The major outer membrane protein OmpU of Vibrio splendidus contributes to host antimicrobial peptide resistance and is required for virulence in the oyster Crassostrea gigas Auteur(s) : Duperthuy, Marylise Binesse, Johan Le Roux, Frederique Romestand, Bernard Caro, Audrey Got, Patrice Givaudan, Alain Mazel, Didier Éditeur(s) : Wiley-blackwell Publishing, Inc Résumé : Vibrio splendidus, strain LGP32, is an oyster pathogen associated with the summer mortalities affecting the production of Crassostrea gigas oysters worldwide. Vibrio splendidus LGP32 was shown to resist to up to 10 mu M Cg-Def defensin and Cg-BPI bactericidal permeability increasing protein, two antimicrobial peptides/proteins (AMPs) involved in C. gigas immunity. The resistance to both oyster Cg-Def and Cg-BPI and standard AMPs (polymyxin B, protegrin, human BPI) was dependent on the ompU gene. Indeed, upon ompU inactivation, minimal bactericidal concentrations decreased by up to fourfold. AMP resistance was restored upon ectopic expression of ompU. The susceptibility of bacterial membranes to AMP-induced damages was independent of the ompU-mediated AMP resistance. Besides its role in AMP resistance, ompU proved to be essential for the adherence of V. splendidus LGP32 to fibronectin. Interestingly, in vivo, ompU was identified as a major determinant of V. spiendidus pathogenicity in oyster experimental infections. Indeed, the V. splendidus-induced oyster mortalities dropped from 56% to 11% upon ompU mutation (Kaplan Meier survival curves, P < 0.01). Moreover, in co-infection assays, the ompU mutant was out competed by the wild-type strain with competitive indexes in the range of 0.1-0.2. From this study, ompU is required for virulence of V. splendidus. Contributing to AMP resistance, conferring adhesive properties to V. splendidus, and being essential for in vivo fitness, the OmpU porin appears as an essential effector of the C. gigas/V. splendidus interaction. Environmental Microbiology (1462-2912) (Wiley-blackwell Publishing, Inc), 2010-04 , Vol. 12 , N. 4 , P. 951-963 Droits : 2010 Society for Applied Microbiology and Blackwell Publishing Ltd http://archimer.ifremer.fr/doc/00003/11421/8044.pdf DOI:10.1111/j.1462-2920.2009.02138.x http://archimer.ifremer.fr/doc/00003/11421/ | Partager |
A Functional Study of Transforming Growth Factor-Beta from the Gonad of Pacific Oyster Crassostrea gigas Auteur(s) : Corporeau, Charlotte Groisillier, Agnes Jeudy, Alexandra Barbeyron, Tristan Fleury, Elodie Fabioux, Caroline Czjzek, Mirjam Huvet, Arnaud Éditeur(s) : Springer Résumé : The transforming growth factor (TGF)-beta superfamily is a group of important growth factors involved in multiple processes such as differentiation, cell proliferation, apoptosis and cellular growth. In the Pacific oyster Crassostrea gigas, the oyster gonadal (og) TGF-beta gene was recently characterized through genome-wide expression profiling of oyster lines selected to be resistant or susceptible to summer mortality. Og TGF-beta appeared specifically expressed in the gonad to reach a maximum when gonads are fully mature, which singularly contrasts with the pleiotropic roles commonly ascribed to most TGF-beta family members. The function of og TGF-beta protein in oysters is unknown, and defining its role remains challenging. In this study, we develop a rapid bacterial production system to obtain recombinant og TGF-beta protein, and we demonstrate that og TGF-beta is processed by furin to a mature form of the protein. This mature form can be detected in vivo in the gonad. Functional inhibition of mature og TGF-beta in the gonad was conducted by inactivation of the protein using injection of antibodies. We show that inhibition of og TGF-beta function tends to reduce gonadic area. We conclude that mature og TGF-beta probably functions as an activator of germ cells development in oyster. Marine Biotechnology (1436-2228) (Springer), 2011-10 , Vol. 13 , N. 5 , P. 971-980 Droits : Springer Science+Business Media, LLC 2011 http://archimer.ifremer.fr/doc/00042/15371/13438.pdf DOI:10.1007/s10126-010-9361-4 http://archimer.ifremer.fr/doc/00042/15371/ | Partager |
Bases biologiques de la production de deux Mollusques d'intérêt économique: reproduction chez Megathura crenulata, reproduction et développement chez Crassostrea gigas Auteur(s) : Cannuel, Rozenn Éditeur(s) : Université de Nantes Résumé : The reproductive cycle of Megathura crenulata was documented and quantification of oocyte lipid reserves with lipo-specific stains was explored in both this species and in Crassostrea gigas. The necessity of providing food to female broodstock C. gigas in spring was re-evaluated, because subsequent larval and post-larval rearing performance was not affected by broodstock starvation during conditioning. Developmental study of the organs responsible of particle processing in C. gigas allowed the identification of critical stages related to the ontogenesis of each organ, as well as a better understanding of the evolution of these organs, highly-modified in the Ostreidae. Ciliary type identification and mucocyte mapping from post-larval to adult stage showed that the heterorhabdic specialization precedes the anatomic formation of gill plicae specific to this condition. Le cycle reproducteur de Megathura crenulata a été documenté et la quantification des réserves ovocytaires par des colorants lipospécifiques a été tentée, sans résultats concluants pour cette espèce, ni pour Crassostrea gigas. L'intérêt d'une alimentation des géniteurs femelles C. gigas au printemps est re-évalué, car la performance ultérieure des élevages larvaires et post-larvaires n'a pas été affectée par le jeûne imposé lors du conditionnement. L'étude du développement des organes impliqués dans le traitement des particules chez C. gigas a permis d'identifier des stades critiques associés à l'ontogenèse de chaque organe, ainsi qu'une meilleure compréhension de l'évolution de ces organes si particuliers chez les Ostreidae. L'examen des types ciliaires et la cartographie des mucocytes de la post-larve à l'adulte ont montré que la spécialisation hétérorhabdique précède même la formation anatomique des plis branchiaux caractéristiques de cette condition. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/these-1371.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1371/ | Partager Voir aussi Mucocytes Mantle Gill Larvae postlarvae juveniles Feeding Crassostrea gigas Megathura crenulata Development Reproduction Mucocytes Télécharger |
Bilan énergétique de l'huître japonaise Crassostrea gigas en conditions expérimentales de laboratoire au cours du mois de septembre 1991 Auteur(s) : Soletchnik, Patrick Bougrier, Serge Razet, Daniel Geairon, Philippe Prou, Jean Heral, Maurice Barille, Laurent Résumé : L'étude ci dessous, réalisée chez Crassostrea gigas, a comme objectif de comparer l'effet de différents types d'aliments sur le bilan énergétique de cette espèce. Droits : 1992 Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/00100/21095/18720.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00100/21095/ | Partager Voir aussi Huître creuse Crassostrea gigas Bilan énergétique Sources alimentaires Biodépots Tri pré-ingestif Télécharger |
Conséquences génétiques de la production de larves d'huîtres en écloserie : étude des processus de dérive et de sélection Auteur(s) : Taris, Nicolas Sauvage, Christopher Batista, Frederico Baron, Sophie Ernande, Bruno Haffray, Pierrick Boudry, Pierre Éditeur(s) : Actes du 6e colloque national BRG, La Rochelle, 2-3-4 octobre 2006 Résumé : Previous studies have shown heritable variation in larval developmental traits in the Pacific oyster Crassostrea gigas. In order to study the genetic consequences of production of oyster larvae in hatcheries, two factors, specific to hatcheries, were examined: the effect of discarding the smallest larvae (i.e. culling) and the effect of temperature (20°C versus 26°C). A mixed-family approach was used in order to infer the genetic composition of larval populations and family assignment, limiting possible environmental bias and allowing the study of a relatively large number of families using a limited number of larval tanks. Our results show that three multiplexed highly polymorphic microsatellite markers are a powerful tool for family assignment and, consequently, for the study of bivalve larvae genetics. Culling, by selective sieving of the smallest larvae is an advantageous practice at a phenotypic scale as it reduced variance in larval size, variance of developmental rate and time to settlement. Culling of 50% of the larval population only led to 15% less spat, showing a positive phenotypic correlation between larval growth and settlement success. However, culling represents a substantial risk for diversity loss, because it increases the variance of reproductive success among parental oysters. The effective population sizes of early settling cohorts of settlement were lower than those of later ones. Our results show that the settlement of slow growing larvae significantly contributes to minimizing the variability of reproductive success and therefore to maximizing genetic diversity. These results corroborate the low estimations of variability of broodstocks sampled in several French commercial hatcheries, relative to natural populations. The genetic composition of the larval population and the resulting spat was significantly different between the two tested temperatures, revealing genotype x environment interaction for survival. Similarly, genotype x environment interaction was also observed for larval growth as a higher temperature exerted a positive influence on the expression of genetic variability for this trait. Consequently, we can conclude that a temperature of 26°C coupled with culling, to common practice in oyster hatcheries, is likely to amplify the selection pressure for fast growing larvae. To test for this hypothesis, we compared larval developmental traits in the progeny of a hatchery broodstock closed for 7 generations, with the progeny of wild oysters and the two possible hybrids. Our results show that selection of fast growing larvae can counteract presumed inbreeding depression, due to higher mean relatedness among hatchery broodstock than in the wild. Genetic effects of intensive rearing conditions at larval stage are significant and should be taken into account in hatchery practices, especially in terms of genetic diversity management. Afin d'étudier les conséquences génétiques des pratiques de production en écloserie d'huître creuse, deux facteurs ont été examinés : l'élimination des petites larves et la température. Nos résultats montrent que l'assignation de parenté par marqueurs microsatellites est un outil performant pour les études génétiques en phase larvaire de familles élevées en mélange. Bien qu'avantageux d'un point de vue phénotypique, le tamisage sélectif représente un risque de perte de diversité. La fixation des larves à croissance lente permet en effet de minimiser la variabilité du succès reproducteur et de fait, de maximiser la variabilité génétique. Ces résultats corroborent les estimations de variabilité sur les stocks d'écloseries françaises où l'on constate une diversité allélique inférieure à celle de populations issues du milieu naturel. La température exerce également une influence sur la précocité de l'expression de la variabilité génétique pour la croissance larvaire. Ainsi une température élevée associée à une procédure de tamisage peut amplifier l'effet sélectif. Enfin, la sélection de larves à croissance rapide semble démontrée, s'opposant à la dépression de consanguinité présumée. Les conditions d'élevage peuvent donc avoir un effet génétique significatif qui devrait être pris en considération dans les pratiques d'écloserie, notamment dans la gestion de la diversité génétique. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/acte-1505.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1505/ | Partager |
Natural hybridization between genetically differentiated populations of Crassostrea gigas and C-angulata highlighted by sequence variation in flanking regions of a microsatellite locus Auteur(s) : Huvet, Arnaud Fabioux, Caroline Mccombie, Helen Lapegue, Sylvie Boudry, Pierre Éditeur(s) : Inter-Research Résumé : The marine environment is of special interest for studying hybridization between closely related taxa because of the high dispersal potential of planktonic larvae, such as those of most bivalve species. The oysters Crassostrea angulata and C. gigas are known to be very close genetically and entirely inter-fertile under controlled conditions. However, hybridization in the wild had not been investigated, mainly due to the lack of nuclear diagnostic markers. In the present paper, we first estimated genetic differentiation between these 2 closely related taxa using 8 microsatellite markers. Interestingly, 5 markers displayed significant differences of allele size between taxa. The subsequent sequencing of alleles of one of these microsatellites showed several mutational events, which suggested null alleles and homoplasy. The presence of 1 insertion/deletion event in its 5' flanking sequence enabled us to design a new bi-allelic ('C' and 'NC') nuclear PCR-restriction fragment length polymorphism (-RFLP) marker (CG44R). This, together with a mitochondrial DNA marker, was used to analyze populations of C. angulata and C. gigas. The CG44R allele frequencies were very different between C. angulata (f[C] = 0.91) and C. gigas (f[NC] = 0.92) populations. This analysis also provided evidence for hybridization between C. angulata and C. gigas in a wild Portuguese population where the 2 taxa are in contact due to recent transportation of C. gigas stocks for aquacultural production. Our results represent the first indication of hybridization between these 2 taxa in the natural environment, and contribute to knowledge of the evolutionary history of the Crassostrea genus. Marine Ecology Progress Series (0171-8630) (Inter-Research), 2004 , Vol. 272 , P. 141-152 Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/2004/publication-3355.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3355/ | Partager Voir aussi Allele size Microsatellites Genetic differentiation Hybridization Crassostrea gigas Crassostrea angulata Télécharger |
Variations spatio-temporelles de l'infestation des huitres creuses, Crassostrea Gigas, par les vers du genre Polydora (Annelides Polychetes), dans le cadre du reseau Ifremer/REMORA. Auteur(s) : Duault, Céline Gillet, Patrick Éditeur(s) : Union des Océanographes de France Résumé : The worms Polydora. damage the oysters, Crassostrea gigas, by foraging the shell, training the formation of galleries and chambers with mud. The IFREMER'S REMORA network which has in charge to survey the oysters Crassostrea gigas in France, has showed an increase of the infestation of oysters since 1993 (first year of the network). The study had for goal first to estimate the spatial and temporal variations of the infestation of the oysters in 1999, by using two methods: the infestation index, the number of worms by individual and a quality index, the Polydora Index (IP varies from 0 to 1) which is based on 5 classes of the oysters quality (from 0 to 4) in relation to the aspect of the valves Les vers Polydora détériorent les huîtres creuses, Crassostrea gigas, par perforation de la coquille, entraînant la formation de galeries et de chambres à vase. Le réseau IFREMER /REMORA de suivi des huîtres creuses en France a mis en évidence une progression de l'infestation dans les huîtres depuis 1993 (année de démarrage du réseau). L'étude a pour objectif d'évaluer les variations spatio-temporelles de l'infestation des huîtres de 1999, en comparant deux méthodes : un indice d'infestation, le nombre de vers par huître ; et un indice de qualité, l'Indice Polydora (IP variant de 0 à 1) qui repose sur la qualité des huîtres réparties en 5 classes (de 0 à 4) en fonction de l'aspect des valves. Journal de Recherche Océanographique (Union des Océanographes de France), 2001 Droits : 2001 Union des Océanographes de France http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/publication-2447.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2447/ | Partager Voir aussi REMORA network Infestation Crassostrea gigas Polydora sp. Réseau REMORA Infestation Crassostrea gigas Polydora sp. Télécharger |
Effects of short-term environmental disturbances on living benthic foraminifera during the Pacific oyster summer mortality in the Marennes-Oléron Bay (France) Auteur(s) : Bouchet, Vincent Debenay, Vincent Sauriau, Pierre-guy Radford Knoery, Joel Soletchnik, Patrick Éditeur(s) : Elsevier Résumé : Sediment cores were collected from April to August 2004 on tidal mudflats of the macrotidal Marennes-Oléron Bay (SW France), famous for the cultivation of Pacific oysters (Crassostrea gigas). The response of living (stained) benthic foraminifera to short-term biogeochemical disturbances in the sediment and overlying water, which may be involved in oyster summer mortality, was monitored. Short-term hypoxia occurred in early June, in conjunction with a sudden rise in temperature. In mid-June, the ammonia content of sediment porewater increased, leading to potentially maximal flux towards overlying waters. Foraminiferal assemblages, particularly in the topmost layer, were altered. Ammonia tepida was the most tolerant to temperature increase and hypoxic conditions whereas Brizalina variabilis and Haynesina germanica were sensitive to organic degradation and hypoxia. Cribroelphidium gunteri was the most opportunistic during recolonisation. Benthic foraminifera showed that short-term biochemical changes in the sediment are toxic and may be involved in the summer mortality of Pacific oysters. Marine Environmental Research (0141-1136) (Elsevier), 2007-09 , Vol. 64 , N. 3 , P. 358-383 Droits : 2007 Elsevier Ltd All rights reserved http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/publication-2586.pdf DOI:10.1016/j.marenvres.2007.02.007 http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2586/ | Partager Voir aussi Marennes Oléron bay Aquaculture Crassostrea gigas Intertidal Ammonium Hypoxia Organic matter Living benthic foraminifera Télécharger |
Oyster population genetics : understanding natural populations and tracing introductions Auteur(s) : Lapegue, Sylvie Boudry, Pierre Éditeur(s) : World Aquaculture Society, Aquaculture 2006 Résumé : Oysters are among the most familiar of all marine invertebrate taxa. However our knowledge of oyster phylogeny and systematics is fragmentary. This is principally due to the plastic growth patterns of these animals, which result in a wide range of overlapping, ecophenotypic variants that greatly reduce the value of analysis based on shell morphology. Besides that, many intentional or accidental anthropogenic transfers have emphasised this situation. In several cases of misclassification or misidentification of oysters, DNA molecular data, have provided valuable new insights on the tracing of introductions or more generally on the phylogeographic relationships between oyster species. We will illustrate this issue with recent case studies from our lab on several flat and cupped oysters: (1) the Crassostrea gigas Crassostrea angulata couple of Asian species and their successive introductions in Europe, (2) the new species of cupped oysters, Crassostrea honkongensis, described in Hong-Kong and very divergent from the species Crassostrea gigas it was initially supposed to be, (3) the mangrove oyster Crassostrea gasar that was shown not only to be present along the coasts of Western Africa but also along the Atlantic coasts of South America, and (4) the geographic disjunction between Ostreola stentina, described in the Mediterranean Sea, and the genetically closely related species Ostrea aupouria (from New Zealand) and Ostreola equestris (from Mexico Gulf/Atlantic). At the intra specific level, we will focus on one of the main documented case in Europe, the flat oyster, Ostrea edulis. It is a marine bivalve whose natural geographical distribution ranges along the European Atlantic coast from Norway to Morocco, in addition to the Mediterranean and Black Sea. Studies of allozymes, microsatellites and mitochondrial differentiation over the whole range concluded that a significant divergence existed between Mediterranean and Atlantic populations, together with an isolation-by-distance pattern. However, the average mitochondrial haplotypic diversity displayed a high among populations variance, reflecting smaller effective population size in some locations. Additionally, a ten-fold quantitative difference was observed in the same study in Fst between the mitochondrial and the nuclear genomes, which could be due to sex biased differential reproductive success between males and females. In order to further document this hypothesis, two experiments at the population level were conducted. First, brooding females were sampled in a wild population and the number of males fertilizing a given female estimated. Then, parentage analyses were achieved under experimental conditions: successive mass spawnings were collected from a population of potential genitors kept in hatchery, whose genotypes were known, in order to infer a posteriori the relative contribution of each genitor. Moreover, we aimed to better understand the reproduction dynamics of this species. Several patterns of spawning could be distinguished: unique, successive or extended in time. The different parental contributions and reproductive behaviors observed in these experiments are discussed in the context of the hypothesis of a variance in the reproductive success of males and females and consequences in local and temporal reduced effective population sizes. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/acte-3475.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3475/ | Partager Voir aussi Genetic Ostreola stentina Crassostrea honkongensis Crassostrea gigas Crassostrea angulata Oysters Population genetics Télécharger |
Apport d'un programme de génétique à une filière de production aquacole : l'exemple de l'ostréiculture Auteur(s) : Lapegue, Sylvie Bedier, Edouard Goyard, Emmanuel Degremont, Lionel Baud, Jean-pierre Gerard, Andre Goulletquer, Philippe Boudry, Pierre Éditeur(s) : Styli 2003. Trente ans de crevetticulture en Nouvelle-Calédonie. Nouméa - Koné, 2-6 juin 2003. 2004. Gorarant C, Harache Y, Herbland A, Mugnier C. Ed. Ifremer, Actes de Colloque, n°38, pp.113-120 Résumé : Two oyster species are currently present along the French coasts : the indigenous European flat oyster (Ostrea edulis), and the Pacific cupped oyster (Crassostrea gigas), that has been introduced from Japan since the beginning of the 70ies. The flat oyster successively suffered from two protozoan diseases during the 60ies and its production decreased from 20 000 tons/year by that time to 1 500 tons/year nowadays. Consequently, the oyster production is principally (99%) based upon the Pacific oyster species with approximately 150 000 tons/year among which 90% are grown from the natural spat. However, the hatchery production of this species is developing and was estimated to 400 to 800 millions spat in 2002. Moreover, strengthened relationships between IFREMER and the 5 commercial hatcheries, that all joined the SYSAAF (Union of the French poultry, shellfish and fish farming selectors), allow to plan for new genetic breeding programs. At the end of the 80ies, IFREMER initiated a genetic breeding program for the resistance of the European flat oyster to the bonamiosis, and obtained strains more tolerant to this disease. After two generations of massal selection, molecular markers had identified a reduced genetic basis in this program. It was then reoriented to an intra-familial selection. However, we were confronted to a zootechnic problem to manage such a scheme and we compromised by an intra-cohorts of families selection scheme managed using molecular markers. The program has now reached the transfer level with experimentation at a professional scale. Concerning the Pacific cupped oyster, and in parallel with the obtaining and the study of polyploids, performance of different Asian cupped oyster strains were compared to the one introduced in France thirty years ago and currently suffering from summer mortalities. The local strain exhibited better performance, certainly based upon a good local adaptation. In other respects, although early growth is a relevant criteria for selection for growth to commercial stage, it is not to be privileged in the context of an oyster producing region with a limited food availability. Contrary, the spat summer mortality became a priority for numerous teams (genetic, physiology, pathology, ecology,...) joined in the MOREST program. The first results showed important survival differences between fullsib and halsib families. They indicate a genetic determinism to this character "survival" and promote for its selection. Deux espèces d'huîtres sont aujourd'hui présentes sur les côtes françaises : l'huître plate européenne (Ostrea edulis), indigène, et l'huître creuse du Pacifique (Crassostrea gigas), introduite du Japon dans le début des années 1970. L'huître plate a subi coup sur coup, dans les années 1960, deux maladies dues à des protozoaires parasites et sa production est ainsi passée de 20 000 t/an dans les années 1960 à 1500 t/an aujourd'hui en France. Il en résulte que la filière ostréicole française repose quasiment exclusivement (99%) sur la production de l'huître creuse, C. gigas, avec 150 000 tonnes en 2000 dont environ 90% est issu du captage naturel. Cependant, la reproduction de cette espèce en écloserie est actuellement en expansion avec une estimation de 400 à 800 millions de naissains commercialisés en 2002. Des rapports renforcés entre l'IFREMER et les cinq écloseries françaises de la filière ostréicole, qui adhèrent toutes au SYSAAF (SYndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français), permettent désormais d'envisager le développement de nouveaux programmes d'amélioration génétique. A la fin des années 1980, un programme de sélection pour la résistance de l'huître plate à la bonamiose a été initié au sein de l'IFREMER, et a permis d'obtenir des souches plus tolérantes à cette maladie. Après deux générations en sélection massale, les marqueurs moléculaires avaient mis en évidence une base génétique réduite au sein de ce programme qui s'était alors orienté vers une sélection intra-familiale. Devant la lourdeur zootechnique d'un tel schéma, un compromis a été trouvé en réalisant une sélection au sein de cohortes de familles biparentales, la gestion de ces cohortes étant permise par les analyses moléculaires. Le programme est maintenant dans sa phase de transfert, avec des expérimentations à plus grande échelle en partenariat avec la profession. En ce qui concerne l'huître creuse, et en parallèle de l'obtention et l'étude de polyploïdes, les performances de différentes souches d'huîtres creuses provenant d'Asie ont été comparées à celles de la souche introduite en France il y a trente ans, sujette à des mortalités estivales. La souche locale présente de meilleures performances, vraisemblablement grâce à une adaptation bien réalisée. Par ailleurs, bien que l'amélioration de la croissance jusqu'à la taille commerciale s'avère possible par une sélection précoce au stade larvaire, le critère de croissance n'est pas nécessairement à privilégier dans le contexte d'un bassin ostréicole disposant de ressources trophiques limitées. En revanche, les importantes mortalités rencontrées par le naissain en périodes estivales constituent le sujet d'étude prioritaire sur lequel se sont penchées de nombreuses équipes (génétique, physiologie, pathologie, écologie, ...) dans le cadre du grand défi MOREST. Les premiers résultats ont mis en évidence de fortes différences de survie entre des familles biparentales d'animaux indiquant un déterminisme génétique du caractère « survie », et encourageant dans la voie d'une sélection pour ce caractère. Droits : 2004 Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-3491.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3491/ | Partager Voir aussi Growth Selection Genetic breeding Genetic Ostrea edulis Crassostrea gigas Oysters Croissance Sélection Amélioration génétique Télécharger |
Real-time PCR assay for rapid detection and quantification of Vibrio aestuarianus in oyster and seawater: A useful tool for epidemiologic studies Auteur(s) : Saulnier, Denis De Decker, Sophie Haffner, Philippe Éditeur(s) : Elsevier Résumé : Because Vibrio aestuarianus is known to cause serious infections in Pacific oyster Crassostrea gigas, a real-time PCR assay was developed targeting the dnaJ gene of this bacterium. Only V. aestuarianus strains isolated from C. gigas mortality events in different geographic areas and the reference strain tested positive, whereas no amplification products was obtained with type strains belonging to 23 other species of Vibrio. Sensitivity and reproducibility of the method were assessed using either seawater or oyster homogenate samples spiked with one V aestuarianus strain. All these samples were stored at -20 degrees C in order to mimic retrospective or grouped natural sample analysis without quantification bias due to prolonged freezing. Analysis of standard curves revealed excellent correlation values between light microscopy cell enumerations and PCR Threshold Cycle (Ct) values, and acceptable PCR reaction efficiencies for all type of samples. Quantification curves of both sample types were equivalent, with a detection level as low as 1.6 V. aestuarianus cells in the PCR reaction tube, corresponding to 1.6.10(2) cells ml(-1) and 1.6.10(2) cells mg(-1) in seawater and entire oyster samples, respectively, taking into account the dilution factor used for appropriate template DNA preparation. Comparison of PCR assay reproducibility according to the complexity of samples revealed that seawater samples gave more reproducible quantification measures than samples from oyster homogenate, with precision of measured Ct values inferior to 0.4 and 0.6 respectively at 99% confidence. Use of the real-time PCR assay allowed us to monitor V. aestuarianus load in oysters naturally infected with this pathogen. Furthermore, we were able to detect V aestuarianus in samples of seawater in which oysters had been reared and in algal cultures used for feeding oysters. Because of the rapidity and reliability of the real-time PCR assay method used in this study, just a few hours are needed compared with the two days required using the classic culture method, this technique will be particularly valuable in mollusc pathology laboratories, for monitoring the source and course of infections by V. aestuarianus in pathogenesis and epidemiologic studies, as well as for designing appropriate prophylactic control measures. (C) 2009 Elsevier B.V. All rights reserved. Journal of Microbiological Methods (0167-7012) (Elsevier), 2009-05 , Vol. 77 , N. 2 , P. 191-197 Droits : 2009 Elsevier B.V. All rights reserved. http://archimer.ifremer.fr/doc/2009/publication-6447.pdf DOI:10.1016/j.mimet.2009.01.021 http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6447/ | Partager |
Experimental assessment of oyster transfers as a vector for macroalgal introductions Auteur(s) : Mineur, Frederic Belsher, Thomas Johnson, Mark P. Maggs, Christine A. Verlaque, Marc Éditeur(s) : Elsevier Résumé : Introduction of non-indigenous species can alter marine communities and ecosystems. In shellfish farming, transfer of livestock, especially oysters, is a common practice and potentially constitutes a pathway for non-indigenous introductions. Many species of seaweeds are believed to have been accidentally introduced in association with these transfers, but there is little direct evidence. We experimentally simulated the transfer of oysters from the Thau Lagoon (France). These transfers involved increasing periods of aerial emersion and additional brine and hot water treatments. The brine and hot water treatments were evaluated as a means of reducing the probability of algal introductions with oyster transfers. Shells were cultured for 40 days in experimental tanks to identify the macroalgae likely to be introduced with any oyster transfer. A total of 57 macroalgal taxa, including 16 taxa not indigenous to the Thau Lagoon, were recorded across all treatments and experiments. The abundance of some species increased in several cases following aerial emersion. Elimination treatments (immersion in brine or hot water) significantly reduced algal diversity, with hot water treatments resulting in no species or only tubular Ulva spp. present. The results support the hypothesis that oyster transfers are effective as primary and secondary vectors of macroalgal introductions. Relatively simple changes to the transfer practice (particularly hot water treatments) are suggested as a means of reducing the risk of non-indigenous algal introductions. Biological Conservation (0006-3207) (Elsevier), 2007-06 , Vol. 137 , N. 2 , P. 237-247 Droits : 2007 Elsevier Ltd All rights reserved. http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/publication-2779.pdf DOI:10.1016/j.biocon.2007.02.001 http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2779/ | Partager Voir aussi Elimination treatments Transport Marine macrophytes Thau Lagoon Shells Crassostrea gigas Biological invasions Télécharger |
Contrat de Plan Etat Région Poitou-Charentes 1994-1998. Convention 95 RPC R 62 - Programme Pathologie - Rapport Scientifique année 1995 Auteur(s) : Renault, Tristan Berthe, Franck Chollet, Bruno Cochennec, Nathalie Haffner, Philippe Le Deuff, Rose-marie Thuillier, Benoit Résumé : Le but de ce programme pathologie est de rechercher et d'étudier les agents pathogènes connus et inconnus chez les mollusques bivalves marins, plus particulièrement chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, afin d'identifier d'éventuels agents causant des mortalités, de proposer des mesures prophylactiques et de définir des conditions zootechniques permettant aux professionnels de limiter l'impact des maladies sur leur cheptel. La présence de maladies, chez les mollusques bivalves marins dont l'impact socio économique peut être catastrophique pour les productions conchylicoles, et l'accroissement des échanges de produits d'aquaculture entre les pays de la CEE et avec les pays tiers nécessitent le renforcement des recherches dans les domaines de la pathologie. En particulier, du fait du mono élevage de l'huître japonaise, Crassostrea gigas, en France, il semble aujourd'hui indispensable d'effectuer des contrôles zoosanitaires réguliers chez cette espèce. Ces travaux ont d'autant plus d'importance qu'aujourd'hui, devant les pathologies rencontrées, les professionnels restent extrêmement démunis (traitements inapplicables ou inexistants). Dans ce cadre, la promptitude du diagnostic ainsi que l'acquisition de données épidémiologiques et biologiques concernant les agents pathogènes impliqués sont les meilleurs moyens d'éviter leur dissémination chez les mollusques bivalves marins. Les travaux entrepris dans ce cadre par l'URPIG, semblent d'autant plus indispensables qu'il n'existait pas jusqu'à ces dernières années de pathologies identifiées chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, sur le littoral français. Cependant depuis 1991, sont apparus dans certaines écloseries françaises des épisodes de mortalité sur des larves de cette espèce. Il a été possible de détecter un virus apparenté à la famille des Herpesviridae par ses caractères morphologiques (NICOLAS et al., 1992) et de démontrer sa pathogénicité pour les larves (LE DEUFF et al., 1994). Par ailleurs, en 1993, 1994 et 1995, un virus de même type, a été observé en association à de fortes mortalités sur différents lots de naissain de la même espèce, originaires d'écloseries et de captage naturel. Par ailleurs, en 1993, suite à l'observation d'anomalies au niveau des branchies chez des huîtres creuses provenant de Charente Maritime et du bassin d'Arcachon associées à de médiocres performances de croissance, il a été entrepris des analyses de divers échantillons, en histologie classique et en microscopie électronique à transmission. Ces examens ont permis de révéler la présence au niveau des branchies, chez un nombre non négligeable d'animaux, d'un microorganisme de type chlamydien (RENAULT and COCHENNEC, 1995). Il a également été possible, chez cette même espèce, de détecter la présence d'un organisme de type rickettsien au niveau des branchies (RENAULT, COCHENNEC and CHOLLET, 1995). Droits : 1995 Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15453/12828.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15453/ | Partager |
Phylogénie moléculaire des huîtres du genre Crassostrea. Approche par les techniques de restriction enzymatique et de séquençage Auteur(s) : Delandes, Hélène Résumé : En France, ainsi que dans de nombreux autres pays, l'histoire de l'ostréiculture est émaillée d'une succession de phases de développement, de surexploitation et d'apparition de maladies qui perturbent lourdement la profession. Depuis la disparition massive de l'huître portugaise, Crassostrea angulata, victime entre 1969 et 1971 d'une épidémie virale et l'effondrement de l'élevage de l'huître plate Ostrea edulis dû à deux parasitoses, la marteiliose et la bonamiose, l'ostréiculture française connaît actuellement une situation de monoculture de l'huître creuse japonaise Crassostrea gigas, suite à l'introduction de l'espèce entre 1971 et 1975 (Grizel & al. 1991). Pour tenter de remédier à cette situation de monoculture, qui reste une des inquiétudes majeures des professionnels, la région Poitou-Charentes a apporté une aide financière pour la création d'un "conservatoire de souches", implanté dans les locaux du Laboratoire Génétique, Aquaculture et Pathologie de La Tremblade. Les principaux objectifs sont d'étudier les possibilités d'acclimatation des huîtres étrangères dans les eaux françaises afin de diversifier la production ou de préparer une éventuelle substitution à C. gigas en cas d'épizootie majeure, de développer des hybrides intra et inter-spécifiques au sein du genre Crassostrea (performants en ce qui concerne la résistance aux maladies parasitaires, la croissance et la fertilité) et enfin d'effectuer une étude de la différenciation génétique (intra et inter spécifique). Droits : 1997 Univ. La Rochelle, the author, Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14380/11670.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14380/ | Partager |
Etat actuel de l'introduction d'organismes marins non-indigènes Auteur(s) : Marteil, Louis Éditeur(s) : Acte du Conseil International pour l'Exploration de la Mer, C.M. 1973/E:6 Résumé : Le présent rapport fera le point sur les introductions d'organismes marins non-indigènes effectuées en France depuis 1971, en se référant au questionnaire qui a servi de base à l'établissement du rapport initial. Droits : 1973 CIEM http://archimer.ifremer.fr/doc/00021/13217/10277.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00021/13217/ | Partager |
Ressources génétiques et phylogéographie des huîtres creuses Crassostrea gigas et C. angulata : variabilité, différenciation et adaptation des populations naturelles et introduites Auteur(s) : Huvet, Arnaud Éditeur(s) : Université de Tours Résumé : L 'huître creuse japonaise Crassostrea gigas et portugaise C. angulata ont été respectivement décrites par Thunberg (1793) et Lamarck (1819). Mais les similitudes morphologiques et l 'homogénéité des fréquences allozymiques entre populations ont conduit de nombreux auteurs à proposer l'existence d'une seule et mênle espèce. L'analyse récente d'un gène mitochondrial a pennis de déterminer l'origine asiatique de C. angulata, soulignant l'intérêt de l'étude de la différenciation génétique et phénotypique entre les deux taxons. La notion biologique d'espèce a tout d'abord été examinée. Des croisements de 1ère et 2ème génération ont montré la viabilité et fertilité des hybrides. L'analyse de la compétition spennatique par marqueurs microsatellites ne montre pas d'isolement reproductif, mênle partiel et le séquençage du fragment ITS 1 confirme la forte proximité génétique des deux taxons. Les patrons de différenciation génétique observés par marqueurs microsatellites et mitochondriaux apparaissent sitnilaires. L'origine asiatique de C. angulata est donc confinnée. Le fort niveau de polymorphisme des marqueurs microsatellites explique partiellement les plus faibles valeurs observées de différenciation. Une bimodalité des tailles d'allèles microsatellites entre taxons a pennis le développement d'un nouveau marqueur nucléaire, mettant en évidence des phénomènes d'hybridation naturelle dans la zone du sud de l'Europe où l'activité ostréicole met aujourd'hui les 2 taxons en contact. L'étude de caractères phénotypiques a été réalisée en milieu naturel et contrôlé sur des descendances d'écloserie. Les résultats montrent une meilleure croissance de C. gigas et une période de reproduction plus longue chez C. angulata. Des mesures physiologiques montrent un plus fort taux de respiration du naissain C. gigas, ainsi qu'un temps de filtration supérieur chez les adultes. La différence de croissance entre taxons pourraient donc être expliquée par le temps de filtration et l'effort de reproduction. Droits : Université de Tours, The author http://archimer.ifremer.fr/doc/00034/14564/11867.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00034/14564/ | Partager Voir aussi génétique des populations Crassostrea isolement reproducteur marqueurs moléculaires écophysiologie aquaculture Télécharger |
Dix ans de production en ecloserie de mollusques bivalves Auteur(s) : Leborgne, Y Éditeur(s) : Actes de colloques. Ifremer. Brest [ACTES COLLOQ. IFREMER.]. 1985 Résumé : SATMAR has developed techniques and methods allowing a production of over 100 million spat per year at a size from 2 to 10 millimetres. Among the 13 species concerned by this production, 3 of major importance are the oysters Crassostrea gigas, Ostrea edulis and the Japanese little neck clam, Ruditapes philippinarum . The hatchery production could easily be doubled if the market would increase. Current research tend to increase the quality of the products by means of genetics and to lower the costs by improving the nursery phase. La Société Atlantique de Mariculture a développé des techniques et des méthodes permettant la production annuelle de plus de l00 millions de naissains d'une taille de 2 à 10 millimètres. Parmi les 13 espèces concernées par ces productions les 3 principales sont les huîtres Crassostrea gigas, Ostrea edulis, et la palourde du Pacifique, Ruditapes philippinarum. La production de l'écloserie pourrait facilement doubler si le marchess développait. Les recherches actuelles portent sur l'amélioration de la qualité des produits par la sélection génétique et un abaissement du prix de revient par l'optimisation des performances au niveau de la phase nurserie. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1983/acte-1184.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1184/ | Partager |
Etude des processus de dérive et de sélection liés aux pratiques d'élevage en écloserie d'huître creuse Auteur(s) : Boudry, Pierre Résumé : Genetic consequences of production of Pacific oyster larval in hatchery: drift and selective pressures related to rearing practices. In order to study the genetic consequences of production of oyster larvae in hatcheries, two factors were examined: the effects of discarding the smallest larvae (i.e. culling) and temperature effects. A mixed-family approach was used in order to infer the genetic composition of the larval population. The results show that high polymorphic microsatellite-based family assignment is a powerful tool for the study of bivalve larvae genetics. Culling by selective sieving is an advantageous practice at a phenotypic scale, but also represents a substantial risk for diversity loss if parentage assignment is not introduced as a breeding practice. Settlement of slow growing larvae contributes to minimizing the variability of reproductive success and therefore to maximizing genetic diversity. These results corroborate the lower estimations of variability made on broodstocks from French commercial hatcheries relative to natural populations. Temperature exerts an influence on the expression of genetic variability for larval growth. A temperature of 26°C, coupled with culling could amplify the selective effect. Furthermore, selection of fast growing larvae has proven to counteract inbreeding depression at this stage. Genetic effects of intensive rearing conditions are significant and should be taken into account in hatchery practices, especially in terms of genetic diversity management. Afin d'étudier les conséquences génétiques des pratiques de production de larves en écloserie d'huître creuse, deux facteurs ont été examinés : l'effet de l'élimination des plus petites larves et l'effet de la température. Une approche de familles élevées en mélange a été utilisée afin d'avoir accès à l'information génétique au stade larvaire. Les résultats obtenus montrent que l'assignation de parenté basée sur des marqueurs microsatellites hautement discriminants est un outil performant pour les études génétiques en phase larvaire. Bien qu'avantageuse d'un point de vue phénotypique, la pratique de tamisage sélectif représente un risque substantiel de perte de diversité si cette pratique n'est pas associée à une assignation de parentée par empreintes génétiques. La fixation des larves à croissance lente permet de minimiser la variabilité du succès reproducteur et de fait, de maximiser la variabilité génétique. Ces résultats corroborent les estimations de variabilité sur les stocks d'écloseries commerciales françaises où l'on constate une diversité allélique inférieure à celle de populations issues du milieu naturel. La température exerce également une influence sur la précocité de l'expression de la variabilité génétique pour la croissance larvaire. Ainsi une température élevée (26°C) associée à une procédure de tamisage peut amplifier l'effet sélectif. Enfin, la sélection de larves à croissance rapide semble démontrée, s'opposant à la dépression de consanguinité présumée en phase larvaire. Les conditions d'élevage peuvent donc avoir un effet génétique significatif qui devrait être pris en considération dans les pratiques d'écloserie, notamment dans la gestion de la diversité génétique. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/rapport-1459.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1459/ | Partager |
Origine et état de la population de Crepidula fornicata (Gastropoda Prosobranchia) sur le littoral français Auteur(s) : Blanchard, Michel Éditeur(s) : Société Française de Malacologie Résumé : The introduction of the limpet Crepidula fornicata on French coasts occurred through a number of stages of unequal amplitude. The two main stages are the result of a) its transportation on the hulls of the Allies ships during WWII, and b) the voluntary introduction of the Japanese oyster Crassostrea gigas in the 1970s. A recent assessment of its distribution shows that it can be found from the North Sea to the Mediterranean shores, resulting in some conflicts, due to its high density. L'introduction de la crépidule Crepidula fornicata sur les côtes de France s'est effectuée en plusieurs phases d'inégale amplitude. Les deux plus importantes sont dues au transport par les coques de bateaux alliés, à la fin de la deuxième guerre mondiale et à l'introduction volontaire, durant les années 1970, de l'huître japonaise Crassostrea gigas. Un bilan actuel de sa répartition montre qu'elle est présente de la Mer du Nord aux rives de Méditerranée, engendrant parfois des situations de conflit, du fait de sa forte densité. Haliotis (Société Française de Malacologie), 1995 , Vol. 24 , P. 75-86 Droits : 1995 Société Française de Malacologie http://archimer.ifremer.fr/doc/1995/publication-6191.PDF http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6191/ | Partager |
Responses of diploid and triploid Pacific oysters Crassostrea gigas to Vibrio infection in relation to their reproductive status Auteur(s) : De Decker, Sophie Normand, Julien Saulnier, Denis Pernet, Fabrice Castagnet, Sophie Boudry, Pierre Éditeur(s) : Academic Press Inc Elsevier Science Résumé : Several Vibrio species are known to be pathogenic to the Pacific oyster Crassostrea gigas. Survival varies according to pathogen exposure and high mortality events usually occur in summer during gametogenesis. In order to study the effects of gametogenetic status and ploidy (a factor known to affect reproduction allocation in oysters) on vibriosis survival, we conducted two successive experiments. Our results demonstrate that a common bath challenge with pathogenic Vibrio splendidus and Vibrio aestuarianus on a mixture of mature, spawning and non-mature oysters can lead to significant mortality. Previous bath challenges, which were done using only non-mature oysters, had not produced mortality. Immunohisto-chemical analyses showed the affinity of Vibrio for gonadic tissues, highlighting the importance of sexual maturity for vibriosis infection processes in oysters. Mortality rate results showed poor repeatability between tanks, however, in this bath challenge. We then tested a standardized and repeatable injection protocol using two different doses of the same combination of two Vibrio species on related diploid and triploid oysters at four different times over a year. Statistical analyses of mortality kinetics over a 6-day period after injection revealed that active gametogenesis periods correspond to higher susceptibility to vibriosis and that there is a significant interaction of this seasonal effect with ploidy. However, no significant advantage of triploidy was observed. Triploid oysters even showed lower survival than diploid counterparts in winter. Results are discussed in relation to differing energy allocation patterns between diploid and triploid Pacific oysters. (C) 2010 Elsevier Inc. All rights reserved. Journal Of Invertebrate Pathology (0022-2011) (Academic Press Inc Elsevier Science), 2011-02 , Vol. 106 , N. 2 , P. 179-191 Droits : 2010 Elsevier Inc. All rights reserved. http://archimer.ifremer.fr/doc/00030/14108/11368.pdf DOI:10.1016/j.jip.2010.09.003 http://archimer.ifremer.fr/doc/00030/14108/ | Partager Voir aussi Experimental vibriosis Crassostrea gigas Vibrio Survival distribution function Triploidy Reproductive effort Télécharger |