Éditeur(s) : Gauthier-Villars
Résumé : Concerning the basic functioning of mangrove ecosystems, three groups of key factors are examined and explained. Several parameters external to these ecosystems have a strong influence; i.e. - the regular and abundant input from fresh water sources; - provision of nutrients; - the stabiity of the substrata. Each of these groups of factors is related to a number of parameters which do not lend themselves to in situ studies. For example, the stability of the substrata depends on the sedimentation load which itself is linked to the geological nature of the basin, land utilization, local climate, etc. The principal cause of the decline in mangroves is analyzed.
Oceanologica Acta, Special issue (0399-1784) (Gauthier-Villars), 1982

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00246/35749/34257.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00246/35749/

Éditeur(s) : La recherche face aux pêches artisanales
Résumé : Each of nine people agreed to write a summary regarding changes in research on small-scale fishing in a large region of the world. These summaries that will be presented to you focus respectively on changes in research in Southeast Asia, in the South Pacific along the western coast of Latin America, in West Africa, in the Mediterranean, in Northwest Europe, and in North America. In order to help you reconstruct their actions in the halieutic context of the regions about which they are talking, Serge Garcia will first present us with a panorama of small-scale fishing. By asking them to do this study, we wished to be able to place the symposium's study within an overall framework and in an historical perspective. The objective was to relativise the conclusions that could be drawn from analyses of local situations, or, on the contrary, to allow them to be generalised by using bases of comparison. The summaries are far from being able to offer a planetary geographical coverage, just as they do not really include the evolution of all disciplines. The means available to the organisers did not allow for going up to that point. We must at this point thank the authors who agreed to do this complex work of summarisation, because they succeeded in showing the richness of such a step, which the participants will be able to appreciate in their reports. In this analysis of geographical syntheses, we would like to draw a few comparisons able to fuel the symposium's debates. We will examine how small-scale fishing became a subject of research, and the difficulty of defining it. Then we will see how the various disciplines became mutually involved, then specialised, depending upon the stages through which the research passed on this subject. The role of institutions and the weight of the contextual environment will be examined. Finally, we will propose a few possible directions for the debates on various themes of the symposium. Some outside contributions to the summaries also focus on the evolution of the research and we have taken that into account in this presentation. Limited to one country (Yahaya Jahara) or to one province (Maneschy and Furtado), they are useful complements to the summaries.
(OCR non controlé) Neuf personnes ont accepté de rédiger chacune une synthèse concernant l'évolution des recherches sur les pêches artisanales dans une grande région du monde. Les synthèses qui vont vous être présentées portent respectivement sur l'évolution des recherches en Asie du Sud-Est, dans le Pacifique-sud sur la façade occidentale de l'Amérique Latine, en ,Afrique de l'Ouest, en Méditerranée, en Europe du Nord- Ouest, en Amérique du Nord. Pour vous permettre de resituer leurs interventions dans le contexte halieutique des régions dont ils nous parlent, Serge Garcia nous présentera en premier lieu un panorama des pêches artisanales. En leur demandant ce travail, nous avons souhaité pouvoir replacer les travaux du symposium dans un cadre global et dans une perspective historique. L'objectif était de relativiser les conclusions qui pourraient être tirées d'analyses de situations locales, ou, au contraire, de permettre leur généralisation en disposant de bases de comparaison. Les synthèses sont loin d'offrir une couverture géographique planétaire, tout comme elles n'intègrent pas vraiment l'évolution de toutes les disciplines. Les moyens à la disposition des organisateurs ne permettaient pas d'aller jusque là. Il nous faut remercier ici les auteurs qui ont consenti à faire ce travail complexe de synthèse, car ils ont réussi à démontrer la richesse d'une telle démarche, ainsi que les participants pourront l'apprécier à travers leurs exposés. Dans cette analyse des synthèses géographiques, nous voudrions tenter quelques comparaisons de nature à alimenter les débats du symposium. Nous examinerons comment est née la pêche artisanale en tant qu'objet de recherche, et la difficulté de la définir. Puis nous verrons, en fonction des étapes par lesquelles sont passées les recherches sur ce sujet, comment les différentes disciplines se sont mutuellement impliquées, puis se sont spécialisées. Le rôle des institutions et le poids des contextes seront examinés. Enfin nous proposerons quelques orientations possibles pour les débats sur les différents thèmes du symposium. Certaines contributions extérieures aux synthèses portent aussi sur l'évolution des recherches et nous en avons tenu compte dans cette présentation. Limitées à un pays (Yahaya Jahara) ou à une province (Maneschy et Furtado), elles complètent utilement les synthèses.

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http://archimer.ifremer.fr/doc/1990/acte-2464.pdf
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Éditeur(s) : Remote Sensing and Geographic Information Systems for the Pacific: Report of the Working Group Meeting on Regional Co-operation in Applications of Remote Sensing and Geographic Information Systems Technology for the Pacific, 18-22 March 1991, Suva, Fiji. ST/ESCAP/998.
Résumé : Once the specific geographical context of French Polynesia and its needs about the use of results od Remote Sensing and Geographic Information have been presented and situated, the strategy used and developped both by the territory of French Polynesia and Ifremer in partnership is introduced. It comprises four parts and tries, by involving directly the end users, to make known the use of data of the high technology tools represneted bu Space Remote Sensing and Geographic Information Systems. Several types of the products are proposed and regional extrapolation plans are offered consequently.
Après avoir présenté et situé le contexte géographique spécifique à la Polynésie française et ses besoins en résultats de la télédétection et de l'information géographique, on présente la stratégie mise en place en partenariat entre le Territoire de Polynésie Française et Ifremer. Celle-ci comprend quatre axes et cherche, en impliquant directement les utilisateurs finaux, à faire mieux connaître l'utilisation des données des outils de haute technologie que sont la télédétection spatiale et les Systèmes d'Information Géographiques. Plusieurs types de produits dérivés sont présentés et des plans d'extrapolation régionale sont offerts en conséquence.

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http://archimer.ifremer.fr/doc/00143/25437/23590.pdf
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Éditeur(s) : HAL CCSD Publisher : Paris : Baillière [1980-. Latest Publisher : Paris : Elsevier
Résumé : National audience
Introduction L’hypertension artérielle pulmonaire précapillaire constitue l’une des premières causes de décès au cours de la sclérodermie systémique. Le pronostic dépend de la précocité du diagnostic et de l’introduction rapide du traitement ciblé. En 2013, l’algorithme DETECT a été élaboré en vue d’un dépistage plus précoce de l’hypertension artérielle pulmonaire. Le but de notre étude est d’évaluer l’impact de l’utilisation de l’algorithme DETECT en comparant les pratiques actuelles d’un centre de compétence français à celles recommandées par ce nouvel outil de dépistage. Patients et méthodes Il s’agit d’une étude transversale monocentrique. Les patients sclérodermiques ayant bénéficié d’un bilan viscéral au cours de l’année 2014–2015, contenant les données nécessaires au calcul du score DETECT, ont été inclus. Conformément aux pratiques habituelles du service, l’ensemble des patients avait bénéficié d’une échographie cardiaque transthoracique et l’indication du cathétérisme cardiaque droit était posée au cours d’une réunion de concertation pluridisciplinaire. En parallèle, l’algorithme DETECT était calculé avec une première étape posant ou non l’indication théorique de l’échographie cardiaque transthoracique, puis une seconde décidant de l’indication théorique d’un cathétérisme droit. Les résultats des deux étapes de l’algorithme étaient inconnus des médecins participant à la prise en charge des patients ou à la réunion de concertation pluridisciplinaire. À la fin de la période d’inclusion, les décisions proposées par l’algorithme étaient comparées à celles issues de la réunion de concertation pluridisciplinaire. Résultats Cent dix-sept patients ont été inclus dans l’étude. Quatre-vingt-onze pour cent (n = 106) répondaient aux critères ACR 2013. Si l’algorithme DETECT était appliqué à l’ensemble de la population, l’indication de l’échographie cardiaque transthoracique était retenue chez 80 % d’entre eux (n = 94). Parmi les 94 patients sélectionnés à la première étape, il était retenu l’indication d’un cathétérisme droit chez 70 d’entre eux, soit 60 % de la population initiale. Au cours du suivi annuel, l’indication du cathétérisme droit avait été retenue par la réunion de concertation pluridisciplinaire chez 15 des 117 patients. Le diagnostic d’hypertension artérielle pulmonaire avait été retenu chez 9 d’entre eux, dont 7 avec une hypertension artérielle pulmonaire précapillaire. Si l’algorithme DETECT n’était appliqué qu’aux patients répondant aux critères initialement proposés pour la mise au point de l’algorithme (patients avec DLCO inférieure à 60 % de la valeur prédite, et symptômes – autres que phénomène de Raynaud – évoluant depuis plus de 3 ans), 42 patients étaient alors éligibles (36 % de la population totale). Les épreuves fonctionnelles respiratoires retrouvaient une DLCO moyenne à 46 % de la valeur prédite. L’indication de l’échographie cardiaque transthoracique était retenue chez 36 patients (31 % de la population totale). Parmi les 36 patients sélectionnés à la première étape, l’algorithme retenait l’indication d’un cathétérisme droit chez 31 d’entre eux (26 % de la population totale). Au cours du suivi annuel, l’indication avait été retenue par la réunion de concertation pluridisciplinaire chez 13 des 42 patients. Le diagnostic d’hypertension artérielle pulmonaire avait été posé chez 9 d’entre eux, dont 7 avec une hypertension artérielle pulmonaire précapillaire. Discussion L’application de l’algorithme DETECT à la cohorte d’un centre de compétence français confirme son efficacité en termes de dépistage de l’hypertension artérielle pulmonaire dans la population suivie pour une sclérodermie systémique car elle permet de retenir la réalisation d’un cathétérisme droit diagnostique chez tous les patients pour lesquels l’indication avait été portée en réunion de concertation pluridisciplinaire. Ces résultats sont confortés par ceux récemment publiés par une équipe tchèque. D’après nos résultats, il semble que l’application de l’algorithme à une population plus restreinte (selon les critères de l’étude DETECT) fasse aussi bien que l’application de l’algorithme à tous les patients sclérodermiques (indifféremment de la DLCO ou de l’ancienneté des symptômes). Il reste maintenant à déterminer quel suivi et quel dépistage proposer aux patients ayant une DLCO de plus de 60 %. Enfin, il restera à déterminer si l’algorithme permettra un dépistage plus précoce de l’hypertension artérielle pulmonaire chez les patients sclérodermiques, et donc d’améliorer à terme la survie. Conclusion Jusqu’en 2016, les patients suivis pour sclérodermie systémique bénéficiaient d’un dépistage de l’hypertension artérielle pulmonaire selon les recommandations internationales. L’application du nouvel algorithme DETECT aux patients sclérodermiques (avec une DLCO de plus de 60 % et les premiers symptômes autres que phénomène de Raynaud de plus de 3 ans) permettrait de limiter le nombre d’ échographies cardiaques transthoraciques (moins 70 % environ) et augmenterait le nombre de cathétérismes cardiaques droits (par un facteur 3 environ). Il permettrait donc un dépistage au moins aussi efficace que celui réalisé jusqu’à présent, avec cependant un coût probablement plus élevé et un caractère plus invasif
ISSN: 0248-8663

hal-01321852
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01321852
DOI : 10.1016/j.revmed.2016.04.300

Éditeur(s) : Elsevier
Résumé : The Latin American shrimp Litopenaeus stylirostris was introduced in three different Pacific islands (Tahiti, New Caledonia via Tahiti, and Hawaii) and hatchery-propagated for 7-25 generations to develop shrimp farming based on these domesticated stocks. Three microsatellite markers have been used in an attempt to assess the genetic bases of the populations available to start a selective breeding program. The comparison of eight hatchery stocks (five New Caledonian, two Hawaiian and one Tahitian stocks) and one wild Ecuadorian population showed a much lower variability in the domesticated stocks than in the wild population, especially in New Caledonia and Tahiti (2-3.7 vs. 14-27 alleles per locus; 20-60% vs. 90% expected heterozygosity). The Tahitian and the New Caledonian stocks share the same alleles, suggesting that the loss of alleles occurred during the common past of these populations. On the contrary, New Caledonian and Hawaiian populations share only one common allele at the three loci studied. Although the low genetic variability and the resulting inbreeding of the New Caledonian stocks do not seem to affect their present performance, the results of this study demonstrate the usefulness of the introduction of new stocks in order to increase the potential responses to new controlled or uncontrolled selective pressures. The introduction in New Caledonia of the Hawaiian domesticated stocks, which would provide the local shrimp industry with 40% of the allelic diversity of the species, is advised and preferred to the one of wild animals in order to take advantage (i) of the spontaneous selection which occurred during domestication and (ii) of their favourable sanitary "specific pathogen free" status (no presence of four viruses: WSV, YHV, IHHNV, TSV) which limits the risk of introduction of pathogens.
La crevette d'Amérique latine Litopaenus stylirostris a été introduite dans trois îles du Pacifique (à Tahiti, en Nouvelle-Calédonie via Tahiti, et à Hawaii), et a été ensuite reproduite en écloserie pendant 7 à 25 générations à des fins d'aquaculture. Trois marqueurs microsatellites ont été utilisés pour évaluer les bases génétiques des populations disponibles pour le démarrage d'un programme d'amélioration génétique. L'étude comparative de 8 populations domestiquées (cinq néo-calédoniennes, deux hawaiiennes et une tahitienne) et d'une population sauvage d'Equateur révèle une variabilité très réduite dans les populations d'élevage, en particulier en Nouvelle-Calédonie et à Tahiti (2 à 3.7 allèles par locus au lieu de 14 à 27 en population sauvage ; 20% à 60% d'hétérozygotie au lieu de 90%). Les souches tahitiennes et calédoniennes disposent des mêmes allèles, ce qui suggère que la perte d'allèles a eu lieu lors de l'histoire commune des ces populations. A l'inverse, les populations néo-calédoniennes et hawaiiennes n'ont en commun qu'un seul allèle sur les 3 locus étudiés. Bien que la très faible variabilité génétique du cheptel calédonien ne semble pas affecter ses performances actuelles, les résultats de cette étude démontrent l'utilité de l'introduction de variabilité afin d'augmenter la capacité de réponse à de nouvelles pressions de sélection (contrôlées ou non). L'introduction des souches hawaiiennes en Nouvelle-Calédonie qui permettrait à la filière locale de disposer de 40% de la diversité allélique de l'espèce) est préconisée de préférence à celle d'animaux sauvages afin de bénéficier (i) de la sélection spontanée qu'elles ont subi lors de leur domestication et (ii) de leur statut sanitaire « specific pathogen free, SPF » (absence de 4 virus : WSV, YHV, IHHNV, TSV) qui limite les risques de transferts de pathogènes.
Aquatic Living Resources (0990-7440) (Elsevier), 2003-12 , Vol. 16 , N. 6 , P. 501-508

Droits : 2003 Published by Elsevier, Paris.
http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/publication-596.pdf
DOI:10.1016/j.aquliv.2003.07.001
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/596/

Éditeur(s) : Gauthier-Villars
Résumé : In developing countries, recourse to extensive aquaculture systems based on the exploitation of natural aquatic food webs is currently the subject of considerable interest. In this connection, the construction of artificial reefs (known as Acadja) for the development on substrates of living communities, and the utilization of this new production to enhance fish growth have been evaluated in Cote d'Ivoire. This paper describes the granulometric, chemical and biological transformation of the sedimentary ecosystem as a consequence of this practice. In the artificial habitat, an increase in the sedimentation rate of the mineral fraction (definitive trapping of particle resuspension generated by the waves and induced by the wind) and of the organic fraction (direct and indirect sedimentation of the epiphytic biomass) constitutes the starting point of significant modifications in epibenthic communities. In the Acadja, the meiofauna, dominated by nematodes and copepods, is somewhat less diversified, some groups being absent or poorly represented (turbellarians, gastrotrichs, ostracods). These characteristics were confirmed by a specific study of the nematode assemblages. In fact, the relatively high diversity of the nematode community in the natural lagoon sediment (dominated seasonally by Paraphanolaimus, Anonchus et Daptonema) contrasts with low diversity in the Acadja sediment, where the community is always dominated by Theristus sp. This lower specific diversity generates a reduction of the trophic types. In the Acadja, only the non-selective detritus feeders colonize the fine and organic sediment. These sedimentological and ecological transformations, which affect the entire ''brush park'' (Acadja), induce a strong eutrophication of the benthic ecosystem. Sustainable fish production in such tropical lagoons, in an environment where anaerobic processes dominate (especially sulfate-reduction), calls for strategic spatio-temporal planning to take of account of this progressive eutrophication.
Oceanologica Acta (0399-1784) (Gauthier-Villars), 1995 , Vol. 18 , N. 5 , P. 543-555

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00097/20796/18421.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00097/20796/

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : La Martinique est actuellement en proie un taux de chômage chronique élevé et une augmentation constante du coût de la nourriture et des autres produits essentiels. La catastrophe écologique s’ajoute à ce problème sociétal avec la contamination par la chlordécone d'environ un tiers de la surface de la terre et les eaux environnantes de cette île. La chlordécone est extrêmement toxique et récalcitrante, son utilisation fut interdite aux Etats-Unis dès 1979 mais elle fut utilisée continuellement jusqu'en 1993. L’agriculture alternative est un moyen pratique pour atténuer le malaise social profond résultant d’un taux de chômage chroniquement élevé et d’une dépendance totale envers les couteuses importations alimentaires de la France métropolitaine. L'un des objectifs de base de cette approche serait de ne pas utiliser de produits chimiques. La culture de certaines plantes solanacées comestibles, comme le poivron, semble être possible dans cet environnement avec l’installation de serres semi-ouvertes, dans lesquelles la lumière naturelle, les précipitations et les températures chaudes toute l'année sont abondantes. Dans cette perspective, l'empreinte carbone de telles productions réalisées en Martinique pourraient être livrées au Royaume-Uni avec une empreinte carbone sensiblement inférieure à celle de poivrons cultivés dans des serres chauffées autonomes d’Europe.
Martinique is currently beset by, among other things, chronic high unemployment rate and steadily rising cost of food and other life essentials. Overlaying this societal problem is the continuing ecological disaster of chlordecone contamination of about 1/3 of the land surface, and surrounding waters. Chlordecone is extremely toxic and recalcitrant; its use was banned in the USA in 1979, but it was used continually until 1993. Alternative agriculture is a practicable means to alleviate the deep social unrest arising from chronically high unemployment rate and near total dependency on costly food imports from metropolitan France. One of the basics aims of this approach would be the zero use of synthetic chemicals for pest-and weed-control for all crops. Cropping of certain edible Solanaceae fruits, viz, bell pepper, appears to be feasible under a semi-open greenhouse environment, in which natural sunlight, rainfall and warm year-round temperatures would be deployed maximally. The carbon footprint of this prospective Martinique produce delivered to the UK might be substantially lower than that of bell peppers grown in stand-alone heated greenhouses in mainland Europe.
Martinique

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.6710
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/6710

Résumé : La Norvège a toujours passé, avec quelque raison, semble-t-il, en France tout au moins, comme l'un des pays où l'industrie de la pêche est le plus développée. A diverses reprises, nous lui avons emprunté ses engins et ses méthodes. Aussi, paraît-il indispensable pour quelqu'un, dont le rôle est de faire et de diriger dans nos colonies, les études scientifiques et appliquées se rapportant à l'industrie du poisson, de visiter avec soin la Norvège, pour y étudier d'une façon aussi complète que possible, les engins, les méthodes de travail, les bateaux de pêche, la préparation des produits et aussi des sous-produits, qui intéressent d'une façon si considérable nos colonies, dont les besoins en matières azotées alimentaires et agricoles sont très grands. Nous avions pensé pouvoir accomplir notre voyage d'études en 1914 ou 1915, mais le déchaînement de la guerre mondiale, nous a, comme tant d'autres, dirigé d'un autre côté. Nous avons pu l'année dernière, reprendre notre projet, et grâce à la bienveillance de M. le Ministre des Colonies, à la générosité des grands Gouvernements généraux et de l'Office Scientifique et Technique des Pêches Maritimes, nous avons pu accomplir un voyage utile, qui, nous l'espérons, sera d'un certain profit pour la France métropolitaine, et aussi surtout, pour la France coloniale, vers laquelle nous dirigeons depuis de longues années déjà, nos constants et patients efforts.
Notes et mémoires, 1922 , Vol. 16

Droits : 1922 OSTPM
http://archimer.ifremer.fr/doc/00016/12755/9687.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00016/12755/

Éditeur(s) : Wiley-blackwell
Résumé : Managing fisheries resources to maintain healthy ecosystems is one of the main goals of the ecosystem approach to fisheries (EAF). While a number of international treaties call for the implementation of EAF, there are still gaps in the underlying methodology. One aspect that has received substantial scientific attention recently is fisheries-induced evolution (FIE). Increasing evidence indicates that intensive fishing has the potential to exert strong directional selection on life-history traits, behaviour, physiology, and morphology of exploited fish. Of particular concern is that reversing evolutionary responses to fishing can be much more difficult than reversing demographic or phenotypically plastic responses. Furthermore, like climate change, multiple agents cause FIE, with effects accumulating over time. Consequently, FIE may alter the utility derived from fish stocks, which in turn can modify the monetary value living aquatic resources provide to society. Quantifying and predicting the evolutionary effects of fishing is therefore important for both ecological and economic reasons. An important reason this is not happening is the lack of an appropriate assessment framework. We therefore describe the evolutionary impact assessment (EvoIA) as a structured approach for assessing the evolutionary consequences of fishing and evaluating the predicted evolutionary outcomes of alternative management options. EvoIA can contribute to EAF by clarifying how evolution may alter stock properties and ecological relations, support the precautionary approach to fisheries management by addressing a previously overlooked source of uncertainty and risk, and thus contribute to sustainable fisheries.
Fish And Fisheries (1467-2960) (Wiley-blackwell), 2014-03 , Vol. 15 , N. 1 , P. 65-96

Droits : 2012 John Wiley & Sons Ltd
http://archimer.ifremer.fr/doc/00124/23522/21409.pdf
DOI:10.1111/faf.12007
http://archimer.ifremer.fr/doc/00124/23522/

Résumé : Suite à la mission d'expertise réalisée en 1999, un programme d'extension de la surveillance RNO aux Antilles à été décidé en Comité de Pilotage. Fin 2000, une intercomparaison de trois laboratoires antillais, menée par DEL/EC-EB, a permis le choix des deux partenaires chargés des analyses hydrologiques (Laboratoire Départemental d'Hygiène pour la Martinique et Institut Pasteur pour la Guadeloupe). Le programme expérimental de suivi dans l'eau et la matière vivante a été proposé par la coordination en juillet 2001. Les objectifs de la présente mission d'assistance au démarrage du RNO étaient multiples : (a)Finaliser la stratégie de surveillance. Définir et fixer les points de prélèvements proposés en fonction des réalités du terrain. Vérifier par une campagne réelle la faisabilité du programme. (b)Réunir les différents intervenants RNO afin de garantir une bonne coordination des opérations futures par une connaissance réciproque des tâches de chacun, en particulier les DIREN, CQEL et laboratoires. (c) Former les préleveurs aux techniques de prélèvement en milieu marin, en particulier par l'utilisation de bouteilles à prélèvements. Les sensibiliser aux précautions particulières à ce milieu, souvent pauvre en nutriments et en matières en suspension. (d) Résoudre avec les analystes des laboratoires les problèmes rencontrés à tous les stades de l'analyse, en insistant sur les différences avec les eaux douces auxquelles ils sont habitués. Vérifier que leur matériel est bien adapté et, sinon, les conseiller dans leurs achats. (e) Répondre à toutes les interrogations des partenaires sur l'organisation du RNO ou inhérentes à la surveillance d'un milieu nouveau pour eux.

Droits : 2001 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00016/12748/9680.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00016/12748/

Éditeur(s) : Cnexo
Résumé : Voici un an déjà le dépôt du Programme d'action à Moyen Terme que m'avaient demandé les Ministres, marquait le départ d'une réflexion intense au niveau gouvernemental sur l'océanologie. Témoignage d'un intérêt précieux pour la mise en valeur d'océans à la fois si proches et si lointains par la faiblesse de nos connaissances et de nos moyens d'investigation, cette réflexion a clarifié le cadre dans lequel nous devons travailler. Notre rôle, notre mission en ressortent mieux. Nous ne sommes pas un ensemble de recherche-développement comme les autres parce que nous sommes, parce que vous êtes d'abord au service de quatre missions nationales indissociables qui nous sont confiées: 1. animer, orienter, développer en liaison avec les utilisateurs finaux l'effort de recherche exploratoire national, c'est-à-dire cette recherche de pointe qui doit associer les finalités de connaissance et celles des applications sur des problématiques de portée générale et avec des visées qui peuvent être à relativement long terme; 2. permettre à la communauté scientifique de disposer des meilleurs outils, des meilleurs équipements lourds pour poursuivre un effort dont l'efficacité, la productivité scientifique doivent être accrues fortement en raison de son coût élevé pour la Nation. A cette mission se rattache celle de favoriser le développement des technologies de base utile à la pénétration, à la mesure et à la valorisation du milieu marin lato sensu; 3. être l'outil privilégié de la promotion d'une approche intégrée pluridisciplinaire et intersectorielle de l'effort océanologique; 4. S'assurer du meilleur transfert possible à l'économie des résultats de l'effort public de recherche en le facilitant en cas de besoin, notamment en encourageant l'effort privé et en s'y associant. [OCR NON CONTRÔLE]
La Lettre du Cnexo (Cnexo), 1980-04 , N. 1 , P. 1-6

Droits : Cnexo - Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/1980/publication-4776.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4776/

Résumé : Depuis l'extension de la Zone Economique Exclusive française à 200 milles au large des côtes de la Guyane française (Amérique du sud), une flottille d'environ soixante dix chalutiers industriels battant pavillon français, exploite le stock de crevettes pénéïdes (Penaeus subtilis) présent dans ces eaux. Cette pêcherie est gérée par un système de T.A. C. 's fixé annuellement par la Communauté Européenne. Comme dans de nombreuses autres pêcheries de ce type en eaux sub-tropicales ou équatoriales le taux des prises accessoires est élevé. L'objectif de cette étude a été d'évaluer et de cartographier le volume de ces captures accessoires. Cette analyse devait également permettre de caractériser le peuplement de l'écosystème du plateau guyanais, étude de la biodiversité et des associations, et d'estimer la variabilité de la répartition spatio-temporelle des principales espèces capturées en prises accessoires. Les eaux chaudes de la Guyane sont fréquentées par cinq espèces de tortues marines, les tortues luth Dermochelys coriacea, olivâtre Lepidochelys olivacea, verte Chelonia mydas, imbriquée Eretmochelys imbricata, et caouanne Caretta caretta. En raison de la menace d'embargo américain sur les produits crevettiers guyanais, liée au fait que selon eux, aucune mesure de protection n'est appliquée pour limiter les prises accidentelles de ces tortues, une étude particulière visant à estimer le taux réel de leurs captures a également été menée. Les captures accessoires de la pêcherie de crevettes pénéïdes du plateau continental de la Guyane française, ont représenté environ 99% des prises totales des crevettiers. Ces prises accessoires sont principalement constituées de poissons (96% des captures), et secondairement de quelques espèces de crustacés, de crevettes autres que Penaeus subtilis et de céphalopodes. Sur les 120 espèces de poissons inventoriées dans les captures, seule une dizaine d'entre elles contribue à près de 80% du total de la biomasse apparente estimée. Les autres sont apparues de manière épisodique avec des rendements faibles (inférieurs à 1 kg!30min). La majorité de ces espèces présente des tailles réduites. La variabilité spatiotemporelle de ces captures accessoires est peu marquée. L'analyse des prises accessoires de tortues montre quant à elle, que seule une espèce, la tortue olivâtre (Lepidochelys olivacea), apparaît vulnérable aux chaluts des crevettiers. Les informations recueillies, que ce soit lors des campagnes scientifiques ou lors des enquêtes auprès des professionnels, sont trop succinctes pour être utilisées dans tout calcul d'inférence. La conclusion de cette étude est que les chalutiers industriels guyanais capturent des tortues en prises accessoires, mais que leur nombre total annuel, ainsi que leur variabilité dans le temps et l'espace sont pour l'instant impossible à déterminer. Les résultats de l'étude d'impact des T.E.D. (ou Turtle Excluder Deviee) menée en bassin d'essais ont montré que ces engins n'ont pas d'impact sur le comportement général du chalut. La seule conséquence de leur utilisation réside dans leur risque de colmatage, et donc dans la baisse des rendements de crevettes, estimés à environ 10 %.

Droits : 1994 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00073/18454/15992.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00073/18454/

Résumé : L'industrie française des algues rouges qui occupe en 1978 le deuxième rang mondial extrait de certaines espèces d'algues telles que Chondrus orispus, Gigartina stellata, Eucheuma cottonii, Eucheuma spinosum, des polyssaccharides appelés carraghénanes. La principale propriété de ces carraghénanes est de réagir avec les composants du lait pour donner des gels à fine structure, d'où leur utilisation dans la fabrication de tous les dérivés actuels du lait (pâtisseries, flans, crèmes, glaces, fromages, laits chocolatés, sauces). Cette industrie traite actuellement 7 000 tonnes d'algues sèches Le littoral métropolitain en fournit 2 000. Le reste, soit 5 000 tonnes provient d'Extrême-Orient, d'Afrique ou d'Amérique du Sud. Mais, les pays fournisseurs ont de plus en plus tendance à freiner ces exportations de façon à favoriser la création d'usines de transformation sur leur propre territoire. Les usines françaises éprouvent donc de plus en plus de difficultés pour obtenir la matière première indispensable à leur fonctionnement et à leur expansion, surtout en ce qui concerne les carraghénophytes de haute qualité. L'I.S.T.P.M. s'efforce de les aider dans ce domaine : - il étudie les possibilités de culture d'algues qui pourraient augmenter le potentiel disponible soit en France comme les travaux actuels sur la culture en bassin de l'algue rouge Chondrus crispus, soit à l'étranger comme les travaux sur la culture en mer de l'algue rouge Eucheuma spinosum à Djibouti, dont les résultats ont été spectaculaires ; - il recherche sur nos côtes d'autres espèces d'algues qui contiendraient des carraghénanes où des populations de carraghénophytes encore inexploités.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00018/12926/9888.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00018/12926/

Résumé : Le programme d'amélioration des techniques d'élevage de la Chevrette Macrobrachium rosenbergii en Guyane constitue la deuxième phase du programme d'expérimentation mené sur la station IFREMER de Kourou. Jusqu'en 1988, l'effort a porté sur l'analyse du système continu classique utilisé par l'ensemble des producteurs de Macrobrachium aux Antilles et en Guyane. A partir de 1988, il apparut que la résolution des problèmes posés par son application passait par l'utilisation de schémas de gestion de la population en mode discontinu. Les expérimentations ont donc porté sur les principales conditions d'élevage susceptibles d'améliorer l'efficacité du schéma d'exploitation de la population. En prégrossissement, il s'agissait d'obtenir le meilleur compromis densité/croissance en jouant sur des facteurs tels que l'aliment artificiel ou la stimulation de la productivité naturelle, tout en produisant un juvénile pour toute post larve ensemencée. En grossissement, la contrainte essentielle est l'organisation sociale de la population qui se traduit par une croissance rapide et hétérogène des mâles et une croissance lente mais homogène des femelles. Nous avons essayé de dégager les schémas permettant de tirer le maximum de profit de ces spécificités de croissance avec un minimum de coût. Pour cela nous avons testé différentes procédures en jouant sur le poids moyen initial, les caractéristiques de la population introduite (monosexe, lot de tête ou de queue issus d'un tri), la densité et la durée d'élevage,le mode de récolte.

Droits : 1992 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00041/15262/12611.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00041/15262/

Résumé : En 1987, la filière de production de chevrettes Macrobrachium rosenbergii en Guyane Française a fait l'objet d'intervention du laboratoire d'aquaculture de l'IFREMER à 2 niveaux : un appui technique à la profession, et des expérimentations à la station expérimentale gérée en commun par IFREMER et INRA, à KOUROU. L'appui technique a porté sur la formation d'éleveurs notamment pour le démarrage des exploitations, l'amélioration des techniques d'exploitation et de choix des classes détaillées commerciales, la maîtrise des caractéristiques du milieu d'élevage par l'utilisation des amendements classiques, la lutte contre la contamination des produits par les germes coliformes. Le programme de recherche a porté en 1987 sur l'analyse du milieu d'élevage et tenté d'identifier un bon estimateur de la qualité du milieu, nécessaire pour l'exploitation des bassins par la méthode en «continu». Au plan de la production, l'année 1987 est marquée par un arrêt brutal de la dynamique de la production qui caractérisait les années précédentes, en raison de l'échec de la commercialisation à l'exploitation, allant jusqu'à l'arrêt de quatre exploitations représentant une vingtaine d'hectares.

Droits : 1989 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00041/15267/12619.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00041/15267/

Éditeur(s) : Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes (ENSAR)
Résumé : Artificial Fish Aggregating Devices (FADs) are known to concentrate tropical tunas. This aggregative behaviour drastically increases the vulnerability of these species to fishing. Alternatively, FADs can be used as oceanic observatories to study the aggregative behaviour of large pelagic fish. We conducted sea surveys in Martinique (Lesser Antilles) to i) establish a typology of the pelagic fish aggregations found around moored FADs ii) study their relations with their biotic and abiotic environment and the local fishery. The mean biomass of large pelagic fish aggregations was also estimated to provide scientific inputs to achieve a sustainable management of the moored FAD fishery. The first part presents the background of the study. We introduce the regional pelagic ecosystem, the aggregative behaviour of pelagic fish around FADs and the Martinican moored FAD fishery. The second part begins with a presentation of the conceptual framework of the study: the hierarchy theory. Observation scales and survey methodology are therefore described. Repeated echosounder surveys run in a star pattern were conducted around 2 moored FADs, in combination with underwater video observations, classical fishing experiments and CTD profiles. In the third part, the elements of the [moored FAD ¿ pelagic fish - environment - fishing] system and their interactions are numerically characterised in the vertical plane. The main type of pelagic fish aggregation was a large aggregation distributed in sub-surface (40-100 m) within a radius of 400 m of the FAD. This aggregation was mostly made of 60 cm FL blackfin tunas (Thunnus atlanticus). It appeared at sunrise and mostly spread away in the late afternoon. It was observed during all daytime surveys. The average density and the vertical structure of the micronektonic sound scattering layers (SSLs) were assessed locally around a FAD for 48h cycles. These SSLs descriptors showed positive correlation with the size and the abundance of the sub-surface tuna aggregation. Whereas this aggregation accounted for about 95% of the total biomass aggregated around a moored FAD, it was nearly unexploited by the local commercial fishermen. The fourth part focuses on the sub-surface tuna aggregation. A high variability of the spatial distribution of the aggregation was evidenced in the horizontal plane at daily, day to day and monthly temporal scales. These variations were related to fluctuations of the global abundance of the aggregation. The daytime average density of sub-surface tuna was modelled as a function of the distance to FAD, within an advection-diffusion framework. Based on these results, a universal kriging model was designed to assess the mean maximum daily biomass of the sub-surface tuna aggregation. This mean biomass estimate yielded 11 tons with an estimation error of 26%. To conclude, we present a hierarchical organization in space and time of a sub-surface tuna population distributed within a network of moored FADs, from micro to meso-scale. We suggest that the spatial distribution of tunas can be explained from fine to coarse-scales by behavioural processes (self-organization, feeding, aggregative behaviour) whereas their spatial distribution is mainly forced by environmental processes at broader scales.
L'utilisation de Dispositifs de Concentration de Poissons permet de provoquer la formation de larges agrégations de thonidés autour de dispositifs artificiels, ce qui augmente considérablement la vulnérabilité de ces ressources vis-à-vis de l'exploitation halieutique. Les DCP peuvent également être utilisés en tant qu'observatoires océaniques, afin d'étudier le comportement agrégatif du macronecton pélagique. Nous avons ainsi réalisé des observations autour de DCP ancrés en Martinique, afin de définir une typologie des agrégations de macronecton et de étudier leurs relations avec leur environnement biotique, abiotique et l'exploitation halieutique locale. Nous avons ensuite estimé la biomasse moyenne de macronecton agrégé autour d'un DCP ancré, afin de fournir des éléments scientifiques nécessaires à une gestion durable de ces ressources. La première partie présente le contexte de l'étude i.e. l'écosystème pélagique régional, le phénomène d'agrégation du macronecton autour des DCP et la pêche associée aux DCP ancrés en Martinique. La deuxième partie introduit la théorie de la hiérarchie qui a fourni le cadre conceptuel de l'étude et présente les échelles et méthodes d'observation. Le principal outil d'observation est un échosondeur scientifique, mis en oeuvre le long de parcours en étoile autour du DCP. Les prospections acoustiques ont été combinées à des observations vidéo sous marines, des pêches expérimentales et un suivi in-situ de l'environnement abiotique. La troisième partie présente une typologie des éléments constituant le système [DCP ancré - macronecton - environnement - pêche] dans le plan vertical et précise leurs interactions. Le type d'agrégation de macronecton dominant est une grande agrégation composée d'une majorité de thons noirs (Thunnus atlanticus) de taille moyenne (60 cm) distribuée en sub-surface (40-100 m), dans un rayon de 300 m autour de la tête des DCP. Cette agrégation se forme au lever du soleil et se disperse presque totalement dans l'après midi. Elle a été observée de jour lors de toutes les campagnes. Une corrélation positive entre la densité et la structure moyenne des couches micronectoniques diurnes évaluée localement autour du DCP au cours de 48 h et les dimensions et l'énergie acoustique de l'agrégation de thons de subs-surface a été mise en évidence. Malgré le fait que cette agrégation représente en moyenne 95 % de l'énergie acoustique du macronecton autour des DCP, elle est presque inexploitée par les pêcheurs artisans locaux. La quatrième partie met en évidence les fortes variations conjointes de la distribution spatiale dans le plan horizontal de la densité de l'agrégation de thons de sub-surface et de son abondance globale. Ces variations ont été observées au cours du cycle nycthéméral et aux échelles inter-journalières et mensuelles. La distribution spatiale moyenne de la densité diurne de l'agrégation en fonction de la distance au centre de gravité de l'agrégation est cependant très stable et peut être modélisée au moyen d'une équation d'advection-diffusion. Un modèle de krigeage universel, utilisant les résultats du modèle d'advection-diffusion, a permis d'évaluer la biomasse maximale journalière moyenne de l'agrégation de thons de sub-surface à une dizaine de tonnes, avec un coefficient de variation d'estimation de 26%. Nous proposons une représentation hiérarchique synthétique de la distribution spatiale d'une sous-population de thons dans un réseau de DCP ancrés de la micro à la méso-échelle. Nous suggérons que la distribution spatiale des thons est déterminée principalement à l'échelle fine (100m-1km) et à l'échelle grossière (1-10 km) par des processus comportementaux (auto-organisation, agrégation, nutrition) et par des processus environnementaux à échelle plus large.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/these-1735.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/sup-1735.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1735/

Résumé : L’élevage des crevettes pénéides a connu un développement spectaculaire à l’échelle mondiale depuis les années soixante-dix, en particulier grâce à la maîtrise de l’ensemble du cycle biologique en captivité de plusieurs espèces d’intérêt aquacole (Aquacop, 1979). Elle a en effet permis de s’affranchir de l’approvisionnement aléatoire en juvéniles de pêche et en géniteurs sauvages, et par voie de conséquence de domestiquer ces espèces, c'est-à-dire de les sélectionner spontanément pour de meilleures aptitudes à l’élevage. Cette évolution est similaire à celle de filières piscicoles. Cependant les pathologies infectieuses représentent un frein important au développement ultérieur de ces activités. De manière générale, une pathologie infectieuse est la conséquence d’une rupture d’équilibre entre un hôte, son environnement et un ou plusieurs pathogènes (Lightner & Redman, 1998). Toute tentative de lutte contre une pathologie nécessite une meilleure connaissance de ces 3 compartiments ainsi que leurs interactions. Le présent rapport vise à synthétiser les informations scientifiques essentielles utiles à la mise au point de stratégies de lutte contre ces pathologies en pénéiculture. Un premier point sur les pathogènes sera développé avant d’évoquer les principaux descripteurs de la santé de la crevette. Enfin, les différentes possibilités de gestion des pathologies en crevetticulture, dont l’une est la sélection génétique, seront passées en revue.

Droits : 2004 Université de la Rochelle, Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00204/31528/29944.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00204/31528/

Éditeur(s) : PSIC 11 - 11th Pacific Science Inter-Congress : Pacific Countries and their Ocean: Facing Local and Global Changes / 2nd Symposium on French Research in the Pacific. March 2 - 6, 2009 Tahiti, French Polynesia.
Résumé : In aquaculture, Artemia nauplii are commonly used as live prey; and represent 40 % of the total aquaculture feed demands in the early stages. However, the production of Brine shrimp is very unstable from one year to another and in the late 90’s, only 20 % of the world aquaculture need was covered. An insufficient offer leads to higher prices of the Artemia cysts and consequently, the price of shrimp juveniles from hatchery. In New Caledonia, marine aquaculture is mainly based on the blue shrimp Litopenaeus stylirostris. From Zoea 3 to 10 days old post-larvae (P10), the shrimp are mainly fed with live preys. Eleven kilos of Artemia cyst are necessary for producing one million of P10. From a sanitary point of view, Artemia can be a virus carrier and Vibrio population increase is often detected in the larval rearing tank the day after the feeding with live prey. Up to now, Brine shrimp are delivered in excess but with the cost and sanitary problems, Saint-Vincent laboratory has started some experiments in order to optimise the use of Artemia in shrimp larval rearing. The first tests were conducted to determine the effect of the Artemia quantity on the growth and the survival rate at different post-larval stages (P8-P11, P5-P8 and M3-P3). It was shown that four to twelve times fold Artemia was necessary for P8-P11 compared to M3-P3. And it was also noticed that the “optimized”quantity of live food at M3-P3 was twice lower than the recommended amount of the hatchery feeding protocol in New Caledonia. A better knowledge of the real feed requirement in the early life of the blue shrimp will be helpful to decrease the cysts quantities used in shrimp hatcheries but also the associated sanitary impact. And further, these results will give data for developing formulated diets which will replace the live prey and will increase the biosecurity and the sustainability of the production of the blue juvenile shrimp in New Caledonia.
En aquaculture, les nauplii d’Artemia sont largement utilisés comme proies vivantes et représentent près de 40 % des besoins en aliments pour la production des stades précoces. Cependant, l’approvisionnement en Artemia peut fluctuer de façon importante d’une année sur l’autre. Ainsi vers la fin des années 90, la demande mondiale a pu être satisfaite seulement à hauteur de 20%. Les années avec une offre insuffisante correspondent à des augmentations importantes du cours mondial des cystes d’artemia avec des répercussions sur le prix des animaux juvéniles produits en écloserie. En Nouvelle-Calédonie, l’aquaculture marine est principalement basée sur la crevette bleue Litopenaeus stylirostris. Les larves de cette espèce, à partir du stade Zoé 3, se nourrissent essentiellement de proies vivantes. Ainsi pour produire un million de Post-larves de 10 jours il faut compter 11 kilos de cystes d’Artemia. Outre le problème posé par le coût, les artemii peuvent également représenter un risque sanitaire pour l’écloserie. En effet certaines souches sont infectées par des virus qui peuvent contaminer les crevettes et de façon plus générale l’introduction des artemii dans le volume d’élevage larvaire s’accompagne le plus souvent d’une flambée de la flore vibrionacée. Jusqu’à présent, les Artemii étaient distribuées en excès cependant du fait de leur coût et des risques sanitaires, le laboratoire de St Vincent a débuté un travail pour optimiser leur utilisation en production larvaire de crevette. Ainsi, nos premières expérimentation sur l’effet de la dose en artemii sur le développement et la survie des larves de crevettes ont permis de déterminer les rations optimales pour les stades larvaires P8-P11, P5-P8 et M3-P3. Nous avons ainsi montré que la ration de proies vivantes était 4 à 12 fois plus importante à P8-P11 qu’à M3-P3. Par ailleurs la dose optimale déterminée au cours de nos expérimentations était pour les stades M3-P3 deux fois moins élevée que celle préconisée par le protocole actuel des écloseries commerciales de Nouvelle-Calédonie. Nous voyons ainsi, qu’une meilleure compréhension des besoins alimentaires de la crevette au cours de son développement permettra de diminuer de façon substantielle les proies vivantes utilisées ainsi que le risque sanitaire associé. A terme, ces travaux donneront des bases au développement d’aliments inertes en remplacement des proies vivantes et à la production durable, en conditions de biosécurité, des crevettes bleues juvéniles pour la filière Calédonienne

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00198/30877/29245.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00198/30877/

Éditeur(s) : Proceedings of the 3th International Colloquium on Spectral Signatures of Objects in remote Sensing,16-20 décembre 1985, Les Arcs, France. 1985. ESA SP-247, pp.203-206
Résumé : Spectral signatures were measured on the coast using a "high-resolution" spectroradiometer and a SPOT simulation radiometer. These data allow to define optical indexes that are useful for the characterization of seaweeds and of intertidal areas.
Des signatures spectrales ont été mesurées sur le littoral au moyen d'un spectroradiomètre "haute résolution " et d'un radiomètre de simulation SPOT. Ces données permettent de définir des indices optiques utiles à la caractérisation des algues et des faciès de l'estran

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00143/25436/23589.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00143/25436/

Résumé : Ce travail de thèse intitulé «Evaluation de marqueurs génétiques du complexe Mycobacterium tuberculosis combinée à l'utilisation d'outils bioinformatiques: apport en épidémiologie et phylogénie de la tuberculose» a consisté en la sélection et l'évaluation de marqueurs minisatellites dans le cadre d'études épidémiologiques et phylogénétiques du bacille tuberculeux, Une première partie a ainsi porté sur l'épidémie de tuberculose en Guadeloupe, Martinique, et Guyane française ainsi que dans un pays continental à faible incidence de tuberculose, la Suède, Les résultats montrent les disparités existant entre les populations de patients tuberculeux des 3 départements français d'Amérique (DFA) ainsi que les similitudes génotypiques existant entre les bacilles tuberculeux. Par ailleurs le rôle majeur joué par les cas d'importation dans l'épidémie de tuberculose a été montré aussi bien dans les DFA qu'en Suède. Nous nous sommes ensuite intéressés à une utilisation optimale des minisatellites pour une meilleure discrimination de la famille génotypique émergeante « Beijing» circulant au Japon (Osaka, Kobe et Okinawa), ainsi qu'en Russie. Nous avons constaté le faible pouvoir discriminant du format classique 12-locus MIRU (Mycobacterial lnterspersed Repetitive Units) et proposons plusieurs nouvelles stratégies de typage basées plusieurs marqueurs minisatellites incluant certains locus hypervariables. Enfin, dans un troisième volet, nous avons étudié la diversité génétique des bacilles tuberculeux circulant actuellement dans la Caraïbe. laquelle semble refléter le passé historique très particulier de cette zone géographique au croisement d'une multitude de peuplements.
This thesis entitled "Evaluation of genetic markers of Mycobacterium tuberculosis combined with the use of bioinformatics tools: input for epidemiology and phylogeny of tuberculosis" deals with the selection and evaluation of minisatellite markers in the context of epidemiological and phylogenetic studies of the tubercle bacillus M. tuberculosis. The first part of the present work has focused on the epidemic of tuberculosis in Guadeloupe, Martinique and French Guiana as well as in a low incidence continental country, i.e Sweden. The results show differences between populations of TB patients in the three French Departments of America and similarities between the genotypes of the circulating tubercle bacilli Moreover, results highlight the important role played by imported cases for TB epidemic the three French departments of America and Sweden. ln a second part, minisatellite markers have been evaluated for a better discrimination of strains of the emerging genotype "Beijing" circulating in Japan (Osaka, Kobe and Okinawa), and Russia. A low discriminatory power of classical format 12-locus MIRU (Mycobacterial lnterspersed Repetitive Units) was observed and new combinations of minisatellites have also been proposed including hypervariable locus. Finally, the genetic diversity of tubercle bacilli circulating in the Caribbean was investigated which currently seem to reflect historical past of this very special region at the intersection of a multitude of cultures and peoples.

http://www.theses.fr/2011AGUY0427/document