![]() | Compte-rendu de la campagne "Resubguy 2" (mai 1993) sur le plateau continental de la Z.E.E. guyanaise Auteur(s) : Gueguen, Frédéric Résumé : Le cycle biologique du priucipal stock de crevettes pénéïdes (Penaeus subtilis) exploité sur le plateau continental guyanais est court (18 mois environ). Les variabilités intra et inter annuelles de l'abondance des individus appartenant aux différentes composantes des premières phases du cycle (larves, post-larves, juvéniles) sont très fortes, ce phénomène étant exacerbé par le double changement de milieu au cours du cycle, passage d'un habitat en eau salée à celui en eau douce puis retour au précédent.
La pêcherie de la flottille crevettière guyanaise est ainsi basée sur un stock au renouvellement rapide et variable, aussi l'optimisation de sa gestion implique une meilleure compréhension des mécanismes de recrutement des crevettes et notamment de ses variabilités spatio-temporelles, intra et inter annuelles.
Ainsi, depuis octobre 1992 une étude est conduite pour analyser ce mécanisme de recrutement Elle s'intègre dans un programme de coopération régionale entre l'IFREMER et le Ministère de l'Agriculture, de l'Elevage et des Pêches du Surinam financé par des fonds FEDER et du FIC, et elle est menée par l'IFREMER dans la Zone Economique française et le laboratoire du Département des pêches du Surinam sur le plateau surinamien.
Ce programme prévoit une série de huit campagues en mer qui seront conduites en parallèle par chacun des deux laboratoires Français et Surinamien sur les plateaux de Guyane (campagues RESUBGUY) et du Surinam (campagnes RESUBSUR) afin d'analyser le phénomène de recrutement sur la plus large échelle possible d'observation (plateau guyano~urinaruien). Deux campagues annuelles ont été programmées pour chaque pays, en mai et en octobre. La périodicité de ces campagues est fonction des résultats des travaux conduits par l'IFREMER et l'ORSTOM sur la phase pré-recrutée de Penaeus subtilis qui ont mis en évidence deux principales périodes annuelles distinctes de recrutement (avril-mai; septembre-octobre).
Cette étude n'est pas limitée pas à l'examen des seules captures de crevettes Penaeus subtilis, puisqu'elle inclue également l'analyse de la composition des prises accessoires des crevettiers. Les "by-catches" considérées dans ce travail sont surtout représentées par la crevette "sea-bob", Xiphopenaeus kroyeri, ainsi que par les principales espèces de poissons d'intérêt commercial (ou ayant une forte probabilité de le devenir dans un futur proche). Enfin, une attention particulière a aussi été portée sur les captures accidentelles de tortues marines afin d'en estimer l'importance réelle. Droits : 1993 Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/00070/18155/15710.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00070/18155/ | Partager |
![]() | Dynamic of an intracontinental orogenic prism: thermochronologic (apatitefission tracks) and tectonic evolution of the Axial Zone and the piedmonts of the west‐central Pyrenees ; Dynamique d'un prisme orogénique intracontinental : évolution thermochronologique (traces de fission sur apatite) et tectonique de la Zone Axiale et des piémonts des Pyrénées centro‐occidentales Auteur(s) : MERESSE, Florian Auteurs secondaires : Géosciences Montpellier ; Université des Antilles et de la Guyane (UAG) - Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS) - Université de Montpellier (UM) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Université de Montpellier 2 Pierre Labaume; Marc Jolivet Éditeur(s) : HAL CCSD Résumé : In this work on a complete transect of the west‐central Pyrenees, we combine low temperature thermochronology (apatite fission tracks, AFT) with a detailed structural analysis to describe vertical movements related to the thrusting system evolution, and to determine the influence of the latter on the sedimentation/burial/exhumation cycle of thesynorogenic deposits of the southern foreland basin (Jaca and Ainsa basins). AFT analysis from a transect of the south‐Pyrenean basin show the southward decrease of the fission track reset level from the southern edge of the Axial Zone to the South‐Pyreneanfrontal thrust, implying the southwards decrease of the burial amount from more than 5kmin the north to less than 3km in the south assuming an average geothermal gradient of 25°C.km‐1. The structural setting of the Jaca basin attests that the burial of the synorogenicsediments was mainly due to the sedimentary accumulation. AFT data from the northernpart of the basin display a late Oligocene‐early (middle) Miocene cooling event. Newinterpretation of industrial seismic reflection profiles across the Jaca basin suggests that the Oturia thrust is rooted in the Bielsa basement thrust, responsible for the early (‐middle) Miocene out‐of‐sequence tectonic reactivation of the southern flank of the Axial Zone (Jolivet et al., 2007). These results reveal a lower Miocene (Burdigalian ‐?Langhian) out‐of sequence episode of tectonic activity of the interior of the south‐Pyrenean foreland basin. AFT data from the Axial Zone and the North‐Pyrenean Zone confirm the general southwardmigration of the thrusting system, and also bring evidence of the late Oligocene‐lowe rMiocene out‐of‐sequence tectonic reactivation of the northern flank of the Axial Zone. All these results attest of a late Oligocene‐lower Miocene (Burdigalian‐?Langhian) "pop‐up" reactivation of the inner part of the west‐central Pyrenees, younger than the sealing of thesouth‐Pyrenean front (Aquitanian‐?Burdigalian) which is classically considered to mark the end of the Pyrenean compression. These results lead us to propose a new crustal scale evolution model of the west‐central Pyrenees in 3 stages: (i) From the Late Cretaceous to themiddle Eocene, the orogenic prism is characterised by the absence of relief, related to theinversion of Cretaceous extensional structures leading to the accretion of thin crustal units; (ii) The late Eocene‐Oligocene stage corresponds to the continental collision, marked by the creation of important relief associated with the accretion of thick crustal units; (iii) During the early Miocene, the inner part of the Pyrenean wedge is tectonically reactivated. Ce travail de thèse concerne une transversale complète des Pyrénées centro-occidentales, où on a combiné la thermochronologie basse température (traces de fission sur apatites, TFA) avec une analyse structurale détaillée pour décrire les mouvements verticaux associés à l'évolution du système chevauchant, et pour déterminer l'influence de ce dernier sur le cycle sédimentation/enfouissement/exhumation des dépôts synorogéniques du bassin d'avant‐chaine sud (bassins de Jaca et Ainsa). L'analyse TFA complète les données déjà publiées dans la Zone Axiale et la Zone Nord‐Pyrénéenne, e tconstitue la première étude de ce genre dans un bassin d'avant‐chaîne pyrénéen. Les données TFA sur la transversale du bassin sud‐pyrénéen montrent une diminution vers le sud du degré d'effacement des traces de fission, traduisant la diminution vers le sud de la quantité d'enfouissement, supérieure à 5 km au nord et inférieure à 3 km au sud dans l'hypothèse un géotherme de 25°.km‐1. Le contexte géologique montre que l'enfouissement est principalement lié à l'accumulation des dépôts synorogéniques. Les données TFA de lapartie nord du bassin montrent un refroidissement d'âge Oligocène supérieur‐Miocèneinferieur (moyen). Par ailleurs, une nouvelle interprétation de profils de sismiques réflexiondans le bassin de Jaca montre que le chevauchement d'Oturia s'enracine dans lechevauchement de socle de Bielsa, responsable de l'exhumation tectonique hors‐séquencedu bord sud de la Zone Axiale au Miocène inférieur (‐moyen) (Jolivet et al., 2007). Cesrésultats attestent donc de l'exhumation tectonique hors‐séquence au Miocène inférieur (Burdigalien‐ ?Langhien) de la partie nord du bassin d'avant‐chaine sud‐pyrénéen. Des données TFA obtenues dans la Zone Axiale et la Zone Nord‐Pyrénéenne confirment lamigration générale vers le sud du système chevauchant, et mettent également en évidencela réactivation tectonique hors‐séquence du bord nord de la Zone Axiale à l'Oligocèneterminal‐Miocène inférieur. L'ensemble de ces résultats atteste donc de la réactivation en " pop‐up " de la parties interne des Pyrénées centre‐ouest à l'Oligocène supérieur‐Miocèneinférieur (Burdigalien‐ ?Langhien), postérieurement au scellement du front sud‐pyrénéen (Aquitanien‐ ?Burdigalien) classiquement considéré comme marquant la fin de lacompression pyrénéenne. Ces données nous ont permis de proposer un nouveau modèle d'évolution crustale des Pyrénées centro‐occidentales en 3 grandes étapes : (i) du Crétacé supérieur à l'Eocène moyen, le prisme est caractérisé par une absence de relief, en lien avec l'inversion de structures extensives crétacées conduisant à l'accrétion de petites écailles crustales ; (ii) la période Eocène supérieur‐Oligocène correspond à la collision continentale proprement dite, et est marquée par la création d'importants reliefs associés à l'accrétion d'épaisses unités crustales ; (iii) au Miocène inférieur, la partie interne du prisme pyrénéen est réactivée. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00772154 Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess tel-00772154 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00772154 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00772154/document https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00772154/file/thesemeresse.pdf | Partager |
![]() | Modèles hiérarchiques et processus ponctuels spatio-temporels - Applications en épidémiologie et en sismologie Auteur(s) : Valmy, Larissa Auteurs secondaires : Laboratoire de Mathématiques Informatique et Applications (LAMIA) ; Université des Antilles et de la Guyane (UAG) Université des Antilles-Guyane Professeur Jean VAILLANT Éditeur(s) : HAL CCSD Résumé : Point processes are often used as spatial or spatio-temporal distribution models of occurrences. In this PhD dissertation, we focus first on Cox processes driven by a hidden process associated with a Dirichlet process. This model corresponds to hidden occurrences influencing the stochastic intensity of observed occurrences. We generalize the notion of "Shot noise Cox process" introduced by M{o}ller and develop its bayesian analysis by a Gibbs sampler combined with a Metropolis-Hastings algorithm. We show that our MCMC method is a reversible jump one. The model takes into account a random number of hidden contributions producing effects on the observed point process intensity. Therefore the parameter space has a variable dimension. We focus the statistical inference on the estimation of the hidden contribution expected value, the hidden contribution expected number, the spatial influence and correlation parameters. The contribution equality test and contribution independence test are proposed. Applications in epidemiology and ecology are shown from extit{Rubus fruticosa} data, extit{Ibicella lutea} data and death number data in counties of Georgia, USA. Two situations are considered with respect to available data~: firstly, the spatial positions of occurrences are observed between several pairs of consecutive dates; secondly, counts are carried out over a fixed time interval in several spatial sampling units. Secondly, we focus on point processes with memory introduced by Kagan, Ogata and Vere-Jones, pioneers in statistical seismology. In fact, spatio-temporal point processes play an important role in the studies of earthquake catalogs since they consist of seismic events with their dates and spatial locations. We studied an ETAS (Epidemic Type Aftershock Sequence) model with time independent background intensity and several triggering functions taking into account previous events. We illustrate our approach with a seismicity study of the Lesser Antilles arc. A comparaison study of Gamma, Weibull, Log-Normal and modified Omori law triggering function models is also carried out. We show that the modified Omori law does not fit the Lesser Antilles seismic data and the best adjusted triggering function is the Weibull model. Consequently, the waiting time between aftershocks is weaker in the Lesser Antilles zone compared to the one in regions with seismicity described by the modified Omori law. In other words, aftershock aggregativity is higher in the Lesser Antilles region. The stochastic background intensity following a Dirichlet process centered on a spatial log-normal process is discussed. Les processus ponctuels sont souvent utilisés comme modèles de répartitions spatiales ou spatio-temporelles d'occurrences. Dans cette thèse, nous nous intéressons tout d'abord à des processus de Cox dirigés par un processus caché associé à un processus de Dirichlet. Ce modèle correspond à des occurrences cachées influençant l'intensité stochastique des occurrences observées. Nous généralisons la notion de " Shot noise Cox process " introduite par Moller et développons le traitement bayésien par un échantillonneur de Gibbs combiné à un algorithme de Metropolis-Hastings. Nous montrons que cette méthode MCMC est à sauts réversibles. Le modèle prend en compte, en effet, un nombre aléatoire de contributions cachées influençant l'intensité du processus ponctuel observé donc a un espace paramétrique de dimension variable. Nous focalisons l'inférence statistique sur l'estimation de la valeur espérée de chaque contribution cachée, le nombre espéré de contributions cachées, le degré d'influence spatiale de ces contributions et leur degré de corrélation. Le test d'égalité des contributions et celui de leur indépendance sont ainsi développés. L'utilité en épidémiologie et en écologie est alors démontrée à partir de données de Rubus fruticosa, Ibicella lutea et de mortalité dans les cantons de Georgia, USA. En termes de données observées, deux situations sont considérées: premièrement, les positions spatiales des occurrences sont observées entre plusieurs paires de dates consécutives; deuxièmement, des comptages sont effectués, au cours d'une période fixée, dans des unités d'échantillonnage spatiales. D'autre part, nous nous intéressons aux processus ponctuels à mémoire introduits par Kagan, Ogata et Vere-Jones, précurseurs de la statistique sismologique. En effet, les processus ponctuels spatio-temporels ont une place importante dans l'étude des catalogues sismiques puisque ces derniers sont généralement constitués d'événements sismiques datés et géo-référencés. Nous avons étudié un modèle ETAS (Epidemic Type Aftershock Sequence) avec une intensité d'arrière-plan indépendante du temps et plusieurs fonctions déclenchantes permettant d'intégrer les événements antérieurs récents. Cette approche est utilisée pour étudier la sismicité de l'arc des Petites Antilles. Une étude comparative des modèles Gamma, Weibull, Log-Normal et loi d'Omori modifiée pour les fonctions déclenchantes est menée. Nous montrons que la loi d'Omori modifiée ne s'ajuste pas aux données sismiques des Petites Antilles et la fonction déclenchante la plus adaptée est le modèle de Weibull. Cela implique que le temps d'attente entre répliques dans la zone des Petites Antilles est plus faible que celui des régions à sismicité décrite par la loi d'Omori modifiée. Autrement dit, l'agrégation des répliques après un événement majeur est plus prononcée dans la zone des Petites Antilles. La possibilité d'inclure une intensité d'arrière-plan suivant un processus de Dirichlet centré sur un processus spatial log-gaussien est discutée. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00841146 Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess NNT : 2012AGUY0555 tel-00841146 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00841146 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00841146/document https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00841146/file/these_VALMY.pdf | Partager |
![]() | Une mondialisation culturelle et linguistique ? Le cas des organismes de promotion culturelle et linguistique Auteur(s) : Ludivynn, Munoz Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes Résumé : La mondialisation favorise le développement d’organisations supranationales, qui fédèrent de nombreux États, il s’agit principalement d’organisations économiques, comme l’Union Européenne, mais elle voit également l’avènement d’organisations d’un nouveau type : les organismes de promotion culturelle et linguistique. L’un des premiers fut le Commonwealth of Nations britannique développé au début du XXe siècle, mais depuis d’autres organismes se sont créés et ils connaissent un succès croissant au vu du nombre de pays qui adhèrent ou souhaitent adhérer. L’un des buts majeurs de ces organismes est la promotion d’une langue et d’une culture ainsi que la promotion de la diversité culturelle. Le champ de questionnement concerne la géopolitique, qui caractérise le rapport de force existant entre les langues et les organismes de promotion à l’échelle mondiale. La méthodologie mobilisée se base sur une étude des différents organismes de promotion culturelle et linguistique ainsi qu’une comparaison pour tenter de comprendre les stratégies développées par ces organismes. Globalisation promotes the development of supranational organizations, which unite many states, and is primarily embodied by economic organizations like the European Union but also by a new type of organizations: organizations promoting cultural and linguistic diversity. Among the first was the British Commonwealth of nations developed in the early twentieth century, and then other organizations have been created and they are increasingly popular in terms of number of countries members or wishing to join. One of the major goals of these organizations is the promotion of a language and culture and the promotion of cultural diversity.The field of inquiry concerns geopolitics that characterized the power struggle between languages and promotion agencies. The methodology is based on a study of the various organizations to promote cultural and linguistic as well as a comparison to try to understand the strategies developed by these organizations. La globalización promueve el desarrollo de las organizaciones supranacionales, que unen a muchos estados, esas organizaciones son principalmente de carácter económico como la Unión Europea, pero también se ve la llegada de un nuevo tipo de organizaciones: los organismos de promoción cultural y lingüística. Una de las primeras fue el Commonwealth of nations británico desarrollado en el siglo XX, pero otros organismos se han creado y están cada vez más popular en cuanto a número de países miembros o que desean unirse. Uno de los principales objetivos de estos organismos es la promoción de la lengua y la cultura y la promoción de la diversidad cultural. El alcance de las preguntas relativas a la geopolítica, que caracteriza el equilibrio de poder entre las lenguas y las agencias de promoción en todo el mundo. La metodología se basa en movilizar un estudio de los diversos organismos de promoción cultural y lingüística, así como una comparación para tratar de entender lo que las estrategias desarrolladas estos organismos. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.5840 http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/5840 | Partager |
![]() | Exposition domiciliaire aux moisissures : quel impact sur le statut aspergillaire du patient atteint de mucoviscidose ? Auteur(s) : Pricope, D. Deneuville, E. Frain, S. Chevrier, S. Belaz, S. Roussey, M. Gangneux, J.-P. Auteurs secondaires : CHU Pontchaillou [Rennes] Association CAPT’AIR Bretagne (CAPT’AIR) ; Centre hospitalier de Dinan Laboratoire de Parasitologie-Mycologie ; Centre Hospitalier Universitaire de Rennes Institut de recherche, santé, environnement et travail [Rennes] (Irset) ; Université d'Angers (UA) - Université des Antilles et de la Guyane (UAG) - Université de Rennes 1 (UR1) - École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ) Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier Masson Résumé : National audience The sources of exposure during diseases due to Aspergillus fungi in cystic fibrosis patients are still poorly explored. We assessed home fungal exposure in patients suffering from cystic fibrosis and analysed its impact on the presence of Aspergillus biological markers, the colonisation of airways, as well as the sensitization and Aspergillus serology. Between March 2012 and August 2012, 34 patients benefited from a visit performed by a home environment medical adviser including sampling for mycological analysis. The number of colonies of Aspergillus was not significantly different in the various sampling sites (P = 0.251), but the number of non-Aspergillus colonies was much higher in the kitchen (P = 0.0045). Subsequently, home fungal exposure was compared between the groups “absence of Aspergillus-related markers” and “presence of Aspergillus-related markers”. Home exposure to Aspergillus (P = 0.453) and non-Aspergillus (P = 0.972) flora was not significant between the 2 groups. Within this series of 34 patients that should be expanded, we note an absence of clear relationship between home exposure and the Aspergillus-linked markers in patients suffering from cystic fibrosis. This result should be taken into account regarding too restrictive hygiene advices provided to families, given the fact that fungal exposure can also results from activities performed away from home. La source d’exposition au cours des pathologies aspergillaires du patient atteint de mucoviscidose reste encore peu explorée. Nous avons évalué l’exposition fongique domiciliaire chez des patients atteints de mucoviscidose, et analysé son impact sur la présence de marqueurs biologiques aspergillaires, colonisation des voies aériennes, ainsi que sensibilisation et sérologie anti-aspergillaire. Trente-quatre patients ont bénéficié d’une visite par un conseiller médical en environnement intérieur entre mars et août 2012, comprenant des prélèvements à visée mycologique. Le nombre de colonies aspergillaires ne différait pas significativement d’un site de prélèvement à l’autre (p = 0,251), mais le nombre de colonies non aspergillaires était significativement plus important dans la cuisine (p = 0,0045). L’exposition fongique domiciliaire a ensuite été comparée entre les groupes « marqueurs aspergillaires absents » et « marqueurs aspergillaires présents ». L’exposition domiciliaire à une flore aspergillaire (p = 0,453) et non aspergillaire (p = 0,972) ne différait pas significativement entre les 2 groupes. Sur cette série de 34 patients qui mérite d’être élargie, on note une absence de lien évident entre l’exposition domiciliaire et la pathologie aspergillaire. Ce résultat doit rendre prudent sur des conseils d’hygiène parfois très contraignants donnés aux familles, l’exposition fongique étant également importante dans le cadre des activités extra-domiciliaires. ISSN: 1156-5233 hal-01158660 https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01158660 https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01158660/document https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01158660/file/Exposition%20domiciliaire%20aux%20moisissures%20postprint%20MYCMED-S-14-00173.pdf DOI : 10.1016/j.mycmed.2015.03.005 | Partager |
![]() | Marine Turtles, Ecosystem Services and Human Welfare in the Marine Ecosystems of the Caribbean Sea: A Discussion of Key Methodologies Auteur(s) : S. Teelucksingh, Sonja Eckert, Scott A.L.D. Nunes, Paulo Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes Résumé : It is increasingly recognized that maintaining biodiversity is of fundamental importance toward sustaining human livelihoods. One of the major assets of the region identified as “Latin America and the Caribbean” (LAC) is its biological wealth; by extension, the continued biodiversity loss of the LAC region is seen as one of the world’s principal environmental problems. The marine resources of Caribbean Sea are of vital economic, ecological and social importance to the LAC region, and are under particular threat. Marine turtles play vital roles throughout the Caribbean Sea both in terms of ecological functions and human welfare. Conservation efforts in this direction can often depend on the ability to place a value on welfare changes associated with the loss of ecosystem goods and services into which biodiversity plays an integral role.Using the ecosystem service categories of the Millennium Ecosystem Assessment, this paper discusses from an inter-disciplinary perspective the methodologies associated with linking marine turtles, ecosystem services and human welfare. While the main economic benefit to be currently valued may stem from the eco-tourism potential surrounding turtle nesting sites, for a true picture of the environmental resources upon which this service depends, it is necessary to also identify the other provisioning, regulating and cultural services of the resource. In this way, human welfare impacts can be more truly judged, and effective resource management can be undertaken. La préservation de la biodiversité est d'une importance fondamentale pour le maintien des moyens de subsistance de l'homme. L'un des atouts majeurs de l’ensemble régional que constitue l'Amérique latine et les Caraïbes (LAC) demeure sa richesse biologique, par extension, toute dégradation de sa biodiversité pose des problèmes environnementaux d’ordre mondial. Les ressources marines de la mer des Caraïbes, qui sont particulièrement menacées, sont d'une importance économique, écologique et sociale vitale pour la région. Les tortues marines jouent un rôle essentiel dans la mer des Caraïbes à la fois en termes de fonctions écologiques et de bien-être humain.En ce sens, les efforts de conservation peuvent de la capacité de chiffrer la valeur sur le bien-être des changements associés à la perte de biens et de services des écosystèmes dans lesquels la biodiversité est partie intégrante. En utilisant les catégories de services des écosystèmes du Millennium Ecosystem Assessment, la présente étude aborde, dans une perspective interdisciplinaire, les méthodologies associées aux interrelations entre les tortues marines, les services écosystémiques et le bien-être de l'homme.Si le principal avantage économique actuellement identifié repose sur le potentiel écotouristique, autour des sites de nidification des tortues, pour une image fidèle des ressources environnementales sur lesquelles ce service repose, il est nécessaire d'identifier également les autres apports de la ressource, en termes de régulations, de services culturels. De cette façon, les impacts sur le bien-être humain peuvent être mieux appréhendés et les ressources peuvent être gérées de façon plus efficace. Caraïbes Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.10990 http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/10990 | Partager |
![]() | Integrating functional diversity into tropical forest plantation designs to study ecosystem processes ; Diversité fonctionnelle et processus écosystémiques dans des assemblages synthétiques d'espèces d'arbres de forêt tropicale Auteur(s) : Baraloto, Christopher Marcon, Eric Morneau, François Pavoine, Sandrine Roggy, Jean-Christophe Auteurs secondaires : Ecologie des forêts de Guyane (ECOFOG) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (CIRAD) - Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) - Université des Antilles et de la Guyane (UAG) - AgroParisTech - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag/EDP Sciences Résumé : International audience The elucidation of relationships between biodiversity and ecosystem processes has been limited by the definition of metrics of biodiversity and their integration into experimental design. Functional trait screening can strengthen the performance of these designs.* We suggest the use of Rao's quadratic entropy to measure both functional diversity and phylogenetic diversity of species mixtures proposed for an experimental design, and demonstrate how they can provide complementary information.* We also present an index assessing the statistical performance of these independent variables in different experimental designs. Measurement of independent variables as continuous vs. discrete variables reduces statistical performance, but improves the model by quantifying species differences masked by group assignments.* To illustrate these advances, we present an example from a tropical forest tree community in which we screened 38 species for nine functional traits. The proposed TropiDEP design is based on the relative orthogonality of two multivariate trait axes defined using principal component analysis.* We propose that independent variables describing functional diversity might be grouped to calculate independent variables describing suites of different traits with potentially different effects on particular ecosystem processes. In other systems these axes may differ from those reported here, yet the methods of analysis integrating functional and phylogenetic diversity into experimental design could be universal. La compréhension des relations pouvant exister entre biodiversité et fonctionnement des écosystèmes a été longtemps limitée par la définition de méthodes de quantification de la diversité biologique et la mise en œuvre de dispositifs expérimentaux permettant sa mesure. L'identification de syndromes de traits fonctionnels clefs influençant des fonctions écosystémiques particulières peut renforcer la performance de ces dispositifs.* Nous suggérons l'utilisation de l'entropie quadratique de Rao pour mesurer la diversité fonctionnelle et phylogénétique dans des assemblages synthétiques d'espèces, et montrons comment ces mesures de diversité sont complémentaires.* Nous présentons également un indice permettant de tester la performance statistique de ces variables indépendantes dans différents modèles expérimentaux. L'utilisation de variables indépendantes continues plutôt que discrètes réduit la performance statistique mais améliore le modèle en quantifiant les différences fonctionnelles entre espèces; différences généralement masquées lors de leur assignation en groupes fonctionnels.* Pour illustrer ces avancées, nous présentons un exemple d'assemblages synthétiques à partir de 38 espèces d'arbres de forêt tropicale sélectionnées pour 9 traits fonctionnels (TropiDEP). Le plan d'expérience de TropiDEP est basé sur l'orthogonalité relative de deux axes multivariés de traits fonctionnels définis par analyse en composantes principales.* Nous proposons que les variables décrivant la diversité fonctionnelle soient groupées pour calculer des variables indépendantes, divisées en plusieurs axes décrivant des combinaisons de différents traits pouvant influencer des processus différents de l'écosystème (e.g. processus du N et du C). Dans d'autres systèmes, ces axes peuvent différer de ceux présentés ici, mais les méthodes d'analyse peuvent être universelles. ISSN: 1286-4560 Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess hal-00883621 https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00883621 https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00883621/document https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00883621/file/hal-00883621.pdf DOI : 10.1051/forest/2009110 | Partager |
![]() | Melt-rock interactions and melt-assisted deformation in the Lherz peridodite, with implications for the structural, chemical and isotopic evolution of the lithospheric mantle Auteur(s) : Le Roux, Véronique Auteurs secondaires : Géosciences Montpellier ; Université des Antilles et de la Guyane (UAG) - Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS) - Université de Montpellier (UM) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Université Montpellier 2 Bodinier Jean-Louis Éditeur(s) : HAL CCSD Résumé : Differentiation of the lithospheric mantle occurred principally through partial melting and extraction of melts. Harzburgites are generally considered as melting residues whereas lherzolites are regarded as pristine mantle weakly affected by melting. However, some orogenic peridotites show evidence of igneous refertilization. In this context, this work re-investigates the nature of the Lherz lherzolites (Pyrenees), type-locality of lherzolites, described as a piece of preserved fertile mantle. Structural and geochemical data show that these lherzolites are not pristine but formed through a refertilization reaction between MORB-like melts and refractory lithosphere. Moreover, the Lherz peridotites were partly used to infer the composition of the primitive upper mantle and these results may have important implications for the nature of the late veneer. Additionally, crystal-preferred orientations of minerals (CPO) highlight a strong feedback between melt percolation and finite strain in the percolated rocks. CPO variations are ruled by a subtle balance between instantaneous melt fraction and local strain rate. This work also investigated the effect of melt percolation on Hf, Nd and Sr isotopes. Isotope systematics in Lherz shows that strong isotopic decoupling may arise in a percolation front. The modelling suggests that decoupled isotopic signatures are generated during porous flow and governed by the melt/matrix elements concentrations, chemical diffusivities or efficiency of isotopic homogenization. Melt-rock interactions can generate “intraplate-like” isotopic signatures. This suggests that a part of isotopic signatures of mantle-related rocks could be generated by diffusional processes associated with melt transport. La différenciation du manteau lithosphérique s'est principalement effectuée par fusion partielle et extraction de magmas. Les harzburgites sont généralement considérées comme des résidus de fusion tandis que les lherzolites représentent un manteau originel peu affecté par la fusion. Cependant, certaines péridotites orogéniques montrent des évidences de refertilisation magmatique. Dans ce contexte, ce travail remet en cause la nature primitive des lherzolites de Lherz (Pyrénées), lithotype de la lherzolite. Les données structurales et géochimiques montrent que ces lherzolites ne représentent pas du manteau préservé mais qu'elles se sont formées par une réaction de refertilisation entre un liquide de type MORB et une lithosphère réfractaire. De plus, les orientations préférentielles de réseau (OPR) des minéraux montrent une forte interdépendance entre la percolation magmatique et la déformation finie observée dans les roches percolées. Les variations d'OPR semblent contrôlées par un équilibre subtil entre fraction de liquide instantanée et taux de déformation local. Ce travail a également abordé les effets de la percolation magmatique sur la variabilité isotopique des roches mantelliques. Les résultats montrent qu'un fort découplage isotopique peut s'observer dans un front de percolation. Les modèles suggèrent que le découplage des signatures isotopiques se produit pendant la percolation, gouverné par le rapport des concentrations en éléments (magma/matrice), la diffusivité et le processus d'homogénéisation isotopique. Les réactions magma/roche peuvent générer des signatures isotopiques de type intraplaque. Ceci suggère qu'une part des signatures isotopiques des roches ou laves dérivées du manteau pourrait être produite par des processus diffusionnels associés à du transport de magma. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00431325 tel-00431325 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00431325 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00431325/document https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00431325/file/theseleroux08.pdf | Partager |
![]() | Etude d'un milieu gélose semi-sélectif pour la recherche de Vibrio penaecida : tests de nouvelles méthodes diagnostiques dans le cadre du programme de recherche sur le syndrome 93 Auteur(s) : Lapouyade, Patrick Résumé : Ce travail décrit la mise au point d'un milieu gélosé semi-sélectif visant à mettre en évidence les Vibrio penaecida en élevage larvaire de pénéides. Le ZoBell-Mannitol-Saccharose-Bleu de bromothymol (ZMSB) a un pH élevé, une forte teneur en sels et ne possède que deux sucres acidifiables, le mannitol et le saccharose. Ce milieu peut être utilisé pour la sélection d'un grand nombre d'espèces du genre Vibrio. La salinité et le ph séparent le germe cherché d'une fraction importante d'espèces de Vibrio, et l'acidification du mannitol et du saccharose révèlent (par le changement de couleur du milieu) les Vibrio de type penaecida qui présentent cette caractéristique. De plus, un milieu minimum comme le ZoBell, additionné de glycérol, permet d'augmenter considérablement la production de pigments noirs (grisâtres) insolubles qui s'accumulent sous forme cristalline chez certaines colonies bactériennes comme Vibrio nigripulchritudo, facilitant ainsi la distinction d'espèces physiologiquement proches comme V. penaecida. Les différents aspects des souches testées sont alors observés par repiquages à l'aide de tampons et permettent d'obtenir des images comparables par superposition. Sur les 26 souches testées une seule présente un aspect comparable à V. penaecida sur ZMSB. Ce Vibrio (V. nigripulchritudo) est facilement différenciable de V. penaecida par culture en milieu ZoBell additionné de glycérol. On peut donc conclure à une bonne spécificité du milieu en question et du procédé de repiquage utilisé. En cas de doutes, la présence de V. penaecida est confirmées par quelques tests biochimiques simples. Un protocoles de fabrication d'un sérum anti V. penaecida est également testé. Droits : 1997 The author, Univ. Caen, Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14340/11624.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14340/ | Partager |
![]() | L'interface hommes-nature: les ressources renouvelables Auteur(s) : Weber, Jacques Betsch, Jean Marie Cury, Philippe Éditeur(s) : CNRS Programme Environnement : Colloque Recherche et Environnement Strasbourg, 24-25 Septembre 1990 Résumé : As the third millennium draws near, industrial societies are becoming aware of the limits of what they can do to constrain the biosphere, ending up where "primitive" societies left off. If the perverse effects of a century of technical revolution and economic expansion are above all perceptible in the area of multiple contaminations that put in danger the well-being of people, environments and in a general way the biosphere's functioning, they also concern the standardisation of products and landscapes and overinvestment in the means of exploiting resources (inputs increasing more rapidly than outputs, when they are not bringing about their decrease). The search for solutions to the growing imbalance of the relationships Man Nature Resources cannot reside in a partial approach or a technical resolution of the problems posed by using renewable resources. (OCR non controlé) A l'approche du troisième millénaire, les sociétés industrielles prennent la mesure des limites de leurs possibilités de contraindre la biosphère, aboutissant là d'où partaient les sociétés "primitives". Si les effets pervers d'un siècle de révolution technique et d'expansion économique sont surtout perceptibles dans le domaine des pollutions multiples qui mettent en péril le bien-être des personnes, les milieux et d'une manière générale le fonctionnement de la biosphère, ils concernent également l'uniformisation des produits et des paysages et le surinvestissement dans les moyens d'exploitation des ressources (les intrants croissant plus vite que les rendements, quand ils n'entraînent pas leur baisse). La recherche de solutions au déséquilibre croissant des relations Hommes - Nature - Ressources ne peut résider dans une approche partielle ou une résolution technique des problèmes posés par l'utilisation des ressources renouvelables. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1990/acte-2416.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2416/ | Partager |
![]() | Les énergies marines renouvelables : qu'est-ce que c'est ? Quelles perspectives en Nouvelle-Calédonie. Auteur(s) : De Roeck, Yann-herve Loubersac, Lionel Éditeur(s) : Neidine Editeurs Résumé : This text presents a review of the various technologies for exploitation of renewable marine energy resources. Il exposes the solutions offered by tide and currents, swell and waves, the marine wind energy, the Ocean Thermal Energy, the osmotic energy and specifies the various degrees of technological maturity for each solution. This new economic activity on the littoral and coastal areas also contains indirect effects in terms of management which are called back. The inter-tropical islands benefit from a very vast potential for the insertion of these renewable sources of energy in their mix of energy production. Although the exploitation of these energies is not still the object of a programming in New Caledonia, an overview of the specificities of the country allows to think that certain medium term solutions will be possible. Ce texte présente une revue des différentes technologies d’exploitation des ressources énergétiques qui peuvent être tirées de la mer. On expose ainsi les solutions offertes par la marée et les courants, la houle et les vagues, l’éolien marin, l’énergie thermique des mers, l’énergie osmotique et on précise les degrés de maturité technologique très échelonnés de chaque solution. Cette nouvelle activité économique sur l’espace littoral et côtier comporte également des effets indirects en termes d’aménagement qui sont rappelés. Les îles inter-tropicales bénéficient d’un très vaste potentiel pour l’insertion de ces EMR dans leur mix de production énergétique. Bien que l’exploitation de ces énergies ne fasse pas encore l’objet d’une programmation en Nouvelle-Calédonie, un rappel des spécificités du pays permet de penser que certaines solutions seront envisageables à moyen terme. Tai Kona (2269-7535) (Neidine Editeurs), 2013-09 , N. 4 , P. 24-40 Droits : Tai kona http://archimer.ifremer.fr/doc/00174/28504/26853.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00174/28504/ | Partager |
![]() | Peches experimentales des crustaces profonds dans les eaux de la martinique ( pandalidae, nephropidae ). Prospections, rendements et biologie des especes. Auteur(s) : Paulmier, Gerard Gervain, Paul Résumé : The principal objective of the work carried out in the deep waters adjoining the island shelf around Martinique between July 1991 and april 1992 was to establish an initial inventory of potentially exploitable deep benthic resources.The cylindrical lobster pot used during fishing experiments allowed the catch of a varied carcinological marine organisms of which six species at least have economic interest : 5 species of shrimp all belonging to the sub-order of Caridea of the Pandalidae family : Plesionika edwardsi, P. (macropoda) polyacanthomerus, P.laevis, Heterocarpus ensifer and H.laevigatus, and one species of prawn of the Nephropidae family : Eunephrops cadenasi. The yields, compared to those of commercial fishermen, were medium or good for Plesionika edwardsi and P. (macropoda) polyacanthomerus between depths of 200 - 300 metres ; for Plesionika laevis and Eunephrops cadenasi in the vicinity 500 metres ; for Heterocarpus laevigatus below 700 metres. The species Heterocarpus ensifer , of which the vertical distribution is very spread out from 170 to 600 metres, seems divided into two populations which provide good yields about 300 metres and below of 450 mètres. Data on the environment and the biology of the species where also established, especially on growth and breeding. For example growth of the pandalids is relatively rapid and their life cycle rather short, between three and four or five years according to the species. At least 2 principal egg-laying seasons occur in the annual cycle. Information is given on the isopoda of the family of Cirolanidae, Bathynomus giganteus, which could eventually, under certain conditions, become of interest to the fishermen. Les pêches expérimentales effectuées dans les eaux profondes circum-martiniquaises,attenantes au plateau insulaire, entre juillet 1991 et avril 1992, avaient pour principal objectif d'établir un premier inventaire des ressources benthiques profondes potentiellement exploitables. Le casier cylindrique , a permis la capture d'une faune carcinologique variée dont 6 espèces au-moins ont présenté un intérêt économique : 5 espèces de crevettes appartenant toutes à l'infra-ordre des Caridea, famille des Pandalidae, Plesionika edwardsi, P. (macropoda) polyacanthomerus, P.laevis, Heterocarpus ensifer et H.laevigatus, et une espèce de langoustine, famille des Nephropidae: Eunephrops cadenasi. Les rendements, comparés à ceux des professionnels, sont moyens ou bons pour Plesionika edwardsi et P.(macropoda) polyacanthomerus entre 200 et 300 mètres de profondeur; pour Plesionika laevis et Eunephrops cadenasi autour de 500 mètres ; pour Heterocarpus laevigatus en-dessous de 700 mètres. L'espèce Heterocarpus ensifer dont la distribution verticale est très étendue, de 170 à 600 mètres, semble divisée en 2 populations pour lesquelles de bons rendements peuvent être obtenus vers 300 mètres et en-dessous de 450 mètres. Des données sur l'environnement et la biologie des espèces ont également été acquises, notamment sur la croissance et la reproduction. Ainsi la croissance des pandalides est relativement rapide et leur longévité plutôt courte, entre 3 et 4 ou 5 années selon les espèces. Au moins deux pontes principales interviennent sur un cycle annuel. Des informations sont données sur l'isopode de la famille des Cirolanidae, Bathynomus giganteus, qui pourrait éventuellement, sous certaines conditions, présenter un intérêt pour les pêcheurs. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1994/rapport-1540.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1540/ | Partager |
![]() | Architecture, deformation mechanisms, fluid-rock interations and petrophysical properties of fault zones in deeply buried arkosic turbidites. The case of the grès d’Annot (french Alps) ; Architecture et propriétés pétrophysiques des zones de failles dans une série gréso-pelitique turbiditique profondément enfouie : rôle de la déformation et des interactions fluide-roche. Exemple des grès d'Annot (France) Auteur(s) : CAVAILHES, Thibault Auteurs secondaires : Géosciences Montpellier ; Université des Antilles et de la Guyane (UAG) - Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS) - Université de Montpellier (UM) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Université Montpellier 2 Pierre Labaume Martine Buatier Éditeur(s) : HAL CCSD Résumé : Fault zones are major discontinuities in sedimentary basins. Understanding their role on fluid migrations is an essential issue to (i) characterize the mechanisms and kinematics of deformation and (ii) to determine the parameters which control the distribution of energetic or mineral resources. This work applies to faulting under a temperature range of 200-250°C, corresponding to that of deeply buried reservoirs as well as potentially seismogenic fault zones. The studied faults are normal faults affecting the “Grès d’Annot” Formation, a Priabonian-Rupelian siliclastic turbidite succession of the Alpine foreland basin. They are located in two distinct areas: the Moutière-Restefond area in the eastern part of the basin and the Estrop area in the western part. Vitrinite reflectance outside fault zones indicates maximal temperatures of 240-260°C at Moutière-Restefond and 170-200°C at Estrop, i.e. burial depths around 8 km and 6 km, respectively, assuming a mean geothermal gradient of 30°C/km. Burial was due to underthrusting below the Embrunais-Ubaye Alpine nappes, the difference in burial between the two areas traducing the westward taper of the nappe front.The studied faults affect alternating arkosic sandstone beds and pelite layers with offsets from centimeters to decameters. Two types of core zones are recognized: (1) the foliated core zones of the Moutière-Restefond area, where deformation dominated by pressure solution and synkinematic phyllosilicate neoformation resulted in a foliated fabric, and (2) the core zones of the Estrop area, characterized by dilatant quartz-mineralized veins and breccia. Fault and host rock petrophysical properties were measured on drill plugs, using the water porosity technique and nitrogen permeability technique under 2 Mpa of confining pressure. In the Moutière-Restefond fault zones, plug axes were oriented in three orthogonal directions corresponding to the main deformation axes (X, Y, Z) of the foliated arkose to characterize the effect of structural anisotropy. In the Estrop fault zones, where deformation does not show equivalent anisotropy, the plug axes were oriented according to the main fault plane orientation (i.e., parallel to azimuth, parallel to dip and normal). In each fault zone, the porosity of fault rocks is equivalent to that of host rocks. In the Moutière-Restefond fault zones, the plugs parallel to the X and Z axes of deformation have a permeability similar to that of the host rocks, whereas permeability parallel to the Y axis (i.e. parallel to the foliation and the main fault plane) is one order of magnitude higher. By contrast, the permeability values in the Estrop fault zones are isotropic and equivalent to the host rock values. This study highlights the importance of various types of deformation mechanisms and related fluid-rock interactions in determining different fault rock types within a similar protolith, ultimately controlling distinct petrophysical properties of fault zones. Les zones de failles constituent des discontinuités majeures dans la croûte supérieure. Ce mémoire s’intéresse aux failles actives à des profondeurs de 5-8 km, i.e. dans des conditions pouvant jouer un rôle important (i) sur le comportement mécanique de de la croûte, en particulier sur son potentiel sismogénique et (ii) sur la compartimentation des réservoirs géologiques profondément enfouis.Les failles étudiées sont des failles normales (rejet jusqu’à 50 mètres) affectant des alternances de bancs de grès arkosiques et de pélites dans les Grès d’Annot, une formation turbiditique d’âge priabonien-rupélien du bassin d’avant-chaine alpin. Les Grès d’Annot ont été enfouis sous les nappes de l’Embrunais-Ubaye peu de temps après leur dépôt et exhumés au Miocène moyen-supérieur. L’étude a été réalisée dans deux secteurs des Alpes de Haute-Provence, (1) le secteur de l’Estrop (chaine des Trois Evéchés, dans la partie occidentale du bassin) et (2) le secteur de Point Vert-Restefond (alentours du col de la Bonette, dans la partie orientale du bassin). La réflectance de la vitrinite dans les Grès d’Annot indique des températures maximales de 160-190°C dans le secteur (1) et de 240-260 °C dans le secteur (2) , soit des profondeurs d’enfouissement de 5-6 km et 8-10 km, respectivement, dans l’hypothèse d’un gradient géothermique moyen de 25-30°C/km. A partir des observations microstructurales, de données d’inclusions de fluides, de modélisations thermodynamiques sur chlorites syncinématiques et des indices de cristallinité de l’illite, on a établi que les failles du secteur (1) ont fonctionné à une température d’environ 200°C pour une pression de 0.6Kbar et celles du secteur (2) dans une gamme de température de 200-220°C et de pression comprise entre 0.6 et 1.1 Kba. L’activité de la faille de Point-Vert a été datée par la méthode 40Ar/39Ar au Miocène inférieur (21 Ma). Ces failles sont interprétées comme associées aux premiers stades du soulèvement résultant de l’activité des chevauchements dans le socle sous-jacent.Deux types principaux de roches de failles caractérisent les failles étudiées. Les brèches dilatantes sont majoritaires dans les zones de failles du secteur (1) alors que les arkoses foliées sont majoritaires dans les zones de failles du secteur (2). Les brèches dilatantes témoignent de mécanismes de déformation dominés par la fracturation transgranulaire et la pression-solution des silicates. Ce dernier mécanisme se manifeste principalement par d’abondantes précipitations cycliques de quartz, les stylolites restant peu développés. Les géométries structurales sont associées à l’activation de plans T de Riedel déterminant l’ouverture de relais extensifs et un régime localement dilatant. Nous associons ce type de roche de faille à une faible pression effective au cours de la déformation.La déformation cisaillante exprimée dans les arkoses foliées témoigne de mécanismes de déformation dominés par (i) la fracturation intragranulaire et transgranulaire, (ii) la pressionsolution/ précipitation des silicates, principalement le quartz, (iii) la néoformation de micas blancs liée à l’altération des feldspaths et (iv) la précipitation de chlorite. Ce travail montre également que les transformations minéralogiques liées aux interactions fluide-roche dans la zone de faille (forte augmentation de la proportion des phyllosilicates au dépend des feldspaths) changent radicalementla composition minéralogique de la roche. Nous associons ce type de roche de faille à une forte pression effective au cours de la déformation.La pétrophysique montre que les brèches de failles (secteur 1) ont une perméabilité isotrope et équivalente à celle du protolithe (10-3mD sous 2 MPa de confinement) tandis que les roches foliées (secteur 2) montrent une augmentation de perméabilité (10-2mD) selon l’axe Y de la déformation, d’un ordre de grandeur supérieure aux perméabilités suivant les axes X et Z et dans la roche hôte (10-3mD). Ce drain préférentiel potentiel est associé à l’orientation des phyllosilicates dans la foliation. https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01310382 tel-01310382 https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01310382 https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01310382/document https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01310382/file/Th%C3%A8seCAVAILHES2012.pdf | Partager |
![]() | Role of IL-33 in the hepatic immune response during visceral leishmaniasis ; Place de l'Interleukine-33 dans la réponse immune du foie au cours de la leishmaniose viscérale Auteur(s) : Rostan, Octavie Auteurs secondaires : Institut de recherche, santé, environnement et travail [Rennes] (Irset) ; Université d'Angers (UA) - Université des Antilles et de la Guyane (UAG) - Université de Rennes 1 (UR1) - École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ) Institut de recherche en santé environnement et travail -- Rennes Université Rennes 1 Jean-Pierre Gangneux Florence Robert-Gangneux Éditeur(s) : HAL CCSD Résumé : Visceral leishmaniasis is a life-threatening systemic disease caused by Leishmania protozoans, L. donovani and L. infantum, which invade mononuclear phagocytes in the lymphoid organs and the liver. The control of the hepatic parasite burden depends on the granuloma formation, which is favored by a Th1 immune response in a Th2 tissue microenvironment. The aim of this work was to study the role of the recently described Th2 cytokine IL-33 in this complex immune response, which remains partially misunderstood. IL-33 dosages in different patient sera and IL-33+ cells detected in the liver of a patient from Rennes suggested that IL-33 could be a biomarker for active visceral leishmaniasis. As IL-33 was described in hepatic stellate cells during chronic hepatitis, these cells were exposed to L. donovani in primary culture. The cell permissivity to L. donovani and the parasite persistence during a long term culture led us to propose hepatic stellate cells as a new type of sanctuary cells, which could partially explain asymptomatic carriage. However, these cells were apparently not the main source of IL-33 during visceral leishmaniasis. In infected BALB/c and C57BL/6 mice, IL-33 was detected in the liver in non stellate cells preferentially localized in granulomas. The presence of cells expressing its specific receptor ST2 in the liver led us to explore the role of the IL-33/ST2 axis. BALB/c mice deficient in ST2 or treated with recombinant IL-33 and infected with L. donovani revealed that IL-33 downregulates the expression of Th1 key cytokines (IL-12, IFN-γ) and the recruitment of neutrophils and monocytes. Finally, IL-33 acts as a susceptibility factor during visceral leishmaniasis. Besides, the model of L. donovani infected C57BL/6 mice deficient in IL-33 or treated with recombinant IL-33 suggests possible differential roles of IL-33 depending on the immune environment related to the host genetic background. La leishmaniose viscérale est une maladie systémique mortelle en l’absence de traitement. Elle est due aux protozoaires Leishmania donovani et L. infantum, parasites des phagocytes mononucléés, capables d’envahir les organes lymphoïdes et le foie. Le contrôle de l’infection hépatique repose sur la mise en place d’une réponse granulomateuse efficace, promue par une réponse immunitaire Th1, dans un environnement tissulaire Th2. L’objectif de ce travail était l'étude du rôle d’une cytokine Th2 récemment décrite, l’IL-33, dans cette réponse hépatique complexe encore partiellement incomprise. Des dosages d’IL-33 sur des sérums de patients et la détection de cellules IL-33+ dans le foie d’un patient rennais ont placé l’IL-33 comme un biomarqueur possible de la maladie active. L’IL-33 étant exprimée dans les cellules étoilées du foie au cours d’hépatites chroniques, ces cellules ont été exposées à L. donovani. Leur permissivité aux leishmanies sans toxicité apparente ni perturbation de leurs propriétés fonctionnelles, ainsi que la persistance des leishmanies sur une culture de plusieurs semaines, nous ont conduit à proposer les cellules étoilées comme cellules sanctuaires possibles pour les leishmanies viscérotropes, contribuant donc potentiellement au portage asymptomatique. En revanche, elles ne sont pas apparues comme une source majeure d'IL-33 au cours de la leishmaniose viscérale. Chez des souris C57BL/6 et BALB/c infectées par L. donovani, l'IL-33 a été observée dans des cellules ne s'apparentant pas à des cellules étoilées, et principalement localisées dans les granulomes. Des cellules exprimant son récepteur ST2 ayant été également observées dans le foie, un rôle de l’axe IL-33/ST2 a été recherché. Les résultats obtenus chez des souris BALB/c déficientes en ST2 ou traitées par de l'IL-33 recombinante suggèrent que l'IL-33 régule négativement l'expression de cytokines Th1 (IL-12, IFN-γ) et l'infiltrat de neutrophiles et monocytes dans le foie, limitant ainsi le contrôle de la charge parasitaire. Ainsi, l'IL-33 semble être un facteur de susceptibilité pour la leishmaniose viscérale. En parallèle, des travaux entrepris sur des souris C57BL/6 infectées par L. donovani suggèrent de possibles rôles différentiels de l'IL-33 en fonction de l'environnement immunitaire inhérent au fond génétique de l'hôte. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01126847 Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess NNT : 2013REN1B002 tel-01126847 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01126847 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01126847/document https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01126847/file/2013REN1B002.pdf | Partager |
![]() | Guide pour le suivi de la qualité du milieu marin en Nouvelle-Calédonie Auteur(s) : Beliaeff, Benoit Bouvet, Guenole Fernandez, Jean-michel Laugier, Thierry David, Carine Résumé : This guide is intended to facilitate the implementation of specifications for marine environmental monitoring in New Caledonia. It is intended for public or private environmental actors. He provides a set of information on marine monitoring: summary of environmental regulations and the practical implications, definitions of terms, proposed general approach for the establishment of a monitoring, sampling strategy elements, method to develop reference frames, recommendations for the management and exploitation of data collected. The guide also provides lists of suggested environmental parameters to monitor for different pressures and general state of the environment, as well as, a set of methodology sheets for parameters and (when available) the reference values.
This guide produced in 2011 based on technical and scientific knowledge that can evolve and is intended to be updated in the future. Ce guide est destiné à faciliter la réalisation de cahiers des charges pour les suivis environnementaux marins en Nouvelle-Calédonie. Il s’adresse aux acteurs environnementaux publics ou privés. Il leur fournit un ensemble d’informations relatives aux suivis marins : résumé de la réglementation environnementale et de ces implications concrètes, définitions de termes, proposition de démarche générale pour la mise en place d’un suivi, éléments de stratégie d’échantillonnage, méthode pour concevoir des grilles de lecture, préconisations en matière de gestion et de valorisation des données récoltées. Le guide fournit également des listes de paramètres conseillés pour suivre différentes pressions et l’état général du milieu ainsi qu’une série de fiches méthodologiques pour les paramètres et (quand elles existent) des valeurs de référence. Ce guide produit en 2011 s’appuie sur des techniques et des connaissances scientifiques qui peuvent évoluer et est destiné à subir des modifications dans les années à venir. Droits : 2011 Ifremer, Melanopus, IRD http://archimer.ifremer.fr/doc/00050/16163/13647.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00050/16163/ | Partager |
![]() | Contribution à l’évaluation de l’impact de l’implantation des DCP collectifs sur l’activité de pêche en Guadeloupe Auteur(s) : Guyader, Olivier Reynal, Lionel Angin, Baptiste Beramice, David Erialc, Carole Jean-charles, Cedric Vincent, Charly Résumé : Dans le cadre du projet de DCP collectifs, l’Association des pêcheurs du Sud Basse-Terre (APBST) a demandé à l’Ifremer d’organiser un suivi de l’activité de pêche sur ces dispositifs ancrés, afin de contribuer à l’évaluation de l’impact de l’implantation de ce parc de DCP. L’Ifremer étant responsable du projet pilote de Système d’Informations Halieutiques (SIH) en Guadeloupe sur la période 2007-2008, le suivi DCP collectifs s’insère dans ce dispositif avec un renforcement des moyens de collecte de données sur la zone d’étude.
12 dispositifs de concentration de poissons (DCP) collectifs conçus pour répondre aux exigences du développement durable ont été immergés par l’APSBT au large de Basse-Terre (Guadeloupe) en janvier et février 2008. Cette opération qui a valeur d’exemple pour d’autres communautés de pêcheurs constitue un réel enjeu pour l’avenir de la pêche aux DCP ancrés.
Dans le cadre de cette opération, des améliorations étaient attendues dans plusieurs domaines :
1. la sécurité de la navigation et des équipements sous-marins,
2. l’activité et la production sur DCP, sa régularité au cours de l’année et les retours économiques
3. L’organisation de l’entretien des dispositifs en vue de la réduction du coût et des pertes de matériel,
4. la gestion du parc et les règles d’accès aux DCP,
Ce rapport final couvre les points 2 et 3 mentionnés ci-dessus, il est organisé de la manière suivante. En premier lieu sont présentées les différentes tâches réalisées par l’Ifremer et les relations avec les autres actions menées dans le cadre du projet. On présente ensuite l’organisation du dispositif de collecte et son insertion dans le projet SIH Guadeloupe. Sur la base des données collectées sur l’année de référence 2006 par le SIH, une analyse de
l’activité de pêche sur DCP avant l’implantation des DCP collectifs est réalisée (section 3). La section 4 apporte des éléments sur la pratique de l’activité sur le parc de DCP collectifs après respectivement 5 mois et 11 mois de fonctionnement. Dans cette section, sont également présentées les premières observations réalisées par prospection aérienne pour estimer les densités de DCP privés dans la zone du parc et l’activité de pêche associée. Enfin, la dernière section fournit des données de production, de composition spécifique et économiques par sortie autour des DCP.
Les éléments disponibles dans ce rapport constituent une évaluation intermédiaire après moins d’une année de fonctionnement. Il sera utile de mener une analyse avec plus de recul historique afin de mieux mesurer les impacts à long terme de ce projet. Droits : 2008 Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/00190/30108/28570.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00190/30108/ | Partager |
![]() | L’esclavage et la naissance de l’église noire aux États-Unis Auteur(s) : Gadet, Steve Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes Résumé : Dès l’arrivée des premiers Africains déportés sur le sol américain, la vie religieuse est devenue un moyen de transcender un quotidien mortifère. Leur chemin est parsemé de longues journées de travail forcé, de conditions de vie inhumaines, de châtiments et de sévices en tous genres. La pratique religieuse leur donne une fenêtre sur un autre monde. D’année en année, le culte religieux deviendra un espace de relâchement, de liberté et d’expression unique. L’église chrétienne s’est comportée comme un mouvement social pour la communauté africaine-américaine. Elle est devenue un lieu de liberté qui, progressivement, supportera les fondations de l’expression politique et de la demande de justice sociale. Sa fonction pivotale s’explique également par le rôle de la religion dans la fondation de la société et la vie politique étasuniennes. Entre les idéaux d’une nation divisée, ivre de liberté et ceux d’une communauté poussée dans ses retranchements, cette contribution se propose d’analyser la naissance de l’église africaine-américaine durant l’esclavage. Ensuite, je me pencherai sur l’impact de cette dynamique dans la Caraïbe à travers la vie de George Leile, premier missionnaire africain-américain en Jamaïque. From the moment the first Africans were brought to the Americas, religious life has become a way to transcend a humiliating and desperate life. Their lives were made of long days of forced work, inhuman living conditions, punishments and ill treatments of all sorts. Religious practice gave them a window onto another world. Over the years, it has slowly become a space of freedom and unique expression. The Black Church acted as a social movement on behalf of the African-american community. It has become a place of freedom which gradually has supported the foundations of their political expression and their demand of social justice. Understandably, as religion has always played a central role in North America, it is no wonder that it would play a central function in the liberation of slaves. Between the ideals of a divided nation and those of a marginalized community, the article analyzes the birth of the African-american church during slavery. Then, it examines the impact of African-american protestantism in the Caribbean through the life of George Leile, the first African-american missionary in Jamaica. États-Unis Jamaïque Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.7229 http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/7229 | Partager |
![]() | Prophylaxie antifongique chez les patients d’hématologie en France : fréquences et choix de l’antifongique systémique en fonction du type d’hémopathie maligne (étude AFHEM) Auteur(s) : Gangneux, J. -P. El Cheikh, J. Herbrecht, R. Yakoub-Agha, I. Caillot, D. Michallet, M Auteurs secondaires : Institut de recherche, santé, environnement et travail [Rennes] (Irset) ; Université d'Angers (UA) - Université des Antilles et de la Guyane (UAG) - Université de Rennes 1 (UR1) - École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ) Service de Parasitologie-Mycologie [Rennes] ; Université de Rennes 1 (UR1) - Hôpital Pontchaillou - CHU Pontchaillou [Rennes] Service greffe de moelle osseuse ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) - Groupe Hospitalier Saint-Louis-Lariboisière- Fernand-Widal - Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7) CHU Dijon ; Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon) Éditeur(s) : HAL CCSD Résumé : National audience Objectif L’objectif était de décrire la fréquence de recours et les caractéristiques de la prophylaxie antifongique systémique chez des patients présentant hémopathie maligne. Méthodes Étude multicentrique, transversale, prospective conduite dans 24 services d’hématologie (717 lits dont 368 stériles) sur 5 jours consécutifs chez des patients adultes ou pédiatriques hospitalisés avec une hémopathie maligne. Résultats Les 494 patients inclus ont été classés en 4 groupes selon leur risque d’infection fongique invasive : groupe 1 : patients allogreffés (n = 147) ; groupe 2 : patients LAM/SMD non allogreffés (n = 131) ; groupe 3 : patients LAL non allogreffés (28,0 % de < 18 ans) ; groupe 4 : patients MM, LH, LNH et autres (n = 145). Deux cent quarante-six patients ont bénéficié d’une stratégie antifongique systémique. Quatre-vingt-quinze sur 119 (79,8 %) patients du groupe 1, 56/78 (71,8 %) du groupe 2, 12/19 (63,2 %) du groupe 3 et 24/30 (80,0 %) du groupe 4 ont bénéficié d’une stratégie antifongique systémique prophylactique. Cinquante pour cent des patients des groupes 2 et 3 présentaient une neutropénie de plus de 10 jours versus 17 % pour les groupes 1 et 4. Quatre-vingt-deux pour cent (78/95) et 73 % (41/56) des patients des groupes 1 et 2 ont été placés en chambre stérile versus 50 % (6/12) dans le groupe 3 et 54 % (13/24) dans le groupe 4. Dans le groupe 1 : 75 % (71/95) des patients ont reçu un azolé, généralement du fluconazole (44/71) ; 13/95 ont reçu une échinocandine généralement de la caspofungine (11/13) ; 11/95 ont reçu un polyène. Dans le groupe 2 : 89 % (50/56) des patients ont reçu un azolé, généralement le posaconazole (35/56) ; 6/56 un polyène et 1/56 une échinocandine. Dans le groupe 3 : 33 % (4/12) des patients ont reçu du fluconazole po ; 3/12 du posaconazole, 3/12 un polyène et 3/12 une échinocandine. Dans le groupe 4 : 92 % (22/24) des patients ont reçu un azolé, généralement du posaconazole (16/24) ; 1/24 un polyène et 1/24 une échinocandine. Conclusion La prophylaxie antifongique est dorénavant la stratégie antifongique dominante. Soixante-seize pour cent des patients traités en ont bénéficié. Elle est principalement basée sur les azolés po : le fluconazole est utilisé chez les patients allogreffés neutropéniques en association au traitement de l’air et les patients à faible risque (groupe 4) ; le posaconazole est principalement utilisé dans les LAM/SMD mais également dans les LAL non allogreffées. Les échinocandines sont majoritairement utilisées chez les patients à haut risque Congrès de la SFMM Talence-Bordeaux, France hal-01198634 https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01198634 DOI : 10.1016/j.mycmed.2015.06.020 | Partager |
![]() | CNEXO Rapport annuel 1988 Résumé : L'Ifremer a reçu la mission de développer toutes les recherches sur la mer et l'exploitation de ses ressources qui représentent pour notre pays et l'avenir un enjeu d'importance. Celui-ci est multiple: il est scientifique, technologique, humain et économique, stratégique aussi au sens le plus large du terme, avec une dimension internationale de plus en plus marquée. J'ai la conviction que l'Ifremer est le fer de lance d'une politique scientifique et technologique volontariste et ambitieuse dans tous les domaines qui touchent à la connaissance de la mer, et doit permettre l'exploitation de ses richesses à court et long termes. L'Ifremer prend des paris scientifiques et technologiques, il doit avoir une vision prospective des enjeux et des potentialités de la recherche et des techniques. Sa flotte océanologique constitue un outil remarquable pour ses activités et un atout irremplaçable. L'Ifremer a également une mission de service public, et de conseils des administrations, des groupements professionnels, des régions sur les activités de pêche, de conchyliculture, sur les problèmes d'environnement du littoral. [OCR NON CONTRÔLE] Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1988/rapport-4840.PDF http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4840/ | Partager |
![]() | AMH signaling pathway and its target genes in female reproductive tract ; Voie de signalisation et gènes cibles de l’AMH dans le tractus génital femelle Auteur(s) : Sèdes, Lauriane Auteurs secondaires : Institut de recherche, santé, environnement et travail [Rennes] (Irset) ; Université d'Angers (UA) - Université des Antilles et de la Guyane (UAG) - Université de Rennes 1 (UR1) - École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ) Université Paris Sud - Paris XI Soazik Jamin Éditeur(s) : HAL CCSD Résumé : Anti-Müllerian hormone (AMH) is a member of the TGF-ß superfamily. AMH is well known for its role in Müllerian duct regression in male fetuses. Postnatally, AMH is secreted by granulosa cells (GCs) of small growing follicles (preantral and small antral). However, despite the increasing interest of ovarian AMH in clinics, little is known on its mechanism of action and its role in female reproductive tract. My PhD project focuses on the identification of AMH function in the female reproductive tract.AMH signals through a type II transmembrane serine/threonine kinase receptor (AMHR-II) which forms a complex with a type I serine/threonine kinase receptor (ActR-IA, BMPR-IA, BMPR-IB). The type II receptor phosphorylates serine and threonine residues of type I receptor. Once activated, the type I receptor phosphorylates the receptor-regulated Smads (R-Smad1/5/8) which interact with a common partner Smad4. The Smad complex accumulates into the nucleus and regulates target gene expression. This canonical signalling pathway is regulated at different levels, in particular by co-receptors which amplify or antagonize TGF-ß family members action. The type I receptors and R-Smads involved in AMH effects on post-natal GCs remain unknown. In addition, to date, no co-receptor has been found for AMH. To define the involvement of the different type I receptors, we used siRNA technology to inactivate Acvr1, Bmpr1a and Bmpr1b in GC. In parallele, we analysed GC extracted from conditional mutant mice for Acvr1 and Bmpr1a. We found that BMPR-IA is the most important type I receptor for AMH to transduce its signal in GC. A Smad-Gal4/UAS-luciferase reporter gene technology allowed us to show that Smad1 and 5 are involved in AMH signaling pathway. Recently, new BMPs coreceptors were found, RGMs for Repulsive Guidance Molecules. There are three RGMs : RGMa, b and c. Because AMH shares with BMPs its type I receptors and R-Smad proteins, we hypothesized that they also share the same co-receptors, the RGM. We showed that RGMb was the only one expressed in GC and after siRNA transfection we demonstrated that this coreceptor is not essential for AMH to transduce its signal.To date, only few AMH target genes have been identified. Aromatase (Cyp19a1) and LH receptor (Lhcgr) are down-regulated by AMH in rat and porcine GCs. We used micro-array technology (Affymetrix) by comparing Wt and knockout immature ovaries to find new AMH target genes. This experiment evidenced that Ovgp1 and Kcnj2 are two new potential AMH target genes in the ovary.The last part of my project was to define a potential role of AMH in murine uterus. Only one study showed that AMHR-II is expressed in the mouse myometrium. We showed that Amh gene is slightly expressed in uterus but the results are not confirmed at the protein level. Using PCR-array, we found a lot of differentially expressed genes between Wt and Amh KO uterus. Therefore, AMH could regulate uterine function through the modulation of different genes located in the myometrium. L’hormone anti-Müllerienne (AMH) est un membre de la famille TGF-β impliquée dans la différenciation du tractus reproductif mâle. Elle est aussi exprimée par les cellules de la granulosa de l’ovaire adulte. Cependant, son rôle physiologique chez la femelle n’a pas encore été entièrement établi. Mon projet de thèse a pour objectif d’élucider le(s) rôle(s) de l’AMH dans le tractus reproductif femelle. L’AMH transduit ses effets par l’intermédiaire de deux récepteurs transmembranaires sérine/thréonine kinase : un récepteur de type II qui lui est spécifique (AMHR-II) et un récepteur de type I (ActR-IA, BMPR-IA, BMPR-IB) qu’elle partage avec les BMPs. Après fixation de l’hormone sur le récepteur de type II, celui-ci recrute et phosphoryle le récepteur de type I. Ce dernier phosphoryle à son tour les Smads spécifiques (Smad1, 5 et 8) qui s’associent à la Smad commune, Smad4. L’ensemble transloque dans le noyau et en association avec des facteurs de transcription régule les gènes cibles de l’hormone. L'utilisation de souris KO conditionnelles pour les récepteurs Acvr1 et Bmpr1a et d'une technique de siRNA dirigés contre chacun des trois récepteurs de type I a permis de mettre en évidence que le récepteur BMPR-IA est un acteur essentiel de la voie de signalisation de l'AMH dans les cellules de la granulosa. Pour déterminer la ou les Smad(s) impliquées, une technique de gènes rapporteurs, Smad-Gal4/UAS-luciférase, a été utilisée. Nous avons pu montrer que les Smad1 et 5 sont importantes pour la transduction du signal de l'AMH dans les cellules de la granulosa. Récemment des corécepteurs aux BMPs, les Repulsive Guidance Molecule (RGMs), ont été mis en évidence. L’AMH partageant sa voie de signalisation avec les BMPs, nous avons cherché à déterminer si ces corécepteurs pouvaient également intervenir dans la voie de signalisation de l’AMH. Il existe 3 types de RGMs: RGMa, RGMb et RGMc. Nous avons montré en q-PCR que seul RGMb est exprimé dans les cellules de la granulosa alors que les 3 RGMs sont exprimés dans l’ovaire. L'utilisation de siRNA dirigés contre RGMb a permis de montrer que ce récepteur n'est pas nécessaire à la transduction du signal de l'AMH. Actuellement, seuls deux gènes cibles de l’AMH sont connus dans les cellules de la granulosa : l’aromatase et le récepteur LH. Nous avons réalisé des analyses de puces à ADN (ou micro-array) pour décrire de nouveaux gènes cibles de l'AMH. L'analyse des puces a permis de décrire de nouveaux gènes régulés par cette hormone tels qu’Ovgp1 ou Kcnj2. La dernière partie de mon projet visait à déterminer un rôle potentiel de l'AMH dans l'utérus. En effet, le récepteur de cette hormone est exprimé dans le myomètre utérin de souris permettant de supposer qu’elle peut agir sur cet organe. Nous avons pu mettre en évidence une expression faible du gène de l’Amh dans l’utérus. En revanche, l’expression et la localisation de la protéine restent encore à définir. Une expérience de PCR-array a permis de montrer que de nombreux gènes sont différentiellement exprimés entre l’utérus Wt et l’utérus KO Amh. Ceci indique que l’AMH jouerait un rôle sur la régulation de la fonction utérine qu’elle soit exprimée ou non dans cet organe. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00989662 Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess NNT : 2014PA11T014 tel-00989662 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00989662 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00989662/document https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00989662/file/VA_SEDES_LAURIANE_03042014.pdf | Partager |