Éditeur(s) : Digital Library of the Caribbean (dLOC) Digital Library of the Caribbean (dLOC) ( Miami, Florida )
Résumé : Equipment list to accompany training manual and guide used originally developed in 2011 for digitizing materials at the National Archives of Haiti on equipment purchased by the Institute of Pan-American Geographic History, under the Organization of American States.

Droits : [cc by] This item is licensed with the Creative Commons Attribution License. This license lets others distribute, remix, tweak, and build upon this work, even commercially, as long as they credit the author for the original creation.
http://ufdc.ufl.edu/AA00009691/00004

Éditeur(s) : Université de Bretagne Occidentale
Résumé : The stock of Lambi, Strombus gigas (gastropod: strombidae), coastal benthic resource, has been exploited artisanally since the prehistoric period in Martinique. Nowadays, three lines of work exploit the species: free diving, nets (since the middle of the century) and scuba diving since 1985. This report presents the activity of each line of work, surveyed directly from 1986 to 1987: fishing zones and resource allocation, production, effort and performance, detail of catches (by length). The socio economic characteristics of the lambi fishermen are studied. The significant production of leisure fishing is also estimated. The decrease in the production and performance, as well as the lowering of the size of the first catch for about thirty years show that the stock is overexploited. The biological phenomenon of the stock: growth of the shell (length and shell lip), growth in weight, acquiring of sexual maturity, natural mortality are studied. The factors of mortality through fishing are estimated by class of length for the current exploitation regime by pseudo-cohort analysis. If the results confirm that the stock is overexploited, the level of overexploitation of the stock cannot be specified because of the presence of a number of lipped adults not yet too exploited in water deeper than 20 metres. The analysis of the dynamic process of the exploited population indicates two ways to the production of the stock: the forcing of the recruitment and the regulation of the exploitation regime. The lack of economic profitability of the production of juveniles over 30 mm and the difficulties raised by their collection in their natural habitat lead to the rationalization of the exploitation. The production and performance (by recruits) simulations performed for different exploitation regimens indicate that the only two conceivable options are the introduction of a minimum catch size, i.e. lambi with forming lip, and the regulation of the fishing effort. The socio-economic implications of the introduction of the determined management measures show that their applicability level is very low, because of the Martinique fishermen polyactivity, their low socio-economic level and mostly because of the free access to the resource. As a consequence, it is suggested to create new professional structures with a wide jurisdiction, in order to locally manage the marine areas, their use and their resources. (unverified OCR)
Le stock de lambi, Strombus gigas (gastéropode: strombidae), ressource benthique côtière, est exploitée artisanalement depuis l'époque préhistorique en Martinique. Trois métiers exploitent actuellement l'espèce: plongée libre, filets (depuis le milieu du siècle) et plongée en scaphandre autonome depuis 1985. Ce rapport présente l'activité de chaque métier, suivie de 1986 à 1987 par une enquête directe: zones de pêche et allocation de la ressource, productions, efforts et rendements, composition en longueur des captures. Les caractéristiques socioéconomiques des pêcheurs de lambi sont étudiées. La production d'une pêche plaisancière non négligeable est estimée. La diminution de la production, des rendements et l'abaissement de la taille de première capture depuis une trentaine d'années révèlent que le stock est surexploité. Les phénomènes biologiques du stock: croissance de la coquille (longueur et pavillon), croissance en poids, acquisition de la maturité sexuelle, mortalité naturelle sont étudiés. Les coefficients de mortalité par pêche sont estimés par classe de longueur pour le régime d'exploitation actuel par l'analyse de pseudo-cohorte. Si les résultats confirment l'état surexploité du stock, le niveau de surexploitation ne peut être précisé en raison de l'existence d'adultes pavillonnés encore peu exploités sur les fonds de plus de 20 mètres. L'analyse des processus dynamiques de la population exploitée indique deux voies pour restaurer la production du stock: le forçage du recrutement et la régulation du régime d'exploitation. Le manque de rentabilité économique de l'élevage des juvéniles au-delà de 30 mm et les difficultés pour leur collecte dans le milieu naturel conduisent à rechercher la rationalisation de l'exploitation. Les simulations de la production et du rendement par recrue réalisées pour différents régimes d'exploitation indiquent que seule la mise en place d'une taille minimale de capture, i.e le lambi au pavillon en formation, et une régulation de l'effort de pêche sont envisageables. Les implications socio-économiques de la mise en oeuvre des mesures de gestion déterminées montrent que leur niveau d'applicabilité est très faible, en raison de la polyactivité des pêcheurs martiniquais, de leur faible niveau socioéconomique et surtout, du régime de libre accès à la ressource. Aussi, il est proposé la création de nouvelles structures professionnelles aux compétences larges, qui permettraient, pour chacun des bourgs, une gestion locale de l'espace marin, des usages et des ressources. OCR NON CONTRÔLE

Droits : 1993 UBO
http://archimer.ifremer.fr/doc/1993/these-3751.PDF
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3751/

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley-Blackwell
Résumé : International audience
The Lanzo peridotite massif is a fragment of oceanic lithosphere generated in an ocean-continent transition context and eclogitized during alpine collision. Despite the subduction history, the massif has preserved its sedimentary oceanic cover, suggesting that it may have preserved its oceanic structure. It is an exceptional case for studying the evolution of a fragment of the lithosphere from its oceanization to its subduction and then exhumation. We present a field and petrological study retracing the different serpentinization episodes and their impact on the massif structure. The Lanzo massif is composed of slightly serpentinized peridotites (<20% serpentinization) surrounded by an envelope of foliated serpentinites (100% serpentinization) bordered by oceanic metabasalts and metasedimentary rocks. The limit between peridotites and serpentinites defines the front of serpentinization. This limit is sharp: it is marked by the presence of massive serpentinites (80% serpentinization) and, locally, by dykes of metagabbros and mylonitic gabbros. The deformation of these gabbros is contemporaneous with the emplacement of the magma. The presence of early lizardite in the peridotites testifies that serpentinization began during the oceanization, which is confirmed by the presence of meta-ophicarbonates bordering the foliated serpentinite envelope. Two additional generations of serpentine occur in the ultramafic rocks. The first is a prograde antigorite that partially replaced the lizardite and the relict primary minerals of the peridotite during subduction, indicating that serpentinization is an active process at the ridge and in the subduction zone. Locally, this episode is followed by the deserpentinization of antigorite at peak P-T (estimated in eclogitized metagabbros at 2-2.5 GPa and 550-620 °C): it is marked by the crystallization of secondary olivine associated with chlorite and/or antigorite and of clinopyroxene, amphibole and chlorite assemblages. A second antigorite formed during exhumation partially to completely obliterating previous textures in the massive and foliated serpentinites. Serpentinites are an important component of the oceanic lithosphere generated in slow to ultraslow spreading settings, and in these settings, there is a serpentinization gradient with depth in the upper mantle. The seismic Moho limit could correspond to a serpentinization front affecting the mantle. This partially serpentinized zone constitutes a less competent level where, during subduction and exhumation, deformation and fluid circulation are localized. In this zone, the reaction kinetics are increased and the later steps of serpentinization obliterate the evidence of this progressive zone of serpentinization. In the Lanzo massif, this zone fully recrystallized into serpentinite during alpine subduction and collision. Thus, the serpentinite envelope represents the oceanic crust as defined by geophysicists, and the sharp front of serpentinization corresponds to an eclogitized seismic palaeo-Moho.
ISSN: 0263-4929

hal-00823051
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00823051
DOI : 10.1111/jmg.12008

Éditeur(s) : HAL CCSD DGLF - Observatoire des pratiques linguistiques
Résumé : Nonobstant leur diversité sur le plan linguistique et socioculturel, les contextes d'enseignement dans les départements et collectivités de l'outre-mer français présentent de nombreux points communs, et notamment la présence de plusieurs langues entrainant des phénomènes de contacts comme les alternances codiques (désormais AC). Ainsi, dans ces contextes bi et plurilingues, la question de la gestion des langues au cours des interactions didactiques est centrale et concerne tous les acteurs : élèves, parents, enseignants, formateurs, conseillers pédagogiques, inspecteurs de l'Éducation nationale... Si l'utilisation des langues régionales et de l'AC dans les situations d'enseignement a longtemps été interdite et considérée comme un manque de maitrise ou de respect, les travaux actuels tendent à considérer ces phénomènes comme des marques de mobilisation des ressources langagières et de construction de compétences plurilingues en vue de l'enseignement et de l'apprentissage de savoirs, tant dans les disciplines dites linguistiques (français, langue vivante étrangère, langue vivante régionale...) que non linguistiques (sciences de la vie et de la terre, histoire, mathématiques, éducation physique et sportive...). C'est pourquoi nous avons relevé, transcrit puis analysé des corpus de parole issus de situations d'enseignement aux Antilles et en Guyane françaises, afin d'analyser les AC en classe et de proposer des pistes de réflexion didactiques et pédagogiques, mais également éducatives, culturelles et sociales en contextes bi- et plurilingues.
Langues et cité

halshs-00665378
https://halshs.archives-ouvertes.fr/halshs-00665378

Éditeur(s) : HAL CCSD American Society for Biochemistry and Molecular Biology
Résumé : International audience
2-Amino-9H-pyrido[2,3-b]indole (AαC) is a carcinogenic heterocyclic aromatic amine (HAA) that arises in tobacco smoke. UDP-glucuronosyltransferases (UGTs) are important enzymes that detoxicate many procarcinogens, including HAAs. UGTs compete with P450 enzymes, which bioactivate HAAs by N-hydroxylation of the exocyclic amine group; the resultant N-hydroxy-HAA metabolites form covalent adducts with DNA. We have characterized the UGT-catalyzed metabolic products of AαC and the genotoxic metabolite 2-hydroxyamino-9H-pyrido[2,3- b]indole (HONH-AαC) formed with human liver microsomes, recombinant human UGT isoforms, and human hepatocytes. The structures of the metabolites were elucidated by 1H NMR and mass spectrometry. AαC and HONH-AαC underwent glucuronidation by UGTs to form, respectively, N 2-(β- D-glucosidurony1)-2-amino-9H-pyrido[2,3-b]indole (AαC-N 2-Gl) and N 2-(β-D-glucosidurony1)-2-hydroxyamino-9H-pyrido[2,3-b] indole (AαC-HON 2-Gl). HONH-AαC also underwent glucuronidation to form a novel O-linked glucuronide conjugate, O-(β-D-glucosidurony1)-2-hydroxyamino-9H-pyrido[2,3-b]indole (AαC-HN 2-O-Gl). AαC-HN 2-O-Gl is a biologically reactive metabolite and binds to calf thymus DNA (pH 5.0 or 7.0) to form the N-(deoxyguanosin-8-yl)-AαC adduct at 20-50-fold higher levels than the adduct levels formed with HONH-AαC. Major UGT isoforms were examined for their capacity to metabolize AαC and HONH-AαC. UGT1A4 was the most catalytically efficient enzyme (V max/K m) at forming AαC-N 2-Gl (0.67 μl*min -1*mg of protein -1), and UGT1A9 was most catalytically efficient at forming AαC-HN-O-Gl (77.1 μl*min -1*mg of protein -1), whereas UGT1A1 was most efficient at forming AαC-HON 2-Gl (5.0 μl*min -1*mg of protein -1). Human hepatocytes produced AαC-N 2-Gl and AαC-HN 2-O-Gl in abundant quantities, but AαC-HON 2-Gl was a minor product. Thus, UGTs, usually important enzymes in the detoxication of many procarcinogens, serve as a mechanism of bioactivation of HONH-AαC. © 2012 by The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Inc.
ISSN: 0021-9258

hal-00696860
https://hal-anses.archives-ouvertes.fr/hal-00696860
DOI : 10.1074/jbc.M111.320093
PUBMED : 22393056

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : Tandis que l’agriculture et le tourisme sont en concurrence pour l’accès au foncier, comment penser, soutenir et promouvoir les complémentarités entre ces deux activités pour développer un tourisme rural intégré socialement, économiquement et spatialement ? Cette question trouve un écho particulier dans les territoires insulaires où les enjeux pour les communautés locales sont d’autant plus cruciaux que les conflits sont aigus. Compte tenu de ce contexte problématique, cet article propose une grille d’indicateurs évaluant les complémentarités entre les deux activités. Outil d’accompagnement du développement durable, cette grille est mise à l’épreuve du territoire de Balagne en Corse : les résultats de l’expérimentation conduite sur cette île méditerranéenne en 2010 conduisent à discuter la portée des indicateurs sélectionnés.
On coastal areas and in islands in particular, the tourism sustainability is still at stake: whereas agriculture and tourism are competing for land, how can we think and promote the complementarities between both activities for a sustainable territorial development? This paper deals with this question. For instance, a grid of indicators for the complementarities between farming systems and tourism is set as a tool for local development. The results of a survey lead in the Mediterranean island of Corsica in 2010 are used to discuss the scope of such a grid.
Corse

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.6249
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/6249

Résumé : La compétence géographique assurée par le laboratoire dans ses fonctions concerne l'ensemble des Pertuis Charentais depuis le Sud-Vendée jusqu'à l'embouchure de la Gironde. Ce rapport d'activité tient compte de ces faits et présente par ailleurs les programmes de recherche selon la nomenclature établie dans le cadre du Plan Stratégique de l'Ifremer et dans la définition des mandats de laboratoires.

Droits : 2002 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00074/18551/16102.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00074/18551/

Éditeur(s) : Université de Paris 7
Résumé : The Seine estuary and its adjacent region Pays de Caux are two significant sources of mercury for coastal marine environments. It is carried through fluvial means for the Seine bay and through karstic fresh water emergences for Pays de Caux's coastal area. Mercury cycle in the Seine estuary and bay is affected by additional anthropical activities. The estuary's maximal turbidity area acts like a trap and a chemical reactor for fluvial mercury. Within this area, we can confirm: (i) the non conservative behaviour of dissolved mercury; (ii) mercury enrichment of particles when comparing the Seine's and marine environment and we suggest mercury particle redistribution from the organic fraction to the oxyhydroxydes fraction. A large fraction of mercury is exported in this state towards coastal areas. Mercury reduction in surface coastal waters and its atmospherical recycling are major phenomena. Photoreduction and biological reduction play quantitative roles equivalent to total mercury recycling via the atmosphere corresponding approximately to 30 % of fluvial exchanges. We are demonstrating that reactive forms of mercury are supporting photoreduction. Mercury behaviour within Pays de Caux's karst depends of the hydrogeological context of the system (time and flow speed, turbidity, flow); regardless of the speciation and/or partition in underground waters, the total amount of mercury in intertidal areas is quantitatively the same as in the Seine estuary. Mercury brought through intertidal emergences (karstic exudations) is not « filtered » by a maximal turbidity area and is more widely bio-available for mussels than in the Seine estuary. Even being free from growth factor influences through simple models, mussels found in Pays de Caux still show one of the highest mercury contamination on the French coast; for the first time this places the emphasis on how much mercury is brought from underground waters to the coastal environment. Surface complexation modelisation tests are able to reproduce the major part of mercury partition in the Seine estuary and bay if a very low mercury exchangeable fraction and minimum complexation parameters are taken into account; thermodynamic calculations also suggest that a strong or highly concentrated « dissolved » ligand must be present in the water in order to compete with chlorocomplex formations and explain our measures.
L'estuaire de la Seine et la région adjacente du Pays de Caux sont deux sources significatives en mercure pour le milieu marin côtier. Les apports sont d'une part fluviatiles en ce qui concerne la Baie de Seine et karstiques via des émergences d'eau douce pour la zone côtière du Pays de Caux. Le cycle du mercure en estuaire et baie de Seine est perturbé par les apports liés aux activités anthropiques. La zone de turbidité maximum de l'estuaire joue le rôle de piège et de réacteur chimique pour le mercure fluviatile. Au sein de cette zone, nous mettons en évidence : (i) un comportement non-conservatif du mercure dissous; (ii) un enrichissement en mercure des particules par rapport à celles de la Seine et du milieu marin et suggérons une redistribution du mercure particulaire de la fraction organique vers la fraction oxyhydroxydes. C'est sous cette forme qu'une fraction importante du mercure est exportée vers la zone côtière. La réduction du mercure dans les eaux côtières de surface et son recyclage atmosphérique sont des phénomènes majeurs. En effet, la photoréduction et la réduction biologique jouent des rôles quantitativement équivalents avec un recyclage total du mercure via l'atmosphère correspondant à environ 30% des apports fluviatiles. Nous montrons que les formes réactives du mercure constituent le substrat de la photoréduction. Le comportement du mercure au sein du karst du Pays de Caux dépend du contexte hydrogéologiques du système (temps et vitesse de circulation, turbidité, débit) ; quelle que soit la spéciation et/ou la partition dans les eaux souterraines, l'apport en mercure total à la zone intertidale est quantitativement du même ordre de grandeur que les apports de la Seine. Le mercure apporté par les émergences intertidales (exutoires karstiques) n'est pas « filtré » par une zone de turbidité maximale et se trouve plus largement biodisponible pour les moules qu'en estuaire de Seine. En s'affranchissant, par des modèles simples, de l'influences des facteurs de croissance, les moules du Pays de Caux affichent toujours une contamination par le mercure parmi les plus élevées du littoral français; ceci met pour la première fois l'emphase sur l'importance de l'apport en mercure par des eaux souterraines dans un environnement côtier. Les essais de modélisation de complexation de surface reproduisent la majeure partie de la partition du mercure dans l'estuaire et la baie de Seine si l'on tient compte d'une fraction échangeable en mercure très faible et de paramètres de complexation minimums ; les calculs thermodynamiques suggèrent aussi qu'un ligand « dissous » fort ou présent à de fortes concentrations doit être présent dans l'eau afin d'entrer en compétition avec la formation de chlorocomplexes et expliquer nos mesures.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/these-1842.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1842/

Éditeur(s) : HAL CCSD Institut de Géographie Alpine
Résumé : International audience
The international symposium on «Urban Growth and Natural Hazards, in particular in Developing Countries» was held in the University Blaise Pascal, Clermont-Ferrand (France) on December 2 and 3, 1994. This meeting brought together about 70 research people, Ph.D. students, and professionals from France and 12 countries, representing universities, research agencies, as well as government and private companies. The symposium aimed to gather specialized people who are engaged and acting in programmes on hazard appraisal, risk prevention and urban management in city environment. These people aimed to compare experiences acquired in two different fields: on the one hand urban growth and its consequences, and on the other hand, natural hazards and effects, in particular in Developing Countries.Half-way through the International Decade for Natural Hazard Disaster Reduction, we strove to reconcile two points of view usually distincts: nature-oriented research and society-oriented research on hazards. These convergent approaches should merge, not only to improve knowledge of natural hazards and risks, but also to cope with hazard and risk situation on a day-basis in a city. We also choose to study both approaches in Developing Countries (DC) because most of the large cities of the world already are or will be located there in near future. In addition, city location in DC coincides with tropical areas where natural hazards are most frequent threats to life, in particular in mountains, on seashores, and on active convergent plate margins. We stress the fact that the 3 following topics are often lacking in studies which have been carried out on natural hazard appraisal and management. 1) How should we include social and economical factors, and particularly a sound analysis of vulnerability of people and values at risk ? 2) How should we cope with hazard management in large cities of Developing Countries ? 3) What is the specific task of research people in hazard case studies engaged in urban environment and management?Three themes correspond to the three sessions of the symposium. (1) Natural hazards and environmental factors : inventory, diagnostic and classification, (2) Vulnerability of urban society and environment : concepts, approaches, and classification, (3) Tools for urban risk prevention and risk management in case of crisis and catastrophes.
Ce numéro de la Revue de Géographie Alpine reprend une dizaine parmi les 41 contributions exposées par des chercheurs français et étrangers lors du colloque international « Croissance urbaine et risques naturels dans les pays en développement » qui s'est déroulé à l'Université Blaise Pascal, Clermont-Ferrand, les 2 et 3 décembre 1994. L'objectif général du colloque était de rassembler les diverses compétences existant en France et à l'étranger dans le domaine de l'évaluation et de la gestion des risques naturels et de confronter les expériences acquises à l'interface entre les villes en croissance et le champ d'action des phénomènes naturels créateurs de risques. Le colloque a donc réuni des chercheurs, des doctorants et des praticiens français et leurs collègues étrangers chargés de prévention, de gestion des risques naturels et de gestion urbaine, principalement dans les grandes villes des pays en développement (P.E.D.).Parvenus à mi-chemin de la Décennie Internationale pour la Prévention des Catastrophes Naturelles, nous avons porté des regards croisés sur les approches naturalistes et sociologiques des risques naturels. Il est maintenant nécessaire de faire converger ces approches, non seulement dans la connaissance des menaces et des risques, mais dans la gestion du risque quotidien en milieu urbain. Nous avons concentré ces approches dans les pays en développement ; en effet, le site de leurs grandes villes coïncide souvent avec le champ d'action des phénomènes naturels générateurs de risques, notamment dans la zone intertropicale et en particulier dans les marges continent ales actives (par exemple autour du Pacifique).Nous avons porté l'accent sur 3 points principaux, qui semblent en partie faire défaut dans les études et les méthodes actuellement mises en oeuvre dans la gestion des risques naturels : 1) comment prendre en compte les aspects socio-économiques, en particulier les types d'analyse des vulnérabilités ? 2) comment aborder la gestion des risques en milieu urbain dans les P.E.D. ? 3) quel rôle doit jouer le chercheur en Sciences de l'Homme, de la Société et de la Terre dans les analyses, les expertises consacrées aux risques et surtout dans leur gestion globale, à la charnière des sociétés citadines précaires et des milieux « naturels » contraignants ?Les contributions ont été regroupées, exposées et discutées lors du colloque sous forme de 3 thèmes. (1) Les phénomènes naturels créateurs de dommages (= menaces) : diagnostic, inventaire et typologie, (2) Les vulnérabilités des sociétés et des espaces urbanisés : concepts, typologie et modes d'analyse, (3) Les outils d'aide à la prévention et à la gestion du risque en milieu urbain.
Colloque international : "Croissance urbaine et risques naturels dans les pays en développement"
Clermont-Ferrand, Université Blaise Pascal, France

ISBN : 0035-1121
hal-01165252
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01165252

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
BACKGROUND: Evidence of human sexual transmission during Zika virus emergence is a matter of concern, particularly in procreation, but to date, kinetics of seminal shedding and the effects of infection on human reproductive function have not been described. To investigate the effects of Zika virus infection on semen and clearance of Zika virus from semen and body fluids, we aimed to study a cohort of Zika virus-infected men. METHODS: This prospective observational study recruited men presenting with acute Zika virus infection at Pointe-à-Pitre University Hospital in Guadeloupe, French Caribbean, where a Zika virus outbreak occurred between April and November, 2016. Blood, urine, and semen were collected at days 7, 11, 20, 30, 60, 90, and 120 after symptom onset, and semen characteristics, such as total sperm count, sperm motility, vitality, and morphology, and reproductive hormone concentrations, such as testosterone, inhibin, follicle-stimulating hormone, and luteinising hormone, were assessed. At days 7, 11, and 20, semen was processed to isolate motile spermatozoa. Zika virus RNA was detected by RT-PCR using whole blood, serum, urine, seminal plasma, semen cells, and motile spermatozoa fractions. Zika virus was isolated from different sperm fractions on Vero E6 cultures. FINDINGS: 15 male volunteers (mean age 35 years [SD 5; range 25-44) with acute Zika virus infection and positive Zika virus RNA detection in blood or urine were enrolled. Total sperm count was decreased from median 119 × 10(6) spermatozoa (IQR 22-234) at day 7 to 45·2 × 10(6) (16·5-89·6) at day 30 and 70 × 10(6) (28·5-81·4) at day 60, respectively, after Zika virus infection. Inhibin values increased from 93·5 pg/mL (IQR 55-162) at day 7 to 150 pg/mL (78-209) at day 120 when total sperm count recovered. In motile spermatozoa obtained after density gradient separation, Zika virus RNA was found in three of 14 patients at day 7, four of 15 at day 11, and four of 15 at day 20, and replication-competent virus was found in the tested patient. Seminal shedding kinetics seemed heterogeneous among patients. Whole blood was the fluid most frequently positive for Zika virus RNA (62 of 92 samples) and three patients remained positive at day 120. INTERPRETATION: Semen alterations early after acute Zika virus infection might affect fertility and could be explained by virus effects on the testis and epididymis. Frequency of shedding and high viral load in semen, together with the presence of replicative virus in a motile spermatozoa fraction, can lead to Zika virus transmission during sexual contact and assisted reproduction procedures. Whole blood seems to be the best specimen for Zika virus RNA detection, diagnosis, and follow-up. FUNDING: Agence de la Biomédecine/Agence Régionale de Santé de la Guadeloupe/Inserm-REACTing.
ISSN: 0140-6736

hal-01647078
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01647078
DOI : 10.1016/S1473-3099(17)30444-9
PUBMED : 28838639

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : The modernization of agriculture is under scrutiny. It is currently debated within the growing concept and practice of agroecology that applies ecological fundaments to the design and the management of sustainable agroecosystems. In matter of ecologization of agriculture, agroecological transition may be considered as a privileged pathway. It relies on two main forms: the weak (that intends to reduce the use of chemicals by alternative practices such as their substitution by biological inputs) versus strong modernization of agriculture (based on the valorization of biodiversity providing ecosystemic services). In this article, through an analysis of the technological innovations used for the enhancement of mycorrhiza (symbiotic interactions between plants and soil microorganisms) as an illustration of the implementation of the agroecological transition in France, we wonder in what extent a strong modernization of agriculture is likely to occur.This paper shows how the conceptual framework of socio-technical regime is useful to analyze the dynamics of the agroecological transition. Our demonstration relies on an empirical material (survey of the main actors of the mycorrhiza supply chain) that permits to understand how is structured the dominant system and how it impedes the development of the alternative niche. We then give some prerequisites in terms of public action to define in what extent the niche can be supported and can compete the current system.
54. ERSA Congress "Regional development & globalization: Best practices"
Saint-Petersburg, Russia

hal-01606449
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01606449
PRODINRA : 387723

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
The Gibraltar arc, spans a complex portion of the Africa-Eurasia plate boundary marked by slow oblique convergence and intermediate and deep focus seismicity. The seemingly contradictory observations of a young extensional marine basin surrounded by an arcuate fold-and-thrust belt, have led to competing geodynamic models (delamination and subduction). Geophysical data acquired in the past decade provide a test for these models and support a narrow east-dipping, subduction zone. Seismic refraction studies indicate oceanic crust below the western Gulf of Cadiz. Tomography of the upper mantle reveals a steep, east-dipping high P-wave velocity body, beneath Gibraltar. The anisotropic mantle fabric from SKS splitting shows arc-parallel "fast directions", consistent with toroidal flow around a narrow, westward retreating subducting slab. The accompanying WSW advance of the Rif-Betic mountain belt has constructed a thick pile of deformed sediments, an accretionary wedge, characterized by west-vergent thrust anticlines. Bathymetric swath‐mapping images an asymmetric embayment at the deformation front where a 2 km high basement ridge has collided. Subduction has slowed significantly since 5 Ma, but deformation of recent sediments and abundant mud volcanoes suggest ongoing activity in the accretionary wedge. Three possible origins for this deformation are discussed; gravitational spreading, overall NW-SE convergence between Africa and Iberia and finally a WSW tectonic push from slow, but ongoing roll-back subduction. In the absence of arc volcanism and shallow dipping thrust type earthquakes, evidence in favor of present-day subduction can only be indirect and remains the object of debate. Continued activity of the subduction offers a possible explanation for great (M > 8.5) earthquakes known to affect the area, like the famous 1755 Great Lisbon earthquake. Recent GPS studies show SW motion of stations in N Morocco at velocities of 3-6 mm/yr indicating the presence of an independent block, a "Rif-Betic-Alboran" microplate, situated between Iberia and Africa.
ISSN: 0040-1951

insu-00769762
https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-00769762
DOI : 10.1016/j.tecto.2012.08.038

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley-Blackwell
Résumé : International audience
In marine invertebrates that acquire their symbionts from the environment, these are generally only taken up during early developmental stages. In the symbiosis between lucinid clams and their intracellular sulfur-oxidizing bacteria, it has been shown that the juveniles acquire their symbionts from an environmental stock of free-living symbiont forms, but it is not known if adult clams are still competent to take up symbiotic bacteria from the environment. In this study, we investigated symbiont acquisition in adult specimens of the lucinid clam Codakia orbiculata, using transmission electron microscopy, fluorescence in situ hybridization, immunohistochemistry and PCR. We show here that adults that had no detectable symbionts after starvation in aquaria for 6 months, rapidly reacquired symbionts within days after being returned to their natural environments in the field. Control specimens that were starved and then exposed to seawater aquaria with sulfide did not reacquire symbionts. This indicates that the reacquisition of symbionts in the starved clams returned to the field was not caused by high division rates of a small pool of remaining symbionts that we were not able to detect with the methods used here. Immunohistochemistry with an antibody against actin, a protein involved in the phagocytosis of intracellular bacteria, showed that actin was expressed at the apical ends of the gill cells that took up symbionts, providing further evidence that the symbionts were acquired from the environment. Interestingly, actin expression was also observed in symbiontcontaining cells of untreated lucinids freshly collected from the environment, indicating that symbiont acquisition from the environment occurs continuously in these clams throughout their lifetime.
ISSN: 1462-2912

hal-00743019
https://hal.univ-antilles.fr/hal-00743019
DOI : 10.1111/j.1462-2920.2012.02748.x

Éditeur(s) : HAL CCSD American Association for the Advancement of Science
Résumé : International audience
Most eukaryotic organisms are arthropods. Yet, their diversity in rich terrestrial ecosystems is still unknown. Here we produce tangible estimates of the total species richness of arthropods in a tropical rainforest. Using a comprehensive range of structured protocols, we sampled the phylogenetic breadth of arthropod taxa from the soil to the forest canopy in the San Lorenzo forest, Panama. We collected 6144 arthropod species from 0.48 hectare and extrapolated total species richness to larger areas on the basis of competing models. The whole 6000-hectare forest reserve most likely sustains 25,000 arthropod species. Notably, just 1 hectare of rainforest yields >60% of the arthropod biodiversity held in the wider landscape. Models based on plant diversity fitted the accumulated species richness of both herbivore and nonherbivore taxa exceptionally well. This lends credence to global estimates of arthropod biodiversity developed from plant models.
ISSN: 0036-8075

hal-00817285
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00817285
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00817285/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00817285/file/1226727Revisedtext.pdf
DOI : 10.1126/science.1226727

Éditeur(s) : Wiley-blackwell
Résumé : Alexandrium tamarense (M. Lebour) Balech strains isolated in spring 2007 from a single bloom in Thau lagoon have been grown in nonaxenic artificial media. For three strains showing large oscillations in biomass (crashes followed by recoveries) on a scale of several days, a significant relationship was observed between changes in cell densities (as in vivo fluorescence) and changes in nitrate concentrations. Increases in cell densities were accompanied by decreases in nitrate, while decreases in cell densities corresponded to increases in nitrate, presumably due to nitrification. Net increases in nitrate could reach up to 15 mu mol N . L(-1) . d(-1) indicating a very active nitrifying archaeal/bacterial population. However, following population crashes, algal cells can recover and attain biomass levels similar to those reached during the first growth phase. This finding indicates that those archaea/bacteria do not compete for nutrients or do not hamper algal growth under those conditions. In contrast to diatoms, dinoflagellates such as A. tamarense do not excrete/exude dissolved organic matter, thus preventing excessive bacterial growth. This mechanism could help explain the recovery of this species in the presence of bacteria.
Journal Of Phycology (0022-3646) (Wiley-blackwell), 2011-10 , Vol. 47 , N. 5 , P. 1057-1062

Droits : 2011 Phycological Society of America
http://archimer.ifremer.fr/doc/00049/16046/13585.pdf
DOI:10.1111/j.1529-8817.2011.01031.x
http://archimer.ifremer.fr/doc/00049/16046/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
Un certain nombre de travaux montrent que la manière dont les élèves perçoivent et traitent les erreurs en mathématiques est influencée par leurs croyances épistémologiques, conceptions de l’apprentissage et la perception de leurs compétences. Tout en reconnaissant l’importance de ces facteurs d’ordre motivationnel, certains chercheurs insistent sur le rôle que joue l’environnement de la classe sur les perceptions des élèves des erreurs. Pour avancer dans ce sens Van Dyck et al. (2005) proposent le concept de « climat de l’erreur » (ensemble de savoirs et pratiques pédagogiques véhiculés en classe) et suggèrent d’étudier ses effets. La présente recherche s’inscrit dans cette perspective et poursuit les objectifs suivants :1)Identifier les savoirs et les pratiques que les enseignants mobilisent en classe pour traiter différents types d’erreurs. 2)Déterminer la manière dont les élèves perçoivent et interprètent les savoirs et les pratiques des enseignants. Nous avons réalisé une étude par questionnaire (300 élèves de lycée et leurs enseignants) et une observation au sein de deux classes. Les résultats révèlent une discordance enseignants – élèves au niveau du traitement des erreurs, provenant d’une interprétation variée ou en décalage. Cela nous permettra d’aborder la problématique du traitement des erreurs des élèves en difficultés
CRIFPE 4° ColloqueInternationnal en Education
Montréal, Canada

hal-01618422
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01618422

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
This work aims to better understand the physical processes governing the wave propagation in a vertically shearedcurrent and the resulting nearshore circulation patterns. It is based on a high resolution hydro-morphodynamic fieldcampaign, ROUSTY2014, collecting a comprehensive hydro-morphodynamical dataset during a full winter season.The overall analysis highlights three main circulation patterns, largely controled by the bathymetric features and byco-working or competing wind and waves forcings. Regarding the vertical structuration of the circulation, most of fieldobservations shown seaward directed circulation with onshore component close to the air/sea surface whose intensityvaries according to incoming wave conditions. Forth, vertical shear increase when breaking happen close to sensorlocation and orientation of mean circulation depend on wind direction.
35th International Conference on Coastal Engineering
Antalya, Turkey

hal-01426582
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01426582

Résumé : This document is written for and at the request of the Central Committee of Maritime Fishing. Yet it is also addressed to regional institutions, several of which would like to equip themselves with an economic monitor. In his "report on the modernisation of the Interprofessional Organisation of Fishing and Marine Farming", the president of the CCPM makes the development of economic information one of the main principles of reform. At the same time, a growing number of regional authorities wish to equip themselves with economic monitors, with the concern of controlling the management and future of their sector of fishing and marine farming. The two problems are similar insomuch as: (i) it is a matter, in both cases, of responding to the same questions: - what information? - according to what means of collection, processing and distribution? - to what ends? (ii) although the concerns at regional and national levels differ, they are interdependent: - the report on modernisation foresees a devolution of competencies to the regional level; - the information needs of each of the levels will be partially satisfied by information available in the other. The first part of this document examines the concerns to which economic and social information should respond; the second addresses the building of indicators likely to help the responsible parties through clarification of the choices and arbitrages they must confront. The references marked in the text refer to publications containing many illustrations of types of information, indicators, economic calculations and models.
(OCR non controlé) Ce document est rédigé à l'attention et à la demande du Comité Central des Pêches Maritimes. Toutefois, il s'adresse également aux institutions régionales, dont plusieurs souhaiteraient se doter d'un observatoire économique. Dans son «rapport sur la modernisation de l'Organisation Interprofessionnelle des Pêches et Cultures Marines», le Président du CCPM fait du développement de l'information économique, l'un des principes essentiels de la réforme. Dans le même temps, un nombre croissant d'autorités régionales sont désireuses de se doter d'observatoires économiques , dans le souci de maîtriser la gestion et le devenir de leur secteur des pêches et cultures marines. Les deux problèmes se rejoignent dans la mesure où: (i) il s'agit, dans les deux cas, de répondre aux mêmes questions: - quelle information? - selon quelles modalités de recueil, traitement et diffusion? - pour quelles finalités? (ii) si les préoccupations des niveaux régional et national diffèrent, elles sont interdépendantes: - le rapport sur la modernisation prévoit une déconcentration des compétences au niveau régional; - les besoins d'information de chacun des niveaux seront partiellement satisfaits par l'information disponible dans l'autre. La première partie de ce document examine les préoccupations auxquelles devrait répondre l'information économique et sociale; la seconde traite de la construction des indicateurs susceptibles d'assister les responsables par un éclairage des choix et des arbitrages auxquels ils ont à faire face. Les références indiquées dans le texte renvoient à des publications contenant de nombreuses illustrations des types d'information, d'indicateurs, de calcul économique et de modèles.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1989/rapport-2477.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2477/

Éditeur(s) : HAL CCSD Publisher : Paris : Baillière [1980-. Latest Publisher : Paris : Elsevier
Résumé : National audience
Introduction L’hypertension artérielle pulmonaire précapillaire constitue l’une des premières causes de décès au cours de la sclérodermie systémique. Le pronostic dépend de la précocité du diagnostic et de l’introduction rapide du traitement ciblé. En 2013, l’algorithme DETECT a été élaboré en vue d’un dépistage plus précoce de l’hypertension artérielle pulmonaire. Le but de notre étude est d’évaluer l’impact de l’utilisation de l’algorithme DETECT en comparant les pratiques actuelles d’un centre de compétence français à celles recommandées par ce nouvel outil de dépistage. Patients et méthodes Il s’agit d’une étude transversale monocentrique. Les patients sclérodermiques ayant bénéficié d’un bilan viscéral au cours de l’année 2014–2015, contenant les données nécessaires au calcul du score DETECT, ont été inclus. Conformément aux pratiques habituelles du service, l’ensemble des patients avait bénéficié d’une échographie cardiaque transthoracique et l’indication du cathétérisme cardiaque droit était posée au cours d’une réunion de concertation pluridisciplinaire. En parallèle, l’algorithme DETECT était calculé avec une première étape posant ou non l’indication théorique de l’échographie cardiaque transthoracique, puis une seconde décidant de l’indication théorique d’un cathétérisme droit. Les résultats des deux étapes de l’algorithme étaient inconnus des médecins participant à la prise en charge des patients ou à la réunion de concertation pluridisciplinaire. À la fin de la période d’inclusion, les décisions proposées par l’algorithme étaient comparées à celles issues de la réunion de concertation pluridisciplinaire. Résultats Cent dix-sept patients ont été inclus dans l’étude. Quatre-vingt-onze pour cent (n = 106) répondaient aux critères ACR 2013. Si l’algorithme DETECT était appliqué à l’ensemble de la population, l’indication de l’échographie cardiaque transthoracique était retenue chez 80 % d’entre eux (n = 94). Parmi les 94 patients sélectionnés à la première étape, il était retenu l’indication d’un cathétérisme droit chez 70 d’entre eux, soit 60 % de la population initiale. Au cours du suivi annuel, l’indication du cathétérisme droit avait été retenue par la réunion de concertation pluridisciplinaire chez 15 des 117 patients. Le diagnostic d’hypertension artérielle pulmonaire avait été retenu chez 9 d’entre eux, dont 7 avec une hypertension artérielle pulmonaire précapillaire. Si l’algorithme DETECT n’était appliqué qu’aux patients répondant aux critères initialement proposés pour la mise au point de l’algorithme (patients avec DLCO inférieure à 60 % de la valeur prédite, et symptômes – autres que phénomène de Raynaud – évoluant depuis plus de 3 ans), 42 patients étaient alors éligibles (36 % de la population totale). Les épreuves fonctionnelles respiratoires retrouvaient une DLCO moyenne à 46 % de la valeur prédite. L’indication de l’échographie cardiaque transthoracique était retenue chez 36 patients (31 % de la population totale). Parmi les 36 patients sélectionnés à la première étape, l’algorithme retenait l’indication d’un cathétérisme droit chez 31 d’entre eux (26 % de la population totale). Au cours du suivi annuel, l’indication avait été retenue par la réunion de concertation pluridisciplinaire chez 13 des 42 patients. Le diagnostic d’hypertension artérielle pulmonaire avait été posé chez 9 d’entre eux, dont 7 avec une hypertension artérielle pulmonaire précapillaire. Discussion L’application de l’algorithme DETECT à la cohorte d’un centre de compétence français confirme son efficacité en termes de dépistage de l’hypertension artérielle pulmonaire dans la population suivie pour une sclérodermie systémique car elle permet de retenir la réalisation d’un cathétérisme droit diagnostique chez tous les patients pour lesquels l’indication avait été portée en réunion de concertation pluridisciplinaire. Ces résultats sont confortés par ceux récemment publiés par une équipe tchèque. D’après nos résultats, il semble que l’application de l’algorithme à une population plus restreinte (selon les critères de l’étude DETECT) fasse aussi bien que l’application de l’algorithme à tous les patients sclérodermiques (indifféremment de la DLCO ou de l’ancienneté des symptômes). Il reste maintenant à déterminer quel suivi et quel dépistage proposer aux patients ayant une DLCO de plus de 60 %. Enfin, il restera à déterminer si l’algorithme permettra un dépistage plus précoce de l’hypertension artérielle pulmonaire chez les patients sclérodermiques, et donc d’améliorer à terme la survie. Conclusion Jusqu’en 2016, les patients suivis pour sclérodermie systémique bénéficiaient d’un dépistage de l’hypertension artérielle pulmonaire selon les recommandations internationales. L’application du nouvel algorithme DETECT aux patients sclérodermiques (avec une DLCO de plus de 60 % et les premiers symptômes autres que phénomène de Raynaud de plus de 3 ans) permettrait de limiter le nombre d’ échographies cardiaques transthoraciques (moins 70 % environ) et augmenterait le nombre de cathétérismes cardiaques droits (par un facteur 3 environ). Il permettrait donc un dépistage au moins aussi efficace que celui réalisé jusqu’à présent, avec cependant un coût probablement plus élevé et un caractère plus invasif
ISSN: 0248-8663

hal-01321852
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01321852
DOI : 10.1016/j.revmed.2016.04.300

Éditeur(s) : HAL CCSD Institute of Electrical and Electronics Engineers
Résumé : International audience
Tailoring nearest neighbors algorithms to boosting is an important problem. Recent papers study an approach, UNN, which provably minimizes particular convex surrogates under weak assumptions. However, numerical issues make it necessary to experimentally tweak parts of the UNN algorithm, at the possible expense of the algorithm's convergence and performance. In this paper, we propose a lightweight alternative algorithm optimizing proper scoring rules from a very broad set, and establish formal convergence rates under the boosting framework that surprisingly compete with those known for UNN. It is an adaptive Newton-Raphson algorithm, which belongs to the same lineage as the popular Gentle Adaboost. To the best of our knowledge, no such boosting-compliant convergence rates were previously known for these algorithms. We provide experiments on a dozen domains, including the challenging Caltech and SUN computer vision databases. They display that GNNB significantly outperforms UNN, both in terms of convergence rate and quality of the solution obtained, and GNNB provides a simple and efficient contender to techniques that can be used on very large domains, like stochastic gradient descent -- for which little is known to date. Experiments include a divide-and-conquer improvement of GNNB which exploits the link with proper scoring rules optimization.
ISSN: 0162-8828

hal-00958809
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00958809
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00958809/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00958809/file/PAMI.pdf
DOI : 10.1109/TPAMI.2014.2307877