Éditeur(s) : CRILLASH : Centre de Recherches Interdisciplinaires en Lettres, Langues, Arts et Sciences Humaines CRILLASH : Centre de Recherches Interdisciplinaires en Lettres, Langues, Arts et Sciences Humaines
Extrait de : "L'apprentissage scolaire" : journée d'étude, le 11 mars 2015. Université des Antilles et de la Guyane
Description : Les difficultés d'attention sont une composante majeure des troubles d'apprentissage car elles réduisent la compréhension, l'automatisation, et la récupération des savoirs. L'inattention peut avoir plusieurs sources dont des facteurs motivationnels (interférence liée au stress et aux affects, sous mobilisation de l'intérêt, orientation impulsive aux stimulations hors tâche, mauvaises habitudes liées aux efforts) mais aussi l'inefficacité des moteurs de recherche cérébraux impliqués dans le repérage, la catégorisation et le rappel des informations. Ces facteurs peuvent être réduits par des aménagements environnementaux (distractions, émotions, routines), des encadrements systématiques (écoute active, prise de note, soulignement, étude) ainsi que des traitements psychologiques et pharmacologiques.
Siècle(s) traité(s) : 21
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V15172
V15172

Éditeur(s) : Université des Antilles AREBio Groupe de recherche BIOSPHERES : BIOlogie, Sciences Physiques & Humaines pour les énergies Renouvelables, l
Extrait de : 1er colloque international BIOSPHERES, du 18 au 20 juin 2019. Université des Antilles
Description : Dans son rapport intitulé « Stratégie de l'OMS pour la médecine traditionnelle pour 2014- 2023 », l'OMS rappelle que plusieurs millions de personnes ont recours à des médicaments à base de plantes, des traitements traditionnels et des praticiens traditionnels, qui constituent pour eux la principale, voire l'unique source de soins de santé. Généralement peu coûteux, ils s'avèrent également primordiaux pour faire face à la montée de maladies chroniques non transmissibles telles que le diabète de type 2 ou l'obésité. Dans les pays dits développés, l'usage des médecines traditionnelles est parfois répandu pour des raisons culturelles et historiques (ex République de Corée) ou a pu se maintenir localement pour les mêmes raisons (ex certains territoires ultramarins français) ou encore se présente comme une alternative aux médecines conventionnelles avec le plus souvent une connotation de faible toxicité et une part importante d'automédication. D'une manière globale donc, les médecines traditionnelles et complémentaires suscitent un intérêt grandissant constant également favorisé par la diffusion des informations et l'achat des produits sur internet.

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V19071

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier Masson
Résumé : National audience
Introduction Les télomérases sont les enzymes assurant la synthèse des télomères, séquences d’ADN essentiels dans la protection des chromosomes. Les mutations des télomérases sont responsables, entre autres, d’anomalies hématologiques, pulmonaires (fibrose pulmonaire idiopathique) et hépatiques. Il n’y a que peu de données dans la littérature concernant les résultats des transplantations pulmonaires chez ces patients mutés. Cas clinique Nous rapportons le cas d’un jeune homme de 39 ans, souffrant de syndrome myélodysplasique associé à une fibrose pulmonaire, permettant de poser le diagnostic de téloméropathie (mutation de la sous-unité ARN ou TERC ; r.182delG, pseudoknot area). L’insuffisance médullaire est sévère : leucopénie à 1,3 G/L dont 0,54 G/L de PNN, anémie macrocytaire (Hb à 10,3 g/dL ; VGM à 120 fL) et thombopénie à 27 G/L. Le syndrome restrictif est également sévère avec une CPT à 60 % et une CVF à 82 % de la valeur prédite (% pred). Il s’associe à une altération de la membrane alvéolo-capillaire (DLCO corrigée sur l’hémoglobine à 31 % pred). Le patient a été récusé à la fois pour la transplantation médullaire et pour la transplantation pulmonaire malgré son jeune âge. La prise en charge est donc palliative : réhabilitation respiratoire, oxygénothérapie, puis nintedanib. Discussion Dans la littérature, les transplantations médullaires chez les patients présentant une mutation des télomérases s’associent à une dégradation de la fonction respiratoire, en lien avec la toxicité des traitements immunosuppresseurs, même en l’absence d’atteinte pulmonaire initiale. Par ailleurs, les complications infectieuses et hématologiques post-transplantations pulmonaires chez ces patients mutés semblent plus fréquentes et nécessitent souvent une adaptation des traitements anti-rejets. Ces risques post-transplantations paraissent plus importants en présence d’une thrombopénie sévère préopératoire. Ces données sont cependant limitées à trois études rétrospectives de petites tailles. Au total, ce jeune patient a été jugé inéligible à la transplantation médullaire et à la transplantation pulmonaire, respectivement à cause de l’insuffisance respiratoire et de l’insuffisance médullaire. Il est émis l’hypothèse que l’allègement de la thérapie immunosuppressive pourrait améliorer le devenir des patients mutés transplantés, sans majorer le risque de rejet, illustrant le concept d’immunosénescence. Mais cette hypothèse reste à être validée. Ce cas clinique souligne l’importance de reconnaître les signes évocateurs de téloméropathie, dans la mesure où le diagnostic impacte la prise en charge de la fibrose pulmonaire
ISSN: 0761-8425

hal-01334065
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01334065
DOI : 10.1016/j.rmr.2016.04.018

Éditeur(s) : GFP : Groupe Français des Pesticides
Extrait de : "Protection des cultures et santé environnementale : héritages et conceptions nouvelles" : congrès, le 26 mai 2014. Université des Antilles et de la Guyane
Description : L'objectif du projet est d'évaluer la réduction des transferts de pesticides d'une bananeraie en se basant sur la complémentarité de 2 types d'action : réduction des traitements par adaptation des pratiques culturales, et réduction des transferts par l'implantation d'aménagement au sein du bassin versant intra et extra parcellaires. Le projet s'articule en 3 phases : une année témoin (2012-2013, sans modification notable des pratiques), une année de transition (2013-2014, choix et implantation des aménagements) et une année d'évaluation des impacts des 2 types d'action (2014-2015).
Siècle(s) traité(s) : 21
Droits : CC-BY-NC-ND - Attribution - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification
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V14254

Éditeur(s) : Université de Bretagne Occidentale
Résumé : This activity report entitled (“Chemical contamination of the marine environment: from measurement to risk assessment”) summarizes the main stages my career at Ifremer from November 1975 to june 2013. The first chapter deals with the seawater chlorination and chlorinated waters released into the sea, the identification and the conditions of the formation of various by-product of these processes. The second chapter concerns PCBs, their nature, their chemical analysis in environmental matrices. PCBs are considered as the best examples of persistant and bioaccumulable compounds and therefore, in all this report they are flagship contaminants to which other groups of studied substances are compared. The third chapter refers to studies performed within marine pollution monitoring programme RNO (Réseau National d’Observation de la qualité de l’environnement marin - National observation network on the quality of the marine environnment) and well as other more limited studies like a first assessement on the presence of dioxins and dioxin-like PCBs in the French coastal marine environment and last, on the use of zebra mussel (Dresseinia polymorpha) as sentinelle species of the chemical contamination in the Seine estuary. The next two chapters are about bioaccumulation and about the distribution of organic contaminants (PCBs, dioxins, PAHs, PBDEs) in marine organisms and in marine foodwebs. These studies aim at a better knowledge of the presence and fate of these compounds in fish and marine organisms eitheir in an environmental perspective (chapter IV) or in order to contribute to the assessment of their health impact, or more precisely to estimate therelative part of fish and seafood to the human exposure to chemical residues (chapter V). To conclude, the chapter VI concerns the PCB and dioxin fingerprints in the various studied marine matrices ; analytical and environmental interpretations of the observed differences are suggested as well as possible applications.
Ce bilan d’activité intitulé « Contamination chimique du milieu marin : de la mesure à l’évaluation des risques » retrace les étapes essentielles de mon parcours à Ifremer entre novembre 1975 et juin 2013. Le premier chapitre traite de la chloration dans l’eau de mer et les rejets chlorés en mer, l’identification des sous-produits formés lors de ces traitements, les conditions de leur formation. Le second chapitre concerne la nature des PCB et leur analyse dans les matrices environnementales. Les PCB considérés comme les meilleurs exemples de composés persistants bioaccumulables constituent les « contaminants phares » de l’ensemble de ce travail et c’est par rapport aux PCB que sont comparés et évalués les autres groupes de contaminants étudiés. Le troisième chapitre se rapporte aux travaux réalisés dans le cadre de la surveillance RNO (Réseau National d’Observation de la qualité de l’environnement marin) ainsi que dans des études ponctuelles comme un premier inventaire sur les niveaux de présence des dioxines (PCDD et PCDF) dans l’environnement marin littoral ou sur l’utilisation de la moule zébrée (Dresseinia polymorpha) comme espèce indicatrice de la contamination de l’estuaire de la Seine. Les deux chapitres suivants sont consacrés aux travaux sur la bioaccumulation et aux contaminants organiques (PCB, dioxines, HAP, PBDE) dans les organismes et les réseaux trophiques marins soit dans une perspective environnementale sur le devenir des contaminants dans le vivant (chapitre IV) soit dans le cadre de l’évaluation des risques sanitaires ou, plus précisément, de l’estimation de la contribution de la consommation des produits de la mer à l’exposition de l’homme aux résidus chimiques (chapitre V). Pour terminer, le chapitre VI concerne les empreintes de PCB et de dioxines dans les différentes matrices étudiées ; une interprétation analytique et environnementale des différences observées est proposée ainsi que de possibles applications.

Droits : 2013 UBO
http://archimer.ifremer.fr/doc/00168/27946/26237.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00168/27946/

Résumé : Depuis 2001, le Service de la Pêche (SPE) a initié un projet de recherche sur la domestication de deux espèces de poissons lagonaires « Mo’i » (Polydactylus sexfilis) et le « Paraha peue », (Platax orbicularis) en collaboration avec l’Ifremer du Centre de Tahiti. La collaboration a pour objectif essentiel de maîtriser le cycle de reproduction complet et la zootechnie des deux espèces. Toutefois, ces élevages ont été rapidement confrontés à des épisodes de mortalités. Pour répondre à ces problèmes récurrents et en fonction des différentes hypothèses émises lors des mortalités, plusieurs techniques d’analyse complémentaires ont été développées (état frais, histologie, bactériologie, biologie moléculaire). Des traitements spécifiques ont été proposés aussi bien au niveau thérapeutique que préventif en soutien à la filière aquacole. Ce rapport de convention comporte cinq parties. La première partie décrit les différentes techniques d’analyse mises en oeuvre pour détecter les principaux organismes pathogènes rencontrés chez les poissons en élevage au COP. Selon les hypothèses infectieuses émises lors des épisodes de mortalités, différentes techniques sont utilisées : état frais, histologie, bactériologie et biologie moléculaire. Dans la deuxième partie, nous détaillons les principaux agents pathogènes rencontrés lors des expertises durant cette convention. Une description précise de chaque bioagresseur est établie, accompagnée des différentes méthodes d’identification et de diagnostic. Des traitements spécifiques sont proposés aussi bien au niveau thérapeutique que préventif. La troisième partie, une description des techniques d’écloserie et d’élevage réalisées au COP est présentée avec un point particulier sur les mesures prophylactiques développées et améliorées. Ces éléments constituent un soutien technique pour la filière aquacole polynésienne. Une partie est consacrée aux différentes collaborations mise en place dans le domaine de la santé aquacole. Elles ont pour objectif l’acquisition de connaissances au niveau du diagnostic, du traitement et de la prévention des pathologies rencontrées en milieu aquacole. La mise en place de ce réseau international d’experts sera un soutien pour un diagnostic précis et rapide des nouvelles pathologies survenants dans les élevages aquacoles polynésiens. La dernière partie de ce rapport retrace l’expertise effectuée par le laboratoire de référence de l’OIE sur les élevages de crevettes (Litopenaeus stylirostris). Cette analyse permet d’évaluer l’état sanitaire actuel des élevages locaux. Il déterminera les mesures de bioscurisation à mettre en oeuvre pour protéger la filière crevetticole.

Droits : 2008 Ifremer, Service de la pêche
http://archimer.ifremer.fr/doc/00128/23884/21817.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00128/23884/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Correspondance : Dupraz@supagro.inra.fr
En conduite agroforestière, durant leurs premières années de croissance les arbres sont protégés par des abris individuels plastiques ventilés (disponibilité du C02, limitation de l'augmentation de temperature). Les arbres conduits en abri ont une croissance en biomasse totale comparable à celle des arbres sans abris (Dupraz, 1997b), mais présentent une croissance en hauteur plus importante,une croissance en diamètre inferieure (Bergez and Dupraz, 2000) et une biomasse racinaire plus faible de 17% (Dupraz, 1997a). Des études (Bergez and Dupraz, 2000 ; Dupraz and Bergez, 1999) ont conduit à éliminer la responsabilité des facteurs microclimatiques pour expliquer ces diffférences. Il restait un facteur explicatif : I'absence de sollicitation mécanique des arbres dans les abris. En effet, les sollicitations mécaniques telles que le vent induisent des mouvements des axes de plantes. Il a été démontré que les plantes ne perçoivent pas les forces auxquelles elles sont soumises mais leur état de déformation (Coutand and Moulia, 2000). Celle mécano-perception engendre des modifications de la croissance en dimension (Larson, 1954; Coutand et al., 2000) et de l'allocation de la biomasse des vegetaux (Niklas, 1998). Cette expérimentation avait donc pour but de voir si des arbres en abri soumis à des sollicitations mécaniques artificielles retrouvaient une croissance en dimensions et une répartition de la biomasse semblables à celle des arbres de plein vent. L'expérimentation a été conduite sur des merisiers d'un an et comportait 4 traitements : Abri, Abri+flexion artificielles, Sans Abri+vent, Sans abri+tuteurage. Les résultats ne montrent aucune différence de biomasse totale produite entre les 4 traitements. Par contre, les sollicitations mécaniques (naturelles ou artificielles) réduisent la croissance en hauteur (d'environ 60%), stimulent la croissance radiale d'environ 30% et induisent une allocation de la biomasse en faveur des racines. L'absence de sollicitations mécaniques est donc le facteur responsable des différences entre arbres en abri et arbres au vent.Quantitativement, les flexions artificielles n'étaient pas équivalentes à celles induites par le vent et n'ont pas mimé complètement les effets du vent. Reproduire les effets mécaniques du vent dans l'abri nécessite de parvenir à quantifier les variations d'état mécanique induites par le vent sur les axes des arbres. Ceci suppose donc d'abord de comprendre le couplage fluide-structure. Ce type de travail a été initié sur un couvet de luzerne, il explique les couplages vent-mouvements des tiges à la surface du couvert (Py, 2005). Ce type de travail pourrait servir de base à la prolongation de ce travail.
L'arbre isolé
Montpellier, France

hal-01032058
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Éditeur(s) : HAL CCSD Montpellier : CIRAD
Résumé :  
Le projet STREK (Développement des techniques sylvicoles pour la régénération des forêts humides exploitées de l'Est-Kalimantan) avait pour objectif de proposer des règles de gestion en vue d'une productivité durable des forêts de cette région, principaux pourvoyeurs de l'industrie du bois en Indonésie. Le projet s'est déroulé de 1989 à 1996. Dans la concession de PT INHUTANI I à Berau, deux sites d'étude, de 1 000 ha chacun, ont été choisis. Sur le premier site, exploité en 1978-1979, six parcelles de 4 ha chacune ont été installées pour appliquer des traitements sylvicoles avec deux parcelles-témoins. Sur le second site, localisé en forêt primaire jusqu'en 1991, 12 parcelles de 4 ha chacune ont été matérialisées. On a choisi trois parcelles-témoins et mis en oeuvre trois traitements d'exploitation avec trois répétitions : deux techniques d'exploitation à faible impact (EFI) avec deux limites de diamètre (> 50 et > 60 cm) et la dernière appelée "conventionnelle". Tous les arbres de diamètre ≥ 10 cm ont été mesurés, numérotés et cartographiés à l'échelle de 1:200. Une base de données portant sur 40 000 arbres a été créée où la botanique, la typologie et la pédologie sont présentes. La création de cette base de données est la première étape avant de pousser plus loin l'étude de la croissance et de la productivité des arbres.
ISSN: 0006-579X

hal-01032164
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032164

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Food-grade dairy propionibacteria release beneficial short chain fatty acids (SCFAs), folic acid and cobalamin. They induce apoptosis via the mitochondrial death pathway. We investigated their synergy with drugs used in gastric and colorectal cancer.Fermented milk containing propionibacteria and SCFAS acetate and propionate, as well as its cell-free supernatant, induced apoptosis in gastric HGT-1 and colic HT-29. Characterization of cells revealed apoptosis induction evidenced by chromatin condensation, DNA laddering, emergence of a subG1 population, phosphatidylserine exposure at the plasma membrane outer leaflet and cytochrome c release. Interestingly, the fermented milk was shown to potentiate the cytotoxic effect of molecules used in cancer chemotherapy, camptothecin and TRAIL (TNF Related Apoptosis Inducing Ligand).These results open new perspectives in the field of colon cancer cells prevention and/or treatment. Such a fermented product, or the propionibacterium alone, may be proposed as a food supplement to enhance the effects of anticancer treatments.
Les bactéries propioniques laitières produisent des acides gras volatils (AGV), acide folique et cobalamine, composés bénéfiques. Elles induisent l’apoptose via la voie mitochondriale. Nous avons recherché leur synergie avec des drogues utilisées dans le cancer gastrique ou colique.Un lait fermenté contenant des bactéries propioniques et les AGVs propionate et acétate a induit l’apoptose de cellules gastriques HGT-1 et coliques HT-29. L’étude des cellules a révélé l’induction de l’apoptose : condensation de la chromatine, fragmentation de l’ADN, l’émergence d’une population subG1, l’externalisation des phosphatidylserines et le relargage du cytochrome c. De manière intéressante, le lait fermenté a potentialisé les effets cytotoxiques de molécules utilisées en chimiothérapie, camptothécine et TRAIL (TNF Related Apoptosis Inducing Ligand).Ces résultats ouvrent de nouvelles perspectives dans le domaine du traitement ou de la prévention des cancers digestifs. Un tel produit fermenté, ou les propionibactéries seules, pourrait être proposé comme supplément alimentaire pour augmenter l’efficacité de traitements anti-cancéreux.
5. Colloque Intenational Molécules & Ingrédients Santé
Quimper, France

hal-01204307
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01204307
PRODINRA : 261444

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Session "Atelier IHMA"
National audience
Nous présentons une méthode pour la simulation des capacités d'évaluation de la dissemblance de stratégies de construction de dessins. Cette méthode exploite un descripteur structurel des procédures, l'OPSRL, ainsi qu'une mesure de dissemblance que nous présentons. La polyvalence des types de traitements qui peuvent être mis en oeuvre grâce à cette méthode est illustrée sur des jeux de tracés de formes géométriques qui ont été acquis en ligne au moyen de tablettes à digitaliser.
Actes de la conférence RFIA 2012
Lyon, France

Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess
hal-00660983
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00660983/file/IHMA_06_-_Ney_-_Remi.pdf

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Diffusion du document : INRA Documentation de Centre, Domaine de Duclos, 97170 Petitt-Bourg (Guadeloupe, France) Diplôme : DEA
il s'agit d'un type de produit dont les métadonnées ne correspondent pas aux métadonnées attendues dans les autres types de produit : DISSERTATION
Because soil respiration representes 80% of ecosystem respiration, it is a major flux between biosphere and atmosphere. We examined the effects of root and litter exclusion on soil CO! efflux (Rsu1) using trenching and litter exclusion in a tropical plantation constituted of trees seedlings installed in 16 mono-specific stands 20 years ago near Kourou, French Guyana. Soil CO2 efflux was measured using an infra red gas analyser (PP System,EGM4 ) at 16 randomly distributed plot in each treatment: control, root exclusion, litter exclusion and both root and litter exclusion. in the plantation. We measured R'1l1during four periods, and we have collected soil samples, litter biomass and measured moisture at 5 cm depth in the soil. Soil CO, efflux varied significantly among species from 2,8±O,7f1mo l. m''. s' (mean ± standard deviation) to 7.4± 1.7fLmol. n'-' . s ' for Qualea rosea and Vochys ia tomentosa, respectively. 1'0 significant correlation was found between RSIlI variability and soil moisture, which is mostly related to soil texture in the experimental site. Soil CO2 efflux was significantly reduced in litter exclusion treatment and root exclusion plots (6 months litter and/or root exclusion) during ail measurements period and for ail species, compared to control plots. The reduction of soil CO, efflux was higher in plot without root than in plot without litter of control plot (42% and 25%, respectively). There was an import ant specific diversity in these reductions . We estimated the contribution of roof respiration (Rr) to total Rso1 by calculating the difference between Rso1 control and Rsn l root exclusion plot corrected for the decomposition of root that were killed following t re n e h in ~. Thus the heterotrophic component of soil carbon efflux accounts for 46% of total carbon efflux (1,9f1 mol. rn" . s•') while root respiration accounts for 54% of soil carbon release (2,3 ~t mo l. m-2 S-I) . Because there was a negative and significant correlation between microbial respiration (Rrn) and C/N of mature leaves it seemed to be possible to predict Rm if we known the mature leaves quality. In addition a good estimate theorical R ~, values from R~, measured in different treatments.
La respiration du sol en représentant une part de 80% de la respiration de l'écosystème apparaît être un flux majeur entre la biosphère et l'atmosphère. Nous avons étudié les effets de l'exclusion racinaire et de la litière sur le flux de CO, du sol (R ~ , ) en utilisant la méthode de " Trench-plots" et de suppression de litière dans une plantation d'arbres tropicaux. Ces arbres, âgés de 20 ans ont été plantés sur un sol uniforme, près de Kourou en Guyane française, en 16 placeaux mono-spécifiques. Pour mesurer les flux de CO2 provenant du sol, nous avons utilisé un analyseur différentiel de gaz infrarouge portable muni d'une chambre. Les mesures ont été faites sur 4 traitements différents tels que : le contrôle, l'exclusion racinaire, l'exclusion de litière et l'exclusion de litière et de racine et ce, répétés sur chacune des 16 placettes mono-spécifiques. Cette étude comporte 4 campagnes de mesures. Nous avons également effectué des prélèvements de sol de litière et nous avons fait des mesures d’humidité de sol à une profondeur de 5 cm. Les flux de C01 du sol varient fortement entre espèces de 2.8±O.7 ~t m o 1. m-2. sol à 7 A± 1. 7 ~t m o l. m•1 sol pour Qua/ev rosea ct Vochysto tomentasa, respectivement. Il n'existe pas de corrélation significative entre les variations de Rw l ct celles de l'humidité du sol (indication sur la texture du sol de la plantation ). Nous avons observé que Rso1 était significativement plus faible dans les placeaux sans racines et/ou sans litière (6 mois après la mise en place de l'expérimentation) pour toutes les campagnes de mesures et pour toutes les espèces que dans les placeaux contrôlés. Cette réduction du flux de CO2 du sol est plus forte dans les "trench-plots " que dans les traitement s d'exclusion de litière avec 42 et 25% respectivement. Un effet "traitement " et un effet "espèce" important expliquent 3 1"/.. ct 13% de la variabilité totale de R~. Nous avons cherché à connaître la contribution des racines dans les valeurs de R""I. en comparant le flux de CO2 provenant du sol sur des "trench -plot s'' au flux de COl provenant du sol dans les placeaux contrôlés . Cette estimation a été corrigée pour prendre en compte la décomposition des racines tuées par les tranchées. Ainsi, la composante appartenant aux micro -organismes représente 46% du flux total de carbone provenant du sol (1.9Jlmo l. m-2 S•I ) alors que la respiration des racines représente 54% du dégagement de carbone (2 ,3~lmol. m ol . 5-La respiration des micro-organismes pourrait être estimée en mesurant le C/N des feuilles matures puisqu'il existe une corrélation significative et négative entre les deux. Enfin les résultats obtenus sur les différents traitements permettent d'obtenir une bonne estimation de la respiration du sol avec un RSIlI théorique corrélé à 66% avec les valeurs réelles mesurées.
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189239

hal-01189239
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01189239
PRODINRA : 18212

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : National audience
Il existe différents facteurs déclenchant des exacerbations aiguës de BPCO (EA BPCO), principalement les infections, virales et bactériennes, mais sont également incriminés la pollution, l’arrêt des traitements de fond ou un terrain génétique spécifique...
Revue Des Maladies Respiratoires

Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess
hal-01560278
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DOI : 10.1016/j.rmr.2017.03.005

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Given the technological development of embedded satellite sensors, the potential of available satellite images increases so that the question now arises of their most efficient exploitation possible. This is the purpose of the CARTAM-SAT project to fluidize the processing workflow from satellite images to users. The thesis is part of this framework.Processing operations relating to images have evolved over the years. Low-resolution images were processed by a so-called pixel approach while the high-resolution has allowed the development of a so-called object approach. The latter focuses on analysing not about the isolated pixels, but about groups of pixels representative of concrete objects on the ground. Thus, in principle, these are groups of pixels with a domain-specific remote sensing semantics.Along with satellite imagery, knowledge representation has evolved. The standards of representation have benefited from the expansion of the web to give rise to standards like OWL. This one is widely based on description logics that allow the use of automated reasoners able to infer implicit knowledge.This thesis is at the junction of these two sciences and provides an ontological approach for analysing satellite images. The aim is to formalize different types of knowledges and conceptualizations implicitly used by image processing programs and by remote sensing experts, and then reasoning automatically on an image description to obtain one semantic interpretation.This general principle may have numerous technical variations. The implementation consisted in a prototype combining a satellite image analysis library and an ontology-based reasoner. The implementation proposed in the thesis allows to explore four technical variations of the principle that lead to discussions on the complementarity of pixel and object analysis paradigms, the representation of some of the spatial relations and the role of knowledge in relation to processing.
Étant donnée l'évolution technologique des capteurs embarqués à bord des satellites, le potentiel d'images satellitaires accessible s'accroît de telle manière que se pose maintenant la question de son exploitation la plus efficace possible. C'est l'objectif du projet CARTAM-SAT que de fluidifier la chaîne de traitement depuis les satellites jusqu'aux utilisateurs des images. La thèse s'inscrit dans ce cadre. Les traitements relatifs aux images ont évolué au cours des années. Les images basse résolution étaient traitées par une approche dite pixel alors que la haute résolution a permis le développement d'une approche dite objet. Cette dernière s'attache à analyser non plus des pixels isolés, mais des groupes de pixels représentatifs d'objets concrets sur le terrain. Ainsi, en principe, ces groupes de pixels sont dotés d'une sémantique propre au domaine de la télédétection. La représentation des connaissances a évolué parallèlement aux images satellitaires. Les standards de représentation ont profité de l'expansion du web pour donner naissance à des standards comme OWL. Celui-ci repose en grande partie sur les logiques de description qui permettent l'utilisation de raisonneurs automatiques capables d'inférer une connaissance implicite.Cette thèse se place à la jonction de ces deux sciences et propose une approche ontologique d'analyse des images satellitaires. Il s'agit de formaliser différents types de connaissances et de conceptualisations implicitement utilisés par les logiciels de traitement d'image et par les experts en télédétection, puis de raisonner automatiquement sur la description d'une image pour en obtenir une interprétation sémantique.Ce principe général est susceptible de nombreuses déclinaisons techniques. La mise en œuvre a consisté en la réalisation d'un prototype alliant une bibliothèque d'analyse d'images satellitaires et un raisonneur basé sur les ontologies. L'implémentation proposée dans la thèse permet d'explorer quatre déclinaisons techniques du principe qui mènent à des discussions sur la complémentarité des paradigmes d'analyse pixel et objet, la représentation de certaines relations spatiales et la place de la connaissance par rapport aux traitements.
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NNT : 2013MON20059
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Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Séminaire de Synthèse du Projet FPPSM "Forêts, Parcs, Pauvreté au Sud de Madagascar"
A Madagascar, la déforestation mobilise toutes les recherches, mais il manque encore une base de données complète, référencée et réactualisable sur les dynamiques forestières. Une solution est la valorisation d'images satellitaires multidates qui, de ce fait, sont issues de capteurs différents en termes de résolution spatiale, radiométrique et temporelle (Spot, Landsat, Modis). Ces données géolocalisées sont volumineuses, elles doivent être normalisées puis stockées et finalement traitées. Face à l'hétérogénéité des données et traitements, l'interopérabilité des ressources est assurée par le standard ISO (International Standard Organisation) et la spécification OGC (Open Geospatial Consortium). Le traitement de séries chronologiques de la couverture forestière exige un outil réutilisable qui s'adapte à de nouvelles données satellitaires : des chaînes de traitement pour les données simples, des workflows pour les gros volumes de données. La modélisation du workflow est illustrée par la construction de sa base de connaissance en utilisant un contexte de travail.
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01370017

hal-01370017
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01370017
IRD : fdi:010066424

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Viral haemorragic fevers are characterized by similar clinical manifestations, with a biphasic course : After a 2-21 day-incubation, onset of an influenza-like illness, that will drive to an haemorragic syndrom with shock, in a subgroup of patients, unpredictable. Human-to-human transmission mostly occurs through contact with biological fluids, especially if contaminated with blood. The biology, the epidemiology and the letality of these viruses differ. For all these viral haemorragic fevers, the importance of an early diagnosis relies mostly in the need to interrupt human-to-human transmission, as therapeutic options are mostly restricted to symptomatic treatment, with the exception of Lassa fever (ribavirin probably effective).
Les fièvres hémorragiques virales regroupent plusieurs viroses, potentiellement graves, avec un tableau clinique relativement stéréotypé, d’évolution biphasique. Après une incubation de 2 à 21 jours, apparition d’un syndrome pseudo-grippal qui évolue au bout de quelques jours, de manière imprévisible, chez une proportion variable de patients, vers un syndrome hémorragique avec choc. La transmission interhumaine s’effectue le plus souvent par contacts avec des liquides biologiques, surtout en présence de sang. La biologie de ces virus, leur épidémiologie et leur létalité sont très variables. Pour toutes ces fièvres hémorragiques virales, l’importance d’un diagnostic rapide réside plus dans la nécessité d’interrompre les chaînes de transmission que dans les possibilités thérapeutiques, limitées aux traitements symptomatiques, à l’exception notable de la fièvre de Lassa (efficacité probable de la ribavirine).
ISSN: 1773-035X

hal-01299296
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01299296
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01299296/document
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01299296/file/Fi%C3%A8vres%20h%C3%A9morragiques%20virales_accepted.pdf
DOI : 10.1016/S1773-035X(16)30091-0

Résumé : Le but de ce programme pathologie est de rechercher et d'étudier les agents pathogènes connus et inconnus chez les mollusques bivalves marins, plus particulièrement chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, afin d'identifier d'éventuels agents causant des mortalités, de proposer des mesures prophylactiques et de définir des conditions zootechniques permettant aux professionnels de limiter l'impact des maladies sur leur cheptel. La présence de maladies, chez les mollusques bivalves marins dont l'impact socio économique peut être catastrophique pour les productions conchylicoles, et l'accroissement des échanges de produits d'aquaculture entre les pays de la CEE et avec les pays tiers nécessitent le renforcement des recherches dans les domaines de la pathologie. En particulier, du fait du mono élevage de l'huître japonaise, Crassostrea gigas, en France, il semble aujourd'hui indispensable d'effectuer des contrôles zoosanitaires réguliers chez cette espèce. Ces travaux ont d'autant plus d'importance qu'aujourd'hui, devant les pathologies rencontrées, les professionnels restent extrêmement démunis (traitements inapplicables ou inexistants). Dans ce cadre, la promptitude du diagnostic ainsi que l'acquisition de données épidémiologiques et biologiques concernant les agents pathogènes impliqués sont les meilleurs moyens d'éviter leur dissémination chez les mollusques bivalves marins. Les travaux entrepris dans ce cadre par l'URPIG, semblent d'autant plus indispensables qu'il n'existait pas jusqu'à ces dernières années de pathologies identifiées chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, sur le littoral français. Cependant depuis 1991, sont apparus dans certaines écloseries françaises des épisodes de mortalité sur des larves de cette espèce. Il a été possible de détecter un virus apparenté à la famille des Herpesviridae par ses caractères morphologiques (NICOLAS et al., 1992) et de démontrer sa pathogénicité pour les larves (LE DEUFF et al., 1994). Par ailleurs, en 1993, 1994 et 1995, un virus de même type, a été observé en association à de fortes mortalités sur différents lots de naissain de la même espèce, originaires d'écloseries et de captage naturel. Par ailleurs, en 1993, suite à l'observation d'anomalies au niveau des branchies chez des huîtres creuses provenant de Charente Maritime et du bassin d'Arcachon associées à de médiocres performances de croissance, il a été entrepris des analyses de divers échantillons, en histologie classique et en microscopie électronique à transmission. Ces examens ont permis de révéler la présence au niveau des branchies, chez un nombre non négligeable d'animaux, d'un microorganisme de type chlamydien (RENAULT and COCHENNEC, 1995). Il a également été possible, chez cette même espèce, de détecter la présence d'un organisme de type rickettsien au niveau des branchies (RENAULT, COCHENNEC and CHOLLET, 1995).

Droits : 1995 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15453/12828.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15453/

Éditeur(s) : HAL CCSD Editions Paralia CFL
Résumé : Le lido de Villeneuve-lès-Maguelone (Languedoc-Roussillon) est un archétype de littoral microtidal, dominé par la houle, en érosion, et largement affecté par la submersion marine lors des tempêtes. Les observations réalisées dans le cadre du Système d'Observation Littoral - Trait de Côte (SO LTC) concernent l'hydrodynamique et le transport sédimentaire dans l'avant-côte et la lagune. La tache d'observation MAGOBS (Observatoire Aresquiers-Maguelone-Palavas) de cet observatoire regroupe un dispositif instrumental automatisé composé de 30 points d'acquisition en temps réel entre 6 mètres de profondeur et le haut de plage (à terre) ainsi que dans la lagune. Le dispositif est opérationnel depuis mai 2011. Son déploiement a permis de déverrouiller les difficultés techniques liées à la mesure temps réel en zone littorale : choix du type des appareils de mesure, de la technologie embarquée, des cadences d'acquisition, résolution des questions du transfert de la donnée. Le dispositif produit 2 Tera-octets de données par an. Les données sont stockées sur un ensemble de serveurs dédiés. Les données sont mises en ligne sur le site du SO-LTC (www.soltc.org), immédiatement après premiers traitements et qualification. Elles commencent à être utilisées pour des calculs de niveau d'eau à la côte, et dansdes outils de prédiction des vagues et des niveaux à la côte associant mesure et modélisation.
ISSN: 1760-8716

hal-00854410
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00854410
DOI : 10.5150/jngcgc.2012.064-G

Résumé : Cette thèse traite de la problématique de l'analyse automatique de tracés manuscrits réalisés à mains levée, à caractère géométrique et acquis en ligne. Lorsque l'on analyse un tracé en ligne, on peut le faire selon plusieurs angles. Comme pour les tracés hors ligne, on peu s'atteler à reconnaitre la forme produite. Mais le caractère en ligne de l'acquisition permet également d'autres niveaux d'analyse, comme l'analyse de la procédure utilisée par le dessinateur lors de la production de son dessin. Nous avons dans le cadre de ce travail élaboré des outils permettant de telles analyses de la production de tracé. Dans une première partie nous traitons des pré traitements à effectuer sur le tracé afin de pouvoir procéder aux analyses spatio-graphique et procédurale. Ces pré traitements sont le filtrage, la segmentation mixte à base d'arcs de cercles et de segments de droite, la sélection des points d'intérêt ainsi que l'identification de la nature de ces points. La seconde partie concerne l'analyse visuo-spatiale. Nous abordons alors deux aspects: la question de la reconnaissance des formes et celle de l'évaluation automatique de leur qualité. Notre contribution consiste en une méthode de reconnaissance basée sur l'apparence utilisant des descripteurs locaux. La dernière partie traite de l'analyse procédurale. Nous proposons une méthode d'extraction et de modélisation de la procédure mise en œuvre lors du dessin d'une forme. Nous montrons comment en utilisant cette modélisation, nous pouvons non seulement déterminer la procédure favorite d'un utilisateur mais également reconnaitre un dessinateur par l'analyse de sa procédure.
This thesis handles the problem of the automatic analysis of online hand drawn geometric sketches. An online sketch can be analysed according to several points of view. As for offline sketching, we can try to recognize the produced shape. However, online sketching allows other levels of analysis. For example the analysis of the behavior of the drawer during the production of the sketch. In this thesis, we have tried to develop tools allowing a multi level analysis, including both shape and behavior analysis. The first part of our work deals with the pre treatments that must be performed on the sketch in order to allow upper level analysis. Those pre treatments are filtering, mixed segmentation and feature points detection and labelisation. In the second part, we approach shape analysis in two aspects: shape recognition and evaluation. We have developed a appearance based method which use local descriptors to allows both recognition and evaluation of the quality of a produced shape compared to the model . in the last part we propose a method for drawer's behavior extraction and modeling. Then we show how we can not only determine the favorite procedure of a drawer but also recognize the drawer by analyzing his behavior.

http://www.theses.fr/2010AGUY0394/document

Éditeur(s) : HAL CCSD Saint-Maurice (Val de Marne) : Institut de veille sanitaire
Résumé : National audience
Introduction – Le nombre d’accès palustres diminue globalement en Guyane, alors que les orpailleurs travaillantsur les sites illégaux semblent particulièrement touchés par cette pathologie. Les objectifs de cette étudeétaient de déterminer la prévalence du paludisme dans cette population, les comportements associés ainsi quele niveau de résistance des parasites vis-à-vis des dérivés de l’artémisinine.Matériel et méthodes – Les inclusions ont eu lieu sur les sites de repli fréquentés par les orpailleurs le long dufleuve Maroni. Ont été effectués : un test de diagnostic rapide du paludisme, un questionnaire, un prélèvementsanguin pour PCR et un génotypage du gène pfK13 pour les PCR positives à Plasmodium falciparum.Résultats – De janvier à juin 2015, 421 orpailleurs ont été inclus, majoritairement des hommes (70,6%) brésiliens(93,8%). La prévalence du portage de plasmodies déterminée par PCR était en moyenne de 22,3%(IC95%: [18,3-26,3]), à 84% asymptomatiques. Les espèces identifiées étaient principalement P. falciparum(47,9%) puis P. vivax (37,2%), plus 10,6% de co-infections. Lors du dernier accès palustre, 52,4% des orpailleursavaient eu recours à l’automédication, majoritairement avec des dérivés de l’artémisinine (93,8%) avecune mauvaise observance (37,8%). L’analyse du gène pfK13 n’a pas mis en évidence de mutations associéesà la résistance à P. falciparumDiscussion – La prévalence élevée de porteurs asymptomatiques de plasmodies constitue un réservoir importantde transmission dans la région. L’utilisation massive de dérivés de l’artémisinine associée à une mauvaise observancedes traitements sont des facteurs de risque d’émergence de résistance imposant des mesures rapides
ISSN: 0245-7466

inserm-01491193
http://www.hal.inserm.fr/inserm-01491193
http://www.hal.inserm.fr/inserm-01491193/document
http://www.hal.inserm.fr/inserm-01491193/file/2017%2C%20Douine%20-%20Paludisme%20et%20orpaillage%20ill%C3%A9gal%20en%20Guyane.pdf

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier Masson
Résumé : International audience
Alveolar proteinosis (AP) is a rare disease characterized by alveolar accumulation of surfactant components, which impairs gas exchange. AP is classified into three groups: auto-immune AP defined by the presence of plasma autoantibodies anti-GM-CSF, the most frequent form (90 % of all AP); secondary AP, mainly occurring as a consequence of haematological diseases, or following on from toxic inhalation or infections, and genetic AP, which affects almost exclusively children. AP diagnosis is suspected where chest CT-scan demonstrates interstitial lung disease with a crazy paving aspect; and confirmed by bronchoalveolar lavage, which has a milky appearance and contains periodic acid Schiff positive proteinaceous alveolar deposits. The use of surgical lung biopsy to confirm AP is less frequent nowadays. In this context, positive antibodies against GM-CSF indicates an auto-immune etiology of the AP. Concerning management, whole lung lavage is the gold standard therapy. In refractory AP, new treatments are available such as subcutaneous or inhaled GM-CSF supplementation, or rituximab infusions. The clinical course is unpredictable. Spontaneous improvement or even cure can occur, and the 5-year actuarial survival is 95 %. The most frequent complications are infectious etiology.
La protéinose alvéolaire pulmonaire (PAP) est une maladie rare caractérisée par l’accumulation alvéolaire de composants du surfactant qui gêne les échanges gazeux. Les PAP sont séparées en trois groupes : les PAP auto-immunes caractérisées par la présence d’anticorps sériques anti-GM-CSF qui sont les plus fréquentes ; les PAP secondaires à une maladie sous-jacente, le plus souvent hématologique, mais aussi à l’inhalation de toxiques et à des infections ; enfin, les PAP d’origine génétique. Le diagnostic de PAP est évoqué sur le scanner thoracique avec une pneumopathie infiltrante diffuse ayant un aspect classique de crazy paving, puis confirmé par l’aspect laiteux du lavage bronchoalvéolaire, et la présence de matériel lipoprotéinacé PAS positif. La confirmation du diagnostic de PAP par biopsie pulmonaire chirurgicale est désormais rarement nécessaire. La positivité des anticorps sériques anti-GM-CSF signe le caractère auto-immun de la maladie. Le traitement de référence des PAP auto-immunes est le « grand lavage pulmonaire thérapeutique ». En cas de maladie réfractaire, d’autres traitements sont disponibles, tels que le GM-CSF en injection sous-cutanée ou en aérosol et le rituximab. L’évolution de la maladie est imprévisible. Une évolution spontanément favorable ou même une guérison spontanée peuvent survenir et la survie actuarielle à 5 ans est de 95 %. Les principales complications sont infectieuses.
ISSN: 0761-8425

hal-01085907
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01085907
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01085907/document
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01085907/file/Prot%C3%A9inose%20alv%C3%A9olaire%20pulmonaire_accepted.pdf
DOI : 10.1016/j.rmr.2014.08.009