Éditeur(s) : Université des Antilles. Service commun de la documentation Université de Guyane
Extrait de : 52e congrès annuel de la Société caribéenne des plantes alimentaires / 52nd annual meeting of the Caribbean food crops society (CFCS), du 10 au 16 juillet 2016. INRA, CFCS
Description : The Sargassum seaweed [Sargassum natans and S. fluitans] can be classed as a perennial invasive weed problem in all the Caribbean islands. It has been shown to affect fisher-folks, sea bathers, and tourists. It is proving to be costly to remove; in addition to its offensive odour which hampers the clean-up operations. The University of Trinidad and Tobago at the BAFT campus is engaged in series of activities to find suitable uses of the seaweed as animal feed, and as soil medium and ameliorant. This study aimed at evaluating the suitability of the seaweed as a growing media for the production of sweet peppers [Capsicum annuum var. annuum] using different percentage of the weed (0, 25, 50 and 100%) with soil under greenhouse conditions. The crop growth and development and yield were monitored. The results indicated that the plant height [Y pl ht = 16.6 + 0.3 DAT - 0.11 TRT] and leaf number [Y no.lvs = 0.90 + 1.04 DAT - 0.206 TRT] increased as age of the crop increased, but decreased with the increase in percentage of seaweed/ soil mixture. A similar response was observed for the flower buds and fruits numbers and percentage soil mixture. The medium had no effect on the crop transpiration and net photosynthesis rate [PN] , photosynthesis active radiation[PAR] , and stomatal conductance. A nutrient analysis of the medium was also conducted.
Siècle(s) traité(s) : 21
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V16268

Extrait de : Christophe Colomb vu par un marin (Page 126)
Résumé : Dessin

Droits : Domaine public
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PAP110640130i1

Éditeur(s) : GFP : Groupe Français des Pesticides
Extrait de : "Protection des cultures et santé environnementale : héritages et conceptions nouvelles" : congrès, le 26 mai 2014. Université des Antilles et de la Guyane
Description : Bien que la réglementation concernant l'usage des phytosanitaires soit de plus en plus encadrée, la présence de nombreux pesticides persiste dans l'environnement. Le lessivage des surfaces cultivées entraine ces derniers dans les écosystèmes aquatiques dans lesquels on trouve encore des molécules comme l'atrazine dont l'emploi est pourtant interdit en Europe depuis plus de 10 ans. La présence de ces molécules constitue un risque avéré pour la pérennité de la ressource en eau. Ainsi, des outils de monitoring pour une surveillance in situ des écosystèmes deviennent indispensables pour les gestionnaires. C'est dans ce contexte que nous développons des biocapteurs dont le fonctionnement repose sur l'étude de la perturbation du métabolisme de cellules algales immobilisées. Les algues, à la base des chaînes trophiques, sont très sensibles aux pollutions. L'outil proposé possède ainsi une bonne pertinence écologique
Siècle(s) traité(s) : 21
Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
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V14251

Éditeur(s) : Paris : N. Rémond
Extrait de : "Cryptogamia Guyanensis seu plantarum cellularium in Guyana Gallica annis 1835-1849. A CL. Leprieur collectarum. Enumeratio Universalis (Entre p.62 et p.63)
Siècle(s) traité(s) : 19
Droits : Domaine public
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GAD110530001i1

Éditeur(s) : Madibenthos
Description : Du 5 septembre au 11 octobre 2016, le Muséum national d'Histoire naturelle a piloté sur les côtes martiniquaises un inventaire de grande ampleur de la faune et de la flore. L'expédition avait pour objectif de renforcer la connaissance actuelle de la biodiversité marine en Martinique par un inventaire quasi exhaustif d'espèces qui sont encore méconnues (algues, éponges, mollusques, crustacés, échinodermes...). Philippe Bouchet, chef de la mission, rappelle dans quel cadre sont menées les grandes expéditions du Muséum. Claude Bouchon évoque ensuite l'évolution des récifs coralliens antillais depuis 30 ans et explique comment les activités humaines impactent cet écosystème riche et fragile. Josiane Pain Mahieu, enseignante au Lycée Montgérald du Marin, qui a participé à la constitution de l'alguier lors de la mission, clôt la conférence en soulignant la nécessité de sensibiliser le jeune public : faire connaître les problématiques de la biodiversité marine de la Martinique aujourd'hui devrait permettre de la préserver demain.
Siècle(s) traité(s) : 21
Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
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V16284

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : L’algue est une ressource marine peu étudiée par la géographie ; elle offre pourtant des potentialités de développement économique. Les macro-algues cultivées à des fins alimentaires sont une alternative à la pêche. Les micro-algues constituent une biomasse valorisable : molécule pharmaceutique, Oméga 3 et biocarburants. De ces différents usages naît la question suivante : les algues sont-elles une ressource marine à exploiter pour développer durablement les territoires de la zone intertropicale ? Nous présenterons tout d’abord l’algoculture à l’échelle mondiale en soulignant le faible poids de cette activité dans le bassin caribéen. Puis nous montrerons que l’algoculture s’inscrit dans un processus de développement durable en assurant un revenu à des communautés rurales (Petites Antilles). Enfin, dans une approche comparative (États-Unis), nous verrons que l’espace caribéen est une région de projets et d’aménagements durables qui a des atouts pour développer l’algoculture : exposition solaire, hautes températures, proximité de la recherche américaine.
Algae as sea resource have not been largely explored in Geography, yet it offers the potential for economic development. Macro-algae are cultivated for food purposes and they can substitute for fishing. Micro-algae can be valued as biomass: “nutraceutics”, Omega 3, biofuel. These various utilizations raise a question: are algae a key to a sustainable development in intertropical islands? We shall present Algaculture on a global scale, while emphasizing its low importance in the Caribbean. Then we shall show how algaculture can be part of a process of sustainable development by providing revenue to rural communities (Lesser Antilles). Finally, in a comparative approach (with the US), we shall see that the Caribbean Region has a number of assets for algaculture that make it suitable for sustainable projects and infrastructures: solar exposure, high temperatures, close to the US research centers.
États-Unis
Caraïbes

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.4389
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/4389

Éditeur(s) : Universite Montpellier II
Résumé : Since 1980, the expansion of a green macro-alga: Valonia aegagropila (C Agardh) is observed in Salses-Leucate lagoon (France). It is currently distributed in the north of the lagoon with important biomasses (40 gDW/m²) eroding the cover of Zostera noltii. The free form of the alga can be transported with the surface or bottom currents depending on seasons. It multiplies mainly by vegetative reproduction. There are few studies on the ecophysiological capacities of V. aegagropila. This work tries to answer why (physiological adaptation) and how (mechanical process of transport) the alga invaded the lagoon, with an approach including observations, experiments in controlled environment and biological and hydrodynamic models. The growth capacities depend on temperature and light intensities, the nutrients absorption rates and internal nitrogen and phosphorus internal quotas were measured and modelled using a Droop model based on internal quota. Vertically transport was studied with laboratory experiments and measurements of biomass transport were made into the lagoon. The biological model (growth, vertical transport, mortality) was coupled to the MARS 3D hydrodynamic model with a meshgrid of 160m. The results show an adaptation of the alga to low availability of phosphorus and an annual growth of biomass controlled by the availability of nutrient during winter. The alga seems to occupy the whole zones where growth is optimal and the risk of invasion of the southern part of the lagoon is limited. This work opens on research prospects on an ecological model (confronting physiological capacities and competition of V. aegagropila, Zostera noltii, green algae and primary production), new physiological experiments, ecological observations and potential valorisation of V. aegagropila.
Depuis 1980, est observée dans l'étang de Salses-Leucate l'expansion d'une macro-algue verte : Valonia aegagropila (C. Agardh). En 2004, elle était présente sur la presque totalité de la moitié nord de la lagune avec des biomasses importantes (jusqu'à 600 gPS/m²). L'algue envahit et érode également la couverture d'herbiers garant de la biodiversité, de la productivité et de la stabilité de l'écosystème. V. aegagropila se reproduit essentiellement de manière végétative (fragmentation des thalles) et possède la particularité de retenir de l'oxygène de la photosynthèse dans sa structure sphérique. Cet oxygène piégé lui donne la possibilité de mouvement sur la verticale et d'être transportée dans le domaine par les courants. Les conditions physico-chimiques de l'étang présentent de fortes variations saisonnières en salinité, en température et en turbidité, ainsi que des apports nutritifs faibles : la production primaire est principalement limitée par le phosphore. Il existe malheureusement peu d'informations sur V. aegagropila ainsi que trop peu de connaissances sur son écophysiologie. Elle semble vivre dans des milieux plutôt oligotrophe dans des régions tropicales à sub-tropicales. Ce travail basé sur une approche d'observations de terrain, d'expérimentations en milieu contrôlé (en laboratoire) et de modélisation des processus, a permis d'une part d'explorer les capacités adaptatives physiologiques de V. aegagropila aux conditions environnementales de l'étang et d'autre part de mettre à jour les modes de fonctionnement de la dynamique spatio-temporelle de la population. Les capacités de croissance ont été mesurées sur un large spectre de température et de lumière. Les capacités d'absorption des sels nutritifs dans l'eau et les facultés de l'algue à stocker l'azote et le phosphore dans ses tissus ont également été étudiées. D'autre part, un modèle de dynamique des populations a été conceptualisé puis développé. Les processus pris en compte dans ce modèle sont la croissance de l'algue (modèle à quota interne), la flottabilité de l'algue et la mortalité par surdensité. Ces processus ont été paramétrés en majeure partie par des expérimentations réalisées en laboratoire. Ce modèle 0D a par la suite était couplé au modèle hydrodynamique MARS3D (modèle Ifremer) mis en place sur la lagune de Salses-Leucate, utilisant deux grilles de calcul (160m ou de 80m de résolution). Les simulations réalisées permettent d'appréhender les capacités spatio-temporelles de la croissance de l'algue dans l'étang, le turnover annuel de la biomasse totale et les attracteurs de biomasse du système sous différents évènements météorologiques. Ces résultats sont comparés avec les répartitions cartographiques de la population observées in situ en 1999 et 2004 et des flux de biomasses mesurés au cours d'observations de terrain entre juin 2003 et septembre 2004. L'ensemble des résultats montre d'une part une adaptation de l'algue à évoluer dans un milieu pauvre en phosphore et d'autre part une croissance annuelle de la biomasse totale qui est principalement contrôlée par les apports hivernaux en sels nutritifs dans la lagune. Les résultats des simulations montrent également que V. aegagropila semble occuper à présent la majeure partie des zones favorables à sa croissance. Il est également montré que si sa capacité de mouvement peut favoriser la dispersion d'individus dans la lagune et accélérer la croissance de la population pour de faibles biomasses initiales, cette même capacité de mouvement joue plutôt un rôle de régulation de la population lorsque la biomasse totale devient importante. On peut penser que le risque de colonisation de l'herbier à zostère de la partie sud de la lagune (bassin de Salses) est limité. Ce travail ouvre enfin des perspectives de recherche sur l'amélioration du modèle de dynamique des populations de l'espèce, sur de nouvelles expérimentations à réaliser ou encore sur la surveillance écologique du milieu. Des propositions sont faites pour concevoir un modèle écologique confrontant les capacités physiologiques des macrophytes (algues vertes, Valonia et zostères) afin d'apréhender les phénomènes de compétitions et les modes de fonctionnement du réseau trophique de la lagune de Salses- Leucate. Des pistes sur la valorisation de la matière algale de V. aegagropila sont enfin proposées.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/these-2453.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2453/

Éditeur(s) : CRILLASH : Centre de Recherches Interdisciplinaires en Lettres, Langues, Arts et Sciences Humaines
Extrait de : "Patrimonialisation et développement dans la Caraïbe et les Amériques" : colloque international, du 2 au 4 mars 2011. Université des Antilles et de la Guyane
Description : L'ile de Saba est une ile néerlandaise d'une superficie de 13 km2 située au nord ouest des petites Antilles qui a entamé il y a plusieurs décennies un processus de patrimonialisation. Bien que ne comportant pas de plage, la beauté et la richesse des fonds marins sont réelles en raison des coraux, éponges, algues... Il y a alors pour les activités de plongée un intérêt économique de protéger les récifs coralliens, et ce dès 1984 avec l'élaboration d'un parc marin de 1300 hectares entourant l'ile. La patrimonalisation est donc dans ce cas une forme de régulation environnementale. Toutefois, la zone naturelle ne fait pas l'unanimité au regard de l'exclusion de la population locale et de l'appropriation des ressources marines par le tourisme.
Siècle(s) traité(s) : 21
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V12130

Résumé : L' industrie française des algues rouges qui occupe en 1982 le deuxième rang mondia extrait de certaines espèces d'algues telles que Chondrus crispus, Gigartina stellata, G. skotsbergi, Eucheuma cottonii, E. spinosum, Iridea sp. des polysaccharides appelés carraghénanes

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00045/15656/13059.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00045/15656/

Résumé : Shouldn't Earth, the human planet, be called the algae planet? First appearing 3.5 billion years ago, algae have always been objective allies of life and humans. Brought about by algae, oxygen and the ozone layer allowed plant and animal life to develop in oceans and on continents. They offer spawning grounds and feeding grounds for marine fauna....
La Terre, dite planète des hommes, n'est-elle pas en réalité celle des algues? Présentes il y a 3,5 milliards d'années, elles ont toujours été les alliées objectives de la vie et des hommes. Nous leur devons l'oxygène et la couche d'ozone qui ont permis la vie végétale et animale en mer et sur les continents. Elles servent de frayères et de nourriceries à la faune marine. Les algues ont toujours été offertes à l'homme pour sa nourriture et les besoins les plus divers. Algues brunes, vertes, rouges fournissent les substances, alginates, carraghénanes, agars, que l'industrie adapte à des usages innombrables entrant de plus en plus dans la vie moderne, qu'il s'agisse de matériaux courants (textiles, papiers, films, peintures), de toutes sortes d'aliments pour l'homme ou les animaux d'élevage, de médicaments, de produits de beauté,... La transformation des algues est parmi les secteurs les plus performants et les plus innovants de l'industrie moderne. L'avenir est prometteur pour les antibiotiques, antivirus et anticoagulants qu'elles contiennent. / Mais, les peuplements naturels ne suffisent plus à satisfaire cette demande. Il a fallu recourir à la culture des algues. Plus de 530 000 hectares y sont consacrés, 900 000 algoculteurs y travaillent dans 200 000 entreprises familiales, 250 usines conditionnent les produits. L'algoculture est la branche la plus forte de l'aquaculture. Cet ouvrage fait l'inventaire des méthodes utilisées dans le monde, surtout en Extrême-Orient, au moment où l'on passe de la culture toute simple à celle gérée par ordinateur, en un temps où il apparaît de plus en plus que l'algoculture pourrait être une des sources de cette énergie propre dont l'humanité aura immanquablement besoin. Cette synthèse s'adresse non seulement aux scientifiques qui y trouveront un point des connaissances màis à tous ceux, algoculteurs, industriels, aménageurs, écologistes, qui tireront le meilleur parti de cette somme d'expériences. Qui s'intéresse aux algues y trouve un livre de base. [OCR NON CONTRÔLE]

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1992/rapport-4402.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4402/

Éditeur(s) : HAL CCSD Fayard/Arthème
Résumé : La biomécanique des plantes est née d'une approche interdisciplinaire. Elle regroupe ainsi des biologistes, des forestiers ou des agronomes, et des mécaniciens (des matériaux et des structures et plus récemment des fluides). Elle s'intéresse à la façon dont les plantes se portent et croissent. En particulier comment les plantes terrestres croissent en hauteur " contre " la gravité et dans le vent ; mais aussi comment les plantes aquatiques et les algues se développent dans les courants.
Aux Origines des Plantes

hal-00795935
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00795935
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00795935/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00795935/file/BiomA_canique_plantes_Fournier_Moulia_Gril.pdf

Éditeur(s) : Centre Océanologique de Bretagne
Résumé : Après une période de croissance rapide depuis la seconde guerre mondiale, l'exploitation des ressources vivantes des océans est stabilisée depuis quelques années entre 60 et 65 millions de tonnes par an, pour l'ensemble des océans. Ces chiffres recouvrent l'ensemble des produits tirés de la mer, qu'il s'agisse de vertébrés ou d'invertébrés, d'animaux ou de végétaux. De même, la distinction entre produit de la pêche et produit de la culture ou de l'élevage n'est pas faite. En réalité, si les poissons représentent une partie importante de ce total, l'homme exploite également la plupart des groupes zoologiques d'invertébrés marins, quelques reptiles et les mammifères marins (cétacés et pinnipèdes), et des algues (en particulier des algues rouges et des algues brunes). Dans la plupart des cas, ces groupes sont exploités en vue de l'alimentation humaine ; il existe toutefois d'autres formes d'utilisation de certaines espèces, l'une des plus connues étant l'utilisation des algues pour la production d'alginates, de carragen et d'agar-agar. L'utilisation de certaines espèces de gastéropodes marins pour la fabrication de colorants remonte en Méditerranée a l'époque antique (la pourpre). L'utilisation de coquillages à des fins décoratives ou même en tant que monnaie d'échange a été très répandue chez les populations des îles du Pacifique ; la collection de l'amateur moderne, comportant des pièces atteignant une valeur élevée, peut être considérée comme un dérivé récent de ces usages traditionnels. Afin de ne pas alourdir l'exposé, nous limiterons volontairement cet inventaire aux algues et aux invertébrés, utilisés dans l'alimentation humaine, à l'exclusion des autres formes d'utilisation (1). [OCR NON CONTRÔLE]
Recueil des travaux du Centre Océanologique de Bretagne (Centre Océanologique de Bretagne), 1971 , N. 5 , P. 527-537

Droits : Centre Océanologique de Bretagne
http://archimer.ifremer.fr/doc/1971/publication-5110.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/5110/

Résumé : L'industrie française des algues rouges qui occupe en 1978 le deuxième rang mondial extrait de certaines espèces d'algues telles que Chondrus orispus, Gigartina stellata, Eucheuma cottonii, Eucheuma spinosum, des polyssaccharides appelés carraghénanes. La principale propriété de ces carraghénanes est de réagir avec les composants du lait pour donner des gels à fine structure, d'où leur utilisation dans la fabrication de tous les dérivés actuels du lait (pâtisseries, flans, crèmes, glaces, fromages, laits chocolatés, sauces). Cette industrie traite actuellement 7 000 tonnes d'algues sèches Le littoral métropolitain en fournit 2 000. Le reste, soit 5 000 tonnes provient d'Extrême-Orient, d'Afrique ou d'Amérique du Sud. Mais, les pays fournisseurs ont de plus en plus tendance à freiner ces exportations de façon à favoriser la création d'usines de transformation sur leur propre territoire. Les usines françaises éprouvent donc de plus en plus de difficultés pour obtenir la matière première indispensable à leur fonctionnement et à leur expansion, surtout en ce qui concerne les carraghénophytes de haute qualité. L'I.S.T.P.M. s'efforce de les aider dans ce domaine : - il étudie les possibilités de culture d'algues qui pourraient augmenter le potentiel disponible soit en France comme les travaux actuels sur la culture en bassin de l'algue rouge Chondrus crispus, soit à l'étranger comme les travaux sur la culture en mer de l'algue rouge Eucheuma spinosum à Djibouti, dont les résultats ont été spectaculaires ; - il recherche sur nos côtes d'autres espèces d'algues qui contiendraient des carraghénanes où des populations de carraghénophytes encore inexploités.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00018/12926/9888.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00018/12926/

Résumé : La mission effectuée du 8 au 24 août 1980 par M. DRENO du Centre Antilles-Guyane et M. BARBAROUX du Centre de Nantes se situe dans le cadre des missions prévues dans le programme de recherches sur les possibilités de culture de l'algue Eucheuma spinosum aux Antilles. Elle avait deux objectifs : * faire le point sur la biologie de l'algue et en particulier sur sa croissance; * construire un module de culture intensive de 2 SOO m² pour évaluer les incidences financières de la culture sur une grande échelle.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00046/15692/13094.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00046/15692/

Résumé : It is about an article presenting the institute, its history, its presence and the projects it leads in New Caledonia. After a first part of general presentation of Ifremer a focus is placed on the strengthening of the presence of the institute in New Caledonia. 3 points are developed by L. Loubersac on the in-house organization, the strategy and examples of works realized within the framework of the buildind up of the lagoons integrated project. Then a spotlight is offered toward 3 projects: DEDUCTION 2 which aims at optimizing the performances of the shrimp aquaculture sector (T. Laugier), AMICAL which focuses on micro-algae aquaculture (L. Chim) and AMBIO centred on the monitoring and the definition of performance indicators for management of Marine Protected Areas and zones Registered on the World heritage (D. Pelletier). The synthesis of this article is realized by S. Chopot of the New Caledonia environment magazine.
Il s’agit d’un article présentant l’institut, son historique, sa présence et les projets qu’il mène en Nouvelle-Calédonie. Après une première partie de présentation générale de l’organisme un focus est placé sur le renforcement de la présence de l’Ifremer en Nouvelle-Calédonie. 3 questions sont posées à L. Loubersac sur l’organisation en interne, la stratégie et des exemples de travaux réalisés dans le cadre du chantier lagons. Puis un coup de projecteur est porté sur 3 projets : Déduction 2 qui vise à optimiser les performances de la filière crevetticole (T. Laugier), AMICAL qui se focalise sur la culture de micro-algues (L. Chim) et AMBIO axé sur le suivi et la définition d’indicateurs de performance des modes de gestion des Aires Marines protégées et des zones Inscrites au Patrimoine Mondial (D. Pelletier). La synthèse de cet article est réalisée par S. Chopot de la revue Environnement Nouvelle-Calédonie.
Environnement Nouvelle-Calédonie, 2013-05 , N. 20 , P. 60-89

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00200/31093/29501.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00200/31093/

Éditeur(s) : ISTPM
Résumé : L'industrie française des algues rouges qui occupe en 1983 le 2e rang mondial, extrait des polysaccharides appelés carraghénanes de certaines espèces d'algues telles que Chondrus crispus, Gigartina stellata, G. skotsbergi, Eucheuma cottonii, E. spinosum, Iridea sp. La principale propriété de ces carraghénanes est de réagir avec les composants du lait pour donner du gel à fine structure, d'ou leur utilisation dans tous les dérivés actuels du lait (pâtisserie, flans, crèmes, glaces, fromages, laits chocolatés, sauces). Cette industrie a besoin de 7 500 t d'algues sèches ; le littoral métropolitain en fournit à peine 900 t. Le reste, soit plus de 6 000 t provient de l'étranger (Extreme-Orient, Afrique de l'Est, Amérique du Sud, Amérique du Nord). Eucheuma spinosum est importé, non sans problèmes, des Philippines. Un programme d'étude a été réalisé de 1978 à 1982 afin d'exploiter éventuellement les peuplements naturels des Antilles et d'expérimenter divers types de culture.
Science et Pêche (0036-8350) (ISTPM), 1984-09 , Vol. 348 , P. 1-9

Droits : Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/1984/publication-7039.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/7039/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Transposable elements play a major role in the evolution of eukaryotic genomes. Knowing the distribution of transposable elements between different species within the same taxon is essential to study their dynamics and to better understand their role in the evolution of species. Given their abundance, species diversity and living environment, crustaceans are an excellent model for studying comparative genomics of retrotransposons. It is notably in the squat lobsters that the GalEa clade of Superfamily Copia was defined. We studied the distribution of two well-known LTR retrotransposons superfamilies: Gypsy and Copia, in crustaceans. By combining PCRs with degenerate primers and in silico analysis, we identified 35 families of Copia retrotransposons and 46 families of Gypsy retrotransposons in 15 and 18 species of crustaceans (mainly Malacostraca: crabs, shrimp, krill ...). These elements have different distribution and diversity in crustaceans. Gypsy elements appear relatively commonly and diverse in all species. Conversely, the Copia elements seem rare, and consequently more difficult to detect, and are largely dominated by the elements of the clade GalEa. These results suggest two different dynamic strategies for retrotransposons Gypsy (the Red Queen theory) and retrotransposons GalEa (‘domino days spreading’ branching process). In addition, GalEa elements present a great evolutionary success being widely distributed in many branches of metazoans. They are also present in certain red algae and we have also detected them in Fungi. Taking advantage of the large amount of available genomic data, we have studied the distribution of GalEa elements of Fungi, in order to compare it with the results obtained in crustaceans. In fact, they appear only in a large phylum of Ascomycetes, in Pezizomycotina, and they form a monophyletic group within the GalEa. Finally, in the Fungi, the GalEa elements are not majority among Copia retrotransposons. We have therefore initiated a new study in molluscs, to define if the results obtained in crustaceans are a feature of GalEa elements, Malacostraca or metazoans.
Les éléments transposables jouent un rôle majeur dans l’évolution des génomes eucaryotes. La connaissance de la distribution des éléments transposables entre différentes espèces au sein d’un même taxon est une condition essentielle pour étudier leur dynamique et mieux comprendre leur rôle dans l'évolution des espèces. Compte tenu de leur abondance, de leur diversité spécifique et de milieu de vie, les crustacés sont un excellent modèle pour étudier la génomique comparative des rétrotransposons. C’est notamment chez les Galathées qu’a été défini le clade GalEa des éléments de la superfamille des Copia. Nous avons étudié la distribution de deux superfamilles de rétrotransposons à LTR bien connus: les Gypsy et les Copia, au sein des crustacés. En combinant des PCRs avec amorces dégénérées et des analyses in silico, nous avons identifié 35 familles de rétrotransposons Copia et 46 familles de rétrotransposons Gypsy dans respectivement 15 et 18 espèces de crustacés (principalement des malacostracés : crabes, crevettes, krill...). Ces éléments présentent une distribution et une diversité différentes au sein des crustacés. Les éléments Gypsy apparaissent relativement fréquents et diversifiés dans toutes les espèces. A l’inverse, les éléments Copia semblent rares, donc difficilement détectables, et sont largement dominés par les éléments du clade GalEa. Ces résultats suggèrent deux stratégies différentes de dynamique pour les rétrotransposons Gypsy (théorie de la Reine Rouge) et les rétrotransposons GalEa (‘domino days spreading’ branching process). De plus, les éléments GalEa présentent un grand succès évolutif en étant largement distribués dans de nombreuses branches de métazoaires. Ils sont aussi présents chez quelques algues rouges et nous en avons également détecté chez des Fungi. Profitant des nombreuses données génomiques disponibles, nous avons donc étudié la distribution des éléments GalEa de Fungi, dans le but de comparer celle-ci aux résultats obtenus chez les crustacés. En fait, ils n’apparaissent qu’au sein d’un grand embranchement d’ascomycètes, les Pezizomycotina, et ils forment un groupe monophylétique au sein des GalEa. Enfin, chez les Fungi, les éléments GalEa ne sont pas majoritaire parmi les rétrotransposons Copia. Nous avons donc initié une nouvelle étude chez les mollusques, afin de définir si les résultats obtenus chez les crustacés sont une caractéristique des éléments GalEa, des malacostracés ou des métazoaires.
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01132413

NNT : 2015PA066017
tel-01132413
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01132413
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01132413/document
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01132413/file/these_archivage_2600252o.pdf

Éditeur(s) : Office scientifique et technique des pêches maritimes
Résumé : This fourth part deals with the following points: - Industries related to fishing: - Curing, salting and canning - Processing of by-products - Refrigeration - Processing of seaweed - Oyster farming, mussel farming and shellfish farming - General survey of maritime fishing regulation in France
Cette version du Manuel des Pêches Maritimes françaises a été éditée en 1936 par l'Office des Pêches Maritimes. Les auteurs ont essayé de préciser quelle était alors la situation technique de l'industrie à laquelle étaient consacrées leurs études. Ce quatrième fascicule traite des points suivants: - Les Industries annexes de la pêche : - Fumage, Salage et Conserve - Traitement des sous-produits - Frigorification - Traitement des Algues marines - L'Ostréiculture, la Mytiliculture et la Conchylicultrice - Aperçu sur la réglementation de la pêche maritime en France
Mémoires de l'Office des Pêches Maritimes (1245-558X) (Office scientifique et technique des pêches maritimes), 1936-04 , Vol. Série spéciale , N. 12 fasc.4

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http://archimer.ifremer.fr/doc/1936/rapport-1738.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1738/

Résumé : Few years ago, proliferations of the green seaweed Enteromorpha have been noticed on sorne beaches of the southem coast of Martinique (American French Island). A study, in the year 1992, shows that Enteromorpha has a seasonal development, that nitrogen is the limiting factor, and that its principal feeding cornes from urban discharges thrown away directly into growing areas.
Certaines plages de la côte sud de Martinique voient apparaître depuis quelques années des échouages gênants de l'algue verte Enteromorpha. Une étude, réalisée en 1992, montre que le cycle de développement est saisonnier, que l'élément limitant est l'azote, et que la principale alimentation des proliférations d'algues vertes provient de rejets domestiques directs dans les zones de production.

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http://archimer.ifremer.fr/doc/00132/24277/22275.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00132/24277/

Résumé : This report is a prerequisite publication of a popular book, synthesizing and summarizing the main data on identification, names, biology and fishing aspects fo more than a hundred species of seaweeds and marine invertebrate.
Ce rapport interne constitue l'étape préalable à la diffusion d'un ouvrage de vulgarisation sur les produits commerciaux des pêches métropolitaines, destiné en priorité à la profession. Cet ouvrage sera le complément de celui édité en 1984 pour le FIOM par Jacques Grancher : " Les poissons de mer des pêches françaises". L'objectif est de mettre à la portée du plus grand nombre, des données sur la connaissance, la biologie, la pêche et les appellations françaises (officielles et vemaculaires) et étrangères des espèces marines commerciales. Plus d'une centaine d'espèces d'algues et d'invertébrés sont présentées.

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http://archimer.ifremer.fr/doc/1992/rapport-1534.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1534/