Éditeur(s) : Université de La Rochelle
Résumé : Shrimp aquaculture in New Caledonia is a developing industry, exclusively based on the species Litopenaeus stylirostris. However, it is subject to mortalities during grow out as observed all over the world. Since 1993, shrimp reared during the cold period are affected by a disease named "syndrome 93". As a consequence, the whole industry has become seasonal and produces essentially during the warm season. The climatic conditions during the periods of transition between the two main seasons could be responsible for an environmental stress and the origin reason for mortality outbreaks. Stocking density is the main risk factor. It increases the probability of the appearance and development of the epizooty in the pond. The "Summer Syndrome", a septicemic vibriosis caused by Vibrio nigripulchritudo, was identified for the first time in December 1997 in an intensive shrimp farm (DF). It has become enzootic ever since and is expressed after 50d of rearing. Since 2003, two others farms located near DF have developed the disease. As a consequence, the summer syndrome is considered to be a potential threat for all the industry. Between 1991 and 2005, the increase of feed input and nitrogen levels in feed has led to a significant increase in the growth rate over the years in the farms affected by the disease. In consequence, an early eutrophication of the water is observed, which is concomitant with the beginning of the mortality outbreaks. An early eutrophication and the virulence level of the pathogen are considered as the main risk factors of the disease. Factors may act synergistically to explain the summer syndrome. As part of a multidisciplinary approach (pathology – physiology – environment), two high-frequency surveys were carried out to analyse the pond ecosystem. Since the feed quantity increases with the biomass of shrimp, the eutrophication level of the pond ecosystem will also tend to increase with the duration of rearing. During the first part of the rearing, the abundance of each picoplankton type is exceptionally high and picophytoplankton dominated the autotrophic compartment. The nanophytoplankton dominated the second part of the rearing and was more unstable. The shift from pico to nanophytoplankton could be considered as an environmental stress and was observed in relation to the beginning of the mortalities, whatever the disease. Shift intensity could play a role by inducing directly or indirectly a stress for shrimp and/or a growth and/or virulence factors of the pathogen. Results from sediment studies show that mortality was best characterized by TAN concentration in pore water and even more when the TAN concentration was high. TAN and pH are potential stress factors for shrimp reared in ponds affected by these diseases.
L'aquaculture mondiale de crevettes est un secteur à très forte croissance. Toutefois, les problèmes liés aux maladies dans les élevages ne cessent d'augmenter depuis 1980. Au cours du développement de la filière de Nouvelle-Calédonie, deux épisodes saisonniers de mortalités associées à la présence de Vibrio pathogènes sont apparus et ont fortement perturbé les techniques et les schémas de production. Les premières mortalités hivernales, décrites sous le nom de « syndrome 93 » ont été observées en mai 1993. Elles ont affecté depuis tous les élevages de saison froide de toutes les fermes de production. Les conditions climatiques pendant les périodes de transitions entre les deux principales saisons caractérisant le climat de la Nouvelle-Calédonie, seraient responsables d'un stress environnemental à l'origine du déclenchement du syndrome 93. La densité initiale d'ensemencement, apparaît comme le principal facteur de risque, augmentant la probabilité d'apparition de la maladie et l'ampleur de ses effets. Le « syndrome d'été » a été identifié pour la première fois en 1997 dans une ferme pratiquant une production intensive. Il s'est déclaré depuis 2003 dans deux autres fermes géographiquement proches. Les mortalités apparaissent 58 jours en moyenne après l'ensemencement des post-larves dans les bassins. La recherche d'une croissance maximale des animaux a induit, avec les années, une intensification progressive du système caractérisée par une augmentation de la quantité d'aliment distribuée. L'examen des données historiques fait apparaître une eutrophisation du milieu de plus en plus précoce concomitante au déclenchement des mortalités. En l'état actuel de nos connaissances, cette évolution précoce de l'écosystème en présence de façon récurrente de la souche hautement pathogène du Vibrio incriminé et à une période où la fréquence des mues des crevettes est élevée, constitue le principal facteur de risque de la maladie. Avec l'apport croissant en aliment, la colonne d'eau évolue vers une autotrophie croissante alors que le sédiment devient de plus en plus hétérotrophe au fur et à mesure que l'élevage progresse. Au cours du processus d'eutrophisation, le compartiment autotrophe montre une succession de deux assemblages. Le picophytoplancton domine sur la première partie de l'élevage et laisse place à du nanophytoplancton en seconde partie. Cette phase de transition, concomitante à l'apparition des mortalités quel que soit le syndrome, caractérise un stress environnemental dont l'intensité pourrait favoriser ou non le déclenchement des mortalités. Les suivis de différents indicateurs dans les sédiments - pH, potentiel d'oxydoréduction et concentration en ammoniaque dans l'eau interstitielle – indiquent dans les bassins déclarant les épizooties des conditions qui ont été définies expérimentalement comme potentiellement plus stressantes pour les animaux.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/these-2643.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2643/

Éditeur(s) : EDP Sciences
Résumé : Bonamiosis is a parasitic disease (causative agent: Bonamia ostreae) affecting the European flat oyster Ostrea edulis, responsible for a drastic decline in its aquaculture production. Selective breeding programs for resistance to bonamiosis have been undertaken to counter this disease. In the present study, a 6-month cohabitation challenge experiment was performed in order to transmit the disease from wild oysters injected with the parasite to two tested families of oysters (20 and 8-month old at the beginning of the experiment, with different genetic backgrounds) originating from a selective breeding program developed by IFREMER in France. Mortalities were checked daily and ventricular heart smears were performed on dying or moribund oysters to detect the level of infection by B. ostreae. Mortality started after 4 months of cohabitation in the tested oysters. The cumulative mortalities after 6 months were 58% for the wild oysters, 9% for Family 1 (20-month old) and 20% for Family 2 (8-month old). In the dying oysters, the parasite could be detected in 67% of the wild oysters, 68% of Family 1 and 89% of Family 2. It was detected in only 11% of the surviving oysters of Family 2. The mortality and the level of infection by the parasite were significantly higher in Family 2 than in Family 1. Our results demonstrate that prespawning oysters as young as 1 year-old can become infected with the parasite and, most importantly, can die from bonamiosis. This result is inconsistent with the commonly accepted critical age of 2 years-old for the disease development. Additionally, no clear relationship between shell length and level of infection was observed. We also review the different methods for infection of the European flat oyster O. edulis with B. ostreae under experimental conditions and their main results.
La bonamiose est une maladie parasitaire (agent causal : Bonamia ostreae) affectant l'huître plate européenne Ostrea edulis, responsable d'un déclin drastique de sa production aquacole. Des programmes de sélection pour la résistance à la bonamiose ont été entrepris pour contrer cette maladie. Dans cette étude, une expérience de 6 mois d'infection par cohabitation a été réalisée de manière à transmettre la maladie à partir d'huîtres sauvages injectées avec le parasite vers deux familles testées d'huîtres (âgées de 20 et 8 mois en début d'expérience, avec des origines génétiques différentes) issues du programme de sélection développé par IFREMER en France. Les mortalités ont été vérifiées quotidiennement et des frottis de coeur ventriculaire réalisés sur les huîtres mortes ou moribondes pour détecter le niveau d'infection par B. ostreae. La mortalité a commencé chez les huîtres testées après 4 mois de cohabitation. Les mortalités cumulées après 6 mois étaient de 58 % chez les huîtres sauvages, 9 % chez la Famille 1 (âgées de 20 mois) et 20 % chez la Famille 2 (âgées de 8 mois). Chez les huîtres mourantes, le parasite a pu être détecté chez 67 % des huîtres sauvages, 68 % de la Famille 1 et 89 % de la Famille 2. Il n'a pu être détecté que chez 11 % des huîtres survivantes de la Famille 2. La mortalité et le niveau d'infection par le parasite étaient significativement plus élevés chez la Famille 2 que chez la Famille 1. Nos résultats démontrent que des huîtres âgées de un an peuvent devenir infectées par le parasite et surtout, peuvent mourir de bonamiose. Ce résultat contraste avec l'âge critique de développement de la maladie communément accepté de 2 ans. De plus, aucune relation claire entre la longueur de la coquille et le niveau d'infection n'a été observée. Nous faisons également la revue des différentes méthodes d'infection de l'huître plate européenne O. edulis avec B. ostreae en conditions expérimentales et leurs principaux résultats.
Aquatic Living Resources (0990-7440) (EDP Sciences), 2008-12 , Vol. 21 , P. 423-439

Droits : EDP Sciences, IFREMER, IRD 2008
http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/publication-4783.pdf
DOI:10.1051/alr:2008053
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4783/

Résumé : The New-Caledonian shrimp industry is based on the controlled reproduction of the shrimp Litopenaeus stylirostris, a species which was introduced in the 80s. The major difficulty to which the industry has been faced for 10 years is the occurrence of the “Syndrome 93”, which corresponds to mortality phases when the temperature falls down in April-May-June. This mortality is associated to the pathogenic bacteria Vibrio penaecida. An experiment of genetic selection based on the criterion ofsurvival to Syndrome 93 has been conducted at the Laboratory of Aquaculture of New Caledonia. The 3rd selected generation had demonstrated very encouraging results (survival rates improved by around 20% in experimental infections with V. penaeicida). These results have not been confirmed at the 4th generation and no difference in terms of physiology and immunology appears between the selected population and the non-selected control population. The potential causes of these results are examined and proposals for protocol improvements are given.
La filière crevette de Nouvelle-Calédonie reposesur la maîtrise de la reproduction contrôlée de la crevette Litopenaeus stylirostris, espèce introduite dans les années 1980. La difficulté majeure que rencontre la filière depuis une dizaine d’années est la récurrence du « Syndrome 93 », qui s’exprime sous forme d’épisodes de mortalités lors des baisses de température aux intersaisons. Ces mortalités sont associées à la bactérie pathogène Vibrio penaeicida Une expérience de sélection sur un critère de survie à des épisodes de Syndrome 93 a été menée au Laboratoire Aquacole de Calédonie. La 3èmegénération sélectionnée avait montré des résultats très encourageants (survies améliorées de l’ordre de 20% lors d’infections expérimentales à V. penaeicida). Ces résultats ne sont pas confirmés en 4ème génération et aucune différence en termes physio-et immunologique n’apparaît entre la population sélectionnée et la population témoin non sélectionnée. Les causes potentielles de ces résultats sont examinées et des propositions d’amélioration de protocoles sont avancées.

Droits : 2004 Université de la Rochelle, Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00204/31527/29943.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00204/31527/

Résumé : Depuis 2001, le Service de la Pêche (SPE) a initié un projet de recherche sur la domestication de deux espèces de poissons lagonaires « Mo’i » (Polydactylus sexfilis) et le « Paraha peue », (Platax orbicularis) en collaboration avec l’Ifremer du Centre de Tahiti. La collaboration a pour objectif essentiel de maîtriser le cycle de reproduction complet et la zootechnie des deux espèces. Toutefois, ces élevages ont été rapidement confrontés à des épisodes de mortalités. Pour répondre à ces problèmes récurrents et en fonction des différentes hypothèses émises lors des mortalités, plusieurs techniques d’analyse complémentaires ont été développées (état frais, histologie, bactériologie, biologie moléculaire). Des traitements spécifiques ont été proposés aussi bien au niveau thérapeutique que préventif en soutien à la filière aquacole. Ce rapport de convention comporte cinq parties. La première partie décrit les différentes techniques d’analyse mises en oeuvre pour détecter les principaux organismes pathogènes rencontrés chez les poissons en élevage au COP. Selon les hypothèses infectieuses émises lors des épisodes de mortalités, différentes techniques sont utilisées : état frais, histologie, bactériologie et biologie moléculaire. Dans la deuxième partie, nous détaillons les principaux agents pathogènes rencontrés lors des expertises durant cette convention. Une description précise de chaque bioagresseur est établie, accompagnée des différentes méthodes d’identification et de diagnostic. Des traitements spécifiques sont proposés aussi bien au niveau thérapeutique que préventif. La troisième partie, une description des techniques d’écloserie et d’élevage réalisées au COP est présentée avec un point particulier sur les mesures prophylactiques développées et améliorées. Ces éléments constituent un soutien technique pour la filière aquacole polynésienne. Une partie est consacrée aux différentes collaborations mise en place dans le domaine de la santé aquacole. Elles ont pour objectif l’acquisition de connaissances au niveau du diagnostic, du traitement et de la prévention des pathologies rencontrées en milieu aquacole. La mise en place de ce réseau international d’experts sera un soutien pour un diagnostic précis et rapide des nouvelles pathologies survenants dans les élevages aquacoles polynésiens. La dernière partie de ce rapport retrace l’expertise effectuée par le laboratoire de référence de l’OIE sur les élevages de crevettes (Litopenaeus stylirostris). Cette analyse permet d’évaluer l’état sanitaire actuel des élevages locaux. Il déterminera les mesures de bioscurisation à mettre en oeuvre pour protéger la filière crevetticole.

Droits : 2008 Ifremer, Service de la pêche
http://archimer.ifremer.fr/doc/00128/23884/21817.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00128/23884/

Résumé : Ce document présente l'état des principaux stocks exploités par les flottes françaises en termes de mortalité par pêche et de biomasse de reproducteurs. La situation fin 2010 (début 2011) par rapport aux points de référence (de précaution et Fmsy) est indiqué lorsque les indicateurs sont estimés et que les références sont définies. Les grandes tendances en matière d'évolution des mortalités et biomasses sont également indiquées.

Droits : 2011 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00035/14656/11956.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00035/14656/

Éditeur(s) : Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques du Languedoc
Résumé : The work reported here was motivated by the economical importance of the pacific blue shrimp Litopenaeus stylirostris farming where high mortality rates are due to bacterial and viral diseases. It consists in the characterisation of two original peptides, the first members of a new multifunctional family of peptides from peneide shrimps, the stylicines. Those two peptides, named stylicines 1 and 2, are negatively charged (pI < 6.0), and characterised by a proline-rich N-terminal region and a C-terminal region containing 13 cysteine residues. Stylicines are synthesized by heamocytes where they are stored within small cytoplasmic granules. To understand the role of these peptides in the immune response of shrimps to a vibrio infection, their recombinant forms were produced in E. coli BL21 (DE3) plysS, purified and characterised. The two rstylicines display biological anti-proliferative and blood clotting activities. Only rstylicine 1 displays antimicrobial activities: antifungal against Fusarium oxysporum (MIC<2.5μM) and bacteriostatic against Gram (−) bacteria, Vibrio sp. (MIC<80μM). Moreover this peptide displays an LPS-binding activity (dissociation constant (Kd) of 9.6×10−8 M) and agglutinate Vibrio. penaeicida "in vitro". Finally, the presence of sequences coding for modified forms of stylicine 1 in some shrimp’s genome may be in relation with their lower ability to survive infections.
Les travaux présentés dans ce mémoire ont été motivés par l’importance économique de l’élevage de la crevette bleue du pacifique Litopenaeus stylirostris dont les fortes mortalités sont principalement dues au développement de maladies bactériennes et virales. Ils ont consisté en la caractérisation des deux premiers membres d’une famille originale de peptides multifonctionnels présents chez les crevettes pénéides, les stylicines. Ces peptides, nommés stylicines 1 et 2, sont des peptides anioniques (pI < 6.0), formés d’une région amino-terminale riche en résidus de type proline et d’une région carboxyterminale riche de treize résidus cystéines. Ces molécules sont synthétisées et stockées dans de petits granules présents dans le cytoplasme des hémocytes. Pour mieux appréhender leurs rôles dans la réponse immunitaire des crevettes à une infection par des Vibrio, leurs formes recombinantes ont été produites dans E. coli BL21 (DE3) plysS, purifiées et caractérisées. Les deux rstylicines présentent des activités antiproliférative et anticoagulante. Seule la rstylicine1 présente des activités antimicrobiennes : antifongique sur Fusarium oxysporum (CMI<2.5 μM), et antibactérienne (bactériostatique) sur Vibrio sp (CMI<80 μM). Ce peptide est également capable de se lier aux LPS des bactéries à Gram (-) (Kd= 9.6x10-8 M) et d’agglutiner V. penaeicida "in vitro". Enfin, l’existence de gènes codant des formes modifiées de la stylicine1, chez certaines crevettes, pourrait être en relation avec une diminution de la résistante des individus aux infections.

Droits : 2010 The Author, Univ Montpellier 2
http://archimer.ifremer.fr/doc/00024/13558/10612.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00024/13558/

Résumé : The New-Caledonian shrimp industry is based on the controlled reproduction of the shrimp Litopenaeus stylirostris, a species which was introduced in the 80s. The major difficulty to which the industry has been faced for 10 years is the occurrence of the "syndrome 93", which corresponds to mortality phases when the temperature falls down in April-May-June. This mortality is associated to the pathogenic bacteria Vibrio penaecida and is expressed at different levels which are variable from year ta year and from pond to pond. No resistance to this pathology has been developed spontaneously. This is likely due to the protocole used to rear spawners, which does not allow to implement an efficient selective pressure at each generation An experimental selection on the criteria of survival after picks of syndrome 93 has been conducted at the Laboratoire Aquacole de Calédonie. The 3rd selected generation demonstrates survival rates improved by 20% during experimental infections with V. penaeicida in comparison with a non selected control population of same genetic origin. The comparison of the correlated responses on the level of expression of 5 genes which are potentially implicated in immunity phenomena (Peneidins, lysozyme, transglutaminase. profiline, annexine) shows that the selected population has a level of expression in lyzozyme twice higher than the control population. This result suggests that the lysozyme could be a genetic marker which could be used in a selective breeding program to he developed in relation with the private hatcheries.
La filière crevette de Nouvelle-Calédonie repose sur la maîtrise de la reproduction contrôlée de la crevette Litopenaeus stylirostris, espèce introduite dans les années 80. La difficulté majeure que rencontre la filière depuis une dizaine d'années est la récurrence du « syndrome 93 », qui correspond à des épisodes de mortalités lors des baisses de température en avril-mai-juin. Ces mortalités sont associées à la bactérie pathogène Vibrio penaeicida et s'expriment à des niveaux d'intensité variable d'une année à l'autre et d'un bassin à l'autre. Aucune résistance vis-à-vis de cette pathologie ne s'est développée spontanément. Ceci est vraisemblablement lié au protocole employé pour l'élevage des géniteurs qui ne permet pas d'exercer une pression de sélection efficace à chaque génération. Une expérience de sélection sur un critère de survie à des épisodes de syndrome 93 a été menée au Laboratoire Aquacole de Calédonie. La 3ème génération sélectionnée montre des survies améliorées de l'ordre de 20% lors d'infections expérimentales à V. penaeicida par rapport à une population témoin non sélectionnée de même origine génétique. La comparaison des réponses corrélées sur le niveau d'expression de 5 gènes potentiellement impliqués dans les phénomènes de défense immunitaire (penaeidine, lysozyme, transglutaminase, profiline, annexine) montre que la population sélectionnée a un niveau d'expression en lysozyme deux fois plus élevé que la population témoin. Ce résultat suggère que le lysozyme pourrait être un marqueur génétique utilisable dans un programme de sélection à développer en relation avec les écloseries de production.

Droits : 2003 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00109/22020/19643.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00109/22020/

Éditeur(s) : ISTPM
Résumé : This paper is a part of a study concerned with shellfish culture in France. Before presenting improvements in technique, the author gives fundamentals of the biology of oyster and mussels taxonomy and anatomy, respiration, feeding, reproduction, growth, predators and diseases.
SOMMAIRE ------------------ L'HUITRE ------------------ INTRODUCTION CHAPITRE I. TAXONOIVIIE ET ANATOMIE DES HUITRES 1. Taxonomie des huîtres vivant dans ie monde Introduction et rappel historique Les genres (Pycnodonta, Crassostrea, Ostrea) Les principales espèces et leur répartition dans le monde 2. Anatomie de l'huître La coquille Le corps BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE II - LE TRANSPORT DE L'EAU ET LA RESPIRATION 1. Le transport de l'eau . Mécanisme Méthodes de mesure du courant de transnort Quantités d'eau transportées 2. La respiration 3. L'anaérobiose . BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE III. ALIMENTATION ET VERDISSEMENT DES COQUILLAGES 1. Alimentation des coquillages Anatomic des « coquillages » et leur alimentation 1. La collecte des particules alimentaires 2. L'appareil digestif: et la digestion Besoins alimentaires 1. Besoins quantitatifs 2. Nature des aliments. Besoins qualitatifs Conclusion générale 2. Le verdissement Le verdissement. Biologie de Navicula ostrearia La navicule des huîtres, agent du verdissement Le verdissement dans les claires L'écologie des claires en rapport avec la définition du verdissement Données récentes sur la genèse du verdisîsement La navicule bleue de l'huître : ultrastructure du frustule, cytologie, développement . . Derniers résultats sur les conditions d'apparition et de maintien du verdissement en cultures in vitro et en claires Conclusion BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE IV. - LA REPRODUCTION Généralités Anatomie des organes de reproduction La sexualité des huîtres La ponte Incubation et émission des larves Fécondité Rythmes sexuels, influence du milieu Les rythmes Périodicité et durée des émissions de gamètes Influence du milieu OEufs et larves Influence de l'environnement sur la vie larvaire Métamorphose et fixation BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE V. LES ENNEMIS DE L'HUITRE ET DE L'OSTREICULTURE Les prédateurs Le ver plat, Stylochus sp Les bigorneaux perceurs Autres gastéropodes prédateurs Les pieuvres Les crustacés Les échinodevmes Les poissons Les oiseaux Les compétiteurs Animaux Végétaux Le chambrage BIBLIOGRAPHIE CHAPITRE VI. - MALADIES ET MORTALITES 1. Maladies parasitaires Parasites divers Grégarines Trématodes Cestodes Copépodes Maladies à caractère endémique ou épidémique Les viroses Les champignons La maladie des branchies Les flagellés ; Hexamita sp Les haplosporidies La maladie de la glande digestive de l'huître plate et son agent, Marteilia refringens La maladie de Malpèque 2. Mortalités d'origines diverses Variations excessives de la température Variations excessives de la salinité Eutrophisation Mortalités du Belon Mortalité massive de la baie de Matsushima BIBLIOGRAPHIE ------------------ LA MOULE ------------------ TaxonoiTiie La coquille Le corps Alimentation. Croissance. Engraissement La filtration Mécanisme . . . . Action de la température, de la salinité et de l'oxygène dissous Durée journalière Vitesse de filtration Les éléments nutritifs La digestion La croissance L'engraissement La reproduction Glande génitale et sexe Evolution de la gonade Description des phénomènes Facteurs influençant l'évolution de la gonade Emission des produits génitaux Description du phénomène Facteurs influençant l'émission des produits génitaux Vie larvaire Développement de la larve, sa métamorphose Taille des larves Comportement des larves Action de différents facteurs sur la vie des larves Fixation Résumé Les ennemis Prédateurs Compétiteurs Parasites Causes diverses de mortalité BIBLIOGRAPHIE
Revue des Travaux de l'Institut des Pêches Maritimes (0035-2276) (ISTPM), 1976-06 , Vol. 40 , N. 2 , P. 149-346

Droits : Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/1976/publication-1796.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1796/

Éditeur(s) : The 11th Pacific Science Inter-Congress : Pacific Countries and their Ocean: Facing Local and Global Changes. March 2 - 6, 2009 Tahiti, French Polynesia
Résumé : New Caledonian shrimp farming feasibility studies started in the mid-seventies. Today ca. 2000 tons of Litopenaeus stylirostris, introduced in 1978, are semi-intensively produced each year. Since fifteen years, production has been impacted by two seasonal vibriosis, the “Summer” syndrome caused by Vibrio nigripulchritudo in relation to pond bottom and water column quality, and the “Winter Syndrome” caused by Vibrio penaeicida in relation to drastic temperature drops . With the ambition of elucidating processes possibly leading to mortality outbreaks in ponds, Ifremer has been conducting a research program since 2003 under the DESANS project (2003-2006) and the present DEDUCTION project, equally funded by the South and North Provinces and by the Government of New Caledonia. This program has been designed in a multidisciplinary approach integrating the suspected multifactorial origin of shrimp mortalities. Environment quality in ponds (either sediment or water column) plays a major role in the shrimp ecophysiological status, influencing sensitivity to pathogens . DEDUCTION focuses on a better knowledge of phytoplankton composition and biogeochemical fluxes at the sediment-water interface in ponds. Impact of farm discharges is also investigated. In addition, a more fundamental work is conducted to understand the pathogenicity mechanisms of these two Vibrio species but also to prevent the occurrence of viral infections through a RNA interference approach. Markers of the ecophysiological status of broodstock, larvae, post-larvae and reared animals, such as enzymes testifying from an oxidative stress, are developed. Gain of performance (resistance to pathogens and growth) were obtained on hybrids of the New Caledonian and introduced Hawaiian strains. Finally the database Stylog is exploited in view of discriminating “good” from “bad” rearings on the basis of relevant indicators.
Les études de faisabilité de l'aquaculture de crevettes ont débuté en Nouvelle-Calédonie dans les années soixante dix. Aujourd'hui environ 2000 tonnes de Litopenaeus stylirostris, introduite en 1978, sont produites chaque année de façon semi-intensive. Depuis quinze ans la production a été impactée par deux vibrioses : le syndrome d'été provoqué par Vibrio nigripulchritudo en relation avec la qualité de la tranche d'eau et des fonds de bassins et le syndrome d'hiver provoqué par Vibrio penaeicida en relation avec des chutes rapides de température. Dans le but d'élucider les processus entrainant des mortalités dans les élevages, Ifremer a conduit un programme de recherche depuis 2003 dans le cadre du projet DESANS (2003-2006) puis du présent projet DEDUCTION co-financé par les provinces Nord et Sud et le Gouvernement de la Nouvelle-Calédonie. Ce programme se construit dans une démarche multidisciplinaire intégrant les origines supposées multifactorielles des mortalités de crevettes. La qualité environnementale dans les bassins (les fonds et la colonne d'eau) joue un rôle majeur dans l'état physiologique des animaux, influençant leur sensibilité aux pathogènes. DEDUCTION se focalise sur une meilleure compréhension de la composition phytoplanctonique et des flux bio-géochimiques à l'interface eau/sédiment dans les bassins.L'impact des rejets des fermes est également étudié. En outre, un travail plus fondamental est conduit pour connaître les mécanismes de pathogénicité de ces deux espèces de Vibrio mais aussi pour prévenir les occurences d'infections virales par des approches ARN Interférence. Des marqueurs de l'état physiologique des oeufs, larves, post-larves et animaux en élevage, tels que les enzymes du stress oxydant sont utilisés.Les gains de performance (résistance aux pathogènes et croissance) sont obtenus sur des hybrides issus du croisement de la souche locale avec une souche hawaienne. Finalement la base de données STYLOG est exploitée dans le but de distinguer les bonnes des mauvaises pratiques sur la base d'indicateurs fiables.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00143/25438/23591.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00143/25438/

Résumé : Le but de ce programme pathologie est de rechercher et d'étudier les agents pathogènes connus et inconnus chez les mollusques bivalves marins, plus particulièrement chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, afin d'identifier d'éventuels agents causant des mortalités, de proposer des mesures prophylactiques et de définir des conditions zootechniques permettant aux professionnels de limiter l'impact des maladies sur leur cheptel. La présence de maladies, chez les mollusques bivalves marins dont l'impact socio économique peut être catastrophique pour les productions conchylicoles, et l'accroissement des échanges de produits d'aquaculture entre les pays de la CEE et avec les pays tiers nécessitent le renforcement des recherches dans les domaines de la pathologie. En particulier, du fait du mono élevage de l'huître japonaise, Crassostrea gigas, en France, il semble aujourd'hui indispensable d'effectuer des contrôles zoosanitaires réguliers chez cette espèce. Ces travaux ont d'autant plus d'importance qu'aujourd'hui, devant les pathologies rencontrées, les professionnels restent extrêmement démunis (traitements inapplicables ou inexistants). Dans ce cadre, la promptitude du diagnostic ainsi que l'acquisition de données épidémiologiques et biologiques concernant les agents pathogènes impliqués sont les meilleurs moyens d'éviter leur dissémination chez les mollusques bivalves marins. Les travaux entrepris dans ce cadre par l'URPIG, semblent d'autant plus indispensables qu'il n'existait pas jusqu'à ces dernières années de pathologies identifiées chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, sur le littoral français. Cependant depuis 1991, sont apparus dans certaines écloseries françaises des épisodes de mortalité sur des larves de cette espèce. Il a été possible de détecter un virus apparenté à la famille des Herpesviridae par ses caractères morphologiques (NICOLAS et al., 1992) et de démontrer sa pathogénicité pour les larves (LE DEUFF et al., 1994). Par ailleurs, en 1993, 1994 et 1995, un virus de même type, a été observé en association à de fortes mortalités sur différents lots de naissain de la même espèce, originaires d'écloseries et de captage naturel. Par ailleurs, en 1993, suite à l'observation d'anomalies au niveau des branchies chez des huîtres creuses provenant de Charente Maritime et du bassin d'Arcachon associées à de médiocres performances de croissance, il a été entrepris des analyses de divers échantillons, en histologie classique et en microscopie électronique à transmission. Ces examens ont permis de révéler la présence au niveau des branchies, chez un nombre non négligeable d'animaux, d'un microorganisme de type chlamydien (RENAULT and COCHENNEC, 1995). Il a également été possible, chez cette même espèce, de détecter la présence d'un organisme de type rickettsien au niveau des branchies (RENAULT, COCHENNEC and CHOLLET, 1995).

Droits : 1995 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15453/12828.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15453/

Éditeur(s) : Styli 2003. Trente ans de crevetticulture en Nouvelle-Calédonie. Nouméa - Koné, 2-6 juin 2003. 2004. Gorarant C, Harache Y, Herbland A, Mugnier C. Ed. Ifremer, Actes de Colloque, n°38, pp.113-120
Résumé : Two oyster species are currently present along the French coasts : the indigenous European flat oyster (Ostrea edulis), and the Pacific cupped oyster (Crassostrea gigas), that has been introduced from Japan since the beginning of the 70ies. The flat oyster successively suffered from two protozoan diseases during the 60ies and its production decreased from 20 000 tons/year by that time to 1 500 tons/year nowadays. Consequently, the oyster production is principally (99%) based upon the Pacific oyster species with approximately 150 000 tons/year among which 90% are grown from the natural spat. However, the hatchery production of this species is developing and was estimated to 400 to 800 millions spat in 2002. Moreover, strengthened relationships between IFREMER and the 5 commercial hatcheries, that all joined the SYSAAF (Union of the French poultry, shellfish and fish farming selectors), allow to plan for new genetic breeding programs. At the end of the 80ies, IFREMER initiated a genetic breeding program for the resistance of the European flat oyster to the bonamiosis, and obtained strains more tolerant to this disease. After two generations of massal selection, molecular markers had identified a reduced genetic basis in this program. It was then reoriented to an intra-familial selection. However, we were confronted to a zootechnic problem to manage such a scheme and we compromised by an intra-cohorts of families selection scheme managed using molecular markers. The program has now reached the transfer level with experimentation at a professional scale. Concerning the Pacific cupped oyster, and in parallel with the obtaining and the study of polyploids, performance of different Asian cupped oyster strains were compared to the one introduced in France thirty years ago and currently suffering from summer mortalities. The local strain exhibited better performance, certainly based upon a good local adaptation. In other respects, although early growth is a relevant criteria for selection for growth to commercial stage, it is not to be privileged in the context of an oyster producing region with a limited food availability. Contrary, the spat summer mortality became a priority for numerous teams (genetic, physiology, pathology, ecology,...) joined in the MOREST program. The first results showed important survival differences between fullsib and halsib families. They indicate a genetic determinism to this character "survival" and promote for its selection.
Deux espèces d'huîtres sont aujourd'hui présentes sur les côtes françaises : l'huître plate européenne (Ostrea edulis), indigène, et l'huître creuse du Pacifique (Crassostrea gigas), introduite du Japon dans le début des années 1970. L'huître plate a subi coup sur coup, dans les années 1960, deux maladies dues à des protozoaires parasites et sa production est ainsi passée de 20 000 t/an dans les années 1960 à 1500 t/an aujourd'hui en France. Il en résulte que la filière ostréicole française repose quasiment exclusivement (99%) sur la production de l'huître creuse, C. gigas, avec 150 000 tonnes en 2000 dont environ 90% est issu du captage naturel. Cependant, la reproduction de cette espèce en écloserie est actuellement en expansion avec une estimation de 400 à 800 millions de naissains commercialisés en 2002. Des rapports renforcés entre l'IFREMER et les cinq écloseries françaises de la filière ostréicole, qui adhèrent toutes au SYSAAF (SYndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français), permettent désormais d'envisager le développement de nouveaux programmes d'amélioration génétique. A la fin des années 1980, un programme de sélection pour la résistance de l'huître plate à la bonamiose a été initié au sein de l'IFREMER, et a permis d'obtenir des souches plus tolérantes à cette maladie. Après deux générations en sélection massale, les marqueurs moléculaires avaient mis en évidence une base génétique réduite au sein de ce programme qui s'était alors orienté vers une sélection intra-familiale. Devant la lourdeur zootechnique d'un tel schéma, un compromis a été trouvé en réalisant une sélection au sein de cohortes de familles biparentales, la gestion de ces cohortes étant permise par les analyses moléculaires. Le programme est maintenant dans sa phase de transfert, avec des expérimentations à plus grande échelle en partenariat avec la profession. En ce qui concerne l'huître creuse, et en parallèle de l'obtention et l'étude de polyploïdes, les performances de différentes souches d'huîtres creuses provenant d'Asie ont été comparées à celles de la souche introduite en France il y a trente ans, sujette à des mortalités estivales. La souche locale présente de meilleures performances, vraisemblablement grâce à une adaptation bien réalisée. Par ailleurs, bien que l'amélioration de la croissance jusqu'à la taille commerciale s'avère possible par une sélection précoce au stade larvaire, le critère de croissance n'est pas nécessairement à privilégier dans le contexte d'un bassin ostréicole disposant de ressources trophiques limitées. En revanche, les importantes mortalités rencontrées par le naissain en périodes estivales constituent le sujet d'étude prioritaire sur lequel se sont penchées de nombreuses équipes (génétique, physiologie, pathologie, écologie, ...) dans le cadre du grand défi MOREST. Les premiers résultats ont mis en évidence de fortes différences de survie entre des familles biparentales d'animaux indiquant un déterminisme génétique du caractère « survie », et encourageant dans la voie d'une sélection pour ce caractère.

Droits : 2004 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-3491.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3491/

Éditeur(s) : Université de La Rochelle, Ecole doctorale Gay Lussac
Résumé : The thesis work is part of the very current issue on mass mortality outbreaks affecting Pacific oyster, C. gigas, spat and juveniles and questions about the involvement of pesticides in this phenomenon. The first part of this thesis was devoted to study the effects of pesticides on hemocyte parameters in the Pacific oyster (in vitro and in vivo). The immunomodulator effect of selected pesticides (alone or in mixture) has been explored principally through flow cytometry. The second part concerned the study of the effects of a pesticides mixture on OsHV-1 itself. No direct effects have been reported on the viral particles in presence of the pollutants. Moreover, pesticide effects on Pacific oysters were also explored through experimental pathology assays after treatment of animals with a polluant mixture. Results showed that pesticide treated oysters appeared more susceptible to the viral infection in experimental conditions. The third part concerned the study of autophagy in the Pacific oyster, C. gigas. The publication of the complete genome in 2012 has opened up new possibilities for the study of innate immunity in this species. The study of autophagy for the first time in oysters consisted in a first step in the in silico search for genes involved in this pathway and the corresponding proteins by Western blotting. Then, the role of this important process in innate immunity has been explored through reproduction infections tests with or without modulators of autophagy. Results showed that autophagy appeared as involved in defence mechanisms against viral and bacterial infection in Pacific oysters.
Le travail de thèse s’inscrit dans la problématique très actuelle des mortalités massives de naissain et de juvéniles d’huîtres creuses, C. gigas, et des questionnements autour de l’implication des pesticides dans ce phénomène. La première partie de la thèse a été consacrée à l’étude des effets de pesticides sur les capacités hémocytaires de l’huître creuse (in vitro et in vivo). L’effet immunomodulateur des xénobiotiques sélectionnés (seul ou en mélange) a été exploré principalement au travers de la cytométrie en flux. La deuxième partie de la thèse a concerné l’étude des effets d’un mélange de pesticides sélectionnés sur le virus OsHV-1 et l’infection qu’il induit chez l’huître creuse. Les effets des pesticides sur le virus lui-même ont été évalués. Les expériences réalisées non pas permis de mettre en évidence dans les conditions testées, de dégradation des particules virales en présence des polluants. D’autre part, leurs effets sur les huîtres elles-mêmes ont été explorés après traitement des animaux avec un mélange de pesticides lors d’essais de pathologie expérimentale. Il a ainsi pu être montré que des huîtres préalablement comtaminées par un mélange de pesticides à des concentrations retrouvées dans l’environnement semblaient être plus sensibles à l’infection virale. La troisième partie de la thèse a concerné l’étude de l’autophagie chez l’huître creuse, C. gigas. La publication du génome complet de cette espèce en 2012 a ouvert de nouvelles possibilités pour étudier l'immunité innée. L’étude de l’autophagie réalisée pour la première fois chez l’huître creuse a consisté lors d’une première étape en la recherche in silico de gènes impliqués dans cette voie et des protéines correspondantes par western blotting. Puis, le rôle de ce processus important dans l’immunité innée a été exploré au travers d’essais de reproduction d’infections en présence ou non de modulateurs de l’autophagie. Les résultats obtenus semblent montrer que l’autophagie soit un processus important pouvant être impliqué dans les capacités de défense de l’huître creuse vis-à-vis d’infections virales et bactériennes.

Droits : 2014 Université de La Rochelle
http://archimer.ifremer.fr/doc/00226/33740/32149.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00226/33740/

Résumé : La conchyliculture connaît depuis une trentaine d'années une progression régulière de ses productions à travers le monde. Elle représente une activité économique importante avec plus de 240 000 tonnes de coquillage produit annuellement en France. Cependant le développement de cette activité peut être limité par des mortalités parfois massives dues à des maladies infectieuses. L'augmentation des productions peut être expliquée par l'amélioration des méthodes d'élevage grâce à une meilleure connaissance de la biologie des bivalves et des processus physiologiques liés à leur reproduction : l'apparition de l'élevage larvaire en écloserie a permis de pallier le caractère aléatoire et souvent insuffisant du captage naturel. Ces nouvelles techniques ont permis d'acquérir une certaine indépendance vis-à-vis des pontes naturelles, mais ont entraîné une augmentation des transferts d'animaux entre les bassins conchylicoles, une augmentation des densités de mollusques et le développement d'une espèce cible par bassin. Ces actions ont contribué à l'apparition et à la dissémination de nouvelles maladies entraînant de très fortes pertes pour la conchyliculture. De plus, la palourde, comme tous les mollusques marins, présente des caractéristiques biologiques qui laissent peu de possibilités d'actions pour protéger une production vis-à-vis de maladies infectieuses: la culture de ces espèces en milieu ouvert rend tout traitement impossible du fait des quantités de substance à utiliser, et de la forte probabilité de contamination des animaux. Cette méthode peut être appliquée dans le cas d'élevages intensifs : écloseries, nurseries. Le système immunitaire des mollusques est primitif, ils ne possèdent pas de lymphocytes B et lymphocytes T, ce qui empêche toute réponse immune spécifique et rend la vaccination impossible. L'absence d'anticorps spécifique complique la recherche d'agent pathogène, celle-ci n'est possible que par un diagnostic direct, essentiellement réalisé grâce à l'histologie ou à la microscopie.

Droits : 2006 IUT La Rochelle, Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14457/11759.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14457/

Éditeur(s) : Société Nationale de Protection de la Nature
Résumé : Monitoring of French Polynesia coral reefs and their recent development.-French Polynesia, consisting of 118 islands in the centre of the Pacific Ocean, has more than 15 000 km(2) of reefs and lagoons managed by the local government. Tourism and pearl culture are the two main economic resources of the country. Polynesian coral reefs are extremely diverse and are among those for which we have thorough knowledge. The exploitation of local resources has been recorded for multiple decades and includes : coral materials, fishing, harvest and export of mother-of-pearl molluscs, pearl production, and ornamental fish. All over the country, many monitoring programmes have been launched to measure the health of reefs and the natural and anthropogenic perturbations that they suffer : hurricanes and seismic events, water quality, health of benthic and fish communities, pearl oyster pathology and radiobiology. These data, collected over the last few decades, allowed to define the relative importance of natural and anthropogenic degradation on reefs and lagoons, and to explain the present status of reefs at different spatial scales. Devastating hurricanes are rare (1903-1906, 1982-1983 and occasionally at other times), but they may annihilate outer slope coral communities on some islands. Bleaching events with considerable coral mortality at different geographical scales occurred mainly in 1991, 1994 and 2003. Outbreaks of Acanthaster destroyed numerous reefs (lagoons and outer slopes) from 1978-1982 and a new demographic wave began in 2006 at many Society islands. Eutrophication events only occurred occasionally and only in some lagoons. Whereas natural catastrophic events degrade the coral reef ecosystem across many islands, at the archipelago or even regional scale, anthropogenic degradation is limited to a few Society Islands, occurring rarely on atolls and not at all on those (one third) which are uninhabited. The main causes of reef degradation in some areas of Tahiti and Moorea include the embankment of fringing zones, coral mining, overfishing, absence of urban sewage treatment and the development of leisure and tourism activities. Because of its large geographical extent, one may conclude that major reef degradation in French Polynesia is caused by catastrophic natural events. On the other hand, anthropogenic degradation is more localized. Unfortunately, the synergistic effects of these causes of degradation prevent reefs from recovering. Optimum coral cover on French Polynesian outer reef slopes is between 50-60%. After a major destructive impact (hurricane, bleaching, Acanthaster) a reef is reduced to less than 10% coral cover, however if no more major disturbance events occur a reef will recover in about 12 years. Most of the 15 000 km(2) of reefs and lagoons in French Polynesia are in good health, and along with their neighbouring reefs in East and Central Pacific they are considered as the least degraded reefs worldwide and at a low risk of becoming degraded in the few next decades. However, we are more and more anxious about the future of reefs in the world particularly because present simulations predict that major impacts of climate change would include : elevation of sea surface temperatures, increase in the strength of hurricanes and acidification of seawater which will affect the formation of coral structures.
La Polynésie française, 118 îles au coeur du Pacifique, possède une surface de plus de 15 000 km2 de récifs et lagons gérés par le gouvernement polynésien. Le tourisme et la perliculture représentent les deux ressources économiques majeures du Pays. Les formations récifales très diversifiées sont parmi les mieux connues. Plusieurs suivis d'exploitation des ressources sont opérationnels depuis des décennies : granulats coralliens, pêche pour l'alimentation, collecte et exportation de mollusques nacriers, production de perles, poissons d'ornement. À l'échelle du Pays de très nombreux programmes de surveillance de l'état des récifs et des perturbations qu'ils subissent, naturelles et anthropiques, ont été mis en place : perturbations cycloniques et sismiques, qualité des eaux, état de santé des peuplements benthiques et ichtyologiques, pathologie des nacres, radiobiologie. Toutes ces données recueillies au fi l des décennies ont permis d'établir l'importance relative des dégradations naturelles et anthropiques sur les récifs et lagons polynésiens et d'expliquer leur état de santé actuel en considérant différentes échelles spatiales. Les périodes cycloniques dévastatrices pour les récifs sont rares (1903-1906, 1982-1983 et épisodiquement) mais les cyclones ont parfois anéanti les communautés coralliennes de pentes externes dans certaines îles. Les blanchissements suivis de mortalités importantes à des échelles spatiales diverses, ont été surtout ceux de 1991, 1994 et 2003. Les explosions démographiques d'Acanthaster ont détruit de nombreux récifs (lagons et pentes externes) en 1978-1982 et une nouvelle pullulation s'amplifie depuis 2006 dans plusieurs îles de la Société. Les crises dystrophiques n'ont perturbé qu'épisodiquement certains lagons. [...]
Revue d'Ecologie de la Terre et de la Vie (0249-7395) (Société Nationale de Protection de la Nature), 2008 , Vol. 63 , N. 1-2 , P. 145-177

Droits : 2008 Société Nationale de Protection de la Nature
http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/publication-4558.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4558/

Résumé : Les 21 et 22 juin 2000, le Département des Ressources Aquacoles a consacré ses journées annuelles à une revue du thème "santé des cheptels" et du dispositif de recherche en pathologie sur les filières poissons, crustacés et mollusques, domaine très stratégique pour l'aquaculture marine française. Les objectifs des ces journées, rappelés par Yves Harache, Directeur du Département, étaient les suivante : • Dresser le bilan des actions de recherche menées par l'Ifremer en pathologie des espèces aquacoles, • Repréciser la stratégie (objectifs/moyens) du Département des Ressources Aquacoles sur le thème "santé des cheptels", • Programmer les actions de recherche à venir, • Stimuler les interactions entre groupes de recherche et laboratoires impliqués. Le présent rapport rend compte du contenu des débats de ces deux journées.

Droits : 2000 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00164/27547/25711.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00164/27547/

Résumé : Since 1993, the New Caledonian shrimp industry has been faced with cold season mortality outbreaks of multifactorial origin. This pathology called “Syndrome 93” affects as well animals in grow-out ponds as broodstock after their transfer in maturation room, with up to 35% of mortality in 48 hours. From literature data and physiological studies on Litopenaeus stylirostris, several combinations of three abiotic parameters (temperature, salinity and feeding) have been tested during the breeders stocking period. This research allowed us to lower stress factors impact and to propose a transfer protocol which leads to an optimal physiological comfort of the animal. Results showed that survival rate is improved and spawning rates are twice higher. These findings have come up with a routine protocol of carrying out any transfer in a tank with water at temperature of 26°C, salinity of 26 ppt and no food supply during 48 hours. The use of this protocol in a commercial hatchery led to a significant broodstock survival improvement.
Depuis 1993, la filière crevetticole calédonienne est confrontée aux mortalités de saison froide dont les causes sont multifactorielles. Cette pathologie appelé « Syndrome 93 » affecte non seulement les animaux dans les bassins de grossissement, mais elle touche également les géniteurs après leur transfert en salle de maturation, les pertes pouvant atteindre 35% en 48 heures. A partir de la littérature et d’études physiologiques de la Litopenaeus stylirostris, différentes combinaisons de trois paramètres abiotiques (température, salinité et alimentation) ont été testés lors de la stabulation des reproducteurs en salle de maturation. Ces recherches ont permis de diminuer l’impact des facteurs de stress et d’établir un protocole de transfert des animaux dans les conditions de confort physiologique optimale. Les résultats montrent que la survie est améliorée mais que le pourcentage de pontes est également doublé. Il est maintenant recommandé pour tout transfert, de prévoir des bacs de réception dans lesquels l’eau est à la température de 26°C, la salinité à 26 ppt et de ne fournir aucune alimentation pendant 48 heures. L’application de ce protocole dans une écloserie privée a démontré un gain substantiel sur la survie des géniteurs.

Droits : 2008 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00118/22970/20800.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00118/22970/

Résumé : Depuis 2008, la filière ostréicole française fait face à des mortalités très importantes touchant les naissains d’huîtres creuses, Crassostrea gigas. Répondant aux missions qui lui sont assignées, l’Ifremer a rapidement lancé, en synergie avec ses partenaires et l’interprofession, des travaux visant à décrire précisément le phénomène, à progresser dans la compréhension de ses causes, et à étudier quelles pouvaient être les contributions à apporter pour une aide à la gestion du phénomène et à la mise en oeuvre de pistes de sorties de crise. Le 18 janvier 2012, l’Ifremer a organisé, avec le soutien du Ministère de l’Agriculture, de l’Alimentation, de la Pêche, de la Ruralité et de l’Aménagement du Territoire, une journée d’information et d’échanges dédiée à cette problématique pour : présenter une synthèse les connaissances acquises à l’Ifremer depuis 4 ans ; présenter les dernières avancées et les perspectives, les projets en cours et à venir ; donner une large place à l’échange entre les différents participants. Cette journée a réuni les ministères, les représentants de la profession conchylicole, les centres techniques régionaux conchylicoles, les laboratoires agréés et reconnus, des organismes de recherche et des universités partenaires. Ce document retrace les interventions et les échanges qui se sont déroulés pendant cette journée d’information.

Droits : Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00084/19574/17196.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00084/19574/

Résumé : Les phénomènes de coloration des eaux marines au voisinage des côtes, des estuaires, à l'intérieur des baies, lagunes ou ouvrages portuaires, sont connus depuis longtemps. Neanmoins, leur fréquence augmentant depuis quelques années sur le littoral français, des risques d'intoxications par ingestion de bivalves contaminés similaires à celles que connaissent régulièrement les Etats-Unis et le Canada, sont à craindre. De fait, si bon nombre de ces phénomènes "d'eaux rouges" restent sans effet après leur disparition, certains, par contre, peuvent entraîner des mortalités d'animaux marins, ou pire encore, de graves empoisonnements chez les consommateurs de "fruits de mer", du fait de l'énorme pouvoir concentrateur des bivalves.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00046/15774/13176.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00046/15774/

Résumé : Larval mortalities occurring in molluscan hatcheries have often been associated with bacterial contamination. Although batches of oyster and clam larvae have been routinely reared in the hatchery of Argenton without antibiotics, high larval mortalities have been recorded with Pecten maxirnus under similar conditions. For this species, an addition of chloramphenicol was found necessary. However, this chemical has now been banned in Europe. Thus either substitition products or an improvement in the rearing procedures is essential. Studies carried out have shown that neither a decrease in larval density (1 larvae. ml"l) nor sea water change frequency (1 per day) had any positive effects. Furthermore, elective substances such as sugars were not suitable and the use of another antibiotic, erytromvcine. led to inconsistent results-
En ecloserie de mollusques, les mortalités larvaires sont souvent associées à des proliférations bactériennes. Pour les limiter un traitement de l'eau est incontournable et chez certaines espèces, dont la coquille St Jacques Pecten maximus, l'utilisation de chloramphenicol s'avère nécessaire. Or son usage dans les productions animales a été récemment prohibé par la communauté européenne. Afin de pallier à cette interdiction, l'amélioration des procédures zootechniques ainsi que l'utilisation de produits de substitution ont été effectuées. Quel que soit le procédé envisagé, abaissement de la densité en élevage, augmentation de la fréquence du renouvellement de l'eau d'élevage, mise au point de filtres biologiques, utilisation de substances électives, les élevages larvaires n'ont pu être menés à terme. A l'inverse, de bons développement larvaires ont été obtenus avec adjonction d'érythromycine mais ces résultats ne sont pas suffisamment reproductibles pour que cet antibiotique constitue un produit de substitution efficace.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1995/rapport-1568.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1568/

Résumé : Until 1960, the Black scallop Chlamys varia was relatively abundant along the French Atlantic coasts. Today most of these natural beds have disappeared. Because mollusc hatchery and nursery techniques have been mastered, the reintroduction of this species, under control, was carried out in several areas and particularly in the bay of Arcachon, from 1989 to 1992. Good results were obtained in hatchery and nursery but the development of the juveniles in the natural fields was poor. The growth of Chlamys varia was satisfactory but heavy mortalities were rapidly recorded which could not be related to the hydrobiological conditions. This species seems to be very sensitive to short emersion and removal operations which are incompatible with aquaculture processes.
Jusqu'en 1960, le pétoncle noir Chlamys varia était largement distribué sur les côtes atlantiques françaises. Actuellement, la plupart de ces gisements se sont raréfiés. Les techniques de reproduction contrôlée de mollusques étant maintenant relativement maîtrisées, des essais de réimplantation de cette espèce ont pu être tentés dans plusieurs sites ostréicoles, dont le Bassin d'Arcachon, de 1989 à 1992. Les essais de grossissement se sont soldés par un échec. Si de bonnes croissances ont été enregistrées dans le Bassin d'Arcachon au cours de ces trois années, ces performances ont été contrariées par de très fortes mortalités apparaissant peu de temps après la mise en place des élevages. Bien que l'espèce soit considérée comme relativement sensible aux facteurs du milieu, les conditions hydrobiologiques régnant sur la baie à cette période ne peuvent expliquer ces résultats. Chlamys varia semble mal supporter les diverses manipulations (emersion de courte durée, dégrappage) difficilement contournables au cours d'un cycle aquacole.

Droits : 1994 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/1994/rapport-1567.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1567/