Éditeur(s) : Société Nationale de Protection de la Nature
Résumé : Monitoring of French Polynesia coral reefs and their recent development.-French Polynesia, consisting of 118 islands in the centre of the Pacific Ocean, has more than 15 000 km(2) of reefs and lagoons managed by the local government. Tourism and pearl culture are the two main economic resources of the country. Polynesian coral reefs are extremely diverse and are among those for which we have thorough knowledge. The exploitation of local resources has been recorded for multiple decades and includes : coral materials, fishing, harvest and export of mother-of-pearl molluscs, pearl production, and ornamental fish. All over the country, many monitoring programmes have been launched to measure the health of reefs and the natural and anthropogenic perturbations that they suffer : hurricanes and seismic events, water quality, health of benthic and fish communities, pearl oyster pathology and radiobiology. These data, collected over the last few decades, allowed to define the relative importance of natural and anthropogenic degradation on reefs and lagoons, and to explain the present status of reefs at different spatial scales. Devastating hurricanes are rare (1903-1906, 1982-1983 and occasionally at other times), but they may annihilate outer slope coral communities on some islands. Bleaching events with considerable coral mortality at different geographical scales occurred mainly in 1991, 1994 and 2003. Outbreaks of Acanthaster destroyed numerous reefs (lagoons and outer slopes) from 1978-1982 and a new demographic wave began in 2006 at many Society islands. Eutrophication events only occurred occasionally and only in some lagoons. Whereas natural catastrophic events degrade the coral reef ecosystem across many islands, at the archipelago or even regional scale, anthropogenic degradation is limited to a few Society Islands, occurring rarely on atolls and not at all on those (one third) which are uninhabited. The main causes of reef degradation in some areas of Tahiti and Moorea include the embankment of fringing zones, coral mining, overfishing, absence of urban sewage treatment and the development of leisure and tourism activities. Because of its large geographical extent, one may conclude that major reef degradation in French Polynesia is caused by catastrophic natural events. On the other hand, anthropogenic degradation is more localized. Unfortunately, the synergistic effects of these causes of degradation prevent reefs from recovering. Optimum coral cover on French Polynesian outer reef slopes is between 50-60%. After a major destructive impact (hurricane, bleaching, Acanthaster) a reef is reduced to less than 10% coral cover, however if no more major disturbance events occur a reef will recover in about 12 years. Most of the 15 000 km(2) of reefs and lagoons in French Polynesia are in good health, and along with their neighbouring reefs in East and Central Pacific they are considered as the least degraded reefs worldwide and at a low risk of becoming degraded in the few next decades. However, we are more and more anxious about the future of reefs in the world particularly because present simulations predict that major impacts of climate change would include : elevation of sea surface temperatures, increase in the strength of hurricanes and acidification of seawater which will affect the formation of coral structures.
La Polynésie française, 118 îles au coeur du Pacifique, possède une surface de plus de 15 000 km2 de récifs et lagons gérés par le gouvernement polynésien. Le tourisme et la perliculture représentent les deux ressources économiques majeures du Pays. Les formations récifales très diversifiées sont parmi les mieux connues. Plusieurs suivis d'exploitation des ressources sont opérationnels depuis des décennies : granulats coralliens, pêche pour l'alimentation, collecte et exportation de mollusques nacriers, production de perles, poissons d'ornement. À l'échelle du Pays de très nombreux programmes de surveillance de l'état des récifs et des perturbations qu'ils subissent, naturelles et anthropiques, ont été mis en place : perturbations cycloniques et sismiques, qualité des eaux, état de santé des peuplements benthiques et ichtyologiques, pathologie des nacres, radiobiologie. Toutes ces données recueillies au fi l des décennies ont permis d'établir l'importance relative des dégradations naturelles et anthropiques sur les récifs et lagons polynésiens et d'expliquer leur état de santé actuel en considérant différentes échelles spatiales. Les périodes cycloniques dévastatrices pour les récifs sont rares (1903-1906, 1982-1983 et épisodiquement) mais les cyclones ont parfois anéanti les communautés coralliennes de pentes externes dans certaines îles. Les blanchissements suivis de mortalités importantes à des échelles spatiales diverses, ont été surtout ceux de 1991, 1994 et 2003. Les explosions démographiques d'Acanthaster ont détruit de nombreux récifs (lagons et pentes externes) en 1978-1982 et une nouvelle pullulation s'amplifie depuis 2006 dans plusieurs îles de la Société. Les crises dystrophiques n'ont perturbé qu'épisodiquement certains lagons. [...]
Revue d'Ecologie de la Terre et de la Vie (0249-7395) (Société Nationale de Protection de la Nature), 2008 , Vol. 63 , N. 1-2 , P. 145-177

Droits : 2008 Société Nationale de Protection de la Nature
http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/publication-4558.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4558/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé :  
Afin de comprendre l'organisation des communautés de chauves-souris ainsi que la coexistence de nombreuses espèces sympatriques, il est essentiel de déterminer comment les espèces utilisent et se partagent les ressources. Dans un premier temps, nous décrivons un peuplement de chauves-souris en forêt primaire de Guyane Française. Les facteurs locaux tels que la présence de gîtes particuliers comme les grottes, ou l'absence de perturbation anthropique ont une influence sur la structure et la composition des communautés. Au cours de cette étude, nous nous sommes concentrés sur les trois espèces les plus communes de chaque guilde végétarienne (frugivores de sous-bois, frugivores de canopée et nectarivores). Leur coexistence est possible grâce au partage des ressources alimentaires, de l'espace et/ou du temps. Au sein d'une même guilde, les plus petites espèces ont une bonne manoeuvrabilité et semblent occuper davantage les espaces fermés, moins attractifs pour leurs compétiteurs. Elles ont aussi un domaine vital plus petit que les grandes espèces. De même, le décalage des rythmes d'activités que nous avons observé, peut réduire la compétition entre les chauves-souris frugivores en diminuant les interférences directes lors de l'alimentation. En plus d'un intérêt pour l'écologie des communautés, cette étude décrivant des peuplements de chiroptères dans une forêt primaire intacte, peut servir de référence en biologie de conservation.
Revue d'écologie

hal-01032160
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032160

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : Ce numéro de la Revue Etudes Caribéennes consacré au tourisme vise à poser les bases d’une réflexion sur le fonctionnement des lieux touristiques, les programmes d’aménagement touristique et les différents enjeux pour les territoires. Lieu ouvert ou lieu fermé, flux concentré ou flux diffus, la nature du lieu touristique, avec ses pratiques, classiques ou originales, oriente les types d’impacts potentiels. Les choix opérés en matière d’aménagement touristique sont donc primordiaux : dans quelles conditions opte-t-on pour un tourisme balnéaire classique, massif, ou pour une approche touristique alternative ? Ces différentes déclinaisons sont-elles attachées à des territoires spécifiques ? Faut-il opposer ces deux approches ou les considérer complémentaires dans leurs environnements respectifs, peuvent-elles partager un même espace ? L’objectif de ce numéro thématique est de réunir des approches diverses et renouvelées qui développent des analyses sous l’angle de l’économie, de l’aménagement du territoire, de la sociologie, de la géographie… Les articles pourront proposer une réflexion théorique ou privilégier des études de cas, traitant des relations tourisme de masse – tourisme alternatif ou s’attachant à illustrer l’une de ces deux aspects. Les terrains privilégiés ne seront pas exclusivement caribéens et américains, ils pourront relever de n’importe quelle région du monde et illustrer des situations présentes et/ou passées. Les thématiques privilégiées seront : 1. Les concepts de tourisme de masse et de tourisme alternatif (identification, caractéristiques, logiques spatiales, enjeux économiques, sociaux, environnementaux). 2. Les lieux du tourisme masse (stations balnéaires, villes historiques, formes spécifiques d’aménagement des lieux et les types de structures d’accueil) 3. Alter-tourismes et renouvellement des pratiques touristiques (écotourisme, tourisme communautaire, agrotourisme …) 4. L’aménagement des lieux touristiques et les modalités de gestion des environnements protégés (conservation, protection et pratiques touristiques et récréatives) 5. Les enjeux économiques, sociaux, environnementaux autour de différents types de lieux touristiques. This issue of the Revue Etudes Caribéennes, devoted to tourism, aims to lay the foundations of a reflection on the functioning tourist places, their development programs and the different challenges presented to them. Exposed/Open or closed location, concentrated or diffused flows, the nature of these tourist places with their traditional or original customs, orientate different types of potential impacts. The choices made in tourism development are essential: in which conditions should be opted for the traditional seaside tourism, or for mass tourism, or for alternative tourism? Are certain properties linked to specific territories? Should we oppose these two approaches or consider them as complementary in their environments and can they share the same place? The objective of this thematic issue is to call for various and renewed approaches which develop analysis in terms of the economy, regional planning, sociology, geography etc. Articles may propose a theoretical reflection or focus on case studies, dealing with the relations of mass tourism, alternative tourism, or to illustrate one of these two aspects. Priorities fields will not exclusively be Caribbean and American but can come from any part of the world and can illustrate post and/or present situations. The prioritized analysis will include: 1. The concepts of mass tourism and alternative tourism (identification, characteristics, spatial logics, and economic, social and environmental issues). 2. Places of mass tourism (resorts, historic cities, specific forms of site layout and reception facilities) 3. Alter-tourism and the renewal of tourism practices (ecotourism, community tourism, agrotourism) 4. The development of tourist spots and of management methods concerning protected environments (conservation, protection, tourism practices and recreational practices) 5. Economic, social, and environmental issues surrounding different types of tourist places. Este número de la Revista Estudios Caribeños consagrado al turismo apunta a poner las bases de una reflexión sobre el funcionamiento de los lugares turísticos, los programas de ordenación turística y las diferentes apuestas para los territorios. Lugar abierto o cerrado, flujos concentrados o flujos difusos, la naturaleza del lugar turístico, con sus prácticas, clásicas u originales, orienta los tipos de impactos potenciales. Las elecciones operadas en materia de ordenación turística son primordiales: ¿en qué condiciones se opta por un turismo balneario clásico, masivo, o por un enfoque turístico alternativo? ¿Estas diferentes declinaciones están relacionadas a territorios específicos? ¿Se debe oponer estos dos enfoques o considerarlos complementarios en sus ambientes respectivos, pueden compartir el mismo espacio? El objetivo de este número temático es de reunir los diversos y renovados enfoques que desarrollan los análisis sobre el ángulo de la economía, la ordenación del territorio, la sociología, la geografía… Los artículos podrán proponer una reflexión teórica o privilegiar los estudios prácticos, tratando las relaciones turismo de masa-turismo alternativo o dirigirse a ilustrar uno de estos dos aspectos. Los terrenos privilegiados no serán exclusivamente caribeños y americanos, podrán hacer frente a cualquier región del mundo e ilustrar situaciones presentes y/o pasadas. Los temas privilegiados serán: 1. Los conceptos de turismo de masa y de turismo alternativo (identificación, características, lógicas espaciales, apuestas económicas, sociales, ambientales). 2. Los lugares de turismo de masa (estaciones balnearias, ciudades históricas, formas específicas de ordenación de lugares y de tipos de estructuras de recepción). 3. Alter-turismos y renovación de las prácticas turísticas (ecoturismo, turismo comunitario, agroturismo...). 4. La ordenación de lugares turísticos y las modalidades de gestión de los ambientes protegidos (conservación, protección y prácticas turísticas y recreativas). 5. Las apuestas económicas, sociales, ambientales alrededor de diferentes tipos de lugares turísticos.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.7521
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/7521

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley
Résumé : White-sand forests represent natural laboratories of evolution over their long history throughout Amazonia and the Guiana Shield and pose significant physiological challenges to the plants and animals they host. The study of diversification in plant lineages comprising species endemic to white-sand forest can therefore give insights into processes of evolution and community assembly in tropical forests. In this article, we synthesize recent studies of white-sand forests to integrate patterns of plant species distribution with processes of lineage diversification and community assembly in the white-sand flora. We contrast lineages that have radiated uniquely in these habitats (e.g., Pagamea, Rubiaceae), with cosmopolitan lineages comprising specialists to white-sand forests and other habitats that may have arisen via ecological speciation across habitat gradients (e.g., Protium, Burseraceae). In both cases, similar suites of functional traits have evolved, including investment in dense, long-lived tissues that are well-defended structurally and chemically. White-sand endemics, therefore, play an important role in biodiversity conservation because they represent unique combinations of functional and phylogenetic diversity. Furthermore, white-sand endemics may respond differently than other tropical forest plant species to contemporary global changes because they comprise resilient functional types that may better withstand increased drought, temperature, and invasions of exotic pests in these regions.
ISSN: 0006-3606

hal-01531635
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01531635
DOI : 10.1111/btp.12301
PRODINRA : 353397

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley
Résumé : In the Amazon basin and the Guiana Shield, white-sand (WS) forests are recognized as a low-resource habitat often composed by a distinct flora with many edaphic endemic plants. Small patches of nutrient-poor white-sand forests can pose a series of challenges to plants and animals. For plants, these challenges have been shown to function as strong filters that in turn drive taxonomic, functional and phylogenetic plant composition. However, very little is known about animal communities in WS forest and the effect that low-resource availability may have on higher trophic levels. Here, we investigate the diversity of both taxonomic and phylogenetic diversity of three Lepidoptera families' (Nymphalidae, Saturniidae, and Sphingidae) assemblages between low-resource (White-Sand Forest) and two adjacent high-resource habitats, terra firme clay and seasonally flooded forests. We found no clear effect of habitat type on taxonomic composition although butterfly and moth species abundance differed among the three contrasted habitats. The WS forest Lepidoptera community is significantly more phylogenetically overdispersed than expected by chance. We suggest that these low-resource habitats filter the number of plant lineages which, in turn, creates a bottom-up control structuring Lepidoptera phylogenetic structure. We recommend long-term sampling on Lepidoptera community both at larval and adult stages that may complement this study and test hypotheses linking herbivore phylogenetic structure to plant resource availability and trophic cascade theory.
ISSN: 0006-3606

hal-01532550
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01532550
DOI : 10.1111/btp.12294
PRODINRA : 353400

Éditeur(s) : HAL CCSD Wiley
Résumé : International audience
1. Despite considerable interest in the application of plant functional traits to questions of community assembly and ecosystem structure and function, there is no consensus on the appropriateness of sampling designs to obtain plot-level estimates in diverse plant communities. 2. We measured 10 plant functional traits describing leaf and stem morphology and ecophysiology for all trees in nine 1-ha plots in terra firme lowland tropical rain forests of French Guiana (N = 4709). 3.We calculated, by simulation, the mean and variance in trait values for each plot and each trait expected under seven sampling methods and a range of sampling intensities. Simulated sampling methods included a variety of spatial designs, as well as the application of existing data base values to all individuals of a given species. 4. For each trait in each plot, we defined a performance index for each sampling design as the proportion of resampling events that resulted in observed means within 5% of the true plot mean, and observed variance within 20%of the true plot variance. 5. The relative performance of sampling designs was consistent for estimations of means and variances. Data base use had consistently poor performance for most traits across all plots, whereas sampling one individual per species per plot resulted in relatively high performance. We found few differences among different spatial sampling strategies; however, for a given strategy, increased intensity of sampling resulted in markedly improved accuracy in estimates of trait mean and variance. 6. We also calculated the financial cost of each sampling design based on data from our 'every individual per plot' strategy and estimated the sampling and botanical effort required. The relative performance of designs was strongly positively correlated with relative financial cost, suggesting that sampling investment returns are relatively constant. 7. Our results suggest that trait sampling for many objectives in species-rich plant communities may require the considerable effort of sampling at least one individual of each species in each plot, and that investment in complete sampling, though great, may be worthwhile for at least some traits.
ISSN: 0269-8463

hal-00594009
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00594009

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : L’objectif de cette étude est d’analyser les impacts et les limites d’une expérience de lutte contre la pauvreté par le tourisme au travers d’une étude de cas dans le village d’Anse-la-Raye, à Sainte-Lucie.Depuis son indépendance en 1979, Sainte-Lucie a tenté de diversifier la structure économique héritée de son passé colonial, en développant notamment des sources alternatives de recettes. Au début, il y a eu un certain succès avec l'industrie de confection et le tourisme qui ont émergé comme des activités viables en dehors de l'agriculture d'exportation.À la fin des années 1980, le pays avait même atteint un taux de croissance qui aurait été considéré comme raisonnable. Sainte-Lucie a d’ailleurs été l’île ayant connu la plus grande croissance économique des Etats du CARICOM. L’exportation de la banane a contribué pour beaucoup à ces résultats, et les nouveaux secteurs ont permis la création d’emplois ainsi que des revenus et des recettes d'exportation supplémentaires.Mais comme tous les Petits Etats Insulaires en Développement (PEID), Sainte-Lucie est caractérisée par sa vulnérabilité économique face aux catastrophes naturelles et crises extérieures. Ainsi, deux des secteurs principaux de son économie se sont affaiblis ces dernières années (l’agriculture et l’industrie), avec pour résultat principal une aggravation de la pauvreté à Sainte-Lucie malgré les bons résultats du secteur touristique devenu le pilier principal de l’économie de l’île.Dans ce contexte de faible croissance économique, le gouvernement et les partenaires sociaux se sont rassemblés pour identifier les politiques susceptibles d’accélérer la croissance économique de Sainte-Lucie. Ainsi, trois axes principaux ont été retenus : l’augmentation de la production locale, la réduction du crime et la réduction de la pauvreté. Dans ce dernier cadre, le gouvernement a lancé plusieurs stratégies de lutte contre la pauvreté notamment l’aide au développement d’activités touristiques.L’étude s’intéresse plus particulièrement au village d’Anse-la-Raye et à une expérience de tourisme pro-pauvre qui y a été développé en 2000 : l’Anse-la-Raye Seafood Friday, une sorte de festival qui permet aux visiteurs de déguster les produits de la mer tous les vendredis. Ce festival a-t-il eu réellement des répercussions sur la population pauvre de la communauté d’Anse-la-Raye ? Est-il viable? Quel est son devenir?
The objective of this study is to analyse the impacts and limitations of attempts to combat poverty using tourism through a case study in the village of Anse-la-Raye, in St. Lucia.Since its independence in 1979, St. Lucia has attempted to diversify the economic structure it inherited from its colonial past, in particular developing alternative sources of revenue. Initially there was some success with the clothing industry and tourism, which emerged as viable business activities outside of agricultural exports.At the end of the 1980s, the country had reached a growth which was considered reasonable. Of all the states of CARICOM, St. Lucia has moreover experienced the greatest economic growth. Banana exports have contributed significantly to these results, and new sectors have led to the creation of jobs and income to supplement export income.But like all Small Island Developing States (SIDS), St. Lucia is characterized by vulnerability to natural disasters and external economic shocks. Two major sectors of the economy have weakened in recent years (agriculture and industry), resulting in an increase in poverty in St. Lucia despite favourable outcomes in the tourism sector, which became the primary pillar of the island.In the context of low economic growth the government and social partners gathered together to identify policies and accelerate economic growth in St. Lucia. Three main themes were identified: Increasing local production; reducing crime and reducing poverty. In this context, the government launched several strategies to combat poverty including assistance for the development of tourism.The study focuses on the village of Anse-la-Raye and the experiences of pro-poor tourism that was developed in 2000: Anse-la-Raye Seafood Friday, a kind of festival that allows visitors to taste the seafood on Fridays. Has this festival really had an impact on the poor of the community of Anse-la-Raye? Is it viable? And what is its future?
Sainte-Lucie

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.6525
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/6525

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Juin 2003
Dans le contexte actuel de mondialisation, de changement climatique et de forte anthropisation de la biosphère, les Petites Antilles s'érigent en monde marginal ou encore en anti-monde. Fracturées du point de vue politique, économique, linguistique et à certains égards culturel, ces territoires insulaires du Bassin caraïbe recèlent de richesses environnementales (physiques, écosystèmiques et paysagères). Comme partout ailleurs dans le monde humanisé, la survie de ces sociétés implique le rétablissement des grands équilibres écologiques consubstantiels à une articulation efficiente entre le naturel, l'urbain et l'agricole. Compte tenu de la pression démographique, variable d'une île à l'autre, la pérennité des écosystèmes en covariance avec un développement économique profitant au plus grand nombre ne peut se concevoir à l'échelle insulaire. Il semble judicieux d'imaginer un développement à l'échelle de l'archipel basé sur la complémentarité, puisque au sein de chaque composante les diverses ressources biologiques terrestres et marines sont insuffisantes pour assurer une autosuffisance en termes de produits de premières nécessités et d'énergie. Le développement des Petites Antilles s'il doit être durable et prendre comme ossature les directives de Rio (Brésil, 1992) et de Johannesburg (Afrique du Sud, 2002), il devra s'inscrire dans une gestion administrative, scientifique, technique et agricole commune dans le cadre d'une Caraïbe fonctionnellement unifiée. A l'unité floristique, faunistique et biocénotique doivent correspondre des stratégies et donc des politiques, similaires mais diversifiées, d'utilisation des ressources abiotiques (énergie éolienne, hydroélectrique et photovoltaïque) et biotiques (écosystèmes terrestres et marins, flore, faune, sols). Malheureusement dans le présent, la compartimentation économique et politique de la Caraïbe rend ces propos profondément utopiques. Néanmoins dans le futur la survie des peuples des Petites Antilles, impliquera un développement durable signifié par des rapports équilibrés entre hommes et milieux.
–––––
In the nowadays context of "globalization", climatic variation and great anthropization of the biosphere, the Lesser Antilles appear as a marginal world. In a political point of view, those islands offer a greatly distinct and fractured image. The same fact can also be observed in an economic, linguistic and, in a certain measure, cultural perspective. Despite of such a statement, those territories of the Caribbean basin keep economic and landscape resources whom survival depends on the re-establishment of the great ecologic structures implying a productive articulation between the natural, the urban and the agricultural. It seems pertinent to imagine a development on the level of the archipelago based upon complementarity since each constituent presents a limited number of earth and marine biologic reserves which do not guarantee an autosubsistance in energy and first nessecity productivity. A lasting development of the Lesser Antilles supposes a necessary and commun administrative, scientific, technical and agricultural management within the setting of a Caribbean functionally unified. Facing the biocenotic unity, a useful strategy, based on a similar and diversified organization in the exploitation of biophisic resources, must be erected. Such statements could be considered as utopic, regarding the situation of politic and economic division in the Caribbean nowadays. However, in the future, the survival of those insular societies will imply a lasting development lying upon an efficient relationship between Man and environment.
https://halshs.archives-ouvertes.fr/halshs-00003054

Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess
halshs-00003054
https://halshs.archives-ouvertes.fr/halshs-00003054
https://halshs.archives-ouvertes.fr/halshs-00003054/document
https://halshs.archives-ouvertes.fr/halshs-00003054/file/Devpt-durable_JOSEPH-PHILIPPE.pdf

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
Traditional network generation models aim to replicate global structural properties observed on various real-world networks (power law degree distribution, short average distance, community structure, etc.) through synthetic link formation mechanisms such as triadic closure or preferential attachment. Nowadays the large amount of data available allows to study more precisely the link formation processes and to compare the models to real situations. In this work, we analyse the communication activities of the users of a mobile telephony operator for studying the link formation process. The communications emitted and received by users are strong indicators for understanding the underlying mechanisms of the link formation process and highlighting how user attributes correlate with the formation process in such a network. In a first study conducted at a global level we show that the traditional mechanisms commonly used in network generation models are not the main link formation mechanisms involved in this network. In a second study, we analyse more precisely the link formation process by searching for correlations between some user attributes and the formation of the new links. These results provide valuable guidelines to the design of more realistic generation models taking into account network structure and node attributes.
IEEE International Conference on Research Challenges in Information Science (RCIS)
Marrakesh, Morocco

hal-01312314
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01312314
DOI : 10.1109/RCIS.2014.6861065

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Although ants may induce community-wide effects via changes in physical habitats in terrestrial environments, their influence on aquatic communities living in plant-held waters remains largely underexplored. The neotropical tank-bromeliad Aechmea mertensii (Bromeliaceae) occurs along forest edges in ant-gardens initiated by Camponotus femoratus or by Pachycondyla goeldii. Its leaves form wells that hold rainwater and provide suitable habitats for many aquatic organisms. We postulated that these ant-plant mutualisms indirectly affect the microbial community structure via changes in the environmental conditions experienced by the plants. To test this hypothesis, we analyzed the protist communities from 63 tank-bromeliads associated with either C. femoratus or P. goeldii (hereafter Cf-Aechmea and Pg-Aechmea) along a forest edge in French Guiana. For each plant, a large number of environmental variables (including habitat structure, food resources, incident radiation and the presence of aquatic invertebrates) were quantified to determine their relative importance in driving any observed differences across ant-associated plants. Pg-Aechmea are located in sun-exposed areas and hold low volumes of water and low amounts of detritus, whereas Cf-Aechmea are located in partially shaded areas and accumulate higher amounts of water and detritus. Protists (i.e., protozoa and algae) inhabiting Cf-Aechmea exhibit greater richness and abundances than those in Pg-Aechmea. Variations in detritus content, number of leaves, incident radiation, and the epiphyte richness of the ant-garden were the main factors explaining the variation in protist richness. A shift in the functional group composition of protists between bromeliads tended by different ant species suggested that mutualistic ants indirectly mediate changes in the microbial food web.
ISSN: 1439-1791

hal-00817519
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00817519

Éditeur(s) : Université de la Méditerranée
Résumé : This study was supported by the Atlantic working site of the « Programme National d’Océanographie Côtière » (PNOC, PNEC since 1999). The objectives were (1) to check the existence and to understand the mechanisms of winter phytoplankton blooms in the bay of Biscay influenced by the Gironde waters (2) to determine the limiting nutrient of the primary production associated to these blooms and to follow the seasonal evolution of the limiting nutrient, (3) to understand the consequences of this early limitation on the structuration of algal populations in spring. Since phosphorus was supposed to be the major limiting nutrient of algal growth in the Gironde plume, the different forms of the phosphorus cycle as well as the bacterial compartment, central in this cycle, were also studied in term of stocks and fluxes. The sampling strategy consisted in three cruises in 1998, BIOMET 2 (January), BIOMET 3 (beginning of March), PEGASE (June) and six cruises in 1999, PLAGIA 1 to 6 (late February, late April, late May, late June, the middle of July and the beginning of October). Winter algal blooms, essentially diatoms, were actually observed both in the typical waters of the plume (S < 34.5) and at the limit of the plume and adjacent atlantic oceanic waters (S > 34.5) in the successives years 1998 and 1999. These blooms were initiated by the occurrence of short anticyclonic windows in winter, acting on physical processes which dominate the evolution and characteristics of the Gironde plume (runoff, wind direction and speed) and, ultimately, on the evolution of the depth of the mixed layer (haline stratification) and available light (decrease of turbidity). The algal growth was actually phosphorus limited in the typical waters of the plume at the end of the winter bloom, in spring and became nitrogen and phosphorus limited in summer until the first autumn gales restored the nutritive balance. More oceanic waters (S > 34.5) were probably N+P limited from the end of the winter-the beginning of spring to autumn. Phosphorus limitation of winter blooms, associated with girondine unbalanced nutritive supplies (high NO3/PO4 ratios) favoured the development of small cells at the beginning of spring and the later presence of spring blooms (June 1998, late May 1999) composed of pico and nanophytoplankton (nanoflagellates), instead of typical diatom spring blooms for temperate waters. This size reduction of algal communities is strongthened by the competition between phytoplankton and bacteria for the phosphate uptake, bacteria being more competitives at low concentrations and being phosphorus limited sometimes in spring. The decreasing size of algal cells probably acted on the structuration of the whole food web. The study of the different forms of phosphorus displayed the importance of the Dissolved Organic Phosphorus (DOP) pool. The potential biological lability and the capacity of algae and bacteria to use the DOP in spring when phosphate are undetectable was shown by the very high specific activities of alkaline phosphatases and the very rapid cycling of phosphate monoesters. According to the few estimations of actual phosphatasic activity and phosphate assimilation fluxes, the hydrolysis of DOP associated with the coupled assimilation of liberated phosphate would represent 91 to 99 % of the phosphorus fluxes into algal and bacterial cells when phosphate were exhausted. In such conditions DOP could satisfy most of microorganisms phosphorus needs.
Cette thèse s’inscrit dans le cadre du Chantier Atlantique du Programme National d’Océanographie Côtière (PNOC, PNEC depuis 1999). Les objectifs de ce travail étaient (1) de vérifier l’existence et comprendre le déterminisme de blooms phytoplanctoniques hivernaux dans les eaux du Golfe de Gascogne influencées par la Gironde, (2) de préciser le facteur limitant de la production primaire associée à ces blooms et de suivre l’évolution saisonnière de ce facteur et (3) de comprendre les conséquences de cette limitation précoce sur la structuration des populations algales au printemps. Le phosphore étant supposé être le principal élément limitant de la croissance algale dans le panache de la Gironde, les différentes composantes du cycle du phosphore ainsi que le compartiment bactérien, central dans ce cycle, ont été étudiés en terme de stock et de flux. La stratégie d’échantillonnage a consisté en trois campagnes en 1998, BIOMET 2 (janvier), BIOMET 3 (début mars), PEGASE (juin) et six campagnes en 1999, PLAGIA 1 à 6 (fin février, fin avril, fin mai, fin juin, mi-juillet et début octobre). Des efflorescences algales hivernales, constituées essentiellement de diatomées, ont effectivement été observées de façon récurrente dans les eaux typiques du panache (S < 34,5) et à la limite du panache et des eaux océaniques atlantiques adjacentes (S > 34,5) au cours des deux années successives 1998 et 1999. Ces blooms ont été engendrés par l’apparition de courtes fenêtres anticycloniques en période hivernale, ces fenêtres interférant sur les processus physiques qui prévalent sur l’évolution et les caractéristiques du panache de la Gironde (régime des débits, orientation et force du vent) et, de façon ultime, sur l’évolution de la profondeur de la couche de mélange (halostratification) et la disponibilité en lumière (diminution de la turbidité). La croissance algale était limitée par le phosphore dans les eaux typiques du panache à la fin du bloom hivernal, au printemps et devint limitée en azote et en phosphore en période estivale et ceci jusqu’à ce que les premières tempêtes automnales rétablissent l’équilibre nutritif des eaux. Les eaux à caractère plus océanique (S > 34,5) étaient plus probablement limitées par N+P dès la fin de l’hiverdébut du printemps et ce jusqu’à l’automne. La limitation des blooms hivernaux par le phosphore, associée à des apports nutritifs girondins déséquilibrés en phosphate (rapports NO3/PO4 élevés) a favorisé le développement de cellules de petite taille au début du printemps et la présence ultérieure de blooms printaniers (juin 1998, fin mai 1999) composés de pico- et de nanophytoplancton (nanoflagellés), blooms « atypiques » pour des eaux tempérées à cette saison. Cette structuration des communautés algales est renforcée par la compétition entre le phytoplancton et les bactéries pour l’acquisition du phosphate, les bactéries étant plus compétitives aux faibles teneurs en phosphate et pouvant être elles-mêmes limitées par le phosphore à certains moments du printemps. La diminution de taille des cellules algales a probablement une incidence sur la structure de taille de l’ensemble du réseau trophique. L’étude des différentes composantes du phosphore montre l’importance du pool de Phosphore Organique Dissous (POD), sa labilité biologique potentielle et la capacité des communautés algales et bactériennes à utiliser ce pool au printemps quand les phosphates sont indétectables (activités spécifiques des phosphatases alcalines très élevées, recyclage très rapide des monoesters de phosphate). Au vu des quelques estimations de l’activité phosphatasique réelle et des flux d’assimilation de phosphate, l’hydrolyse du POD associée à l’assimilation couplée du phosphate libéré représenterait 91 à 99 % des flux de phosphore vers les cellules algales et bactériennes, quand les phosphates du milieu sont déficients. Dans de telles conditions, le POD pourrait satisfaire l’essentiel des besoins des microorganismes en phosphore.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00013/12463/9298.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00013/12463/

Résumé : Les mattes de procaryotes constituent une niche écologique diversifiée. peu étudié!<..en mangrove et jamais décrjte dans les Antilles. L'objectif de cette thèse est de décrire les procaryotes filamenteux reposant sur le sédiment marin et de caractériser les interactions entre la matte, milieu et entre les différents micro-organismes. Nous avons d'abord caractérisé les micro-organismes majoritaires de la matte par le séquençage de l'ADNr 16S et des hybridations moléculaires (FISH). Il a ainsi été possible de décrire deux nouvelles espèces de Beggiatoaceae dont la structure a été étudiée par microscopie électronique. De plus, afin de caractériser l'environnement chimique de ces bactéries, des capteurs potentiométriques ont été utilisés. Ils ont permis de démontrer que les Beggiaotaceae oxydaient les sulfures en prélevant l'oxygène du milieu, tandis que des analyses de microscopie couplées à de l'EDX ont mis en évidence des réserves de soufre intracellulaires dans ces bactéries. Le séquençage de l'ADNr 16S des cyanobactéries filamenteuses a mis en évidence quatre nouvelles espèces de l'ord~e des Oscillatoriales. Deux d'entre elles, du genre Planktothricoides ont révélé une toxicité positive sur les Artemia sp:, les deux autres ont été identifiées comme proches d'Oscillatoria spongeliae, une espèce symbiotique d'éponge, bien que les coupes uItrafines d'une de ces souches aient montré une morphologie interne proche des Tychonema. L'analyse des données a permis d'étoffer les connaissances sur les communautés microbiennes de mangrove et constitue une base intéressante de travail sur la contribution des micro-organismes au fonctionnement de l'écosystème mangrove dans son ensemble
Procaryotic mats are ecological niches, occuring in many ecosystems. Those structures are little studied in marine mangrove sediment and have never been described in West Indies. The purpose ofthis thesis is to characterize the interactions between the mat and the environment, and between the different filamentous micro-organisms living into the mat. In a first place, we characterized the mainly micro-organisrns of the mat by sequencing 16S rDNA. We confirmed these sequences by molecular hybridization (FISH) with specific probes designed from sequences obtained. Thus, it was possible to describe two new Beggiatoaceae strains, whose structure has been studied by electronic microscopy. Furthemore, we used potentiometric captors in situ and in laboratory, by creating a mesocosm, in order to define the chemical environment where involved these bacteria. These experiences proved that the Beggiatoaceae of the mat oxidized the sulfur taking the oxygen from the medium, while the microscopic analysis coupled with EDX showed intracellular sulfur granules into the bacteria. The study of the filamentous cyanobacteria of the mat highlighted four new cyanobacteria strains, all studied by electronic rmcroscopy. Two of them belongs to Planktothrlcoides genus and showed positive toxicity on Artemia salina. The others species are close to Oscillatorla spongeliae, a sponge symbiont, nevertheless, one ofthem showed an intemal morphology close to Tychonema. The analysis of the different results adduces sorne knowledge about mangrove microbial communities. Furthermore, this study can be used as an interesting base to study the micro-organisms contribution in functioning mangrove ecosystem

http://www.theses.fr/2013AGUY0614/document

Éditeur(s) : Elsevier
Résumé : We report on a multidisciplinary study of cold seeps explored in the Central Nile deep-sea fan of the Egyptian margin. Our approach combines in situ seafloor observation, geophysics, sedimentological data, measurement of bottom-water methane anomalies, pore-water and sediment geochemistry, and Th-230/U dating of authigenic carbonates. Two areas were investigated, which correspond to different sedimentary provinces. The lower slope, at similar to 2100 m water depth, indicates deformation of sediments by gravitational processes, exhibiting slope-parallel elongated ridges and seafloor depressions. In contrast, the middle slope, at similar to 1650 m water depth, exhibits a series of debris-flow deposits not remobilized by post-depositional gravity processes. Significant differences exist between fluid-escape structures from the two studied areas. At the lower slope, methane anomalies were detected in bottom-waters above the depressions, whereas the adjacent ridges show a frequent coverage of fractured carbonate pavements associated with chemosynthetic vent communities. Carbonate U/Th age dates (similar to 8 kyr BP), pore-water sulphate and solid phase sediment data suggest that seepage activity at those carbonate ridges has decreased over the recent past. In contrast, large (similar to 1 km(2)) carbonate-paved areas were discovered in the middle slope, with U/Th isotope evidence for ongoing carbonate precipitation during the Late Holocene (since similar to 5 kyr BP at least). Our results suggest that fluid venting is closely related to sediment deformation in the Central Nile margin. It is proposed that slope instability leads to focused fluid flow in the lower slope and exposure of 'fossil' carbonate ridges, whereas pervasive diffuse flow prevails at the unfailed middle slope.
Marine Geology (0025-3227) (Elsevier), 2009-06 , Vol. 261 , N. 1-4 , P. 92-104

Droits : 2009 Elsevier B.V. All rights reserved.
http://archimer.ifremer.fr/doc/2009/publication-6586.pdf
DOI:10.1016/j.margeo.2008.10.008
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6586/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé :   Diplôme : DEA
il s'agit d'un type de produit dont les métadonnées ne correspondent pas aux métadonnées attendues dans les autres types de produit : DISSERTATION
As part of a programme of degraded soils rehabilitation, and in order to follow the biological processes connected with the soils reconstitution, it is a requisite to determine indicators able to account for the evolution of the soil. These indicators can he found on structural and/or functional characteristics of the bacterial communities, such as soil respiration, denitrification or genetic diversity. Theses descriptors are able to characterize the global community or targeted communities chosen for their importance in the ecosystem functioning. In this work, we tried to know whether soil bacteria genetic diversity was able to be a relevant indicator of the soil evolution in a rehabilitated sequence. This diversity is apprehended via a molecular technique: ARISA. A chronosequence situated on a gold mine, already experimented as part of a programme of degraded zones rehabilitation, was at our disposal. Results show that ARISA is a very sensitive technique, able to account for the bacterial community heterogeneity in a soil but unable, at the parcel scale, to discriminate the treatments nor to account for the evolution in lime of planted treatments. Lastly, the advantage of this indicator of genetic diversity may arise from its confrontation to other indicators (functional, for example).
Dans le cadre de la revégétalisation d'un sol dégradé et afin de pouvoir suivre les processus biologiques liés à la reconstitution des sols, il est nécessaire de déterminer des indicateurs pouvant rendre compte de l'évolution de l'état du sol. Ces indicateurs peuvent être fondés sur des caractéristiques fonctionnelles et/ou structurales des communautés bactériennes telles que la respiration, la dénitrification ou la diversité génétique. Ces descripteurs peuvent analyser la communauté globale ou des communautés cibles choisies pour leur importance dans le fonctionnement de l'écosystème. L'objectif de ce stage était de savoir si la diversité génétique des bactéries du sol pouvait être un indicateur de l'évolution des sols au sein d'une séquence de revégétalisation. Cette diversité est appréhendée par une technique de biologie moléculaire : l'ARISA. On dispose d'une chronoséquence située sur une mine d'or étudiée dans le cadre d'un programme de réhabilitation des zones dégradées. Les résultats montrent que l'ARISA est une technique très sensible, qui rend bien compte de l’hétérogénéité des communautés bactériennes présentes dans un sol mais est incapable, à l’échelle de la parcelle, de discriminer ni les traitements ni de rendre compte de l'évolution dans le temps de ces parcelles. Enfin, l'intérêt de cet indicateur de diversité génétique pourra résulter de sa confrontation avec d'autres indicateurs (fonctionnels par exemple).
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189155

hal-01189155
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189155
PRODINRA : 9464

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : Comme dans d’autres régions du monde, la croissance démographique et l’aménagement côtier sur le littoral acadien au Nouveau-Brunswick contribuent à une plus grande vulnérabilité et à la détérioration des espaces côtiers et environnements littoraux. L’élévation du niveau marin et les effets des changements climatiques rendent les côtes du Nouveau-Brunswick extrêmement sensibles et entrainent des impacts de plus en plus importants. Ainsi, l’adaptation aux changements climatiques constitue un enjeu de taille pour la province.Nous décrivons ici les résultats d’une étude comparative sur les expériences et les stratégies d’adaptation de deux communautés côtières, les communautés de Cocagne - Grande Digue et de Beaubassin-Est - Cap Pelé. Les deux territoires ont en commun d’avoir des littoraux convoités par le tourisme et le secteur immobilier. Des entretiens semi-dirigés et des groupes de discussion (focus groups) ont permis d’obtenir des informations sur les thématiques suivantes : l’expérience des modifications environnementales, les mesures d’adaptation initiées individuellement ou collectivement, les réactions et les besoins futurs. Les résultats de l’étude mettent en évidence l’enchâssement des aspects économiques et sociétaux dans les enjeux environnementaux et le rôle des représentations et des acteurs qui déterminent le niveau de mobilisation. Enfin, le projet souligne l’importance d’une coordination entre les différentes échelles de gouvernance.
As in other parts of the world, population growth and coastal planning on New Brunswick’s Acadian coastline are contributing to greater vulnerability and deterioration of the natural environment. The rise in sea level and the effects of climate change make the coasts of New Brunswick extremely sensitive, leading to impacts that are increasingly larger. Thus, adaptation to climate change is a major challenge for the province.Here, we describe the results of a comparative study of the experiences and coping strategies of two coastal communities: Cocagne – Grande-Digue and Beaubassin East – Cap-Pelé. Both these territories attract tourism and real estate investors. Semi-structured interviews and focus groups were used to obtain information on the following topics: the experience of environmental change, adaptation measures initiated individually or collectively, reactions and future needs. Results of the study highlight the entrenchment of economic and societal aspects of environmental issues and the role of representations and stakeholders that determine the level of mobilization. Finally, the project emphasizes the importance of coordination between the different levels of governance.
Acadie
Nouveau-Brunswick

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.6663
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/6663

Éditeur(s) : HAL CCSD Taylor & Francis (Routledge)
Résumé : International audience
The Maroni basin, an isolated region delineating the border between Suriname and French Guiana has been affected by the human immunodeficiency virus (HIV) epidemic 10 years after coastal French Guiana. However, the rise in HIV prevalence was sharp, exceeding 1% within 10 years. The aim of the present study is to compare, using the first quantitative data from the general population in remote villages, the knowledge, attitudes, and behaviors regarding HIV between Maroon and Amerindian populations, the two most frequent populations living along the Maroni. Data were collected in 2012 using a structured questionnaire among a random sample of 896 individuals residing in the remote villages on the Maroni river. Proportions were compared between the Maroni and the coastal general population, and between Maroon and Amerindian populations. The present study shows significant differences between territories and between communities living on the Maroni river: the multiple sexual partnerships, more common among population living on the Maroni river, were more frequently reported in Maroons than in Amerindians. Condom use was more frequently reported among men on the Maroni river than on the coast, but these findings were reversed for women. Moreover, among people living on the Maroni river, condom use was more frequently reported among Maroons than among Amerindians. Regarding genital factors that may affect transmission, penile implant seemed to have no ethnic boundaries, steam baths seemed specific to Maroon women. The present results should help to improve community-based specific interventions.
ISSN: 0954-0121

hal-01260915
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01260915
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01260915/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01260915/file/2015%2C%20Van%20Melle%20-%20Knowledge%2C%20attitudes%2C%20behaviors%2C%20and%20practices%20differences%20regarding%20HIV.pdf
DOI : 10.1080/09540121.2015.1032203

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : En dehors de l’école et de la famille, d’autres lieux permettent aux jeunes d’apprendre au contact des adultes : c’est ce qu’on appelle les tiers-lieux éducatifs. Les églises de la communauté haïtienne de la Martinique relèvent selon nous de cette catégorie. En effet, cette diaspora se retrouve dans des ecclésioles — véritables entreprises à la tête desquelles se trouvent des pasteurs (autoproclamés) issus de la communauté exilée — qui prennent en charge sa progéniture et l’aident à s’intégrer dans la société martiniquaise. Dans cet article, nous entendons démontrer cette fonction éducative de ces lieux de rassemblement de la communauté haïtiano-martiniquaise. À l’instar d’autres communautés évangéliques autochtones nous avons posé cette hypothèse explicative que nous avons vérifiée. Une fonction que ne rempliraient pas en revanche les rares temples vaudous de l’île à la tête desquels se trouvent des fils de Toussaint Louverture.
Outside regular school and family structures, the youth are exposed to other environments that allow them to learn from adults. This is referred to as “tiers-lieu éducatif” or "third-place education". Churches in Haitian communities in Martinique emerge, in our opinion, from this experience. In fact, the Haitian Diaspora is concentrated in areas that contain small ecclesiastical strongholds, enterprises led by self-acclaimed pastors who originate from the exiled community, assuming responsibility for their progeny, and thus helping them to integrate in the society. This article highlights the function of Education in these areas highly populated by Haitians. Following the example of the native Evangelical Communities, we have formulated the explanatory hypothesis that we have verified: A function that does not fulfil, on the other hand, the few voodoo temples on the island, led by the sons of Toussaint Louverture. 
Martinique

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.4600
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/4600

Éditeur(s) : HAL CCSD Inter-Research
Résumé : International audience
Ecological connectivity is important for effective marine planning and biodiversity conservation. Our aim was to identify factors important in influencing variation in benthic community structure on shallow rocky reefs in 2 regions of the Mediterranean Sea with contrasting oceanographic regimes. We assessed beta (β) diversity at 146 sites in the littoral and shallow sub-littoral from the Adriatic/Ionian Seas (eastern region) and Ligurian/Tyrrhenian Seas (western region) using a null modelling approach to account for variation in species richness. The distance decay relationship between species turnover within each region and geographic distance by sea was determined using generalised linear models. Mantel tests were used to examine correlations between β diversity and connectivity by ocean currents, estimated from Lagrangian dispersal simulations. Variation in β diversity between sites was partitioned according to environmental and spatial components using a distance-based redundancy approach. Species turnover along a gradient of geographic distance was greater by a factor of 3 to 5 in the western region than the eastern region, suggesting lower con-nectivity between sites. β diversity was correlated with connectivity by ocean currents at both depths in the eastern region but not in the western region. The influence of spatial and environmental predictors of β diversity varied considerably between regions, but was similar between depths. Our results highlight the interaction of oceanographic, spatial and environmental processes influencing benthic marine β diversity. Persistent currents in the eastern region may be responsible for lower observed β diversity compared to the western region, where patterns of water circulation are more variable.
Marine Ecology Progress Series

Droits : http://creativecommons.org/licenses/by/
hal-01357935
https://hal-univ-perp.archives-ouvertes.fr/hal-01357935
https://hal-univ-perp.archives-ouvertes.fr/hal-01357935/document
https://hal-univ-perp.archives-ouvertes.fr/hal-01357935/file/m553p001.pdf
DOI : 10.3354/meps11783

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : For ecology scientists, spatial statistics are a set of tools allowing characterization of the structure of a point set, for instance a map of trees in a forest plot. This structure is defined implicitly as a departure from complete spatial randomness (CSR), the result of a Poisson point process. Inhomogeneity of the process and non-independence of points are its causes. As they cannot be disentangled by analyzing the data, so-called "spatial concentration" or "aggregation" (evenness due to repulsion also exists but is actually rare) usually concerns non-independence while intensity is assumed as known. The literature of point processes and measures of spatial structures is reviewed to clarify concepts and choices. The purpose of this thesis was to produce methodological enhancements. Its main results are: * A test for the most used statistic, Ripley's K function, against the null hypothesis of CSR. It can replace Monte-Carlo simulations used until now in the literature. * An extension of K to inhomogeneous processes, within a typology of available statistics (absolute, relative and topographic measures). When data is available as number of objects per zones (say a number of tree in each forest plot) rather than their exact position, information theory is used to define a general framework allowing to characterize spatial structure (of species) and diversity (of plots) as two aspects of a single measure of inequality. This framework is applied to Shannon's index of biodiversity to derive a self-sufficient definition of beta diversity, its calculation independently from the difference between gamma and alpha diversity, and a statistical test of significance against the null hypothesis that plots are samples of the same community. The way is paved for other applications to measures of diversity and spatial structures. As a conclusion, it appears clear that pattern characterization tools are a first step to deal with ecological questionings. Their development is still a matter of research. Yet, they are far from sufficient to address ecological processes as point processes ignore the temporal aspect of object locations.
Les statistiques spatiales sont pour les écologues un ensemble d'outils permettant de caractériser la structure d'un semis de points, par exemple une carte représentant des emplacements des arbres dans une parcelle de forêt. Cette structure est définie implicitement comme un écart à semis complètement aléatoire, résultat d'un processus de Poisson. L'hétérogénéité du processus ponctuel dont le semis de points est une réalisation et la non-indépendance des points en sont les causes indiscernables, ce qui amène généralement à supposer l'intensité du processus connu et nommer " concentration spatiale " ou " agrégation " (la régularité spatiale est possible, mais rare en pratique) la non-indépendance. Une revue de la littérature des processus ponctuels et des mesures de structures spatiales est fournie pour clarifier les concepts et les choix. L'objectif de ce travail de thèse était de produire des améliorations méthodologiques. Ses résultats principaux sont : * L'établissement d'un test pour la principale statistique utilisée, la fonction K de Ripley, permettant de s'affranchir de la méthode de Monte-Carlo utilisée dans la littérature pour rejeter l'hypothèse nulle d'un processus complètement aléatoire. * L'extension de K aux processus hétérogènes, dans le cadre d'une typologie claire des statistiques (absolues, relatives, topographiques). Lorsque la position exacte des objets n'est pas connue, mais que des effectifs par zone sont disponibles (par exemple des nombres d'arbres par parcelle), la théorie de l'information est utilisée pour définir un cadre général permettant de caractériser la structure spatiale (des espèces dans les parcelles) et la diversité (des parcelles, en termes d'espèces) comme deux aspects d'une même mesure d'inégalité. Ce cadre est appliqué à l'indice de biodiversité de Shannon pour définir clairement la mesure de diversité bêta, son calcul direct indépendamment de la différence entre diversités gamma et alpha, et fournir un test statistique de non nullité. La voie est ouverte pour l'application à d'autres mesures de diversité et de structure spatiale. En conclusion, il semble clair que ces outils de caractérisation sont un premier pas pour traiter les questions écologiques, leur développement étant toujours du domaine de la recherche. Ils sont cependant très insuffisants pour répondre à des questions liées aux processus écologiques, assez éloignés des processus ponctuels qui ignorent l'aspect temporel de l'installation des objets.
https://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00540327

NNT : 2010AGPT0075
pastel-00540327
https://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00540327
https://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00540327/document
https://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00540327/file/13_Marcon2010.pdf

Éditeur(s) : Elsevier Science Bv
Résumé : During the Echolag cruise (13 February-8 March 2007), the effect of 16-30 knot trade winds on abundance, community structure and dynamics of phytoplankton was investigated in the southern part of the New Caledonian coral reefs and surrounding oceanic waters. In this area, the coral reefs form two horn-like structures (hereinafter referred to as 'horn reefs'), oriented south-east, and separated by a relatively deep valley. Three repeated samplings at one week intervals of a 32 station array showed that trade winds induce surface water cooling and significant enrichment of mid- and bottom waters above the reef shelf. This enrichment appeared as the result of a general rise of the oceanic thermocline and nitracline due to the combination of trade winds and tidally-generated internal waves between the horn reefs. It was accompanied by a factor of 1.5 and 2.3 mean increase for the chlorophyll concentration and picoplankton-nanoplankton cell number, respectively. From diel variations of in vivo chlorophyll a fluorescence and hourly sampling, phytoplankton gross growth rate was estimated to be 1-1.35 divisions per day and was quasi balanced with phytoplankton mortality for a 24 h period.
Journal Of Marine Systems (0924-7963) (Elsevier Science Bv), 2010-09 , Vol. 82 , N. 4 , P. 230-244

Droits : 2010 Elsevier B.V. All rights reserved.
http://archimer.ifremer.fr/doc/00013/12437/9258.pdf
DOI:10.1016/j.jmarsys.2010.05.010
http://archimer.ifremer.fr/doc/00013/12437/