Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Herbicides are generally the most extensively used of the pesticides applied to agricultural crops. However, the literature contains little evidence useful in assessing the potential sources of the general population's exposure to herbicides, including by residential proximity to crops. The objective of this study was to take advantage of data from the PELAGIE mother-child cohort to identify the main determinants of the body burden of exposure to the chloroacetanilide and triazine herbicides commonly used on corn crops in Brittany, France, before 2006. Urine samples from a randomly selected subcohort of women in the first trimester of pregnancy (n=579) were assayed for herbicide metabolites. The residential exposure resulting from proximity to corn crops was assessed with satellite-image-based scores combined with meteorological data. Data on diet, drinking tap water (from the public water supply), occupations, and household herbicide use were collected by questionnaires. Herbicides were quantified in 5.3% to 39.7% of urine samples. Alachlor and acetochlor were found most frequently in the urine of women living in rural areas. The presence of dealkylated triazine metabolites in urine samples was positively associated with residential proximity to corn crops (OR=1.38, 95% CI: 1.05-1.80). Urinary metabolites of both atrazine and dealkylated triazine were correlated with tap water consumption (OR=2.94, 1.09-7.90, and OR=1.82, 1.10-3.03, respectively); hydroxylated triazine metabolites were correlated with fish intake (OR=1.48, 1.09-1.99). This study reinforces previous results that suggest that environmental contamination resulting from agricultural activities may contribute to the general population's exposure to herbicides.
Environment International

hal-00966842
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00966842
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00966842/document
DOI : 10.1016/j.envint.2013.10.010
PUBMED : 24246238

Éditeur(s) : HAL CCSD Linnean Society of London
Résumé : Disentangling the impact of landscape features such as rivers and historical events on dispersal is a challenging but necessary task to gain a comprehensive picture of the evolution of diverse biota such as that found in Amazonia. Adenomera andreae, a small, territorial, terrestrial frog species of the Amazonian forest represents a good model for such studies. We combined cytochrome b sequences with 12 microsatellites to investigate the genetic structure at two contrasted spatial scales in French Guiana: along a similar to 6-km transect, to evaluate dispersal ability, and between paired bank populations along a similar to 65-km stretch of the Approuague river, to test the effect of rivers as barriers to dispersal. We observed significant spatial genetic structure between individuals at a remarkably small geographical scale, and conclude that the species has a restricted dispersal ability that is probably tied to its life-history traits. Mitochondrial and microsatellite data also indicate a high level of differentiation among populations on opposite banks of the river, and, in some cases, among populations on the same riverbank. These results suggest that the observed population structure in A. andreae is the result of restricted dispersal abilities combined with the action of rivers and Quaternary population isolation. Given that Amazonia hosts a great portion of anurans, as well as other small vertebrates, that display life-history traits comparable with A. andreae, we argue that our analyses provide new insights into the complex interactions among evolutionary processes shaping Amazonian biodiversity. (c) 2012 The Linnean Society of London, Biological Journal of the Linnean Society, 2012, 106, 356373.
ISSN: 0024-4066

hal-01032422
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032422
DOI : 10.1111/j.1095-8312.2012.01871.x

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : Dans les années 1800, l’agriculture représentait près de 95 % du Produit intérieur brut (PIB) d’Haïti. En 2009, le secteur primaire entier ne représentait plus que 23 % du PIB. Ce déclin s’est fait au profit du développement du secteur tertiaire, lui-même dominé par des petits commerces. Le secteur tertiaire est passé de moins de 5 % à 60 % du PIB sur la même période. La mise en évidence de ce processus irréversible est l’objectif poursuivi dans cet article. Il s’agit de faire la lumière sur ce changement de tendance sectorielle dans l’activité économique en Haïti. L’observation des données macroéconomiques dans le temps nous amène à la conclusion que l’économie haïtienne n’est plus essentiellement agricole. Elle est tertiarisée de façon informelle.
In the 1800’s, agriculture represented almost 95% of the Haitian Gross Domestic Product (GDP). In 2009, the whole primary sector does not contribute more than 23% in the GDP. This decline profited the service sector which is dominated by little trade. The service sector moved from less than 5% to 60% of the GDP in the same period. In the present article we intend to underline this irreversible process. We aim to shed light on the current sectoral tendency change in Haiti’s economic activity. Evidence from macroeconomic data through time allows us to conclude that the Haitian economy is no more dominated by agriculture. It is dominated by the service sector, greatly informal.
Haïti

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.4757
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/4757

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : Understanding the pattern in spatial distribution of soil microbial processes is critical to understand the environmental factors that regulate them as well as to scale up these processes to ecosystem. Soil samples from a I ha tropical rainforest plot (Paracou, French Guiana) were analyzed according a nested sampling approach using different separation distances ranging from 0.4 to 40 m. The variability of substrate induced respiration (SIR) and of denitrification enzyme activity (DEA) was characterized in relation to various soil properties (total C and N contents, NIRS related index of soil organic matter quality, SOMQ and index of tree influence potential, IP). The variability of SIR and DEA was higher than that of environmental properties. The patterns of accumulated variance as a function of distance varied among the soil properties. The variability of SIR and DEA mainly occurred at small (1 m) scale (and at the 10-40 m-scales for SIR), probably reflecting the quality of litter input that results of the influence of local assemblage of different tree species, though changes in the soil N and C contents. Indeed, total soil C and N contents explained the microbial properties at every scale. Coefficients of codispersion showed that neither SOMQ nor IP did correlate with SIR and DEA, and confirmed that total C and N contents explained microbial properties in a scale dependent and complex manner. Such spatial dependency underlines the importance of soil heterogeneity in this tropical forest with implications for sampling strategies when studying the microbial processes and their response to disturbances. (C) 2012 Elsevier B.V. All rights reserved.
ISSN: 0016-7061

hal-01032409
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032409
DOI : 10.1016/j.geoderma.2012.12.009

Résumé : Les mutualismes, interactions interspécifiques où chaque partenaire retire un bénéfice net de leur association, sont centraux dans l’origine et l’organisation de la biodiversité. Bien que globalement bénéfiques pour chacun des partenaires, ces interactions n’enlèvent rien à l’égoïsme inhérent de chaque espèce pour sa survie et sa reproduction, générant des conflits d’intérêts entre les espèces. Ainsi, comprendre les processus écologiques et évolutifs qui maintiennent le caractère mutualiste d’interactions entre plusieurs espèces est primordial dans la compréhension du maintien de la biodiversité. Néanmoins, le corpus scientifique s’est jusqu'à présent surtout concentré sur des paires d’espèces en interaction. Or, ces avancées scientifiques restent partielles car la plupart de ces interactions s’englobent dans un contexte communautaire. C’est dans ce cadre conceptuel que se place mon travail de thèse. Alors que la diversité structurelle des mutualismes de protection entre plantes et fourmis en ont fait un modèle d’étude clé dans la compréhension des mutualismes, j’ai concentré mes recherches sur l’intégration d’un troisième partenaire fongique pour comprendre ses conséquences sur les résultantes écologiques et évolutives de ces mutualismes tripartites. Je me suis tout d’abord intéressé à définir la relation qui lie de façon mutualiste le champignon aux deux autres partenaires et à établir les conflits d’intérêts émanant de ces différentes interactions pour comprendre quels facteurs permettaient de les réguler. Ainsi, la relation qui lie le champignon aux fourmis peut être qualifiée d’agriculture. Les fourmis protègent, nourrissent et disséminent le champignon et celui-ci, via ses propriétés structurales, permet l’élaboration de galeries servant de piège pour capturer des proies. Ce phénomène crée cependant un conflit d’allocation de la force ouvrière des fourmis et nuit directement aux bénéfices de la plante par une diminution de l’intensité des patrouilles sur ses feuilles, diminuant consécutivement sa protection et sa fitness. Néanmoins, le rôle du champignon dans les transferts de nutriments entre les fourmis et la plante, ainsi que certaines réponses évolutives de la plante permettent de réguler ces conflits, stabilisant les bénéfices nets de chaque partenaire dans ce mutualisme tripartite. Puis, je me suis concentré à comprendre comment certains facteurs évolutifs pouvaient moduler cette résultante écologique. La prise en compte du caractère multipartite d’un mutualisme change radicalement la vision de l’évolution des mutualismes jusqu’alors étudiée entre paires d’espèces. Alors que le corpus scientifique s’accorde à dire que la spécialisation entre espèce par coévolution renforce la stabilité et les bénéfices perçus par chaque partenaire, le contexte multipartite semble altérer ces prédictions. Au contraire la spécialisation multipartite peut être dans certains cas un moteur d’instabilité et de baisse des bénéfices. Enfin cette thèse permet de faire le lien entre deux concepts qui s’opposent : la coévolution diffuse et la coévolution par paire. Je montre ainsi que la coévolution peut intervenir sur plus de deux espèces à la fois, mais qu’elle peut quand même entrainer une spécialisation multispécifique. Finalement, au contraire des prédictions de la coévolution diffuse, cette thèse montre que plusieurs pressions de sélection contrastées émanant de différentes espèces envers un seul trait d’une troisième espèce peuvent promouvoir la spécialisation multi-spécifique.
Mutualisms, defined as interspecific interactions where each partner receives net benefices from their interactions, are central to the organization of earth biodiversity. Although globally beneficial for each partner, such interactions do not modify the inherent selfishness of species for their survival and reproduction, generating conflicts of interests between species. Thus understanding the ecological and the evolutionary processes maintaining positive outcomes in mutualisms is fundamental to understand how mutualisms shape earth biodiversity. However, scientific research on mutualisms has most of the time focused on interaction between pairs of species. Such knowledge is thus partial as mutualisms are embraced in a community context. My doctoral thesis takes place in this conceptual framework. I focused my research on the integration of a third fungal partner in protective interactions between ants and plants to evaluate its consequences on the ecological and evolutionary outcomes of such mutualisms, taken as multispecies interactions. I first focused my researches in defining the mutualistic interaction linking the fungal partner with its two other associates and in revealing any conflict of interests and their regulation that may emerge from such tripartite interactions. The interactions between the ants and the fungi can be qualified as a case of non-food fungiculture. The ants protect, provide food and disseminate the fungus, and the latter, thanks to its structural properties, allows the elaboration of galleries used that are then used as trap to capture preys. This phenomenon creates a conflict of interest in the allocation of the worker force, altering host plant benefits through a decrease of worker patrolling activity and consequently leaves protection and thus fitness. However, the role of the fungus in the nutrient transfers between ants and plants added to evolutionary responses from the plant allows regulating this conflict, stabilizing the net benefits towards the plant. Then I have concentrated my researches in understanding how evolutionary factors would modulate the ecological outcomes of such interactions. Taking into account the multispecific character of mutualisms changes radically the vision on the evolution of mutualisms when pair of species are considered. While it is widely accepted that specialization of mutualist species through coevolution reinforce the stability of the interaction and the net benefit of each partner, the multispecific context seems to deviate these predictions. Conversely, I show that specialization between three mutualistic partners can drive instability and decrease of benefits. Finally, the results of this thesis join the gap between two previously opposed concepts: diffuse coevolution and pairwise coevolution. I show that coevolution can happen between more than two species simultaneously and that it can drive mutlispecific specialization. Opposed to the diffuse coevolution, I show that contrasting selective pressures on a same trait from different partner can promote specialization of species.

http://www.theses.fr/2013AGUY0622/document

Éditeur(s) : HAL CCSD Public Library of Science
Résumé : International audience
BACKGROUND: The use of pesticides and the related environmental contaminations can lead to human exposure to various molecules. In early-life, such exposures could be responsible for adverse developmental effects. However, human health risks associated with exposure to complex mixtures are currently under-explored. OBJECTIVE: THIS PROJECT AIMS AT ANSWERING THE FOLLOWING QUESTIONS: What is the influence of exposures to multiple pesticides on the metabolome? What mechanistic pathways could be involved in the metabolic changes observed? METHODS: Based on the PELAGIE cohort (Brittany, France), 83 pregnant women who provided a urine sample in early pregnancy, were classified in 3 groups according to the surface of land dedicated to agricultural cereal activities in their town of residence. Nuclear magnetic resonance-based metabolomics analyses were performed on urine samples. Partial Least Squares Regression-Discriminant Analysis (PLS-DA) and polytomous regressions were used to separate the urinary metabolic profiles from the 3 exposure groups after adjusting for potential confounders. RESULTS: The 3 groups of exposure were correctly separated with a PLS-DA model after implementing an orthogonal signal correction with pareto standardizations (R2 = 90.7% and Q2 = 0.53). After adjusting for maternal age, parity, body mass index and smoking habits, the most statistically significant changes were observed for glycine, threonine, lactate and glycerophosphocholine (upward trend), and for citrate (downward trend). CONCLUSION: This work suggests that an exposure to complex pesticide mixtures induces modifications of metabolic fingerprints. It can be hypothesized from identified discriminating metabolites that the pesticide mixtures could increase oxidative stress and disturb energy metabolism.
ISSN: 1932-6203

inserm-00863407
http://www.hal.inserm.fr/inserm-00863407
http://www.hal.inserm.fr/inserm-00863407/document
http://www.hal.inserm.fr/inserm-00863407/file/journal.pone.0064433.pdf
PUBMED : 23704985

Résumé : L’ingénierie agroécologique vise à produire des savoirs actionnables, pour concevoir des systèmes de cultures économiquement et écologiquement performants, par la valorisation de régulations naturelles. Notre problématique est centrée sur la santé des cultures, et plus particulièrement sur la bactérie phytopathogène Ralstonia solanacearum, agent du flétrissement bactérien alors qu’une souche extrêmement agressive menace la production de tomates en plein champ en Martinique. La nécessité d’explorer et de développer des alternatives aux méthodes conventionnelles de protection des plantes (variétés résistantes, pesticides), actuellement inefficaces, invite à la mise en œuvre d’une démarche de conception innovante. Nos travaux montrent que la mobilisation d’une barrière rhizosphérique est une stratégie de régulation biologique alternative. Différents processus y contribuent, telle que la mycorhization, symbiose entre racines et champignons mycorhiziens à arbuscules, présents dans la plupart des sols. Nous montrons que la mobilisation de réseaux de mycorhizes indigènes à partir d’un sol agricole permet une mycorhization précoce de la tomate. De plus, l’association de plantes aux propriétés mycorhizotrophes et assainissantes en conditions contrôlées montre des effets bioprotecteurs partiels et ouvre de nouvelles perspectives de combinaisons entre processus. Ces combinaisons sont mobilisables par des leviers d’actions multi-scalaires. Nous avons produit une grille d’analyse générique de ces leviers d’action pour la conception, par des trajectoires d’innovation multidirectionnelles, de « systèmes de culture bioprotégés ». Dans le contexte agricole martiniquais, une démarche d’apprentissage permet en effet l’émergence d’une dynamique de co-conception de systèmes de cultures recourant aux plantes mycorhizotrophes. Nos travaux proposent des outils pour une exploration collective de nouvelles stratégies de gestion durable de la santé des cultures.
Agroecological engineering aims to produce actionable knowledge to design economically and environmentally efficient cropping systems, based on the exploitation of natural regulation mechanisms. Our issue is centered on crop health, especially on the plant pathogenic bacterium Ralstonia solanacearum (bacterial wilt agent), of which an extremely aggressive strain threatens field tomato production in Martinique. The need to explore and develop alternatives to conventional methods of plant protection (resistant varieties, pesticides), ineffective in our case, calls for the implementation of an innovative design approach. Our work shows that the protection of the roots via the formation of a self-sustaining rhizospheric barrier may be an alternative biological control strategy. Different processes contribute, such as mycorrhizal symbiosis between roots and arbuscular mycorrhizal fungi, which are present in most soils. We show that the mobilization of indigenous mycorrhizal networks from an agricultural soil allows early mycorrhization of tomatoes. In addition, the association of plants with mycorrhizal and sanitizing properties in controlled conditions showed partial bioprotective effects and opens up new prospects for combinations between processes. These combinations may be exploited in various ways. We produced a generic analysis grid of key levers to design "healthy cropping systems " through multi-directional innovation trajectories. In Martinique's agricultural context, a learning process allows the emergence of a dynamic co-design of cropping systems using mycorrhizal plants. Our work thus provides tools for collective exploration of new sustainable management strategies for crop health.

http://www.theses.fr/2015AGUY0828/document

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : La préservation et l’exploitation durable du patrimoine culturel, en particulier du patrimoine historique (et, accessoirement, scientifique), et sa mise en tourisme au service d’activités de loisirs et de découverte, suscitent de nouvelles formes et alimentent de nouvelles offres de tourismes, dites « alternatives », sur lesquelles elle s’appuie en retour.Le patrimoine historique de la Guadeloupe, tant agricole qu’industriel, longtemps délaissé et aujourd’hui redécouvert et remis en valeur, en constitue un exemple significatif, comme il en va dans d’autres territoires et pays de la Caraïbe. Il en illustre les potentialités tout en justifiant les attentes qui s’y attachent en matière de développement local tant touristique que plus général.La reconnaissance de la valeur patrimoniale et de l’intérêt culturel des sites concernés constitue toutefois un phénomène relativement récent, à travers leur sauvegarde et leur réhabilitation. Leur valorisation et leur ouverture au public vont de pair avec leur exploitation au profit d’un tourisme de mémoire marqué par une forte connotation pédagogique.
The preservation and sustainable use of cultural heritage, especially historical (and, incidentally, scientific) heritage, and its introduction into tourism for the benefit of leisure and discovery activities, give rise to new forms and fuel new offers of tourism, called “alternatives”, on which they rely in return.The historical heritage of Guadeloupe, both agricultural and industrial, which has long been untouched and now being rediscovered and restored, is a significant example of this, as it is in other Caribbean territories and countries. It illustrates their potentialities while justifying the expectations that are attached to them in terms of local development both tourism and more general.Recognition of the heritage value and cultural interest of the sites concerned, however, is a relatively recent phenomenon, through their safeguarding and rehabilitation. Their valorisation and their opening to the public go hand in hand with their exploitation in favor of a tourism of memory marked by a strong pedagogical connotation.
La conservación y el uso sostenible del patrimonio cultural, especialmente del patrimonio histórico (y, de paso, científico), y su asignacion al turismo en el servicio de la recreación y del descubrimiento, dan lugar a nuevas formas y nuevos acuerdos de suministro turismo "alternativo", en los que se basa en el rendimiento.El patrimonio histórico de Guadalupe, tanto agrícolas como industriales, y hoy a largo redescuidado y redescubierto, constituye un ejemplo significativo, como es el caso en otros territorios y países del Caribe. Esto ilustra sus potencialidades y justifica las expectativas para uno desarrollo local turistico como mas general.El reconocimiento de la valor patrimonial y de la importancia cultural de los sitios considerados, sin embargo, es un fenómeno relativamente reciente, a través de su protección y rehabilitación. Su desarrollo y su apertura al público van mano a mano con su explotación en beneficio de un turismo de memoria marcada por una fuerte connotación educativa.
Guadeloupe

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.11137
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/11137

Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag
Résumé : Active mechanisms of re-orientation are necessary to maintain the verticality of tree stems. They are achieved through the production of reaction wood, associated with circumferential variations of three factors related to cambial activity: maturation strain, longitudinal modulus of elasticity (MOE) and eccentric growth. These factors were measured on 17 mature trees from different botanical families and geographical locations. Various patterns of circumferential variation of these factors were identified. A biomechanical analysis based on beam theory was performed to quantify the individual impact of each factor. The main factor of re-orientation is the circumferential variation of maturation strains. However, this factor alone explains only 57% of the re-orientations. Other factors also have an effect through their interaction with maturation strains. Eccentric growth is generally associated with heterogeneity of maturation strains, and has an important complementary role, by increasing the width of wood with high maturation strain. Without this factor, the efficiency of re-orientations would be reduced by 31% for angiosperms and 26% for gymnosperms. In the case of angiosperms, MOE is often larger in tension wood than in normal wood. Without these variations, the efficiency of re-orientations would be reduced by 13%. In the case of gymnosperm trees, MOE of compression wood is lower than that of normal wood, so that re-orientation efficiency would be increased by 24% without this factor of variations.
ISSN: 0931-1890

hal-01031825
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01031825
DOI : 10.1007/s00468-005-0407-6

Éditeur(s) : HAL CCSD Ecole nationale du génie rural
Résumé :  
La zoochorie (transport des graines par les animaux) joue un rôle prépondérant dans les forêts tropicales. L'action de la faune sur la régénération forestière est analysée en fonction des co-évolutions s'étant développées entre plantes et animaux frugivores. Différentes associations entre certains types de fruits et certains groupes de mammifères ou d'oiseaux sont décrites, en insistant sur la spécificité de la dissémination qui en résulte. Celle-ci est le plus souvent hétérogène dans des sites plutôt favorables au développement des plantules. Ces diverses modalités de dissémination concourent autant à la colonisation de sites nouveaux qu'au maintien des espèces végétales dans un environnement donné. Dans le cas des plantes pionnières, la distribution est plus homogène et contribue à alimenter la banque de graines du sol. Ces graines entrent en dormance et ne germeront qu'après une ouverture de la canopée. La chasse des animaux frugivores pourrait avoir de lourdes conséquences pour certaines espèces végétales notamment.
ISSN: 0035-2829

hal-01032118
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032118

Éditeur(s) : Université des Antilles Études caribéennes
Résumé : En Amérique centrale, l’élevage des abeilles sans dard est une pratique vieille d’au moins deux millénaires, qui a connu son apogée à la fin de l’ère maya. Les Méliponinés, sous-famille à laquelle appartiennent ces abeilles, rassemblent près de 500 espèces distribuées pour l’essentiel en zone intertropicale. La plupart d’entre elles nichent dans des cavités d’arbres secs ou sous terre, et affectionnent les forêts ombrophiles où elles assurent un rôle actif dans la pollinisation des plantes sauvages. Sur l’île de Cuba, une seule espèce de méliponinés (Melipona beecheii) est présente, elle a probablement été introduite durant l’époque précolombienne à partir de souches génétiques originaires de la péninsule du Yucatán. Dans les campagnes autour de La Havane, les abeilles mélipones continuent d’être un vecteur de socialisation, car leur domestication correspond souvent à une tradition familiale et parce que les bénéficiaires des produits de la ruche sont des familiers du méliponiculteur. En forêt, en revanche, le miel donne davantage lieu à des pratiques de cueillette. Depuis une vingtaine d’années, la prise de conscience du rôle de l’abeille dans le fonctionnement des écosystèmes et la valeur des services qu’elles seraient susceptibles de rendre à l’agriculture sont à l’origine d’une évolution rapide des représentations sociales associées à l’insecte. Cette évolution contribue à diversifier les profils des éleveurs, à détacher les pratiques du poids des traditions d’élevage ou de cueillette, et à concevoir la méliponiculture comme une activité de loisir voire à envisager son intégration dans une logique marchande.
In central America, stingless beekeeping is a practice older than two thousand years which reached its peak at the end of the Maya era. The melipona sub-family which these bees belong to gather more than 500 species mainly in the intertropical area. Most of them nest in cavities, in dead wood or underground, and have a liking for ombrophile forests where they provide the pollinisation of wild plantes in Cuba. There is only are single species (Melipona beecheii) probably introduced during the pre-colombian era, from genetic strains deriving from the Yucatan peninsula. In the countryside surrounding Havana, the melipona bees are still a vector of socialization, knowing their domestication often results from a familial tradition and is profitable to the beekeeper’s relatives. On the other hand, in the forest, honey is the fruit of gathering. For twenty years now people have been aware of the essential function of bees in the ecosystem and of the valuable services they are able to provide agriculture. This awareness has launched a quick evolution in the social representation of the insect. Thanks to this evolution the beekeepers’ profiles are becoming more diverse, traditions in beekeeping or gathering, weigh less heavily on practices, and the meliponiculture can be regarded as a space-time activity or even a trade one.
Cuba

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
urn:doi:10.4000/etudescaribeennes.6967
http://journals.openedition.org/etudescaribeennes/6967

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Croton urucurana Baillon (Euphorbiaceae), plant species popularly known in Brazil as “sangra-d’água”, is commonly found in Mato Grosso do Sul State (midwestern Brazil), where its latex is popularly used to treat several types of cancer. Despite the ethnopharmacological significance of the species, no phytochemical or cytotoxic studies of its latex have been published. In this context, the aim of the present study was to assess the cytotoxic activity of crude extracts, fractions and isolated compound from the latex of C. urucurana and to investigate the effects of crourorb A1 on the viability, apoptosis, cell cycle and cell migration of human hepatocarcinoma cell lines (Huh-7). Also, we have evaluated the viability of Huh-7 cells treated with crourorb A1 in 3D collagen gels. The cytotoxicity was detected using the sulforhodamine B (SRB) assay against six human cancer cells lines and one nontumor NIH/3T3 cell line (murine fibroblast). Studies on the mechanism of cell death of crourorb A1 were conducted in different test systems in vitro. The bioactive ethyl acetate phase obtained from the latex of C. urucurana afforded a novel cyclic peptide, [1−9-NαC]-crourorb A1, that proved active against NCIADR/ RES (ovary, multidrug-resistance phenotype) cells with the same potency as doxorubicin (positive control) and inactive up to the highest concentration tested against nontumor NIH/3T3 cells (GI50 = > 250 μg/mL). Crourorb A1 treatment decreases the cell viability of Huh-7 at dose and time dependent manner associated with induction of apoptosis by caspase 3/7 activation and increasing expression of pro-apoptotic proteins: Bak, Bid, Bax, Puma, Bim, and Bad and clived-caspase3 protein. The JNK/MAP pathway is involved in this induced cell death. Crourorb A1 effect is also associated with G2/M phase cell cycle arrest. In parallel, we observed that crourorb A1 treatment resulted in an increase of cyclin-dependent kinase (CDK1), cyclin B1 and cyclin D1 expressions. A significant reduction of Huh-7 cells migration by crourorb A1 can be assessed and we also show that cells grown on 3D collagen gels exhibited increased resistance to crourorb A1 when compared to 2D cell culture.
Croton urucurana Baillon (Euphorbiaceae), est une plante très connue et utilisée en médecine traditionnelle au Brésil, la «sangra-d’água» retrouvée dans l'État du Mato Grosso do Sul (région Centre-Ouest du Brésil). Son latex est abondamment utilisé en médecine traditionnelle dans le traitement de plusieurs types de cancer. En dépit de son importance ethnopharmacologique, on ne trouve aucune étude sur sa composition chimique ou sur sa potentielle activité anti-cancéreuse. L’objectif de ce travail a été d'évaluer l'activité cytotoxique des extraits totaux, fractions d’extraits et de molécules purifiées, isolées du latex de C. urucurana. Nous avons étudié plus particulièrement les effets du crourorb A1 sur la viabilité, l'apoptose, le cycle cellulaire et la migration de cellules issues de carcinome hépatocellulaire humaine (Huh-7). Nous avons également évalué l’effet du crourorb A1sur la viabilité des cellules Huh-7 cultivées dans les gels de collagène en 3D. L' activité cytotoxique ont été réalisées par le test à la sulforhodamine B sur six lignées cellulaire cancéreuses et sur une lignée cellulaire non cancéreuse de fibroblastes murins, les cellules NIH/3T3. L'étude phytochimique de la fraction ‘acétate d'éthyle’ du latex de C. urucurana bioguidé a permis d’obtenir un nouveau cyclopeptide que nous avons nommé [1-9-NαC]-crourorb A1. Le crourorb présente une cytotoxicité puissante sur la lignée cellulaire cancéreuse NCI-ADR/RES (ovaire, le phénotype de multirésistance) à un niveau équivalent à celle de la doxorubicine (témoin positif). Ce composé est de plus pratiquement inactif (GI50 = >250 μg/mL) sur la lignée non cancéreuse NIH/3T3. L'évaluation de la cytotoxicité in vitro du crourorb A1 (test wst1) sur les cellules Huh-7 a démontré que la viabilité des cellules est inhibée de manière dose et temps-dépendant. Nous avons mesuré une forte activation des caspases 3 et 7 et une nette augmentation de l’expression des protéines pro-apoptotiques (Bak, Bid, Bax, Puma, Bim et Bad) ainsi que de la caspase 3 clivée par le crourorb A1. Nous avons également déterminé que la voie de signalisation JNK-MAPkinase semble nécessaire à l’induction de la mort cellulaire des cellules Huh-7 traitées au crourorb A1. Le crourob A1 induit un arrêt du cycle cellulaire en phase G2/M. En parallèle, les expressions de la cycline-dépendante kinase CDK1, des cyclines B1 et D1 sont augmentées après traitement au crourorb A1. De plus, le crourorb A1 a un effet inhibiteur significatif de la migration des cellules Huh-7, en présence ou absence de mitomycine C. Nous avons également confirmé, l’effet inhibiteur du crourob A1 sur la viabilité des cellules Huh7 cultivées en 3D dans les gels de collagène 1 et démontré que les cellules cultivées en 3D semblent plus résistantes au crourorb A1 par rapport aux cultures en monocouche 2D.
Croton urucurana Baillon (Euphorbiaceae) é uma espécie arbórea conhecida popularmente no Brasil como “sangra d´água”, comumente encontrada no estado de Mato Grosso do Sul, onde seu látex tem sido utilizado na medicina popular no tratamento de vários tipos de câncer. Apesar de sua importância etnofarmacológica, não há relatos de estudos relacionados à sua composição química ou atividades anticâncer na literatura. Nesse contexto, o objetivo do presente estudo foi avaliar a atividade citotóxica de extratos, fases, frações e da substância isolada do látex de C. ururucurana e investigar os mecanismos celulares e moleculares in vitro responsáveis pela citotoxicidade da substância isolada considerando seu potencial apoptótico e influência sobre a progressão do ciclo celular em uma linhagem de hepatocarcinoma celular humano (Huh-7), bem como, os efeitos desta substância sobre a migração e viabilidade de células Huh-7 cultivadas em geis de colágeno em 3D. O ensaio de citotoxicidade in vitro foi realizado com o corante sulforrodamina B (SRB) em seis linhagens de células neoplásicas humanas e uma linhagem de células não neoplásicas NIH/3T3 (fibloblasto murinho). Os estudos de mecanismos de ação com crourorb A1 foram conduzidos em diferentes sistemas-teste in vitro. O estudo fitoquímico biomonitorado da fase bioativa acetato de etila do látex de C. urucurana resultou no isolamento de um novo ciclopeptídeo denominado [19-NαC]-crourorb A1, que apresentou potente atividade citotóxica frente à linhagem de células neoplásicas NCI-ADR/RES (ovário com fenótipo de resistência a múltiplos fármacos), com a mesma potência que a doxorrubicina (controle positivo), e foi inativa até a maior concentração testada (GI50 = >250 μg/mL) frente à linhagem de células não neoplásicas 3T3. A exposição de células Huh-7 ao crourorb A1 resultou em uma diminuição da viabilidade celular de maneira dose e tempo-dependentes. Nós observamos um aumento da atividade de caspases 3 e 7 e um aumento da expressão de proteínas próapoptóticas (Bak, Bid, Bax, Puma, Bim e Bad) e caspase 3 clivada após tratamento com crourorb A1. Além disso, observamos que a via de sinalização celular MAP/JNK foi necessária para induzir a morte celular em células Huh-7 tratadas com crourorb A1. Os efeitos de crourorb A1 foram também associados com o acúmulo de células na fase G2/M do ciclo celular. Em paralelo, as expressões da cinase dependente da ciclina (CDK1), ciclina B1 e ciclina D1 foram aumentadas após tratamento com crourorb A1. Foi demonstrado também o envolvimento de crourorb A1 na redução da migração de células Huh-7 cultivadas na presença e ausência de mitomicina C. A avaliação da viabilidade de células Huh-7 cultivadas em geis de colágeno em 3D apontou uma maior resistência destas células ao crourorb A1 quando comparadas com a cultura de células em 2D.
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NNT : 2016REN1B010
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Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : Eperua falcata (Aublet), a late-successional species in tropical rainforest and one of the most abundant tree in French Guiana, has developed an original strategy concerning N-acquisition by largely preferring nitrate, rather than ammonium (H. Schimann, S. Ponton, S. Hattenschwiler, B. Ferry, R. Lensi, A.M. Domenach, J.C. Roggy, Differing nitrogen use strategies of two tropical rainforest tree species in French Guiana: evidence from N-15 natural abundance and microbial activities, Soil Biol, Biochem. 40 (2008) 487-494). Given the preference of this species for nitrate, we hypothesized that root exudates would promote nitrate availability by (a) enhancing nitrate production by stimulating ammonium oxidation or (b) minimizing nitrate losses by inhibiting denitrification. Root exudates were collected in situ in monospecific planted plots. The phytochemical analysis of these exudates and of several of their corresponding root extracts was achieved using UHPLC/DAD/ESI-QTOF and allowed the identification of diverse secondary metabolites belonging to the flavonoid family. Our results show that (i) the distinct exudation patterns observed are related to distinct root morphologies, and this was associated with a shift in the root flavonoid content, (ii) a root extract representative of the diverse compounds detected in roots showed a significant and selective metabolic inhibition of isolated denitrifiers in vitro, and (iii) in soil plots the abundance of nirK-type denitrifiers was negatively affected in rhizosphere soil compared to bulk. Altogether this led us to formulate hypothesis concerning the ecological role of the identified compounds in relation to N-acquisition strategy of this species. (C) 2013 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.
ISSN: 0981-9428

hal-01032437
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DOI : 10.1016/j.plaphy.2013.05.003

Éditeur(s) : HAL CCSD Ecole nationale du génie rural
Résumé :  
Le Groupement d'Intérêt scientifique (GIS) Silvolab-Guyane coordonne, depuis 1992, les actions de recherche ou de développement sur la forêt tropicale en Guyane, à partir d'orientations scientifiques cadrées et sur financements publics. Les programmes sont exécutés par les chercheurs des organismes membres du GIS, éventuellement en partenariat avec des laboratoires métropolitains ou des instituts étrangers. L'objectif est d'enrichir les connaissances sur la description, la dynamique et l'évolution des écosystèmes pour mieux protéger, gérer ou valoriser la forêt en tant que ressource naturelle. Outre la réalisation conjointe de projets ciblés sur une problématique particulière, la mise en commun d'équipements transversaux tels les laboratoires, l'herbier de Cayenne, le centre de documentation de Kourou, mais aussi et surtout les stations de terrain et les dispositifs expérimentaux, sont des atouts majeurs du GIS.
ISSN: 0035-2829

hal-01032106
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Éditeur(s) : HAL CCSD Éditions de la Maison des sciences de l'homme
Résumé : International audience
For over a century, the complementary nature of fishing and farming activities in the floodplain of the Rufiji River (Tanzania) has formed the basis of the economy in its villages. Starting in the 1970s, the fishery evolved from a seasonal activity practiced on foot during flooding and using traditional traps to year-round dugout canoe operated lake fisheries using nets.The paper analyses the drivers of this change. After having rejected the simplistic technocratic hypothesis that technical innovation equals progress, the paper examines the relevance of the productivity of the different fishing techniques in the light of the evolution of the role of fisheries in the village economy. During the change-over period, the national and international economy deprives the villages of their main habitual sources of cash income. In the absence of any alternative, fisheries imposed themselves as the unique source of cash income, a function they can only fulfil if practiced year-round and this can only be achieved using canoes and nets. However, the perception of the causes of these changes in the villages is differentiated. For those who initiated the change-over, and who are now of an advanced age, the main driver of the transition to nets was the empowerment of the youth versus the elders. Such an interpretation resonates well with the economic determinants. However, it requires considering the modernisation process as a contextualised multi-sided expression of market globalisation.
Depuis plus d’un siècle, l’économie des villages de la plaine inondable du Rufiji (Tanzanie) est fondée sur la complémentarité des activités agricoles et des activités halieutiques. À partir de la fin des années 1970, les pêches traditionnelles à la nasse, pratiquées à pied saisonnièrement lors de la crue annuelle, sont supplantées par les pêches embarquées (pirogues monoxyles) au filet dans les lacs, pratiquées elles toute l’année. L’article s’interroge sur les déterminants de cette substitution.Après avoir rejeté l’hypothèse techniciste vulgaire qui voudrait que l’innovation technique soit synonyme de progrès, la pertinence du critère de productivité des différentes techniques de pêche est examinée à la lumière de l’évolution de la place des activités halieutiques dans l’économie villageoise. Il apparaît qu’à partir de cette époque, l’évolution économique nationale et internationale prive les villageois de leurs principales ressources monétaires habituelles. En l’absence de toute alternative, la pêche s’impose alors comme unique source de revenu monétaire, une fonction qu’elle ne peut remplir qu’à condition d’être pratiquée tout au long de l’année, ce que seules les techniques au filet permettent. Cependant, les représentations villageoises des causes de la généralisation de la pêche au filet sont différentes. Pour ceux d’entre eux, aujourd’hui très âgés, qui furent les pionniers de cette innovation, c’est le souci d’émancipation des cadets vis-à-vis des aînés qui aurait été le moteur de l’adoption de techniques de pêche au filet. Ce point de vue entre en résonance avec les déterminations économiques à condition de considérer le processus de modernisation comme manifestation multiforme contextualisée de la mondialisation marchande.
ISSN: 0248-6016

hal-01344410
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https://hal.univ-antilles.fr/hal-01344410/file/Pauletal2015Version_Def.pdf

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Herbicides are generally the most extensively used of the pesticides applied to agricultural crops. However, the literature contains little evidence useful in assessing the potential sources of the general population's exposure to herbicides, including by residential proximity to crops.The objective of this study was to take advantage of data from the PELAGIE mother–child cohort to identify the main determinants of the body burden of exposure to the chloroacetanilide and triazine herbicides commonly used on corn crops in Brittany, France, before 2006. Urine samples from a randomly selected subcohort of women in the first trimester of pregnancy (n=579) were assayed for herbicide metabolites. The residential exposure resulting from proximity to corn crops was assessed with satellite-image-based scores combined with meteorological data. Data on diet, drinking tap water (from the public water supply), occupations, and household herbicide use were collected by questionnaires.Herbicides were quantified in 5.3% to 39.7% of urine samples. Alachlor and acetochlor were found most frequently in the urine of women living in rural areas. The presence of dealkylated triazine metabolites in urine samples was positively associated with residential proximity to corn crops (OR=1.38, 95% CI: 1.05–1.80). Urinary metabolites of both atrazine and dealkylated triazine were correlated with tap water consumption (OR=2.94, 1.09–7.90, and OR=1.82, 1.10–3.03, respectively); hydroxylated triazine metabolites were correlated with fish intake (OR=1.48, 1.09–1.99).This study reinforces previous results that suggest that environmental contamination resulting from agricultural activities may contribute to the general population's exposure to herbicides.
ISSN: 0160-4120

hal-01107546
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01107546
DOI : 10.1016/j.envint.2013.10.010
PUBMED : 24246238

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier Elsevier Masson
Résumé : International audience
Prostate cancer is the most frequent cancer affecting men in most Western countries. Certain risk factors have been identified (age, family history, ethnic origin), but the aetiology of this cancer remains largely unknown. However, a role for environmental factors is strongly suspected. Questions have been raised concerning the role of the chemical substances generated by human activities in the occurrence of this disease. Diverse studies have consistently demonstrated a higher risk of prostate cancer in agricultural populations than in the general population. The hypothesis that this higher risk is linked to the use of pesticides has been tested in a number of studies, mostly in North America and Europe. However, to date, with a few possible exceptions, it has been impossible to demonstrate a significant association between exposure to pesticides or a chemical family of pesticides and prostate cancer. Studies have also been carried out on the role of exposure to trace metals, such as cadmium, or to pollutants from industry, such as polychlorobiphenyls. However, no firm conclusions have been drawn. Finally, the effect of chemical substances with endocrine disruptor activity on the occurrence of prostate cancer remains largely unexplored in epidemiological studies. In the face of these uncertainties, rigorous studies are required, with objective measurements of exposure, taking into account confounding factors and individual risk factors, making it possible to assess gene-environment interactions.
ISSN: 1297-9589

inserm-00524579
http://www.hal.inserm.fr/inserm-00524579
DOI : 10.1016/j.gyobfe.2008.07.005
PUBMED : 18693059

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Anti-Müllerian hormone (AMH) is a member of the TGF-ß superfamily. AMH is well known for its role in Müllerian duct regression in male fetuses. Postnatally, AMH is secreted by granulosa cells (GCs) of small growing follicles (preantral and small antral). However, despite the increasing interest of ovarian AMH in clinics, little is known on its mechanism of action and its role in female reproductive tract. My PhD project focuses on the identification of AMH function in the female reproductive tract.AMH signals through a type II transmembrane serine/threonine kinase receptor (AMHR-II) which forms a complex with a type I serine/threonine kinase receptor (ActR-IA, BMPR-IA, BMPR-IB). The type II receptor phosphorylates serine and threonine residues of type I receptor. Once activated, the type I receptor phosphorylates the receptor-regulated Smads (R-Smad1/5/8) which interact with a common partner Smad4. The Smad complex accumulates into the nucleus and regulates target gene expression. This canonical signalling pathway is regulated at different levels, in particular by co-receptors which amplify or antagonize TGF-ß family members action. The type I receptors and R-Smads involved in AMH effects on post-natal GCs remain unknown. In addition, to date, no co-receptor has been found for AMH. To define the involvement of the different type I receptors, we used siRNA technology to inactivate Acvr1, Bmpr1a and Bmpr1b in GC. In parallele, we analysed GC extracted from conditional mutant mice for Acvr1 and Bmpr1a. We found that BMPR-IA is the most important type I receptor for AMH to transduce its signal in GC. A Smad-Gal4/UAS-luciferase reporter gene technology allowed us to show that Smad1 and 5 are involved in AMH signaling pathway. Recently, new BMPs coreceptors were found, RGMs for Repulsive Guidance Molecules. There are three RGMs : RGMa, b and c. Because AMH shares with BMPs its type I receptors and R-Smad proteins, we hypothesized that they also share the same co-receptors, the RGM. We showed that RGMb was the only one expressed in GC and after siRNA transfection we demonstrated that this coreceptor is not essential for AMH to transduce its signal.To date, only few AMH target genes have been identified. Aromatase (Cyp19a1) and LH receptor (Lhcgr) are down-regulated by AMH in rat and porcine GCs. We used micro-array technology (Affymetrix) by comparing Wt and knockout immature ovaries to find new AMH target genes. This experiment evidenced that Ovgp1 and Kcnj2 are two new potential AMH target genes in the ovary.The last part of my project was to define a potential role of AMH in murine uterus. Only one study showed that AMHR-II is expressed in the mouse myometrium. We showed that Amh gene is slightly expressed in uterus but the results are not confirmed at the protein level. Using PCR-array, we found a lot of differentially expressed genes between Wt and Amh KO uterus. Therefore, AMH could regulate uterine function through the modulation of different genes located in the myometrium.
L’hormone anti-Müllerienne (AMH) est un membre de la famille TGF-β impliquée dans la différenciation du tractus reproductif mâle. Elle est aussi exprimée par les cellules de la granulosa de l’ovaire adulte. Cependant, son rôle physiologique chez la femelle n’a pas encore été entièrement établi. Mon projet de thèse a pour objectif d’élucider le(s) rôle(s) de l’AMH dans le tractus reproductif femelle. L’AMH transduit ses effets par l’intermédiaire de deux récepteurs transmembranaires sérine/thréonine kinase : un récepteur de type II qui lui est spécifique (AMHR-II) et un récepteur de type I (ActR-IA, BMPR-IA, BMPR-IB) qu’elle partage avec les BMPs. Après fixation de l’hormone sur le récepteur de type II, celui-ci recrute et phosphoryle le récepteur de type I. Ce dernier phosphoryle à son tour les Smads spécifiques (Smad1, 5 et 8) qui s’associent à la Smad commune, Smad4. L’ensemble transloque dans le noyau et en association avec des facteurs de transcription régule les gènes cibles de l’hormone. L'utilisation de souris KO conditionnelles pour les récepteurs Acvr1 et Bmpr1a et d'une technique de siRNA dirigés contre chacun des trois récepteurs de type I a permis de mettre en évidence que le récepteur BMPR-IA est un acteur essentiel de la voie de signalisation de l'AMH dans les cellules de la granulosa. Pour déterminer la ou les Smad(s) impliquées, une technique de gènes rapporteurs, Smad-Gal4/UAS-luciférase, a été utilisée. Nous avons pu montrer que les Smad1 et 5 sont importantes pour la transduction du signal de l'AMH dans les cellules de la granulosa. Récemment des corécepteurs aux BMPs, les Repulsive Guidance Molecule (RGMs), ont été mis en évidence. L’AMH partageant sa voie de signalisation avec les BMPs, nous avons cherché à déterminer si ces corécepteurs pouvaient également intervenir dans la voie de signalisation de l’AMH. Il existe 3 types de RGMs: RGMa, RGMb et RGMc. Nous avons montré en q-PCR que seul RGMb est exprimé dans les cellules de la granulosa alors que les 3 RGMs sont exprimés dans l’ovaire. L'utilisation de siRNA dirigés contre RGMb a permis de montrer que ce récepteur n'est pas nécessaire à la transduction du signal de l'AMH. Actuellement, seuls deux gènes cibles de l’AMH sont connus dans les cellules de la granulosa : l’aromatase et le récepteur LH. Nous avons réalisé des analyses de puces à ADN (ou micro-array) pour décrire de nouveaux gènes cibles de l'AMH. L'analyse des puces a permis de décrire de nouveaux gènes régulés par cette hormone tels qu’Ovgp1 ou Kcnj2. La dernière partie de mon projet visait à déterminer un rôle potentiel de l'AMH dans l'utérus. En effet, le récepteur de cette hormone est exprimé dans le myomètre utérin de souris permettant de supposer qu’elle peut agir sur cet organe. Nous avons pu mettre en évidence une expression faible du gène de l’Amh dans l’utérus. En revanche, l’expression et la localisation de la protéine restent encore à définir. Une expérience de PCR-array a permis de montrer que de nombreux gènes sont différentiellement exprimés entre l’utérus Wt et l’utérus KO Amh. Ceci indique que l’AMH jouerait un rôle sur la régulation de la fonction utérine qu’elle soit exprimée ou non dans cet organe.
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NNT : 2014PA11T014
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Éditeur(s) : HAL CCSD Ecole nationale du génie rural
Résumé :  
Cet article vise à montrer que, depuis les premiers essais de sylviculture interventionniste en forêt tropicale humide, les approches ont évolué et ont permis de mettre en lumière les réactions des peuplements forestiers à certains types d'actions sylvicoles : exploitation forestière et éclaircie. L'effet stimulant de ces interventions sur la dynamique forestière et sur la reconstitution des stocks exploitables en forêt a été montré sur tous les dispositifs expérimentaux installés en forêt tropicale, et en particulier sur ceux de Guyane. Il existe cependant des limites : l'ouverture excessive, que l'on a évaluée à Paracou à l'équivalent de l'élimination de plus de un tiers de la surface terrière initiale, n'a plus d'effet sur la croissance tandis qu'elle favorise l'invasion des peuplements par des espèces pionnières et héliophiles sans intérêt commercial ; l'effet des ouvertures est limité dans le temps d'où l'intérêt, lorsque l'on ne peut pratiquer d'éclaircie complémentaire aux exploitations, de ne pas opter pour des durées de rotation trop longues. Il est alors crucial d'utiliser l'exploitation comme un véritable outil sylvicole et en particulier de limiter au maximum les dégâts causés au peuplement résiduel : les auteurs présentent les enjeux et les modalités de l'exploitation à faible impact pour la Guyane.
ISSN: 0035-2829

hal-01032159
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Éditeur(s) : HAL CCSD Springer Verlag/EDP Sciences
Résumé :  
On 10 trees from 10 species of French Guyana tropical rainforest in a clear active process of restoring verticality growth strains were measured in situ in order to determine the occurrence of tension wood within samples. Wood specimens were cut in the vicinity of the growth strains measurements in order to measure some mechanical and physical properties. As suspected, tensile growth strains was very much higher in tension wood zone, because longitudinal modulus of elasticity was slightly higher. Longitudinal shrinkage was also much higher in tension wood than in opposite wood.
ISSN: 1286-4560

hal-01032110
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01032110
DOI : 10.1051/forest:2007027