Éditeur(s) : Natural Resources Group, CIMMYT Natural Resources Group, CIMMYT ( Mexico D.F )
Résumé : (Bibliography) Includes bibliographical references.
(Statement of Responsibility) A.D. Hartkamp ... et al..
(Funding) Electronic resources created as part of a prototype UF Institutional Repository and Faculty Papers project by the University of Florida.
Latin America
Asia
Africa
Latin America
Asia
Africa
Latin America
Asia
Africa

47771674
9706480501

Éditeur(s) : Université des Antilles AREBio Groupe de recherche BIOSPHERES : BIOlogie, Sciences Physiques & Humaines pour les énergies Renouvelables, l
Extrait de : 1er colloque international BIOSPHERES, du 18 au 20 juin 2019. Université des Antilles
Description : Antarctica is a continent of enigmas. Stunning geographic beauty belies its inhospitable climate. Covered a mile thick in ice, it is the world's largest desert. Fossil ferns found in its mountains speak of its prehistory as a tropical rainforest, but now is largely devoid of life. Its most famous inhabitant, the penguin, is thought of as a flightless bird, but soars underwater much as a falcon glides the sky. Perhaps one of the greatest enigmas is the contrast between the terrestrial and marine environments. On land, monochromatic snow and ice support little life, yet the sea teams with life, life that expresses itself with the full rainbow of colors. Color is but one manifestation of chemical ecology. The Antarctic benthos supports an extensive community of predators and prey, competitors and facilitators. A harsh geographic history has contributed to marine diversification and enhanced what we now recognize as a rich flora and fauna, commensurate in some instances with temperate kelp forests and even approaching the richness of tropical marine environments. Not surprisingly, Antarctic benthic ecology is highly dependent on chemical mediation of interspecific interactions, interweaving chemodiversity with biodiversity in a classical yin and yang feedback loop. The evolution of selective chemical defenses facilitates drug discovery research, producing suites of metabolites that inform structure-activity studies and add breadth to bioactivity profiles. This presentation will focus on recent and contextual research from our lab which has demonstrated the potential for new biomedical lead molecules and scaffolds from these difficult to access biological resources.

Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
Permalien : http://www.manioc.org/fichiers/V19067
V19067

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
It is now well recognized that information management systems often deal with geographic information even if they often do not take advantage of it. In these systems, requirements engineering (RE) is becoming more and more important in helping stakeholders to model their requirements regarding the quality of the data.However, to date, few RE projects take geographic information and geographic constraints into account. We thus propose to study in this paper the question of managing such geographic constraints in the framework of RE. We propose an extension of the RE model and its implementation within the KAOS framework, and the use of geographic ontologies
2nd International Conference on Knowledge Management, Information and Knowledge Systems
Hammamet, Tunisia

lirmm-01230140
https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-01230140

Résumé : The slides were taken on collecting trips sponsored by the William L. Bryant Foundation, where books, music and art indigenous to the regions were gathered. The are organized by geographical location.
The Churchill Building currently stands on the site of the former Adderley building which was purchased by the Bahamian government through the Adderley Property Purchase Loan Act of 1963. The Churchill Building was built in the early 1960s. The Adderley Building, pictured, houses the Tourism Information office and the John F. McCarthy Real Estate Insurance company. The building is located on the south side of Rawson Square which sits on the corner of Bay and East streets. Tourists are driving down Bay Street in a surrey, a horse-drawn door-less, four-wheeled carriage with two seats.
Bahamas -- North America --Nassau, New Providence Island

Droits : All rights to images are held by the respective holding institution. This image is posted publicly for non-profit educational uses, excluding printed publication. For permission to reproduce images and/or for copyright information contact Special Collections & University Archives, University of Central Florida Libraries, Orlando, FL 32816 phone (407) 823-2576, email: speccoll@mail.ucf.edu
CFM1972_01a
Sheet 14:2
http://ufdc.ufl.edu/AA00029327/00001

Résumé : The slides were taken on collecting trips sponsored by the William L. Bryant Foundation, where books, music and art indigenous to the regions were gathered. The are organized by geographical location.
Two female street flower vendors in Kingston, Jamaica. Flowers include various types of lilies and carnations. Selling goods on street corners is part of the informal commercial market economy of Jamaica. Street vendors, higglers, engage in this form of business in order to earn additional or primary income by selling agricultural surplus. The photo contains a Grace Foods brown bag showing the slogan "Grace, The Good Food People" and Hannah Town Bakery box. Slide labeled Jam. flowers, Kingston.
Jamaica -- Caribbean region -- Kingston

Droits : All rights to images are held by the respective holding institution. This image is posted publicly for non-profit educational uses, excluding printed publication. For permission to reproduce images and/or for copyright information contact Special Collections & University Archives, University of Central Florida Libraries, Orlando, FL 32816 phone (407) 823-2576, email: speccoll@mail.ucf.edu
CFM1972_01a
Sheet 58:12
http://ufdc.ufl.edu/AA00030132/00001

Éditeur(s) : HAL CCSD BioMed Central
Résumé : International audience
Background: Heterogeneous patterns of malaria transmission are thought to be driven by factors including host genetics, distance to mosquito breeding sites, housing construction, and socio-behavioural characteristics. Evaluation of local transmission epidemiology to characterize malaria risk is essential for planning malaria control and elimination programmes. The use of geographical information systems (GIS) techniques has been a major asset to this approach. To assess time and space distribution of malaria disease in Bandiagara, Mali, within a transmission season, data were used from an ongoing malaria incidence study that enrolled 300 participants aged under six years old ". Methods: Children's households were georeferenced using a handheld global position system. Clinical malaria was defined as a positive blood slide for Plasmodium falciparum asexual stages associated with at least one of the following signs: headache, body aches, fever, chills and weakness. Daily rainfall was measured at the local weather station. Landscape features of Bandiagara were obtained from satellite images and field survey. QGIS™ software was used to map malaria cases, affected and non-affected children, and the number of malaria episodes per child in each block of Bandiagara. Clusters of high or low risk were identified under SaTScan W software according to a Bernoulli model. Results: From June 2009 to May 2010, 296 clinical malaria cases were recorded. Though clearly temporally related to the rains, Plasmodium falciparum occurrence persisted late in the dry season. Two " hot spots " of malaria transmission also found, notably along the Yamé River, characterized by higher than expected numbers of malaria cases, and high numbers of clinical episodes per child. Conversely, the northeastern sector of the town had fewer cases despite its proximity to a large body of standing water which was mosquito habitat. Conclusion: These results confirm the existence of a marked spatial heterogeneity of malaria transmission in Bandiagara, providing support for implementation of targeted interventions. Background Malaria is one of the leading causes of morbidity and mortality in the world, with an estimated 3.3 billion people at risk of malaria [1]. The incidence of malaria worldwide is estimated to be 216 million cases per year, with 81% of these cases occurring in sub-Saharan Africa. Malaria kills approximately 655,000 people per year; 91% of deaths occur in sub-Saharan Africa [1], mostly in children under five years of age. In Mali, West Africa, malaria represents 36.5% of consultation motives in health center, it is a leading cause of morbidity and mortality children of less than five years of age and the first reason of anaemia in pregnant women [2]. Malaria transmission is seasonal. Malaria parasite transmission and clinical disease are characterized by important microgeographic variation, often between adjacent villages, households or families [3-8]. This local heterogeneity is driven by a variety of factors including human genetics [9,10], distance to potential breeding sites [11,12], housing construction
ISSN: 1475-2875

hal-01307672
https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01307672
https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01307672/document
https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01307672/file/1475-2875-12-82.pdf
DOI : 10.1186/1476-072X-2-5

Éditeur(s) : Rancho Torreon del Molino, Universidad Veracruzana Rancho Torreon del Molino, Universidad Veracruzana ( Veracruz )
Résumé : "El Instituto de Suelos de Cuba y la Universidad Veracruzana de Mexico crean la aplicación de un SIG a partir de la cartografia de suelos y factores limitantes a escala detalladaz de una entidad productiva dedicada a pastos en el tropico, estacionalmente humedo"--leaf 4.
(Statement of Responsibility) autores, Alberto Hernandez J., ... et al..
Mexico
Cuba
Mexico
Mexico
Mexico
Cuba
Cuba
Cuba

754651292
ocn754651292

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
Geographic Information Systems (GIS) help addressing geographical and environmental issues by providing information about a region or a city as a set of maps (layers), each one displaying information about a given theme like roads, vegetation, tourist spots or museums for instance. By combining different layers on a region, one can associate a given area to characteristics from their related themes. Indeed, the information from two or more layers might be merged and then transformed into a new layer as defined in map "algebra". When a theme vocabulary is organized as a taxonomy with concepts linked by is-a relationships, there are different ways to annotate an area with a concept depending on the level selected into the layer taxonomy. In this paper, we present an heuristic- based approach for an optimal merging of such layers in a GIS. Our goal is to generate new layers which sum up information from several themes in a most useful way. Two optimization criteria are considered, the average size of resulting areas and the average informative value of their resulting annotation. We demonstrate the validity of the proposed solution, firstly, on a formal example, and then, on a real world application.
Proceedings of the 4th International Conference on Advanced Geographic Information Systems, Applications, and Services
Valencia, Spain

hal-00679555
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00679555

Éditeur(s) : IRD : Institut de Recherche pour le Développement Université des Antilles et de la Guyane
Extrait de : "Projet CARIBSAT, système caribéen d'information environnementale" : conférence, le 21 mars 2013. Université des Antilles et de la Guyane
Description : L'intervention présente les résultats d'une étude conjointe entre géographes et biologistes de la Caraïbe et de la Réunion. M. David revient sur la création de l'International Coral Reef Initiative. Cette organisation mondiale avait pour but de mettre en place une gouvernance mondiale des récifs coralliens, en réponse aux menaces anthropiques pesant sur les coraux. Mais la prise en compte de l'action du changement climatique a fait évoluer cette conception. Accroissement de la température, acidification de l'océan et intensification des cyclones menacent également la santé des coraux. En réponse, plusieurs stratégies sont établies : création d'aires marines protégées, gestion intégrée des zones côtières et amélioration de l'évaluation des pressions anthropiques.
Siècle(s) traité(s) : 21
Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
Permalien : http://www.manioc.org/fichiers/V13091
V13091

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : L’agriculture aux Antilles, depuis la période coloniale, est orientée vers quelques monocultures, de la canne à sucre à la banane en passant par le coton et le café (Lasserre, 1961). Aux côtés de cette agriculture exportatrice, les agrosystèmes multi-espèces sont aussi très anciens mais ont longtemps fonctionné de façon isolée et sur une base empirique notamment à travers les jardins familiaux ou "jardin créole" (Degras, 2005). De plus en plus, l'intérêt, voire la nécessité d'une diversification professionnelle de l'activité agricole aux Antilles est admise, reconnue voire soutenue compte tenu des impasses agronomiques, environnementales ou économiques L’insularité d’un territoire entraine de nombreux conflits d’usage dans la gestion du capital foncier. La nécessité de terres à bâtir dans un contexte d’augmentation de la population, la nécessité de protection de la forêt tropicale, des forêts marécageuses de mangroves et des zones à proximité des rivières amènent de nombreuses questions en matière d’aménagement et de gestion des territoires surtout lorsqu’ils sont exigus. L’agriculture est un secteur consommateur d’espace et ce pour l’ensemble des productions agricoles Aux Antilles, l’agriculture connaît de lourds héritages avec la prépondérance des cultures destinées à l’exportation et gourmandes en surfaces, la canne à sucre et la banane. La gestion des territoires mais aussi des pratiques agricoles sont très clairement remises en cause depuis la crise médiatique de la chlordécone en 2002 et les années suivantes par les successives interdictions prononcées par arrêtés préfectoraux depuis la crise sociale de 2009 décriant les cultures d’exportation pour leur caractère polluant et intensif et appelant à un retour aux productions locales plus respectueuses de l’environnement. Les systèmes productifs sont sans cesse en évolution. Ces changements sont le reflet des choix productifs effectués par les exploitants et par des pratiques agricoles mises en œuvre. L’analyse du système se fera de manière à identifier les spéculations initiales et leurs évolutions au cours de la dernière décennie. La diffusion spatiale de ces pratiques agricoles ne s’effectue pas linéairement car, dans les systèmes productifs, le phénomène est bien plus complexe dont la compréhension nécessite la prise en compte (i) des interactions entre les acteurs et (ii) de l’aspect temporel. L’émission d’un message informatif évolue dans le temps ainsi que les acteurs et leurs interactions sur le territoire. Même si les agriculteurs sont soumis à des facteurs exogènes communs à l’ensemble de leur exploitation, ils sont tout de même concernés par des influences provenant des réseaux au sein desquels ils sont insérés. Le processus classique de diffusion des pratiques agricoles est résumé par la courbe logistique (Hägerstrand, 1967). Sur le territoire, la situation d’adoption de pratiques n’est pas homogène. Pour une compréhension et une anticipation quant à l’évolution du territoire, l’ensemble des DOM antillais sera sujet à étude. Dans un premier temps, l’analyse des spéculations des systèmes multi-espèces à travers une analyse exploratoire des données permettra de mieux appréhender les dynamiques spatiales perceptibles sur le territoire et ce en fonction du type de production agricole. Pour modéliser la dynamique spatiale de diffusion des choix, il faudra envisager une combinaison de plusieurs approches géographiques pour une meilleure compréhension de la situation et ce en fonction de la complexité du système multi-espèces proposé au sein d’une même exploitation. Il s’agit par la géographie historique de s’intéresser aux changements survenus dans les modèles agricoles au cours du temps en d’étudier l'utilisation des terres agricoles au cours de la dernière décennie (approche diachronique) et la photographie du paysage agricole aux Antilles Françaises (approche synchronique). Ces deux approches synchroniques et diachroniques, révèlent respectivement les corrélations entre plusieurs éléments qui se trouvent dans un même lieu à une période donnée et met l'accent sur les processus de l'activité agricole qui sous-tendent les changements dans les modèles géographiques. La diffusion d’une pratique peut être analysée tout d’abord temporellement (Rogers, 1983) en estimant qu’il n’existe pas de différenciation spatiale dans le phénomène. Dans un deuxième temps, la considération de la dimension spatiale (Hägerstrand, 1967) dans l’étude de la diffusion devient primordiale pour l’étude de diffusion d’une pratique agricole dans des territoires diversifiés même s’ils sont insulaires et exigus. Les processus de diffusion spatiale sont perceptibles à différentes échelles spatiales (Aber, 1972) et il s’agit de déterminer les échelles d’études les plus pertinentes pour clarifier le phénomène : de l’échelle régionale à l’échelle locale (Morrill, 1970). La difficulté est de sélectionner la meilleure échelle pour établir un modèle de diffusion spatio-temporelle (Morrill, 1970). Il s’agira, dans la présente étude, d’opter pour une analyse en « time-geography » (Chardonnel, 2001) à savoir une analyse des réactions des individus dans le temps et l’espace : le comportement des agriculteurs face à leur pratique de 2000 à aujourd’hui et la diffusion spatio-temporelle de ces pratiques agricoles sur le territoire. L’objectif principal de la thèse est de comprendre et de modéliser les processus de diffusion spatiale des pratiques agricoles dans les systèmes productifs multi-espèces aux Antilles françaises. Il s’agira de retracer l’apparition des pratiques agricoles de la dernière décennie des agriculteurs n’ayant pas de mono-spéculation mais développant des systèmes productifs multi-espèces et touchant par conséquent différents secteurs agricoles (banane, canne, élevage, maraîchage…) et tout cela dans une même exploitation agricole. L’enjeu sera d'identifier les différents évènements significatifs survenus et subis par les différentes filières agricoles concernées et les producteurs, évènements marquants intervenus au cours de la période, tant climatiques, parasitaires, qu'organisationnels, structurels, réglementaires, marchands ou sociaux. Chaque agriculteur souhaite faire converger son système de production vers ses objectifs productifs en tenant compte des évolutions contextuelles d’exercice de son activité et ce, en fonction de l’offre technologique disponible dans la période correspondante. Il s’agira d’établir un modèle spatio-temporel de diffusion d’pratiques agricoles en tenant compte des facteurs moteurs et facteurs barrières à l’adoption et en donnant des poids différents aux différents facteurs d’influence. L’adoption de pratiques agricoles dépend de la situation géographique de l’exploitation, de la distance par rapport à l’innovateur : le principal déterminant spatial de l’adoption dans les filières de diversification, moins sujettes à un message technique unilatéral prodigué pour des filières très structurées, est l’effet de « mimétisme » (Girard, 1961). Cette adoption dépend également de l’interconnexion entre les différents acteurs de filière. Ce lien n’est peut-être pas nécessairement lié à la proximité géographique des individus mais à une proximité sociale résultant de l’appartenance à un ou plusieurs réseaux sociaux (Granovetter, 1983). L’accessibilité à l’information et la réaction de l’agriculteur face aux changements de pratiques dépend de son appartenance à un groupe social. Dans des filières très bien structurées (canne à sucre et banane), le message technique diffusé est homogène à toute la population et est influencé grandement par des facteurs exogènes à l’exploitant. La dimension spatiale et les réseaux sociaux sont des facteurs influençant les choix des exploitants et ce selon le type d’exploitations (monoculture ou multi-espèces). Actuellement, il semblerait que ce soit le type d’exploitation (taille et localisation) qui influence le choix de l’exploitation dans l’adoption d’innovation en milieu bananier (Mantran, 2011). A partir des techniques d’exploration des données, on pourra aboutir à la mise au point d’un modèle explicatif de la diffusion d’informations et ce probablement par type de production. Cette étude permettra une meilleure connaissance du territoire et de ses dynamiques spatiales agricoles.
Doctoriales du CEREGMIA
Cayenne, Guyane, France

hal-01458425
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01458425
PRODINRA : 384817

Éditeur(s) : Remote Sensing and Geographic Information Systems for the Pacific: Report of the Working Group Meeting on Regional Co-operation in Applications of Remote Sensing and Geographic Information Systems Technology for the Pacific, 18-22 March 1991, Suva, Fiji. ST/ESCAP/998.
Résumé : Once the specific geographical context of French Polynesia and its needs about the use of results od Remote Sensing and Geographic Information have been presented and situated, the strategy used and developped both by the territory of French Polynesia and Ifremer in partnership is introduced. It comprises four parts and tries, by involving directly the end users, to make known the use of data of the high technology tools represneted bu Space Remote Sensing and Geographic Information Systems. Several types of the products are proposed and regional extrapolation plans are offered consequently.
Après avoir présenté et situé le contexte géographique spécifique à la Polynésie française et ses besoins en résultats de la télédétection et de l'information géographique, on présente la stratégie mise en place en partenariat entre le Territoire de Polynésie Française et Ifremer. Celle-ci comprend quatre axes et cherche, en impliquant directement les utilisateurs finaux, à faire mieux connaître l'utilisation des données des outils de haute technologie que sont la télédétection spatiale et les Systèmes d'Information Géographiques. Plusieurs types de produits dérivés sont présentés et des plans d'extrapolation régionale sont offerts en conséquence.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00143/25437/23590.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00143/25437/

Résumé : The slides were taken on collecting trips sponsored by the William L. Bryant Foundation, where books, music and art indigenous to the regions were gathered. The are organized by geographical location.
Street vendors selling flowers including various types of lilies and carnations. This is an example of small informal Jamaican business. The photo contains a Grace Foods brown bag and Hannah Town Bakery box. Slide labeled Jam. flowers Kingston.
Jamaica -- Caribbean region -- Kingston

Droits : All rights to images are held by the respective holding institution. This image is posted publicly for non-profit educational uses, excluding printed publication. For permission to reproduce images and/or for copyright information contact Special Collections & University Archives, University of Central Florida Libraries, Orlando, FL 32816 phone (407) 823-2576, email: speccoll@mail.ucf.edu
CFM1972_01a
Sheet 58:14
http://ufdc.ufl.edu/AA00030134/00001

Résumé : Au cours de 325 relevés, 518 observations visuelles et 202 acoustiques ont permis de recenser 4 familles, 14 genres et 17 espèces, représentant un effectif total cumulé de près de 6000 cétacés contactés dans les limites de 15 mille nautiques des côtes en Guadeloupe. Les dauphins (Delphinidëe), constituent 33% des 36 espèces actuellement connues dans le monde. Six espèces plus rares ont été décrites. Parmi les cétacés à fanons, la baleine à bosse (Megaptera novaeangliae) migre dans les eaux côtières de décembre à fin mai et reste l'espèce la plus rencontrée. Grâce à un suivi individuel par télémétrie, il a pu être prouvé qu'au moins un individu de cette espèce pouvait séjourner dans l'archipel plus de huit jours. En 2010, une baleine à bosse de la baie du Moule à été suivie sur plus de 6300 kilomètres jusqu'au sud de l'Islande, vers les Iles Féroé. Une première estimation de stock sur la période de 2008 à 2011 propose que 442 baleines à bosse %CV 19,29 IC95% [302-645] évolueraient dans l'archipel côtier. Les carnïvores sont les plus abondants, avec parmi ceux-ci, le dauphin tacheté pantroplcal (Stenella attenuata) dont l'estimation indique que 270 à 300 individus évolueraient sur 1361 km2 avec une densité relative élevée (0,052 tndtvtdus/km>, %CV 90,16), principalement en-côte-sous-le-vent. L'analyse de la répartition spatiale et des facteurs du milieu indique une sectorisation géographique marquée des populations en zone côtière, avec des distributions influencées spécifiquement par la bathymétrie, la latitude, les distances à la côte et à l'isobathe 200, pour les informations principales et selon les espèces.
In 325 surveys, 518 visuai observations and acoustic 202 have identified four families, 14 genera and 17 species, representing a cumulative total ofnearly 6000 cetaceans assessed within 15 miles of coastal water ofGuadeloupe. Dolphins (Delphinidae), constitute 33% ofthe 36 species currently known in the world. Six rare species have been described. Among the baleen whales, the humpback whale (Megaptera novaeangliae) migrate into coastal waters from December to late May and is the species most encountered. With individual monitoring by telemetry, it has been proved that at least one individual ofthis species could stay in the archipelago over eight days. In 2010, a humpback whale in the Bay ofmold were followed for more than 6300 km to the south ofIceland to the Faroe Islands. A first estimate ofstock over the period 2008 to 20 Il suggests that 442 humpback whales CV% 19.2995% [302-645] would evolve in the coastal archipelago. <..';:-.'") Carnivores are the most abundant, with among them, the spotted dolphin (Stenella attenuata) whose estimate indicates that 270 to 300 individuals are present over 1361 km 2 with a high specifie density (0.052 individuals / km 2,% CV 90, 16), mainly in the Leeward coast. The analysis ofthe spatial distribution and environmental factors indicates a marked geographical sectorisation ofpopulations in coastal areas, with distributions specifically influenced by bathymetry, latitude, distance to the coast and the isobath 200, depending on the species

http://www.theses.fr/2012AGUY0520/document

Résumé : After a period of rapid development of the sites (an increase in both reared surface area and production), tropical shrimp aquaculture is currently being faced with critical problems due to economical and ecological constraints. In many countries with favourable conditions for shrimp aquaculture such as indonesia or Vietnam, sites are often badly selected and/or over-exploited. This conducts to sorne extent to decreases or collapses in the production due to the difficulty in predicting the maximum production capacity of the sites. Furthermore, it appears that production sustainability depends on many factors among which socio-economy and ecolo gy are of prime importance. The STD3 project titled « Assessment of tropical shrimp aquaculture impact on the environment in tropical countries using hydrobiology, ecology and remote sensing as helping tools for diagnosis )) was initiated in 1994, with the aim to study the sustainability of marine shrimp aquaculture in tropical areas, main! y Indonesia and Vietnam, through the following tasks: (i) improve site selection and study the impact of aquaculture on marine environments presenting a variable sensitivity to organic sewage, (ii) analyse the socio-economical aspects and profitability of the aquaculture industry and of common resources (iii) use remote sensing and geographical data bases for diagnosis and monitoring of site degradation (iv) reinforce the capacity of Asian scientists through training. Severa! aquaculture sites have been investigated in the Lampung region (South Sumatra, Indonesia), the Mekong delta (Vietnam) and on the West coast of New-Caledonia, providing a large range of typical ecosystems encountered in Asia and in the Pacifie, from coralline sites to coastal plains with mangrove and deltaic areas. The study concerned the spatial structure and seasonal influence of these ecosystems, the temporal variation during the course of the project (3 years) and the relation between the ecological structure and farm productions. Remote sensing provides a synoptic vision over large land expanses. Severa! scenes were processed for landuse mapping using conventional classification techniques. Concerning water quality assessment, a general relation for the Java sea was found between image and field data in terms of total suspended matter. Applying this relation to a new site in Sumatra has provided an initial approach to water type and, together with land use mapping, a preliminary assessment of the suitability of the area to shrimp aquaculture development. Socio-economic research has been focused on the identification ofneeds for collective action, including public policy, in the perspective of shrimp farming sustainability. The main concern is in the regulation of shrimp farming intensification and extensification at the scale of coastal ecosystemic entities in a common property resource management perspective. The common considered here is coastal water quality. Comparing the local development profiles and the institutional grounds for the design and implementation of collective management rules shows that variables such as land tenure system, farm owner socio-economic profile, social homogeneity or heterogeneity of the farmers are key factors to analyse the potential for sustainability. The defmition of water quality and the possible means to ensure its collective management are discussed. The main conclusion is that the economie incentives to farming development are strong but there is no significant difference among traditional, semi-intensive and intensive systems in terms of economie efficiency or wealth distribution. The description of the functioning of the different kinds of ecosystems make it possible to give an advice concerning the positioning of the activity inside the ecosystem, and furthermore to have a reference state in order to determine the impact of the activity on the coastal environnement. This impact can be summarized as an increase in the concentration of total suspended matt€?r, of particulate organic matter and of sulfate reducing bacterias. This organic ma~.er is either issued from rearing activities or from telluric origine, due to mangrove eradication when building the ponds. An evaluation of the relationship existing between productivity and characteristics of each ecosystem bas been conducted by correlating ecological indicators data (concentration of total suspended matter, particulate organic matter, chlorophyll, percentage of pheopigments in total pigments and cyanobacteria and sulfatereducing bacteria in water and sediments) with the average production of the farms. This comparison lead to the compilation of a scale of observed production integrating the range of these environmental parameters with shrimp production levels, bound to facilitate the positioning of shrimp farming in relation with the confmement leve! of each ecosystem. Lastly, ali geographie data originated from the various compartments of the study have been geo-referenced and loaded into a geographical information system. This allows to display any query made on spatial variables and their related statistical data, including the ir variations over the last few years and to reveal patterns and phenomena otherwise not obvious.
Le programme mis en oeuvre par la DRV (Paris, CREMA-L'Houmeau, DELIAO Brest, COP Tahiti, GIE/RA Nouvelle Calédonie), dans le cadre d'un projet européen STD3 «(Sciences et Technique au Service du Développement», en collaboration avec l'Université de Montpellier II, l'Ecole Nationale d'Agronomie de Rennes, l'ITC (Hollande), l'Institut Océanographique de Nha Trang (Vietnam), le BADC de Jepara et le BPPT de Jakarta (Indonésie), avait pour but la mise au point de méthodes permettant d'améliorer la sélection des sites ainsi que le suivi du développement et de l'impact de l'aquaculture des crevettes Péneides en milieu tropical pour éviter la surexploitation. Quatre axes de recherche ont été défmis : a) identifier la nature et quantifier les rejets de déchets issus de ce type d'aquaculture, b) définir les caractéristiques écologiques des écosystèmes susceptibles d'accueillir l'activité aquacole et suivre leur évolution sous l'influence des rejets, c) déterminer l'influence de la gestion des fermes et des ressources (aspects économiques) sur les performances de productivité, d) déterminer la capacité de la télédétection comme outil de diagnostic d'impact à l'échelle de la région, e) mener un programme de formation d'étudiants et jeunes chercheurs Vietnamiens et Indonésiens.

Droits : 1998 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00132/24357/22357.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00132/24357/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : il s'agit d'un type de produit dont les métadonnées ne correspondent pas aux métadonnées attendues dans les autres types de produit : ACTIVITY_REPORT
Understanding genomic evolution in wild populations is of particular importance because evolution is a central process in our understanding of populations’ history and their future response to global changes. In addition to fundamental knowledge, the study of populations’ evolution has wide applications such as conservation/restoration genetics or epidemiology. Indeed, genetic diversity is the ‘fuel’ for populations’ evolution and adaptation to new conditions, and estimating the extent and the geographic structure of genetic diversity, as well as identifying the evolutionary forces behind (demography, gene flow, and adaptation) are thus major challenges in the current context of global changes. [br/]A particular attention is currently devoted to the process of genetic divergence in wild populations, with emphases on gene flow, local adaptation, and their interactions. Indeed, adaptation in wild populations is supported in many species by many kinds of experiments based on both quantitative phenotypic traits and molecular data. However, the processes governing populations’ evolution are poorly understood in the tropical rainforest of Amazonia, and the relative influence of neutral and adaptive processes are continuously discussed. [br/]I am a young scientist interested in the process of genomic divergence in wild (tree) populations. I aimed at understanding how evolution structures the genetic diversity and governs molecular divergence in wild populations, with particular emphases on gene flow and local adaptation. During five years as a young scientist, I worked on answering the following questions, focusing on two tree species occupying vulnerable areas: mainly [i]Eperua falcata[/i] in Amazonia and, to a lesser extent, [i]Abies alba[/i] in the Mediterranean area.[br/][u]Scientific questions:[/u][br/]- Which evolutionary drivers are responsible of the structure of genetic diversity in wild populations occupying wide areas? This question was addressed at different geographical scales: from large (regional) to very local (microgeographic) scales. [br/]- What is the relative influence of neutral (gene flow, inbreeding) and adaptive drivers in the process of genetic divergence?[br/]- Is microgeographic adaptation possible in spite of extensive gene flow between populations occupying the extreme boundaries of an ecological gradient? [br/]- What is the extent of natural selection in the (whole) genome of wild populations? [br/][br/]My research work is at the interface between three promising disciplines: Evolutionary genomics (i.e. the study of populations evolution and the evolutionary drivers behind), Bioinformatics (i.e. the treatment of next-generation data), and Bayesian modelling (i.e. the empirical calibration of complex mechanistic model). I intend to take advantage of the recent advances in sequencing and informatic technologies to bring up to date the field of ecological genetics and evolutionary biology, by developing modern research strategies to study the process of genomic divergence in wild populations.
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01204218

hal-01204218
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PRODINRA : 286326

Éditeur(s) : Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes
Résumé : Long-line fishing has been growing on the island of La Réunion since the beginning of the 1990s. The target species is the swordfish (Xiphias gladius), fished mainly in the tropical waters surrounding the island between longitudes 45 degree E and 60 degree E, and latitudes 17 degree S and 27 degree S. From 1998 to 2000, a finalised research programme enabled the collection of precise data concerning the lines' positions and the parameters of the fishing efforts: 3,602 nettings were thus informed by the catches (in numbers of individuals caught) and 12 descriptive variables of the effort. In parallel with this collection effort, satellite maps that described the ocean's landscape of this region of the Indian Ocean exploited by La Réunion's fisheries were made available to sailors and scientists. Extractions from these environmental variables were made at the fishing lines' positions, which allowed us to propose 20 variables describing the environmental conditions of swordfish catches applied to the nettings. In an early part of this study, after a descriptive analysis and a first selection of the variables, we used several GAM (Generalised Additive Models) to model the respective effects of effort and environmental variables on the variability of swordfish catches. We thus highlighted the predominance of factors linked to fishermen (fishing effort) on oceanographic factors in the explanation of this variability. Following these results, a summary on the biology and ecology of the swordfish was proposed in order to draw up hypotheses on the characteristics of this species' population in the Indian Ocean. The aspects linked to the individual behaviour and movements of the population were particularly highlighted. In a latter part of this study and in order to complete the empirical approach by an exploratory constructivist approach, we proposed a modelling tool in order to simulate the possible movements of individuals within the oceanic landscape described by the available satellite maps. After reading in the literature about the various forms of modelling the movements of the large pelagics, we developed an original computer modelling architecture of the multi-agent type that made it possible to manipulate in a dynamic way the satellite maps (and derived products), the individual movements of "animats" whose behaviours were based on this environmental information, and agents that clarify the process of long-line fishing in a geographical way. The computer model that was implemented (MUFINS, for MUlti-Fish INdian ocean Simulator) was next used by calibrating the behaviour of the animats on the real data originally from the analysis of commercial catches proposed in the first part, using robust techniques based on fuzzy logic. The results of the simulations were compared, on the one hand, with the large-scale hypotheses of movement proposed in the first part, and, on the other hand, to swordfish catches both real and corrected for the effect of the fishing effort modelled by the GAM models. Even if the results of these simulations in this study do not allow for proposing convincing interpretations of the underlying processes, the MUFINS tool showed its ability to address questions associated with the swordfish's behaviour in the tropical oceanic landscape and to the effects of scale transfers between the individual level and the collective level. We now envisage its use in a more operational framework, as an interface for dialogue between fishermen and scientists with a goal of sustainable management of the resource.
La peche palangriere s'est developpee a l'ile de La Reunion depuis le debut des annees 1990. L'espece cible est l'espadon (Xiphias gladius), principalement exploite dans les eaux tropicales autour de l'ile entre les longitudes 45 degree E et 60 degree E, et les latitudes 17 degree S et 27 degree S. De 1998 a 2000, un programme de recherche finalisee a permis de collecter des informations precises concernant les positions des lignes et les parametres de l'effort de peche : 3602 filages sont ainsi renseignes par les captures (en nombre d'individus captures) et 12 variables descriptives de l'effort. En parallele de cet effort de collecte, des cartes satellitales ont pu etre mises a la disposition des marins et des scientifiques, decrivant le paysage oceanique de cette region de l'ocean Indien exploitee par la pecherie reunionnaise. Des extractions de ces variables environnementales ont ete effectuees aux positions des lignes de peche, nous permettant de proposer 20 variables descriptives des conditions environnementales de captures d'espadon appliquees aux filages. Dans une premiere partie de ce travail, apres une analyse descriptive et une premiere selection des variables, on a modelise par plusieurs modeles GAM (Generalized Additive Models) les effets respectifs des variables d'effort et des variables environnementales sur la variabilite des captures d'espadon. On a ainsi mis en evidence la predominance des facteurs lies aux pecheurs (effort de peche) sur les facteurs oceanographiques dans le caractere explicatif de cette variabilite. A la suite de ces resultats, une synthese sur la biologie et l'ecologie de l'espadon a ete proposee afin de degager des hypotheses sur les caracteristiques de la population de cette espece dans l'ocean Indien. Les aspects lies au comportement individuel et aux deplacements de la population ont ete particulierement mis en evidence. Dans une deuxieme partie de ce travail et afin de completer l'approche empirique par une approche constructiviste exploratoire, nous avons propose un outil de modelisation afin de simuler les deplacements possibles d'individus au sein du paysage oceanique decrit par les cartes satellitales disponibles. Apres avoir passe en revue dans la litterature les differentes formes de modelisation des deplacements des grands, pelagiques, nous avons developpe une architecture originale de modelisation informatique de type multi-agents permettant de manipuler de maniere dynamique les cartes satellitales (et les produits derives), les mouvements individuels < d'animats >, dont les comportements sont bases sur cette information environnementale, et des agents qui explicitent le processus de capture palangriere de maniere geographique. Le modele informatique ainsi implemente (MUFINS, pour MUlti-Fish INdian ocean Simulator) a ensuite ete utilise en calibrant les comportements des animats sur les donnees reelles issues de l'analyse des captures commerciales proposee en premiere partie, a partir de techniques robustes basee sur la logique floue. Les resultats des simulations ont ete confrontes d'une part aux hypotheses de deplacement a grande echelle proposees en premiere partie, et d'autre part aux captures d'espadon reelles et corrigees de l'effet de l'effort de peche modelise par les modeles GAM. Meme si les resultats de simulations presentes dans ce travail ne permettent pas de proposer d'interpretations convaincantes des processus sous-jacents, l'outil MUFINS a demontre son aptitude a aborder les questions liees au comportement de l'espadon dans le paysage oceanique tropical et aux effets des transferts d'echelle entre le niveau individuel et le niveau collectif. On envisage desormais son utilisation dans un cadre plus operationnel, comme interface de dialogue entre les pecheurs et les scientifiques a des fins de gestion durable de la ressource.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/these-2592.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2592/

Éditeur(s) : Littoral 2004, Aberdeen, Scotland, UK, September 2004
Résumé : NAMIBIE (a french acronym for Integrated Multimedia Navigator Within Coastal Environment Data Bases) is a specific tool which first concept has been established by Ifremer and has been developped by an association between research in the field of coastal environment, innovation in the field of new information and communication technologies and services in the field of coastal integrated management and impact studies. The objectives of this tool are to facilitate research, direct access and display of relevant multimedia coastal integrated data and information according to an interactive, widely opened and playfull interface. The principles are based upon the fact that sustainable decision making needs an optimized unterstanding of coastal processes and better consultation between actors. In this purpose the development of the tool has considered that the end-user should and could be free to look after the data and the information he needs for a particular site or environment of interest and for a specific ICZM question according to easy navigation interfaces. That is why NAMIBIE concept is based upon : - a coherent 3D representation of the coasts (i.e. from catchement areas to continental shelf and deep sea), which considers a coherent DEM from land to sea and textural representation of the environment using satellite imagery textural displays, - a 3D navigator which allows the user to fly or dive over and within the coastal environment of interest, - a multimedia database (text, graphs, image, maps, geographic objects, modelling results...) specific to the territory of interest, - an interactive interface which helps in finding relevant information associated to specific questions. The technologies used include VRML data format, integration of standard GIS format (shp, grid, img) within the navigator, integration and display of modelling data. The production chain is realized in C++ and Java scripts allow dialogue between web pages and 3D windows. Applications are presented on the coasts of Languedoc Roussillon region (French Mediterranean border) in the framework of ICZM problematics

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00089/20055/17696.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00089/20055/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : In 1996 the European Commission Humanitarian Office (ECHO) launched a regional approach for disaster preparedness, focusing in its first phase on Central America, Caribbean and Southeast Asia (including Bangladesh). The first step in this process was the preparation of a «diagnostic study» that involved a situation review of the countries in these regions with regard to their vulnerabilities, disaster preparedness capacities and national plans or policies for disaster management.The Centre for Research on the Epidemiology of Disasters of the Université Catholique de Louvain (UCL) served as ECHO’s principal technical support with the collaboration of other institutions in Europe and the regions.The present «diagnostic report», covering Central America and the Caribbean, has been carried out by the Centre International pour la Formation et les Echanges en Géosciences (CIFEG) under the supervision of Professor Robert D’Ercole (Université de Savoie, Chambéry).Mr. Thierry Lesales (Université des Antilles et de la Guyane) participated closely in the drafting of this report and was actively involved in the field missions with Mr D’Ercole where they met and interviewed numerous national officials, non-governmental organisations and regional and international bodies. Further assistance was provided by Claudine Misson (CRED) for the interviews and information collected in the Dominican Republic. The report also draws from an earlier mission undertaken by Dr. Philippe Masure (BRGM, France), Christian Bugnion (CRED) and Alexandra Angulo (CRED) who undertook some of the preparatory work for the diagnostic study.This report presents an analysis of the disaster preparedness situation in Central America and the Caribbean and provides some preliminary recommendations regarding priorities and future programme direction. As such it remains primarily a descriptive study. It is expected to form the basis for the formulation of the ECHO Disaster Preparedness Action Plan.
En 1996, la Oficina Humanitaria de la Comunidad Europea (ECHO) lanzó la iniciativa de un enfoque regional en materia de preparación a los desastres, concentrándose inicialmente en las regiones de América Central, Caribe y Asia del Sureste (incluyendo a Bangladesh). La primera fase de este proceso fue la preparación de un « diagnóstico» que implicaba un examen de la situación de los países de cada una de estas regiones en relación a la vulnerabilidad, la capacidad de preparación a los desastres y las políticas y planes nacionales en materia de gestión de desastres.El Centre for Research on the Epidemiology of Disasters (CRED), de la Université Catholique de Louvain (UCL), ha sido el principal apoyo técnico de ECHO para esta iniciativa, con la colaboración y asistencia de otras instituciones en Europa y en las regiones arriba mencionadasEl presente informe que cubre América Central y el Caribe, fue realizado por el International Centre for Training and Exchanges in Geosciences (CIFEG), bajo la dirección del Profesor Robert D'Ercole (Université de Savoie).Thierry Lesales (Université des Antilles et de la Guyane) participó de cerca a la realización de este documento y estuvo activamente implicado junto al Profesor D'Ercole en las misiones que se realizaron en varios países. En el curso de estas misiones, se entrevistaron con numerosos representantes de gobiernos nacionales, de ONGs y de organizaciones regionales e internacionales Se contó igualmente con la asistencia de Claudine Misson (CRED), quien realizó la misión en República Dominicana. El informe se basa igualmente en una misión anterior llevada a cabo por Philippe Masure (BRGM, France), Alexandra Angulo (CRED) y Christian Bugnion (CRED), la cual realizó parte del trabajo preparatorio para el diagnóstico.El informe presenta un análisis de la situación en América Central y el Caribe y provee recomendaciones preliminares para las prioridades y dirección del futuro programa. En el marco de la segunda fase, está destinado a servir de base para la formulación del Plan de Acción de Preparación a los Desastres de ECHO.
Depuis 1994, ECHO (Office Humanitaire de la Commission Européenne, devenu le service de la Commission européenne à l’aide humanitaire et à la protection civile) a financé, à l'échelle mondiale, de nombreuses opérations pour la prévention et la préparation aux catastrophes (catastrophes naturelles principalement) Ces financements ont répondu aux demandes d'ONG et d'organisations internationales qui ont-elles-mêmes mis en oeuvre les projets correspondants. Les évaluations de ces opérations ont donné des appréciations positives. Cependant, ECHO souhaite s'impliquer davantage dans la prévention et la préparation aux catastrophes et mieux cibler ses actions pour une plus grande cohérence d'ensemble.Au cours de la réunion du 16 juillet 1996, le Comité d'Aide Humanitaire a approuvé la nouvelle approche régionale proposée par ECHO pour son programme de prévention, d'atténuation et de préparation aux catastrophes, le DIPECHO (Dlsaster Preparedness ECHO), pour la période 1996—1998. Ce programme doit s'appliquer dans un cadre régional en concentrant d'abord ses financements sur des plans d'action dans les Caraïbes, en Amérique Centrale, en Asie du Sud-Est et au Bangladesh. Par ailleurs, au lieu de répondre exclusivement aux demandes de financements spécifiques d'ONG, d'organisations internationales et de gouvernements, ECHO souhaite préparer des plans d'action et déterminer les partenaires les plus appropriés pour une mise en oeuvre dirigée par ECHO même. En outre, le DIPECHO a pour objet de rendre plus efficace l'action de l'ensemble de l'Union Européenne, par une étroite coordination de son action avec celles de la Commission et des Etats Membres. Il est enfin prévu de faire précéder la préparation des plans d'action par une phase de diagnostic au cours de laquelle seront identifiés, pour chaque région, les risques, les structures et politiques de prévention existantes aux niveaux communautaire, national et régional, ainsi que les appuis extérieurs en cours et à venir. L'objectif est non seulement de déterminer les lacunes, mais également d'évaluer la cohérence et l'efficacité des systèmes de réponse dans leur ensemble......Dans ce contexte, une première mission exploratoire a été réalisée du 30 septembre au 12 octobre 1996 dans les Caraïbes et l'Amérique Centrale (quatre pays visités) et a débouché sur un premier rapport (A. Angulo, Ch. Bugnion, Ph. Masure, "Rapport de mission exploratoire dans les Caraïbes ct en Amérique Centrale pour DIPECHO").Ce rapport apporte de nombreuses informations et en particulier:(1) il définit le cadre conceptuel, insistant, à juste titre, sur le fait que la prévention et la préparation doivent être distinguées de l'aide d'urgence et qu'elles font partie d'un processus continu au même titre que le développement ;(2) il présente les principales organisations régionales et internationales, et leurs activités dans le domaine de la prévention et de la préparation;(3) il met en évidence les grands types de besoins et fournit les premières orientations pour le programme DIPECHO......Le présent rapport, constituant le diagnostic proprement dit, fait suite à une deuxième série de missions effectuées dans la même région. Il vise à compléter les apports de la mission exploratoire, notamment par:(a) une analyse des catastrophes et de leurs conséquences:(b) une évaluation comparée des risques dans la région;(c) une analyse détaillée des réalisations et des besoins en matière de réduction des risques et des conséquences des catastrophes naturelles ;(d) un examen des conditions actuelles pour un programme DIPECHO cohérent, réalisable et efficace, avec, en particulier, la prise en compte de l’organisation actuelle de la prévention et de la préparation dans la région et un état des appuis extérieurs ;- des propositions de lignes d'actions prioritaires pour le DIPECHO......Le diagnostic s'est appuyé sur une importante documentation : travaux scientifiques, études et rapports recueillis auprès du CRED-Université Catholique de Louvain, du CIFEG, du DHA, de l’IDNDR, de divers organismes sur le terrain (notamment le centre de documentation de San José au Costa Rica), et d'universités européennes (Université de Savoie. Chambéry, Université de Lausanne). Mais ce sont avant tout les nombreux entretiens menés lors des missions (près de 200) qui ont donné corps au diagnostic.Treize pays Ont été visités entre le 22/01 et le 07/03/1997 :- République Dominicaine (C Misson);- Costa Rica, Guatemala, Nicaragua et Cuba (R. D'Ercole) ;- Antigua, Barbade, Haïti, Jamaïque, Ste-Lucie, St-Maarten, St-Vincent et le Guyana (Th. Lesales).Leur choix a été déterminé en concertation avec ECHO, le CRED-UCL et le CIFEG. Ils ne recouvrent pas l'ensemble des pays qu'il aurait été théoriquement possible de visiter. Cependant, le choix de pays-clés, les contacts établis avec de nombreux organismes de portée régionale et la documentation consultée, ont permis de bâtir un diagnostic d'ensemble......L'étude comporte trois parties.La 1e partie constitue une analyse des catastrophes en termes de bilan et de risque. Il s'agit, à l'aide de cartes, notamment, de montrer les effets des catastrophes naturelles en Amérique Centrale et dans les Caraïbes, de présenter la répartition et la fréquence des aléas naturels et de procéder à une analyse de critères de vulnérabilité. L'objectif est, enfin, de déterminer des niveaux de risque, à l'échelle de la région, compte tenu des dangers naturels et des critères de vulnérabilité.La 2° partie est l'étude des actions entreprises dans la région, ces dernières années, afin de réduire les risques et les conséquences des catastrophes. Cette étude permet de dégager des lacunes et des besoins. Les différentes composantes entrant dans le processus de réduction des catastrophes sont retenues : recherche scientifique et technique, prévention stricto sensu, préparation, information / formation. L'accent est également placé sur les modes actuels d'application des politiques de réduction des risques : de l'approche sectorielle à l'approche intégrée.La 3e partie traite des conditions actuelles pour la mise en oeuvre d'un programme DIPECHO cohérent et efficace. Quatre aspects fondamentaux sont analysés: les particularités régionales et nationales (l'hétérogénéité et ses conséquences); les faiblesses et qualités institutionnelles aux différents échelons géographiques: les caractéristiques des organismes susceptibles de contribuer à la mise en oeuvre du DIPECHO; le rôle actuel et en perspective de la Communauté Européenne et des Etats Membres.Chaque partie comporte une conclusion partielle La conclusion générale reprend les idées force des conclusions intermédiaires ct débouche sur des lignes d'actions prioritaires recommandées pour le DIPECHO......L'étude confiée au CIFEG par le CRED-UCL et ECHO a été coordonnée par Robert D'Ercole (Département de Géographie, Université de Savoie, Chambéry, France). Elle a bénéficié de la collaboration de Thierry Lesales (Département de Géographie, Université des Antilles et de la Guyane, Martinique, France) et de Patrick Pigeon (Département de Géographie, Université de Savoie, Chambéry, France). Ont également contribué à la réalisation de celle étude: Claudine Misson (CRED-UCL, Belgique), Jean-Claude Napias (CIFEG, directeur), Jacques Giri (CIFEG, président), Sylvie Orlyk (CIFEG, secrétariat).
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Éditeur(s) : Public Library Science
Résumé : Background: Resolving threats to widely distributed marine megafauna requires definition of the geographic distributions of both the threats as well as the population unit(s) of interest. In turn, because individual threats can operate on varying spatial scales, their impacts can affect different segments of a population of the same species. Therefore, integration of multiple tools and techniques - including site-based monitoring, genetic analyses, mark-recapture studies and telemetry - can facilitate robust definitions of population segments at multiple biological and spatial scales to address different management and research challenges. Methodology/Principal Findings: To address these issues for marine turtles, we collated all available studies on marine turtle biogeography, including nesting sites, population abundances and trends, population genetics, and satellite telemetry. We georeferenced this information to generate separate layers for nesting sites, genetic stocks, and core distributions of population segments of all marine turtle species. We then spatially integrated this information from fine-to coarse-spatial scales to develop nested envelope models, or Regional Management Units (RMUs), for marine turtles globally. Conclusions/Significance: The RMU framework is a solution to the challenge of how to organize marine turtles into units of protection above the level of nesting populations, but below the level of species, within regional entities that might be on independent evolutionary trajectories. Among many potential applications, RMUs provide a framework for identifying data gaps, assessing high diversity areas for multiple species and genetic stocks, and evaluating conservation status of marine turtles. Furthermore, RMUs allow for identification of geographic barriers to gene flow, and can provide valuable guidance to marine spatial planning initiatives that integrate spatial distributions of protected species and human activities. In addition, the RMU framework - including maps and supporting metadata - will be an iterative, user-driven tool made publicly available in an online application for comments, improvements, download and analysis.
Plos One (1932-6203) (Public Library Science), 2010-12 , Vol. 5 , N. 12 , P. -

Droits : 2010 Plos One
http://archimer.ifremer.fr/doc/00028/13926/11308.pdf
DOI:10.1371/journal.pone.0015465
http://archimer.ifremer.fr/doc/00028/13926/

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley-Blackwell
Résumé : International audience
1. Our understanding of the contribution of interspecific interactions to functional diversity in nature lags behind our knowledge of spatial and temporal patterns. Although two-species mutualisms are found in all types of ecosystems, the study of their ecological influences on other community members has mostly been limited to third species, while their influence on entire communities remains largely unexplored. 2. We hypothesized that mutualistic interactions between two respective ant species and an epiphyte mediate the biological traits composition of entire invertebrate communities that use the same host plant, thereby affecting food webs and functional diversity at the community level. 3. Aechmea mertensii (Bromeliaceae) is both a phytotelm ('plant-held water') and an ant-garden epiphyte. We sampled 111 bromeliads (111 aquatic invertebrate communities) associated with either the ant Pachycondyla goeldii or Camponotus femoratus. The relationships between ants, bromeliads and invertebrate abundance data were examined using a redundancy analysis. Biological traits information for invertebrates was structured using a fuzzy-coding technique, and a co-inertia analysis between traits and abundance data was used to interpret functional differences in bromeliad ecosystems. 4. The vegetative traits of A. mertensii depended on seed dispersion by C. femoratus and P. goeldii along a gradient of local conditions. The ant partner selected sets of invertebrates with traits that were best adapted to the bromeliads' morphology, and so the composition of the biological traits of invertebrate phytotelm communities depends on the identity of the ant partner. Biological traits suggest a bottom-up control of community structure in C. fenaoratus-associated phytotelmata and a greater structuring role for predatory invertebrates in P. goeldii-associated plants. 5. This study presents new information showing that two-species mutualisms affect the functional diversity of a much wider range of organisms. Most biological systems form complex networks where nodes (e.g. species) are more or less closely linked to each other, either directly or indirectly, through intermediate nodes. Our observations provide community-level information about biological interactions and functional diversity, and perspectives for further observations intended to examine whether large-scale changes in interacting species/community structure over broad geographical and anthropogenic gradients affect ecosystem functions.
Functional Ecology

hal-01096909
https://hal-agroparistech.archives-ouvertes.fr/hal-01096909
DOI : 10.1111/j.1365-2435-2011.01863.x