Éditeur(s) : HAL CCSD Réseau « Développement durable et territoires fragiles »
Résumé : La Trame verte et bleue (TVB), nouveau dispositif d'action publique visant à enrayer la perte de biodiversité traduit un renouvellement des référentiels de justification des politiques de conservation et de leur stratégie territoriale. Il s'agit d'intégrer la planification écologique dans l'aménagement de l'ensemble du territoire. Le processus de territorialisation de la TVB met en rapport de multiples niveaux de décision et d'action imbriqués. Il crée de ce fait des configurations inédites de complexité et d'incertitude et implique des innovations en termes de gouvernance que le cadre analytique de la gouvernance adaptative permet d'appréhender. En nous appuyant sur l'exemple du Parc Naturel Régional des Volcans d'Auvergne, nous analysons le rôle que ces institutions sont susceptibles de jouer dans ces dynamiques de changement et d'apprentissage socio-technique et politique qui conditionnent une mise en œuvre effective de la TVB.
Développement Durable et territoires

hal-00979610
https://hal-agroparistech.archives-ouvertes.fr/hal-00979610

Éditeur(s) : HAL CCSD SAGE Publications
Résumé : International audience
The distribution of redox-sensitive elements (V, U, Mo, Mn) was studied in a sedimentary archive of the Pierre-Blanche lagoon encompassing 3500 years of sedimentation. Between 240 and 255 cm (i.e. between 0 and 350 cal. ad) in the core, there was a dark layer with no mollusc shells. Enrichments of V, U and Mo and depletion of Mn were observed in this layer compared with overlying and underlying sediments. This was attributed to the occurrence of anoxia in bottom water or at the sediment/water interface during the Roman period. This episode was concomitant with the formation of a sandy barrier, which now isolates the lagoon from the sea. Our results suggest that the isolation of the lagoon, which was deeper in the period concerned than at present, favoured stagnation of the water. Combined with the excess nutrient inputs because of human activities in Lattara harbour, stagnation may have caused anoxia in bottom water at least in some parts of the Palavasian lagoon system. Bottom conditions nevertheless remained sufficiently reducing for the accumulation of U and Mo to persist until around 800 cal. ad. Although the lagoon has been hyper-eutrophic since at least the middle of the 20th century and although anoxia occurs frequently in summer, redox proxies show no evidence for their occurrence. The shallow water and associated resuspension and reoxidation events explain the lack of V, Mo and U enrichment in recent sediments.
ISSN: 0959-6836

hal-01062151
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01062151

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer
Résumé : International audience
We present here a synthesis of the evolution of rifted continental margin systems in the Gulf of Aden. These margins are volcanic to the west of the Gulf of Aden, where they are influenced by the Afar hotspot, and non-volcanic east of longitude 46° E. The combined use of magnetics, gravity, seismic reflection, field observations (tectonic, stratigraphic and sedimentological) and oil well data allowed us to obtain better constraints on the timing of continental rifting and seafloor spreading. From the Permo-Triassic to the Oligocene, the Arabian-African plate was subject to distributed extension, probably due, at least from the Cretaceous, to tensile stresses related to the subduction of the Tethysian slab in the north. In Late Eocene-Early Oligocene, 34-33 Ma ago, rifting started to localise along the future area of continental breakup. Initially guided by the inherited basins, continental rifting then occurred synchronously over the entire gulf before becoming localised on the northern and southern borders of the inherited grabens, in the direction of the Afar hotspot. In the areas with non-volcanic margins (in the east), the faults marking the end of rifting trend parallel to the inherited grabens. Only the transfer faults cross-cut the inherited grabens, and some of these faults later developed into transform faults. The most important of these transform faults follow a Precambrian trend. Volcanic margins were formed in the west of the Gulf, up to the Guban graben in the southeast and as far as the southern boundary of the Bahlaf graben in the northeast. Seaward dipping reflectors can be observed on many oil industry seismic profiles. The influence of the hotspot during rifting was concentrated on the western part of the gulf. Therefore, it seems that the western domain was uplifted and eroded at the onset of rifting, while the eastern domain was characterised by more continuous sedimentation. The phase of distributed deformation was followed by a phase of strain localisation during the final rifting stage, just before formation of the Ocean-Continent Transition (OCT), in the most distal graben (DIM graben). About 20 Ma ago, at the time of the continental break-up, the emplacement of the OCT started in the east with exhumation of the subcontinental mantle. Farther west, the system was heated up by the strong influence of the Afar hotspot, which led to breakup with much less extension. In the Gulf of Aden (s.str), up to the Shukra El Sheik fracture zone, oceanic spreading started 17.6 Ma ago. West of this fracture zone, oceanic accretion started 10 Ma ago, and 2 Ma ago in the Gulf of Tadjoura. Post-rift deformation of the eastern margins of the Gulf of Aden can be seen in the distal and proximal domains. Indeed, the substantial post-rift uplift of these margins could be associated with either the continental break-up, or activity of the Afar hotspot and related volcanic/magmatic activity. Uplift of the northern proximal margin was still active (e.g. stepped beach rocks exposed at 60 m of 2 Ma; 30 m of 35,200 years; 10 and 2 m) and active volcanoes can be inferred at depths of between 70 and 200 km beneath the margin (at 5-10 km distance from the coast). On the distal margin, heat flow measurements show a high value that is associated with post-rift volcanic activity and the development of a volcano (with flows and sills) shortly after the formation of the OCT. The Afar hotspot is therefore important for several reasons. It allows the localisation of deformation along the Red Sea/Aden system and the rapid opening of the Gulf after the continental break-up; its influence also seems to persist during the post-rift period.
ISSN: 1866-7411

hal-01053089
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01053089
DOI : 10.1007/s12517-011-0475-4

Éditeur(s) : Université des Antilles AREBio Groupe de recherche BIOSPHERES : BIOlogie, Sciences Physiques & Humaines pour les énergies Renouvelables, l
Extrait de : 1er colloque international BIOSPHERES, du 18 au 20 juin 2019. Université des Antilles
Description : Au-delà des pertes matérielles et humaines, les catastrophes naturelles peuvent générer des troubles psychiques importants, comme le syndrome de stress post-traumatique (TSPT), qui perdure plusieurs années et génère une grande souffrance. On s'est particulièrement intéressé à l'apparition de TSPT, en lien avec le soutien social et l'attachement au lieu, puisque ces facteurs sont susceptibles de médiatiser certains symptômes, comme l'évitement ou la reviviscence. Les résultats, obtenus auprès de sinistrés, mettent en évidence ces liens, notamment concernant l'attachement affectif au domicile et à la ville. Ils permettent ainsi de réfléchir d'une part à une prise en charge des victimes intégrant ces aspects, et d'autre part à l'information et à la communication, notamment en amont et au moment de l'alerte.

Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
Permalien : http://www.manioc.org/fichiers/V19085
V19085

Résumé : This work is in line with the fishing technology section of the DUHAL (Durability of Halieutic activities) action. It aims to reduce the "side" catches associated with shrimp fishing in French Guyana. Shrimp trawling is indeed considered as one of the fishing activities which generates the most waste. The campaign carried out in November/December 2006 had lead to the following conclusions [...]
Ce travail s'inscrit dans le volet technologie pêche de l'action DUHAL (DUrabilité des activités HALieutiques). Son objectif est de réduire sensiblement les captures accessoires associées à la pêche crevettière guyanaise. En effet, le chalutage crevettier est considéré comme une des activités de pêche professionnelle le plus génératrices de gaspillage. La campagne menée en novembre/décembre 2006 avait conduit aux conclusions suivantes : Fenêtre à mailles carrées de 100 mm Les dispositifs à mailles carrées de 100 mm à la jauge, placés sur le dessus de la rallonge, occasionnent des pertes très importantes en crevettes commerciales. Différentes raisons peuvent expliquer ce résultat : − L'emplacement de la fenêtre est sans doute trop près de la poche. Le périmètre de la poche est de 120 mailles de 45 mm à la jauge, or la dimension de la fenêtre est peut être trop importante par rapport à ce périmètre. − Un maillage réduit pourrait diminuer ces pertes. Les résultats sur les poissons de grande taille indiquent une capture plus importante avec le chalut sélectif. L'amélioration de la filtration du chalut imputable aux grandes mailles peut expliquer ce phénomène déjà rencontré dans d'autres pêcheries. Les résultats sur les rejets sont encourageants. Fenêtre à mailles carrées de 70 mm Le dispositif à mailles carrées de 70 mm à la jauge, placé sur le dessus du gorget, occasionne encore des pertes en crevettes non négligeables, bien que sérieusement réduites par rapport au dispositif à mailles de 100 mm. L'action sur les animaux de grande taille est faible. La réduction des captures accessoires (8%) est plus modeste qu'avec le dispositif précédent (23 et 30%). TED L'usage du TED conduit à une perte en crevettes encore importante (23%). Considérant les conditions de pêche guyanaises, on peut envisager d'ajouter à l'avant de la grille un voile concentrateur. Ce dernier permettra de canaliser les différents animaux sur le bas de la grille avant le tri et permettra sans doute de réduire les pertes en crevettes. L'action sur les animaux de grande taille est assez sensible, en particulier sur les raies. L'action sur les rejets est visible (25%) et va dans le sens de la réduction du « gaspillage » pour cette pêcherie.Suite à ces essais et aux travaux menés en juillet 2006, une nouvelle campagne d'essais a été programmée pour valider définitivement les résultats liés à l'usage d'un TED et pour tester un nouveau dispositif sélectif (grille Nordmore) associé à un BRD (Bycatch Reducing Device) particulier, le RES (Radial Escape Section).

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/rapport-6683.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6683/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : The present PhD thesis is devoted to the numerical simulation and analysis of shear on cohesive granular materials. In the framework of the Contact Dynamics method, we developed a model of cohesive bonding, which mimics cohesion by cementation. This model involves three contact strength parameters (a tensile strength, a coefficient of sliding friction, and a coefficient of rolling friction) as well as a local criterion, which controls the creation and the breaking of cohesive bonds. All contacts are cohesive at the beginning of the numerical simulations, and contact rupture leads to an irreversible loss of tensile strength (debonding). We varied systematically the three contact strength parameters and studied their influence on the shear strength, the dilatancy, and the microstructure of the granular media. Our results show that internal friction and macroscopic tensile strength have different origins at the contact scale. We also find that the microstructure of the granular media, when sheared at the steady state (also known as the `critical state"), is strongly affected by the local coefficients of sliding and rolling friction. In particular, the mechanical role of the weak network changes with these two contact parameters, which results from the formation of a new structure of force transmission. On the other hand, we also applied the same numerical simulation method to the simulation of landslides. We developed a methodology, which takes into account the initial morphology of the hillslope, the strength of geomaterials, and a triggering factor, integrating in the same model the initiation and propagation phases of the landslide. To illustrate this methodology, we applied it to the simulation of a hypothetical example of avalanche triggered by the progressive rise of a water table.
Ce travail de thèse porte sur la modélisation numérique et l'analyse du cisaillement dans les milieux granulaires cohésifs. Dans le cadre de la méthode de la Dynamique des Contacts, nous avons développé un modèle de cohésion qui cherche à imiter la cohésion par cimentation. Ce modèle fait intervenir trois paramètres de résistance au niveau des contacts (une résistance à la traction, un coefficient de frottement de glissement, et un coefficient de frottement de roulement) ainsi qu'un critère de création et de rupture des liens cohésifs. Les contacts sont cohésifs au début des simulations et leur rupture entraîne la perte irréversible de la résistance à la traction. Nous avons fait varier les trois paramètres microscopiques et nous avons étudié leur influence dans la résistance au cisaillement, la dilatance, et la microstructure du milieu. Nos résultats montrent que le frottement interne et l'adhésion macroscopiques ont des origines microscopiques différentes. Nous observons aussi que la microstructure du milieu cisaillé à l'état stationnaire (aussi connu comme ``l'état critique") est fortement affectée par l'angle de frottement et la résistance au roulement au niveau des contacts. En particulier, le rôle mécanique du réseau faible change avec ces deux paramètres microscopiques, ce qui résulte de la formation d'une nouvelle structure de transmission de forces. D'autre part, nous avons appliqué cette méthode de simulation numérique à l'étude d'un processus naturel : les glissements de terrain. Nous avons développé une méthodologie qui tient compte de la morphologie initiale du système, de la résistance des géomatériaux, et d'un mécanisme de déclanchement, ce qui permet d'intégrer dans le même modèle les phases d'initiation et de propagation du glissement. Pour illustrer cette méthodologie, nous l'avons appliquée à la modélisation d'un exemple hypothétique d'avalanche déclenchée par la montée progressive du niveau d'une nappe d'eau.
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00311303

tel-00311303
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00311303
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00311303/document
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00311303/file/these_estrada.pdf

Éditeur(s) : Actes de colloques. Ifremer Brest [ACTES COLLOQ. IFREMER.]. 1986
Résumé : Bacterial density of the coelenteric fluid (CF) of some anthozoan species was determined in situ and under laboratory conditions. In all species examined bacterial density of the CF was higher in the gastral cavity than in ambient ranging from 10 super(5) up to 5 x 10 super(6) cells. ml super(-1). Incubation experiments with the CF indicate that a bacterial population within the coelenteron is efficiently controlled by the CF, favoring bacterial growth if bacterial densities are low in the CF and showing clearance activity at high bacterial densities. Feeding of pre-starved anthozoans caused a rapid response of coelenteric rod-shaped bacteria. Evidence is presented that coelenteric bacteria are digested periodically although they contribute 1% to the respiratory carbon losses of the antozoans tested. Therefore, it is more likely that the coelenteric bacterial population provide other substances which cannot be synthesized by the host.
La densité des bactéries du fluide gastrique de différents anthozoaires a été déterminée in situ et au laboratoire. Pour toutes les espèces étudiées, la densité des bactéries dans le fluide gastrique était plus élevée que dans l'eau ambiante et comprise entre 105et 106 cellules m"1. Des expériences d'incubation du fluide gastrique montrent que la population bactérienne est contrôlée efficacement par ce fluide gastrique, favorisant la croissance de bactéries lorsque la densité est faible mais révélant des activités de digestion lorsque la densité est élevée. En nourrissant des anthozoaires mis àjeun plusieurs jours, on provoque une réaction rapide des bactéries déforme bacillaire. Certaines observations montrent que les bactéries gastriques se développent et sont digérées par cycle dans le coelenteron. Néanmoins, la contribution en carbone de ces dernières, comparée aux pertes d'énergie par Sa respiration, représenterait moins de i ','-£. li est probable que cette population bactérienne fournisse des substances qui ne peuvent être synthétisées par i'hôte.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1984/acte-989.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/989/

Éditeur(s) : PSIC 11 - 11th Pacific Science Inter-Congress : Pacific Countries and their Ocean: Facing Local and Global Changes / 2nd Symposium on French Research in the Pacific. March 2 - 6, 2009 Tahiti, French Polynesia.
Résumé : Experimental infections together with epidemiological studies have shown that pathogenic and non‐pathogenic isolates of V. nigripulchritudo co‐existed in shrimp farm environment (2, 3). Moreover, obtained results also demonstrated that the “summer syndrome”was caused by a single, possibly emerging, cluster of virulent strains. Consequently, it was hypothesized that pathogenic strains of V. nigripulchritudo may persist from one year to the next in the shrimp farm environment and re‐develop inside the grow‐out system at the following rearing cycle (3). This study was therefore aimed at determining whether V. nigripulchritudo isolates may survive, or not, in a shrimp pond bottom soil during a 18‐week drying period. To this end, V.nigripulchritudo mapping was performed with recently developed molecular tools and classical culture‐dependent techniques.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00197/30874/29242.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00197/30874/

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : Le changement climatique et le développement durable du tourisme représentent des enjeux majeurs pour l’avenir du tourisme dans plusieurs régions du monde, notamment aux Antilles françaises. Aussi, la présente étude se propose d’analyser et d’évaluer les effets économiques de la variation climatique sur le secteur touristique à la Guadeloupe et à la Martinique, pour quatre raisons essentielles : (a) le secteur du tourisme et les petites économies insulaires qui en dépendent, comme celles de la Guadeloupe et de la Martinique, sont fortement sensibles à la variabilité et au changement du climat. (b) la vulnérabilité intrinsèque de ces petites destinations et de leurs infrastructures à l’élévation du niveau de la mer et aux évènements climatiques extrêmes (cyclones, inondations, sécheresse), (c) la haute dépendance de l’industrie touristique régionale à l’utilisation des énergies fossiles, (d) enfin, en raison du fait qu’aucune évaluation économique chiffrée n’a été produite à ce jour sur les effets économiques de la la variation climatique sur le secteur touristique à la Guadeloupe et à la Martinique. Par conséquent, il importe de cerner dans ces deux régions les conséquences possibles de ce changement au plan touristique et d’envisager le cas échéant des stratégies d’adaptation et d’atténuation. Ce faisant, cette étude se fixe quatre objectifs principaux : (a) examiner les facteurs qui influencent la demande et l’offre de tourisme aux Antilles Françaises ; (b) effectuer à l’aide d’un modèle de demande touristique, l’impact économique de ces facteurs sur le nombre d’arrivées ainsi que sur la dépense touristique dans ces régions ; (c) évaluer et projeter en termes de coût, les effets du changement climatique sur l’activité touristique ; et (d) proposer aux autorités locales, des stratégies d’adaptation et d’atténuation face au défi du changement climatique.L’évaluation de ces différents effets est abordée ici à l’aide d’un modèle structurel de base (MSB) et d’un modèle structurel général (MSG), inspirés tous deux des travaux de Harvey (1990) pour capter à l’aide d’un indice climato-touristique, les éléments du climat qui impactent l’activité touristique. Cet indice synthétique est calculé en se basant sur les données climatiques du passé selon deux scénarios climatiques proposés par le groupe d’experts intergouvernemental sur l’évolution du climat (GIEC) – un scénario pessimiste A2, et un scénario optimiste B2-. Les résultats issus de l’application de ces modèles montrent que les caractéristiques climato-touristiques de la Guadeloupe et de la Martinique subiront vraisemblablement un déclin à long terme, et devraient au plan économique impacter négativement le secteur touristique de ces destinations, se traduisant par des pertes à la fois d’attractivité et de chiffre d’affaires du secteur. Les pertes subies par le tourisme en raison du changement climatique s’élèveraient à l’horizon 2100, et selon le scénario A2, à 45 millions d’euros à la Guadeloupe soit 0,7% de son PIB 2004, et à 60 millions d’euros à la Martinique soit 0,8% de son PIB 2004.
Climate change and the tourism sustainable development are important challenges for tourism future trends of many countries, including the French West Indies. Therefore, this study provides an evaluation of the likely economic effects of climate change on tourism sector in Guadeloupe and Martinique, and identifies four reasons why these countries should be concerned about the potential effects of climate change on tourism: (a) Guadeloupe and Martinique are island destinations very sensitive to climate change; (b) their intrinsic vulnerability and their infrastructure to sea level rise and extreme climatic events (e.g. hurricanes and floods); (c) the high dependence of their tourist industry on carbon-based fuels; and (d) up to date, no economic evaluation of climate change on tourism sector in Guadeloupe and Martinique is provided. Therefore, this study attempted to quantify the likely effects of the changes in the climatic factors on the economy of the French West Indies. There are four main objectives in this study. The first is to examine the factors that influence the demand and supply tourism in Guadeloupe and Martinique. The second is to forecast the impact of climate change to tourism arrivals until 2050 under two scenarios from the intergovernmental panel on climate change (IPCC) – A2: pessimistic scenario and B2: optimistic scenario-. Third is to evaluate and forecast the cost of climate change to the tourism sector until 2100. The fourth is to recommend to authorities the adaptation and mitigation strategies that can be undertaken by the tourism sector to French West Indies to address climate change.Following Harvey (1990), a Basic Structural Model (BSM) and a General structural Model (GSM), are employed to model tourist arrivals to Martinique. A tourism climatic index (TCI) conceptualized by Mieczkowski (1985) is used in this model to capture the elements of climate that impact on a destination’s experience. The results suggest that under both scenarios, the island’s key tourism climatic features will probably decline, and therefore, negatively impact on the destination experience of visitors. Tourism losses due to climate change are projected in 2100 to 45 millions euros in Guadeloupe, or 0.7% of its GDP, and to 60 millions euros in Martinique, or 0,8% of its GDP.
Guadeloupe
Martinique

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.6750
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/6750

Éditeur(s) : HAL CCSD BMJ Publishing Group
Résumé : International audience
OBJECTIVES: The time from the prenatal period through early childhood is an important window of vulnerability for the developing immune and respiratory systems, both sensitive to environmental chemicals such as solvents. This study sought to examine the effects of solvent exposure during the prenatal and postnatal periods on wheezing, eczema and food allergies in early childhood. METHODS: This study, based on the PELAGIE cohort, included 1505 mother-child pairs with measurements of prenatal and postnatal solvent exposures and data on wheezing, eczema or food allergies. The maternal occupation reported at inclusion, in early pregnancy allowed us to define prenatal occupational solvent exposure (by three specific job-exposure matrices). Data on prenatal and postnatal domestic solvent exposure, that is exposure to products that contain solvents, were obtained from self-administered questionnaires, once at inclusion and again when the child was 2 years old. Outcome data was collected at the 2-year follow-up. Associations between exposures and outcomes were estimated by logistic regression models, after adjustment for potential confounders. RESULTS: No association was observed between prenatal exposure to solvents and the outcomes studied. Postnatal exposure was associated with an increased risk of wheezing (OR=1.80 (95% CI 1.25 to 2.59)) which persisted after adjustment for prenatal exposure. No significant association was observed with eczema or food allergies. CONCLUSIONS: Postnatal exposure to solvent-containing products in the home may increase the risk of wheezing in early childhood. Follow-up studies are needed to determine if the health effects observed at age 2 persist at later ages.
ISSN: 1351-0711

hal-01063913
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01063913
DOI : 10.1136/oemed-2013-102036
PUBMED : 24996679

Éditeur(s) : Pêche thonière et dispositifs de concentration de poissons, Caribbean-Martinique, 15-19 Oct 1999 15-19 octobre 1999
Résumé : The development of the FAD gave rise to technical problems owing to their conception, their setting spot and of their utilisation. Failings generated by the unreliability of components or the uncertain repair precariousness, those can prove to be here more and more expensive with the progression of the ageing of devices and reasons of their loss. For as various domains that aerospace or the fishing deck layout, the engineering has functional analysis tools that permit to reduce conception uncertainties of systems by the mean of a hierarchical classification of function values of components. The application of one of these techniques, the FMEA, Failure Mode and Effects Analysis, to the study of reasons of FAD loss in La Reunion describes perfectly everything that this type of method can bring to the appraisal in fishing technology. This preventive analysis method assess the potential risks integrates perfectly in the mind of a precaution approach as it would agree to see to apply to the FADs and to their exploitation.Original Abstract: Le developpement des DCP a entraine l'apparition de problemes techniques, issus tant de leur conception, de leur lieu d'implantation que de leur utilisation. Defaillances generees par le manque de fiabilite des composants ou la precarite de reparations aleatoires, celles-ci peuvent s'averer de plus en plus couteuses au fur et a mesure du vieillissement des systemes et cause a terme de leur perte. Pour des domaines aussi divers que l'aerospatiale ou l'amenagement de pont de peche, l'ingenierie dispose d'outils d'analyse fonctionnelle qui, par le biais d'une hierarchisation des valeurs des fonctions de chaque element des systemes etudies, permettent de reduire les incertitudes de la conception. L'application d'une de ces techniques, l'Amdec, analyse des modes de defaillance et de criticite, a l'etude des causes des pertes de DCP a La Reunion illustre parfaitement tout ce que ce type de methode peut apporter a l'expertise en technologie des peches. Cette methode d'analyse preventive qui recense et met en evidence les risques potentiels s'integre parfaitement dans l'esprit d'une approche de precaution telle que celle qu'il conviendrait de voir appliquer aux DCP et a leur exploitation.

Droits : Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00042/15289/12675.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00042/15289/

Éditeur(s) : HAL CCSD Linnean Society of London
Résumé : International audience
Although migratory pelagic fishes generally exhibit little geographic differentiation across oceans, as expected from their life-history (broadcast spawning, pelagic larval life, swimming ability of adults) and the assumed homogeneity of the pelagic habitat, exceptions to the rule deserve scrutiny. One such exception is the narrow-barred Spanish mackerel (Scomberomorus commerson), where strong genetic heterogeneity at the regional scale has been previously reported. We investigated the genetic composition of S. commerson across the Indo-West Pacific range using control-region sequences (including previously published datasets), cytochrome-b gene partial sequences, and eight microsatellite loci, to further explore its phylogeographic structure. All haplotypes sampled from the Indo-Malay-Papua archipelago (IMPA) and the southwestern Pacific coalesced into a clade (Clade II) that was deeply separated (14.5% nucleotide divergence) from a clade grouping all haplotypes from the Persian Gulf and Oman Sea (Clade I). Such a high level of genetic divergence suggested the occurrence of two sister-species. Further phylogeographic partition was evident between the western IMPA and the regions sampled east and south of it, i.e. northern Australia, West Papua, and the Coral Sea. Strong allele-frequency differences were found between local populations in the southwestern Pacific, both at the mitochondrial locus (ΦST=0.282-0.609) and at microsatellite loci (^θ=0.202-0.313). Clade II consisted of four deeply divergent subclades (9.0-11.8% nucleotide divergence for the control region; 0.3-2.5% divergence at the cytochrome b locus). Mitochondrial sub-clades within Clade II generally had narrow geographic distribution, demonstrating further genetic isolation. However, one particular haplogroup within Clade II was present throughout the central Indo-West Pacific; that haplogroup was found to be sister-group to an haplogroup restricted to West Papua and the Coral Sea, yielding evidence of recent secondary westward colonization. Such a complex structure is in sharp contrast with the generally weak phylogeographic patterns uncovered to date in other widely distributed, large pelagic fishes with pelagic eggs and larvae. We hypothesize that in S. commerson and possibly other Scomberomorus species, philopatric migration may play a role in maintaining the geographic isolation of populations by annihilating the potential consequences of passive dispersal.
Biological Journal of the Linnean Society

ird-00759711
http://hal.ird.fr/ird-00759711
http://hal.ird.fr/ird-00759711/document

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
We use a strike-slip fault analog model to study experimentally the role played by along-fault non-uniform and asymmetric applied normal stress on both coseismic slip and long-term fault behavior. Our model is based on a visco-elasto-plastic multi-layered rheology that allows to produce several hundreds of scaled analog microquakes and associated seismic cycles. Uniform or heterogeneous applied normal stress along the fault plane is imposed and maintained constant during the whole experiment durations. Our results suggest that coseismic slip patterns are strongly controlled by spatial normal stress variations and subsequent accumulated shear stress along fault strike. Major microquakes occur preferentially in zones of major shear stress asperities. Coseismic slip distributions exhibit a pattern similar to the along-fault applied normal stress distribution. The occurrence of isolated low to moderate microquakes where residual stresses persist around secondary stress asperities, indicates that stress conditions along the fault also control the whole variability of fault slip events. Moreover, when fault slip stability conditions are modulated by normal stress distribution, our experiments suggest that the along-fault stress heterogeneity influences the seismic cycle regularity and, consequently, long-term fault slip behavior. Uniform applied normal stress favors irregular seismic cycles and the occurrence of earthquakes clustering, whereas non-uniform normal stress with a single high amplitude stress asperity generates strong characteristic microquake events with stable return periods. Together our results strengthen the assumption that coseismic slip distribution and earthquake variability along an active fault may provide relevant information on long term tectonic stress and could thus improve seismic hazard assessment.
ISSN: 0012-821X

hal-01666379
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01666379
DOI : 10.1016/j.epsl.2017.10.009

Résumé : Cette thèse explore les relations entre histoire et archéologie sous-marine pour étudier le risque de perte en mer aux Petites Antilles à travers l' exemple de la Guadeloupe. Le phénomène du naufrage est envisagé comme un prisme pour aborder les aspects maritimes de l'histoire de la Guadeloupe à l' époque de la marine à voile, entre la fin du XVIIe siècle et la première moitié du XIXe siècle. L' étude repose sur un dépouillement exhaustif de la correspondance administrative et des sondages ciblés dans les archives de la Marine et de quelques-uns des principaux ports du royaume de France liés aux Antilles (Nantes, Bordeaux, Le Havre, Marseille). Le naufrage est défini à travers une étude quantitative des pertes en mer : nombre, fréquence, localisation, répartition chronologique. Cette perspective conduit à qualifier le phénomène de sériel mais marginal en comparaison avec la fréquentation maritime, ce qui n' ôte pas de son intérêt en tant que clé de lecture d'une colonie française d' Amérique et de son économie et de sa société si part iculières , entre cultures d'exportation et esclavage. Environ 550 naufrages son répertoriés en archives entre la fin du XVIIe siècle et le début du XIXe siècle, ce qui représente moins de 1 % de la fréquentation maritime de la colonie. Il s' agit d'un phénomène essentiellement côtier et portuaire lié à la survenue d'événements climatiques exceptionnels (coups de vent et ouragans). Mais, ponctuellement, d'autres causes sont mises en évidence. L'objectif est de dresser une typologie des pertes en mer s'intéressant aussi bien aux différents types de navires perdus qu'à leur fonction , leur cargaison et leur équipage. La question de la perception des risques de pertes (conditions de navigation, dangers d'échouage, aléas climatiques) est envisagée pour analyser les relations entre risques et les moyens mis en oeuvre pour en réduire l'impact. Les différentes pistes allant des premières missions à caractère hydrographique au XVIIIe siècle, aux premiers aménagements portuaires au XIXe siècle, sont étudiées pour voir si elles répondent aux risques de pertes en mer. L'étude des documents d'archives trouve une application dans l'évaluation du potentiel archéologique sous-marin de la Guadeloupe. Celui-ci est évalué à une fourchette entre 50 et 120 sites d'épaves. La lecture critique des sources propose par ailleurs des hypothèses d'identification de 5 sites sur les 15 sites d' épaves anciennes connus, permettant ainsi une vision différente de la question des risques maritimes.
This Ph D explores relationships between history and underwater archaeology in order to study the martime risks in West Indies through the example of Guadeloupe. Shipwreck phenomenon is presented as a prism to analyze maritime aspect of Guadeloupe history during the time of sailing, from the end of 17th to first half of 19th century. The study is based on a archivaI analysis of administrative correspondence and surveys in marine archives and French kingdom main ports linked with West Indies. Shipwreck is defined through an quantitative study of losses : quantity, frequency, localization, chronological spread. This point of view permits to qualify the this phenomenon as serial but low regarding to the maritime activity, This fact is not a lack in order to use this event as a reading key of an American French colony, its economy and society. About 550 shipwrecks have been recorded from the end of 17th to first half of 19th century, thi represents less than 1% of maritime activity of the colony .. This phenomenon is mainly a coastal and a port event, linked with climatic hazard as hurricanes, but the study focused also on others causes . The objective is to set up a losses' typology dealing with ships types, functions, cargos, and crews. The perception of losses risks (seafaring conditions, wrecks dangers and climatic hazards) is presented in order to analyze relationships between risks and means in order to prevent them or reduce their consequences. Different projects from first hydrographical missions during 18th century to first ports building projects at the beginning of 19th century have been studied in order to establish if they answer the losses risks.

http://www.theses.fr/2013AGUY0607

Éditeur(s) : HAL CCSD Oxford University Press (OUP)
Résumé : International audience
BACKGROUND: A prospective study of infectious encephalitis was conducted in France in 2007. In total, 253 patients were enrolled with a proven etiological diagnosis for 52%. The cohort of surviving patients with encephalitis was assessed for sequelae and impairment 3 years after enrollment. METHODS: Patients, their family, and general practitioners (GPs) were interviewed by phone to document persisting symptoms, return to work, and past and current leisure activities, with standardized questionnaires. The IQCODE (Informant Questionnaire on Cognitive Decline in the Elderly) was completed with relatives. The global outcome was determined in all patients with the Glasgow outcome scale. RESULTS: In 2010, 20 patients (10%) were unavailable for follow-up, 2 (1%) were excluded, and 18 (9%) had died since hospital discharge. Data were available for 167 survivors and 9 patients whose death was related to the encephalitis. The outcome was favorable in 108 of 176 patients (61%) (71 with complete resolution), 31 (18%) were mildly impaired, 25 (14%) were severely impaired, and 3 (1%) were in a vegetative state. The most frequent symptoms were difficulty concentrating (42%), behavioral disorders (27%), speech disorders (20%), and memory loss (19%). Fifteen of 63 patients (24%) previously employed were still unable to resume work. Long-term outcome was significantly associated with comorbid conditions, age, level of education, and the causative agent of encephalitis. CONCLUSIONS: Most patients with encephalitis experienced a favorable outcome 3 years after hospital discharge. However, minor to severe disability persists in a high number of cases with consequences for everyday life. Physical and mental impairment should be evaluated in all patients with encephalitis, and neuropsychological rehabilitation implemented whenever needed.
ISSN: 1058-4838

hal-00875190
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00875190
DOI : 10.1093/cid/cis226
PUBMED : 22460967

Éditeur(s) : HAL CCSD Linnean Society of London
Résumé : International audience
Although migratory pelagic fishes generally exhibit little geographic differentiation across oceans, as expected from their life-history (broadcast spawning, pelagic larval life, swimming ability of adults) and the assumed homogeneity of the pelagic habitat, exceptions to the rule deserve scrutiny. One such exception is the narrow-barred Spanish mackerel (Scomberomorus commerson), where strong genetic heterogeneity at the regional scale has been previously reported. We investigated the genetic composition of S. commerson across the Indo-West Pacific range using control-region sequences (including previously published datasets), cytochrome-b gene partial sequences, and eight microsatellite loci, to further explore its phylogeographic structure. All haplotypes sampled from the Indo-Malay-Papua archipelago (IMPA) and the southwestern Pacific coalesced into a clade (Clade II) that was deeply separated (14.5% nucleotide divergence) from a clade grouping all haplotypes from the Persian Gulf and Oman Sea (Clade I). Such a high level of genetic divergence suggested the occurrence of two sister-species. Further phylogeographic partition was evident between the western IMPA and the regions sampled east and south of it, i.e. northern Australia, West Papua, and the Coral Sea. Strong allele-frequency differences were found between local populations in the southwestern Pacific, both at the mitochondrial locus (ΦST=0.282-0.609) and at microsatellite loci (^θ=0.202-0.313). Clade II consisted of four deeply divergent subclades (9.0-11.8% nucleotide divergence for the control region; 0.3-2.5% divergence at the cytochrome b locus). Mitochondrial sub-clades within Clade II generally had narrow geographic distribution, demonstrating further genetic isolation. However, one particular haplogroup within Clade II was present throughout the central Indo-West Pacific; that haplogroup was found to be sister-group to an haplogroup restricted to West Papua and the Coral Sea, yielding evidence of recent secondary westward colonization. Such a complex structure is in sharp contrast with the generally weak phylogeographic patterns uncovered to date in other widely distributed, large pelagic fishes with pelagic eggs and larvae. We hypothesize that in S. commerson and possibly other Scomberomorus species, philopatric migration may play a role in maintaining the geographic isolation of populations by annihilating the potential consequences of passive dispersal.
ISSN: 0024-4066

ird-00759711
http://hal.ird.fr/ird-00759711
http://hal.ird.fr/ird-00759711v2/document
http://hal.ird.fr/ird-00759711/file/FauvelotBorsa_Scomberomorus%20commerson%20p%20HAL.pdf

Éditeur(s) : HAL CCSD AGU and the Geochemical Society
Résumé : International audience
We image the lithospheric and upper asthenospheric structure of western continental Yemen with 24 broadband stations to evaluate the role of the Afar plume on the evolution of the continental margin and its extent eastwards along the Gulf of Aden. We use teleseismic tomography to compute relative P-wave velocity variations in southwestern Yemen down to 300 km depth. Published receiver function analysis suggest a dramatic and localized thinning of the crust in the vicinity of the Red Sea and the Gulf of Aden, consistent with the velocity structure that we retrieve in our model. The mantle part of the model is dominated by the presence of a low velocity anomaly in which we infer partial melting just below thick Oligocene flood basalts and recent off-axis volcanic events (from 15 Ma to present). This low velocity anomaly could correspond to an abnormally hot mantle and could be responsible for dynamic topography and recent magmatism in western Yemen. Our new P-wave velocity model beneath western Yemen suggests the young rift flank volcanoes beneath margins and on the flanks of the Red Sea rift are caused by focused small-scale diapiric upwelling from a broad region of hot mantle beneath the area. Our work shows that relatively hot mantle, along with partial melting of the mantle, can persist beneath rifted margins after breakup has occurred.
ISSN: 1525-2027

hal-01015496
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01015496
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01015496/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01015496/file/Korostelev_etal_GGG_2014.pdf
DOI : 10.1002/2014GC005316

Éditeur(s) : Actes du 6e colloque national BRG, La Rochelle, 2-3-4 octobre 2006
Résumé : Previous studies have shown heritable variation in larval developmental traits in the Pacific oyster Crassostrea gigas. In order to study the genetic consequences of production of oyster larvae in hatcheries, two factors, specific to hatcheries, were examined: the effect of discarding the smallest larvae (i.e. culling) and the effect of temperature (20°C versus 26°C). A mixed-family approach was used in order to infer the genetic composition of larval populations and family assignment, limiting possible environmental bias and allowing the study of a relatively large number of families using a limited number of larval tanks. Our results show that three multiplexed highly polymorphic microsatellite markers are a powerful tool for family assignment and, consequently, for the study of bivalve larvae genetics. Culling, by selective sieving of the smallest larvae is an advantageous practice at a phenotypic scale as it reduced variance in larval size, variance of developmental rate and time to settlement. Culling of 50% of the larval population only led to 15% less spat, showing a positive phenotypic correlation between larval growth and settlement success. However, culling represents a substantial risk for diversity loss, because it increases the variance of reproductive success among parental oysters. The effective population sizes of early settling cohorts of settlement were lower than those of later ones. Our results show that the settlement of slow growing larvae significantly contributes to minimizing the variability of reproductive success and therefore to maximizing genetic diversity. These results corroborate the low estimations of variability of broodstocks sampled in several French commercial hatcheries, relative to natural populations. The genetic composition of the larval population and the resulting spat was significantly different between the two tested temperatures, revealing genotype x environment interaction for survival. Similarly, genotype x environment interaction was also observed for larval growth as a higher temperature exerted a positive influence on the expression of genetic variability for this trait. Consequently, we can conclude that a temperature of 26°C coupled with culling, to common practice in oyster hatcheries, is likely to amplify the selection pressure for fast growing larvae. To test for this hypothesis, we compared larval developmental traits in the progeny of a hatchery broodstock closed for 7 generations, with the progeny of wild oysters and the two possible hybrids. Our results show that selection of fast growing larvae can counteract presumed inbreeding depression, due to higher mean relatedness among hatchery broodstock than in the wild. Genetic effects of intensive rearing conditions at larval stage are significant and should be taken into account in hatchery practices, especially in terms of genetic diversity management.
Afin d'étudier les conséquences génétiques des pratiques de production en écloserie d'huître creuse, deux facteurs ont été examinés : l'élimination des petites larves et la température. Nos résultats montrent que l'assignation de parenté par marqueurs microsatellites est un outil performant pour les études génétiques en phase larvaire de familles élevées en mélange. Bien qu'avantageux d'un point de vue phénotypique, le tamisage sélectif représente un risque de perte de diversité. La fixation des larves à croissance lente permet en effet de minimiser la variabilité du succès reproducteur et de fait, de maximiser la variabilité génétique. Ces résultats corroborent les estimations de variabilité sur les stocks d'écloseries françaises où l'on constate une diversité allélique inférieure à celle de populations issues du milieu naturel. La température exerce également une influence sur la précocité de l'expression de la variabilité génétique pour la croissance larvaire. Ainsi une température élevée associée à une procédure de tamisage peut amplifier l'effet sélectif. Enfin, la sélection de larves à croissance rapide semble démontrée, s'opposant à la dépression de consanguinité présumée. Les conditions d'élevage peuvent donc avoir un effet génétique significatif qui devrait être pris en considération dans les pratiques d'écloserie, notamment dans la gestion de la diversité génétique.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/acte-1505.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1505/

Éditeur(s) : HAL CCSD Montpellier : CIRAD
Résumé :  
Cette étude s'inscrit dans le cadre du suivi de l'exploitation forestière à faible impact en forêt tropicale humide. L'importance des dégâts liés à l'exploitation forestière conditionne fortement la durabilité de cette activité et un contrôle efficace de la qualité des travaux forestiers s'impose donc au gestionnaire. Dans cette étude, l'imagerie satellitaire aide à suivre la progression des chantiers d'exploitation et à estimer les dégâts, par l'acquisition d'images en cours et en fin d'exploitation des parcelles. L'analyse d'images à haute résolution (10 m) permet de bien identifier les trouées d'abattage et certaines pistes de débusquage. Ainsi, on a une évaluation de l'ouverture de la canopée. Plusieurs parcelles ont été étudiées en Guyane française. Pour chacune d'entre elles, un diagnostic simple a été mis en place pour évaluer l'intensité d'exploitation, relever les pistes créées et les pertes de bois. L'outil satellite permet alors de mieux considérer la qualité de l'exploitation et d'en tirer les conséquences vis-à-vis de l'exploitant. Cette étude a permis de démontrer l'utilité de la télédétection pour identifier les concentrations de dégâts après exploitation forestière. Une validation de l'outil a été menée grâce à une base de données de suivi d'exploitation et par des missions de terrain. Cet outil de contrôle postexploitation peut désormais s'automatiser de façon à le rendre totalement opérationnel pour le gestionnaire forestier.
ISSN: 0006-579X

hal-01032146
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032146

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Enamel formation requires the involvement of secretory calcium-binding phosphoproteins. Three of them, amelogenin (AMEL), ameloblastin (AMBN) and enamelin (ENAM), have been extensively studied in mammals. More recently, a fourth protein belonging to the same family has been identified: amelotin (AMTN). AMTN has only been studied in rodents and its role during amelogenesis remains unclear.The aim of this thesis is to extend the knowledge on AMTN by studying its evolution in amniotes and its expression in the lizard Anolis carolinensis.AMTN sequences from many amniote species have been extracted from databases or obtained by PCR, and analyzed. Those analyses allowed us to reveal differences in the gene structure and to highlight residues that were conserved during mammalian or amniote evolution. These conserved amino acids are essential to the structure and/or function of the protein.The expression of AMTN and of AMEL, AMBN and ENAM has been studied by in situ hybridization on lizard jaw sections. Comparison of the expression pattern of these genes during amelogenesis in the lizard with that described in rodents points to similarities (AMEL, AMBN and ENAM) but also to important differences, especially in the spatio-temporal expression of AMTN. In order to better understand AMTN evolution in tetrapods, I studied its expression in an amphibian (Pleurodeles waltl) and a marsupial (Monodelphis domestica).Taken together, these results suggest a link between the evolution of AMTN gene structure (loss of exons and of functional domains in mammals) and its expression (early in non-mammals versus late in mammals) with the emergence of prismatic structure of enamel in early mammals.
La formation de l'émail dentaire met en jeu des phosphoprotéines sécrétées liant le calcium. Parmi celles-ci figurent amélogénine (AMEL), améloblastine (AMBN) et énaméline (ENAM), qui ont fait l'objet de nombreuses études chez les mammifères. Plus récemment, une quatrième protéine de la même famille a été découverte, l'amélotine (AMTN). Elle n'a été étudiée que chez les rongeurs et son rôle au cours de l'amélogenèse reste mal défini. L'objectif de cette thèse est d'élargir les connaissances sur AMTN en étudiant son évolution chez les amniotes et son expression au cours de l'amélogenèse chez le lézard Anolis carolinensis. Les séquences d'AMTN d'un grand nombre d'amniotes ont été extraites des bases de données ou obtenues par PCR, et analysées. Ces analyses ont mis en évidence différentes structures géniques et des acides aminés très conservés au cours de l'évolution. Cette conservation indique qu'ils sont essentiels à la structure ou à la fonction de la protéine. L'expression d'AMTN ainsi que celle d'AMEL, AMBN et ENAM ont été étudiées par hybridation in situ sur des coupes de mâchoires de lézard. La comparaison des patrons d'expression chez le lézard avec ceux décrits chez la souris a révélé des différences dans l'expression spatio-temporelle d'AMTN. De ce fait, afin de mieux comprendre l'évolution de ce gène, son expression a été étudiée chez un amphibien (Pleurodeles waltl) et un marsupial (Monodelphis domestica).Ces travaux suggère un lien entre l'évolution de la structure génique d'AMTN (perte d'exons et de domaines fonctionnels) et de son expression (précoce versus tardive) avec l'émergence de la structure prismatique de l'émail chez les mammifères.
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01154518

NNT : 2015PA066066
tel-01154518
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01154518
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01154518/document
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01154518/file/2015PA066066.pdf