L'élevage larvaire de crevettes en Nouvelle-Calédonie. L'Oxytétracycline et l'association Triméthoprime - Sulfadiazine en tant qu'alternatives à l'emploi de l'Erythromycine en écloserie Auteur(s) : Francois, Cyrille Éditeur(s) : Ecole Nationale Vétérinaire de Nantes Résumé : Aquaculture of penaeid shrimps holds a major place in productions of animals. New Caledonia takes part to these productions by developing the breeding of Pacific blue shrimp Litopenaeus stylirostris. Nowadays, penaeid larviculture can’t be undertaken unless antibiotics are used. Experiments in the Caledonian Aquacultural Laboratory (LAC IFREMER Saint-Vincent) put across to the development of two antibiotic prophylaxis plans for substitution of erythromycine, one plan with oxytetracycline (hydrochloride), the other plan with trimethoprime-sulfadiazine association. After an antimicrobial agent susceptibility testing of bacteria and an acute toxicity study, efficacity assays are the biological validation of these projects of protocols L'aquaculture de la crevette Pénéide occupe une position majeure au sein des productions animales. La Nouvelle-Calédonie y participe activement grâce au développement de l'élevage de la crevette bleue du Pacifique Litopenaeus stylirostris. En l’état actuel de nos connaissances, l’élevage larvaire de crevettes ne peut être mené sans l’utilisation d’antibiotique Les expériences menées au Laboratoire Aquacole Calédonien (LAC IFREMER Saint-Vincent) ont conduit à la mise au point de deux plans d’antibioprévention de substitution à l’érythromycine, l’un employant l’oxytétracycline (chlorhydrate), l’autre utilisant l’association triméthoprime - sulfadiazine. Après une étude de la sensibilité des flores bactériennes hétérotrophe totale et Vibrionacée aux antibiotiques et une étude d’innocuité sur les larves de crevettes, les essais d’efficacité constituent la validation biologique des projets de protocoles. Droits : 2003 The author / Ecole Nationale Vétérinaire de Nantes / ONIRIS / IFREMER http://archimer.ifremer.fr/doc/00072/18312/15877.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00072/18312/ | Partager Voir aussi Crevette Ecloserie Oxytétracycline Triméthoprime Sulfadiazine Shrimp Hatchery Oxytetracycline Trimetroprime Sulfadiazine Télécharger |
Recent innovations in cultivation of molluscs in french Polynesia Auteur(s) : AQUACOP Éditeur(s) : 1st International Biennal Conference on Warm Water Aquaculture - Crustacea 02/9-11/83 Brigham Young University. Hawai Résumé : Until recently, mollusc production in French Polynesia was only based upon fishing, for local consumption of edible bivalves mainly the oyster Saccostrea cucullata and for the exportation of pearl-oyster shells. As a consequence of parasitism problems on local oysters, a mollusc program was initiated by developping hatchery technics on introduced species of edible bivalves, Saccostrea echinata and Perna viridis, and cultivation methods in specialyy fitted up areas. Concerning pearl oyster Pinctada margaritifera the traditional shell production activity was recently reorganized to produce black culture pearls, inducing an increased demand of young implantable pearl-oysters. Hatchery spat production proved to be unsuccessful, and technics of collection and cultivation in lagoons were set up to supply the pearl oyster farming industry, and face the depletion natural stock. [NOT CONTROLLED OCR] Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1983/acte-4449.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4449/ | Partager |
Le système immunitaire du bar Dicentrarchus labrax. Immunoglobulines, cellules productrices d'immunoglobulines, ontogenèse applications à une pathologie virale néonatale Auteur(s) : Breuil, Gilles Éditeur(s) : Université de Montpellier II Résumé : The sea bass, Dicentrarchus labrax, has been subjected to intensive aquaculture on the Mediterranean cost for ten years. Marine fish hatcheries are key factors in the aquaculture field, and face different pathologies, especially one of viral origin (nodavirus) that could challenge their feasibility. Consequently, we have tried to provide some data on larvae and spawning stocks. Firstly, we have studied the immunoglobulins, components of the specific humoral immunity, and their role as antibodies. On adult basses, these immunoglobulins are tetrameric molecules with high molecular weight (850 kD), made of heavy (H) - 80 kD and light (L) - 26 kD chains. In the eggs, simplest forms such as monomeric or dimeric are brought to the fore; they are located under the chorionic membrane. Secondly, we have studied the development of the immunity system on larvae, preparing IgM assays with ELISA method, the study on the organogenesis of the main lymphoid organs, and using flow cytometry for the ontogenesis of IgM producing cell. Based on this experience, we can propose a date for the immunocompetence onset of the bar, i.e. from the 54th day of the hatchery phase. Finally, we made the most of these different results to study a viral pathology (nodavirus) in spawners and larvae. We defined an experimental contamination model for larvae and eggs, and we highlighted that eggs born from vaccinated hen fishes were protected against the nodavirus. Le bar, Dicentrarchus labrax, fait l'objet d'une aquaculture intensive sur le littoral Méditerranéen depuis une dizaine d'années. Les écloseries marines représentent un des maillons clefs de cette filière aquacole, et sont confrontées à différentes pathologies, dont une d'origine virale (nodavirus), pouvant remettre en cause leur faisabilité. Aussi, nous avons tenté d'apporter quelques données concernant la protection des larves et des géniteurs reproducteurs. Dans un premier temps, nous avons étudié les immunoglobulines, éléments de l'immunité spécifique humorale ainsi que leur rôle anticorps. Chez les bars adultes ces immunoglobulines sont des molécules tétramériques de haut poids moléculaire (850 kD), composées de chaînes lourdes (H) de 80 kD et légères (L) de 26 kD. Dans les oeufs, des formes plus simples, monomériques ou dimériques, sont mises en évidence et sont localisées sous la membrane chorionique. Dans un second temps, nous avons étudié la mise en place du système immunitaire spécifique chez les larves, en effectuant le dosage des IgM par ELISA, l'étude de l'organogenèse des principaux organes lymphoïdes, puis celle de l'ontogenèse des cellules productrices d'IgM par cytométrie de flux. L'ensemble de cette étude nous permet de proposer une date d'acquisition de l'immunocompétence à partir du 54ème jour d'élevage chez le bar. Enfin, ces différents résultats ont été mis à profit dans le cadre d'une pathologie virale (nodavirus) touchant les reproducteurs et les larves. Après avoir défini un modèle de contamination expérimental des larves et des oeufs, nous avons mis en évidence une protection des oeufs lorsque ceux-ci proviennent d'une femelle vaccinée (vaccin expérimental) contre le nodavirus. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1997/these-1265.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1265/ | Partager Voir aussi Egg Cytometry Immunity system Larvae Immunoglobulin Nodavirus Dicentrarchus labrax Hatchery Ontogenese Cytometrie Télécharger |
Residual genetic variability in domesticated populations of the Pacific blue shrimp (Litopenaeus stylirostris) of New Caledonia, French Polynesia and Hawaii and some management recommendations Auteur(s) : Goyard, Emmanuel Arnaud-haond, Sophie Vonau, Vincent Bishoff, Vincent Mouchel, Olivier Pham, Dominique Wyban, Jim Boudry, Pierre Éditeur(s) : Elsevier Résumé : The Latin American shrimp Litopenaeus stylirostris was introduced in three different Pacific islands (Tahiti, New Caledonia via Tahiti, and Hawaii) and hatchery-propagated for 7-25 generations to develop shrimp farming based on these domesticated stocks. Three microsatellite markers have been used in an attempt to assess the genetic bases of the populations available to start a selective breeding program. The comparison of eight hatchery stocks (five New Caledonian, two Hawaiian and one Tahitian stocks) and one wild Ecuadorian population showed a much lower variability in the domesticated stocks than in the wild population, especially in New Caledonia and Tahiti (2-3.7 vs. 14-27 alleles per locus; 20-60% vs. 90% expected heterozygosity). The Tahitian and the New Caledonian stocks share the same alleles, suggesting that the loss of alleles occurred during the common past of these populations. On the contrary, New Caledonian and Hawaiian populations share only one common allele at the three loci studied. Although the low genetic variability and the resulting inbreeding of the New Caledonian stocks do not seem to affect their present performance, the results of this study demonstrate the usefulness of the introduction of new stocks in order to increase the potential responses to new controlled or uncontrolled selective pressures. The introduction in New Caledonia of the Hawaiian domesticated stocks, which would provide the local shrimp industry with 40% of the allelic diversity of the species, is advised and preferred to the one of wild animals in order to take advantage (i) of the spontaneous selection which occurred during domestication and (ii) of their favourable sanitary "specific pathogen free" status (no presence of four viruses: WSV, YHV, IHHNV, TSV) which limits the risk of introduction of pathogens. La crevette d'Amérique latine Litopaenus stylirostris a été introduite dans trois îles du Pacifique (à Tahiti, en Nouvelle-Calédonie via Tahiti, et à Hawaii), et a été ensuite reproduite en écloserie pendant 7 à 25 générations à des fins d'aquaculture. Trois marqueurs microsatellites ont été utilisés pour évaluer les bases génétiques des populations disponibles pour le démarrage d'un programme d'amélioration génétique. L'étude comparative de 8 populations domestiquées (cinq néo-calédoniennes, deux hawaiiennes et une tahitienne) et d'une population sauvage d'Equateur révèle une variabilité très réduite dans les populations d'élevage, en particulier en Nouvelle-Calédonie et à Tahiti (2 à 3.7 allèles par locus au lieu de 14 à 27 en population sauvage ; 20% à 60% d'hétérozygotie au lieu de 90%). Les souches tahitiennes et calédoniennes disposent des mêmes allèles, ce qui suggère que la perte d'allèles a eu lieu lors de l'histoire commune des ces populations. A l'inverse, les populations néo-calédoniennes et hawaiiennes n'ont en commun qu'un seul allèle sur les 3 locus étudiés. Bien que la très faible variabilité génétique du cheptel calédonien ne semble pas affecter ses performances actuelles, les résultats de cette étude démontrent l'utilité de l'introduction de variabilité afin d'augmenter la capacité de réponse à de nouvelles pressions de sélection (contrôlées ou non). L'introduction des souches hawaiiennes en Nouvelle-Calédonie qui permettrait à la filière locale de disposer de 40% de la diversité allélique de l'espèce) est préconisée de préférence à celle d'animaux sauvages afin de bénéficier (i) de la sélection spontanée qu'elles ont subi lors de leur domestication et (ii) de leur statut sanitaire « specific pathogen free, SPF » (absence de 4 virus : WSV, YHV, IHHNV, TSV) qui limite les risques de transferts de pathogènes. Aquatic Living Resources (0990-7440) (Elsevier), 2003-12 , Vol. 16 , N. 6 , P. 501-508 Droits : 2003 Published by Elsevier, Paris. http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/publication-596.pdf DOI:10.1016/j.aquliv.2003.07.001 http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/596/ | Partager |
Acquisition of susceptibility to Vibrio penaeicida in Penaeus stylirostris postlarvae and juveniles Auteur(s) : Goarant, Cyrille Regnier, France Brizard, Raphael Marteau, Anne-laure Éditeur(s) : Elsevier Résumé : Vibriosis is a major disease problem in shrimp aquaculture, affecting all developmental stages, from larvae in hatchery tanks to juveniles and broodstock in growout ponds. However, bacterial strains responsible for vibriosis in the successive stages are usually considered to be different, and virulence specificity has been reported both at the species and at the stage levels. The so-called « Syndrome 93 » is a seasonal juvenile vibriosis caused by Vibrio penaeicida which affects Penaeus stylirostris in growout ponds and broodstock tanks in New Caledonia. This pathology does not cause any mortality in hatchery or nursery phases. An experimental infection design using balneation of postlarvae and early juveniles in V. penaeicida suspensions was used to evaluate the developmental stage at which shrimp become sensitive to this vibriosis. We demonstrated that the acquisition of susceptibility to this pathogen is very sudden and correlated with the acquisition of the definitive rostral formula, and from this draw conclusions regarding virulence mechanisms of V. penaeicida in P. stylirostris. Aquaculture (Elsevier), 1998-12 , Vol. 169 , N. 3-4 , P. 291-296 Droits : 1998 Elsevier Science B.V. All rights reserved http://archimer.ifremer.fr/doc/1998/publication-383.pdf DOI:10.1016/S0044-8486(98)00380-9 http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/383/ | Partager |
Temperature, selective mortality and early growth in the short-lived clupeid Spratelloides gracilis Auteur(s) : Durieux, Eric Meekan, Mark G. Ponton, Dominique Vigliola, Laurent Éditeur(s) : Wiley / Blackwell Résumé : Six cohorts of the silver-stripe round herring Spratelloides gracilis, a fast-growing and short-lived tropical clupeid, were collected as juveniles and then as adults during austral summers from November to February in 1998–1999 and 1999–2000, using light traps in the Dampier Archipelago, Western Australia. Otolith analysis allowed backcalculation of size and growth rate at age to examine the relative influences of selective mortality and water temperature on early growth. Negative sizeselective mortality and growth-selective mortality between the juvenile and the adult stages was found only in the cohort that was the smallest and slowest growing in the period immediately following hatching. Selective mortality preferentially removed members of this cohort that were smaller from age 0 to 15 days, and slower growing from 0 to 10 days, resulting in an elevation of size at age to, or even above, that of cohorts that had not undergone this process. Size and growth rate at 5 day age intervals in the first 20 days after hatching differed among cohorts within and between summers and were strongly and positively correlated (r2= 0·61–0·83) with water temperature. Journal of Fish Biology (0022-1112) (Wiley / Blackwell), 2009-03 , Vol. 74 , N. 4 , P. 921-938 Droits : 2010 The Fisheries Society of the British Isles, Wiley Blackwell Publishing, Inc. http://archimer.ifremer.fr/doc/00008/11940/8643.pdf DOI:10.1111/j.1095-8649.2009.02179.x http://archimer.ifremer.fr/doc/00008/11940/ | Partager Voir aussi environmental factors Indo-Pacific region life-history traits otolith pelagic fishes size Télécharger |
Contribution à l'amélioration des survies et performances de reproduction de L. stylirostris en saison fraîche en Nouvelle-Calédonie Auteur(s) : Pham, Dominique Wabete, Nelly Lemaire, Pierrette Mailliez, Jean-rene Broutoi, Francis Chim, Liet Résumé : Since 1993, the New Caledonian shrimp industry has been faced with cold season mortality outbreaks of multifactorial origin. This pathology called “Syndrome 93” affects as well animals in grow-out ponds as broodstock after their transfer in maturation room, with up to 35% of mortality in 48 hours. From literature data and physiological studies on Litopenaeus stylirostris, several combinations of three abiotic parameters (temperature, salinity and feeding) have been tested during the breeders stocking period. This research allowed us to lower stress factors impact and to propose a transfer protocol which leads to an optimal physiological comfort of the animal. Results showed that survival rate is improved and spawning rates are twice higher. These findings have come up with a routine protocol of carrying out any transfer in a tank with water at temperature of 26°C, salinity of 26 ppt and no food supply during 48 hours. The use of this protocol in a commercial hatchery led to a significant broodstock survival improvement. Depuis 1993, la filière crevetticole calédonienne est confrontée aux mortalités de saison froide dont les causes sont multifactorielles. Cette pathologie appelé « Syndrome 93 » affecte non seulement les animaux dans les bassins de grossissement, mais elle touche également les géniteurs après leur transfert en salle de maturation, les pertes pouvant atteindre 35% en 48 heures. A partir de la littérature et d’études physiologiques de la Litopenaeus stylirostris, différentes combinaisons de trois paramètres abiotiques (température, salinité et alimentation) ont été testés lors de la stabulation des reproducteurs en salle de maturation. Ces recherches ont permis de diminuer l’impact des facteurs de stress et d’établir un protocole de transfert des animaux dans les conditions de confort physiologique optimale. Les résultats montrent que la survie est améliorée mais que le pourcentage de pontes est également doublé. Il est maintenant recommandé pour tout transfert, de prévoir des bacs de réception dans lesquels l’eau est à la température de 26°C, la salinité à 26 ppt et de ne fournir aucune alimentation pendant 48 heures. L’application de ce protocole dans une écloserie privée a démontré un gain substantiel sur la survie des géniteurs. Droits : 2008 Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/00118/22970/20800.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00118/22970/ | Partager |
Substitution of live food by formulated diets in marine fish larvae Auteur(s) : Cahu, Chantal Zambonino, Jose-luis Éditeur(s) : Elsevier Résumé : Until recently, it was considered impossible to feed newly hatched marine fish species with a compound diet. Substituting a compound diet for live prey was performed several weeks after hatching, depending on the species. Compound diets were well ingested at the early stage but larvae died with a gut full of food, suggesting that larvae were unable to digest the compound diet. The hypothesis was that younger larvae have insufficient digestive enzymes to thrive on compound diets, and that exogenous enzymes, provided from live prey, are necessary for early stages.The organogenesis of marine fish larvae is not completely achieved at hatching and histological studies have revealed that the anatomy of the digestive tract undergoes developmental changes over some weeks. Nevertheless, biochemical studies over 20 years have shown that most of the digestive enzymes are present in young larvae. Recent studies have provided better understanding of digestion mechanisms in larvae and have led to proposed dietary compositions meeting larvae nutritional requirements. Pancreatic digestive enzymes are detected before mouth opening. Their synthesis is not induced by diet ingestion, but secretory mechanisms in the pancreas, and so enzymatic action, become efficient chronologically after those of synthesis. Inadequate diets can delay the onset of secretion mechanisms. The ratio of secreted enzymes to total enzymes indicates the nutritional value of the diet ingested by the larvae.At the intestinal level, cytosolic enzymes, which are peptidases, exhibit high activity in the early stages, suggesting a high capacity in larvae to digest protein hydrolysate. Indeed, larvae growth and survival is improved by the incorporation of a moderate concentration of peptide or hydrolysate in the diet. Peptidase activity abruptly decreases around day 25 in sea bass, concurrent with an increase in enzymes of the brush border membranes. This corresponds to a normal maturation process of enterocytes. Compound diets can slightly delay the onset of this maturation process, and inadequate diet can prevent it, leading to near death of the larvae. A proper onset of the maturation process has been associated with high larvae survival.The early developmental stage larvae exhibit high hydrolytic capacity, related to their weight. Enzyme activity pattern is age-dependent, but can be modulated by diet composition. Thus, larvae have the ability to digest and thrive on compound diet, if this diet is well adapted. Larvae have different specificities in digestion and nutritional requirements when compared to juveniles. Taking these specificities into consideration, recent research has led to the formulation of a compound diet that was well adapted for larvae from mouth opening, and could totally replace live prey. Aquaculture (0044-8486) (Elsevier), 2001-08 , Vol. 200 , N. 1-2 , P. 161-180 Droits : 2001 Elsevier Science B.V. All rights reserved http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/publication-447.pdf DOI:10.1016/S0044-8486(01)00699-8 http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/447/ | Partager Voir aussi Protein Phospholipid Pancreatic enzymes Microparticulate diet Intestinal enzymes Protein hydrolysate Gut maturation Fish larvae Télécharger |
Amélioration des productions phytoplanctoniques en écloserie de mollusques : caractérisation des microalgues fourrage Auteur(s) : Robert, Rene Chretiennot-dinet, Marie-josèphe Kaas, Raymond Martin-jezequel, Véronique Moal, Jeanne Le Coz, Jean-rene Nicolas, Jean-louis Bernard, Eudes Résumé : in mollusc hatcheries. Consequently, we assessed themost commonly used species to establish their growth and size profiles, their cytomorphological, biochemical, biomolecular identification as well as their cytometer signs, and also their ability to grow under extreme conditions of temperature and salinity.
This work aimed at matching the conformity of the strains used in Argenton (dispatched to most of the French commercial hatcheries) to those of a referenced culture collection. A previous screening preceded this study, because of the 45 species and/or clones held originally, Argenton kept no more than 15 species. As most of the latter are also represented in referenced collection, our strains are therefore correctly identified. On the other hand, the combination of several approaches (characteristic of growth and size, cytomorphological description, establishment of biochemical and biomolecular profiles) to discriminate the different species was broadly successful. Nevertheless, flow cytometer measurements were extremely variable from sample to sample, dueto their high sensitivity to the microalga's physiological state.
Accordingly, we have developed a method of identification which could be transferred at a national or international level, to the Institutions in charge of microalgae collections. Furthermore, we achieved relevant data to establish an identity card for each of the microalgae suitable for mollusc hatcheries. La caractérisation des microalgues fourrage constituait l'un des points perfectibles au regard de ce qui est appliquée en microbiologie. Nous avons alors cherché à définir, pour les espèces les plus utilisées en écloserie, leurs profils de croissance et de taille, leur caractéristiques cytomorphologique, cytofluorimétrique, biochimique et biomoléculaire, et enfin, précisé leur aptitude au développement sous des conditions extrêmes de température et de salinité (écotolérance). Ce travail avait pour but de vérifier, d'une part, la conformité des souches utilisées à l'écloserie d'Argenton (auprès de laquelle se fournissent la plupart des écloseries commerciales françaises) en comparant les espèces utilisées à celles issues d'une collection référencée. Un premier balayage avait été réalisé avant la mise en place de cette étude puisque sur les 45 espèces et clones détenus originellement, Argenton ne possédait plus que 15 espèces. La plupart de ces dernières ayant leur équivalent en collection référencée notre souchier est désormais parfaitement identifiée. D'autre part, la confrontation de plusieurs approches, caractéristique de la croissance et de taille, description cytomorphologique, établissement des profils biochimique et biomoléculaire, écotolérance, signature cytofluorimétrique, pour discriminer les différentes espèces de microalgues fourrage a été globalement couronnée de succès. Seule cette dernière technique n'a pas permis de caractériser les espèces entre elles, les paramètres mesurés en cytométrie de flux étant particulièrement sensibles à l'état physiologique des microalgues, très variable d'un échantillon à un autre. Nous disposons dorénavant d'une méthode d'identification qu'il serait souhaitable de transférer, au niveau national voire international, auprès des organismes en charge des collections. De plus, nous disposons dorénavant de données pertinentes pour établir pour chacune des microalgues d'intérêt aquacole une véritable carte d'identité. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/2004/rapport-1546.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1546/ | Partager |
Marine crustacean farming: present status and perspectives Auteur(s) : Laubier, Annie Laubier, Lucien Éditeur(s) : EDP Sciences Résumé : For centuries, several species of prawns and crabs have been raised from wild-caught juveniles in coastal brackish-water fish ponds in various countries of south east Asia. The Indonesian "tambaks" are well known examples of such traditional practices. In western countries, since the turn of the century, advances of marine biology and fast increase of marine fisheries enabled the development of large-scale production and release of larval stages of American and European lobsters in a fruitless attempt to restock natural populations. After the Second World War, the increasing demand for crustaceans in United States and Japan was satisfied by opening new prawn fisheries all over the world. A major breakthrough was achieved with the development of hatchery technologies for the penaeid prawn Penaeus japonicus (Hudinaga, 1942 in Japan) and the caridean prawn Macrobrachium rosenbergii (Ling, 1969 in Malaysia), which occurred during the first decades of the second half of this century. Together with the increasing market demand in developed countries for sea food, this led to a considerable interest of both public agencies and private investors in marine shrimp and prawn culture. In western countries, a large number of pioneering commercial ventures, often based on assumptions not scientifically founded, failed. Nevertheless, the aquaculture production of prawns mainly based on wild-caught juveniles increased in South-East Asia and Central America during the 1980s. This overall positive trend should not hide important failures which occurred at a local scale, such as the Taiwanese crisis of 1988 due principally to environmental degradation, resulting in severe disease problems and a near collapse of the farming activity. Following the early period of hatchery technology development, the major scientific achievements were related to food requirements and formulation of compound diets for larvae, juveniles and adults and to a better knowledge of diseases caused by bacteria and several viruses which have been identified from hatcheries and intensive farming ponds. Additional new technological advances have emerged from recent research in the fields of physiology (endocrinology) and genetics. By far, the major part of the world production of marine crustaceans relies on penaeid prawns and, to a lesser extent, on Macrobrachium species. However, some other species of marine crustaceans have potential for aquaculture. The economic aspects of marine crustacean aquaculture should be considered together with those of the fishing industry: market prices are rather similar, depending on the quality of the product. The balance between market demand and production is an important constraint which, in turn, establishes the success of prawn farming. Since the early 1980s, crustacean aquaculture has increased tremendously in both Asia and America: the world production for 1991 approximated 700,000 tons, with more than 600,000 tons from penaeid prawn culture. Pendant des siècles, quelques espèces de crevettes et de crabes ont été élevées à partir d'individus juvéniles capturés dans le milieu naturel, dans des bassins à poissons d'eau saumâtre de différents pays d'Asie du Sud-Est. Les « tambaks » indonésiens sont des exemples bien connus de ces pratiques traditionnelles. Dans les pays occidentaux, depuis le début du siècle, les progrès réalisés en biologie marine et la croissance rapide des pêches maritimes ont permis le développement de la production à grande échelle de stades larvaires des homards européen et américain, dans une vaine tentative de reconstitution des stocks naturels. Après la Seconde Guerre mondiale, la demande croissante des Etats-Unis et du Japon a été satisfaite par l'ouverture de nouvelles pêcheries de crevettes dans l'océan mondial. Un progrès décisif a été réalisé avec la mise au point des techniques d'écloserie pour la crevette Pénaeidé Penaeus juponicus (Hudinaga, 1942 au Japon) et la crevette Caridé Macrobrachium rosenbergii (Ling, 1969 en Malaisie), qui sont apparues au cours des premières décennies de la seconde moitié de ce siècle. Parallèlement à la demande croissante du marché des pays développés pour les produits de la mer, ce résultat s'est traduit par un intérêt considérable porté à l'élevage des crevettes marines de la part des institutions de recherche et des investisseurs. Dans les pays occidentaux, un grand nombre de tentatives d'élevage commerciales, fondées sur des considérations non scientifiquement établies, ont échoué. Néanmoins, la production aquacole de crevettes reposant sur la capture d'animaux juvéniles dans la nature, s'est développée en Asie du Sud-Est et en Amérique Centrale au cours des années 1980. Cette tendance globalement positive ne doit pas dissimuler les faillites importantes qui se sont produites à l'échelle locale, comme la crise des élevages de Taiwan en 1988, causée principalement par une dégradation de l'environnement, entraînant l'apparition de problèmes pathologiques sévères et une disparition presque totale de l'activité d'élevage. Après la période pionnière du développement de la technologie d'écloserie, les principaux acquis scientifiques concernent les besoins alimentaires et la formulation d'aliments composés pour les larves, les jeunes et les adultes, et une meilleure connaissance des maladies bactériennes et virales qui interviennent dans les écloseries et les fermes d'élevage intensif. De nouveaux progrès techniques complémentaires ont vu le jour à la suite de recherches dans les domaines de la physiologie (endocrinologie) et de la génétique. De loin, la majeure partie de la production mondiale de Crustacés marins repose sur les crevettes Pénaeidés et, dans une moindre mesure, sur des espèces de Macrobrachium. Cependant, quelques autres espèces de Crustacés marins intéressent potentiellement l'aquaculture. Les aspects économiques de l'aquaculture de crustacés marins doivent être considérés avec ceux de l'industrie des pêches maritimes : les prix du marché sont à peu près les mêmes, et dépendent de la qualité du produit. Le rapport entre la demande du marché et la production est une contrainte importante qui à son tour, détermine les conditions du succès de l'élevage de crevettes. Depuis le début des années 1980, l'aquaculture de crustacés a augmenté considérablement en Asie et en Amérique : la production mondiale pour 1991 avoisine 700 000 tonnes, avec plus de 600 000 tonnes provenant des élevages de crevettes Pénaeidés. Aquatic Living Resources (0990-7440) (EDP Sciences), 1993-10 , Vol. 6 , N. 4 , P. 319-329 Droits : IFREMER-Gauthier-Villars, 1993 http://archimer.ifremer.fr/doc/00190/30119/28587.pdf DOI:10.1051/alr:1993033 http://archimer.ifremer.fr/doc/00190/30119/ | Partager Voir aussi Crustacés crevettes crabes homards aquaculture exploitation Penaeidae Crustaceans shrimps prawns Télécharger |
Live preys in shrimp culture: nutritional and sanitary considerations on the use of Artemia in New Caledonia Auteur(s) : Pham, Dominique Wabete, Nelly Maillez, Jean-rene Broutoi, Francis Chim, Liet Éditeur(s) : PSIC 11 - 11th Pacific Science Inter-Congress : Pacific Countries and their Ocean: Facing Local and Global Changes / 2nd Symposium on French Research in the Pacific. March 2 - 6, 2009 Tahiti, French Polynesia. Résumé : In aquaculture, Artemia nauplii are commonly used as live prey; and represent 40 % of the total aquaculture feed demands in the early stages. However, the production of Brine shrimp is very unstable from one year to another and in the late 90’s, only 20 % of the world aquaculture need was covered. An insufficient offer leads to higher prices of the Artemia cysts and consequently, the price of shrimp juveniles from hatchery. In New Caledonia, marine aquaculture is mainly based on the blue shrimp Litopenaeus stylirostris. From Zoea 3 to 10 days old post-larvae (P10), the shrimp are mainly fed with live preys. Eleven kilos of Artemia cyst are necessary for producing one million of P10. From a sanitary point of view, Artemia can be a virus carrier and Vibrio population increase is often detected in the larval rearing tank the day after the feeding with live prey. Up to now, Brine shrimp are delivered in excess but with the cost and sanitary problems, Saint-Vincent laboratory has started some experiments in order to optimise the use of Artemia in shrimp larval rearing. The first tests were conducted to determine the effect of the Artemia quantity on the growth and the survival rate at different post-larval stages (P8-P11, P5-P8 and M3-P3). It was shown that four to twelve times fold Artemia was necessary for P8-P11 compared to M3-P3. And it was also noticed that the “optimized”quantity of live food at M3-P3 was twice lower than the recommended amount of the hatchery feeding protocol in New Caledonia. A better knowledge of the real feed requirement in the early life of the blue shrimp will be helpful to decrease the cysts quantities used in shrimp hatcheries but also the associated sanitary impact. And further, these results will give data for developing formulated diets which will replace the live prey and will increase the biosecurity and the sustainability of the production of the blue juvenile shrimp in New Caledonia. En aquaculture, les nauplii d’Artemia sont largement utilisés comme proies vivantes et représentent près de 40 % des besoins en aliments pour la production des stades précoces. Cependant, l’approvisionnement en Artemia peut fluctuer de façon importante d’une année sur l’autre. Ainsi vers la fin des années 90, la demande mondiale a pu être satisfaite seulement à hauteur de 20%. Les années avec une offre insuffisante correspondent à des augmentations importantes du cours mondial des cystes d’artemia avec des répercussions sur le prix des animaux juvéniles produits en écloserie. En Nouvelle-Calédonie, l’aquaculture marine est principalement basée sur la crevette bleue Litopenaeus stylirostris. Les larves de cette espèce, à partir du stade Zoé 3, se nourrissent essentiellement de proies vivantes. Ainsi pour produire un million de Post-larves de 10 jours il faut compter 11 kilos de cystes d’Artemia. Outre le problème posé par le coût, les artemii peuvent également représenter un risque sanitaire pour l’écloserie. En effet certaines souches sont infectées par des virus qui peuvent contaminer les crevettes et de façon plus générale l’introduction des artemii dans le volume d’élevage larvaire s’accompagne le plus souvent d’une flambée de la flore vibrionacée. Jusqu’à présent, les Artemii étaient distribuées en excès cependant du fait de leur coût et des risques sanitaires, le laboratoire de St Vincent a débuté un travail pour optimiser leur utilisation en production larvaire de crevette. Ainsi, nos premières expérimentation sur l’effet de la dose en artemii sur le développement et la survie des larves de crevettes ont permis de déterminer les rations optimales pour les stades larvaires P8-P11, P5-P8 et M3-P3. Nous avons ainsi montré que la ration de proies vivantes était 4 à 12 fois plus importante à P8-P11 qu’à M3-P3. Par ailleurs la dose optimale déterminée au cours de nos expérimentations était pour les stades M3-P3 deux fois moins élevée que celle préconisée par le protocole actuel des écloseries commerciales de Nouvelle-Calédonie. Nous voyons ainsi, qu’une meilleure compréhension des besoins alimentaires de la crevette au cours de son développement permettra de diminuer de façon substantielle les proies vivantes utilisées ainsi que le risque sanitaire associé. A terme, ces travaux donneront des bases au développement d’aliments inertes en remplacement des proies vivantes et à la production durable, en conditions de biosécurité, des crevettes bleues juvéniles pour la filière Calédonienne Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/00198/30877/29245.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00198/30877/ | Partager |
Dietary probiotic live yeast modulates antioxidant enzyme activities and gene expression of sea bass (Dicentrarchus labrax) larvae Auteur(s) : Tovar-ramirez, D. Mazurais, David Gatesoupe, J. F. Quazuguel, Patrick Cahu, Chantal Zambonino-infante, J. L. Éditeur(s) : Elsevier Science Bv Résumé : The main goal of this work was to determine the effect of dietary live yeast Debaryomyces hansenii on the enzymatic antioxidative status of sea bass Dicentrarchus labrax larvae. Growth, activity and expression of the main antioxidative enzymes: catalase (CAT), glutathione peroxidase (GPX) and superoxide dismutase (SOD), and heat shock protein (HSP70) were measured in sea bass larvae at 23 and 48 days after hatching. Larvae were fed on two microdiets: group one, fed microdiet containing live yeast and the control group fed microdiet without yeast. Heat shock protein 70 showed the same expression levels in both fish larvae fed yeast and the control diet. The group fed D. hansenii showed highest growth and lower activity and expression levels of GPX and SOD compared to fish fed control diet. In our work the differences in activity and gene expression patterns could only be attributed to the presence of yeast, assuming a possible involvement of superoxide anion retention in fish larvae, which could represent importance to the host to increase cell or tissue responsiveness to growth- and/or differentiation-enhancing factors. Aquaculture (0044-8486) (Elsevier Science Bv), 2010-02 , Vol. 300 , N. 1-4 , P. 142-147 Droits : 2010 Elsevier B.V. All rights reserved. http://archimer.ifremer.fr/doc/00002/11299/7881.pdf DOI:10.1016/j.aquaculture.2009.12.015 http://archimer.ifremer.fr/doc/00002/11299/ | Partager |
Influence de la temperature sur la differentiation sexuelle des gonades chez la tortue luth (Dermochelys coriacea ); etude en incubation artificielle et naturelle Auteur(s) : Rimblot, F Fretey, J Lescure, J Pieau, C Éditeur(s) : Actes de colloques. Ifremer. Brest [ACTES COLLOQ. IFREMER.]. 1985 Résumé : Sexual differentiation of the marine leatherback turtle is sensitive to temperature. Incubation of eggs below 29 degree C results in 100% males, whereas incubationa bove 30 degree C results in 100% potential females at hatching. Therefore, the threshold temperature lies between 29 and 30 degree C as has been found for other marine turtles (Caretta caretta, Chelonia mydas ). Among hatchlings from natural nests in French Guiana, 10% were males, 20% were potential females and 70% had an intermediate phenotype. The sand temperature at 60 cm of depth, near one nest, was recorded and was found to vary between 29 and 30 degree C during the presumed thermosensitive period. These results will be useful to marine turtle hatcheries which seek to manipulate sex ratios among their neonates. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1983/acte-1241.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1241/ | Partager |
The culture of Hoplosternum littorale : State of the art and perspectives Auteur(s) : Luquet, P Boujard, Thierry Planquette, P Moreau, Y Hostache, G Éditeur(s) : Actes de colloques Ifremer, Tahiti, French Polynesia, 20 Feb - 4 Mar 1989, n°9, chap. 48, pp.511-516 Résumé : Hoplosternum littorale is a siluriform fish of very high commercial value in some countries of South America. Some biological characteristics as easy spawning in confinement and good tolerance of low oxygen level make it easy to cultivate. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1989/acte-1491.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1491/ | Partager Voir aussi Fish ponds Incubation Brood stocks Circadian rhythms Sexual maturity Sex ratio Rearing Respiration Survival Diets Télécharger |
Nutrition, digestion et développement des larves de crevettes et poissons marins Auteur(s) : Cahu, Chantal Résumé : This report is presented by Chantal Cahu for obtaining accreditation to supervise research. Since 1981, her research activity has addressed the study of reproducers' nutrition and the young stages of development of marine organisms belonging to two different branch lines, crustaceans and fish. This work, performed in a base-lined research body, IFREMER, is placed within a more general programme of aquaculture development. Indeed, whatever species are at issue, the development of aquaculture in France, as at the global level, is based on the production of juveniles in hatcheries. My work has therefore more precisely the goal of acquiring knowledge about the nutritional needs, mechanisms of digestion and the development of these animals in order to improve the production of prawn post-larvae and fish alevin in the hatchery.
This work took place in three main periods that appear in this report:
- The study of reproducers' nutrition and its influence on the quality of the Penaeid prawn's eggs and larvae. My work has focused mainly on the effect of lipids and vitamins on the development of eggs and larvae.
- The study of the ontogenesis of the digestive functions and the nutritional needs of sea fish larvae, with bass as the model. The goal was to determine the specific nutritional needs of the young stages by studying the implementation and regulation of pancreatic and intestinal digestive enzymes.
- The study of the regulation of certain developmental genes by means of nutrients, so as to understand how these nutrients behave during ontogenesis, particularly during development of the skeleton.
Ce mémoire est présentée par Chantal Cahu pour pour l'obtention d'une habilitation a diriger des recherches. Depuis 1981, son activité de recherche concerne l'étude de la nutrition des reproducteurs et des jeunes stades de développement d'organismes marins appartenant à deux embranchements différents, les crustacés et les poissons. Ce travail réalisé dans un organisme de recherche finalisée, l'Ifremer, se situe dans un programme plus général de développement de l'aquaculture. En effet, quelles que soient les espèces en jeu, le développement de l'aquaculture en France comme au niveau mondial repose sur la production de juvéniles en écloserie. Mon travail a donc plus précisément pour objectif l'acquisition de connaissances sur les besoins nutritionnels, les mécanismes de digestion et le développement des ces animaux afin d'améliorer la production de post-larves de crevettes et d'alevins de poissons en écloserie. Ce travail s'est déroulé en trois grandes périodes qui apparaissent dans ce mémoire : - L'étude de la nutrition des reproducteurs et son influence sur la qualité des oeufs et des larves de crevettes Pénéides. Mon travail a essentiellement porté sur l'effet des lipides et des vitamines sur le développement des oeufs et des larves. - L'étude de l'ontogenèse des fonctions digestives et les besoins nutritionnels des larves de poissons marins, avec le bar comme modèle. Le but était de déterminer les besoins nutritionnels spécifiques des jeunes stades, en étudiant la mise en place et la régulation des enzymes digestives pancréatiques et intestinales. - L'étude de la régulation de certains gènes du développement par les nutriments, de façon à comprendre comment ces nutriments agissent lors de l'ontogenèse, notamment lors du développement du squelette. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/rapport-2086.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2086/ | Partager Voir aussi Skeleton development Vitamins Nutriment Fish larvae Egg quality Reproduction Nutrition Shrimp larvae Peneids Télécharger |
Marine cage fish farming Auteur(s) : Espeut, P. Harache, Yves Lemarie, Gilles Ricard, Jean-marc Résumé : Marine capture fisheries in Jamaica is primarily artisanal in nature ansd is conducted maiinly by fishermen operating from canoes. Approximately 95% of these fishermen operate on the coastal shelf and its associated banks. The commercial species harvested comprise bottom-dwelling, coral reef species and free swimming species of finfish. Other fishery resources of commercial value include marine shrimp, conch and lobsters. Catch statistics are not available for all species, but the Department of Fisheries reports a slight decline in fishery production with production decreasing from 16 milion lbs in 1990, despite the fact that fishing efforts have doubled. Over this period the number of registered fishermen has grown from 12 000 to 16 000, al of whom are engaged in full-time fishing. There arealso part-time fishermen who are not registered. The decline in fish catch is accompanied by a decrease in fish size and quality, suggesting that the fisheries are under pressure and have already exceeded optimum production in relation to vailable resources. As a result the economic returns to fishermen are declining. There are also other problems, such as high incidence of conflicts among fishermen at sea, the high cost of purchasing boats, outboard engine fuel, and equipment, with together with the dangers involved in fishing offshore (piracy, and praedial larceny) create serious social ans economic difficulties for fishermen. Notwithstanding, there is an apparent move on the part of the fishermen to leave the industryor to seek alternative forms of employment. In fact, the Department ofFisheries reports that it is still reciving applications for new licences to operate fishing boats. This is probably due to the fact that where the basis of a community is fishing, it becomes difficult to introduce alternative forms of employment, such as cottage industries, village crafts and other trades. In 1987 the Jamaica Department of Fisheries prepared a Management plan which proposed several conservation measures to promote the efficient use of fisheries resources and to control the development of the Fishery in such a way that the country would receive highest benefits. Adequate attention was given to limitations on fishing gear, institution of closed seasons and related legislation. Strategies to diversify the marine fishing were also proposed. The 1990 five year Devlopment Plan for marine fisheries also focuses on proper resource management in order to reverse trends associated with the overexploitation of marine resources. According to the plan, emphasis will be placed on inland fisheries and mariculture in order to reduce pressure on the fisheries. Inland fisheries in the form of freshwater fish fanning has expanded significantly over the past 10 years with production increasing from less than 0,5 million lbs. in 1980 to in excess of 6.0 million lbs. in 1989. However, some freshwater fish farmers are already experiencing serious competition for water usage and, to a lesser extent for land from crop-producing farmers. The Ministry of Agriculture is of the view that marine cage culture technologically has the potential for introduction in Jamaica . This technologyhas been successfully developed in Norway and the technology is currentlty being experimentally utilized in several countries in the area. The technology, if widely utilized in Jamaica, couls significantly reduce pressure on fisheries, making fishing more cost effective and improve the economic returns to fishermen. Already there exist some technical and institutional capabilities in Jamaica to support commercial development of marine cage culture. The Department of Fisheries has highly trained personnel in aquaculture and marine fisherie, some of whom are directly responsible for the success of freshwater fish fanning. In adition, the Marine Laboratory at the Univesity of the West Indies (UWI) is caarying research on hatchery facilities for marine cage farming. The Department of Fisheries will seek the collaboration ofg the marine unit at UWI which could provide fingerlings of selected marine species for cage 1 Les pêcheries de captage marin en Jamaïque sont principalement de nature artisanale et elles sont dirigées principalement par les pêcheurs qui travaillent depuis des canoës. Environ 95 % de ces pêcheurs travaillent sur la plaine côtière et ses bancs associés. Les espèces commerciales récoltées comprennent les espèces benthiques, les espèces de corail et les espèces de poisson marin de nage libre. D'autres ressources de pêcheries de valeur commerciale comprennent la crevette, la conque et le homard. Les statistiques des pêches ne sont pas disponibles pour toutes les espèces, mais le Département des Pêcheries fait état d'une légère réduction de production de pêcheries, la production se réduisant de 16 millions de livres en 1990, en dépit du fait que les efforts de la pêche ont doublé. Sur cette période le nombre de pêcheurs inscrits a augmenté de 12 000 à 16 000, dont tous sont occupés à plein temps à la pêche. Il y a aussi des pêcheurs à mi-temps qui ne sont pas inscrits. La réduction des pêches est accompagnée d'une réduction de la taille et la qualité des poissons, ce qui implique que les pêcheries sont sous pression et qu'elles ont déjà dépassé la production optimum par rapport aux ressources disponibles. En conséquence, les rendements pour les pêcheurs sont en baisse. Il y a aussi d'autres problèmes, tels qu'un taux élevé de conflits entre les pêcheurs en mer, le coût élevé pour acheter les bateaux, le combustible pour les moteurs hors-bord, et le matériel, ainsi que les dangers impliqués dans la pêche offshore (le piratage, et le vol prédial) ont créé de graves problèmes sociaux et économiques pour les pêcheurs. Néanmoins, il y a une tendance évidente chez les pêcheurs de quitter l'industrie ou de chercher du travail dans d'autres domaines. En fait, le Département des Pêcheries signale qu'il continue de recevoir des demandes de nouveaux permis pour opérer les bateaux de pêche. Ceci est probablement attribuable au fait que là où la base d'une communauté est la pêche, il est difficile d'y introduire des formes alternatives de travail, telles que l'industrie artisanale, l'artisanat de village ou d'autres métiers. Le Département des Pêcheries de la Jamaïque a préparé en 1987 un Projet de gestion qui proposait plusieurs mesures de conservation afin d'encourager l'utilisation efficace des ressources des pêcheries et de contrôler le développement de la Pêcherie de manière que le pays touche le plus de bénéfices. Une attention adéquate a été prêtée aux limitations sur les engins de la pêche, l'établissement de saisons de clôture et les législations associées. Des stratégies pour diversifier la pêche marine ont aussi été proposées. Le Plan de développement quinquennal de 1990 pour les pêcheries marines met l'accent aussi sur la gestion de ressources appropriée afin de faire reculer les tendances associées à la surexploitation des ressources marines. Selon le plan, l'accent sera mis sur les pêcheries intérieures et la mariculture afin de réduire la pression sur les pêcheries. Les pêcheries intérieures, sous la forme de l'élevage de poissons en eau douce, ont pris leur essor sur les 10 dernières années avec une production qui s'est élevée de moins de 0,5 millions de livres en 1980 pour atteindre en 1989 plus de 6.0 millions de livres. Cependant, certains pisciculteurs en eau douce expérimentent déjà une concurrence sérieuse avec les agriculteurs pour l'usage de l'eau et, dans une moindre mesure, de la terre. Le Ministère de l'Agriculture est de l'avis que l'élevage en cage marine a technologiquement le potentiel d'être introduit en Jamaïque. La technologie a été développée avec réussite en Norvège et plusieurs pays dans la région utilisent actuellement la technologie expérimentalement. La technologie, si elle était utilisée en Jamaïque, pourrait réduire de façon significative la pression sur les pêcheries, ce qui rendrait la pêche plus économique et améliorerait les rendements aux pêcheurs. Certaines capacités techniques et institutionnelles existent déjà en Jamaïque qui pourraient soutenir le développement de l'élevage en cage marine. Le Département des Pêcheries a un personnel bien formé en aquaculture et pêcherie marine, dont certains qui sont directement responsables du succès de la pisciculture en eau douce. Par ailleurs, le Laboratoire Marin à l'Université des Antilles (UWI) mène des recherches sur les installations d'écloseries pour l'élevage en cage marine. Le Département des Pêcheries demandera la collaboration de l'unité marine à l'UWI qui pourra fournir des saumoneaux d'espèces marines sélectionnées pour la cage 1. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1993/rapport-1918.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1918/ | Partager |
Marqueurs microsatellites chez l'huître plate Ostrea edulis l. : caractérisation et applications à un programme de sélection pour une résistance au parasite Bonamia ostreae et à l'etude de populations naturelles Auteur(s) : Launey, Sophie Éditeur(s) : Institut national agronomique Paris Grignon Résumé : The flat oyster Ostrea edulis L. is the indigenous oyster of the Atlantic as well as the Mediterranean coasts of Europe. Its commercial exploitation dates back to Antiquity but its breeding is now threatened by two parasitic protozoa, among which Bonamia ostreae. Various aspects of the genetics of this species' natural and farmed populations have been studied with the aid of microsatellite markers. At first, the implementation and the screening of two partial genomic libraries made it possible to identify 28 new microsatellite loci. Analysis of the segregation of 12 of these loci and of two enzymatic loci shows that most microsatellite loci are transmitted in a Mendelian way, but some loci have significant segregation distortions. Moreover, seven linkage groups, of which four contain at least two markers, were identified in Ostrea edulis. The genetic variability of three populations selected for one or two generations for resistance to Bonamia ostreae was analysed with the aid of 5 microsatellite loci. In spite of the absence of genealogical data, we have shown that these selected populations were descended from a very low number of founding genitors (from 3 to 15 depending on the population) and for two populations, we were able to reconstruct the genealogy and the relationships between the individuals were identified. These selected populations have, in addition to a very low genetic variability, real and at times high levels of consanguinity. These results have a significant implication for the continuation of the selection programme (consanguinity management, augmentation of genetic variability by introducing wild genitors). The geographical structuring of the genetic variability of natural populations of Ostrea edulis has been analysed with the aid of 5 microsatellite loci on a sampling covering almost the entire distribution area of the species (from Norway to the Adriatic Sea). The results are consistent with those published in the literature and using enzymatic markers. The populations show a low level of differentiation that could correspond to a model of isolation by distance. The Atlantic populations, which have a reduced polymorphism, could be descended from post-glacial recolonisation from Mediterranean populations that had survived the glaciations of the Quaternary Period. The current distribution of flat oyster populations is surely also subject to anthropogenic activities. Finally, the genetic bases of the heterozygosis-growth correlation were studied in a natural population with the aid of enzymatic and microsatellite markers. Although leads favouring the direct contribution of enzymatic loci have been found, biases in the sampling design make it impossible to come to a formal conclusion. However, this study has made it possible to show that the capture of individuals over a short period (around ten days) leads to a sampling of a population descended from a very low number of founding genitors, in contradiction with the generally accepted idea that marine bivalve populations are large panmictic populations with significant, efficient numbers. These results confirm in a natural population the observations of a significant reduction of efficient sizes in hatchery populations. L'huître plate Ostrea edulis L. est l'huître indigène des côtes européennes aussi bien atlantiques que méditerranéennes. Son exploitation commerciale remonte à l'Antiquité mais son élevage est aujourd'hui menacé par deux protozoaires parasites dont Bonamia ostreae. Différents aspects de la génétique des populations naturelles et cultivées de cette espèce ont été étudiés à l'aide de marqueurs microsatellites. Dans un premier temps, la réalisation et le criblage de deux banques génomiques partielles ont permis l'identification de 28 nouveaux locus microsatellites. L'analyse de la ségrégation de 12 de ces locus et de deux locus enzymatiques montre que la plupart des locus microsatellites sont transmis de façon mendélienne, mais certains locus présentent des distorsions de ségrégation importantes. Par ailleurs, sept groupes de liaison dont quatre contiennent au moins deux marqueurs ont été identifiés chez Ostrea edulis. La variabilité génétique de trois populations sélectionnées depuis une ou deux générations pour une résistance à Bonamia ostreae a été analysée à l'aide de 5 locus microsatellites. Malgré l'absence de données généalogiques, nous avons montré que ces populations sélectionnées étaient issues d'un très faible nombre de géniteurs fondateurs (de 3 à 15 selon les populations) et pour deux populations, la généalogie a pu être reconstituée et les liens de parenté entre les individus ont été identifiés. Ces populations sélectionnées présentent, outre une très faible variabilité génétique, des niveaux de consanguinité réels et parfois élevés. Ces résultats ont une implication importante pour la continuation du programme de sélection (gestion de la consanguinité, augmentation de la variabilité génétique par introduction de géniteurs sauvages). La structuration géographique de la variabilité génétique des populations naturelles d'Ostrea edulis a été analysée à l'aide de 5 locus microsatellites sur un échantillonnage couvrant presque toute l'aire de répartition de l'espèce (de la Norvège à la Mer Adriatique). Les résultats sont cohérents avec ceux publiés dans la littérature et utilisant des marqueurs enzymatiques. Les populations montrent un niveau de différenciation faible qui pourrait correspondre à un modèle d'isolement par la distance. Les populations atlantiques, qui présentent un polymorphisme réduit, pourraient être issues de recolonisation post-glaciaire à partir de populations méditerranéennes ayant survécu aux glaciations du Quaternaire. La répartition actuelle des populations d'huître plate est certainement aussi soumise aux actions anthropiques. Enfin, les bases génétiques de la corrélation hétérozygotie-croissance ont été étudiées dans une population naturelle à l'aide de marqueurs enzymatiques et microsatellites. Bien que des pistes en faveur de la contribution directe des locus enzymatiques aient été trouvées, des biais dans le dispositif expérimental ne permettent pas de conclure de façon formelle. Cependant, cette étude a permis de montrer que le captage d'individus sur une faible période (une dizaine de jours) conduit à l'échantillonnage d'une population issue d'un nombre très réduit de géniteurs fondateurs, en contradiction avec l'idée reçue que les populations de bivalves marins sont de larges populations panmictiques à effectif efficace important. Ces résultats confirment dans une population naturelle les observations de réduction importante des tailles efficaces dans des populations d'écloserie. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1998/these-1919.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1919/ | Partager |
Mono- and polychromatic inner shell phenotype diversity in Pinctadamargaritifera donor pearl oysters and its relation with culturedpearl colour Auteur(s) : Ky, Chin-Long Lo, Cédrik Planes, Serge Auteurs secondaires : Ecosystèmes Insulaires Océaniens (UMR 241) (EIO) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD) - Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER) - Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD) - Université de la Polynésie Française (UPF) Direction des Ressources Marines et Minières Laboratoire d'Excellence CORAIL (LabEX CORAIL) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD) - Université des Antilles et de la Guyane (UAG) - École des hautes études en sciences sociales (EHESS) - École pratique des hautes études (EPHE) - Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER) - Université de la Réunion (UR) - Université de la Polynésie Française (UPF) - Université de Nouvelle Calédonie - Institut d'écologie et environnement Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement (CRIOBE) ; Université de Perpignan Via Domitia (UPVD) - École pratique des hautes études (EPHE) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier Résumé : International audience The pearl oyster Pinctada margaritifera has the specific ability to produce pearls with the widest range of coloursamong all pearl oyster species. This pearl colour diversity originates from the mantle biomineralising tissue(graft) of the donor oyster, which is originally responsible for the variety of colours of the inner shell surface.This study aimed to: 1) assess the geographic distribution and establish a first stocklist of the colourful oysterphenotypes used as donors in French Polynesia, and 2) investigate the phenotypic relation between inner shellcolouration and the corresponding colour of harvested pearls. With the support of a pearl farmers' network,we investigated the different donor phenotype frequencies among five collection sites (Ahe, Apataki, Takaroa,TakumeandMangareva).Thisdonorevaluationwasmadeduringgraftingofpearloysters(N=49,938)obtainedfrom collector stations. Results showed that pearl production is mainly based on six common colourful donorphenotypes classified as monochromatic and polychromatic profiles, which shown different frequenciesamongthecollectionsites.Experimentalgrafts(N=4640)werethenrealisedandsubsequentcultureconductedat a single site in order to avoidpearl colour variation due to environmental influences. Traceability between do-nors (N = 232) and pearls (N = 2776), revealed that: 1) yellow (gold) and aubergine (reddish) pearls could bemostlyobtainedbyusingthemonochromaticyellowandreddonor phenotypes,respectively,and2)onethirdtoonequarterofgreypearlswasinevitablyharvested,whateverthepolychromaticphenotypechosenasthedonor,which leaves at least half the harvest composed of the attractive green and peacock colours. This preliminarystocklist of colour range together with analysis of the colour phenotype transmission between inner shell andpearl provide the basis for producing multiple pearl oyster “colour lines” through hatchery propagation andwould be helpful for future selective breeding programs.Statement of relevance: Donor shell colour selection predict colours of pearls ISSN: 0044-8486 hal-01489247 https://hal-univ-perp.archives-ouvertes.fr/hal-01489247 DOI : 10.1016/j.aquaculture.2016.10.017 | Partager |
Dix ans de production en ecloserie de mollusques bivalves Auteur(s) : Leborgne, Y Éditeur(s) : Actes de colloques. Ifremer. Brest [ACTES COLLOQ. IFREMER.]. 1985 Résumé : SATMAR has developed techniques and methods allowing a production of over 100 million spat per year at a size from 2 to 10 millimetres. Among the 13 species concerned by this production, 3 of major importance are the oysters Crassostrea gigas, Ostrea edulis and the Japanese little neck clam, Ruditapes philippinarum . The hatchery production could easily be doubled if the market would increase. Current research tend to increase the quality of the products by means of genetics and to lower the costs by improving the nursery phase. La Société Atlantique de Mariculture a développé des techniques et des méthodes permettant la production annuelle de plus de l00 millions de naissains d'une taille de 2 à 10 millimètres. Parmi les 13 espèces concernées par ces productions les 3 principales sont les huîtres Crassostrea gigas, Ostrea edulis, et la palourde du Pacifique, Ruditapes philippinarum. La production de l'écloserie pourrait facilement doubler si le marchess développait. Les recherches actuelles portent sur l'amélioration de la qualité des produits par la sélection génétique et un abaissement du prix de revient par l'optimisation des performances au niveau de la phase nurserie. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1983/acte-1184.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1184/ | Partager |
Apport d'un programme de génétique à une filière de production aquacole : l'exemple de l'ostréiculture Auteur(s) : Lapegue, Sylvie Bedier, Edouard Goyard, Emmanuel Degremont, Lionel Baud, Jean-pierre Gerard, Andre Goulletquer, Philippe Boudry, Pierre Éditeur(s) : Styli 2003. Trente ans de crevetticulture en Nouvelle-Calédonie. Nouméa - Koné, 2-6 juin 2003. 2004. Gorarant C, Harache Y, Herbland A, Mugnier C. Ed. Ifremer, Actes de Colloque, n°38, pp.113-120 Résumé : Two oyster species are currently present along the French coasts : the indigenous European flat oyster (Ostrea edulis), and the Pacific cupped oyster (Crassostrea gigas), that has been introduced from Japan since the beginning of the 70ies. The flat oyster successively suffered from two protozoan diseases during the 60ies and its production decreased from 20 000 tons/year by that time to 1 500 tons/year nowadays. Consequently, the oyster production is principally (99%) based upon the Pacific oyster species with approximately 150 000 tons/year among which 90% are grown from the natural spat. However, the hatchery production of this species is developing and was estimated to 400 to 800 millions spat in 2002. Moreover, strengthened relationships between IFREMER and the 5 commercial hatcheries, that all joined the SYSAAF (Union of the French poultry, shellfish and fish farming selectors), allow to plan for new genetic breeding programs. At the end of the 80ies, IFREMER initiated a genetic breeding program for the resistance of the European flat oyster to the bonamiosis, and obtained strains more tolerant to this disease. After two generations of massal selection, molecular markers had identified a reduced genetic basis in this program. It was then reoriented to an intra-familial selection. However, we were confronted to a zootechnic problem to manage such a scheme and we compromised by an intra-cohorts of families selection scheme managed using molecular markers. The program has now reached the transfer level with experimentation at a professional scale. Concerning the Pacific cupped oyster, and in parallel with the obtaining and the study of polyploids, performance of different Asian cupped oyster strains were compared to the one introduced in France thirty years ago and currently suffering from summer mortalities. The local strain exhibited better performance, certainly based upon a good local adaptation. In other respects, although early growth is a relevant criteria for selection for growth to commercial stage, it is not to be privileged in the context of an oyster producing region with a limited food availability. Contrary, the spat summer mortality became a priority for numerous teams (genetic, physiology, pathology, ecology,...) joined in the MOREST program. The first results showed important survival differences between fullsib and halsib families. They indicate a genetic determinism to this character "survival" and promote for its selection. Deux espèces d'huîtres sont aujourd'hui présentes sur les côtes françaises : l'huître plate européenne (Ostrea edulis), indigène, et l'huître creuse du Pacifique (Crassostrea gigas), introduite du Japon dans le début des années 1970. L'huître plate a subi coup sur coup, dans les années 1960, deux maladies dues à des protozoaires parasites et sa production est ainsi passée de 20 000 t/an dans les années 1960 à 1500 t/an aujourd'hui en France. Il en résulte que la filière ostréicole française repose quasiment exclusivement (99%) sur la production de l'huître creuse, C. gigas, avec 150 000 tonnes en 2000 dont environ 90% est issu du captage naturel. Cependant, la reproduction de cette espèce en écloserie est actuellement en expansion avec une estimation de 400 à 800 millions de naissains commercialisés en 2002. Des rapports renforcés entre l'IFREMER et les cinq écloseries françaises de la filière ostréicole, qui adhèrent toutes au SYSAAF (SYndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français), permettent désormais d'envisager le développement de nouveaux programmes d'amélioration génétique. A la fin des années 1980, un programme de sélection pour la résistance de l'huître plate à la bonamiose a été initié au sein de l'IFREMER, et a permis d'obtenir des souches plus tolérantes à cette maladie. Après deux générations en sélection massale, les marqueurs moléculaires avaient mis en évidence une base génétique réduite au sein de ce programme qui s'était alors orienté vers une sélection intra-familiale. Devant la lourdeur zootechnique d'un tel schéma, un compromis a été trouvé en réalisant une sélection au sein de cohortes de familles biparentales, la gestion de ces cohortes étant permise par les analyses moléculaires. Le programme est maintenant dans sa phase de transfert, avec des expérimentations à plus grande échelle en partenariat avec la profession. En ce qui concerne l'huître creuse, et en parallèle de l'obtention et l'étude de polyploïdes, les performances de différentes souches d'huîtres creuses provenant d'Asie ont été comparées à celles de la souche introduite en France il y a trente ans, sujette à des mortalités estivales. La souche locale présente de meilleures performances, vraisemblablement grâce à une adaptation bien réalisée. Par ailleurs, bien que l'amélioration de la croissance jusqu'à la taille commerciale s'avère possible par une sélection précoce au stade larvaire, le critère de croissance n'est pas nécessairement à privilégier dans le contexte d'un bassin ostréicole disposant de ressources trophiques limitées. En revanche, les importantes mortalités rencontrées par le naissain en périodes estivales constituent le sujet d'étude prioritaire sur lequel se sont penchées de nombreuses équipes (génétique, physiologie, pathologie, écologie, ...) dans le cadre du grand défi MOREST. Les premiers résultats ont mis en évidence de fortes différences de survie entre des familles biparentales d'animaux indiquant un déterminisme génétique du caractère « survie », et encourageant dans la voie d'une sélection pour ce caractère. Droits : 2004 Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-3491.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3491/ | Partager Voir aussi Growth Selection Genetic breeding Genetic Ostrea edulis Crassostrea gigas Oysters Croissance Sélection Amélioration génétique Télécharger |