Marqueurs microsatellites chez l'huître plate Ostrea edulis l. : caractérisation et applications à un programme de sélection pour une résistance au parasite Bonamia ostreae et à l'etude de populations naturelles Auteur(s) : Launey, Sophie Éditeur(s) : Institut national agronomique Paris Grignon Résumé : The flat oyster Ostrea edulis L. is the indigenous oyster of the Atlantic as well as the Mediterranean coasts of Europe. Its commercial exploitation dates back to Antiquity but its breeding is now threatened by two parasitic protozoa, among which Bonamia ostreae. Various aspects of the genetics of this species' natural and farmed populations have been studied with the aid of microsatellite markers. At first, the implementation and the screening of two partial genomic libraries made it possible to identify 28 new microsatellite loci. Analysis of the segregation of 12 of these loci and of two enzymatic loci shows that most microsatellite loci are transmitted in a Mendelian way, but some loci have significant segregation distortions. Moreover, seven linkage groups, of which four contain at least two markers, were identified in Ostrea edulis. The genetic variability of three populations selected for one or two generations for resistance to Bonamia ostreae was analysed with the aid of 5 microsatellite loci. In spite of the absence of genealogical data, we have shown that these selected populations were descended from a very low number of founding genitors (from 3 to 15 depending on the population) and for two populations, we were able to reconstruct the genealogy and the relationships between the individuals were identified. These selected populations have, in addition to a very low genetic variability, real and at times high levels of consanguinity. These results have a significant implication for the continuation of the selection programme (consanguinity management, augmentation of genetic variability by introducing wild genitors). The geographical structuring of the genetic variability of natural populations of Ostrea edulis has been analysed with the aid of 5 microsatellite loci on a sampling covering almost the entire distribution area of the species (from Norway to the Adriatic Sea). The results are consistent with those published in the literature and using enzymatic markers. The populations show a low level of differentiation that could correspond to a model of isolation by distance. The Atlantic populations, which have a reduced polymorphism, could be descended from post-glacial recolonisation from Mediterranean populations that had survived the glaciations of the Quaternary Period. The current distribution of flat oyster populations is surely also subject to anthropogenic activities. Finally, the genetic bases of the heterozygosis-growth correlation were studied in a natural population with the aid of enzymatic and microsatellite markers. Although leads favouring the direct contribution of enzymatic loci have been found, biases in the sampling design make it impossible to come to a formal conclusion. However, this study has made it possible to show that the capture of individuals over a short period (around ten days) leads to a sampling of a population descended from a very low number of founding genitors, in contradiction with the generally accepted idea that marine bivalve populations are large panmictic populations with significant, efficient numbers. These results confirm in a natural population the observations of a significant reduction of efficient sizes in hatchery populations. L'huître plate Ostrea edulis L. est l'huître indigène des côtes européennes aussi bien atlantiques que méditerranéennes. Son exploitation commerciale remonte à l'Antiquité mais son élevage est aujourd'hui menacé par deux protozoaires parasites dont Bonamia ostreae. Différents aspects de la génétique des populations naturelles et cultivées de cette espèce ont été étudiés à l'aide de marqueurs microsatellites. Dans un premier temps, la réalisation et le criblage de deux banques génomiques partielles ont permis l'identification de 28 nouveaux locus microsatellites. L'analyse de la ségrégation de 12 de ces locus et de deux locus enzymatiques montre que la plupart des locus microsatellites sont transmis de façon mendélienne, mais certains locus présentent des distorsions de ségrégation importantes. Par ailleurs, sept groupes de liaison dont quatre contiennent au moins deux marqueurs ont été identifiés chez Ostrea edulis. La variabilité génétique de trois populations sélectionnées depuis une ou deux générations pour une résistance à Bonamia ostreae a été analysée à l'aide de 5 locus microsatellites. Malgré l'absence de données généalogiques, nous avons montré que ces populations sélectionnées étaient issues d'un très faible nombre de géniteurs fondateurs (de 3 à 15 selon les populations) et pour deux populations, la généalogie a pu être reconstituée et les liens de parenté entre les individus ont été identifiés. Ces populations sélectionnées présentent, outre une très faible variabilité génétique, des niveaux de consanguinité réels et parfois élevés. Ces résultats ont une implication importante pour la continuation du programme de sélection (gestion de la consanguinité, augmentation de la variabilité génétique par introduction de géniteurs sauvages). La structuration géographique de la variabilité génétique des populations naturelles d'Ostrea edulis a été analysée à l'aide de 5 locus microsatellites sur un échantillonnage couvrant presque toute l'aire de répartition de l'espèce (de la Norvège à la Mer Adriatique). Les résultats sont cohérents avec ceux publiés dans la littérature et utilisant des marqueurs enzymatiques. Les populations montrent un niveau de différenciation faible qui pourrait correspondre à un modèle d'isolement par la distance. Les populations atlantiques, qui présentent un polymorphisme réduit, pourraient être issues de recolonisation post-glaciaire à partir de populations méditerranéennes ayant survécu aux glaciations du Quaternaire. La répartition actuelle des populations d'huître plate est certainement aussi soumise aux actions anthropiques. Enfin, les bases génétiques de la corrélation hétérozygotie-croissance ont été étudiées dans une population naturelle à l'aide de marqueurs enzymatiques et microsatellites. Bien que des pistes en faveur de la contribution directe des locus enzymatiques aient été trouvées, des biais dans le dispositif expérimental ne permettent pas de conclure de façon formelle. Cependant, cette étude a permis de montrer que le captage d'individus sur une faible période (une dizaine de jours) conduit à l'échantillonnage d'une population issue d'un nombre très réduit de géniteurs fondateurs, en contradiction avec l'idée reçue que les populations de bivalves marins sont de larges populations panmictiques à effectif efficace important. Ces résultats confirment dans une population naturelle les observations de réduction importante des tailles efficaces dans des populations d'écloserie. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1998/these-1919.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1919/ | Partager |
Evolution des recherches et études récentes en pathologie des huîtres Auteur(s) : Comps, Michel Éditeur(s) : Gauthier-villars Résumé : Until recently, the study of the pathology of oysters concerned some bacterial and a large number of parsitic diseases. Among the latter, diseases caused by fungi such as Labyrinthomyxa marina or by sporozoa such as Minchinia nelsoni in the American oyster have had very important econimic repercussions in the affected areas. The causes of some severe epizooties, such as the "Malpecue Bay disease" in Canada, have never been determined; in other cases, including the mass mortality of the Portuguese oyster in Fance, several years of investigations have been required before the first results of an etiologic nature were obtained. The use of electron microscopy has permitted great strides in the pathology of oysters. Thus, virus diseases have been found to be associated with the diseases of the Portuguse oyster, with gill disease and with the mass mortality of 1970. New and important data have also been obtained with regard to the structure and development of Marteilia refringens a parasite of the flat oyster which has been recognized as belonging to the haplosporidan species. Recently, Mycoplasma-like and Rickettsia-like organisms have been detected in several oyster species and oyster viruses have been isolated on cell cultures. Such results confirm the evolution of research in this field. Les résultats acquis en matière de pathologie des huîtres concernaient jusqu'à une date récente quelques maladies bactériennes et surtout de nombreuses parasitoses. Pour certaines épizooties graves, comme la maladie de l'huître américaine de Malpèque au Canada, les causes n'ont jamais été déterminées et pour d'autres, comme la mortalité massive de l'huître portugaise en France, les premiers résultats d'ordre étiologique n'ont été obtenus que tardivement avec la mise en évidence d'une infection virale. L'étude ultra-structurale de Marteilia refringens, parasite de l'huître plate, la mise en évidence d'une virose associées à la maladie des branchies de l'huître portugaise, puis la découverte récente de nouveaux germes pathogènes tels que mycoplasmes et rickettsies et l'isolement de virus sur cultures cellulaires chez plusieurs espèces d'huîtres devaient confirmer l'évolution des recherches dans ce domaine. Oceanologica Acta (0399-1784) (Gauthier-villars), 1978 , Vol. 1 , N. 2 , P. 255-262 Droits : 1978 Elsevier http://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12631/9520.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12631/ | Partager |
Les espèces d'huîtres vivant actuellement dans le monde, définies par leurs coquilles larvaires ou prodissoconques - Etude des collections de quelques-uns des grands musées d'histoire naturelle Auteur(s) : Ranson, Gilbert Éditeur(s) : ISTPM Résumé : Shell is the basis of the distinction between the different species of molluscs. But the elements defining the shape and colour of the shell can vary according to the environmental conditions. So much so that, in numerous cases, a whole range of intermediates can be found between two species. Among molluscs, oysters are considered as a particularly confused group. Their shells are indeed extremely variable. All sorts of intermediates can be found. They usually attach themselves using their bottom valve, and, depending on the shape of the substrate, salinity conditions, temperature, outside environment, they present a wide range of individual variations. I had the opportunity to examine the larval shells of some of our coastal species. I noticed that each species had a specific prodissoconch, with a constant shape and no fundamental individual variations, an understandable fact given their planktonic life. The hinge and the position of the ligament in the hinge enable the definition of their genus. During the study of the collections of oysters from some of the world's most renowned museum (1), I tried to isolate the prodissoconches of the different species. I found them attached to the adult shells, making sure that all the prodissoconches attached to the top of the adult shells showed the same morphological characteristics. (unverified OCR) LAMARCK, en 1806, dans l'ouverture de son Cours sur les «Animaux sans Vertèbres», s'exprimait ainsi : «En attendant, souvenons-nous que rien de tout cela n'est dans la nature, qu'elle ne connaît ni Classes, ni Ordres, ni Genres, ni Espèces, malgré le fondement que paraissent leur donner les portions de la série naturelle que nous offrent nos collections et que parmi les corps organisés, il n'y a réellement que des individus et des races diverses qui se nuancent dans tous les degrés de l'organisation. » Ainsi, pour LAMARCK, les cadres de la Classification zoologique seraient artificiels, ce seraient des créations de l'esprit, ayant seulement pour but de faciliter l'étude du monde vivant. Effectivement lorsqu'on consulte, comme je l'ai fait, les «Collections Lamarck» des Musées de Paris et de Genève. on s'aperçoit que, pour LAMARCK, le moindre caractère morphologique qui différencie une coquille de Mollusque d'une autre est une entité. Il multipliait le nombre des espèces et créait des variétés. Pour CUVIER (2) : «Le travail des nomenclatures, besogne facile, qui ne demande aucune intelligence a fait négliger la science véritable.» Et dit-il, ailleurs (:1) : «Après tout je n'ai pas jeté cette esquisse de division pour servir aux commençans à trouver les noms des espèces; qu'ils emploient pour cela tel système artificiel qu'ils trouveront le plus facile; cela est juste... » Les systèmes en question ne seraient donc que jeux de l'esprit, pour CUVIER également. Notre pensée a beaucoup évolué depuis cette époque. Nous pouvons dire maintenant que la Vie est la manière d'être des protéines et qu'il existe autant de protéines que d'espèces. Dès 1912, Jacques LOEB disait (4) : «Qu'en toute certitude, chaque animal a des substances germinatives spécifiques et que les substances germinatives diffèrent chimiquement d'un animal à l'autre, Les qualités chimiques d'un oeuf de poulet font qu'il ne peut donner naissance qu'à un poulet.» La notion d'espèce chimique vivante nous entraîne, par ailleurs, vers une nouvelle conception des autres groupes de la classification. L'individu porteur de caractères particuliers par lesquels il peut seulement être défini, est aussi porteur d'un noyau protoplasmique spécifique et enfin d'autres, propres successivement à la famille, à l'ordre, à la classe et à l'embranchement dont il fait partie. Cela est très important, car toutes ces catégories de la classification zoologique ne nous apparaissent plus alors comme de simples entités, subjectives, formelles, mais comme ayant effectivement une réalité précise dans le monde extérieur. La recherche et la définition correcte des espèces apparaissent alors comme un travail de première importance. Lorsqu'on poursuit des recherches embryologiques, physiologiques, biologiques ou autres sur un organisme, il est indispensable de savoir d'une manière précise en présence de quelle espèce on se trouve. Par ailleurs, comment parler de l'évolution des espèces si leur existence objective n'est pas admise et si elles ne sont pas correctement définies? Toute l'histoire de la Zoologie est marquée par l'effort constant de préciser les caractères de l'espèce et d'en faire une réalité objective. Chez les Mollusques, la coquille a servi de base essentielle pour la distinction des espèces. Mais les éléments de la forme et de la couleur de la coquille varient avec les conditions du milieu de telle sorte qu'on trouve dans de nombreux cas, tous les intermédiaires entre deux espèces. Parmi les Mollusques, les Huîtres constituaient un groupe particulièrement confus. En effet, leurs coquilles sont extrêmement variables. On rencontre tous les intermédiaires. Elles se fixent le plus souvent sur un support par la valve inférieure et là selon la forme du support, selon les conditions de la salinité, de la température, du milieu extérieur, elles présentent une immense gamme de variations individuelles. J'ai été amené à examiner les coquilles larvaires de quelques espèces de nos côtes. J'ai constaté que chaque espèce avait une prodissoconque particulière, d'une forme constante et sans variations individuelles fondamentales ce qui se conçoit aisément, étant donné leur vie planctonique. Leur charnière et la position du ligament par rapport à cette dernière, permettent de définir les genres, En étudiant les collections d'Huîtres des grands musées du monde (1), j'ai cherché à isoler les prodissoconques des diverses espèces. Je les ai trouvées sur les coquilles adultes où elles s'étaient fixées. m'assurant chaque fois que les prodissoconques conservées au sommet des coquilles adultes présentaient les mêmes caractéristiques morphologiques. J'ai microphotographié la plupart des coquilles larvaires étudiées. Ce sont les épreuves qui sont reproduites ici. J'en ai fait faire des dessins au trait et pour quelques-unes dont les microphotographies manquent, on trouvera les dessins au trait réalisé à la chambre claire. Chaque espèce est bien définie par sa coquille larvaire. La meilleure démonstration en est fournie par les deux espèces. si voisines par leurs coquilles adultes, Ostrea edulis et Ostrea chilensis; leurs prodissoconques sont spectaculairement différentes. Je remercie Monsieur le Directeur de l'Institut scientifique et technique des Pêches maritimes qui a bien voulu accepter de publier le résultat de ces recherches dans la belle Revue des Travaux de son Institut. (OCR non contrôlé) Revue des Travaux de l'Institut des Pêches Maritimes (0035-2276) (ISTPM), 1967-06 , Vol. 31 , N. 2 , P. 127-199 Droits : Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/1967/publication-3761.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3761/ | Partager |
Aspects biométriques et biochimiques de la croissance de l'huître Crassostrea virginica en élevage suspendu à Solomons (Baie de Chesapeake) Auteur(s) : Goulletquer, Philippe Prou, Jean Heral, Maurice Éditeur(s) : Société Française de Malacololgie Résumé : Growth and proximate biochemical composition of the American oyster Crassostrea virginica were studied in the Patuxent river (Maryland), located in the middle reach of the Chesapeake bay (U.S.A.). The effects of stocking densities and environmental variables (depth, temperature) were examined in 1989-1990 on oyster population by using off-bottom culture. No significant density effect was observed on the shell growth, which is described by using a seasonally oscillating function. In contrast, the meat growth and the proximate biochemical composition were bath affected by the stacking density and the depth location. The variability of the resulting effects was observed based on a seasonal trend. Different hypothesis mainly related tO environmental conditions (food availability, current speed) are presented. Study implications on the oyster management in the Chesapeake bay are discussed. La croissance et la composition biochimique de l'huître américaine Crassostrea virginica sont étudiés dans la rivière Patuxent, située dans la partie médiane de la baie de Chesapeake (U.S.A.). L'effet de la densité et de la profondeur d'élevage ainsi que de la température sont testés en 1989 et 1990 sur une population d'huîtres en élevage suspendu. La croissance de la coquille ne montre pas d'effet significatif de la densité d'élevage. Un modèle de la croissance en longueur avec oscillation saisonnière est établi. Les effets de la densité et de la profondeur sur l'évolution du poids de chair sèche et des composants biochimiques mettent en évidence une tendance saisonnière. Différentes hypothèses (quantité et qualité de la nourriture, effet de la vitesse du courant) sont présentées. Les implications de ces résultats sur l'aménagement de la baie de Chesapeake dans le cadre d'une réhabilitation de l'huître sont discutées. Haliotis (Société Française de Malacololgie), 1994 , Vol. 23 , P. 113-123 Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1994/publication-3076.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3076/ | Partager Voir aussi USA Chesapeake Bay Oysters Growth Biochemical composition Crassostrea virginica Croissance USA Chesapeake Bay Huîtres Télécharger |
Evolution saisonnière de certains paramètres physico-chimiques et planctoniques des eaux du Havre, du Robert et de la baie de Massy-Massy en Martinique Auteur(s) : Martinet, J Saint-felix, C Guyard, A Éditeur(s) : ISTPM Résumé : Parallèlement aux essais menés sur la biologie de l'huître de palétuviers, Crassostrea rhizophorae, lamellibranche autochtone, et sur l'acclimatation éventuelle en Martinique de l'huître japonaise, Crassostrea gigas, certains paramètres de l'eau de mer, choisis pour leur importance, ont été régulièrement étudiés d'octobre 1973 à octobre 1974 dans deux stations de la côte atlantique de l'île (fig. 1 et 2). Science et Pêche (0036-8350) (ISTPM), 1976-10 , Vol. 262 , P. 1-17 Droits : Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/1976/publication-7124.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/7124/ | Partager |
Bilan énergétique de l'huître japonaise Crassostrea gigas en conditions expérimentales de laboratoire au cours du mois de septembre 1991 Auteur(s) : Soletchnik, Patrick Bougrier, Serge Razet, Daniel Geairon, Philippe Prou, Jean Heral, Maurice Barille, Laurent Résumé : L'étude ci dessous, réalisée chez Crassostrea gigas, a comme objectif de comparer l'effet de différents types d'aliments sur le bilan énergétique de cette espèce. Droits : 1992 Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/00100/21095/18720.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00100/21095/ | Partager Voir aussi Huître creuse Crassostrea gigas Bilan énergétique Sources alimentaires Biodépots Tri pré-ingestif Télécharger |
Competition for food in the larvae of two marine molluscs, Crepidula fornicata and Crassostrea gigas Auteur(s) : Blanchard, Michel Pechenik, J Giudicelli, E Connan, Jean-paul Robert, Rene Éditeur(s) : EDP Sciences Résumé : The degree to which larvae of the invasive American slipper limpet (Crepidula fornicata) and the Japanese oyster (Crassostrea gigas) may compete for food was examined during 2003 in the laboratory. Larval microalgae uptake, growth and mortality were compared for larvae fed each of six species of unicellular algae, ranging in length from 2 to 10 mu m. Tested diets included the two flagellates Tetraselmis chui (Prasinophyceae) and Isochrysis affinis galbana (T-ISO, Haptophyceae), one member of the Chlorophyceae (Nannochloris atomus), and three diatom species (Chaetoceros calcitrans forma pumilum, Chaetoceros gracilis, Skeletonema marino). We found that the limpet larvae ingested phytoplankton over a wider range of cell sizes and ate at higher rates on each diet than did the oyster larvae. For example, oyster larvae consumed 2216 cells h(-1) of N. atomus, while limpet larvae consumed the same phytoplankton cells at approximately twice that rate, 5159 cells h(-1), on the same diet. Larvae of both species grew more quickly on a mixture of flagellates than on any of the diatom alone (12 versus 7 mu m d(-1) for oyster larvae and 41 versus 28 mu m d(-1) for limpet larvae). Our results suggest that in the Bay of Mount Saint-Michel (France, Western Channel), where larvae of both species co-exist in the summer, intensive grazing by limpet larvae can potentially deplete phytoplankton concentrations to cause competition with oyster larvae, particularly for smaller sized phytoplankton species. Compétition trophique chez les larves de mollusques marins Crepidula fornicata et Crassostrea gigas. En 2003, des expérimentations ont été menées en laboratoire pour évaluer la compétition trophique entre les larves de crépidules (Crepidula fornicata) et celles de l'huître japonaise (Crassostrea gigas). Les taux de consommation, de croissance et de mortalité sont comparés, en alimentant les larves de chaque mollusque avec six espèces d'algues unicellulaires, dont la taille varie de 2 à 10 μm, deux flagellées Tetraselmis chui (Prasinophycée) et Isochrysis affinis galbana (T-ISO, Haptophycée), une chlorophycée Nannochloris atomus, et trois diatomées : Chaetoceros calcitrans forma pumilum, Chaetoceros gracilis et Skeletonema marinoï. Contrairement aux larves d'huîtres, les larves de crépidules consomment toutes les cellules phytoplanctoniques quelles que soient leurs tailles, et ceci, à un taux plusélevé que celui des larves d'huîtres. Ainsi, une larve d'huître consomme 2216 cellules h−1 de N. atomus, tandis que la larve de crépidule en consomme 5159 cellules h−1, soit environ deux fois plus. Ces expériences mettent également en évidence que les larves des deux espèces grandissent plus vite quand elles sont nourries avec le mélange des algues flagellées plutôt qu'avec chacune des espèces de ces mêmes algues (12 contre 7 μm j−1 pour l'huître et 41 contre 28 μm j−1 pour la crépidule). Ainsi, en baie du Mont Saint-Michel (Manche ouest) où les larves des deux espèces apparaissent à la même période estivale, nos résultats suggèrent que la filtration des larves de crépidules abaisse notablement la concentration de phytoplancton, et tout spécialement celle des petites cellules algales, entraînant alors une compétition trophique avec les larves d'huîtres. Aquatic Living Resources (0990-7440) (EDP Sciences), 2008-04 , Vol. 21 , N. 2 , P. 197-205 Droits : EDP Sciences, IFREMER, IRD 2008 http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/publication-4703.pdf DOI:10.1051/alr:2008025 http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4703/ | Partager |
Taxonomie et phylogéographie des huîtres creuses dans l'Atlantique Sud Auteur(s) : Boutet, Isabelle Résumé : L'étude de la taxonomie des huîtres est longtemps restée basée sur des critères morphologiques (forme de la coquille et description des organes) et géographiques. Ces considérations sont relativement peu fiables en particulier au niveau interspécifique du fait de la plasticité des caractères morphologiques d'une part de des introductions d'espèces étrangères sur les lieux de culture d'autre part. La biologie moléculaire est donc, depuis quelques années, un outil très utilisé pour différencier les espèces d'huîtres. La phylogéographie des huîtres de la région sud-atlantique a ainsi pu être étudiée grâce à différentes méthodes de recherche du polymorphisme réalisées sur le fragment mitochondrial 16S. La PCR-RFLP, la SSCP et le séquençage ont été utilisés pour déterminer les haplotypes de 9 populations d'huîtres creuses du genre Crassostrea provenant du Sénégal, de Guyane, de Martinique et du Brésil. Ceci a permis par extension à d'autres espèces d'apporter des informations complémentaires à la phylogénie de ce genre. Les résultats obtenus par ces 3 méthodes ont permis de montrer que ces 9 populations se différencient en 2 haplotypes : un africain correspondant à l'espèce Crassostrea gasar et un martiniquais correspondant à l'espèce Crassostrea rhizophorae. De plus,C. gasar, huître caractéristique des côtes africaines, est présente dans 2 sites d'Amérique du sud, ont un en sympatrie avec C. rhizophorae au Brésil, ce qui n'a jamais été décrit jusqu'à présent. L'étude d'un point de vue génétique de cette espèce ainsi que la détermination de sa position phylogénétique, sont également une nouveauté. La sympatrie observée au Brésil permet de s'interroger sur l'existence d'une interfécondité possible et d'un flux de gènes entre les 2 espèces. Des études complémentaires à partir d'un échantillonnage plus vaste réalisé sur toute la côte atlantique sud-américaine permettront de confirmer ces résultats. Par ailleurs, la construction d'un arbre phylogénétique à partir des séquences obtenues dans cette étude et de séquences d'autres espèces du même genre, a permis de préciser les positions de ces espèces les unes par rapport aux autres. Ainsi, C. gasar a une position intermédiaire entre les groupes gigas-angulata et virginica-rhizophorae. Droits : 1999 Univ; La Rochelle, The author http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14365/11656.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14365/ | Partager |
La conchyliculture en Europe Auteur(s) : Antona, Martine Bailly, Denis Paquotte, Philippe Gabott, M Gibbs, J Shaw, S Harmsma, H Résumé : This report includes a qualitative and descriptive approach of the oyster and mussel industries in the European Community. This report compares the structure of production, the marketsn the professional organisation, competition for the resource, legislation and support systemat the community levell. Technical and statistical datas are summarized to représent the structure of the industry, the trade flows and the main evolutions of the two industries in the EC. A summary of the county reports gives an overview of the present state of the industry in each country and suggest a first evaluation of constraints and prospects. [NOT CONTROLLDED OCR] Ce rapport comprend une approche descriptive et qualitative du secteur conchylicole traditionnel (moules et huîtres) dans la Communauté Européenne. Il aborde les aspects production, marché, organisation, réglementation, système d'aide dans les différents pays par une analyse comparative des secteurs, complétée par une synthèse chiffrée des données techniques et statistiques. Une vision d'ensemble des flux et de l'évolution des deux filières dans la Communauté est ainsi présentée. Un résumé des rapports nationaux évalue l'organisation, les contraintes et les perspectives du secteur dans chacun des pays. [OCR NON CONTRÔLE] Droits : 1993 Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/1993/rapport-4176.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/1993/sup-4176.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4176/ | Partager Voir aussi SEM réglementation commerce extérieur marché Production Europe Conchyliculture regulation external trade markets Télécharger |
Acclimatation de nouvelles espèces d'huîtres creuses du genre Crassostrea : hybridation et conservatoire de souches. Contrat Région Poitou-Charentes 1999 - Convention 99 RPC-A-203 "Génétique" Auteur(s) : Boudry, Pierre Heurtebise, Serge Lapegue, Sylvie Ledu, Christophe Phelipot, Pascal Gerard, Andre Résumé : Dans le cadre du plan Etat-Région 1994-1998, un programme de conservatoire de souches a été initié au Laboratoire IFREMER de La Tremblade. Ce conservatoire a pour objectif d'acclimater différentes espèces ou souches d'huîtres creuses (genres Crassostrea et Saccostrea) afin d'acquérir des connaissances sur ces espèces et d'évaluer l'intérêt qu'elles pourraient présenter pour l'ostréiculture locale. L'importation d'espèces étrangères sur les côtes françaises est désormais strictement réglementée: la dissémination d'une nouvelle espèce peut se révéler néfaste d'un point de vue écologique et nuire aux productions existantes. De plus, ces huîtres peuvent être porteuses de pathogènes qui, s'il venaient à se répandre dans le milieu, pourraient toucher les stocks locaux. En conséquence, les huîtres importées sont strictement confinées au laboratoire dans une « salle de quarantaine » dont l'eau est traitée à l'ozone avant rejet afin d'éviter à la fois la dissémination des huîtres et d'éventuels pathogènes... Droits : 1999 Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15514/12901.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15514/ | Partager Voir aussi Génétique Acclimatation Croisement Crassostrea gigas Crassostrea ariakensis Crassostrea sikamea Hybridation Télécharger |
Mise en place du RNO aux Antilles - Mission de formation Quadrige en Martinique et Guadeloupe -14-18 octobre 2002 Auteur(s) : Claisse, Didier Résumé : Suite à la mission d'expertise réalisée en 1999, un programme d'extension de la surveillance RNO aux Antilles à été décidé en Comité de Pilotage. Les opérations en routine ont débuté fin 2001. En octobre 2002 les intervenants du RNO "hydrologie" ont donc accumulé presque un an de résultats. Les premières analyses d'huîtres du RNO "matière vivante" sont en cours. Il était donc nécessaire de procéder à la formation des agents à l'utilisation de l'outil Quadrige de façon à leur permettre de saisir les résultats dans la base de données et à les en extraire. Cette mission a été réalisée par Christian Bonnet pour les aspects Quadrige et Didier Claisse pour les aspects thématiques. Les objectifs de la présente mission de formation Quadrige étaient multiples :
(a) Regrouper tous les intervenants antillais sur un même site de façon à ce qu'ils bénéficient d'une formation homogène et qu'ils s'approprient collectivement Quadrige pour parler entre eux un langage commun par la suite. (b) Vérifier sur chaque site le bon fonctionnement des connexions au serveur Ifremer et encadrer une saisie-extraction type de façon à consolider les acquis en tenant compte des particularités locales. (c) Utiliser le temps éventuellement disponible pour régler certains problèmes de terrain ou d'organisation. Droits : 2002 Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/00016/12750/9682.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00016/12750/ | Partager |
Dynamique et réponse fonctionnelle des foraminifères et de la macrofaune benthiques en zone ostréicole dans les pertuis charentais Auteur(s) : Bouchet, Vincent Éditeur(s) : Université d'Angers Résumé : In oyster farming areas, organic matter fluxes toward sediment is increased. Pacific oysters (Crassostrea gigas) reject organic-rich faeces and pseudofaeces as a result of filtration process. Organic matter can be consumed by benthic fauna, but in excess it can entails the reduction of benthic faunal species richness, abundance and biomass. Organic matter degradation also induces hypoxic (or anoxic) conditions in the sediment, and production of ammonia and sulfides in toxic concentrations. The main objective of this study is to assess the effects of oyster farming on benthic intertidal ecosystems in the Pertuis Charentais. Benthic macrofauna, living (stained) foraminifera, and physicochemical characteristics of the water column and sediment were used as indicators to evaluate these effects. A multidisciplinary approach was conducted across the Pertuis Charentais at 3 different spatial scales: an oyster trestle (micro-scale), an oyster culture area (meso-scale) and various sites across the Pertuis Charentais (macro-scale). The study was also realised at 4 different temporal scales: some months for the spatial micro-scale, every two weeks for 2 years at meso-scale and once per season during one year at macro-scale. In this study, I found that oyster farming enriches sediment in fine particles, organic matter (up to 12 %), particulate organic carbon (15-20 µg mg 1) and leads to high microphytobenthic biomass. Moreover, the association of seasonnal warming (during spring and summer), remineralisation of accumulated organic matter and short-term hypoxic conditions leads to sulfides and ammonium production. Consequently, the benthic biodiversity decreases and the population dynamic is disturbed. The population dynamic disturbance is characterised by fast abundance rises followed by high mortality rates. In these conditions, tolerant benthic macrofaunal (Cirratulidae, Spionidae and Capitellidae) and foraminiferal (Ammonia tepida and Cribroelphidium gunteri) species are promoted. AMBI index confirms "medium" ecological quality of oyster farming areas. On the contrary, across the control sites, sensible species are maintained (Amphipods, Rosalina cf. vilardeboana). Comparison of oyster farming techniques shows that on-bottom culture is less disturbing for benthic ecosystem than off-bottom culture. Axial tomodensitometry, an innovative method, was used to describe in 3D the sedimentary column organisation. I show that oyster farming modifies the sedimentary column functioning. Indeed, the macrofaunal diversity decrease leads to the modification of the functional diversity of assemblages. Thus, the vertical distribution of living foraminifera is limited in oyster farming areas, because their distribution is tightly related to macrofaunal bioturbating modes. Dans les zones ostréicoles, les flux de matière organique sont importants, l'huître Crasssotrea gigas rejetant sous forme de pseudo-fécès et de fécès de grandes quantités de matière organique. De ce fait, bien que cette matière organique puisse être consommée par la faune benthique, sa surabondance peut provoquer une réduction de la richesse spécifique, de l'abondance et de la biomasse et provoquer sur le plan des processus biogéochimiques des déplétions en oxygène et l'apparition de substances comme l'ammonium et les sulfures dont les concentrations peuvent devenir toxiques. L'objectif principal de cette étude était donc de déterminer l'impact de l'ostréiculture, grâce à plusieurs indicateurs, sur le compartiment benthique d'un écosystème littoral comme les pertuis charentais. Pour évaluer ces effets, la macrofaune benthique et les foraminifères vivants benthiques ont été utilisés en association avec des mesures des paramètres physico-chimiques de la colonne d'eau et du sédiment. Une approche pluridisciplinaire a ainsi été menée dans les pertuis charentais à trois échelles spatiales différentes : à l'échelle d'une table ostréicole (micro-échelle), à l'échelle d'un site ostréicole (méso-échelle) et à l'échelle des pertuis charentais (macro-échelle). Dans les trois cas, un suivi dans le temps a été associé à une étude de distribution spatiale, quelques mois à micro-échelle, tous les quinze jours pendant deux années à méso-échelle et une fois par saison pendant une année à macro-échelle. Ces différentes approches ont permis d'avoir une vision pertinente de la dynamique et de la réponse fonctionnelle de la faune benthique aux changements induits par la présence de l'ostréiculture. La présence des cultures ostréicoles dans les pertuis charentais enrichit les sédiments en particules fines, en matière organique (12 %), en carbone organique particulaire (15-20 µg mg-1) et favorise une production microphytobenthique élevée. Pendant la période chaude de l'année printemps-été, la reminéralisation de la matière organique accumulée associée à des hypoxies temporaires a favorisé la production de sulfures et d'ammonium. Dans les stations soumises à l'ostréiculture, la diversité des assemblages diminue. La dynamique des espèces est caractérisée par des augmentations rapides des abondances suivies d'épisodes de mortalité. Les espèces tolérantes de la macrofaune benthique (Cirratulidae, Spionidae et Capitellidae) et des foraminifères vivants benthiques (Ammonia tepida et Cribroelphidium gunteri) sont favorisées. Le calcul de l'indice AMBI confirme la qualité écologique moyenne de ces sites. Au contraire, dans la station témoin, les espèces sensibles sont favorisées (Amphipodes, Rosalina cf. vilardeboana). La comparaison de la technique de culture sur table et de culture à plat a montré que la culture des huîtres à plat est moins perturbante pour le milieu. L'étude de la bioturbation a montré l'influence qui existe entre le mode de bioturbation des différents groupes de la macrofaune et la répartition verticale des foraminifères vivants dans la colonne sédimentaire. La diminution de la diversité des assemblages de la macrofaune dans les zones soumises à l'ostréiculture modifient la diversité fonctionnelle de ces assemblages et affectent le fonctionnement de la colonne sédimentaire, limitant la répartition verticale des foraminifères dans ces zones. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/these-2582.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2582/ | Partager |
Contribution à l'étude des protozooses de l'huître plate Ostrea edulis Linné, 1758 Auteur(s) : Pichot, Yves Éditeur(s) : Université des Sciences et Techniques du Languedoc, Montpellier Résumé : On étudie les parasitoses à Marteilia refringens et à Haplosporidium armoricanum de l’huître plate européenne Ostrea edulis. L’étude de M. refringens précise certains aspects de la biologie de l’agent infectieux. Elle montre que les modalités du cycle de développement du parasite et l‘ultrastructure des stades les plus évolués de la sporogenèse peuvent être modifiées selon les conditions hydrobiologiques du milieu dans lequel est cultivé l’hôte. Elle établi que l’action du parasite conduit à la destruction des épithéliums digestifs de l’huître et s’exerce en interférant avec le métabolisme protéique d’O. edulis. Elle précise l‘ultrastructure des cellules impliquées dans des proliférations hémocytaires atypiques associées à la parasitose et établit la nature néoplasique du phénomène. L’étiologie de l’hémocytose n’est toutefois pas déterminée. Enfin elle met en évidence un cas d‘hyperparasitisme de M. refringens par une Microsporidie. L’étude ultrastructurale de la sporogenèse et des effets pathogènes du Protozoaire vis à vis de l’hôte nous conduit à identifier l’hyperparasite comme Nosema ormieresi et montre que certains stade de M. refringens peuvent être fortement altérés par l’infestation microsporidienne. L’étude d’une Haplosporidie observée chez O. edulis du bassin d’Arcachon (France) nous amène à comparer la sporagenèse du parasite avec celle d’autres Haplosporidies d’invertébrés marins. Les caractéristiques de la spore nous incitent à inclure le parasite dans le genre Haplosporidium et le rapprochement du Protozoaire avec Minchinia armoricana conduit à l’identifier comme Haplosporidium armoricanum. L’étude de la pathogenèse des infections à M. refringens et à H. armoricanum permet de préciser les relations entre les parasites étudiés et leur hôte commun l’huître plate et les interactions hôte-parasite-milieu pouvant intervenir dans le caractère des deux maladies. Droits : The Author, Univ. Montpellier, ISTPM http://archimer.ifremer.fr/doc/00083/19411/17022.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00083/19411/ | Partager |
Conséquences génétiques de la production de larves d'huîtres en écloserie : étude des processus de dérive et de sélection Auteur(s) : Taris, Nicolas Sauvage, Christopher Batista, Frederico Baron, Sophie Ernande, Bruno Haffray, Pierrick Boudry, Pierre Éditeur(s) : Actes du 6e colloque national BRG, La Rochelle, 2-3-4 octobre 2006 Résumé : Previous studies have shown heritable variation in larval developmental traits in the Pacific oyster Crassostrea gigas. In order to study the genetic consequences of production of oyster larvae in hatcheries, two factors, specific to hatcheries, were examined: the effect of discarding the smallest larvae (i.e. culling) and the effect of temperature (20°C versus 26°C). A mixed-family approach was used in order to infer the genetic composition of larval populations and family assignment, limiting possible environmental bias and allowing the study of a relatively large number of families using a limited number of larval tanks. Our results show that three multiplexed highly polymorphic microsatellite markers are a powerful tool for family assignment and, consequently, for the study of bivalve larvae genetics. Culling, by selective sieving of the smallest larvae is an advantageous practice at a phenotypic scale as it reduced variance in larval size, variance of developmental rate and time to settlement. Culling of 50% of the larval population only led to 15% less spat, showing a positive phenotypic correlation between larval growth and settlement success. However, culling represents a substantial risk for diversity loss, because it increases the variance of reproductive success among parental oysters. The effective population sizes of early settling cohorts of settlement were lower than those of later ones. Our results show that the settlement of slow growing larvae significantly contributes to minimizing the variability of reproductive success and therefore to maximizing genetic diversity. These results corroborate the low estimations of variability of broodstocks sampled in several French commercial hatcheries, relative to natural populations. The genetic composition of the larval population and the resulting spat was significantly different between the two tested temperatures, revealing genotype x environment interaction for survival. Similarly, genotype x environment interaction was also observed for larval growth as a higher temperature exerted a positive influence on the expression of genetic variability for this trait. Consequently, we can conclude that a temperature of 26°C coupled with culling, to common practice in oyster hatcheries, is likely to amplify the selection pressure for fast growing larvae. To test for this hypothesis, we compared larval developmental traits in the progeny of a hatchery broodstock closed for 7 generations, with the progeny of wild oysters and the two possible hybrids. Our results show that selection of fast growing larvae can counteract presumed inbreeding depression, due to higher mean relatedness among hatchery broodstock than in the wild. Genetic effects of intensive rearing conditions at larval stage are significant and should be taken into account in hatchery practices, especially in terms of genetic diversity management. Afin d'étudier les conséquences génétiques des pratiques de production en écloserie d'huître creuse, deux facteurs ont été examinés : l'élimination des petites larves et la température. Nos résultats montrent que l'assignation de parenté par marqueurs microsatellites est un outil performant pour les études génétiques en phase larvaire de familles élevées en mélange. Bien qu'avantageux d'un point de vue phénotypique, le tamisage sélectif représente un risque de perte de diversité. La fixation des larves à croissance lente permet en effet de minimiser la variabilité du succès reproducteur et de fait, de maximiser la variabilité génétique. Ces résultats corroborent les estimations de variabilité sur les stocks d'écloseries françaises où l'on constate une diversité allélique inférieure à celle de populations issues du milieu naturel. La température exerce également une influence sur la précocité de l'expression de la variabilité génétique pour la croissance larvaire. Ainsi une température élevée associée à une procédure de tamisage peut amplifier l'effet sélectif. Enfin, la sélection de larves à croissance rapide semble démontrée, s'opposant à la dépression de consanguinité présumée. Les conditions d'élevage peuvent donc avoir un effet génétique significatif qui devrait être pris en considération dans les pratiques d'écloserie, notamment dans la gestion de la diversité génétique. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/acte-1505.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1505/ | Partager |
Recent developments in the detection of phycotoxins Auteur(s) : Hess, Philipp Nicolau, Elodie Éditeur(s) : Actes de Colloque: Avancées et nouvellles technologies en toxinologie, éditeurs: Julien BARBIER, Evelyne BENOIT, Pascale MARCHOT, César MATTEI, Denis SERVENT Résumé : Over the past seven years, methods available for the detection of phycotoxins have been extensively reviewed in a number of international expert committees, such as the consultations organised by FAO/IOC/WHO and EFSA, as well as by individual scientists. These reviews have shown that the methods available have severe limitations for the use in official control, either due to their limited scope and detection capability or due to a lack of calibration standards, reference materials and validation efforts. The present review focuses on recent developments in the detection of phycotoxins in several areas of applied research. Not being able to exhaustively describe all recent developments, the review focussed on three areas of interest to the authors: (i) detection of ultra-trace amounts of toxins, (ii) metabolism of toxins and their localisation in biological tissues, and (iii) approaches to detect unknown toxins or analogues of known toxins. Miniaturisation in combination with physico-chemical techniques appears to be a very efficient approach to detect low trace amounts of individual toxin analogues. In particular, the detection of azaspiracids and okadaic acid and analogues, using micro-filtration and on-line pre-concentration techniques, has shown to be useful for the characterisation of various algal and shellfish species. In the area of interactions of toxins with shellfish and mammalian systems, it is noted that several studies on biomarkers reveal either protein biomarkers of exposure to toxins or potential pathways of metabolism of the toxins themselves. A particular focus is given to recent findings in the areas of brevetoxin metabolism and biomarkers as well as azaspiracid localisation and metabolism. Finally, the detection of novel compounds is a particularly challenging area. The interest in this area has risen over the past years following cases of unexplained mouse toxicity such as the UK cockle toxicity and the French atypical toxicity in mussels and oysters from the Atlantic and Mediterranean coasts. Some attention is given to immuno-, functional and cellular bio-assays for the identification of bioactive agents in shellfish. Durant les sept dernières années, les méthodes disponibles pour la détection des phycotoxines ont été abondamment revues dans de nombreux groupes internationaux d’expertises, tels que les consultations organisées par FAO/IOC/WHO et EFSA ainsi que dans de nombreux articles scientifiques de synthèse. Ces revues ont démontré que, vis-à-vis des systèmes de régulations officiels, les méthodes disponibles présentent des limites d’utilisation importantes. Soit elles ont un périmètre réduit et des limites de détection trop élevées, soit il y a un manque d’étalons, de matériaux de référence ou d’efforts de validation. La présente revue focalise sur les développements récents dans la détection de phycotoxines en recherche appliquée. Sans vouloir décrire de manière exhaustive tous les développements récents, la revue examine trois domaines d’intérêt pour les auteurs : (i) la détection de quantités ultra-traces de toxines, (ii) la métabolisation et la localisation des toxines dans des tissus biologiques, et (iii) les approches pour la détection de toxines non-répertoriées ou des analogues de toxines connues. La miniaturisation en combinaison avec les techniques physico-chimiques constitue apparemment une approche efficace pour la détection de faibles traces d’analogues individuels des toxines. En particulier, la micro-filtration et des techniques de pré-concentration en ligne se sont montrées utiles pour la détection des azaspiracides et des toxines du groupe de l’acide okadaïque dans la caractérisation de diverses espèces d’algues et de coquillages. Dans le domaine des interactions des toxines avec les coquillages et des systèmes vivants de mammifères, nous avons noté que plusieurs études sur les bio-marqueurs révèlent soit des marqueurs protéiniques d’exposition aux toxines, soit des marqueurs du métabolisme des toxines elles-mêmes. Un intérêt spécifique a été trouvé dans les résultats d’étude sur le métabolisme des brévétoxines et des azaspiracides. La détection des composés bioactifs non-répertoriés constitue un défi particulièrement difficile. Ce domaine a trouvé plus d’intérêt dû à plusieurs cas de toxicités inexpliquées dans le test souris telles que les toxicités observées dans les coques en provenance de Grande-Bretagne ou encore dans les moules et huîtres des côtes méditerranéennes et atlantiques françaises. Une attention particulière a été consacrée à l’identification d’agents bioactifs par les essais cellulaires ou fonctionnels ou basés sur la détection immuno-chimique. Droits : 2010 SFET http://archimer.ifremer.fr/doc/00019/12975/9949.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00019/12975/ | Partager |
Taxonomie et virulence de vibrions pathogènes d'huîtres creuses Crassostrea gigas Auteur(s) : Le Roux, Frédérique Résumé : As the emergence of new vibriosis in the European Atlantic coasts has been associated with mass mortalities of molluscs cuasing important economic losses, the project obectives are to provide knowledge and operational tools to evaluate the impact of vibriosis on farmed japenese oyster Crassostrea gigas. Facing the diversity of Vibrio species associated to bivalve disease outbreaks, the difficulties of identification and the detemrination of their pathogenic abilities we propose a double approach to correlate phenotype/geneotype of a bacteria with risk of disease : 1) by genotyping we will evaluate if specific strains are associated with disease. 2) by evaluating likely virulence mechanisms implicated in pathogenesis, we will characterise the genes involved. Therefore, new diagnostic test should be used in an epizootiological study to evaluate the importance of these emerging pathogens in farmed bivalves and will be supplied for further exploitation in aquaculture.
Les vibrioses sont les infections bactériennes les plus courantes chez les espèces marines d'intérêt aquacole. Certaines espèces sont pathogènes et ont été associées à d'importantes pertes économiques pour l'industrie aquacole dans le monde. L'objectif principal de mon projet de recherche est de développer des outils diagnostiques pertinents permettant d'évaluer l'impact des vibrioses dans des élevages d'huîtres creuses Crassostrea gigas. Le problème majeur est l'extraordinaire diversité des espèces appartenant à ce genre bactérien, compliquant considérablement leur caractérisation en terme de spéciation et de virulence. Nous développons une double approche pour corréler le phénotype et le génotype de pathogènes potentiels par : 1) une clarification taxonomique des souches de vibrions nous déterminons si certaines espèces sont systématiquement associées à de maladies; 2) une caractérisation des mécanismes de virulence, nous recherchons les gènes supports de la pathogénie. Les marqueurs génétiques ou de virulence mis au point pourront alors être utilisés pour une étude épidémiologique de ces maladies. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/2004/these-3699.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3699/ | Partager Voir aussi Taxonomie Marqueur génétique Pathogène Génotype Phénotype Crassotrea gigas Huître Vibrioses Diagnostique Télécharger |
Possibilités d'ostréiculture en Guyane Auteur(s) : Lemoine, Michel Rose, Joel Laure, Albert Éditeur(s) : ISTPM Résumé : Les travaux, entrepris dès 1971 au cours des missions d'étude biologique et hydrologique par MM. TROCHON, TOURNIER et BARBAROUX, et poursuivis par le laboratoire I.S.T.P.M. de Cayenne, ont permis d'obtenir en 1975 et 1976 d'intéressants résultats d'essais d'élevage en mer d'huîtres de palétuviers cueillies ou collectées dans le gisement naturel de Montsinéry. Science et Pêche (0036-8350) (ISTPM), 1977-09 , Vol. 272 , P. 15-30 Droits : Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/1977/publication-7132.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/7132/ | Partager |
Etude des processus de dérive et de sélection liés aux pratiques d'élevage en écloserie d'huître creuse Auteur(s) : Boudry, Pierre Résumé : Genetic consequences of production of Pacific oyster larval in hatchery: drift and selective pressures related to rearing practices. In order to study the genetic consequences of production of oyster larvae in hatcheries, two factors were examined: the effects of discarding the smallest larvae (i.e. culling) and temperature effects. A mixed-family approach was used in order to infer the genetic composition of the larval population. The results show that high polymorphic microsatellite-based family assignment is a powerful tool for the study of bivalve larvae genetics. Culling by selective sieving is an advantageous practice at a phenotypic scale, but also represents a substantial risk for diversity loss if parentage assignment is not introduced as a breeding practice. Settlement of slow growing larvae contributes to minimizing the variability of reproductive success and therefore to maximizing genetic diversity. These results corroborate the lower estimations of variability made on broodstocks from French commercial hatcheries relative to natural populations. Temperature exerts an influence on the expression of genetic variability for larval growth. A temperature of 26°C, coupled with culling could amplify the selective effect. Furthermore, selection of fast growing larvae has proven to counteract inbreeding depression at this stage. Genetic effects of intensive rearing conditions are significant and should be taken into account in hatchery practices, especially in terms of genetic diversity management. Afin d'étudier les conséquences génétiques des pratiques de production de larves en écloserie d'huître creuse, deux facteurs ont été examinés : l'effet de l'élimination des plus petites larves et l'effet de la température. Une approche de familles élevées en mélange a été utilisée afin d'avoir accès à l'information génétique au stade larvaire. Les résultats obtenus montrent que l'assignation de parenté basée sur des marqueurs microsatellites hautement discriminants est un outil performant pour les études génétiques en phase larvaire. Bien qu'avantageuse d'un point de vue phénotypique, la pratique de tamisage sélectif représente un risque substantiel de perte de diversité si cette pratique n'est pas associée à une assignation de parentée par empreintes génétiques. La fixation des larves à croissance lente permet de minimiser la variabilité du succès reproducteur et de fait, de maximiser la variabilité génétique. Ces résultats corroborent les estimations de variabilité sur les stocks d'écloseries commerciales françaises où l'on constate une diversité allélique inférieure à celle de populations issues du milieu naturel. La température exerce également une influence sur la précocité de l'expression de la variabilité génétique pour la croissance larvaire. Ainsi une température élevée (26°C) associée à une procédure de tamisage peut amplifier l'effet sélectif. Enfin, la sélection de larves à croissance rapide semble démontrée, s'opposant à la dépression de consanguinité présumée en phase larvaire. Les conditions d'élevage peuvent donc avoir un effet génétique significatif qui devrait être pris en considération dans les pratiques d'écloserie, notamment dans la gestion de la diversité génétique. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/rapport-1459.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1459/ | Partager |
Origine et état de la population de Crepidula fornicata (Gastropoda Prosobranchia) sur le littoral français Auteur(s) : Blanchard, Michel Éditeur(s) : Société Française de Malacologie Résumé : The introduction of the limpet Crepidula fornicata on French coasts occurred through a number of stages of unequal amplitude. The two main stages are the result of a) its transportation on the hulls of the Allies ships during WWII, and b) the voluntary introduction of the Japanese oyster Crassostrea gigas in the 1970s. A recent assessment of its distribution shows that it can be found from the North Sea to the Mediterranean shores, resulting in some conflicts, due to its high density. L'introduction de la crépidule Crepidula fornicata sur les côtes de France s'est effectuée en plusieurs phases d'inégale amplitude. Les deux plus importantes sont dues au transport par les coques de bateaux alliés, à la fin de la deuxième guerre mondiale et à l'introduction volontaire, durant les années 1970, de l'huître japonaise Crassostrea gigas. Un bilan actuel de sa répartition montre qu'elle est présente de la Mer du Nord aux rives de Méditerranée, engendrant parfois des situations de conflit, du fait de sa forte densité. Haliotis (Société Française de Malacologie), 1995 , Vol. 24 , P. 75-86 Droits : 1995 Société Française de Malacologie http://archimer.ifremer.fr/doc/1995/publication-6191.PDF http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6191/ | Partager |
Les surmortalités des naissains d'huîtres creuses Crassostrea gigas - journée d'information et d'échanges du 18 janvier 2012 Résumé : Depuis 2008, la filière ostréicole française fait face à des mortalités très importantes touchant les naissains d’huîtres creuses, Crassostrea gigas. Répondant aux missions qui lui sont assignées, l’Ifremer a rapidement lancé, en synergie avec ses partenaires et l’interprofession, des travaux visant à décrire précisément le phénomène, à progresser dans la compréhension de ses causes, et à étudier quelles pouvaient être les contributions à apporter pour une aide à la gestion du phénomène et à la mise en oeuvre de pistes de sorties de crise. Le 18 janvier 2012, l’Ifremer a organisé, avec le soutien du Ministère de l’Agriculture, de l’Alimentation, de la Pêche, de la Ruralité et de l’Aménagement du Territoire, une journée d’information et d’échanges dédiée à cette problématique pour : présenter une synthèse les connaissances acquises à l’Ifremer depuis 4 ans ; présenter les dernières avancées et les perspectives, les projets en cours et à venir ; donner une large place à l’échange entre les différents participants. Cette journée a réuni les ministères, les représentants de la profession conchylicole, les centres techniques régionaux conchylicoles, les laboratoires agréés et reconnus, des organismes de recherche et des universités partenaires. Ce document retrace les interventions et les échanges qui se sont déroulés pendant cette journée d’information. Droits : Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/00084/19574/17196.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00084/19574/ | Partager |