Éditeur(s) : HAL CCSD VertigO
Résumé : International audience
Les submersions marines sont le plus souvent associées à des conditions météorologiques locales de tempête et aux phénomènes bien connus de surcote résultant du cumul de l’effet barométrique inverse et des vents d'afflux. Le déferlement des vagues joue également un rôle prépondérant dans la surélévation totale. Il provoque des variations du niveau d’eau de deux types : une surélévation statique du niveau moyen (surcote de vague) et des variations instantanées provoquées par le jet de rive. Ces deux phénomènes sont responsables dans certains cas de plus de 2/3 de la surélévation totale. Lors de la circulation des cyclones Lenny et Omar, le littoral ouest de l’île de la Martinique a été considérablement affecté. Les surélévations du niveau marin lors du passage au large de ces deux cyclones ont été reconstituées pour le nord-ouest de l'ile et particulièrement sur les plages de la commune de St Pierre. Les facteurs de variations du niveau marin ont été décomposés et modélisés en emboîtement d'échelles à partir des modèles ADCIRC pour les composantes de marée et de surcotes météorologiques, SWAN pour la propagation des vagues en zone côtière et les surcotes de vague et enfin pCOULWAVE pour le jet de rive. Ce travail de décomposition des facteurs de variations du niveau marin, associé à la reconstitution par enquêtes de terrain et témoignages, des limites des inondations, met en avant la vulnérabilité de la commune face aux houles cycloniques et la nécessité de prendre en compte l’ensemble des facteurs de variation du niveau marin dans l’étude de l’aléa de submersion et les documents de prévention des risques.
ISSN: 1492-8442

hal-01119372
https://hal-brgm.archives-ouvertes.fr/hal-01119372
https://hal-brgm.archives-ouvertes.fr/hal-01119372/document
https://hal-brgm.archives-ouvertes.fr/hal-01119372/file/Nicolae%20et%20al%202014%20Vertigo-15326-modelisation-lenny-1999-et-omar-2008.pdf
DOI : 10.4000/vertigo.15326

Éditeur(s) : Université de Bucarest - Université de Bretagne occidentale
Résumé : This study is focusing on the architecture and recent sedimentary evolution of the Danube channel, the youngest channel-levee system in the Danube deep-sea fan. The study was conducted as part of the BlaSON French-Romanian Project, and combined high-resolution seismic-reflection profiles and chirp profiles with multibeam bathymetry and piston cores. This data set was acquired in 1998 during a joint survey IFREMER-GeoEcoMar of the north-western Black Sea. Previous seismic and acoustic data were also used. The Danube deep-sea fan is a large passive-margin mud-rich fan. Like the other systems of this type (Amazon fan, Mississippi fan or Indus fan) the Danube fan consists of stacked channel-levee systems intercalated with mass-transport deposits. Seismic and sedimentary facies in the Danube fan are similar to those identified in most of the mud-rich systems. Nevertheless, the Danube fan is distinguished by a specific feature: its development in a freshwater environment. This is due to the peculiar water-level history of the Black Sea controlled by the link to the Mediterranean through the Strait of Bosphorus and the Sea of Marmara. This connexion was successively interrupted (during sea level lowstands) and re-established (when the sea level was rising above the Bosphorus). Temporary absence of marine water influx during lowstands together with large freshwater inputs from the Danube and other major rivers changed the Black Sea into a freshwater lake during times of fan activity. This peculiarity possibly favourised the development of hyperpycnal flow at the Danube mouth and the initiation of turbidity currents in the deep-sea fan. The Danube channel is directly connected to the large shelf-indenting Danube canyon (also known as Viteaz canyon). The Danube canyon is deeply incised into the shelf margin for 26 km landward of the shelfbreak. During lowstands this canyon acted as the most important path for sediment supply to the deep sea in this part of the continental margin. It consists of a main trough with steep flanks, and a meandering thalweg cut into the flat canyon floor, attesting for the development of the canyon by erosion in the entrenched axial thalweg. Sections with specific morphology, orientation and gradient identified along the canyon, are interpreted as phases of landward expansion of the canyon. Internal structure of the canyon shows several erosional surfaces, which indicate that the present morphology of the canyon is the result of its polyphasic evolution. Instability in the zone of the canyon is related to the important sediment supply at the Danube mouth, to the presence of the gas in the surficial sediment, and possibly under a structural control. The upper part of the Danube channel (between the Danube canyon and ~1400 m depth) consists in a single leveed-channel that has undergone significant overbank deposition, as attested by the well-developed levees. The levees are strongly asymmetrical, being higher and wider on the right-hand side looking downstream. This type of asymmetry is rather common in deep-sea fans, and is generally attributed to the Coriolis effect (Menard, 1955). The channel is slightly sinuous, partially filled and incised by an entrenched thalweg, connected to the axial thalweg of the Danube canyon. Detailed seismic investigation inside the channel trough documented several depositional phases within the channel fill, separated by erosional surfaces. These surfaces are associated with distinct terraces identified on the multibeam bathymetry, that can be followed downward along the main trough axis. The valley fill deposits (where not removed by the subsequent erosional event) show an axial HAR (High Amplitude Reflections) seismic facies with lateral lower amplitude continuous reflections consisting in a levee facies, as proved by sampling. This indicates that filling up was associated with flow within the channel, and not with interruption of fan activity. On the middle slope below 1400 m, this single channel bifurcates through repeated avulsions. As a result, several highly meandering channels developed. The onlap relationships between these channels indicate that only one channel was active at a time. Each phase of avulsion resulted in a depositional unit consisting in a basal unchannelized lobe defined as High Amplitude Reflection Packets (HARP, Flood et al., 1991) that underlies a channel-levee system. The deposition of HARPs was associated with the readjustment of the longitudinal profile of the channel after the breaching of a levee, which resulted in remobilization of upslope channel deposits and eroded levees. When this adjustment was complete, erosion ceased and levees began to develop above the HARPs (Pirmez et al., 1997). All the identified phases of avulsion followed the same pattern: (1) breaching of the lower and narrower left levee; (2) building of a unit of High Amplitude Reflector Packets (HARP) basinward of the bifurcation point by the unchannelized flow, while the former channel was abandoned; and (3) initiation of a new meandering leveed channel. The northward migration of the resulting units through repeated bifurcations is influenced by the asymmetry between levees (hence by the Coriolis effect), and confined between the high levees of the initial phase of the Danube channel (to the south) and the steep relief of the Dniepr fan (to the north). Structure of the fan valley fill indicate that the erosional surfaces inside the upper channel could be formed in response of successive avulsions, by the adjustment of the longitudinal profile of the channel following the breaching of a levee wall. Sediments removed by erosion formed the HARP lobes basinward of the avulsion point. When this adjustment was complete, a channel-levee system developed downward of the bifurcation, overlying the HARPs, but also upward of this point, as a confined channel-levee system inside the erosional trough of the fan valley. Fluvial incisions identified on the continental shelf, together with the coastline location during the last active period of the Danube channel, indicated that the paleo-Danube was directed towards the head of the Danube canyon. Paleo-Danube mouth was fairly close (ca. 10 km) to the Danube canyon, supplying sediment to the Danube channel. Furthermore, hyperpycnal flow probably prevailed in the freshwater environment that characterized the Black Sea during times of fan activity. These conditions would have enabled the development of a quasi-continuous river-canyon-deep-sea fan system, ensuring the effective transfer of the sediment between the coastal zone and the deep sea.
Ce travail est consacré à l'étude de l'architecture et de l'évolution sédimentaire récente de l'éventail profond du Danube, en particulier de son dernier système chenal-levée: le chenal du Danube. L'étude a été réalisée dans le cadre du projet de coopération franco-roumaine BlaSON, à partir des données sismiques, bathymétriques-acoustiques et sédimentologiques acquises en 1998 lors d'une campagne en mer Noire réalisée par IFREMER et GeoEcoMar. Des données sismiques et acoustiques antérieures ont été également utilisées. L'éventail profond du Danube s'enserre dans la catégorie des grands éventails vaseux. Comme les autres systèmes de ce genre (tel que les éventails de l'Amazone, du Mississippi ou de l'Indus) il est constitué d'une succession de systèmes chenaux-levées intercalés avec des dépôts de transport en masse. Le fonctionnement de l'éventail était conditionné par la baisse du niveau marin lors des périodes glaciaires. Ses faciès sismiques et sédimentaires s'apparentent aux faciès qui caractérisent la plupart des éventails de ce type. L'éventail du Danube constitue néanmoins un cas particulier parmi les autres systèmes étudiés, du fait de son fonctionnement dans un bassin lacustre. Ceci est dû à la situation spécifique de la mer Noire dont la connexion avec la Méditerranée, par le détroit de Bosphore et la mer de Marmara, a été successivement interrompue (au cours de périodes de bas niveau) et reprise (quand le niveau marin remontait en dépassant le seuil du Bosphore). L'absence de l'apport d'eau salée pendant les périodes glaciaires, associée avec l'augmentation de l'apport fluvial, ont déterminé l'installation d'un milieu d'eau douce dans la mer Noire à chaque fois que la baisse du niveau permettait la reprise du fonctionnement de l'éventail profond. Cette situation particulière aurait favorisé la formation des courants hyperpycnaux à l'embouchure d'un fleuve du débit du Danube qui déversait ses eaux turbides dans un bassin lacustre, et aurait donc influencé l'apparition de courants de turbidité dans l'éventail profond. Le chenal du Danube s'est développé sur la pente continentale en prolongation du canyon du Danube (ou Viteaz) auquel il est directement connecté. Le canyon est incisé de manière significative (26 km) dans la plate-forme continentale. Au cours de bas-niveaux marins il constituait la principale voie de transfert des sédiments terrigènes vers le bassin profond dans cette partie de la marge. Le canyon est constitué par une entaille avec des flancs abrupts et un talweg axial incisé, qui montre l'importance du processus d'érosion du fond pour le développement du canyon. Les segments qui ont été identifiés le long du canyon, avec des morphologies, des orientations et des pentes spécifiques, sont interprétés comme des phases d'avancement du canyon vers la côte. Plusieurs incisions sont visibles dans la structure interne du canyon et témoignent que la morphologie actuelle du canyon est le résultat de son évolution polyphasée. L'instabilité de la zone du canyon est en relation avec les apports sédimentaires importants à l'embouchure du Danube, avec la présence du gaz dans les sédiments superficiels, et possiblement sous un contrôle structural. Sur la pente supérieure (entre le canyon du Danube et environ 1400 m de profondeur) le chenal du Danube présente des levées bien développées et fortement asymétriques, avec la levée droite plus haute et plus large que la levée gauche. Ce type d'asymétrie, fréquemment décrit dans les éventails profonds est généralement attribué à l'effet Coriolis (Menard, 1955). Le chenal est légèrement sinueux, partiellement comblé et incisé par un talweg axial qui représente la continuation sur la pente du talweg incisé dans le canyon du Danube. L'analyse sismique détaillée du remplissage de la vallée montre plusieurs phases de dépôt, séparées par des discontinuités érosives. Ces surfaces d'érosion correspondent à des terrasses emboîtées, relativement parallèles le long de la vallée, visibles dans la bathymétrie. Les dépôts qui constituent le remplissage du chenal présentent un faciès sismique de type HAR (High Amplitude Reflections) dans l'axe du chenal, partiellement (ou parfois totalement) enlevé par les phases d'érosion subséquentes, qui continue latéralement avec des réflexions litées correspondant à un faciès sédimentaire de levée. Le remplissage de la vallée a été donc associé avec des écoulements dans le chenal, et non pas avec l'interruption de son fonctionnement. Sur la pente inférieure, le chenal unique bifurque plusieurs fois par avulsion et forme de nouveaux systèmes chenaux-levées méandriformes. Ces systèmes se succèdent verticalement en onlap, ce qui montre qu'un seul chenal a été actif à la fois. Chaque phase d'avulsion a eu comme résultat la mise en place d'une unité constituée par un lobe défini comme "High Amplitude Reflection Packets" (HARP, Flood et al., 1991) à la base, et un système chenal-levée au sommet. Le dépôt d'un lobe HARP est associé avec de l'érosion dans le chenal en amont du point d'avulsion pour l'ajustement de son profil après la rupture de la levée. Quand le chenal a retrouvé son profil d'équilibre, l'érosion a cessé et des levées ont commencé à se développer au-dessus des HARPs (Pirmez et al., 1997). Toutes les phases d'avulsion se sont développées d'après le même modèle: (1) la rupture de la levée gauche, plus étroite; (2) le dépôt d'un lobe HARP par les écoulements non-chenalisés en aval du point d'avulsion, et l'abandon de l'ancien chenal; (3) l'initiation d'un nouveau système chenal-levée. La migration systématique du chenal vers le nord est influencée par l'assymétrie des levées (donc par la force de Coriolis), et confinée entre les grandes levées de la phase initiale du chenal du Danube, au sud, et le relief abrupt de l'éventail du Dniepr au nord. La structure sédimentaire du chenal du Danube indique que les surfaces érosives à l'intérieur du remplissage du chenal se seraient formées en réponse aux avulsions, du fait de l'ajustement du profil du chenal après la rupture d'une levée. Les sédiments du chenal érodés au cours de ce processus ont formé les lobes HARP. Quand le chenal a retrouvé son profil d'équilibre, un système chenal-levée s'est développé en aval du point d'avulsion au dessus du lobe HARP, mais aussi en amont de ce point, où il se trouve confiné dans la vallée érosive. Les incisions fluviatiles identifiés sur la plate-forme continentale et la position de la ligne de côte pendant la dernière période d'activité du chenal du Danube montrent que le paléo-Danube se dirigeait directement vers la tête du canyon du Danube. Son embouchure était située à proximité du canyon, qui alimentait le chenal du Danube. Cependant, les courants hyperpycnaux devaient prévaloir dans le milieu de salinité réduite qui caractérisait la mer Noire lors des périodes actives de l'éventail. Ces conditions auraient favorisé la mise en place d'un système quasi-continu fleuve-canyon-éventail profond, qui contrôlait le transfert des sédiments entre la côte et le bassin profond.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2002/these-1206.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1206/

Éditeur(s) : HAL CCSD Oxford University Press (OUP)
Résumé : International audience
Ocean loading effects cause 3-D displacements large enough to affect space geodesy measurements either at the subdiurnal periods or at longer time scales by the means of spurious signals. GPS measurements, in turn, could provide local improvements of the models in coastal areas if their ability to precisely monitor such rapid displacements is assessed. In this paper, we use 105 days of continuous GPS measurements collected in 2004 in the French Brittany and Cotentin region to investigate: (1) the precision achieved by the GPS analysis on measuring 3-D subdiurnal displacements and amplitude and phase of the tidal constituents, (2) the quality of the most recent ocean tide model FES2004 in such a complex coastal context. Indeed, in this area, tide amplitudes are among the largest in the world (up to 16 cm of loading displacements on the vertical component) and are believed to show strong shallow-water tides. From a state of the art GPS analysis using the scientific GAMIT software over 2-h sessions, we test two independent strategies for the realization of the reference frame. The position time series are then compared with the displacements predicted by the FES2004 model applied on an elastic Earth model. The two sets of results are consistent with each other at the same level of agreement than with the predicted displacements, namely 3–5 mm on the horizontal components, 10 mm on the vertical. This assesses the capability of this technique for measuring 3-D ocean tide loading deformation. We validate the FES2004 model in the Brittany area, even though it slightly (2–7 mm) underestimates the three components amplitudes. With a harmonic analysis of the observed position time series, we obtain nevertheless an agreement at a submillimetre level for the M2, N2, O1, Q1 tidal constituents and at a millimetre level for the K1 and S2 tidal constituents. Moreover, we can extract a significant M4 load signal at the 95 per cent confidence level from the GPS time series at the stations located in the Mont St Michel area. The detection of other shallow-water constituents would be helpful to understand the amplitude deficit between the FES2004 predicted and GPS observed displacements.
ISSN: 0956-540X

insu-00335909
https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-00335909
https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-00335909/document
https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-00335909/file/Vergnolle_GJI_08_revised.pdf
DOI : 10.1111/j.1365-246X.2008.03734.x

Résumé : Les stocks des éléments dans les sols, et en particulier ceux du carbone, sont en constante évolution sous l’effet de facteurs naturels (climat, végétation, teneurs en argiles, etc.) et anthropiques (usages des sols, etc.). Notre objectif est donc, (i) de mieux comprendre les relations entre type de sol, système de culture et quantité de carbone stockée, (ii) d’étudier les conséquences des changements d’usage et de gestion des terres sur les formes de matière organique dans les sols et (iii) de préciser le rôle de la matière organique sur les propriétés physiques des sols.Des situations agro-pédologiques représentatives des trois grands modèles minéralogiques des sols tropicaux (Sols à allophanes (argiles non cristallisées), Sols à argiles 1/1 et Sols à argiles 2/1) et présentant des systèmes culturaux de différents niveaux d’intensification (monocultures intensives destinées à l’exportation, systèmes paysans faiblement intensifiés, etc.) ont ainsi été sélectionnées sur les sols de Martinique. Par ailleurs, afin de limiter les effets des usages antérieurs des parcelles, nous avons généralement choisi des situations culturales âgées au minimum de 3 ans.L’analyse des stocks de carbone des différentes parcelles fait apparaître des comportements différents : dans les sols à allophanes, il y a un effet de la minéralogie sur la stabilisation des matières organiques ; dans les sols à argiles cristallisées, il existe une corrélation entre la teneur en carbone (ou le stock organique) et la texture (ou teneur en éléments fins), aussi bien pour les situations non cultivées que pour les situations sous cultures. L’amplitude des variations (diminution) des stocks en carbone observées sous l’effet de différents modes de gestion des sols, dépend elle aussi de la texture : dans les sols sableux, la potentialité de séquestration du carbone est faible ou nulle, en revanche, les potentialités de stockage du carbone sont plus fortes dans les sols argileux.L’estimation des stocks totaux de carbone à l’échelle de la Martinique, pour un mètre de profondeur et pour une situation moyenne entre les cartes d’usage des terres de 1969/1970 et 1979/1980, s’élèvent à 11,859 Mt de C calculés pour 95,8% de la surface.La distribution de la matière organique du sol varie avec la texture du sol : dans les sols sableux, à faibles teneurs en matière organique, les matières organiques sont principalement associées aux fractions sableuses ; dans les sols argileux, plus riches en matières organiques, 50 à 60 % de la matière organique sont associées à la fraction argileuse. De même, la dynamique de la matière organique dépend également de la texture du sol : dans les sols sableux, les variations des stocks organiques sont essentiellement dues à la perte ou à l’accumulation en carbone de la fraction sableuse ; dans les sols argileux, la fraction argileuse participe de manière prépondérante aux variations des stocks organiques de ces sols lors de leur mise en culture ou en prairie ; les sols sablo-argileux ont un comportement intermédiaire entre ces deux pôles.La stabilité structurale varie avec la minéralogie. Les andosols (ou ALL) présentent un haut degré d’agrégation et de stabilité, du à la présence d’allophanes et à leur association particulière avec les composés organiques. Dans les sols à argiles cristallisées, la stabilité de l’agrégation est plus élevée dans les sols à argiles 1/1 (ou LAC) ; les valeurs les plus faibles sont généralement observées dans les parcelles sur sols à argiles 2/1 (ou HAC). En outre, la mise en culture se traduit généralement par une diminution de la stabilité de l’agrégation.L’intensification des cultures (labours fréquents, faibles restitutions de matière organique au sol, etc.) accentue la perte de la stabilité de l’agrégation provoquée par la mise en culture, en particulier dans les parcelles sur sols à argiles 2/1 (ou HAC).
Soils elements stocks, and particularly those of carbon, are in constant evolution under natural factors effect (climate, vegetation, clays content, etc) and anthropic factors effect (soils uses, etc). Our objective is thus, (i) to better understand the relations between soil, farming system and stored carbon quantity, (ii) to study the consequences of soils uses changes and of soils managements changes on organic matter shapes in soil and (iii) to specify organic matter role on soil properties physics.Representative agri-pedological situations of the three great mineralogical models of tropical soils (allophonic soils (not crystallized clays), 1:1 clay soils and 2:1 clay soils) and presenting agricultural systems of various levels of intensification (intensive monocultures intended for export, slightly intensified farming systems, etc) were thus selected in the soils of Martinique. In addition, to limit the effects of their former uses, we generally chose to the minimum 3 years old farming situations.The analysis of the various lands carbon stocks reveals different behaviors: in allophonic soils, a correlation exists between carbon content (or organic stock) and texture (or fine elements content), as well for not cultivated as for cultivated situations. Variations ranges (reduction) of carbon stocks observed under various management soils systems effect, also depends on texture: in sandy soils, carbon sequestration potentiality is low or null, on the other hand, carbon storage potentialities are higher in clay soils.The estimation of total carbon stocks on the scale of Martinique, for one meter of depth and for and average situation between the use soils charts of 1969/70 and 1979/80, rises to 11,859 Mt of C calculated for 95,8% of the surface.Soil organic matter distribution varies with soil texture: in sandy soils, with low contents of organic matter, organics matters are mainly associated with the sandy fractions; in clay soils, richer in organic matters, 50 to 60% of the organic matters are associated with the argillaceous fraction. In the same way, the organic matter dynamics also depends on soil texture: in sandy soils, organic stocks variations are primarily due to carbon loss or accumulation of the sandy fraction; in clay soils, the argillaceous fraction takes part in a dominating way in organic stocks variations of these soils at the time of their setting in culture or meadow; the sand-clay soils have an intermediate behavior between these two poles.Structural stability varies with mineralogy. Andosols (or ALL) present a high degree of aggregation and stability, due to the presence of allophones and their particular association with the organics compounds. In crystallized clay soils, aggregation stability is higher in 1:1 clay soils (or LAC); the lowest values are generally observed in the lands on 2:1 clay soils (or HAC). Moreover, culture setting generally results in aggregation stability reduction.Cultures intensification (frequent ploughings, low organic matter restitutions to the soil, etc) accentuates aggregation stability loss caused by culture setting, particularly in lands on 2:1 clay soils (or HAC).

http://www.theses.fr/2012AGUY0513/document

Éditeur(s) : HAL CCSD Public Library of Science
Résumé : International audience
BACKGROUND: Histoplasmosis is an endemic fungal infection in French Guiana. It is the most common AIDS-defining illness and the leading cause of AIDS-related deaths. Diagnosis is difficult, but in the past 2 decades, it has improved in this French overseas territory which offers an interesting model of Amazonian pathogen ecology. The objectives of the present study were to describe the temporal trends of incidence and mortality indicators for HIV-associated histoplasmosis in French Guiana. METHODS: A retrospective study was conducted to describe early mortality rates observed in persons diagnosed with incident cases of HIV-associated Histoplasma capsulatum var. capsulatum histoplasmosis admitted in one of the three main hospitals in French Guiana between 1992 and 2011. Early mortality was defined by death occurring within 30 days after antifungal treatment initiation. Data were collected on standardized case report forms and analysed using standard statistical methods. RESULTS: There were 124 deaths (45.3%) and 46 early deaths (16.8%) among 274 patients. Three time periods of particular interest were identified: 1992-1997, 1998-2004 and 2005-2011. The two main temporal trends were: the proportion of early deaths among annual incident histoplasmosis cases significantly declined four fold (χ2, p<0.0001) and the number of annual incident histoplasmosis cases increased three fold between 1992-1997 and 1998-2004, and subsequently stabilized. CONCLUSION: From an occasional exotic diagnosis, AIDS-related histoplasmosis became the top AIDS-defining event in French Guiana. This was accompanied by a spectacular decrease of early mortality related to histoplasmosis, consistent with North American reference center mortality rates. The present example testifies that rapid progress could be at reach if awareness increases and leads to clinical and laboratory capacity building in order to diagnose and treat this curable disease.
ISSN: 1935-2727

inserm-01065109
http://www.hal.inserm.fr/inserm-01065109
http://www.hal.inserm.fr/inserm-01065109/document
http://www.hal.inserm.fr/inserm-01065109/file/PLOS_Neglected_Tropical_Dis_2014.pdf
http://www.hal.inserm.fr/inserm-01065109/file/2014_Adenis_-_HIV-associated_histoplasmosis_early_mor.pdf

Résumé : Notre étude s’est proposée d’analyser l’incidence du paludisme et son évolution dans le temps et dans l’espace, ainsi que de rechercher les facteurs de risque d’accès palustres chez les enfants d’un village du Moyen-Oyapock (Camopi), peuplé d’Amérindiens wayampi et émerillon, d’une part, et d’un village du Haut-Maroni (Antecume Pata), peuplé d’Amérindiens wayana, d’autre part. L’approche a été multiple avec, pour chacun des deux sites d’étude :- Une analyse de survie (modèle de Cox) à partir des accès palustres confirmés biologiquement dans une cohorte d’enfants de moins de sept ans régulièrement suivis, ainsi qu’un questionnaire de type Connaissances, Attitudes et Pratiques (CAP), puis les caractéristiques des habitats et la description de leur environnement immédiat.- Une analyse spatiale avec une classification de l’occupation du sol à partir d’images satellites SPOT 5, l’extraction de variables environnementales d’intérêt, l’étude de leur effet sur la transmission du paludisme et la mise au point d’une méthode objective de sélection d’un rayon d’observation autour des habitations pour la caractérisation de l’environnement.- Une étude de séries temporelles (ARIMA) afin de déterminer l’effet des évènements climatiques et hydrologiques sur le paludisme, aux niveaux local et plus global (El Niño).Les taux d’incidence d’accès palustres sur la période 2001-2009 se sont révélés particulièrement élevés chez les jeunes enfants, notamment à Camopi avec une moyenne de 773‰ par année. Une diminution brutale de l’incidence a eue lieu en 2007 sur le Haut-Maroni et ce phénomène est observé à Camopi depuis 2010. Une prémunition se développe assez rapidement au cours de la vie (2-3 ans), surtout contre les reviviscences à Plasmodium vivax. Les facteurs environnementaux se sont avérés être les plus nombreux et les plus fortement liés à l’incidence palustre. En effet, le dégagement des alentours du carbet de toute végétation et une certaine distance de celui-ci à la forêt sont des facteurs protecteurs. La composante géographique est également apparue essentielle à Camopi avec une incidence qui variait selon le fleuve d’habitation et en fonction de la distance au hameau principal. Les facteurs météorologiques locaux (température et niveau du fleuve) se sont également révélés être liés à l’incidence du paludisme à court terme (0-3 mois). Par ailleurs, nos résultats ont permis d’émettre un certain nombre d’hypothèses quant à la transmission et au(x) vecteur(s) local(ux), et notamment de suggérer la participation d’un vecteur autre qu’An. darlingi dans la transmission du paludisme à Camopi. Nous avons également prouvé par ce travail que la télédétection et les systèmes d’information géographique sont très prometteurs pour la prise en compte de la dimension spatiale et environnementale dans l’étude des maladies transmissibles, notamment dans les zones d’accès difficile de Guyane.
The aim of our study was to analyze the incidence of malaria in children and its evolution through time and space, as well as to search for risk factors in a village in Mid-Oyapock (Camopi), populated by Amerindians Wayampi and Emerillon, on the one hand, and a village in Upper-Maroni (Antecume Pata), populated by Amerindians Wayana, on the other hand. The approach was multiple with, for both study sites:- A survival analysis (Cox modelling) completed out of biologically confirmed malaria attacks in a cohort of children under seven, as well as a Knowledge, Attitudes, Practices and Behavior (KAPB) questionnaire, and also the characteristics of the houses and the description of their immediate environment.- A spatial analysis with a land cover classification from SPOT 5 satellite images, the extraction of environmental variables, the study of their effect on malaria transmission and the development of an objective method for picking the proper observation horizon around houses in order to characterize the environment.- A time series study (ARIMA) to determine the effect of climatic and hydrological events on malaria at local and global (El Niño) scales.The incidence rates of malaria attacks during the period 2001-2009 were particularly high among young children, especially in Camopi with an average of 773‰ by year. A sharp decline in incidence occurred in 2007 on the Upper Maroni and this phenomenon has been observed in Camopi since 2010. An acquired immunity develops quite rapidly during the life (2-3 years old), especially against P. vivax relapses. Environmental factors were found to be the most strongly associated with malaria incidence. Indeed, living in a hut cleared from the surrounding vegetation and at a larger distance from the forest are protective factors. The geographic component also appeared essential in Camopi with an incidence which varied with the river of living and with the distance from the main hamlet. The local meteorological factors (temperature and river level) also proved to be linked to malaria incidence in the short term (0-3 months). Moreover, our results have allowed issuing a number of assumptions about the transmission and the local vector(s), in particular to suggest the involvement of another vector than An. darlingi in the malaria transmission in Camopi. We also proved by this work that remote sensing and geographic information systems hold great promise for the inclusion of the spatial and environmental dimensions in the study of transmitted diseases, especially in areas of difficult access in French Guiana.

http://www.theses.fr/2011AGUY0448/document

Éditeur(s) : HAL CCSD Oxford University Press (OUP): Policy P - Oxford Open Option A Oxford University Press (OUP)
Résumé : International audience
It is well known that sedimentary rocks having same porosity can have very different pore size distribution. The pore distribution determines many characteristics of the rock, among which its transport properties are often the most useful. Multifractal analysis is a powerful tool that is increasingly used to characterize the pore space. In this study, we performed multifractal analysis of pore distribution on simulated sedimentary rocks using the relaxed bidisperse ballistic deposition model (RBBDM). The RBBDM can generate a 3-D structure of sedimentary rocks of variable porosity by tuning the fraction p of particles of two different sizes. We also performed multifractal analysis on two samples of real sedimentary rock to compare with the simulation studies. One sample, an oolitic limestone is of high porosity (40 per cent) while the other is a reefal carbonate of low porosity, around 7 per cent. 2-D sections of X-ray microtomographs of the real rocks were stacked sequentially to reconstruct the real rock specimens. Both samples show multifractal character. The results from analysis of real rock agree quite well with the simulated structure of low porosity. The simulated rock of high porosity showed a weak multifractal nature though the real rock sample of similar porosity was found to be strongly multifractal. We propose a ‘structure parameter’ ξ which is a function of porosity and the generalized dimensions, and controls the transport properties of the rock.
ISSN: 0956-540X

hal-01174142
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01174142
DOI : 10.1093/gji/ggu417

Éditeur(s) : HAL CCSD AGU and the Geochemical Society
Résumé : International audience
Although magmatism may occur during the earliest stages of continental rifting, its role in strain accommodation remains weakly constrained by largely 2-D studies. We analyze seismicity data from a 13 month, 39-station broadband seismic array to determine the role of magma intrusion on state-of-stress and strain localization, and their along-strike variations. Precise earthquake locations using cluster analyses and a new 3-D velocity model reveal lower crustal earthquakes beneath the central basins and along projections of steep border faults that degas CO2. Seismicity forms several disks interpreted as sills at 6-10 km below a monogenetic cone field. The sills overlie a lower crustal magma chamber that may feed eruptions at Oldoinyo Lengai volcano. After determining a new ML scaling relation, we determine a b-value of 0.87±0.03. Focal mechanisms for 65 earthquakes, and 13 from a catalogue prior to our array reveal an along-axis stress rotation of ∼60° in the magmatically active zone. New and prior mechanisms show predominantly normal slip along steep nodal planes, with extension directions ∼N90°E north and south of an active volcanic chain consistent with geodetic data, and ∼N150°E in the volcanic chain. The stress rotation facilitates strain transfer from border fault systems, the locus of early-stage deformation, to the zone of magma intrusion in the central rift. Our seismic, structural, and geochemistry results indicate that frequent lower crustal earthquakes are promoted by elevated pore pressures from volatile degassing along border faults, and hydraulic fracture around the margins of magma bodies. Results indicate that earthquakes are largely driven by stress state around inflating magma bodies.
ISSN: 1525-2027

hal-01667198
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01667198
DOI : 10.1002/2017GC007027

Éditeur(s) : HAL CCSD European Geosciences Union
Résumé : International audience
The seasonal climate drivers of the carbon cycle in tropical forests remain poorly known, although these forests account for more carbon assimilation and storage than any other terrestrial ecosystem. Based on a unique combination of seasonal pan-tropical data sets from 89 experimental sites (68 include aboveground wood productivity measurements and 35 litter productivity measurements), their associated canopy photosynthetic capacity (enhanced vegetation index, EVI) and climate, we ask how carbon assimilation and aboveground allocation are related to climate seasonality in tropical forests and how they interact in the seasonal carbon cycle. We found that canopy photosynthetic capacity seasonality responds positively to precipitation when rainfall is < 2000 mm yr(-1) (water-limited forests) and to radiation otherwise (light-limited forests). On the other hand, independent of climate limitations, wood productivity and litterfall are driven by seasonal variation in precipitation and evapotranspiration, respectively. Consequently, light-limited forests present an asynchronism between canopy photosynthetic capacity and wood productivity. First-order control by precipitation likely indicates a decrease in tropical forest productivity in a drier climate in water-limited forest, and in current light-limited forest with future rainfall < 2000 mm yr(-1).
ISSN: 1726-4170

hal-01557759
https://hal.univ-lorraine.fr/hal-01557759
https://hal.univ-lorraine.fr/hal-01557759/document
https://hal.univ-lorraine.fr/hal-01557759/file/bg-13-2537-2016.pdf
DOI : 10.5194/bg-13-2537-2016

Éditeur(s) : HAL CCSD Oxford University Press (OUP)
Résumé : International audience
Our knowledge and understanding of the 3-D lithospheric structure of the Himalayas and the Tibetan Plateau is still challenging although numerous geophysical studies have been performed in the region. The GOCE satellite mission has the ambitious goal of mapping Earth's gravity field with unprecedented precision (i.e. an accuracy of 1-2 mGal for a spatial resolution of 100 km) to observe the lithosphere and upper-mantle structure. Consequently, it gives new insights in the lithospheric structure beneath the Himalayas and the Tibetan Plateau. Indeed, the GOCE gravity data now allow us to develop a new strategy for joint gravimetry-seismology inversion. Combined with teleseismic data over a large region in a joint inversion scheme, they will lead to lithospheric velocity-density models constrained in two complementary ways. We apply this joint inversion scheme to the Hi-CLIMB (Himalayan-Tibetan Continental Lithosphere during Mountain Building) seismological network which was deployed in South Tibet and the Himalayas for a 3-yr period. The large size of the network, the high quality of the seismological data and the new GOCE gravity data set allow us to image the entire lithosphere of this active area in an innovative way. We image 3-D low velocity and density structures in the middle crust that fit the location of discontinuous low S-velocity zones revealed by receiver functions in previous geophysical studies. In the deeper parts of our velocity model we image a positive anomaly interpreted to be the heterogenous Indian lithosphere vertically descending beneath the centre of the Tibetan Plateau.
ISSN: 0956-540X

hal-00858024
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00858024
DOI : 10.1093/gji/ggs110

Résumé : Le Réseau Hydrologique Littoral Normand (RHLN) pérenne a été approuvé en 2007 par ses partenaires, avec le triple objectif (1) de maintenir le suivi de la qualité des masses d’eau et évaluer leur niveau d’eutrophisation en réponse aux réglementations (Directive Nitrate, OSPAR, DCE), (2) de poursuivre la réflexion sur la définition des indicateurs DCE, puis (3) de développer les connaissances et de fournir des données à la modélisation. Ce rapport réalise la synthèse des résultats obtenus en 2008 première année de la mise en oeuvre du RHLN pérenne. L’analyse des cycles hydrobiologiques observés au sein des différentes masses d’eau normandes en 2008 a permis de mettre en évidence le caractère analogue de cette année 2008 du point de vue météorologique par rapport à l’année 2007. Malgré cela, les précipitations n’ont pas entrainé d’apports de nutriments aussi importants qu’en 2007 le long des côtes normandes dont les stocks sont restés modérés. Cependant, les périodes de carence en azote, phosphore ou silice dans le milieu ont été de nouveau très limitées, ce qui aurait pu favoriser la croissance du phytoplancton tout au long de la période productive. Or, comme en 2007, les niveaux de biomasses chlorophylliennes sont restés relativement faibles. L’évaluation du niveau d’eutrophisation (ou plus précisément de dystrophie) des masses d’eaux normandes au moyen des indicateurs retenus dans le cadre de la DCE, a permis de conclure que sur les 19 masses d’eau suivies dans le cadre du RHLN 2008 : 14 peuvent être classées en « très bon état » (dont deux par extrapolation) ; 2 en « bon état » ; et 5 en « état moyen », au vue des indicateurs actuellement validés pour l’élément de qualité « Phytoplancton », combiné à celui des « Conditions physico-chimiques » pour l’évaluation de l’état écologique des masses d’eau.

Droits : Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00006/11730/8404.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00006/11730/

Résumé : Nous avons étudié les marqueurs hémorhéologiques, hématologiques et biochimiques chez des sujets drépanocytaires homozygotes SS (HbS/HbS) et hétérozygotes composites SC (HbS/HbC) dans deux cohortes, pédiatriques et adultes, de patients drépanocytaires, et ce, à travers 7 complications récurrentes de la drépanocytose : 2 appartenant au profil hémolytique (l’ulcère de jambes et la glomérulopathie) et 5 appartenant au phénotype visqueux/vaso-occlusif (l’hypertension artérielle, le syndrome thoracique aigu (STA), la crise vaso-occlusive (CVO), la rétinopathie et l’ostéonécrose). Nous avons montré que : 1) une viscosité sanguine et une déformabilité érythrocytaire élevées sont des facteurs de risques de CVO chez les enfants homozygotes ; 2) Une viscosité sanguine élevée est associée à une hypertension artérielle systémique relative chez des adultes SS ; 3) les enfants SC présente une fonction vasculaire mieux préservée que les enfants SS pour faire face à une augmentation de la viscosité sanguine ; 4) les patients adultes SS avec une ostéonécrose présentent une déformabilité érythrocytaire plus élevée que les patients sans ostéonécrose ; 5) une viscosité sanguine élevée est associée à la présence d’une rétinopathie chez les adultes SC mais pas chez les SS ; 6) les patients adultes SS présentant une glomérulopathie ont un taux d’hémolyse élevé, une déformabilité érythrocytaire réduite et des agrégats érythrocytaires très robustes ; 7) les patients adultes SS avec des ulcères de jambes récurrents ont un taux d’hémolyse accru et une déformabilité érythrocytaire réduite. De plus, nos travaux confirment que l’-thalassémie module les propriétés de déformabilité érythrocytaire, mais montrent pour la première fois qu’elle module aussi les propriétés d’agrégation érythrocytaire, et notamment la force des agrégats érythrocytaires. En conclusion, ces travaux permettent de préciser le rôle de la rhéologie sanguine dans un certain nombre de complications de la drépanocytose et d’enrichir le modèle préexistant divisant les complications de la drépanocytose selon 2 phénotypes : hémolytique versus visqueux/vaso-occlusif. Nous montrons pour la première fois que le phénotype hémolytique est caractérisé aussi par des anomalies de la rhéologie du globule rouge : rigidité accrue et agrégats érythrocytaire robustes.
Hemorheological, hemathological, and biochemical marquers of patients with sickle cell anemia (SS) and patients with sickle cell SC disease (SC) were studied in 2 cohorts: children and adults. We focused on 7 recurrent complications: 5 belonging to the viscosity/vaso-occlusion phenotype (systemic hypertension, acute chest syndrome (ACS), vaso-occlusive crisis (VOC), retinopathy and osteonecrosis) and 2 belonging to the hemolytic phenotype (leg ulcer and glomerulopathy). Our results show that 1) high viscosity is associated with increased risk for VOC in SS children; 2) blood viscosity is increased in SS adults with systemic relative hypertension; 3) SC children have preserved vascular function compared to SS children; 4) SS adults with osteonecrosis are characterized by higher red blood cell (RBC) deformability than SS adults without osteonecrosis; 5) high blood viscosity is associated with retinopathy in SC adults but not in SS adults; 6) SS adults affected by glomerulopathy have high hemolytic rate, low RBC deformability and increased RBC aggregates strenght; 7) SS adults with recurrent leg ulcers have high hemolytic rate and reduced RBC deformability. Moreover, our studies shows that alpha-thalassemia modulate RBC deformability and RBC aggregation properties. In conclusion, this work shows for the first time that the hemolytic phenotype is characterized by an abnormal RBC rheology which may play a role in several sickle cell complications.

http://www.theses.fr/2013AGUY0684/document

Éditeur(s) : Elsevier
Résumé : A study was conducted using a bioenergetics approach to generate information on energy requirement and feed utilization of Litopenaeus stylirostris. Animals (initial mean weight 21 +/- 1 g were fed ad libitum six experimental diets, ranging from 25 to 58% crude protein (CP), for 50 days. Weight gain increased from 21 to 30 g with increasing dietary protein level. Survival rates averaged 80%. Basal metabolism (HeE) and heat increment of feeding (HiE) were monitored using respirometry. HeE was on average I U shrimp(-1) day(-1) or 47 U kg live weight(-1) day (22 kJ/kg(0.8). d(-1)), slightly more than what is observed in fish. HiE averaged 0.2 W/sbrimp(-1) day(-1) or 10 W kg live weight(-1) day(-1) (4 kJ/kg(0.8) d(-1)). It represented 3 1 % and 12% digestible energy intake (DET) for shrimp fed on 58% CP and 25% CP diet respectively. Non-fecal (UE + ZE) energy calculated on the basis of N-ammonia excretion averaged 0.2 jig N-ammonia/g dry wt./ mn or 25 J live shrimp(-1) day(-1) in fasting stage and increased to 40 J in post-prandial stage. Ammonia production increased with increasing dietary crude protein (CP). The O:N ratio indicated that protein was increasingly used as an energy substrate as CP increased. The information was used to construct an energy budget for shrimp fed a protypical 40% CP diet. Gross energy intake (IE) was estimated at 6.5 W live shrimp(-1) day(-1); digestible energy intake (DEI) at 5, urinary and branchial excretion (UE +ZE) at 1.2, total heat production (HE) at 3.2; recovered energy (RE) at 0.6 (or 11% DEI). L. stylirostris adults issued from domesticated strain appeared to be more efficiently utilizing (i.e. converting into carcass energy) protein than carbohydrates. This preliminary energy budget can be used to construct theoretical feed requirement and waste outputs model for L. stylirostris. (C) 2007 Published by Elsevier B.V.
Aquaculture (0044-8486) (Elsevier), 2007-10 , Vol. 271 , N. 1-4 , P. 439-448

Droits : 2007 Published by Elsevier B.V.
http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/publication-6263.pdf
DOI:10.1016/j.aquaculture.2006.05.062
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6263/

Éditeur(s) : HAL CCSD Oxford University Press (OUP)
Résumé : International audience
To improve earthquake location, we create a 3-D a priori P-wave velocity model (3-DVM) that approximates the large velocity variations of the Ecuadorian subduction system. The 3-DVM is constructed from the integration of geophysical and geological data that depend on the structural geometry and velocity properties of the crust and the upper mantle. In addition, specific station selection is carried out to compensate for the high station density on the Andean Chain. 3-D synthetic experiments are then designed to evaluate the network capacity to recover the event position using only P arrivals and the MAXI technique. Three synthetic earthquake location experiments are proposed: (1) noise-free and (2) noisy arrivals used in the 3-DVM, and (3) noise-free arrivals used in a 1-DVM. Synthetic results indicate that, under the best conditions (exact arrival data set and 3-DVM), the spatiotemporal configuration of the Ecuadorian network can accurately locate 70 per cent of events in the frontal part of the subduction zone (average azimuthal gap is 289° ± 44°). Noisy P arrivals (up to ± 0.3 s) can accurately located 50 per cent of earthquakes. Processing earthquake location within a 1-DVM almost never allows accurate hypocentre position for offshore earthquakes (15 per cent), which highlights the role of using a 3-DVM in subduction zone. For the application to real data, the seismicity distribution from the 3-D-MAXI catalogue is also compared to the determinations obtained in a 1-D-layered VM. In addition to good-quality location uncertainties, the clustering and the depth distribution confirm the 3-D-MAXI catalogue reliability. The pattern of the seismicity distribution (a 13 yr record during the inter-seismic period of the seismic cycle) is compared to the pattern of rupture zone and asperity of the Mw = 7.9 1942 and the Mw = 7.7 1958 events (the Mw = 8.8 1906 asperity patch is not defined). We observe that the nucleation of 1942, 1958 and 1906 events coincides with areas of positive Simple Bouguer anomalies and areas where marine terraces are still preserved on the coastal morphology. From north to south: (1) the 1958 rupture zone is almost aseismic and is attributed to a zone of high coupling; (2) south of the Galera alignment (perpendicular to the trench), the 1942 rupture zone presents moderate seismicity, deeper on the seismogenic interplate zone, and abutting on the Jama cluster (to the south). This cluster is facing the Cabo Pasado cap and positive Bouguer anomalies on the overriding margin. We suspect that this cluster reflects a zone of local asperity (partial coupling). South of the Jama cluster, the spherical aseismic zone in the Bahia area is interpreted as having a low seismic coupling (steady creep motion or slow slip events). We suspect that the site that generated the three M > 7 events (1896, 1956 and 1998) correspond to a small patch of strong coupling. To the south, in the Manta-Puerto Lopez zone, the seismicity is mainly organized in earthquake swarms (1998, 2002, 2005). Although slow slip events have been observed in the area (Vallée et al. submitted), we infer from the coastline shape, the marine terraces and the high positive Bouguer anomalies that the seismicity here might reveal a significant amount of seismic coupling.
ISSN: 0956-540X

hal-00873478
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00873478
DOI : 10.1093/gji/ggs083

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
BIOLOGICAL IDENTITY IS NOT ONLY GENETICAL IDENTITY : A CHALLENGE FOR A CITIZEN TEACHING. The 20 th century marked the success of the genetics. The beginning 21 th century is aware of the limits of the " all-genetics ". Nevertheless, the curricula of the secondary school are not yet modified in this way. The present work analyses the conceptions of 33 future Biology teachers, and analyses also, in 3 scholar textbooks (for pupils 16 years old), the chapters related to the notion of " biological identity ". The results show that this notion is reduced to the notion of " genetical program " , and associated with a model of linear causal determinism of the phenotype by the genotype. The scientific and citizen dangers of this model are discussed. The challenge is now to teach a new model with interactions between the genotype and its environment : the epigenesis, and particularly the cerebral epigenesis. KEYWORDS : Biology Education – Genetics – Genetical determinism – Phenotype – Cerebral epigenesis-Conceptions of teachers – Curricula – Scholar textbooks-RÉSUMÉ : Alors que le 20 ème siècle est celui du succès de la génétique, le 21 ème siècle s'ouvre avec la conscience des limites du " tout-génétique ". Cependant les programmes de Biologie au Lycée tardent à se modifier dans ce sens. Le présent travail analyse les conceptions de 33 futurs enseignants de Biologie, ainsi que, dans 3 manuels scolaires de la classe de Première S, les chapitres relatifs à la notion d'identité biologique. Il en ressort que celle-ci est limitée à la notion de programme génétique, avec un modèle de déterminisme causal linéaire du phénotype par le génotype.
Bioed2000 the challenge of the next century
Paris, France

Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess
hal-01620726
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01620726
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01620726/document
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01620726/file/clementforissierBioEd2001.pdf

Résumé : L'importance des forêts tropicales dans le cycle du carbone à l'échelle planétaire est majeure, tant en terme de stock qu’en terme de flux de CO2. Plusieurs études mettent en évidence des changements au sein des forêts tropicales au cours des 20 dernières années, notamment des changements de la dynamique forestière et une augmentation de la biomasse aérienne. Les déterminants de ces variations sont aujourd’hui discutés et nous proposons ici d’apporter une contribution à ce débat. Les données utilisées dans ce travail proviennent du dispositif de suivi forestier à long terme de Paracou, Guyane Française, mis en place en 1984 et qui recouvre plus de 120 ha de forêt tropicale humide. Les données météorologiques proviennent de la tour à flux du dispositif, Guyaflux. Les mesures de diamètre proviennent de la base Guyafor pour les données annuelles et bisannuelles, et des mesures de 260 arbres à proximité de la tour à flux pour les mesures diamétriques intra-annuelles.Cette thèse se divise en deux grandes parties. La première concerne l’analyse de la biomasse du dispositif de suivi forestier de Paracou en Guyane et l’implication des changements de structure de cette forêt sur le bilan de carbone. Cette partie est constituée de deux points. (i) Quelles échelles temporelles et spatiales sont pertinentes pour analyser les composantes de structure (biomasse, aire basale et nombre de tiges) et de dynamique (croissance, recrutement et mortalité) des forêts tropicales afin de minimiser les effets d’échantillonnage ? Nous avons établi une méthodologie permettant de relier les intervalles de temps et la surface de mesure aux coefficients de variation de chacune des variables de structure et de dynamique de la forêt. (ii) Quels processus démographiques sont prépondérants dans l’explication des variations de biomasse et comment se redistribue la biomasse accumulée dans le système ? L’augmentation de la biomasse observée sur le dispositif de Paracou serait liée à la rareté des évènements de mortalité des gros arbres qui portent une part très importante de la biomasse.La deuxième partie de la thèse concerne l’analyse de l’effet du climat à moyen terme, inter et intra-annuel, et les effets directs du climat dans les changements de dynamique de la forêt. Cette partie se divise en 3 points. (i) Comment quantifier le stress hydrique en forêt tropicale humide ? Nous avons réalisé un modèle journalier de réserve en eau du sol pour les arbres en forêt tropicale. (ii) Quelles variables sont explicatives de la croissance des arbres en forêt guyanaise ? Nous avons montré que l’eau dans le sol est le facteur le plus explicatif du déterminisme climatique parmi un panel de variables climatiques. (iii) Quels traits fonctionnels sont prédicteurs de la réponse des arbres aux variations climatique ? Nous avons déterminé que des traits spécifiques, densité du bois et la hauteur maximale, ainsi que le diamètre de l'arbre au moment de la mesure, modulent la croissance des arbres en réponse au climat.
At a global scale tropical forest play a major role in term of carbon stock as well as in term of CO2 fluxes. Several studies have highlighted changes in tropical forest functioning during the last 20 years including a faster turnover and an increase of above ground biomass. The drivers of these changes are discussed and throughout this thesis we propose to contribute to this debate. We use the data from the Paracou experimental site in French Guiana established in 1984 on 120 hectares of moist tropical forest. Meteorological data come from the flux tower of the site, Guyaflux. We use annual and bisannual diameter measurements from the Guyafor database, and intra-annual diameter increments from the measurements of 260 trees near the flux tower.This thesis has two main parts. In the first part we present the biomass analysis of the Paracou permanent plots and the impact of structural changes in this forest on the carbon budget. The first part is constituted by two points. (i) Which temporal and spatial scale used to analyze the structure (biomass, basal area and stem density) and dynamics (tree growth, recruitment and mortality)components of tropical forest in order to minimized sample bias ? We establish a simple method to rely measurement interval between census and surface of measurement to the coefficient of variation of forests structure and dynamic components (ii) Which demographic process are involved in the explanation of biomass variation and how the biomass is distributed in the system ? The observed increase of biomass at Paracou could be link to the rarity of big trees mortality events. These big trees represent the larger part of the biomass. In the second part, we present the analysis of intra and inter-annual climate variation effects on forest dynamic changes. This part is divided in two points. (i) How to model drought stress in moist tropical forest ? We built a daily water balance model for tropical trees. (ii) Which climate variables explain the tree growth in guianian forests? We shown that soil water availability is the determinant factor of tree growth among a panel of climate variables. (iii) Which functional traits are involved in the tropical tree growth responses to climate? In this analysis, we determined that wood specific gravity, maximum tree height and tree diameter modulate the tree growth response to climate variations.

http://www.theses.fr/2011AGUY0481/document

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Satellite and in situ chlorophyll concentration data collected as part of VALidation HYperspectral of a BIOgeochemical model (ValHyBio), a PNTS-sponsored project dedicated to satellite ocean-colour imaging of the Southwest Pacific, are analyzed to describe chlorophyll variability in the Coral Sea, a vast oligotrophic region characterized by a deep chlorophyll maximum and blue waters of high transparency. Average chlorophyll concentrations estimated from MODIS-Aqua are very low (<0.2 mg m-3) except in the vicinity of main islands and coral reefs, where enrichment may occur due to upwelling or internal waves that bring nutrients to the euphotic zone from the deep part of the water column. During the summer season, blooms of cyanobacteria (Trichodesmium) develop in the surface waters and may form large slicks. The nitrogen fixed by these slicks is a potential source of new nitrogen later assimilated by picoplankton and the marine food chain. Coastal areas exhibit higher chlorophyll concentrations because of nutrient input from the land, as observed in 2008 around New Caledonia. In lagoon areas, the sea colour is influenced by turbidity and bathymetry, and the MODIS OC3 algorithm is inadequate, with a systematic overestimation of chlorophyll concentration in the New Caledonia lagoon. Improved bio-optical algorithms are needed for those turbid and shallow waters, to allow not only a better description of chlorophyll variability, but also evaluation of chlorophyll simulations by recently developed biogeochemical models.
of the 12th International Coral Reef Symposium, 18E
CAIRNS, Australia

hal-00746470
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00746470
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00746470/document

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
We report new data on the geochemical evolution, metasomatic and deformation processes in the lower layers of cratonic lithospheric mantle based on a detailed study of extraordinarily fresh and large deformed peridotite xenoliths from the Udachnaya kimberlite pipe, Siberia. Based on our T-P estimates, the deformed peridotites are localized in a depth range of 170 to 220 km near the base of cratonic mantle. The degree of deformation is not correlated with the depth and equilibration temperatures of the xenoliths. The deformed peridotites are depleted in magmaphile major elements indicating their residual nature, but are enriched in incompatible trace elements, Fe and K. The deformed peridotites experienced a complex evolution, i.e., they were formed initially as high-degree melt extraction residues and later were subjected to three main stages of metasomatic modification. (1) An old, mostly cryptic metasomatism by melt/fluid of carbonatitic composition, which formed garnets with sinusoidal REE patterns (Smn/Ern > 1). (2) Silicate metasomatism, which led to the most significant changes in mineralogical and chemical composition of the deformed peridotites. (3) Fe and Ti metasomatism just before the entrainment of the deformed rocks into kimberlite magma. Enrichment of the peridotites in large-ion lithophile elements (K, Rb, Ba) is related to the formation of kelyphitic rims around garnet. The nature of the metasomatic agent of silicate metasomatism was evaluated from mass-balance of measured and calculated whole-rock compositions, ratios of highly incompatible elements (D < 0.1) and fractional crystallization modeling. All this evidence indicates that the agent of silicate metasomatism had a composition intermediate between that of kimberlites and HIMU OIB. The metasomatic processes responsible for the formation of deformed peridotites and precipitation of megacryst suites cannot be widespread at the base of the cratonic mantle. Rather, they are local features only existing in the cratonic mantle below kimberlite fields and localized along the metasomatic vein system.
ISSN: 0024-4937

hal-00941010
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00941010
DOI : 10.1016/j.lithos.2012.11.014

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Diffusion du document : INRA Unité d'Economie et Sociologie rurales rue Adolphe Bobierre CS 61103 35011 Rennes Cedex (FRA)
Dans le cadre de l'Organisation commune de marché de la banane (OCMB) instituée dans l'Union européenne (UE) en 1993, celle-ci impose un contingent tarifaire contraignant à ses importations de bananes en provenance d'Amérique latine (bananes "dollar"). Le système de gestion des certificats d'importation (ou droits à importer) lié à ce contingent présente la particularité d'allouer 30 % des droits à des firmes importatrices de bananes en provenance d'origines non soumises au contingent, i. e., les zones ACP (Afrique, Caraïbes et Pacifique) et communautaires. Cet article développe un cadre d'analyse théorique du fonctionnement du marché des certificats d'importation verticalement lié au marché contingenté de la banane dans l'UE. Le modèle développé permet d'analyser l'impact d'éventuels comportements non concurrentiels des firmes importatrices de bananes "dollar" sur la détermination du prix d'équilibre des certificats d'importation et sur le partage de la rente associée au contingent tarifaire entre les différents opérateurs de la filière.
15. Journées de microéconomie appliquée
Pointe-à-Pitre, France

hal-01594045
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01594045
PRODINRA : 151943

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer-Verlag
Résumé : The Chile-Argentina Patagonian Cordillera is a natural laboratory to study the interactions between oceanic and continental lithosphere during the subduction of an active spreading ridge beneath a continent. Subduction of the South Chile spreading ridge, which separates the Nazca plate from the Antarctic plate, started around 15–14 Ma at the southern tip of Patagonia. Presently, the southernmost segment of the Chile Ridge enters the Peru-Chile trench at 46°S, at the site of the Chile Triple Junction (CTJ). We review the main events which occurred on land in the CTJ region (46–47°S), related with processes of ridge subduction. We summarize tectonic, sedimentary, and magmatic features in a 30 Ma-to Present chronological table. A preridge subduction stage, from 30 to 15 Ma, is characterized by the onset and growth of Patagonian relief and by a shift from marine to continental detrital sedimentation in the foreland at 20–22 Ma. The change from pre-ridge subduction to ridge subduction is marked on land by a transition from calc-alkaline to alkaline volcanism, at 14–12 Ma, and by the onset of eruption of very large fl ood basalt provinces (future volcanic plateaus) following rapid erosion of the eastern foreland belt. Post-plateau basaltic volcanism (<4 Ma) is coeval with a period of tectonic and morphological rejuvenation during which the eastern foreland of the Cordillera has been affected by extensional/transtensional tectonics. We place these events in the framework of a tectonomagmatic model involving the opening of slab windows due to both slab tear and ridge axis subduction.
Subduction Zone Geodynamics

hal-00421053
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00421053
DOI : 10.1007/978-3-540-87974-9_12