Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Transposable elements play a major role in the evolution of eukaryotic genomes. Knowing the distribution of transposable elements between different species within the same taxon is essential to study their dynamics and to better understand their role in the evolution of species. Given their abundance, species diversity and living environment, crustaceans are an excellent model for studying comparative genomics of retrotransposons. It is notably in the squat lobsters that the GalEa clade of Superfamily Copia was defined. We studied the distribution of two well-known LTR retrotransposons superfamilies: Gypsy and Copia, in crustaceans. By combining PCRs with degenerate primers and in silico analysis, we identified 35 families of Copia retrotransposons and 46 families of Gypsy retrotransposons in 15 and 18 species of crustaceans (mainly Malacostraca: crabs, shrimp, krill ...). These elements have different distribution and diversity in crustaceans. Gypsy elements appear relatively commonly and diverse in all species. Conversely, the Copia elements seem rare, and consequently more difficult to detect, and are largely dominated by the elements of the clade GalEa. These results suggest two different dynamic strategies for retrotransposons Gypsy (the Red Queen theory) and retrotransposons GalEa (‘domino days spreading’ branching process). In addition, GalEa elements present a great evolutionary success being widely distributed in many branches of metazoans. They are also present in certain red algae and we have also detected them in Fungi. Taking advantage of the large amount of available genomic data, we have studied the distribution of GalEa elements of Fungi, in order to compare it with the results obtained in crustaceans. In fact, they appear only in a large phylum of Ascomycetes, in Pezizomycotina, and they form a monophyletic group within the GalEa. Finally, in the Fungi, the GalEa elements are not majority among Copia retrotransposons. We have therefore initiated a new study in molluscs, to define if the results obtained in crustaceans are a feature of GalEa elements, Malacostraca or metazoans.
Les éléments transposables jouent un rôle majeur dans l’évolution des génomes eucaryotes. La connaissance de la distribution des éléments transposables entre différentes espèces au sein d’un même taxon est une condition essentielle pour étudier leur dynamique et mieux comprendre leur rôle dans l'évolution des espèces. Compte tenu de leur abondance, de leur diversité spécifique et de milieu de vie, les crustacés sont un excellent modèle pour étudier la génomique comparative des rétrotransposons. C’est notamment chez les Galathées qu’a été défini le clade GalEa des éléments de la superfamille des Copia. Nous avons étudié la distribution de deux superfamilles de rétrotransposons à LTR bien connus: les Gypsy et les Copia, au sein des crustacés. En combinant des PCRs avec amorces dégénérées et des analyses in silico, nous avons identifié 35 familles de rétrotransposons Copia et 46 familles de rétrotransposons Gypsy dans respectivement 15 et 18 espèces de crustacés (principalement des malacostracés : crabes, crevettes, krill...). Ces éléments présentent une distribution et une diversité différentes au sein des crustacés. Les éléments Gypsy apparaissent relativement fréquents et diversifiés dans toutes les espèces. A l’inverse, les éléments Copia semblent rares, donc difficilement détectables, et sont largement dominés par les éléments du clade GalEa. Ces résultats suggèrent deux stratégies différentes de dynamique pour les rétrotransposons Gypsy (théorie de la Reine Rouge) et les rétrotransposons GalEa (‘domino days spreading’ branching process). De plus, les éléments GalEa présentent un grand succès évolutif en étant largement distribués dans de nombreuses branches de métazoaires. Ils sont aussi présents chez quelques algues rouges et nous en avons également détecté chez des Fungi. Profitant des nombreuses données génomiques disponibles, nous avons donc étudié la distribution des éléments GalEa de Fungi, dans le but de comparer celle-ci aux résultats obtenus chez les crustacés. En fait, ils n’apparaissent qu’au sein d’un grand embranchement d’ascomycètes, les Pezizomycotina, et ils forment un groupe monophylétique au sein des GalEa. Enfin, chez les Fungi, les éléments GalEa ne sont pas majoritaire parmi les rétrotransposons Copia. Nous avons donc initié une nouvelle étude chez les mollusques, afin de définir si les résultats obtenus chez les crustacés sont une caractéristique des éléments GalEa, des malacostracés ou des métazoaires.
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01132413

NNT : 2015PA066017
tel-01132413
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Éditeur(s) : Elsevier
Résumé : Phosphorus forms with respect to sediment characteristics, such as grain-size, and major chemical elements, were studied in French coastal marine areas (the Bay of Seine and the Loire and Gironde Estuaries).In the three areas, Fe/Al-bound phosphate (Fe/Al-P) and exchangeable phosphate (exch-P) were significantly related to the proportion of fine fraction (< 63 mum). The special association of these forms with fine particles, as well as the relationships between exch-P, Fe/Al-P and Fe showed that adsorption processes on Fe oxides had taken place. However, for similar Fe concentrations, Bay of Seine sediments showed Fe/Al-P concentrations which were four to five times higher than those found in the Loire and Gironde Estuaries. This was attributed to differences in sediment nature and processes in these two types of areas. Indeed, the Loire and Gironde Estuaries frequently show hypoxia.Calcium-bound phosphate (Ca-P) was found in all grain size classes with comparable concentrations in the Bay of Seine where there was no correlation between Ca-P and Ca. This corresponded to the calcium's marine origin (shells) in the Bay of Seine. In contrast, the correlation of Ca-P with Ca and the fine fraction of the sediment in the Loire and Gironde Estuaries was characteristic of the predominant metamorphic origin of Ca-P in these areas.Useful information for interpretation of P-forms can be obtained from major sediment characteristics. Thus, for areas where specific relationships have previously been established good estimates of P-forms could be predicted from sediment properties.
Estuarine, Coastal and Shelf Science (0272-7714) (Elsevier), 2001-05 , Vol. 52 , N. 5 , P. 617-629

Droits : 2001 Academic Press. All rights reserved
http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/publication-469.pdf
DOI:10.1006/ecss.2001.0766
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/469/

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
We present new groundmass K–Ar ages obtained using the Cassignol–Gillot technique, together with whole-rock major and trace elements, from Les Saintes islands (Terre-de-Haut and Terre-de-Bas). They are located along the northern Lesser Antilles inner arc, between Basse-Terre Island (western Guadeloupe) to the North and Dominica Island to the South. Ages reveal that the main volcanic phase in Terre-de-Haut occurred between 2.98 ± 0.04 and 2.00 ± 0.03 Ma, and show that the onset of sub-aerial volcanism in Terre-de-Haut is slightly older (~ 0.2 Myr) than that of northern Basse-Terre. Volcanism in Les Saintes resumed to the west, with the rapid construction of Terre-de-Bas Island at 0.888 ± 0.009 Ma. Major elements analyses show that most lavas from Les Saintes belong to a sub-alkaline medium-K magmatic series and are mainly andesites, with relatively rare basaltic andesites and dacites. Rare earth elements spectra reveal a strong enrichment in light elements, as observed for Dominica lavas, and significantly higher than observed for Basse-Terre lavas. Noticeably, Terre-de-Bas spectra display more enriched patterns relative to those from Terre-de-Haut lavas, suggesting a lower degree of partial melting or a stronger sedimentary component incorporated to the subducting slab. Overall, geochemical signatures of Les Saintes and Dominica magmas display common characteristics, which we interpret as reflecting strong petrogenetic affinities, while both are significantly different from that of Basse-Terre lavas. Finally, this study provides a precise timing of subaerial volcanism of Les Saintes Islands, which can be used to better constrain through time the development of the tectonic half-graben where these islands lie, which is part of the arc-parallel en-echelon faults system accommodating the oblique convergence of the North American plate from Montserrat to Dominica. In addition, these results reveal that the initiation of Terre-de-Haut volcanism is presently the oldest dated volcanism from the northern part of the Lesser Antilles active arc.
ISSN: 0377-0273

hal-01067336
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01067336

Éditeur(s) : HAL CCSD Oxford University Press (OUP): Policy B - Oxford Open Option A Oxford University Press (OUP)
Résumé : International audience
Peridotite xenoliths exhumed by Quaternary alkaline magmatism in the Tahalgha district, southern Hoggar, represent fragments of the subcontinental lithospheric mantle beneath the boundary between the two major structural domains of the Tuareg Shield: the ‘Polycyclic Central Hoggar’ to the east and the ‘Western Hoggar’, or ‘Pharusian Belt’, to the west. Samples were collected from volcanic centres located on both sides of a major lithospheric shear zone at 4°35' separating these two domains. Although showing substantial variations in their deformation microstructures, equilibrium temperatures and modal and chemical compositions, the studied samples do not display any systematic changes of these features across the 4°35' fault. The observed variations rather record small-scale heterogeneities distributed throughout the study area and reflecting the widespread occurrence of vein conduits and metasomatized wall-rocks related to trans-lithospheric melt circulation during the Cenozoic. These features include partial annealing of pre-existing deformation microstructures, post-deformation metasomatic reactions, and trace-element enrichment, coupled with heating from 750–900°C (low-temperature lherzolites) to 900–1150°C (intermediate-T lherzolites and high-T harzburgites and wehrlites). Trace-element modelling confirms that the range of rare earth element (REE) variations observed in the Tahalgha clinopyroxenes may be accounted for by reactive porous flow involving a single stage of basaltic melt infiltration into a light REE (LREE)-depleted protolith. Whole-rock compositions record the final entrapment of disequilibrium metasomatic melts upon thermal relaxation of the veins–wall-rock system. The striking correlations between equilibrium temperatures and trace-element enrichment favor a scenario in which the high-temperature peridotites record advective heat transport along melt conduits, whereas the intermediate- and low-temperature lherzolites reflect conductive heating of the host Mechanical Boundary Layer. This indicates that the lithosphere did not reach thermal equilibrium, suggesting that the inferred heating event was transient and was rapidly erased by thermal relaxation down to the relatively low-temperature present-day geotherm. The low-T (<900°C) deformed lherzolites (porphyroclastic to equigranular) are characterized by only incipient annealing and LREE-depleted clinopyroxene compositions. They were only weakly affected by the Cenozoic events and could represent relatively well-preserved samples from rejuvenated Pan-African lithosphere. Extensive lithospheric rejuvenation occurred either regionally during the Pan-African orogeny, as a result of lithospheric delamination or thermomechanical erosion after thickening, or more locally along the meridional shear zones. The low-T Tahalgha lherzolites are comparable with lherzolites from Etang de Lherz, southern France, interpreted as lithospheric mantle rejuvenated by melt-induced refertilization during a late stage of the Variscan orogeny.
ISSN: 0022-3530

hal-01107410
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01107410
DOI : 10.1093/petrology/egu056

Résumé : The availability in interesting sites and the zootechnical performances of tropical fish are two impo rt ant assets in favor of the development of fish farming in the Caribbean islands. This repor presents a technical and financial analysis of red drum farming projects in floating cages in Martinique(French West Indies). This project analysis makes it possible to compare the economic feasability of a small-scale production system with that of a semi-industrial one submitted to different technical constraints. The main criteria of the project analysis are the profitability of the funded capital, the financial feasability during the buildup period, the profitability at a steady state and the cost price. Production costs are hi gher in the the small-scale enterprises than in the semi-industrial ones, thanks to better capita] productivity and better labour productivity. An analysis of sensitivity to the variations ofbiological and economical parameters is also contained in the report. The results of these studies indicate that Caribbean fish farming could be profitable, due to the rapid buildup of the facilities and to the short production cycles. Nevertheless, attention should be paid to the risk of storms and hurricanes in this part of the world. Moreover, the analysis of sensitivity highlights the great influence of seed price. [NOT CONTROLLED OCR]
Les bonnes performances zootechniques des poissons tropicaux et la disponibilité en sites propices sont deux atouts majeurs favorables au développement de l'aquaculture de poissons dans les îles des Caraïbes. Ce rapport présente l'adaptation d'un outil de simulation technico- économique à l'éleva ge de l'ombrine en cages flottantes dans le contexte martiniquais. Cet outil permet de disposer d'éléments de comparaison sur la faisabilité de deux systèmes de production, Fun de type artisanal et l'autre de type semi- industriel, soumis à des contraintes techniquesdifférentes : rentabilité du capital investi, faisabilité financière au démarrage, rentabilité en année de routine, prix de revient. Une analyse de sensibilité des résultats aux variations de paramètres biologiques et économiques est également présentée. L'analyse de ces projets fait apparaître une rentabilité satisfaisante de l'activité, liée à la rapidité de mise en route des installations et à la brièveté des cycles de production. Line grande attention doit être cependant portée sur les risques d'accidents climatiques fréquents dans cette région du globe (cyclone, mais aussi tempête...). L'analyse de sensibilité montre la grande influence du prix d'achat de l'alevin, en particulier sur les résultats de la variante artisanale, dont le coût de production de l'ombrine rendue à quai, est plus élevé que celui de la variante semi- industrielle. [OCR NON CONTRÔLE]

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1996/rapport-4019.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4019/

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Predicting the impact of underground engineering on the environment requires the knowledge of natural media at different scales. In particular, understanding basic phenomena controlling the properties of rocks in the presence of complex fluids necessitates a detailed atomic description of the solid/fluid/solid contacts, the subject of Part I of the present study. First, building the solid interspace between two different crystals in a non-periodic situation is achieved using the ab initio and molecular mechanics code GenMol (TM). A description of the fluid confined within the interspace is then derived from the original genetic iterative multi-species (GIMS) algorithm implemented in the same code. This approach consists of equilibrating chemical potentials, cycle after cycle and species after species, between the confined fluid and the free natural fluid. An elementary iteration for a species k consists of different steps incrementing the number N-k of particles k, with other numbers N-k remaining constant. At each step, an optimum fluid composition is obtained by a genetic process distributing the fluid particles on a grid by stochastic shots, followed in fine by a refining process. The effectiveness of the GIMS approach is demonstrated in the case study of a fluid confined between two (0 0 1) kaolinite faces, with apertures h varying between 4 and 10 A. connected to a 9-species external solution [H2O, Cl-, Na+ CO2(aq), NaCl(aq), Ca2+, Mg2+, HCO3-, H3O+] where concentrations are ranging from 55 to 10(-4) mol/L. The results show a drastic variation in the solute/solvent and cations/ions ratios in the confined fluid when aperture h is lowered to less than 1 nm. These results obtained with a very rapid convergence of the iterative algorithm combined with a very competitive genetic optimizer are validated with high precision on a free solution. This description of contacts between crystals is original and unattainable by standard crystal interface approaches. It opens the way to understanding and/or predicting phenomena between crystals in a complex natural environment, such as adhesion or repulsion investigated in the Part II of this study.
ISSN: 0022-0248

hal-00544569
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00544569
DOI : 10.1016/j.jcrysgro.2010.08.009

Éditeur(s) : HAL CCSD Société Géologique de France
Résumé : International audience
The seaward extension of onshore formations and structures were previously almost unknown in Provence. The interpretation of 2D high-resolution marine seismic profiles together with the integration of sea-bottom rock samples provides new insights into the stratigraphic, structural and paleogeographic framework of pre-Messinian Salinity Crisis (MSC) deposits of the Provence continental shelf. Seven post-Jurassic seismic units have been identified on seismic profiles, mapped throughout the offshore Provence area and correlated with the onshore series. The studied marine surface and sub-surface database provided new insights into the mid and late Cretaceous paleogeography and structural framework as well as into the syn-and post-rift deformation in Provence. Thick (up to 2000 m) Aptian-Albian series whose deposition is controlled by E-W-trending faults are evidenced offshore. The occurrence and location of the Upper Cretaceous South-Provence basin is confirmed by the thick (up to 1500 m) basinal series downlaping the Aptian-Albian unit. This basin was fed in terrigenous sediments by a southern massif (" Massif Méridional ") whose present-day relict is the Paleozoic basement and its sedimentary cover from the Sicié imbricate. In the bay of Marseille, thick syn-rift (Rupelian to Aquitanian) deposition occurred (>1000 m). During the rifting phase, syn-sedimentary deformations consist of dominant N040 to N060 sub-vertical faults with a normal component and N050 drag-synclines and anticlines. The syn-rift and early post-rift units (Rupelian to early Burdigalian) are deformed and form a set of E-W-trending en echelon folds that may result from sinistral strike-slip reactivation of N040 to N060 normal faults during a N-S com-pressive phase of early-to-mid Burdigalian age (18-20 Ma). Finally, minor fault reactivation and local folding affect post-rift deposits within a N160-trending corridor localized south of La Couronne, and could result from a later, post-Burdigalian and pre-Pliocene compressive phase.
Cadre tectonostratigraphique des formations anté-pliocènes du plateau continental de Provence (golfe du Lion oriental, SE France) Mots-clés. – Géologie marine, Tectonostratigraphie, Stratigraphie sismique, Paléogéographie crétacée, Rifting oligo-miocène, Compression post-rift Résumé. – Le prolongement en mer des formations et des structures provençales était jusqu'alors largement inconnu.L'interprétation de profils de sismique-réflexion marine 2D et l'intégration de dragages et carottages du fond-marin ont permis d'apporter des éléments nouveaux concernant le cadre stratigraphique, structural et paléogéographique des dé-pôts anté-Messiniens du plateau continental de Provence. Sept unités sismiques post-jurassiques ont été identifiées sur les profils sismiques, cartographiées à travers le plateau continental et corrélées avec les séries affleurant à terre. Une épaisse unité apto-albienne (jusqu'à 2000 m) dont le dépôt est contrôlé par des failles E-W a été mise en évidence en mer. L'existence d'un bassin subsident au Crétacé supérieur sur le plateau continental de Provence a été confirmée par le développement d'une épaisse série de bassin (jusqu'à 1500 m) reposant en downlap sur l'Apto-Albien. Le socle mé-tamorphique de l'écaille de Sicié et sa couverture sédimentaire peut être considéré comme une relique allochtone du « Massif Méridional » ayant alimenté le Bassin sud-provençal en éléments terrigènes au Crétacé supérieur. Dans la rade de Marseille, une épaisse unité syn-rift (Rupélien à Aquitanien) a été mise en évidence (>1000 m), structurée en une série de synformes en échelon d'axe E-W et affectée par des failles d'orientation dominante N040 à N060. Sur le flanc sud des synformes, la formation de plis d'axe N050 est associée à une déformation syn-sédimentaire. La formation des synformes en échelon d'axe E-W résulterait d'une réactivation en décrochement des failles N040 à N060 pendant une phase de compression N-S dont l'âge est compris entre le Burdigalien inférieur et moyen (18-20 Ma). Enfin, les dépôts post-rift sont affectés par des déformations mineures (réactivation de failles et plis associés), le long d'un couloir d'orientation N160 à l'ouest de la baie de Marseille, attribuables à une phase de compression post-burdigalienne et anté-pliocène.
ISSN: 0037-9409

hal-01463727
https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01463727
https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01463727/document
https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01463727/file/Fournier_et_al_Provence_2016.pdf
DOI : 10.2113/gssgfbull.187.4-5.187

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Nous étudions dans l'anneau Fq[X0, X1] des polynômes à m + 1 variables et à coefficients dans le corps fini à q éléments, l'idéal homogène J engendré par les polynômes homogènes qui s'annulent sur tout l'espace. Cet idéal s'introduit naturellement lors de l'étude des codes de Reed-Muller projectifs ([7], [8]). Nous donnons une résolution libre du quotient Fq[X0, ..., Xm]/J en utilisant le complexe de Eagon et Northcott [4] qui généralise le complexe de Koszul [5]. Ceci permet en particulier de calculer directement les dimensions des composantes homogènes de l'idéal.
ISSN: 0022-4049

hal-00767441
https://hal.univ-antilles.fr/hal-00767441
https://hal.univ-antilles.fr/hal-00767441/document
https://hal.univ-antilles.fr/hal-00767441/file/ccod0010.pdf

Éditeur(s) : HAL CCSD Oxford University Press (OUP)
Résumé : International audience
BACKGROUND: Mammalian spermatogenesis is a process that involves a complex expression program in both somatic and germ cells present in the male gonad. A number of studies have attempted to define the transcriptome of male meiosis and gametogenesis in rodents and primates. Few human transcripts, however, have been associated with testicular somatic cells and germ cells at different post-natal developmental stages and little is known about their level of germline-specificity compared with non-testicular tissues. METHODS: We quantified human transcripts using GeneChips and a total of 47 biopsies from prepubertal children diagnosed with undescended testis, infertile adult patients whose spermatogenesis is arrested at consecutive stages and fertile control individuals. These results were integrated with data from enriched normal germ cells, non-testicular expression data, phenotype information, predicted regulatory DNA-binding motifs and interactome data. RESULTS: Among 3580 genes for which we found differential transcript concentrations in somatic and germ cells present in human testis, 933 were undetectable in 45 embryonic and adult non-testicular tissues, including many that were corroborated at protein level by published gene annotation data and histological high-throughput protein immunodetection assays. Using motif enrichment analyses, we identified regulatory promoter elements likely involved in germline development. Finally, we constructed a regulatory disease network for human fertility by integrating expression signals, interactome information, phenotypes and functional annotation data. CONCLUSIONS: Our results provide broad insight into the post-natal human testicular transcriptome at the level of cell populations and in a global somatic tissular context. Furthermore, they yield clues for genetic causes of male infertility and will facilitate the identification of novel cancer/testis genes as targets for cancer immunotherapies.
ISSN: 0268-1161

hal-00877243
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00877243
DOI : 10.1093/humrep/des301
PUBMED : 22926843

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : To understand the effect of inherited lithospheric structures on the continental plates deformation process, we have developed a multi scale model that explicitly takes into account an anisotropic viscosity due to the Crystal Preferred Orientation (CPO) of olivine in the mantle by coupling a viscoplastic self-consistent simulation of the deformation at the polycrystalline aggregate to a 3D Finite Element code. Using this tool, we calculate the mechanical behavior of a continental lithosphere submitted to extension for various initial structures. The first set of experiments investigates the deformation of a plate with a homogeneous initial olivine CPO. Results show that the macroscopic anisotropy is strongly dependent on the initial orientation of the olivine CPO relative to the solicitation and to its evolution. The second set of experiments aims to analyze the deformation of a continental plate containing pre-existing lithospheric scale shear zones. These multi-domain models show that the olivine mechanical anisotropy may induce the reactivation of pre-existing lithospheric scale shear zones in a plate submitted to rifting. In both cases, the results shows that the macroscopic mechanic anisotropy induced by the evolution of olivine CPO in the upper mantle is a key parameter to understand the deformation of the continental plates and to explain the observed reactivation of inherited structure from past tectonics events
Afin de comprendre l'effet des structures préexistantes sur la déformation des plaques continentales, nous avons développé une méthode de modélisation mécanique multi-échelle utilisant une viscosité anisotrope induite par les Orientations Préférentielles du Réseau (OPR) des cristaux d'olivine présents dans le manteau. Cette méthode en couple le calcul viscoplastique autocohérent de la déformation d'un agrégat d'olivine à un code éléments finis 3D. Elle a été utilisée pour le calcul du comportement mécanique d'une plaque continentale soumise à une extension. Une première série d'expériences numériques sur l'extension de plaque lithosphérique présentant des OPR initiales d'olivine homogènes a permis de montrer que l'anisotropie mécanique macroscopique est fortement dépendante de l'orientation initiale de l'OPR. La seconde série de simulations analyse l'extension d'une plaque continentale présentant une zone présentant des OPR d'olivine héritées d'un événement tectonique précédant. Les résultats de ces calculs multi-domaines que l'anisotropie mécanique de l'olivine peut expliquer la réactivation des zones de cisaillement héritées lors du rifting. Les résultats obtenus dans les deux séries de modèles montrent que l'anisotropie mécanique macroscopique induite par l'évolution des OPR d'olivine dans le manteau supérieur est un paramètre clé pour la compréhension de la déformation des plaques continentales et pour expliquer la réactivation observée de structures tectoniques, tels que les grands décrochements, lors des épisodes tectoniques ultérieurs.
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00369463

tel-00369463
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00369463
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00369463/document
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00369463/file/KnollThese09.pdf

Résumé : This book represents a two year study by a team of French biologists to collect, summarise and present the experience and knowledge gained in the rearing of the giant freshwater prawn, not only in the French overseas territories but also in the main countries which are developing this culture. This document comprises four parts : - The first describes the world market. The prawn rearing is already an economic reality in the tropical world, the United States and in Europe. - The second on shows that, although the culture techniques are quite complex, production systems can be adapted to local conditions and markets. - The third part is a practical guide, both for investors and farmers, giving all necessary data to start-up and monitor a project in the best conditions. - The final part summarises the main elements of the biology of this species, in order that people interested in its development may have a better understanding of its life history. The authors were based at the aquaculture laboratory of the Ifremer station of French Guiana from 1989 to 1990 and had 15 years previous experience of this culture in Tahiti and the Caribbean. Regarding this initial complete French synthesis on this species in a special care has been given to balance accurate scientific reporting with the objective of reaching a wider audience.
Quinze années d'expérience sur l'élevage de la crevette d'eau douce tropicale, à Tahiti, aux Antilles et en Guyane, comme dans les principaux pays qui pratiquent cet élevage, sont rassemblées et synthétisées dans cet ouvrage. - Où en est le marché mondial ? Cet élevage est déjà une réalité économique dans le monde tropical, comme sur les marchés américain ou européen. - L'exploitation du cheptel est complexe, mais des schémas de production peuvent être adaptés aux conditions locales d'élevage et de marché. - Ce guide pratique donne toutes les informations nécessaires pour monter un projet et le mettre en oeuvre dans de bonnes conditions. - Pour élever la crevette, il faut mieux la connaître. On trouve ici les éléments essentiels de la biologie de cette espèce. L'ouvrage a été rédigé par l'équipe du laboratoire d'aquaculture de la station Ifremer de Guyane en 1989 et 1990. Ce guide, première synthèse en langue française, est unique en son genre. Il équilibre rigueur scientifique et esprit de vulgarisation pour s'adresser aussi bien aux scientifiques et techniciens qu'aux éleveurs ou aux décideurs du développement.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1991/rapport-639.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/639/

Éditeur(s) : Inter-research
Résumé : Chemical tracers (e. g. stable isotopes or trace metals) are increasingly used to study trophic ecology and feeding habits of marine organisms and various factors can affect their values. The aim of the present study was to provide information on ontogenic effects on stable carbon and nitrogen values (delta C-13 and delta N-15) and on cadmium (Cd) and mercury (Hg) concentrations in 5 cephalopod species from the Bay of Biscay (North-East Atlantic Ocean). To this end, individuals belonging to 3 species showing the widest range of sizes were analysed for muscle delta C-13 and delta N-15 values and muscle Hg, and digestive gland Cd concentrations. Results showed that stable isotope ratios allowed discrimination of specific feeding strategies during ontogenesis. Segregation between 5 cephalopod species in terms of trophic ecology was also evidenced (different isotopic niches). In contrast, Hg concentrations varied over the same order of magnitude in these 5 cephalopod species, despite higher levels in the benthic octopus Eledone cirrhosa. Consistently, Hg concentrations followed the same ontogenic pattern and increased with increasing body size/age of cephalopods. Finally, Cd concentrations varied over 3 orders of magnitude among the 5 species. Despite possible effects of physiology in terms of metal bioaccumulation, Cd concentrations were likely to reflect specific feeding preferences or feeding zones and ontogenic variability within a single species. Thus, ontogenic effects have to be taken into account when stable isotope ratios of carbon and nitrogen or trace metals are used as ecological tracers; the best recommendation being to focus on a given class age.
Marine Ecology Progress Series (0171-8630) (Inter-research), 2011 , Vol. 433 , P. 107-120

Droits : Inter-Research 2011 · www.int-res.com
http://archimer.ifremer.fr/doc/00166/27761/25938.pdf
DOI:10.3354/meps09159
http://archimer.ifremer.fr/doc/00166/27761/

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : Afin de mettre en perspective les différents articles du dossier, le texte souligne les différentes étapes qui définissent la situation de la façade caraïbe à la fois au sein des Etats-nations et de la région centraméricaine. Depuis une position de marge ou d’enclave liée à la fois à la géographie et aux logiques de l’empire espagnol, cet ensemble territorial s’est construit à partir de fragments plus ou moins connectés entre eux et aux espaces régionaux maritimes (caribéen ou atlantique). Au cours de leur construction, les différents Etats-nations n’envisagent d’abord la façade caraïbe que dans sa dimension de connexion transisthmique. Pourtant, on constate au vingtième siècle différents processus d’intégration territoriale qui visent à relier espace continental et façade caraïbe, processus qu’il faut associer à de nouvelles dynamiques démographiques. Les sociétés d’interface qui en résultent, voient leurs composantes « ladinas », indiennes, ou afro-descendantes se réorganiser. Enfin, ces fragments qui composent la façade prennent de nouvelles couleurs à la lumière des projections faites par d’autres acteurs (ONG) ou à d’autres échelles (région américaine).
In order to put into perspective the different papers of the issue, this text highlights the successive stages by which the Caribbean coastline of Central American has been constructed, under the several States-nations and as a part of the Central American region. As a margin or enclave due to geographical characters as to the logics of Spanish Empire, these territories have been made from fragments more or less connected between them or to other regional maritime spaces (Caribbean or Atlantic). When growing, the States-nations in the region first exclusively consider their Caribbean coastline as a transisthmic connection. Yet, during the twentieth century, various process of territorial integration aim to connect continental spaces and maritime coastline, associating demographical dynamics. Societies of interface result of these process, where their ladina, indian, afro components are reorganized. Finally, theses fragments as elements of the façade take a new color in the look of new actors (NGO) or from other scales and spaces (Atlantic region, Caribbean Sea).
Para poner en perspectiva los diferentes artículos del numero temático, este texto subraya las varias etapas en que definieron la situación de la costa caribeña, a la vez en cada Estado-Nacion y al nivel de la región. Con una posición de margen o enclave, que se explica tan por motivos geográficos que por las lógicas del imperio español, este conjunto territorial se ha construido a partir de fragmentos más o menos conectados entre sí e con los espacios regionales marítimos (caribeño o atlántico). Cuando se desarrollaron, los Estados-naciones consideraban las costas caribeñas solo por su potencial transístmico. Sin embargo, en el siglo veinte, llevaron a cabo varios procesos de integración territorial que les permiten vincular su espacio continental con la fachada atlántica, y eso asociándose a importantes dinámicas poblacionales. Resultan de estos procesos sociedades de interfaz, cuyos componentes ladinos, indígenas y afros se ven reorganizados. Por fin, los fragmentos que componen la costa caribeña toman otro color a la luz de proyectos llevados por actores ajenos (ONG) o desde espacios y escalas diferentes (Espacio atlántico, región americana).
Amérique centrale
Caraïbes
Livingston
Guatemala

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.6032
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/6032

Résumé : Dans le cadre du projet de DCP collectifs, l’Association des pêcheurs du Sud Basse-Terre (APBST) a demandé à l’Ifremer d’organiser un suivi de l’activité de pêche sur ces dispositifs ancrés, afin de contribuer à l’évaluation de l’impact de l’implantation de ce parc de DCP. L’Ifremer étant responsable du projet pilote de Système d’Informations Halieutiques (SIH) en Guadeloupe sur la période 2007-2008, le suivi DCP collectifs s’insère dans ce dispositif avec un renforcement des moyens de collecte de données sur la zone d’étude. 12 dispositifs de concentration de poissons (DCP) collectifs conçus pour répondre aux exigences du développement durable ont été immergés par l’APSBT au large de Basse-Terre (Guadeloupe) en janvier et février 2008. Cette opération qui a valeur d’exemple pour d’autres communautés de pêcheurs constitue un réel enjeu pour l’avenir de la pêche aux DCP ancrés. Dans le cadre de cette opération, des améliorations étaient attendues dans plusieurs domaines : 1. la sécurité de la navigation et des équipements sous-marins, 2. l’activité et la production sur DCP, sa régularité au cours de l’année et les retours économiques 3. L’organisation de l’entretien des dispositifs en vue de la réduction du coût et des pertes de matériel, 4. la gestion du parc et les règles d’accès aux DCP, Ce rapport final couvre les points 2 et 3 mentionnés ci-dessus, il est organisé de la manière suivante. En premier lieu sont présentées les différentes tâches réalisées par l’Ifremer et les relations avec les autres actions menées dans le cadre du projet. On présente ensuite l’organisation du dispositif de collecte et son insertion dans le projet SIH Guadeloupe. Sur la base des données collectées sur l’année de référence 2006 par le SIH, une analyse de l’activité de pêche sur DCP avant l’implantation des DCP collectifs est réalisée (section 3). La section 4 apporte des éléments sur la pratique de l’activité sur le parc de DCP collectifs après respectivement 5 mois et 11 mois de fonctionnement. Dans cette section, sont également présentées les premières observations réalisées par prospection aérienne pour estimer les densités de DCP privés dans la zone du parc et l’activité de pêche associée. Enfin, la dernière section fournit des données de production, de composition spécifique et économiques par sortie autour des DCP. Les éléments disponibles dans ce rapport constituent une évaluation intermédiaire après moins d’une année de fonctionnement. Il sera utile de mener une analyse avec plus de recul historique afin de mieux mesurer les impacts à long terme de ce projet.

Droits : 2008 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00190/30108/28570.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00190/30108/

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Melting experiments were performed on a silica-rich peridotite composition at 10-17 GPa to determine majoritic garnet-melt partition coefficients (D) for major and trace elements. Our results show that D for many elements, including Na, Sc, Y and rare earth elements (REE), varies significantly with increasing pressure or proportion of majorite component. Lu and Sc become incompatible at 17 GPa, with D decreasing from 1.5 at 10 GPa to 0.9 at 17 GPa. As predicted from lattice strain, log D for isovalent cations entering the large site of majoritic garnet exhibits a near-parabolic dependence on ionic radius. Our data are used to refine a previously published predictive model for garnet-melt partitioning of trivalent cations, which suffered from a lack of calibration in the 10-20 GPa range. Our results suggest that Archean Al-depleted komatiites from Barberton (South Africa) may have been generated by partial melting of dry peridotite at depths between 200 and 400 km. We also speculate that transition zone diamonds from Kankan (Guinea), which contain inclusions of majoritic garnet, may have formed from the partial reduction of CO2-rich magmas that subsequently transported them to the surface. This hypothesis would provide an explanation for the REE patterns of majoritic garnet trapped within these diamonds, including Eu anomalies. Finally, we show that segregation of majoritic garnet-bearing cumulates during crystallisation of a deep Martian magma ocean could lead to a variety of Lu/Hf and Sm/Nd ratios depending on pressure, leading to a range of ε143Nd and ε176Hf isotope signatures for potential mantle sources of Martian rocks.
ISSN: 0024-4937

hal-00767567
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00767567
DOI : 10.1016/j.lithos.2012.06.013

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Serpentinites are one of the major components of the oceanic lithosphere and are stable in the slab and the mantle wedge up to 100-150 km depth in subduction zones. During oceanic mantle hydration and alteration, they trap trace and fluid mobile (FME: B, Li, As, Sb, Rb, Ba, Cs, Sr, U and Pb) elements that participate to elemental transfer occurring between the dehydrating slab and the mantle wedge in subduction context. The Lanzo massif is an eclogitized oceanic lithosphere that preserved its oceanic structure and recorded different steps of serpentinization/de-serpentinization from oceanic lizardite to prograde antigorite in subduction context, up to its dehydration and secondary olivine crystallization, and finally retrograde antigorite during massif exhumation. It constitutes a suitable place to study trace element behavior during serpentinization/de-serpentinization processes and associated chemical transfers between the different envelopes of the oceanic lithosphere and the mantle wedge. Geochemical analyses of serpentine and associated minerals show that the serpentinization/de-serpentinization of the Lanzo massif took place in a relatively closed system without significant trace element transfer between the different parts of the oceanic lithosphere. In the deeper part of the lithosphere, from the slightly serpentinized mantle peridotites (SSP, < 20% serpentinization) to the paleo-Moho, composed of massive serpentinites (MS, 80% serpentinization), the trace elements mobility is reduced. The chemical composition of lizardite and antigorite is homogenized with the local degree of serpentinization: in SSP, serpentine veins composition is inherited from the host mineral while, in MS, their composition is homogenous between destabilized phases at the scale of the outcrop (~ 5 m). In the shallowest part of the oceanic lithosphere, from the paleo-Moho to the oceanic paleo-seafloor, the serpentinites are foliated (FS, > 90% serpentinization). In that zone, the alpine deformation enhances the mobility of trace elements and permits their redistribution and the homogenization of antigorite composition at massif scale. Locally, in the SSP and MS, the crystallization of metamorphic veins of ~ 1-2 m corresponds to channelized fluid flows that allowed fluid transfers - and thereby trace elements - to longer distance. The successive crystallizations of antigorite and then olivine are accompanied by a diminution of some FME (B, Li, As, Sb, Ba, Rb) and Eu contents attesting that these elements are removed from slab to mantle wedge during subduction.
ISSN: 0009-2541

hal-00937661
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00937661
DOI : 10.1016/j.chemgeo.2013.08.025

Résumé : Les stocks des éléments dans les sols, et en particulier ceux du carbone, sont en constante évolution sous l’effet de facteurs naturels (climat, végétation, teneurs en argiles, etc.) et anthropiques (usages des sols, etc.). Notre objectif est donc, (i) de mieux comprendre les relations entre type de sol, système de culture et quantité de carbone stockée, (ii) d’étudier les conséquences des changements d’usage et de gestion des terres sur les formes de matière organique dans les sols et (iii) de préciser le rôle de la matière organique sur les propriétés physiques des sols.Des situations agro-pédologiques représentatives des trois grands modèles minéralogiques des sols tropicaux (Sols à allophanes (argiles non cristallisées), Sols à argiles 1/1 et Sols à argiles 2/1) et présentant des systèmes culturaux de différents niveaux d’intensification (monocultures intensives destinées à l’exportation, systèmes paysans faiblement intensifiés, etc.) ont ainsi été sélectionnées sur les sols de Martinique. Par ailleurs, afin de limiter les effets des usages antérieurs des parcelles, nous avons généralement choisi des situations culturales âgées au minimum de 3 ans.L’analyse des stocks de carbone des différentes parcelles fait apparaître des comportements différents : dans les sols à allophanes, il y a un effet de la minéralogie sur la stabilisation des matières organiques ; dans les sols à argiles cristallisées, il existe une corrélation entre la teneur en carbone (ou le stock organique) et la texture (ou teneur en éléments fins), aussi bien pour les situations non cultivées que pour les situations sous cultures. L’amplitude des variations (diminution) des stocks en carbone observées sous l’effet de différents modes de gestion des sols, dépend elle aussi de la texture : dans les sols sableux, la potentialité de séquestration du carbone est faible ou nulle, en revanche, les potentialités de stockage du carbone sont plus fortes dans les sols argileux.L’estimation des stocks totaux de carbone à l’échelle de la Martinique, pour un mètre de profondeur et pour une situation moyenne entre les cartes d’usage des terres de 1969/1970 et 1979/1980, s’élèvent à 11,859 Mt de C calculés pour 95,8% de la surface.La distribution de la matière organique du sol varie avec la texture du sol : dans les sols sableux, à faibles teneurs en matière organique, les matières organiques sont principalement associées aux fractions sableuses ; dans les sols argileux, plus riches en matières organiques, 50 à 60 % de la matière organique sont associées à la fraction argileuse. De même, la dynamique de la matière organique dépend également de la texture du sol : dans les sols sableux, les variations des stocks organiques sont essentiellement dues à la perte ou à l’accumulation en carbone de la fraction sableuse ; dans les sols argileux, la fraction argileuse participe de manière prépondérante aux variations des stocks organiques de ces sols lors de leur mise en culture ou en prairie ; les sols sablo-argileux ont un comportement intermédiaire entre ces deux pôles.La stabilité structurale varie avec la minéralogie. Les andosols (ou ALL) présentent un haut degré d’agrégation et de stabilité, du à la présence d’allophanes et à leur association particulière avec les composés organiques. Dans les sols à argiles cristallisées, la stabilité de l’agrégation est plus élevée dans les sols à argiles 1/1 (ou LAC) ; les valeurs les plus faibles sont généralement observées dans les parcelles sur sols à argiles 2/1 (ou HAC). En outre, la mise en culture se traduit généralement par une diminution de la stabilité de l’agrégation.L’intensification des cultures (labours fréquents, faibles restitutions de matière organique au sol, etc.) accentue la perte de la stabilité de l’agrégation provoquée par la mise en culture, en particulier dans les parcelles sur sols à argiles 2/1 (ou HAC).
Soils elements stocks, and particularly those of carbon, are in constant evolution under natural factors effect (climate, vegetation, clays content, etc) and anthropic factors effect (soils uses, etc). Our objective is thus, (i) to better understand the relations between soil, farming system and stored carbon quantity, (ii) to study the consequences of soils uses changes and of soils managements changes on organic matter shapes in soil and (iii) to specify organic matter role on soil properties physics.Representative agri-pedological situations of the three great mineralogical models of tropical soils (allophonic soils (not crystallized clays), 1:1 clay soils and 2:1 clay soils) and presenting agricultural systems of various levels of intensification (intensive monocultures intended for export, slightly intensified farming systems, etc) were thus selected in the soils of Martinique. In addition, to limit the effects of their former uses, we generally chose to the minimum 3 years old farming situations.The analysis of the various lands carbon stocks reveals different behaviors: in allophonic soils, a correlation exists between carbon content (or organic stock) and texture (or fine elements content), as well for not cultivated as for cultivated situations. Variations ranges (reduction) of carbon stocks observed under various management soils systems effect, also depends on texture: in sandy soils, carbon sequestration potentiality is low or null, on the other hand, carbon storage potentialities are higher in clay soils.The estimation of total carbon stocks on the scale of Martinique, for one meter of depth and for and average situation between the use soils charts of 1969/70 and 1979/80, rises to 11,859 Mt of C calculated for 95,8% of the surface.Soil organic matter distribution varies with soil texture: in sandy soils, with low contents of organic matter, organics matters are mainly associated with the sandy fractions; in clay soils, richer in organic matters, 50 to 60% of the organic matters are associated with the argillaceous fraction. In the same way, the organic matter dynamics also depends on soil texture: in sandy soils, organic stocks variations are primarily due to carbon loss or accumulation of the sandy fraction; in clay soils, the argillaceous fraction takes part in a dominating way in organic stocks variations of these soils at the time of their setting in culture or meadow; the sand-clay soils have an intermediate behavior between these two poles.Structural stability varies with mineralogy. Andosols (or ALL) present a high degree of aggregation and stability, due to the presence of allophones and their particular association with the organics compounds. In crystallized clay soils, aggregation stability is higher in 1:1 clay soils (or LAC); the lowest values are generally observed in the lands on 2:1 clay soils (or HAC). Moreover, culture setting generally results in aggregation stability reduction.Cultures intensification (frequent ploughings, low organic matter restitutions to the soil, etc) accentuates aggregation stability loss caused by culture setting, particularly in lands on 2:1 clay soils (or HAC).

http://www.theses.fr/2012AGUY0513/document

Éditeur(s) : Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes (ENSAR)
Résumé : Artificial Fish Aggregating Devices (FADs) are known to concentrate tropical tunas. This aggregative behaviour drastically increases the vulnerability of these species to fishing. Alternatively, FADs can be used as oceanic observatories to study the aggregative behaviour of large pelagic fish. We conducted sea surveys in Martinique (Lesser Antilles) to i) establish a typology of the pelagic fish aggregations found around moored FADs ii) study their relations with their biotic and abiotic environment and the local fishery. The mean biomass of large pelagic fish aggregations was also estimated to provide scientific inputs to achieve a sustainable management of the moored FAD fishery. The first part presents the background of the study. We introduce the regional pelagic ecosystem, the aggregative behaviour of pelagic fish around FADs and the Martinican moored FAD fishery. The second part begins with a presentation of the conceptual framework of the study: the hierarchy theory. Observation scales and survey methodology are therefore described. Repeated echosounder surveys run in a star pattern were conducted around 2 moored FADs, in combination with underwater video observations, classical fishing experiments and CTD profiles. In the third part, the elements of the [moored FAD ¿ pelagic fish - environment - fishing] system and their interactions are numerically characterised in the vertical plane. The main type of pelagic fish aggregation was a large aggregation distributed in sub-surface (40-100 m) within a radius of 400 m of the FAD. This aggregation was mostly made of 60 cm FL blackfin tunas (Thunnus atlanticus). It appeared at sunrise and mostly spread away in the late afternoon. It was observed during all daytime surveys. The average density and the vertical structure of the micronektonic sound scattering layers (SSLs) were assessed locally around a FAD for 48h cycles. These SSLs descriptors showed positive correlation with the size and the abundance of the sub-surface tuna aggregation. Whereas this aggregation accounted for about 95% of the total biomass aggregated around a moored FAD, it was nearly unexploited by the local commercial fishermen. The fourth part focuses on the sub-surface tuna aggregation. A high variability of the spatial distribution of the aggregation was evidenced in the horizontal plane at daily, day to day and monthly temporal scales. These variations were related to fluctuations of the global abundance of the aggregation. The daytime average density of sub-surface tuna was modelled as a function of the distance to FAD, within an advection-diffusion framework. Based on these results, a universal kriging model was designed to assess the mean maximum daily biomass of the sub-surface tuna aggregation. This mean biomass estimate yielded 11 tons with an estimation error of 26%. To conclude, we present a hierarchical organization in space and time of a sub-surface tuna population distributed within a network of moored FADs, from micro to meso-scale. We suggest that the spatial distribution of tunas can be explained from fine to coarse-scales by behavioural processes (self-organization, feeding, aggregative behaviour) whereas their spatial distribution is mainly forced by environmental processes at broader scales.
L'utilisation de Dispositifs de Concentration de Poissons permet de provoquer la formation de larges agrégations de thonidés autour de dispositifs artificiels, ce qui augmente considérablement la vulnérabilité de ces ressources vis-à-vis de l'exploitation halieutique. Les DCP peuvent également être utilisés en tant qu'observatoires océaniques, afin d'étudier le comportement agrégatif du macronecton pélagique. Nous avons ainsi réalisé des observations autour de DCP ancrés en Martinique, afin de définir une typologie des agrégations de macronecton et de étudier leurs relations avec leur environnement biotique, abiotique et l'exploitation halieutique locale. Nous avons ensuite estimé la biomasse moyenne de macronecton agrégé autour d'un DCP ancré, afin de fournir des éléments scientifiques nécessaires à une gestion durable de ces ressources. La première partie présente le contexte de l'étude i.e. l'écosystème pélagique régional, le phénomène d'agrégation du macronecton autour des DCP et la pêche associée aux DCP ancrés en Martinique. La deuxième partie introduit la théorie de la hiérarchie qui a fourni le cadre conceptuel de l'étude et présente les échelles et méthodes d'observation. Le principal outil d'observation est un échosondeur scientifique, mis en oeuvre le long de parcours en étoile autour du DCP. Les prospections acoustiques ont été combinées à des observations vidéo sous marines, des pêches expérimentales et un suivi in-situ de l'environnement abiotique. La troisième partie présente une typologie des éléments constituant le système [DCP ancré - macronecton - environnement - pêche] dans le plan vertical et précise leurs interactions. Le type d'agrégation de macronecton dominant est une grande agrégation composée d'une majorité de thons noirs (Thunnus atlanticus) de taille moyenne (60 cm) distribuée en sub-surface (40-100 m), dans un rayon de 300 m autour de la tête des DCP. Cette agrégation se forme au lever du soleil et se disperse presque totalement dans l'après midi. Elle a été observée de jour lors de toutes les campagnes. Une corrélation positive entre la densité et la structure moyenne des couches micronectoniques diurnes évaluée localement autour du DCP au cours de 48 h et les dimensions et l'énergie acoustique de l'agrégation de thons de subs-surface a été mise en évidence. Malgré le fait que cette agrégation représente en moyenne 95 % de l'énergie acoustique du macronecton autour des DCP, elle est presque inexploitée par les pêcheurs artisans locaux. La quatrième partie met en évidence les fortes variations conjointes de la distribution spatiale dans le plan horizontal de la densité de l'agrégation de thons de sub-surface et de son abondance globale. Ces variations ont été observées au cours du cycle nycthéméral et aux échelles inter-journalières et mensuelles. La distribution spatiale moyenne de la densité diurne de l'agrégation en fonction de la distance au centre de gravité de l'agrégation est cependant très stable et peut être modélisée au moyen d'une équation d'advection-diffusion. Un modèle de krigeage universel, utilisant les résultats du modèle d'advection-diffusion, a permis d'évaluer la biomasse maximale journalière moyenne de l'agrégation de thons de sub-surface à une dizaine de tonnes, avec un coefficient de variation d'estimation de 26%. Nous proposons une représentation hiérarchique synthétique de la distribution spatiale d'une sous-population de thons dans un réseau de DCP ancrés de la micro à la méso-échelle. Nous suggérons que la distribution spatiale des thons est déterminée principalement à l'échelle fine (100m-1km) et à l'échelle grossière (1-10 km) par des processus comportementaux (auto-organisation, agrégation, nutrition) et par des processus environnementaux à échelle plus large.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/these-1735.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/sup-1735.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1735/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Among erosion processes, river incision is classicaly described as a key process controlling erosion of landscapes. Incision efficiency is mainly influenced by climate and erodibility. This latter is not only dependent on the nature of the bedrock, but also on its past deformation, which affects its rheological effective properties, such as fracture density. The main objectives of this thesis are: (1) to better constrain the relationship between effective properties and erodibility, and (2) to quantify the influence of erodibility and erosion on both the temporal and spatial building or decay of the topography. Several numerical tools are developed. A 1D formalism of landscape evolution is introduced, including river incision with stochastic distribution of water discharge and hillslope landsliding. A new remeshing algorithm called Surface Lagrangian Remeshing (SLR) is developed as a complement to remeshing algorithms dealing with internal elements. It allows one to take into account long-term erosion into 2D Lagrangian numerical codes based on triangular finite elements. Then the potentiality of measuring erodibility in-situ using a Schmidt hammer (R) is assessed for the active orogen of Taiwan, the diagenetic Annot sandstones and St Clement fault zone. Results suggest a strong control of R by effective properties. A linear model based on effective medium theory is applied to a fault zone with an unmacthed resolution (750 measures, 25 measures per square meter). The model successfully correlates R to fracture density. These results demonstrate that effective elasticity as well as erodibility are sensitive to the density and type of fractures. Finally I focus on the erosional and rheological conditions that allows reproducing post-orogenic evolution of mountain belts. A model coupling surface erosion and regional isostatic uplift is consistent with observations. The topographic decay and decrease of the ratio of surface elevation over crustal root thickness is at first order controlled by the initial geometry of the mountain belt and erosion efficiency. This new model highlights the control ofclimate and erodibility on the topographic decay and of lithospheric rheology on the perseverance of crustal roots.
Parmi les processus d'érosion, l'incision des rivières est classiquement décrit comme un processus clé contrôlant l'érosion des paysages. L'efficacité de l'incision est principalement influencée par le climat et par l'érodabilité. Ce dernier paramètre ne dépend pas seulement de la nature du substratum rocheux, mais aussi de sa déformation passée qui affecte ses propriétés rhéologiques équivalentes. Les principaux objectifs de cette thèse sont: (1) de mieux contraindre les relations entre propriétés équivalentes et érodabilité, et (2) de quantifier l'influence de l'érosion et de l'érodabilité sur la formation ou la décadence, spatiale et temporelle, de la topographie. Plusieurs outils numériques sont développés. Un formalisme 1D d'évolution des paysages est proposé, prenant en compte simultanément l'incision des rivières avec une distribution stochastique des débits en eau et l'érosion des versants par glissements de terrain. Un nouvel algorithme de remaillage appelé Surface Lagrangian Remeshing (SLR) est développé. Il permet de prendre en compte l'érosion à long terme dans les codes numériques 2D Lagrangiens basés sur des éléments finis triangulaires. Ensuite, la possibilité de mesurer in-situ l'érodabilité avec un marteau de Schmidt (R) est évaluée pour: l'orogène actif de Taiwan, les grès diagénétiques d'Annot et la zone de faille de St Clément. Les résultats suggèrent un fort contrôle de R par les propriétés équivalentes des roches testées. Un modèle linéaire, basé sur la théorie des milieux équivalents, est appliqué à une zone de faille avec une résolution inégalée (750 mesures, 25 mesures par mètre carré). Le modèle permet de corréler avec succès la densité de fracture et R. Ces résultats démontrent empiriquement que l'élasticité équivalente ainsi que l'érodabilité sont sensibles à la densité et à la nature des fractures. Enfin j'étudie les conditions d'érosion et de rhéologie qui permettent de reproduire l'évolution des chaînes de montagnes post-orogéniques. Un modèle couplant érosion en surface et soulèvement isostatique régional est compatible avec les observations. Les taux de décroissance topographique et de diminution du rapport de l'élévation de surface sur l'épaisseur de racine crustale sont contrôlés au premier ordre par la géométrie initiale de la chaîne de montagne et par l'efficacité de l'érosion. Ce nouveau modèle met en évidence le contrôle du climat et de l'érodabilité sur la décroissance topographique et de la rhéologie lithosphérique sur la persévérance des racines crustales.
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00602341

tel-00602341
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00602341
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00602341/document
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00602341/file/thesephilippesteer.pdf

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
We provide results of a detailed study of the first peridotite xenoliths of proven mantle origin reported from Bezymyanny volcano in the Klyuchevskoy Group, northern Kamchatka arc. The xenoliths are coarse spinel harzburgites made up mainly of Mg-rich olivine as well as subhedral orthopyroxene (opx) and Cr-rich spinel, and also contain fine-grained interstitial pyroxenes, amphibole and feldspar. The samples are unique in preserving the evidence for both initial arc mantle substrate produced by high-degree melt extraction and subsequent enrichment events. We show that the textures, modal and major oxide compositions of the Bezymyanny xenoliths are generally similar to those of spinel harzburgite xenoliths from Avacha volcano in southern Kamchatka. However, coarse opx from the Bezymyanny harzburgites has higher abundances of light and medium rare earth elements and other highly incompatible elements than coarse opx from the Avacha harzburgites. We infer that (1) the sub-arc lithospheric mantle beneath both Avacha and Bezymyanny (and possibly between these volcanoes) consists predominantly of harzburgitic melting residues, which experienced metasomatism by slab-related fluids or low-fraction, fluid-rich melts and (2) the degrees of metasomatism are higher beneath Bezymyanny. By contrast, xenolith suites from Shiveluch and Kharchinsky volcanoes 50-100 km north of the Klyuchevskoy Group include abundant cumulates and products of reaction of mantle rocks with silicate melts at high melt/rock ratios. The high melt flux through the lithospheric mantle beneath Shiveluch and Kharchinsky may be related to the asthenospheric flow around the northern edge of the sinking Pacific plate; lateral propagation of fluids in the mantle wedge south of the plate edge may contribute to metasomatism in the mantle lithosphere beneath the Klyuchevskoy Group volcanoes.
ISSN: 0377-0273

hal-00941258
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00941258
DOI : 10.1016/j.jvolgeores.2012.12.022