Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
In French Guiana, located on the northeastern coast of South America, bats of different species are very numerous. The infection of bats and their ticks with zoonotic bacteria, especially Rickettsia species, is so far unknown. In order to improve knowledge of these zoonotic pathogens in this French overseas department, the presence and diversity of tick-borne bacteria was investigated with molecular tools in bat ticks. In the beginning of 2013, 32 bats were caught in Saint-Jean-du-Maroni, an area close to the coast of French Guiana, and the ticks of these animals were collected. A total of 354 larvae of Argasidae soft ticks (Ornithodoros hasei) from 12 bats (Noctilio albiventris) were collected and 107 of them were analysed. DNA was extracted from the samples and quantitative real-time PCR was carried out to detect Rickettsia spp., Bartonella spp., Borrelia spp. and Coxiella burnetii. All tested samples were negative for Bartonella spp., Borrelia spp. and Coxiella burnetii. Rickettsia DNA was detected in 31 (28.9%) ticks. An almost entire (1118 base pairs long) sequence of the gltA gene was obtained after the amplification of some positive samples on conventional PCR and sequencing. A Bayesian tree was constructed using concatenated rrs, gltA, ompA, ompB, and gene D sequences. The study of characteristic sequences shows that this Rickettsia species is very close (98.3-99.8%) genetically to R. peacockii. Nevertheless, the comparative analysis of sequences obtained from gltA, ompA, ompB, rrs and gene D fragments demonstrated that this Rickettsia is different from the other members of the spotted fever group. The sequences of this new species were deposited in GenBank as Candidatus Rickettsia wissemanii. This is the first report showing the presence of nucleic acid of Rickettsia in Ornithodoros hasei ticks from South American bats. (C) 2016 Elsevier GmbH. All rights reserved.
TICKS AND TICK-BORNE DISEASES

hal-01459758
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01459758
DOI : 10.1016/j.ttbdis.2016.09.004

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Several studies have documented that more deprived populations tend to live in areas characterized by higher levels of environmental pollution. Yet, time trends and geographic patterns of this disproportionate distribution of environmental burden remain poorly assessed, especially in Europe. We investigated the spatial and temporal relationship between ambient air nitrogen dioxide (NO2) concentrations and socioeconomic and demographic data in four French metropolitan areas (Lille in the North, Lyon in the center, Marseille in the South, and Paris) during two different time periods. The geographical unit used was the census block. The dependent variable was the NO2 annual average concentration (μg/m(3)) per census block, and the explanatory variables were a neighborhood deprivation index and socioeconomic and demographic data derived from the national census. Generalized additive models were used to account for spatial autocorrelation. We found that the strength and direction of the association between deprivation and NO2 estimates varied between cities. In Paris, census blocks with the higher social categories are exposed to higher mean concentrations of NO2. However, in Lille and Marseille, the most deprived census blocks are the most exposed to NO2. In Lyon, the census blocks in the middle social categories were more likely to have higher concentrations than in the lower social categories. Despite a general reduction in NO2 concentrations over the study period in the four metropolitan areas, we found contrasting results in the temporal trend of environmental inequalities. There is clear evidence of city-specific spatial and temporal environmental inequalities that relate to the historical socioeconomic make-up of the cities and its evolution. Hence, general statements about environmental and social inequalities can be made.
ISSN: 0013-9351

hal-01063900
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01063900
DOI : 10.1016/j.envres.2014.07.017
PUBMED : 25199972

Éditeur(s) : HAL CCSD American Society of Tropical Medicine and Hygiene
Résumé : International audience
From September 2013 to July 2014, several gold miners working in the tropical forest consulted the Maripasoula Health Center in French Guiana for edema and findings consistent with right cardiac failure. Of the 42 cases of beriberi that were diagnosed, one patient died. The laboratory and clinical investigation demonstrated vitamin B1 deficiency in most of the patients tested. Furthermore, 30 of 42 patients responded favorably to 500 mg of intravenous or intramuscular thiamine supplementation. In addition, dietary investigation showed insufficient thiamine intake in these patients. We concluded that patients had acquired beriberi because of diet restrictions, hard labor, and infectious diseases, notably malaria. In 2016, cases were still being reported. We recommend screening for compatible symptoms in gold miners, thiamine supplementation, and nutritional intervention
ISSN: 0002-9637

inserm-01503899
http://www.hal.inserm.fr/inserm-01503899
http://www.hal.inserm.fr/inserm-01503899/document
http://www.hal.inserm.fr/inserm-01503899/file/2017%2C%20Mosnier%20-%20A%20Large%20Outbreak%20of%20Thiamine%20Deficiency%20among%20Illegal%20Gold%20Miners%20in%20French%20Guiana.pdf
DOI : 10.4269/ajtmh.15-0906

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag (Germany)
Résumé : International audience
The Michaelis-Menten enzymatic reaction is sufficient to perceive many subtleties of network modeling, including the concentration and time scales separations, the formal equivalence between bulk phase and single-molecule approaches, or the relationships between single-cycle transient probabilities and steady state rates. Twelve methods proposed by different authors and yielding the same famous Michaelis-Menten equation, are selected here to illustrate the kinetic and probabilistic use of rate constants and to review basic techniques for handling them. Finally, the general rate of an ordered multistep reaction, of which the Michaelis-Menten reaction is a particular case, is deduced from a Markovian approach.
ISSN: 0259-9791

hal-00920806
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-00920806
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-00920806v2/document
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-00920806/file/12MM.pdf
ARXIV : 1312.5468

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : Adequate hydrogeophysical monitoring of CO2 geological storage remains a challenge as different parameters might be modified during storage. That implies to compare real-time measurements to an adequate baseline. At the Maguelone shallow experimental site a representative baseline for electrical resistivity was built from a large number of downhole geophysical measurements. At this coastal site this issue is particularly important due to the production of biogenic gas from the subsurface sediments. For this, a modified petrophysical model based on the Waxman-Smits model is proposed to estimate gas saturation found to vary from 2 to 7% within shallow sand layers.
ISSN: 1876-6102

hal-01412685
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01412685
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01412685/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01412685/file/pezard2015.pdf
DOI : 10.1016/j.egypro.2015.07.910

Résumé : Le programme d'amélioration des techniques d'élevage de la Chevrette Macrobrachium rosenbergii en Guyane constitue la deuxième phase du programme d'expérimentation mené sur la station IFREMER de Kourou. Jusqu'en 1988, l'effort a porté sur l'analyse du système continu classique utilisé par l'ensemble des producteurs de Macrobrachium aux Antilles et en Guyane. A partir de 1988, il apparut que la résolution des problèmes posés par son application passait par l'utilisation de schémas de gestion de la population en mode discontinu. Les expérimentations ont donc porté sur les principales conditions d'élevage susceptibles d'améliorer l'efficacité du schéma d'exploitation de la population. En prégrossissement, il s'agissait d'obtenir le meilleur compromis densité/croissance en jouant sur des facteurs tels que l'aliment artificiel ou la stimulation de la productivité naturelle, tout en produisant un juvénile pour toute post larve ensemencée. En grossissement, la contrainte essentielle est l'organisation sociale de la population qui se traduit par une croissance rapide et hétérogène des mâles et une croissance lente mais homogène des femelles. Nous avons essayé de dégager les schémas permettant de tirer le maximum de profit de ces spécificités de croissance avec un minimum de coût. Pour cela nous avons testé différentes procédures en jouant sur le poids moyen initial, les caractéristiques de la population introduite (monosexe, lot de tête ou de queue issus d'un tri), la densité et la durée d'élevage,le mode de récolte.

Droits : 1992 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00041/15262/12611.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00041/15262/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
It is classically admitted that the goodfriction properties of lamellar compounds are strongly related to their anisotropic structure and especially to the existence of weak interlayer interactions through the van der Waals gap separating the basal layers. As it is also known, the presence of the van der Waals gap in the structure of lamellar compounds will allow lot of chemical species to be intercalated in the structure leading both to the expansion of structure parameters and inter layer interactions modifications. The present work is concerned with the experimental and theoretical study of friction propertiesof Graphite Intercalated Compounds (GICs) in order to better understand thetribologiclamellar compounds. In order to modulate the interlayer interactions, two types of intercalated species were used, electrophylic species (AlCl3, FeCl3, SbCl5) and nucleophilic species (Li, K, Rb).
40th Leeds-Lyon Symposium on Tribology & Tribochemistry Forum 2013
Lyon, France

Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess
hal-00926509
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00926509
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00926509/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00926509/file/Delbe_9781.pdf
OATAO : 9781

Éditeur(s) : Actes du colloque, April 28-30 1997
Résumé : Due to favourable environmental conditions and political will, marine fish farming has developed recently around the Mediterranean. The Mediterranean area is characterised by a large number of islands which are extremely diversified from geographical, political or socioeconomic point of views. As a matter of fact, it turns out that almost a third of the Mediterranean fish farming production comes from these islands which have proven to offer good conditions for the development of that new activity. The reasons why somany enterprises have been established on islands are very diverse. Taking advantage of good environmental conditions is the most common motivation, since islands are usually less submitted to constraints due to town extension, industry development or intensive agriculture. Moreover, as far as European Union countries are concerned, incentive policy towards ultraperipheral or late development regions has made it possible to attribute specific subsidies to islands for aquaculture in the aim of more employment and wealth. Like any other economic activity, aquaculture has to face some specific constraints due to the insular context. Transport to and from the islands is more expensive and less regular, which has a negative impact on the price competitiveness of the insular products. Local markets are often too small to make it possible for the enterprises to develop first at a domestic level and to take advantage of economies of scale. Thanks to their positive and attractive world-wide image, Mediterranean islands could promote the quality of their products on the basis of geographical origin, of quality of the environment or of specific production processes. Information networks implementation and marketing approach in terms of image are challenges Mediterranean islands have to take up in order to supply the large European seafood market with quality products. [NOT CONTROLLED OCR]
Grâce à de bonnes conditions de milieu et à une volonté politique affirmée, l'élevage des poissons marins s'est développé récemment dans la Méditerranée. Le bassin méditerranéen possède un très grand nombre d'îles qui sont très diverses de par leur caractéristiques géographiques, politiques ou socio-économiques. Près du tiers de la production de poissons marins d'élevage des pays méditerranéens est réalisée dans des îles. Les raisons qui ont incité tant d'entreprises à s'établir sur des îles sont diverses. La motivation principale avancée par les promoteurs de l'aquaculture insulaire méditerranéenne est la qualité de l'environnement des îles et la disponibilité en sites, justifiée par le fait que les îles sont moins soumises à certaines contraintes comme l'extension des villes, le développement de zones industrielles ou l'intensification de l'agriculture. La politique d'aide envers les régions ultra-périphériques ou en retard de développement a permis d'attribuer des subventions spécifiques aux îles pour développer l'aquaculture dans un objectif de création de richesse et d'emploi. Comme toute autre activité économique dans les îles, l'aquaculture doit faire face à des contraintes directement liées à l'insularité. Le transport est plus coûteux et moins régulier, ce qui a un effet négatif sur la compétitivité prix des produits. Les marchés locaux sont souvent trop petits pour permettre aux entreprises de se développer d'abord en interne et de profiter d'économies d'échelle. Une réponse possible à cette contrainte de concurrence internationale pourrait être la promotion des produits sur la base de l'origine géographique,de la qualité de l'environnement ou de procédés de production spécifiques afin de valoriser l'image très positive et la notoriété de ces îles dans le monde entier. Les réseaux dédiés à l'information, à la recherche et au transfert technologique sont des outils nécessaires pour compenser les contraintes dues à la petite taille et à l'isolement dans le but de fournir le vaste marché européen en produits de la mer de qualité. [OCR NON CONTRÔLE]

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1997/acte-4010.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4010/

Résumé : En 1987, la filière de production de chevrettes Macrobrachium rosenbergii en Guyane Française a fait l'objet d'intervention du laboratoire d'aquaculture de l'IFREMER à 2 niveaux : un appui technique à la profession, et des expérimentations à la station expérimentale gérée en commun par IFREMER et INRA, à KOUROU. L'appui technique a porté sur la formation d'éleveurs notamment pour le démarrage des exploitations, l'amélioration des techniques d'exploitation et de choix des classes détaillées commerciales, la maîtrise des caractéristiques du milieu d'élevage par l'utilisation des amendements classiques, la lutte contre la contamination des produits par les germes coliformes. Le programme de recherche a porté en 1987 sur l'analyse du milieu d'élevage et tenté d'identifier un bon estimateur de la qualité du milieu, nécessaire pour l'exploitation des bassins par la méthode en «continu». Au plan de la production, l'année 1987 est marquée par un arrêt brutal de la dynamique de la production qui caractérisait les années précédentes, en raison de l'échec de la commercialisation à l'exploitation, allant jusqu'à l'arrêt de quatre exploitations représentant une vingtaine d'hectares.

Droits : 1989 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00041/15267/12619.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00041/15267/

Résumé : En 1987, l'analyse du système d'élevage en continu menée par l' IFREMER tant sur les fermes guyanaises que sur la station expérimentale de Kourou a permis de mettre en évidence les limites et les faiblesses de ce mode d'élevage. Elle a montré la nécessité d'un meilleur contrôle du cheptel depuis l'ensemencement jusqu'à la commercialisation afin de pouvoir atteindre de manière fiable des rendements de l'ordre de 2,5 T/ha/an.

Droits : 1990 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00041/15266/12618.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00041/15266/

Éditeur(s) : HAL CCSD
18th European Congress of Clinical Microbiology an Infectious Diseases (ECCMID)
Barcelone, Spain

hal-00676899
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00676899

Éditeur(s) : HAL CCSD MDPI
Résumé : International audience
Many epidemiological studies examining long-term health effects of exposure to air pollutants have characterized exposure by the outdoor air concentrations at sites that may be distant to subjects' residences at different points in time. The temporal and spatial mobility of subjects and the spatial scale of exposure assessment could thus lead to misclassification in the cumulative exposure estimation. This paper attempts to fill the gap regarding cumulative exposure assessment to air pollution at a fine spatial scale in epidemiological studies investigating long-term health effects. We propose a conceptual framework showing how major difficulties in cumulative long-term exposure assessment could be surmounted. We then illustrate this conceptual model on the case of exposure to NO₂ following two steps: (i) retrospective reconstitution of NO₂ concentrations at a fine spatial scale; and (ii) a novel approach to assigning the time-relevant exposure estimates at the census block level, using all available data on residential mobility throughout a 10- to 20-year period prior to that for which the health events are to be detected. Our conceptual framework is both flexible and convenient for the needs of different epidemiological study designs
ISSN: 1660-4601

hal-01296781
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01296781
DOI : 10.3390/ijerph13030319
PUBMED : 26999170

Éditeur(s) : Actes du colloque Journées aquacoles de l'Océan Indien; 31 mai-3 juin 1999
Résumé : La rentabilité des entreprises aquacoles est déterminée par un ensemble de facteurs internes et externes, ce qui explique la diversité des modèles d'entreprises et de leurs implantations géographiques. Les facteurs externes sont à l'origine d'avantages comparatifs dont bénéficient les entreprises suivant les conditions économiques, institutionnelles ou environnementales. Ces avantages peuvent se traduire par des coûts de production moins élevés ou par de plus grandes facilités d'accès aux marchés. Etant donné la f01ie dépendance des entreprises aquacoles vis-à-vis du milieu, les questions d'appropriation de la ressource et de l'espace, en particulier sur une frange littorale très convoitée, et de protection de l'environnement face à l'impact de ces élevages, prennent une grande importance. Dans ces conditions, la longueur des cycles d'élevage et les risques liés à l'activité nécessitent une trésorerie importante en phase de démarrage. Des gains de compétitivité prix sont possibles avec le support de la recherche, mais ils doivent s'accompagner d'une politique de différenciation des produits afin de bien s'adapter à la demande des consommateurs. Dans cet objectif, toutes les formes de coopération entre les acteurs de la filière sont à rechercher, particulièrement dans les domaines du transfert des acquis de la recherche et de la promotion des produits.

Droits : Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00041/15180/12517.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00041/15180/

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag (Germany)
Résumé : International audience
The Michaelis-Menten enzymatic reaction is sufficient to perceive many subtleties of network modeling, including the concentration and time scales separations, the formal equivalence between bulk phase and single-molecule approaches, or the relationships between single-cycle transient probabilities and steady state rates. Seven methods proposed by different authors and yielding the same famous Michaelis-Menten equation, are selected here to illustrate the kinetic and probabilistic use of rate constants and to review basic techniques for handling them. Finally, the general rate of an ordered multistep reaction, of which the Michaelis-Menten reaction is a particular case, is deduced from a Markovian approach.
Journal of Mathematical Chemistry

hal-00920806
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-00920806
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-00920806/document
ARXIV : 1312.5468
DOI : 10.1007/s10910-013-0237-5

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Semi-Volatile Organic Compounds (SVOCs) are commonly present in dwellings and several are suspected of having effects on male reproductive function mediated by an endocrine disruption mode of action. To improve knowledge of the health impact of these compounds, cumulative toxicity indicators are needed. This work derives Benchmark Doses (BMD) and Relative Potency Factors (RPF) for SVOCs acting on the male reproductive system through the same mode of action. We included SVOCs fulfilling the following conditions: detection frequency (>10%) in French dwellings, availability of data on the mechanism/mode of action for male reproductive toxicity, and availability of comparable dose-response relationships. Of 58 SVOCs selected, 18 induce a decrease in serum testosterone levels. Six have sufficient and comparable data to derive BMDs based on 10 or 50% of the response. The SVOCs inducing the largest decrease in serum testosterone concentration are: for 10%, bisphenol A (BMD10= 7.72E-07 mg/kg bw/d; RPF10= 7033679); for 50%, benzo[a]pyrene (BMD50= 0.030 mg/kg bw/d; RPF50= 1630), and the one inducing the smallest one is benzyl butyl phthalate (RPF10 and RPF50= 0.095). This approach encompasses contaminants from diverse chemical families acting through similar modes of action, and makes possible a cumulative risk assessment in indoor environments. The main limitation remains the lack of comparable toxicological data.
ISSN: 0273-2300

hal-01237085
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01237085
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01237085/document
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01237085/file/Multiple%20exposures%20to%20indoor%20contaminants_accepted.pdf
DOI : 10.1016/j.yrtph.2015.11.017