Éditeur(s) : INRAP : Institut National de Recherches Archéologiques Préventives Université des Antilles. Service commun de la documentation
Extrait de : "L'archéologie urbaine, l'archéologie funéraire et l'archéozoologie : apports des disciplines archéologiques à la connaissance des sociétés passées des Antilles", le 11 mars 2016. Université des Antilles
Description : Cette intervention porte sur l?archéozoologie et plus particulièrement, une de ses branches, l'archéomalacologie, qui aborde la fouille et l?étude des restes de coquillages en contextes archéologiques. Comme précédemment, les techniques, méthodologies et limites de la discipline seront présentées. Puis les apports de cette approche à la connaissance des populations du passé seront abordés au travers d'exemples de contextes précolombiens et, dans une moindre mesure historiques, fouillés en Guadeloupe et en Martinique dans le cadre d'interventions préventives et programmées.
Siècle(s) traité(s) : 21
Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
Permalien : http://www.manioc.org/fichiers/V16056
V16056

Résumé : Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département des Landes. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2010-2012. La qualité a pu être estimée pour la zone de production conchylicole. Suivant les seuils microbiologiques du règlement (CE) n° 854/2004, la zone suivie sur le Lac d’Hossegor est estimé de qualité B pour le groupe 3. L’étude des tendances met en évidence une augmentation de la contamination microbiologique sur un des deux points de suivies. L’année 2012 a été marquée par un épisode d’alerte microbiologique suite à une TIAC.

Droits : 2013 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00151/26270/24354.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00151/26270/

Éditeur(s) : HAL CCSD Société géologique de France
Résumé : International audience
The central part of the Gulf of Lions shoreline is characterized by many coastal wetlands that resulted from the interaction between a process of shoreline regularization by migrations of littoral barriers and a slow filling of the back-barrier areas by the riverine and marine inputs. Analyses of Late-Holocene deposits with a very high-resolution multi-proxy study of two sediment cores, allow us to reconstruct the evolution of this coastal system. Two main Holocene sediment units are identified overlying a Pliocene carbonate continental formation. The lower unit consists of sandy and pebbly marine sediments deposited around 7800 B.P., during the final stand of the last sea level rise. Just above, the upper unit displays lagoonal grey clay silts with shells and some intercalated layers of silty sands related to paleostorm events. The age model was established from radiocarbon dating, for the oldest part of the core. Over the last century, sedimentation rates were calculated using the CFCS Pb-210 model, together with Cs-137 data. Radiocarbon data show an increase in he accumulation rate from the base to the top of cores. Marine sand units related to the last transgressive deposit allow to refine the curve of Holocene post-glacial sea level rise. Sedimentological and faunal analyses associated with chronological data provide a means for reconstructing the Late-Holocene paleoenvironments along this part of the coast and suggest that the final closure of the coastal lagoon by the sandy barrier occurred at around 730 +/- 120 yr cal B.P. The beginning of this closure, together with the progradation of the coastal plain, could be responsible for the decline in economic activity of the Lattara harbour during the Roman period.
La partie centrale du littoral du golfe du Lion est caractérisée par de nombreuses lagunes qui résultent de l'interaction entre un processus de régularisation du trait de côte par migration de barrières littorales et d'un lent remplissage des zones situées en arrière des barrières par des apports continentaux et marins. Les analyses des dépôts tardi-holocènes avec une étude multi-traceurs à très haute résolution de deux carottes sédimentaires nous permettent de reconstruire l'évolution de ce système côtier. Deux unités sédimentaires holocènes sont identifiées recouvrant une formation pliocène carbonatée. L'unité inférieure est constituée de sables et de galets d'origine marine déposés vers 7800 B.P., durant les stades ultimes de la dernière remontée marine. Audessus, l'unité supérieure montre des dépôts d'argile et de silt gris coquilliers d'origine lagunaire, dans lesquels sont intercalés des niveaux de sable silteux révélant la présence d'événements de tempêtes. Le modèle d'âge est établi à partir de dates radiocarbones pour les parties les plus anciennes des archives sédimentaires, tandis que pour le dernier siècle, les taux de sédimentation sont calculés en utilisant le modèle CFCS pour le 210Pb, associé aux données de 137Cs. Les données 14C montrent une augmentation du taux d'accumulation depuis la base jusqu'en surface des carottes. Les unités de sables marins liées aux dépôts de la dernière transgression marine permettent de préciser la courbe post-glaciaire de remontée du niveau marin. Les analyses sédimentologiques et faunistiques associées aux données chronologiques fournissent une méthode permettant de reconstituer les paléoenvironnements littoraux tardi-holocènes dans la zone d'étude et suggèrent que la fermeture finale de ces lagunes par le cordon sableux survient autour de 730 ± 120 ans cal B.P. Le début de cette fermeture, associée à la une progradation deltaïque, pourrait être responsable du déclin des activités économiques du port de Lattara durant la période Romaine.
EISSN: 1777-5817

halshs-00740923
https://halshs.archives-ouvertes.fr/halshs-00740923
DOI : 10.2113/gssgfbull.181.1.27

Résumé : This study is inserted within the research project Risco, which aims at understanding the causes of oysters mortalities in the bay of Quiberon, since 2006. The objective was to test the feasability of an automatic segmentation of sonar images devoted to the distinction of molluscs (oysters and crepidulas) and sedimentary substrate. The method tested was of the type "segmentation dirigée basée région", implemented on the software SonarScope. It could be applied successfully only on muddy sediment where it succeeded to identify the shellfish sectors with negligeable error. However the distinction between oysters and crepidulas proved to be very delicate. A generalization to other sectors of the bay will be attempted.
Dans le cadre du projet RISCO sur la compréhension des facteurs de mortalité d'huîtres en Baie de Quiberon (France), l'objectif du stage était de tester la possibilité d'une segmentation automatique d'imagerie sonar en vue de distinguer les faciès coquilliers (huîtres et crépidules) du substrat sédimentaire. La méthode testée était de type « segmentation dirigée basée région » implémentée sous le logiciel SonarScope. Cette approche testée uniquement en secteur vaseux s'est montrée capable de détecter sans confusion les secteurs coquilliers. La distinction entre crépidules et huîtres s'est par contre avérée pour le moment très délicate. Une généralisation a d'autres secteurs sédimentaires de la Baie reste à menée.

Droits : 2011 Ifremer, UBS
http://archimer.ifremer.fr/doc/00128/23946/21911.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00128/23946/

Éditeur(s) : Epidémiologie et santé animale, 62, pp. 27-42
Résumé : The basic concepts and objectives of animal disease surveillance are common to all types of animal production. Yet, the procedures for implementation have been mostly developed for terrestrial animal productions. Disease surveillance in marine shellfish calls for specific measures in view of the peculiarities of marine biology and rearing techniques. The main objective of disease surveillance in marine shellfish is to detect as early as possible exotic and newly emerging diseases. With this objective in mind, a national surveillance network for surveillance of mollusc diseases called Repamo has been developed. It combines passive reporting and risk-based surveillance.
Les enjeux de la surveillance épidémiologique sont globalement similaires entre les différentes filières de production animale, mais les modalités de surveillance ont été principalement conceptualisées pour les productions terrestres. Leur adaptation au contexte des productions aquacoles, conchylicoles en particulier, présente plusieurs défis tant par les caractéristiques biologiques des animaux que par celles de leur élevage en milieu marin. L’objectif prioritaire de la surveillance des maladies des coquillages marins est la détection précoce de l’apparition d’une maladie exotique ou nouvelle afin d’entreprendre rapidement une lutte. Pour atteindre cet objectif, des modalités de surveillance événementielle et ciblée sur le risque d’introduction ou d’émergence sont combinées et coordonnées par le Réseau de pathologie des mollusques (Repamo), réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français.

Droits : 2012 Association pour l'étude de l'épidémiologie des maladies animales
http://archimer.ifremer.fr/doc/00109/22023/19653.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00109/22023/

Résumé : L'activité de transport maritime dans les eaux côtières et les ports français nécessite que les navires ballastent ou déballastent pour décharger ou prendre du frêt. L'eau de mer (ou d'estuaire) rejetée à cette occasion a souvent été prise aux escales précédentes dans d'autres parties du monde et peut contenir des organismes vivants néfastes pour la faune, la flore, ou l'activité économique des régions côtières françaises. Il en est de même des eaux françaises prises comme ballast. Certaines espèces peuvent proliférer dans un nouveau milieu où les facteurs de leur régulation n'existent plus et devenir envahissantes (jacinthes d'eau en Floride ou moules zébrées dans les Grands Lacs). Les plus néfastes sont les bactéries et le phytoplancton toxique. L'épidémie de choléra qui a sévi sur les côtes Sud Américaines en 1992, peut être importée d'Asie du Sud Est par eaux de ballast, est à l'origine de contamination de coquillages sur les côtes du golfe du Mexique (Louisiane, Alabama). Sur dix neuf navires échantillonnés dans les ports américains (et venant d'Amérique du Sud) cinq portaient des eaux de ballast hébergeant Vibrio cholerae (variétés 01 et 0139) agents de l'épidémie, lesquels auraient également été retrouvés dans les coquillages de la même zone. L'économie des régions côtières françaises, très peuplées, est étroitement dépendante d'un milieu marin équilibré et non pollué. La pêche côtière l'aquaculture et même le tourisme nécessitent des écosystèmes marins en bonne santé. A l'instar de ce qui est réalisé dans les pays avancés, il était nécessaire d'évaluer les risques liés à l'activité de déballastage des navires. Après une première évaluation des provenances d'eau sur un port charentais (D. FOUCHE, D. MASSON 1999) une campagne de prélèvements sur des navires de transport faisant escale dans les principaux ports français a été commandée par le Ministère de l'Equipement, (Direction Technique de la Mer des Port et du Littoral), ainsi que les Ports Autonomes. Les résultats devaient permettre à la France, d'apprécier la réalité de la menace et de participer au règlement international de ce problème (législation solutions, techniques, etc ... ). C'est à notre connaissance la seule étude en cours en France sur le sujet.

Droits : 2000 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00191/30228/28642.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00191/30228/

Éditeur(s) : ISTPM
Résumé : Table of Contents The Natural Environment Production centres Oyster farming centres Mussel farming centres Chapter I. - The Physicochemical Environment I. Sea Water a) Transparency, turbidity b) Temperature c) Salinity d) Dissolved gases e) Substances dissolved in the water f) Water movements g) Hydrology of the main shellfish farming centres II. Soils a) Soil properties b) Mechanical amendment of soils, its effects c) Fertilisation of soils in shellfish farming d) Changes in soils due to farming Bibliography Chapter II. - The Natural Environment Phytoplankton Zooplankton Basic biology of phytoplankton Assessment of phytoplankton production, notion of primary productivity Phytoplankton from a few shellfish farming regions Microphytobenthos Factors controlling primary productivity Toxicity of planktonic organisms; red tides Bibliography Chapter III – Alterations in the Natural Environment Pollution I. Chemical Pollution Definitions Influence of turbidity A. Telluric pollution 1o Domestic pollution 2o Agriculture-related pollution 3o Industrial pollution B. Pelagic pollution 1o Pollution through hydrocarbons Conclusion II. Bacterial Pollution Future of micro-organisms in the sea A. Specimen conditions B. Phenomena of dispersion Survival of germs in the marine environment A. Factors influencing the total microbial content B. Resistance of various groups of germs Consequences of bacterial pollutions on shellfish and shellfish farming Shellfish Shellfish farming Conclusion Bibliography
Sommaire : Le milieu naturel Les centres de production Les centres ostréicoles Les centres mytilicoles Chapitre I. - le milieu physico-chimique I. L'eau de mer a) Transparence, turbidité b) Température c) Salinité d ) Les gaz dissous e) Les substances dissoutes dans l'eau f) Les mouvements de l'eau g) Hydrologie des principaux centres conchylicoles IL Les sols a ) Propriétés des sols b) Amendement mécanique des sols, ses effets c) La fertilisation des sols en conchylicutture d) Evolution des sols du fait de la culture Bibliographie Chapitre II. - le milieu biologique Le phytoplancton Le zooplancton Biologie sommaire du phytoplancton Evaluation de la production de phytoplancton, notion de productivité primaire Phytoplancton de quelques régions conchylicoles Le microphytobenthos Facteurs contrôlant la productivité primaire Toxicité d'organismes planctoniques ; les eaux rouges bibliographie Chapitre III - les altérations du milieu naturel. Les pollutions I. Les pollutions chimiques Définitions Influence de la turbidité A. Pollution tellurique 1° Pollution d'origine domestique 2° Pollutions liées aux activités agricoles 3° Pollutions industrielles B. Pollution pélagique 1° Pollution par les hydrocarbures Conclusion II. Les pollutions bactériennes Devenir des microorganismes dans la mer A. Conditions de prélèvements B. Phénomènes de dispersion Survie des germes dans le milieu marin A. Facteurs influant sur la teneur microbienne globale B. Résistance des divers groupes de germes Conséquences des pollutions bactériennes sur les coquillages et sur la conchyliculture Les coquillages La conchyliculture Conclusion Bibliographie
Revue des Travaux de l'Institut des Pêches Maritimes (0035-2276) (ISTPM), 1974-09 , Vol. 38 , N. 3 , P. 217-337

Droits : Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/1974/publication-1776.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1776/

Éditeur(s) : Neidine Editeurs
Résumé : This article has for objective to put forward the ethical values of the sea and the ocean. After a reminder(abs of the marine origin of life on earth and what the human always carries in him tracks of this origin, we underline several characteristics: the regulation of the climate by the ocean, the specificities of part of the animal kingdom which unlike other did not conquer the terrestrial domain, the fact that marine biological material was at the origin of numerous Nobel prizes, finally which the sea holds number of biological, mineral, energy resources etc. which will be the resources of tomorrow. The following part is dedicated to the human values which the sea inculcates to those who frequent her. We offer a list of some current expressions of the French language the origin of which is marine or maritime. We discuss then about prosperous nations, sometimes small ones, which knew how to put forward the values of the sea and benefit from it for their influence. We talk about the symbols pulled by the sea, in particular the shells and their value, which various civilizations and peoples have known to adopt. We end on the New Caledonian case and on the opportunities and the assets which can be, considering its marine and maritime values as an island Pacific country.
Cet article a pour objectif de mettre en avant les valeurs éthiques de la mer et de l’océan. Après un rappel de l’origine marine de la vie sur terre et du fait que l’homme porte toujours en lui des traces de cette origine, on souligne plusieurs caractéristiques : la régulation du climat par l’océan, les spécificités de certains embranchements du règne animal qui à la différence d’autres n’ont pas conquis le domaine terrestre, le fait que matériel biologique marin a été à l’origine de nombreux prix Nobel, enfin que la mer recèle nombre de ressources biologiques, minérales, énergétiques etc… qui seront les ressources de demain. La partie suivante est consacrée aux valeurs humaines que la mer inculque à ceux qui la fréquentent. On offre une liste d’expressions courantes de la langue française dont l’origine est marine ou maritime. On discute ensuite des nations florissantes, parfois petites, qui ont su mettre en avant les valeurs de la mer et en tirer profit pour leur rayonnement. On disserte sur les symboles tirés de la mer et notamment des coquillages et de leur valeur que différentes civilisations et peuples ont su adopter. On conclue sur le cas calédonien et sur les opportunités et atouts qui peuvent être les siens de considérer ses valeurs marines et maritimes en tant que pays insulaire du Pacifique.
Tai Kona (2269-7535) (Neidine Editeurs), 2014-07 , N. 9 , P. 28-43

Droits : Tai Kona
http://archimer.ifremer.fr/doc/00203/31393/29782.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00203/31393/

Éditeur(s) : HAL CCSD Editions de la maison des sciences de l'Homme
Résumé : International audience
En 2000, deux gisements préservés de façon exceptionnelle étaient découverts sur l'arrière-plage de Baie Orientale à Saint-Martin, une île des Petites Antilles : des campements du Mésoindien (800 av. J.-C - 100 ap. J.-C.) associant activités de subsistance et fabrication d'outils sur pierre, coquille ou corail, ce qui est sans précédent pour la période précéramique, et une occupation du Néoindien récent (740-960 ap. J.-C.) interprétée comme un campement spécialisé, satellite du village de Pointe du Canonnier, selon un schéma d'occupation du territoire caractéristique de cette période. L'étude à la fois novatrice et originale que nous en propose Dominique Bonnissent, nous permet d'accéder au mode de vie complexe des populations précéramiques nomades qui ont sillonné la mer Caraïbe, et fait de cet ouvrage une ressource incontournable pour l'archéologie précolombienne caribéenne. En tête de chaque chapitre, un résumé avec références bibliographiques et renvois aux figures permettra aux lecteurs de langue anglaise et espagnole d'accéder aux données essentielles de la démonstration. Ces deux chapitres traitent de la caractérisation et de l'origine de la matière première lithique utilisée par ces deux groupes d'occupants
Les gisements précolombiens de la Baie Orientale. Campements du Mésoindien et du Néoindien sur l'île Saint-Martin (Petites Antilles)

ISBN : 978-2-7351-1124-4
hal-00989501
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00989501

Résumé : La conchyliculture connaît depuis une trentaine d'années une progression régulière de ses productions à travers le monde. Elle représente une activité économique importante avec plus de 240 000 tonnes de coquillage produit annuellement en France. Cependant le développement de cette activité peut être limité par des mortalités parfois massives dues à des maladies infectieuses. L'augmentation des productions peut être expliquée par l'amélioration des méthodes d'élevage grâce à une meilleure connaissance de la biologie des bivalves et des processus physiologiques liés à leur reproduction : l'apparition de l'élevage larvaire en écloserie a permis de pallier le caractère aléatoire et souvent insuffisant du captage naturel. Ces nouvelles techniques ont permis d'acquérir une certaine indépendance vis-à-vis des pontes naturelles, mais ont entraîné une augmentation des transferts d'animaux entre les bassins conchylicoles, une augmentation des densités de mollusques et le développement d'une espèce cible par bassin. Ces actions ont contribué à l'apparition et à la dissémination de nouvelles maladies entraînant de très fortes pertes pour la conchyliculture. De plus, la palourde, comme tous les mollusques marins, présente des caractéristiques biologiques qui laissent peu de possibilités d'actions pour protéger une production vis-à-vis de maladies infectieuses: la culture de ces espèces en milieu ouvert rend tout traitement impossible du fait des quantités de substance à utiliser, et de la forte probabilité de contamination des animaux. Cette méthode peut être appliquée dans le cas d'élevages intensifs : écloseries, nurseries. Le système immunitaire des mollusques est primitif, ils ne possèdent pas de lymphocytes B et lymphocytes T, ce qui empêche toute réponse immune spécifique et rend la vaccination impossible. L'absence d'anticorps spécifique complique la recherche d'agent pathogène, celle-ci n'est possible que par un diagnostic direct, essentiellement réalisé grâce à l'histologie ou à la microscopie.

Droits : 2006 IUT La Rochelle, Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14457/11759.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14457/

Résumé : Le Laboratoire Côtier de La Tremblade est implanté géographiquement dans le premier bassin ostréicole d'Europe (30 000 tonnes produites et 60 000 tonnes commercialisées chaque année). L'ostréiculture est une activité économique très importante en terme d'emplis, qui doit cohabiter sur un même littoral avec le tourisme et l'agriculture générant parfois des conflits d'usages (gestion de l'eau, qualité de l'eau). Les avis donnés à l'Administration ou aux collectivités locales s'appuient sur les résultats de la surveillance ou ceux émanant des études spécifiques comme les études microbiologiques locales. Les activités, les responsabilités de chacun dans le cadre ce de mandat, figurent dans le Manuel Qualité du Laboratoire. Enfin, l'assistance technique à la profession conchylicole, en matière environnementale ou de préparation à la mise en marché des coquillages revêt des formes multiples : formations données, distribution de fiches pratiques, fourniture de renseignements, interface entre professionnels et laboratoires de recherche, études spécifiques.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00074/18538/16085.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00074/18538/

Résumé : La taxonomie des huîtres est longtemps restée basée sur des critères morphologiques tel que la coquille et les organes internes ou sur la répartition géographique. Ces critères se révèlent aujourd'hui peut fiable du fait de la grande plasticité des caractères morphologiques des huîtres en fonction des conditions environnementales, et du transport d'espèce par l'ostréiculture ou accidentellement. La biologie moléculaire et en particulier les marqueurs génétiques sont des outils très utiles pour différencier les espèces. La phylogéographie des huîtres creuses de l'Atlantique Sud a ainsi été étudié grâce à différentes méthodes d'observation du polymorphisme de l'ADN. Ces techniques ont dans un premier temps été appliquées à des fragments mitochondriaux (16S) pui à des fragments nucléaires (ITS). La PCR6RFLP a été utilisée d'une part sur les fragments 16S pour déterminer les haplotypes de 5 nouvelles populations du genre Crassostrea provenant du Sénégal, du Nigeria et du Brésil. Il a été ainsi possible d'identifier une nouvelle population de Crassostrea gasar en Amérique du Sud. Nous nous sommes ensuite intéressés aux polymorphisme pouvant exister entre les différentes populations de C. gasar de part et d'autre de l'Atlantique. Pour cela des fragments nucléaires ITS, à priori plus polymorphes que les fragments mitochondriaux 16S ont été étudiés. Différentes mises au point ont été réalisées afin de révéler un éventuel polymorphisme entre les populations. Toutes les informations recueuillies tendent vers cette hypothèse sans toutefois pouvoir la confirmer. La présence d'une zone de sympatrie entre les espèces C. gasar en Amérique du Sud poste la question de son introduction, soit par l'homme soit accidentellement. Des études complèmenaires sont indispensables, par un échantillonnage plus large, pour évaluer l'étendue de la présence des espèces de part et d'autre de l'océan. Il est également nécessaire de continuer la mise au point sur les marqueurs nucléaires afin de confirmer le polymorphisme suspecté entre les populations C. gasar d'Afrique et d'Amérique. La publication récente d'un article séparant les espèces C. brasiliana et C. rhizophorae pose également la question de la position de C. brasiliana par rapport aux deux espèces que nous avons étudié.

Droits : 2000 Univ. La Rochelle
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14409/11706.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14409/

Résumé : The full exploitation of the world fishery resources has drastically modified the prospects and conditions for progress in fisheries. It was detenninant in the change of the Ocean Regime. Moreover, it widened considerably the range of issues which have to be addressed for an efficient use of marine living resources. Assessment approaches for complex fisheries, carrying capacity of basins and management of bivalve mollusc stocks, natural variability of fish stocks and management implications, methods for access regulation, economic rent, resources and use rights allocation, nature of aitisanal fisheries, strategies for fishery development in Third World countries, international dimensions of fisheries, etc. are among the issues reviewed in this book by scientists of international repute.
La pleine exploitation des ressources halieutiques mondiales a profondément modifié les perspectives et les conditions de progrès de la pêche. Elle a pesé lourd dans l'acccptalion du nouveau régime des océans. Surtout, elle a considérablement élargi le champ des questions à aborder pour mieux valoriser les ressources vivantes de l'océan. Méthodes d'évaluation de pêcheries complexes, capacité biotique des bassins et aménagement des cheptels coquilliers, variabilité naturelle des stocks et conséquences pour l'aménagement des pêches, méthodes de régulation de l'accès, rente économique, allocation de ressources communes et de droits d'usage, spécificité des pêches artisanales, stratégies de développement de la pêche dans les pays du Tiers Monde, dimensions internationales de la pêche, etc. figurent parmi les thèmes qu'abordent dans cet ouvrage des spécialistes de notoriété mondiale.

Droits : Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer, IFREMER, 1989
http://archimer.ifremer.fr/doc/1989/rapport-1511.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1511/

Éditeur(s) : Elsevier
Résumé : To improve the knowledge of the survival of enteric viruses in a marine environment, the influence of physico-chemical parameters (temperature, UV, salinity) on the survival of infectious poliovirus 1 and hepatitis A Virus (HAV) in seawater was first studied, the influence of suspended solids (SS) on poliovirus adsorption and survival in seawater was then evaluated and the detection of rotavirus genome in environmental samples (shellfish, river water, treated wastewater) was finally investigated. The results show that temperature has a major impact on virus survival in seawater as the time necessary to inactivate 90 % of the virus (T-90) is 671 days at 4 degrees C and only 25 days at 25 degrees C. Ultraviolet light (42 mW s cm(-2)) rapidly inactivates viruses but HAV is more resistant (T-90 = 2.6 min) than the poliovirus 1 (T-90 = 1.3 min). By contrast, seawater salinity has no effect on virus survival. In presence of SS, 90 % to 99.9 % of the viruses were adsorbed. This adsorption does not provide any protection for viruses with low SS concentrations (3 and 15 mg L-1) but a slight increase in virus survival was observed with a high SS concentration (500 mg L-1). Finally environmental sample analysis indicated that 20 % shellfish, about 40 % river water and 40 % treated wastewater tested positive for the rotavirus genome.
Ce travail a pour but de mieux comprendre le devenir des virus en milieu marin. Dans ce cadre, l'influence de certains paramètres physicochimiques (température, UV et salinité) sur le pouvoir infectieux du poliovirus 1 et du virus de l'hépatite A (VHA) en eau de mer a été évalué, puis l'adsorption du poliovirus 1 sur les matières en suspension (MES) a été étudié, ainsi que les conséquences sur le pouvoir infectieux du virus et enfin le génome des rotavirus a été recherché en milieu naturel (eaux et coquillages). Les résultats montrent que la température est un paramètre important pour la survie des virus puisque le temps nécessaire à inactiver 90 % des virus (T90) en eau de mer est de 671 j à 4 °C alors qu'il est seulement de 25 j à 25 °C. Le rayonnement ultraviolet (42 mW s cm−2) testé en pilote expérimental, permet d'obtenir une inactivation rapide du poliovirus 1 (T90 = 1,3 min). Le VHA est plus résistant avec un T90 = 2,6 min. En revanche la salinité de l'eau de mer n'a pas d'influence sur la survie des virus. En ce qui concerne l'influence des MES, les résultats montrent qu'en présence de 3, 15 et 500 mg L−1 de Na-montmorillonite la majorité des virus est adsorbée (90 à 99,9 %). Cet état adsorbé ne procure aucune protection aux virus pour les faibles concentrations de MES (3 et 15 mg L−1) alors qu'une augmentation significative de survie est observée pour les fortes concentrations (500 mg L−1). Enfin, l'analyse d'échantillon de l'environnement a montré que 20 % des fruits de mer, environ 40 % des eaux de rivière et environ 40 % des eaux usées traitées testées contenaient du génome de rotavirus.
Oceanologica Acta (0399-1784) (Elsevier), 1998-11 , Vol. 21 , N. 6 , P. 983-992

Droits : 1998 Ifremer / CNRS / IRD - Published by Elsevier SAS
http://archimer.ifremer.fr/doc/1998/publication-846.pdf
DOI:10.1016/S0399-1784(99)80020-6
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/846/

Résumé : Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département du Morbihan. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées. L’évaluation de la qualité des zones de production sur la période 2012-2014 (2011-2014 pour les classements saisonniers) révèle une qualité B pour neuf zones actuellement classées A pour le groupe 3 (dont 6 zones classées en A de façon saisonnière) et une qualité C pour quatre zones actuellement classées B pour le groupe 2 (dont 1 zone classée en B de façon saisonnière). L’année 2014 a vu une diminution considérable du nombre d’alertes par rapport à 2013, avec 9 alertes de niveau 1 (déclenchées dans le cadre de la surveillance régulière) dont 3 avec persistance de la contamination (alerte de niveau 2). L’analyse statistique des tendances sur les 10 dernières années ne met en évidence aucune tendance pour la plupart des zones. Seules six zones confirment une tendance à la dégradation. La qualité chimique est très satisfaisante sur toutes les stations.

Droits : 2015 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00260/37094/35604.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00260/37094/

Résumé : Larval mortalities occurring in molluscan hatcheries have often been associated with bacterial contamination. Although batches of oyster and clam larvae have been routinely reared in the hatchery of Argenton without antibiotics, high larval mortalities have been recorded with Pecten maxirnus under similar conditions. For this species, an addition of chloramphenicol was found necessary. However, this chemical has now been banned in Europe. Thus either substitition products or an improvement in the rearing procedures is essential. Studies carried out have shown that neither a decrease in larval density (1 larvae. ml"l) nor sea water change frequency (1 per day) had any positive effects. Furthermore, elective substances such as sugars were not suitable and the use of another antibiotic, erytromvcine. led to inconsistent results-
En ecloserie de mollusques, les mortalités larvaires sont souvent associées à des proliférations bactériennes. Pour les limiter un traitement de l'eau est incontournable et chez certaines espèces, dont la coquille St Jacques Pecten maximus, l'utilisation de chloramphenicol s'avère nécessaire. Or son usage dans les productions animales a été récemment prohibé par la communauté européenne. Afin de pallier à cette interdiction, l'amélioration des procédures zootechniques ainsi que l'utilisation de produits de substitution ont été effectuées. Quel que soit le procédé envisagé, abaissement de la densité en élevage, augmentation de la fréquence du renouvellement de l'eau d'élevage, mise au point de filtres biologiques, utilisation de substances électives, les élevages larvaires n'ont pu être menés à terme. A l'inverse, de bons développement larvaires ont été obtenus avec adjonction d'érythromycine mais ces résultats ne sont pas suffisamment reproductibles pour que cet antibiotique constitue un produit de substitution efficace.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1995/rapport-1568.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1568/

Éditeur(s) : Université de Bretagne Occidentale
Résumé : The stock of Lambi, Strombus gigas (gastropod: strombidae), coastal benthic resource, has been exploited artisanally since the prehistoric period in Martinique. Nowadays, three lines of work exploit the species: free diving, nets (since the middle of the century) and scuba diving since 1985. This report presents the activity of each line of work, surveyed directly from 1986 to 1987: fishing zones and resource allocation, production, effort and performance, detail of catches (by length). The socio economic characteristics of the lambi fishermen are studied. The significant production of leisure fishing is also estimated. The decrease in the production and performance, as well as the lowering of the size of the first catch for about thirty years show that the stock is overexploited. The biological phenomenon of the stock: growth of the shell (length and shell lip), growth in weight, acquiring of sexual maturity, natural mortality are studied. The factors of mortality through fishing are estimated by class of length for the current exploitation regime by pseudo-cohort analysis. If the results confirm that the stock is overexploited, the level of overexploitation of the stock cannot be specified because of the presence of a number of lipped adults not yet too exploited in water deeper than 20 metres. The analysis of the dynamic process of the exploited population indicates two ways to the production of the stock: the forcing of the recruitment and the regulation of the exploitation regime. The lack of economic profitability of the production of juveniles over 30 mm and the difficulties raised by their collection in their natural habitat lead to the rationalization of the exploitation. The production and performance (by recruits) simulations performed for different exploitation regimens indicate that the only two conceivable options are the introduction of a minimum catch size, i.e. lambi with forming lip, and the regulation of the fishing effort. The socio-economic implications of the introduction of the determined management measures show that their applicability level is very low, because of the Martinique fishermen polyactivity, their low socio-economic level and mostly because of the free access to the resource. As a consequence, it is suggested to create new professional structures with a wide jurisdiction, in order to locally manage the marine areas, their use and their resources. (unverified OCR)
Le stock de lambi, Strombus gigas (gastéropode: strombidae), ressource benthique côtière, est exploitée artisanalement depuis l'époque préhistorique en Martinique. Trois métiers exploitent actuellement l'espèce: plongée libre, filets (depuis le milieu du siècle) et plongée en scaphandre autonome depuis 1985. Ce rapport présente l'activité de chaque métier, suivie de 1986 à 1987 par une enquête directe: zones de pêche et allocation de la ressource, productions, efforts et rendements, composition en longueur des captures. Les caractéristiques socioéconomiques des pêcheurs de lambi sont étudiées. La production d'une pêche plaisancière non négligeable est estimée. La diminution de la production, des rendements et l'abaissement de la taille de première capture depuis une trentaine d'années révèlent que le stock est surexploité. Les phénomènes biologiques du stock: croissance de la coquille (longueur et pavillon), croissance en poids, acquisition de la maturité sexuelle, mortalité naturelle sont étudiés. Les coefficients de mortalité par pêche sont estimés par classe de longueur pour le régime d'exploitation actuel par l'analyse de pseudo-cohorte. Si les résultats confirment l'état surexploité du stock, le niveau de surexploitation ne peut être précisé en raison de l'existence d'adultes pavillonnés encore peu exploités sur les fonds de plus de 20 mètres. L'analyse des processus dynamiques de la population exploitée indique deux voies pour restaurer la production du stock: le forçage du recrutement et la régulation du régime d'exploitation. Le manque de rentabilité économique de l'élevage des juvéniles au-delà de 30 mm et les difficultés pour leur collecte dans le milieu naturel conduisent à rechercher la rationalisation de l'exploitation. Les simulations de la production et du rendement par recrue réalisées pour différents régimes d'exploitation indiquent que seule la mise en place d'une taille minimale de capture, i.e le lambi au pavillon en formation, et une régulation de l'effort de pêche sont envisageables. Les implications socio-économiques de la mise en oeuvre des mesures de gestion déterminées montrent que leur niveau d'applicabilité est très faible, en raison de la polyactivité des pêcheurs martiniquais, de leur faible niveau socioéconomique et surtout, du régime de libre accès à la ressource. Aussi, il est proposé la création de nouvelles structures professionnelles aux compétences larges, qui permettraient, pour chacun des bourgs, une gestion locale de l'espace marin, des usages et des ressources. OCR NON CONTRÔLE

Droits : 1993 UBO
http://archimer.ifremer.fr/doc/1993/these-3751.PDF
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3751/

Résumé : En 1999, le risque écologique encouru par les écosystèmes côtiers soumis à la prolifération de la crépidule, Crepidula fornicata, a été pleinement reconnu par la communauté scientifique nationale et internationale. Au niveau national, le Programme National Environnement Côtier (PNEC) et le programme national LITEAU ont tous deux identifié des actions thématiques prioritaires sur la dynamique de prolifération de la crépidule et les interactions crépidule/bivalves exploités. Les actions du LEMAR (UMR 6539 CNRS) sur cette thématique s’inscrivent dans deux projets : 1 - La crépidule : identifier les mécanismes de sa prolifération et caractériser ses effets sur le milieu pour envisager sa gestion. » (LITEAU) 2 - Recrutement, milieu physique et interactions d'espèces en environnement côtier : cas des mollusques » (PNEC ART2) En rade de Brest, l’accent est mis sur l’interaction des cycles biologiques de la crépidule et de la coquille Saint-Jacques. Les objectifs poursuivis en rade de Brest s’articulent en 4 points, dans le cadre de LITEAU : 1- Dynamique de colonisation de la crépidule en rade de Brest : acquisition des paramètres de dynamique de population (caractéristiques du cycle reproducteur, déterminisme du recrutement, dispersion, croissance, sensibilité aux efflorescences toxiques...) ; 2- Impact de cette prolifération sur l’évolution de la nature sédimentaire des zones colonisées et l’enrichissement en matière organique (par le biais de l’activité alimentaire et de la production de biodépôts) ; 3- Modifications engendrées sur les peuplements benthiques dans leur globalité (sites ateliers). La strate à crépidules, au sens biosédimentaire et écologique, verra sa définition affinée et sa dynamique analysée en vue d'obtenir un modèle prévisionnel des évolutions possibles en matière de biodiversité ; 4- Rôle de la crépidule dans le contrôle de la production primaire phytoplanctonique (par le biais des activités de filtration et de production de biodépôts).

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14292/11570.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14292/

Éditeur(s) : ISTPM
Résumé : These first results might clarify some problems linked to the biology of tarets and other small lignivorous crustaceans. The systematic of the molluscs Teredinidae, so complex, is only based on the study of pallets, which is a great source of confusion when one has to examine the woods after the molluscs' death. We tried to distinguish the species by examining the striates and denticulations on the shelves. The size of the intervals between the striates and the proportional size of the denticulations, as well as the shape of the denticulation marks of the middle part, can indeed allow us to differentiate between some species. [...]
Ces premiers résultats pourront peut-être jeter quelque clarté sur les problèmes se rapportant à la biologie des tarets et des petits crustacés lignivores. La systématique des mollusques Teredinides, si complexe, a été fondée uniquement sur l'examen des palettes, ce qui est une source de confusion lorsqu'on est obligé, ce qui est le cas le plus fréquent, d'examiner les bois après la mort des mollusques. Nous avons cherché à distinguer les espèces par les stries et les denticulations visibles sur les coquilles. Les dimensions des intervalles séparant les stries et la taille proportionnelle des denticulations, ainsi que la forme de l'empreinte des denticulations de la partie moyenne peuvent différencier, effectivement, quelques espèces. C'est ainsi que Teredo pedicellata et Teredo navalis sont immédiatement distingués à l'examen des stries; de même Bankia minima et Bankia badigaensis. Mais il faut, bien entendu, tenir compte des variations individuelles, les denticulations pouvant être plus ou moins fortes chez une même espèce. Il semble difficile d'interpréter tout le comportement des petits crustacés et même des larves de Térédinides par une simple réaction de chimiotropisme : les animaux peuvent choisir un point ou une zone sur le support. Certaines essences, tout au moins au début de leur immersion, semblent jouer un rôle répulsif ou non attractif pour les crustacés: le Hêtre, Kaya ivorensis et Samba; ces observations ne sont valables que pour une saison chaude. Chez les mêmes crustacés, la préférence pour l'ombre joue un rôle très important. (OCR non contrôlé)
Revue des Travaux de l'Institut des Pêches Maritimes (0035-2276) (ISTPM), 1956-06 , Vol. 20 , N. 2 , P. 185-200

Droits : Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/1956/publication-4669.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4669/

Éditeur(s) : Union des Océanographes de France
Résumé : The worms Polydora. damage the oysters, Crassostrea gigas, by foraging the shell, training the formation of galleries and chambers with mud. The IFREMER'S REMORA network which has in charge to survey the oysters Crassostrea gigas in France, has showed an increase of the infestation of oysters since 1993 (first year of the network). The study had for goal first to estimate the spatial and temporal variations of the infestation of the oysters in 1999, by using two methods: the infestation index, the number of worms by individual and a quality index, the Polydora Index (IP varies from 0 to 1) which is based on 5 classes of the oysters quality (from 0 to 4) in relation to the aspect of the valves
Les vers Polydora détériorent les huîtres creuses, Crassostrea gigas, par perforation de la coquille, entraînant la formation de galeries et de chambres à vase. Le réseau IFREMER /REMORA de suivi des huîtres creuses en France a mis en évidence une progression de l'infestation dans les huîtres depuis 1993 (année de démarrage du réseau). L'étude a pour objectif d'évaluer les variations spatio-temporelles de l'infestation des huîtres de 1999, en comparant deux méthodes : un indice d'infestation, le nombre de vers par huître ; et un indice de qualité, l'Indice Polydora (IP variant de 0 à 1) qui repose sur la qualité des huîtres réparties en 5 classes (de 0 à 4) en fonction de l'aspect des valves.
Journal de Recherche Océanographique (Union des Océanographes de France), 2001

Droits : 2001 Union des Océanographes de France
http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/publication-2447.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2447/