la première marque hivernale est positionnée à 0,143 cm du nucléus de la sagittae). Au terme de sa première année de vie le merlu atteint une longueur de 24 cm. Sa longévité est assez longue (23 ans environ) et ses paramètres de croissance (L = 138,24 cm ; K = 0,132) permettent d'estimer son coefficient de mortalité naturelle à M = 0,21. Il n'a pas été établi de croissance différentielle entre sexe chez le merlu dans ces eaux. Le rapport poids total / poids éviscéré a été estimé à Fc = 1,086. Mâles ou femelles, les merlus ont une même répartition spatiale et bathymétrique. En général, ils sont très profonds à leurs stades juvéniles (< 17 cm) et ils se dirigent vers les eaux côtières pour les atteindre à 33 cm de longueur environ. Au-delà de cette taille, les merlus se concentrent au niveau des zones de nourricerie pour s'y alimenter avant de rejoindre les eaux plus profondes pour y pondre. Les zones de nourricerie du merlu sont très nombreuses et sont localisées en mer Celtique et dans le golfe de Gascogne aussi bien dans sa partie sud que dans sa partie nord. Les perturbations importantes dans l'hydrodynamisme du golfe de Gascogne (upwelling) semble influencer les niveaux de colonisation des zones de nourricerie notamment celles situées dans la partie sud du golfe. Le régime alimentaire du merlu évolue avec l'âge. Juvénile, il se nourrit principalement de crustacés (Euphausia krohni) et devient ichtyophage exclusif dès 23 cm de longueur. Le cannibalisme est une réalité chez le merlu et les merlus-proies sont les juvéniles du groupe d'âge G-0. Il s'intensifie avec l'âge notamment dans la partie nord du golfe de Gascogne et en mer Celtique ; Il est très faible dans le sud du golfe de Gascogne. La taille des proies évolue avec la taille du merlu et les poissons proies sont en général des espèces qui vont se nourrir ou se reproduire sur le fond. Ce comportement alimentaire fait que le merlu est un prédateur peu actif et qui attaque ses proies lorsqu'elles viennent sur le fond. Ces résultats, bien qu'ils ne soient que ponctuels, ont été obtenus après avoir déterminé le schéma d'évolution de la longueur du merlu durant sa première année de vie (dénombrement des accroissement journaliers) et des paramètres de sa période de ponte (rétro-calcul).La taille au premier hiver et la position de la première marque hivernale ont été déterminées en relativisant nos observations à l'estimation de la longueur du merlu au premier janvier suivant sa naissance : celle-ci étant obtenue en utilisant le taux de croissance et les paramètres de la période de ponte. Bien que l'ensemble des résultats obtenus, en ce qui concerne la répartition spatiale et les données sur la période de ponte, soient généralement conformes à ceux décrits dans la littérature, il est nécessaire de confirmer ceux concernant la croissance et le régime alimentaire. Pour cela, une étude à plus long terme semble indispensable pour parvenir à bien maîtriser l'ensemble des paramètres de biologie et d'écologie du merlu permettant ainsi une meilleure gestion de son stock.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2004/these-1247.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1247/

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag
Résumé : International audience
The objective of this study is to assess the association of clinical manifestations of systemic sclerosis (SSc) with the absolute count of circulating blood monocyte subpopulations according to their membrane expression of CD16. Forty-eight consecutive patients fulfilling the 2013 ACR/EULAR classification criteria for SSc were included in this cross-sectional study. CD16+ monocyte absolute count was defined by flow cytometry and confronted to the clinical characteristics of SSc patients. Twenty-three healthy donors (HD) were randomly selected for comparison. SSc patients had an increased number of total circulating blood monocytes compared to HD (p < 0.001). The CD16- subpopulation absolute count was increased in SSc patients compared to HD (p < 0.001) but was similar in limited SSc (lSSc) and diffuse SSc (dSSc). On the contrary, the CD16+ population absolute count was increased in dSSc compared to both HD and lSSc patients (dSSc 0.071 Giga/L (+/- 0.034) vs HD 0.039 Giga/L (+/- 0.030), p < 0.01, and dSSc 0.071 Giga/L (+/- 0.034) vs lSSc 0.048 Giga/L (+/- 0.024), p < 0.05). The CD16+ monocyte subpopulation absolute count was significantly correlated with the severity of skin fibrosis evaluated by the modified Rodnan skin score (p < 0.001). The CD16+ monocyte subpopulation was also associated with pulmonary fibrosis (p < 0.05), with the severity of the restrictive ventilatory defect evaluated by total lung capacity (p < 0.05) and with the pulmonary function impairment reflected by diffusing capacity of the lungs for carbon monoxyde measures (p < 0.01). These results suggest that CD16+ monocytes are associated with the main fibrotic manifestations of SSc and their role in the pathogenesis of fibrosis in this autoimmune disorder should therefore be further considered.
ISSN: 0770-3198

hal-01560150
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01560150
DOI : 10.1007/s10067-017-3597-6
PUBMED : 28293753

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag
Résumé : International audience
Bronchoalveolar lavage (BAL) is a major diagnostic tool in lung diseases, including viral respiratory infections. We aimed to better define the situations where viral tests should be performed on BAL fluid (BALF). We retrospectively studied all cases where viral tests [immunofluorescence, immunocytochemistry, viral culture, and/or polymerase chain reaction (PCR)] were performed on BALF during a period of 1 year (2008) in our institution. We compared the characteristics of patients with virus-positive versus virus-negative BALF. Of the 636 BALF samples sent to the microbiology laboratory, 232 underwent viral tests. Of these, 70 (30 %) were positive and identified 85 viruses: herpes simplex virus (HSV)-1 (n = 27), cytomegalovirus (CMV, n = 23), Epstein-Barr virus (EBV, n = 18), human herpesvirus (HHV)-6 (n = 12), respiratory syncytial virus (RSV, n = 3), rhinovirus (n = 1), and adenovirus (n = 1). The variables associated with positive viral tests on univariate analysis were immunosuppression [human immunodeficiency virus (HIV), corticosteroids >10 mg/day for ≥3 weeks, or other immunosuppressive therapy], ground-glass attenuations on computed tomography (CT) scanning, late-onset ventilator-associated pneumonia (VAP), and durations of (i) hospital stay, (ii) intensive care unit (ICU) stay, and (iii) mechanical ventilation before BAL (p < 0.01 for each comparison). On multivariate analysis, only immunosuppression [odds ratio (OR) 6.4, 95 % confidence interval (CI) [2.8-14.3], p < 0.0001] and ground-glass attenuations (OR 3.7, 95 % CI [1.8-7.7], p = 0.0004) remained associated with virus-positive BAL. None of the viral tests performed on BALF for the initial assessment of diffuse infiltrative lung disease (n = 15) was positive. PCR improved the diagnostic yield of viral tests on BALF by 50 %. Testing for viruses on BALF should be mostly restricted to immunocompromised patients with acute respiratory diseases and/or patients with unexplained ground-glass attenuations on CT scanning.
ISSN: 0934-9723

hal-00873158
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00873158
DOI : 10.1007/s10096-012-1791-7
PUBMED : 23238685

Résumé : Les ressources récifales et côtières du plateau insulaire de la Martinique subissent une pression anthropique croissante et ne sont plus en mesure d'assurer un revenu suffisant aux pêcheurs professionnels. La présente étude a pour objectif d'accompagner le redéploiement de l'activité de la flottille martiniquaise de proximité vers l'exploitation des ressources en grands poissons pélagiques à l'aide de dispositifs de concentration de poissons (DCP), sans imposer un changement d'échelle des unités d'exploitation. Les travaux sont développés selon deux axes complémentaires (i) l'amélioration technologique des DCP, (ii) une meilleure connaissance de la biologie des grands poissons pélagiques exploitables dans la zone d'activité de la flottille. La modélisation du comportement des DCP sous l'action des courants, complétée par un suivi technologique en mer, permet de faire progresser la conception des dispositifs ancrés et d'accroître leur durée de vie. Les pêches expérimentales ont révélé la présence de ressources accessibles pour les petites unités de pêche, durant de longues périodes au cours de l'année: l'espadon (Xiphias gladius), le thon noir adulte (Thunnus atlanticus), l'albacore (Thunnus albacares). Elles ont permis de mieux définir les moyens de capture à mettre en œuvre pour leur exploitation. En complément des résultats obtenus sur la technologie des DCP et sur la biologie des espèces agrégées, cette étude permet d'identifier des priorités de recherche dans les différents domaines abordés. Ces priorités ont été discutées au niveau international dans le cadre du colloque "Pêche thonière et DCP" organisé en Martinique à l'issue du programme. Parmi ces priorités, l'étude du comportement agrégatif des principales espèces d'intérêt halieutique permettrait une meilleure évaluation de l'impact biologique des DCP (piège écologique). Une attention particulière a été portée, tout au long du programme, au transfert des résultats vers la profession afin d'assurer l'appropriation rapide de la technique par la flottille concernée et de faciliter la mise en œuvre d'une exploitation durable des ressources partagées avec les états voisins de la Caraïbe.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00128/23907/21851.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00128/23907/

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
The aim of this study was to establish a new QuEChERS (quick, easy, cheap, effective, rugged and safe) method coupled to gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) detection for the evaluation of the pesticide biodistribution in specific maternal and fetal tissues. This method was validated for the quantification of pesticides such as chlorotriazines (atrazine, simazine and propazine), their chlorinated metabolites (DIA, DEA and DACT). This new QuEChERS method was developed to facilitate extraction from small tissues such as fetal tissues (mean value: 200mg). The limits of detection, quantification, recovery, precision and accuracy were evaluated for different tissues (liver and brain) and blood. LOD and LOQ ranged between 0.34 and 3.27 ng/g and 1.04 to 9.91 ng/g, respectively. Recovery exceeded 80% for all pesticides, except DACT, with an associated RSD<15%. Precision and accuracy satisfied the criteria usually applied in the validation of bioanalytical methods. The results obtained indicate that this technique is suitable for use in studies of the biodistribution of pesticides in fetal tissues and can be used to evaluate the risk of exposure to pesticides during gestation.
ISSN: 0731-7085

hal-01122837
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01122837
PUBMED : 25497890
DOI : 10.1016/j.jpba.2014.10.035

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
29 inorganic compounds (Al, As, B, Ba, Be, Bi, Ca, Cd, Ce, Co, Cr, Cu, Fe, Gd, K, Mg, Mn, Mo, Na, Nd, Ni, Pb, Sb, Se, Sr, Ti, U, V and Zn) were measured in the tap water of 484 representative homes of children aged 6 months to 6 years in metropolitan France in 2008-2009. Parents were asked whether their children consumed tap water. Sampling design and sampling weights were taken into account to estimate element concentrations in tap water supplied to the 3,581,991 homes of 4,923,058 children aged 6 months to 6 years. Median and 95th percentiles of concentrations in tap water were in mu g/L: Al: <10, 483, As: 02, 2.1; B: <100, 100; Ba: 30.7, 149.4; Ca: 85,000, 121,700; Cd: <0.5, <0.5; Ce: <0.5, <0.5; Co: <0.5, 0.8; Cr: <5, <5; Cu: 70, 720; K: 2210, 6740; Fe: <20, 46; Mn: <5, <5; Mo: <0.5,1.5; Na: 14,500, 66,800; Ni: <2,10.2; Mg: 6500,21,200; Pb: <1, 5.4; Sb: <0.5, <0.5; Se: <1, 6.7; Sr: 256.9, 1004; TI: <0.5, <0.5; U: <0.5, 2.4; V: <1, 1; Zn; 53, 208. Of the 2,977,123 young children drinking tap water in France, some were drinking water having concentrations above the 2011 World Health Organization drinking water quality guidelines: respectively 498 (CI 95%: 0-1484) over 700 mu g/L of Ba; 121,581 (CI 95%: 7091-236,070) over 50 mg/L of Na; 2044 (CI 95%: 0-6132) over 70 mu g/L of Ni, and 78,466 (17,171-139,761) over 10 mu g/L of Pb. Since it is representative, this tap water contamination data can be used for integrated exposure assessment, in conjunction with diet and environmental (dust and soil) exposure data. (C) 2016 Elsevier Ltd. All rights reserved.
ISSN: 0160-4120

hal-01390976
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01390976
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01390976/document
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01390976/file/Le%20Bot%202016%20EI%20revision1%20.pdf
DOI : 10.1016/j.envint.2016.06.009

Éditeur(s) : HAL CCSD Lippincott, Williams & Wilkins
Résumé : International audience
Among 103 patients with multidrug-resistant HIV who initiated raltegravir, etravirine, and darunavir/ritonavir-containing regimen in the ANRS 139 TRIO trial, 100 participated in extended follow-up and continued study treatment until week 96. Among them, 87 (87%) received an optimized background therapy including either nucleoside reverse transcriptase inhibitors or enfuvirtide, they were 78 (78%) at week 96. At week 96, 88% achieved durable virologic response (<50 copies/mL). CD4 response was maintained (median change of +150 cells/mm(3)). No major toxicity was reported. This triple drug combination showed sustained efficacy and thus should be strongly considered for patients with multiclass-resistant virus.
ISSN: 1525-4135

hal-00875207
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00875207
DOI : 10.1097/QAI.0b013e31824bb720
PUBMED : 22293546

Éditeur(s) : Université de Bretagne Occidentale
Résumé : Study of mineral suspended particulate matter (SPM) is essential to understand ecosystem dynamics. SPM influences light penetration which is closely related to primary production and carries pollutants and nutrients within the water masses. This work aims to study near-surface mineral SPM dynamics in the English Channel using two complementary methods: remote-sensing by satellites and numerical modelling. Firstly, MODIS and MERIS satellite images processed by the IFREMER semi-analytical algorithm and describing non-algal SPM, are analysed to build three statistical models which are able to estimate near-surface SPM using simple variables, e.g., tidal coefficient, significant wave height and mean chlorophyll-a concentration. Secondly, the three-dimensional hydrosedimentary model ROMS (Regional Ocean Modeling System) is applied in the English Channel. It considers tidal forcing along open boundaries, wind stress at the sea-surface, wave-current interactions in the bottom boundary layer and realistic heterogeneous bottom sediments. Results of the more sophisticated statistical model is also used to impose SPM concentrations at open boundaries. Sensitivity tests on SPM boundary conditions show the importance of prescribing realistic sediment concentrations to improve the model predictions. Biological influences on mineral SPM are also tested using settling velocity and critical shear stress for erosion which vary with seasons. Both statistical and numerical models highlight and locate respective influences of tide, waves and biology on mineral SPM. Numerical predictions indicate that near-surface SPM is mainly composed of silts (>70%). Near-surface suspended silts come largely from seabed resuspension alongshore in the Eastern Channel and from the open boundaries of our limited-area coastal model at the West of Cotentin Peninsula and offshore. Near-surface SPM variations are investigated at semi-diurnal, neap-spring tidal cycle time scales and during a wave event. Finally, dynamics of sediments in the turbidity maximum zone around the Isle of Wight is examined depending on hydrodynamical conditions in order to distinguish the role played by advection and local erosion/settling processes in this area. Keywords: Suspended particulate matter, satellite, remote-sensing, modelling, English Channel, sediments, turbidity, tide, wave
L'étude des matières en suspension (MES) minérales est essentielle pour comprendre le fonctionnement des écosystèmes en Manche : les MES influencent la pénétration de la lumière dans la colonne d'eau, paramètre clé pour la production biologique, et sont susceptibles de transporter des polluants et nutriments. Lors de ce travail, la dynamique des MES minérales de surface en Manche est étudiée à l'aide de deux méthodes complémentaires : l'observation par satellite et la modélisation numérique tridimensionnelle. Dans un premier temps, les images satellite MODIS et MERIS, traitées par l'algorithme semi-analytique développé par l'IFREMER et représentant les MES non-algales de surface, sont analysées afin d'élaborer trois modèles statistiques permettant d'estimer la MES de surface en fonction de variables basiques telles que le coefficient de marée, la hauteur significative des vagues et la concentration moyenne en chlorophylle-a. Dans un deuxième temps, le modèle hydrosédimentaire multiclasse tridimensionnel ROMS (Regional Ocean Modeling System) est implémenté en Manche. Il prend en considération le forçage par la marée aux frontières ouvertes, la contrainte exercée par le vent à la surface de la mer, l'interaction houle-courant en couche limite de fond et l’hétérogénéité spatiale réaliste du lit sédimentaire. Les résultats du modèle statistique le plus sophistiqué sont également utilisés pour forcer la concentration en MES aux frontières ouvertes du domaine de calcul. Des tests de sensibilité sur les conditions limites montrent l'importance de considérer de manière réaliste les sédiments entrant en Manche par les frontières ouvertes lors de la modélisation numérique. L'influence de la biologie sur les MES minérales est testée en utilisant une formulation de la vitesse de chute et de la contrainte critique d'érosion variant saisonnièrement. Grâce à ces deux outils associés, les influences respectives de la marée, de la houle et de la biologie sur les MES minérales sont mises en avant et localisées en Manche. Le modèle numérique prédit que les MES de surface sont composées principalement de silts (>70%). Les silts en suspension en surface proviennent majoritairement du lit sédimentaire près des côtes en Manche orientale et des frontières ouvertes du domaine de calcul à l'ouest de la presqu'île du Cotentin et au large en Manche centrale et orientale. Les variations des MES de surface sont ensuite étudiées aux échelles des cycles de marée semi-diurnes, vive-eau/morte-eau et autour d'un épisode de houles. Enfin, l'évolution de la concentration de sédiments dans la zone de forte turbidité autour de l'île de Wight peut être analysée suivant les conditions hydrodynamiques afin d'évaluer les rôles respectifs des processus locaux d'érosion/dépot et d'advection dans la génération de ces turbidités remarquables. Mots-clés : Matière en suspension, télédétection, satellite, modélisation, Manche, sédiments, turbidité, marée, houle

Droits : 2013 UBO
http://archimer.ifremer.fr/doc/00157/26783/24884.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00157/26783/