Crustaces profonds captures aux casiers aux Antilles françaises - 1996 Auteur(s) : Paulmier, Gerard Résumé : For several years the fishermen of the West Indies have directed their activities towards new fishing grounds, notably the bathyales zones adjacent to island plateaux up to approximately 1000 metres in depth. Explorations carried out since 1989 have shown that diverse crustacean populations could be exploited. However, populations and exploitable stocks are not well known. The use of crustaceans traps as a fishing technique permits the capture of shellfish, shrimps and prawns of which at least six species could have commercial interest. The main objective of this work is do draw up an inventory of the principal commercial species as well as the accompanying species belonging to the subordres Decapoda macrura, anomura, brachyura and to the orders Isopoda and Amphipoda. It is intended for fishermen and other socio-professionals of the fishing industry. It should enable them to identify and name these previously unexploited varieties of Crustacea to facilitate their sale in local markets. Depuis quelques années, des pêcheurs antillais orientent leurs activités vers de nouveaux secteurs de pêche, notamment les zones bathyales adjacentes aux plateaux insulaires, jusque vers 1000 mètres de profondeur. Des campagnes exploratoires menées depuis 1989, ont montré que diverses populations carcinologiques pouvaient faire l'objet d'une exploitation. Toutefois, populations et stocks exploitables ne sont pas bien connus. L'emploi du casier comme technique de pêche, permet la capture de crustacés, crevettes et langoustines, dont au moins 6 espèces peuvent avoir un intérêt commercial. Ce travail nomenclatural a pour premier objectif de dresser l'inventaire des principales espèces commerciales ainsi que des espèces accompagnatrices appartenant aux infra-ordres des Décapodes macroures, anomoures, brachyoures, et aux ordres des Isopodes et des Amphipodes. Il est destiné aux pêcheurs et aux autres personnes des catégories socio-professionnelles de la filière pêche. Il devrait leur permettre d'identifier et de nommer ces produits nouveaux pour faciliter leur vente sur les marchés locaux. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1996/rapport-1543.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1543/ | Partager |
Filamentous ascomycete genomes provide insights into Copia retrotransposon diversity in fungi Auteur(s) : Donnart, Tifenn Piednoël, Mathieu Higuet, Dominique Bonnivard, Éric Auteurs secondaires : Evolution des Génomes Eucaryotes (EGE) ; Systématique, adaptation, évolution (SAE) ; Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) - Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) - Evolution Paris Seine ; Université Nice Sophia Antipolis (UNS) ; Université Côte d'Azur (UCA) - Université Côte d'Azur (UCA) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) - Université des Antilles et de la Guyane (UAG) - Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC) - Université Nice Sophia Antipolis (UNS) ; Université Côte d'Azur (UCA) - Université Côte d'Azur (UCA) - Université des Antilles et de la Guyane (UAG) Department of Plant Developmental Biology ; Max Planck Institute for Plant Breeding Research (MPIPZ) Éditeur(s) : HAL CCSD BioMed Central Résumé : International audience Background: The relative scarcity of Copia retrotransposons has been recently characterized in metazoans in comparison with the other superfamilies of LTR elements. Furthermore, Copia retrotransposons have often a particular dynamics that results in a highly predominant single clade of elements within a large host taxon, such as the GalEa-like retrotransposons in crustaceans. Taking advantage of the skyrocketing amount of genomic data available for fungi, we carried out the first large-scale comparative genomic analysis of the Copia clades in filamentous ascomycetes.Results: Screening 30 completely sequenced genomes allowed us to identify more than 2500 Copia copies with conserved LTR, which are distributed in 138 families. Their characterization revealed that fungal Copia diversity is much broader than previously thought with at least 27 clades, 23 of which likely correspond to new ones. While the Copia copy number is low in most species, the two clades GalEa and FunCo1 are widely distributed and highly dominate Copia content as they both account for 80% of the detected sequences.Conclusions: In Fungi, GalEa retrotransposons are restricted to Pezizomycotina in which they can make up an outstandingly high proportion of the genome (up to 10% in Cenococcum geophilum). At last, we revealed that fungal GalEa elements structurally differ from all other Copia elements with an absence of Primer Binding Site. These elements however harbor a Conserved Hairpin Site which is probably essential for their transposition.sequences. ISSN: 1471-2164 Droits : http://creativecommons.org/licenses/by/ hal-01529914 http://hal.upmc.fr/hal-01529914 http://hal.upmc.fr/hal-01529914/document http://hal.upmc.fr/hal-01529914/file/art_10.1186_s12864-017-3795-2.pdf DOI : 10.1186/s12864-017-3795-2 | Partager |
Caractérisation de la contamination de la faune halieutique par la chlordécone autour de la Guadeloupe. Résultats des campagnes de 2008 à 2011 (projet CarGual). Auteur(s) : Bertrand, Jacques Guyader, Olivier Reynal, Lionel Résumé : In the French West Indies islands, the transfer of chlordecone (kepone) from treated grounds towards the marine environment has been proved since the beginning of 2000s. In 2008, a maximal residue limit (MRL) was set at 20 µg / kg wet weight in fish and seafood, and therefore intensified the concern about the risks of high human exposure to the pesticide due to the consumption of contaminated marine products. To answer this concern, several sampling cruises were carried by public authorities and by Ifremer in order to analyze the contamination of the fish fauna around the Guadeloupe island. The data collected within these surveys improved our knowledge on the characteristics of the contamination of fish fauna and allowed to assess the distribution of this contamination in relation with optional geographical plans of the marine area around the Guadeloupe island. Further, this study was completed by an assessment of the fishery activity in areas which are the more exposed to the chlordecone contamination, taking into account data from a fishery observatory which has been set up in the archipelago since 2007.
The results allow to precise two main characteristics of distribution of the contamination: its spatial and specific dimensions. About the spatial aspect, contamination of the fish fauna is centred on marine areas which are closely downstream contaminated watersheds. Concerning the marine fauna, two species groups are particularly exposed: the very coastal ones, particularly those living at or close to the mouth of rivers, and crustaceans wherever they live. Among fishes, the most contaminated species belong to many various groups which are present in the very coastal belt, more or less regularly. Lastly, this study provided orders of magnitude on the relative part of the fishery activity around the archipelagos for which the contamination is of great concern. Aux Antilles, l’existence d’un transfert de la molécule de chlordécone des sols traités vers le milieu marin est avérée depuis le début des années 2000. L’établissement d’une limite maximale de résidus à 20 µg/kg pf pour tous les produits marins en 2008 y a intensifié la préoccupation vis-à-vis des risques d’exposition des populations humaines par les produits de la pêche. Pour répondre à cette préoccupation, depuis 2008, plusieurs campagnes d’échantillonnage ont été réalisées par les services de l’Etat (DAAF) et par l’Ifremer pour analyser la contamination de la faune halieutique autour de la Guadeloupe. Les données collectées de 2008 à 2011 par ces plans d’observation ont été utilisées pour actualiser les connaissances sur les caractéristiques de la contamination de la faune halieutique autour de la Guadeloupe, et analyser cette distribution en référence à différents schémas de segmentation du domaine marin. L’étude a été complétée par une analyse de l’activité halieutique dans les secteurs les plus sensibles à la contamination, à partir des données du système d’informations halieutiques déployé dans l’archipel depuis 2007. L’analyse a permis de préciser deux traits majeurs de cette distribution : sa dimension spatiale et son caractère spécifique. Sur le plan spatial, la contamination de la faune halieutique est centrée sur les espaces maritimes situées immédiatement en aval des bassins versants contenant des sols contaminés. Sur le plan faunistique, deux groupes apparaissent particulièrement sensibles, les espèces très côtières, en particulier celles fréquentant les embouchures des cours d’eau, et les crustacés, quelque soit leur milieu de vie. Chez les poissons, parmi les espèces contaminées, on trouve un large cortège d’espèces fréquentant plus ou moins régulièrement la bande littorale. Enfin, l’étude a permis de fournir des ordres de grandeur sur la part de l’activité halieutique de l’archipel directement concernée par cette pollution. Droits : 2013 Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/00136/24762/22840.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00136/24762/ | Partager |
Feeding behaviour of Anguilla anguilla and trophic resources in the Ingril Lagoon (Mediterranean, France) Auteur(s) : Bouchereau, Jean-Luc Marques, Catarina Pereira, Patricia Guélorget, Olivier Lourié, Sven-Michel Vergne, Yvan Auteurs secondaires : Systématique, adaptation, évolution (SAE) ; Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Ecosystèmes lagunaires : organisation biologique et fonctionnement (ECOLAG) ; Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2) - Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Éditeur(s) : HAL CCSD Station Biologique Résumé : International audience This study focuses on the diet of the eel Anguilla anguilla, sampled during one month of each of the four seasons from autumn 1998 to summer 1999 in the Languedocian Ingril Lagoon (Gulf ot Lion). The following feeding indices were calculated based on observations of 11 categories of prey found in the contents of full stomachs: coefficient of vacuity (CV), degree of fullness (DR), occurrence frequency (PP, in %), relative abundance (N, in %) and relative weight (P, in %). A parallel monitoring of the benthic macrofauna was conducted in autumn and spring. The interpretation of the results is based on the degree III of the scale of confinement established by Guélorget & Perthuisot (1983) and on the Costello et al. (1990) method, which combines PP and N. A. anguilla mainly feeds on benthic organisms, primarily amphipods crustaceans, polychaetes, insect larvae and small fish. The eel's feeding activity is very low in November and February and usually increases during May. The trophic quality available to the eel population in the Ingril Lagoon depends on its hydrodynamic variables, which are directly related to its close communication with the sea. Changes observed in the eel's diet over this year long study illustrate an opportunist type of feeding behaviour that reflects the typical composition of the macroinvertebrate species assemblage at a given point in time. Eels consume the type of benthic prey that is most available at a given moment without using a particular feeding strategy (e.g., specialisation or generalisation). The eels adapt by shifting their diet according to the energetic resources available in the ecosystem, which vary depending on hydrological regime. Thus, the facultative catadromous migrant species Anguilla anguilla could be used as a bioindicator of changes in the biological zonation and in the available food resources in the brackish ecosystem of Ingril Lagoon during its lagoon-resident ecophase. ISSN: 0007-9723 hal-00753020 https://hal.univ-antilles.fr/hal-00753020 | Partager |
Transmission per os du white spot syndrome virus : facteur limitant l'extension de la maladie chez les crustacés marins Auteur(s) : Hernandez Herrera, Rosa Idalia Éditeur(s) : Université de Montpellier II Résumé : Penaeid family shrimp constitute the first aquaculture product in the world in terms of commercial value. They are produced in third world countries of the sub-equatorial belt. Among the causes limiting their production, one is the presence of the WSSV (White Spot Syndrome Virus), a pathogenic agent that produces massive mortality. Our aim was to investigate the first stages of the viral infection, in order to be used as target of prophylactic actions. A fish cell line (SSN-1) was used as model to tentatively develop in vitro studies. Only defective particles were produced confirming the high specificity to crustacea of the infection with crustacean virus. Electron microscopy showed structural similarities between the WSSV and B, B2 and Baculo-B viruses of crabs. This suggests B2 may belong also to the family Nimaviridae, genus Whispovirus. This comparison with B2 virus gives the possibility to understand the role played by the tail-like extension of these viruses in the infectious process by attachment to the plasmic membrane at the beginning of the infection in its specific host. Les crevettes de grande taille de la famille des Penaeidae constituent le premier produit aquacole en valeur commerciale à l'échelle planétaire. Elles sont produites à 99% dans les pays en voie de développement de la ceinture sub-équatoriale. Parmi les causes limitant leur production, le White Spot Syndrome Virus est l'agent pathogène ayant provoqué le plus des pertes dans le monde. Notre étude a été orientée vers la reconnaissance des premiers stades de l'infection, susceptibles d'être la cible d'une action prophylactique. Nous avons testé l'utilisation d'une lignée cellulaire de poisson SSN-1 afin d'étudier les possibilités d'un développement in vitro. Seules des particules défectives ont été produites confirmant la haute spécificité des infections à virus de crustacés. Les recherches en microscopie électronique ont montré une similarité structurale du WSSV avec les virus (B, B2 et Baculo-B) des crabes. Ceci suggère que ces agents (B2 et WSSV) seraient tout deux de la famille des Nimaviridae et du genre Whispovirus. La comparaison avec le virus B2 permet de comprendre le rôle clef joué par la partie caudale de ces virus dans l'infection par son attachement à la membrane plasmique lors de l'infection chez son hôte spécifique. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/these-6650.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6650/ | Partager |
Contribution a l'étude des xylophages marins Auteur(s) : Deschamps, P. Éditeur(s) : ISTPM Résumé : These first results might clarify some problems linked to the biology of tarets and other small lignivorous crustaceans. The systematic of the molluscs Teredinidae, so complex, is only based on the study of pallets, which is a great source of confusion when one has to examine the woods after the molluscs' death. We tried to distinguish the species by examining the striates and denticulations on the shelves. The size of the intervals between the striates and the proportional size of the denticulations, as well as the shape of the denticulation marks of the middle part, can indeed allow us to differentiate between some species. [...] Ces premiers résultats pourront peut-être jeter quelque clarté sur les problèmes se rapportant à la biologie des tarets et des petits crustacés lignivores. La systématique des mollusques Teredinides, si complexe, a été fondée uniquement sur l'examen des palettes, ce qui est une source de confusion lorsqu'on est obligé, ce qui est le cas le plus fréquent, d'examiner les bois après la mort des mollusques. Nous avons cherché à distinguer les espèces par les stries et les denticulations visibles sur les coquilles. Les dimensions des intervalles séparant les stries et la taille proportionnelle des denticulations, ainsi que la forme de l'empreinte des denticulations de la partie moyenne peuvent différencier, effectivement, quelques espèces. C'est ainsi que Teredo pedicellata et Teredo navalis sont immédiatement distingués à l'examen des stries; de même Bankia minima et Bankia badigaensis. Mais il faut, bien entendu, tenir compte des variations individuelles, les denticulations pouvant être plus ou moins fortes chez une même espèce. Il semble difficile d'interpréter tout le comportement des petits crustacés et même des larves de Térédinides par une simple réaction de chimiotropisme : les animaux peuvent choisir un point ou une zone sur le support. Certaines essences, tout au moins au début de leur immersion, semblent jouer un rôle répulsif ou non attractif pour les crustacés: le Hêtre, Kaya ivorensis et Samba; ces observations ne sont valables que pour une saison chaude. Chez les mêmes crustacés, la préférence pour l'ombre joue un rôle très important. (OCR non contrôlé) Revue des Travaux de l'Institut des Pêches Maritimes (0035-2276) (ISTPM), 1956-06 , Vol. 20 , N. 2 , P. 185-200 Droits : Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/1956/publication-4669.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4669/ | Partager |
A white spot disease-like syndrome in the Pacific blue shrimp (Litopenaeus stylirostris) as a form of bacterial shell disease Auteur(s) : Goarant, Cyrille Brizard, Raphael Marteau, Anne-laure Éditeur(s) : Elsevier Résumé : In May 1997, some white lesions evoking the white spot syndrome disease were observed in Litopenaeus stylirostris broodstock in New Caledonia. The occurrence of these lesions was neither associated with mortality, nor with histological evidence of white spot syndrome baculovirus (WSBV), The evidence suggests that these lesions result from a form of bacterial disease and are associated with an increased bacterial flora on the outer surface of the cuticle, as well as an increased incidence throughout the molt cycle. A microscopic observation of these lesions allows them to be differentiated from WSBV-associated lesions. Aquaculture (0044-8486) (Elsevier), 2000-03 , Vol. 183 , N. 1-2 , P. 25-30 Droits : 2000 Elsevier Science B.V. All rights reserved http://archimer.ifremer.fr/doc/2000/publication-373.pdf DOI:10.1016/S0044-8486(99)00284-7 http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/373/ | Partager Voir aussi New Caledonia white spot syndrome Aquaculture Pathogenic bacteria Shrimp culture Crustaceans Diseases Litopenaeus stylirostris Télécharger |
Survie des langoustines (Nephrops norvegicus ) s'echappant d'un cul de chalut Auteur(s) : Morizur, Yvon Charuau, Anatole Rivoalen, Jean-jacques Éditeur(s) : ICES-CM-1982/B:14 Résumé : The survival rate of Nephrops escaping through the cod-end was recently studied in the Bay of Biscay. Over the 45mm meshed cod-end was put a 15mm meshed net in order to retain the Nephrops escaping though, the cod-end. Soon after hauling escaped Nephrops were returned on the sea-bed into cages. After an inversion of 60-78 hours, the average survived rate was about 70 %. However it was found increasing with the size of individuals. The value obtained, which is only a result of- the action oh several factors, may be lower than the true value. I he evolution, of this biological parameter according to the mesh size is discussed in the scope of assessments Le taux de survie des langoustines s'échappant à travers les mailles d'un cul de chalut a été étudié dans le Golfe de Gascogne. Sur le cul de chalut muni d'un maillage de 45 mm a été ajoutée une double-pêche en un maillage de 15mm: afin de recueillir les langoustines échappées. Les langoustines ainsi retenues ont été ré immergées dans des casiers. Après une immersion de 60-78 heures, le taux ce survie moyen était de l'ordre de 70%- Le taux de survie augmente avec la taille ces individus. Le taux de survie moyen obtenu n'est qu'une résultante de divers facteurs. Cette résultante pourrait dans le cas présent, être un minorant. L'évolution de ce paramètre biologique en fonction de la taille des vailles est, en outre, discutée. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1982/acte-2339.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2339/ | Partager Voir aussi size distribution crustacean fisheries mesh selectivity trawling fishing mortality survival Télécharger |
Osmoregulation pattern and salinity tolerance of the white shrimp Litopenaeus vannamei (Boone, 1931) during post-embryonic development Auteur(s) : Chong-robles, Jennyfers Charmantier, Guy Boulo, Viviane Lizarraga-valdez, Joel Enriquez-paredes, Luis M. Giffard-mena, Ivone Éditeur(s) : Elsevier Science Bv Résumé : The euryhaline white shrimp Litopenaeus vannamei lives in both coastal and oceanic areas through ontogeny. Its osmoregulation pattern and variations in its tolerance to salinity are partially known from several studies under different experimental conditions (developmental stages, salinities and acclimation procedures). Although L. vannamei is recognized as one of the most euryhaline penaeid species, with adults and juveniles exhibiting an hyper-hypo-osmoregulatory pattern and being able to tolerate a wide salinity range, little is known on larval and early postlarval strategies to cope with salinity fluctuations. In order to establish their euryhalinity range and to fully understand the ontogenetic changes in L. vannamei osmoregulatory pattern, we evaluated the effect of six salinities (5, 10, 20, 32, 45 and 60 psu) on 17 developmental stages by directly exposing them to experimental salinities and conducting observations during the next 48 hours. At 5 hours post osmotic shock (hps), all developmental stages survived (> 20%) in 20, 32 and 45 psu. The euryhalinity and osmoregulation pattern changed at some developmental stages of L. vannamei. The hyper-hypo osmoregulatory pattern exhibited by Juvenile and Adult appears to be established early in the first post-larval stage PL1 (ontogenetic osmoregulation pattern type 3), with higher tolerance to salinity variations observed in PL2, PL4 and PL22 suggesting that L. vannamei shows a progressive increase in the efficiency of osmoregulatory mechanism following last metamorphosis. Aquaculture (0044-8486) (Elsevier Science Bv), 2014-02 , Vol. 422 , P. 261-267 Droits : 2013 Elsevier B.V. All rights reserved. http://archimer.ifremer.fr/doc/00169/28068/26283.pdf DOI:10.1016/j.aquaculture.2013.11.034 http://archimer.ifremer.fr/doc/00169/28068/ | Partager |
Consequences des recents changements de maillage sur les rendements de la flotille langoustiniere lorientaise en Mer Celtique Auteur(s) : Morizur, Yvon Charuau, Anatole Éditeur(s) : ICES-CM-1981/K:36 Résumé : Some trawlers from Lorient (France) are fishing for Nephrops at the North of 48th parallel. During the last years, the mesh size of their cod-end changed twice. It increased from 45 mm to 60 mm at the end of year 1978 and to 70 mm at the end of year 1979.'. Whereas the change to 60 mm seems to have no immediate- effect on Nephrops landings, the increase from 60 mm to 70 mm results in a loss in Nephrops landings of 30-40 %. That loss in Nephrops landings goes with an increase in some by-catches species as whiting, cod and hake. Les langoustiniers Lorientais travaillant au nord du 48ème parallèle ont subi successivement deux augmentations de maillage. Ils sont passés du 45 mm au 60 mm en fin d'année 1978 puis au 70 mm en fin d'année 1979. Alors que le passage au 60 mm ne s'est pas fait sentir, le passage de 60 au 70 mm a provoqué une baisse des rendements en langoustine de 30-40 %. Cette baisse des rendements s'est accompagnée d'une augmentation des rendements de certains poissons comme le merlan, la morue et le merlu. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/1981/acte-2345.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2345/ | Partager Voir aussi ANE, Celtic Sea Nephrops Malacostraca Catch statistics Crustacean fisheries Yield Fishery management Mesh regulations Télécharger |
Nutrition, digestion et développement des larves de crevettes et poissons marins Auteur(s) : Cahu, Chantal Résumé : This report is presented by Chantal Cahu for obtaining accreditation to supervise research. Since 1981, her research activity has addressed the study of reproducers' nutrition and the young stages of development of marine organisms belonging to two different branch lines, crustaceans and fish. This work, performed in a base-lined research body, IFREMER, is placed within a more general programme of aquaculture development. Indeed, whatever species are at issue, the development of aquaculture in France, as at the global level, is based on the production of juveniles in hatcheries. My work has therefore more precisely the goal of acquiring knowledge about the nutritional needs, mechanisms of digestion and the development of these animals in order to improve the production of prawn post-larvae and fish alevin in the hatchery.
This work took place in three main periods that appear in this report:
- The study of reproducers' nutrition and its influence on the quality of the Penaeid prawn's eggs and larvae. My work has focused mainly on the effect of lipids and vitamins on the development of eggs and larvae.
- The study of the ontogenesis of the digestive functions and the nutritional needs of sea fish larvae, with bass as the model. The goal was to determine the specific nutritional needs of the young stages by studying the implementation and regulation of pancreatic and intestinal digestive enzymes.
- The study of the regulation of certain developmental genes by means of nutrients, so as to understand how these nutrients behave during ontogenesis, particularly during development of the skeleton.
Ce mémoire est présentée par Chantal Cahu pour pour l'obtention d'une habilitation a diriger des recherches. Depuis 1981, son activité de recherche concerne l'étude de la nutrition des reproducteurs et des jeunes stades de développement d'organismes marins appartenant à deux embranchements différents, les crustacés et les poissons. Ce travail réalisé dans un organisme de recherche finalisée, l'Ifremer, se situe dans un programme plus général de développement de l'aquaculture. En effet, quelles que soient les espèces en jeu, le développement de l'aquaculture en France comme au niveau mondial repose sur la production de juvéniles en écloserie. Mon travail a donc plus précisément pour objectif l'acquisition de connaissances sur les besoins nutritionnels, les mécanismes de digestion et le développement des ces animaux afin d'améliorer la production de post-larves de crevettes et d'alevins de poissons en écloserie. Ce travail s'est déroulé en trois grandes périodes qui apparaissent dans ce mémoire : - L'étude de la nutrition des reproducteurs et son influence sur la qualité des oeufs et des larves de crevettes Pénéides. Mon travail a essentiellement porté sur l'effet des lipides et des vitamines sur le développement des oeufs et des larves. - L'étude de l'ontogenèse des fonctions digestives et les besoins nutritionnels des larves de poissons marins, avec le bar comme modèle. Le but était de déterminer les besoins nutritionnels spécifiques des jeunes stades, en étudiant la mise en place et la régulation des enzymes digestives pancréatiques et intestinales. - L'étude de la régulation de certains gènes du développement par les nutriments, de façon à comprendre comment ces nutriments agissent lors de l'ontogenèse, notamment lors du développement du squelette. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/rapport-2086.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2086/ | Partager Voir aussi Skeleton development Vitamins Nutriment Fish larvae Egg quality Reproduction Nutrition Shrimp larvae Peneids Télécharger |
Metal and metalloid bioaccumulation in the Pacific blue shrimp Litopenaeus stylirostris (Stimpson) from New Caledonia: Laboratory and field studies Auteur(s) : Metian, Marc Hedouin, Laetitia Eltayeb, Mohamed M. Lacoue-labarthe, Thomas Teyssie, Jean-louis Mugnier, Chantal Bustamante, Paco Warnau, Michel Éditeur(s) : Pergamon-elsevier Science Ltd Résumé : The present work aimed at better understanding metal and metalloid bioaccumulation in the edible Pacific blue shrimp Litopenaeus stylirostris, using both laboratory and field approaches. In the laboratory, the bioaccumulation kinetics of Ag, Cd, Co, Cr, and Zn have been investigated in shrimp exposed via seawater and food, using the corresponding gamma-emitting radiotracers (Ag-110m, Cd-109, Co-57, Cr-51, and Zn-65) and highly sensitive nuclear detection techniques. Results showed that hepatopancreas and intestine concentrated the metals to the highest extent among the blue shrimp organs and tissues. Moulting was found to play a non negligible detoxification role for Co, Cr and, to a lesser extent, Zn. Metal retention by L stylirostris widely varied (from a few days to several months), according to the element and exposure pathway considered (a given metal was usually less strongly retained when ingested with food than when it was taken up from the dissolved phase). In the field study, Ag, As, Cd, Co, Cr, Cu, Mn, Ni, and Zn were analysed in shrimp collected from a New Caledonian aquaculture pond. Metal concentrations in the shrimp muscles were generally relatively low and results confirmed the role played by the digestive organs and tissues in the bioaccumulation/storage/detoxification of metals in the Pacific blue shrimp. Preliminary risk considerations indicate that consumption of the shrimp farmed in New Caledonia is not of particular concern for human health. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved. Marine Pollution Bulletin (0025-326X) (Pergamon-elsevier Science Ltd), 2010 , Vol. 61 , N. 7-12 , P. 576-584 Droits : 2010 Elsevier Ltd All rights reserved. http://archimer.ifremer.fr/doc/00014/12528/9869.pdf DOI:10.1016/j.marpolbul.2010.06.035 http://archimer.ifremer.fr/doc/00014/12528/ | Partager |
Etude, caractérisation et suivi électrochimique de la surface de l’acier inoxydable 254 SMO en milieux aqueux naturels amazoniens ; Study, electrochemical characterization and monitoring of the surface of stainless steel 254 SMO in Amazonian natural environnement Auteur(s) : Ntienoue, Joseline Auteurs secondaires : Antilles-Guyane Roos, Christophe Résumé : Les aciers inoxydables à haute teneur en molybdène présentent une excellente résistance à la corrosion et ont été récemment utilisés dans des applications marines. L'acier inoxydable de type 254 SMO contient du molybdène (6% Mo) et des quantités plus élevées en éléments d'alliages que les aciers inoxydables plus classiques tels que 304, 316 et 316L. Alors que Anees Uddin Malik et al. montrent que l’acier 254 SMO est moins sensible à la corrosion par piqûre en eau de mer du golfe persique, Abdulsalam et al. démontrent que bien que cet acier présente une bonne résistance à la corrosion, il reste encore sensible à une corrosion caverneuse (surtout en milieu à 16% en masse d’ion chlorure ou à plus de 30°C).La première partie de ce travail traite du comportement électrochimique de l’acier inoxydable 254 SMO immergé dans l’eau de mer naturelle en laboratoire. Ainsi deux sites de la Guyane ont été choisis pour effectuer des prélèvements d’eau. Des analyses physicochimiques de ces eaux sont réalisées et montrent que l’eau du site du Port Larivot contient une quantité en ions chlorures plus importante que celle de l’eau du site du Mahury. Une colonisation par des bactéries et crustacés (balanes) a été mise en évidence, à l’aide du microscope électronique à balayage environnemental. Les mesures électrochimiques, notamment la voltammétrie cyclique a montré l’existence d’une zone de passivation et l’augmentation du courant de passivation par un facteur de 10 en présence d’un biofilm pour l’acier inoxydable immergé en eau du Mahury durant 22 jours. La deuxième partie propose une étude approfondie du comportement de l’interface complexe métal/couche passive/biofilm. Trois différents coupons d’aciers inoxydables (brut, poli et grenaillé) ont été déposés sur site (in-situ) dans un premier temps. Dans une seconde étape, nous avons réalisé des expérimentations mixtes (incubation in-situ et croissance en laboratoire). L’évolution du potentiel d’abandon de ces aciers est très proche pour l’acier brut et l’acier poli. En revanche, celui de l’acier grenaillé, de par la présence des grains d’alumine à sa surface, affiche un comportement différent. Une étude comparative des deux expérimentations montre des différences concernant les paramètres électriques de l’interface complexe métal/couche passive/biofilm. Stainless steels with high content in molybdenum present an excellent corrosion resistance and were recently used in marine applications. The stainless steel 254 SMO contains molybdenum (6 %) and higher amounts of alloying elements than conventional stainless steels such as 304, 316 and 316L. While Anees Uddin Malik et al. show that 254 SMO steel is less likely to be susceptible to pitting corrosion in Arabian Gulf sea water, Abdulsalam et al. demonstrate that although this steel has good resistance to corrosion, it remains still susceptible to crevice corrosion (especially in environment with 16 chloride percent weight or more than 30 ° C).The first part of this work deals with the electrochemical behaviour of stainless steel 254 SMO immersed in natural seawater at laboratory. Two sites in French Guyane were chosen to take samples of seawater. Physicochemical analyses of these waters are made and show than the in Port Larivot site seawater contains a higher quantity of chloride ion than to Mahury seawater. Colonization by bacteria and crustaceans (barnacles) was highlighted, using the environmental scanning electron microscope. The electrochemical measurements, including cyclic voltammetry showed the existence of a passivation region and increasing the passivation current by a factor of 10 in the presence of biofilm on stainless steel immersed in Mahury seawater during 22 days.The second part offers a detailed study of the behaviour of the interface metal/passive film/biofilm. Three different coupons of stainless steel (crude, polished and blasted) were deposited on the site (in-situ) in the first time. In a second step, we performed experiments mixed (in-situ incubation and growth in the laboratory). The evolution of the free potential of these steels is very close for crude steel and polished steel. Conversely, the blasted steel, by the presence of alumina grains on its surface, shows a different behaviour. A comparative study of those two experiments shows differences in the electrical parameters of the interface metal/passive film/biofilm. http://www.theses.fr/2013AGUY0598/document | Partager |
Could a diet enriched with n-3 highly unsaturated fatty acids be considered a promising way to enhance the immune defences and the resistance of Penaeid prawns to environmental stress? Auteur(s) : Chim, Liet Lemaire, Pierrette Delaporte, Maryse Le Moullac, Gilles Galois, Robert Martin, Jean-louis Éditeur(s) : Blackwell science Résumé : The prawn Penaeus stylirostris (Stimpson), when fed for 28 days with n-3 highly unsaturated fatty acid (HUFA)-enriched feed pellets, demonstrated an enhanced resistance to variations in environmental parameters (a decrease in temperature and salinity over a 4-day period from 28 degreesC to 17 degreesC and from 35 parts per thousand to 10 parts per thousand respectively) and an improvement in their immune defence potential, i.e. increased agglutination titre of plasma and increased respiratory burst of haemocytes. Aquaculture Research (1355-557X) (Blackwell science), 2001-02 , Vol. 32 , N. 2 , P. 91-94 Droits : 2001 Blackwell http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/publication-606.pdf DOI:10.1046/j.1365-2109.2001.00534.x http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/606/ | Partager |
Acquisition of susceptibility to Vibrio penaeicida in Penaeus stylirostris postlarvae and juveniles Auteur(s) : Goarant, Cyrille Regnier, France Brizard, Raphael Marteau, Anne-laure Éditeur(s) : Elsevier Résumé : Vibriosis is a major disease problem in shrimp aquaculture, affecting all developmental stages, from larvae in hatchery tanks to juveniles and broodstock in growout ponds. However, bacterial strains responsible for vibriosis in the successive stages are usually considered to be different, and virulence specificity has been reported both at the species and at the stage levels. The so-called « Syndrome 93 » is a seasonal juvenile vibriosis caused by Vibrio penaeicida which affects Penaeus stylirostris in growout ponds and broodstock tanks in New Caledonia. This pathology does not cause any mortality in hatchery or nursery phases. An experimental infection design using balneation of postlarvae and early juveniles in V. penaeicida suspensions was used to evaluate the developmental stage at which shrimp become sensitive to this vibriosis. We demonstrated that the acquisition of susceptibility to this pathogen is very sudden and correlated with the acquisition of the definitive rostral formula, and from this draw conclusions regarding virulence mechanisms of V. penaeicida in P. stylirostris. Aquaculture (Elsevier), 1998-12 , Vol. 169 , N. 3-4 , P. 291-296 Droits : 1998 Elsevier Science B.V. All rights reserved http://archimer.ifremer.fr/doc/1998/publication-383.pdf DOI:10.1016/S0044-8486(98)00380-9 http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/383/ | Partager |
Synthèse hydrobiologique du site électronucléaire de Flamanville Auteur(s) : Dreves, Luc Lampert, Luis Abernot, Chantal Martin, Jocelyne Arzel, Pierre Dumas, Franck Latrouite, Daniel Schlaich, Ivan Résumé : This synthesis report assesses the current state of the marine hydrobiological knowledge acquired in the surroundings of the Flamanville electronuclear site (north-west of Cotentin), in the framework of the various project and monitoring programs in the pelagic, benthic and halieutic domains carried out on this site since 1976. Each domain is divided, as much as necessary, into different study areas such as hydrobiology, phytoplankton, microbiology, crustacean larvae or macrophyte algae. For each area, a series of parameters, considered as representative of the evolution of this area, is studied. In this way, for the hydrological area, the sea water temperature and salinity, the mineral nutriment concentrations, the holagen compounds and the boron are monitored. The evolution of each of these parameters enabled us to draw the following conclusions. The vegetal and animal species' physiology is conditioned by climate changes. The study of the pluviometry and air temperature parameters shows that the 1986/2005 period is slightly less humid and warmer than the 1949/2005 period. This reflects also on the sea water temperature whose average values increase on a regular basis. Ce rapport de synthèse fait le point sur l'état des connaissances hydrobiologiques marines acquises aux abords du site électronucléaire de Flamanville (nord-ouest Cotentin), dans le cadre des différents programmes de projet et de surveillance des domaines pélagique, benthique et halieutique, menés sur ce site depuis 1976. Chaque domaine est divisé, autant que nécessaire, en compartiments d'étude, tels que l'hydrologie, le phytoplancton, la microbiologie, les larves de crustacés ou les algues macrophytes. Pour chaque compartiment, une série de paramètres, jugés représentatifs de l'évolution de ce compartiment, est étudié. Ainsi, pour le compartiment hydrologique, sont suivis la température et la salinité de l'eau de mer, les concentrations en nutriments minéraux, les composés halogénés et le bore. Les évolutions de ces différents paramètres ont permis d'élaborer les conclusions suivantes. La physiologie des espèces animales et végétales est conditionnée par les changements climatiques. L'examen des paramètres pluviométrie et température de l'air montre que la période 1986/2005 est sensiblement plus humide et plus chaude que la période 1949/2005. Cela se répercute également sur la température de l'eau de mer dont les valeurs moyennes croissent régulièrement. Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/rapport-6405.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6405/ | Partager |
A relationship between antimicrobial peptide gene expression and capacity of a selected shrimp line to survive a Vibrio infection Auteur(s) : De Lorgeril, Julien Gueguen, Yannick Goarant, Cyrille Goyard, Emmanuel Mugnier, Chantal Fievet, Julie Piquemal, D Bachere, Evelyne Éditeur(s) : Elsevier Résumé : Understanding of antimicrobial defence mechanisms of penaeid shrimp should help in the design of efficient strategies for the management and disease control in aquaculture. In this study, we have specifically analysed the expression in circulating hemocytes of antimicrobial peptides (AMPs) encoding genes, such as PEN2 and PEN3, ALF, crustin, lysozyme and a putative cysteine-rich peptide. We evidenced a relationship between the level of expression of some AMPs and the successful response of the shrimp, Litopenaeus stylirostris, to circumvent a pathogenic Vibrio penaeicida infection. Additionally, significant differences in some AMP transcript amounts are evidenced between control, non-selected shrimp line and the third generation breeding of shrimp selected for their survival to natural V. penaeicida infections. On the basis of these results, it will now be of great interest to determine if these AMPs are directly involved in the resistance of shrimp to infection or if they only reflect other acquired defence mechanisms which can confer a resistance. (C) 2008 Elsevier Ltd. All rights reserved. Molecular Immunology (0161-5890) (Elsevier), 2008-07 , Vol. 45 , N. 12 , P. 3438-3445 Droits : 2008 Elsevier Ltd All rights reserved. http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/publication-4524.pdf DOI:10.1016/j.molimm.2008.04.002 http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4524/ | Partager Voir aussi Real time PCR Cysteine rich peptide Crustin Anti LPS factor Lysozyme Penaeidins Immune response Vibrio penaeicida Penaeid Decapoda Télécharger |
Catalogue descriptif des poissons vénéneux du banc de Saint Barthelemy (Antilles françaises) Auteur(s) : Morice, Jean Éditeur(s) : ISTPM Résumé : The Caribean Sea ichthyofauna, like that of all tropical and subtropical seas, contains venomous fishes some of which can cause certain forms of ichthyosarcotoxism.The first people to notice, at their expense, the existence of these dangerous animals in the waters of the West Indies were the conquistadores who settled in Haïti and Cuba after Christopher COLOMBUS. As these men were not well provided by fresh supplies from their far away home-as related by many chroniclers-they had to live on local food resources. Originally, terrestrial fauna, in these islands, was very lacking as far as big mammals go, and birds bigger than a pigeon were rare. As a consequence, Spanish sailors and soldiers ate mostly seafood, fish, crustaceans and molluscs that abounded in the clear waters of the Caribean shores. (The introduction of European mammals: bovines, ovines, caprines and porcines, but also poultry, only happened many years later-cattle raising only developed when the conquistadores were well settled and land had been divided-initial protid production was not sufficient to cover the Spaniards' needs.... La faune ichthyologique de la Mer des Antilles, comme celle de toutes les mers des regions tropicales et subtropicales, contient des poissons vénéneux, causes de certaines formes d'ichthyosarcotoxisme. Les premiers qui s'aperçurent, à leurs dépens, de l'existence de ces animaux dangereux dans les eaux des Indes occidentales furent les conquistadores qui s'installèrent en Haïti et à Cuba après les découvertes de Christophe COLOMB et de ses lieutenants. Ces hommes, souvent fort mal ravitaillés par leur trop lointaine métropole -tous les chroniqueurs de l'époque en font foi -furent obligés d'utiliser les ressources alimentaires locales. Comme à l'origine, la faune terrestre des îles était très pauvre en grands mammifères et que les oiseaux plus volumineux qu'un ramier étaient rares, les soldats et les marins espagnols consommèrent surtout les fruits de la mer : poissons, crustacés et mollusques qui abondaient dans les eaux claires des rivages antillais. (L'introduction des mammifères européens: bovins, ovins, caprins et porcins, comme des oiseaux de basse-cour, fut relativement tardive; l'élevage ne se développa que lorsque les conquérants de l'Eldorado furent installés et que la terre fut partagée; la production initiale de protides était très nettement insuffisante pour couvrir les besoins des Espagnols.) L'un des animaux les plus faciles à capturer était -et l'est encore -le-« burgo », Linona pica L., gros gastéropode de la famille des Trochidés qu'il suffisait de récolter à la main sur les récifs coralliens ou les rochers qui bordaient les plages; l'abondance de la distribution de ce gros bigorneau est encore telle à l'heure actuelle qu'il forme une ressource permanente appréciée; dans certaines petites îles très mal ravitaillées: Los Hermanos et La Blanquilla dans les Antilles vénézuéliennes; Saint-Barthélémy, La Désirade, dans les Antilles françaises, etc., où le « burgo » constitue une partie importante de la ration alimentaire. Il arrivait à Cuba, que sa consommation soit la cause d'accidents gastro-intestinaux et neuraux qui furent groupés par les Espagnols sous le nom de "ciguatera", le mollusque lui-même étant appelé "cigua", (II faut noter que les « burgos » récoltés sur certains îlots et récifs de la côte méridionale de Saint-Barthélemy sont la cause de troubles analogues à ceux qui furent décrits par les chroniqueurs des XVe et XVIe siècles) Le vocable s'est étendu ensuite, dans le langage populaire, aux troubles digestifs et aux troubles neuraux ressentis après l'ingestion de différentes espèces de poissons vénéneux, espèces qui se révélèrent malheureusement relativement nombreuses dans les eaux des Grandes Antilles, Le auteurs anciens, repris par COUTIÈRE dans sa thèse (1899) décrivent également des cas d'intoxications graves depuis le début de l'occupation des Petites Antilles par les Européens, intoxications attribuées pour la plupart aux barracudas, aux balistes, aux murènes, à certains clupes, aux carangues comme à un certain nombre d'espèces de « poissons rouges ». Les naturalistes modernes, d'ARCISZ (1950) à RANDALL (1958), donnent la liste scientifique des espèces incriminables dans la Mer des Antilles. Il n'existe actuellement aucun manuel en langue française permettant la détermination des poissons marins et des espèces dulçaquicoles des Petites Antilles, Le naturaliste est obligé, pour identifier les poissons, de recourir à des ouvrages américains ou hollandais, ou encore à des monographies toutes rédigées en langue anglaise. Ces livres, à de très rares exceptions près, sont anciens et difficiles à trouver en librairie étant presque tous épuisés ou rares. La publication que nous présentons ici n'a pas la prétention de pallier l'inexistence de documents en langue française sur l'ensemble de la faune ichthyologique antillaise; elle n'a pour but que de fournir au personnel chargé du contrôle du conditionnement et des marchés, aux armateurs à la pêche désireux de se renseigner sur les possibilités locales, comme à quelques esprits curieux, une documentation suffisante et illustrée, pour permettre une identification sûre et rapide des espèces dangereuses. Cette étude est née d'un besoin précis : les pêcheurs des Antilles françaises, maintenant guidés par une assistance technique qui reprend élémentairement les bases de la profession, se sont heurtés très rapidement au fait suivant : il était nécessaire de créer un conditionnement des produits de la pêche car quelques espèces de poissons commerciaux, saines dans certaines régions, sont vénéneuses dans d'autres, géographiquement toutes voisines, et doivent être éliminées du marché. Pour cela il fallait établir avec précision quelles espèces pouvaient être dangereuses, et donner aux pêcheurs, aux marchands et au public l'image exacte des formes incriminables. Si une espèce donnée peut contenir des individus vénéneux, tous les individus de cette espèce ne sont pas dangereux et des spécimens de la même espèce incriminables en un point ne le seront pas dans d'autres lieux de pêche. POEY (1866) a écrit: « ... il n'y a pas un poisson suspect sur dix mille... » Cela est sans doute vrai si l'on envisage le stock constitué par une espèce, mais ne l'est plus si l'on considère les concentrations géographiques. A travers l'expérience que nous avons acquise à Saint-Barthélemy, nous pouvons affirmer avec certitude que les poissons vénéneux sont bien groupés en isolats cernés par des frontières géographiques précises. De plus il apparaît très nettement que les poissons âgés, donc ayant atteint un certain poids, sont seuls responsables des accidents ciguatériques les plus graves. Le fait que l'ichthyologiste cubain POEY, 1866, ait imposé l'interdiction des poissons pesant plus de trois livres dans les espèces suspectes sur le marché de La Havane est très significatif. Un fait statistique observé à Saint-Barthélemy vient corroborer les notions précédemment énoncées. Un certain nombre de canots de pêche à la ligne à main, travaillant à l'accore méridional du banc de Saint-Martin, capturait surtout des « oreilles noires » (Lufianus buccanella (c. et V.), 1828) et des « vivaneaux » (L. vivanus (c. et V.), 1828) ; le poids des poissons vidés acceptés par le service de contrôle de la coopérative des pêcheurs de Gustavia avait été fixé à 1 500 g; des poissons de poids bien supérieurs à ce plafond ayant été acceptés par le conditionnement en janvier et février 1963, toute une série d'intoxications graves de type ciguatérique se produisit à Basse-Terre et à Pointe-à-Pitre de La Guadeloupe, lieux principaux de consommation du poisson capturé sur le banc de Saint-Martin. Le poids des poissons vidés exportables ayant été ramené à 1 500 g. les intoxications cessèrent. Il reste à étudier l'étiologie de la «ciguatera », forme la plus commune d'ichthyosarcotoxisme notée aux Antilles. L'accumulation des observations et des notes prises à propos des cas observés à Saint-Barthélemy, à La Guadeloupe, comme à La Martinique (1950) ainsi que les dissections effectuées sur les poissons capturés par les pêcheurs de Saint-Barthélemy nous permettront peut-être de conclure bientôt à ce sujet. Enfin. il faudra trouver le test biochimique simple et précis permettant de déterminer rapidement si un poisson considéré comme « redouteux» est vénéneux ou non. (Les poissons incriminables sont désignés sous le nom de poissons «redouteux» dans le patois de Saint-Barthélemy; la « ciguatera » est nommée « mal poisson ».) Les appellations vernaculaires créoles des espèces vénéneuses ont été établies à partir des notes prises depuis 1950. Cette liste est loin d'être exhaustive car il n'y a pas de domaine plus ingrat que la synonymie vernaculaire. Les appellations américaines, britanniques et hollandaises ont été prises dans les ouvrages publiés d'une part par le Fish and Wildlife Service (laboratoire de Biologie marine de Miami), et d'autre part par la Commission des Caraïbes. Kent House, à La Trinidad. 1959. relayée ensuite par le Secrétariat central de l'Organisation des Caraïbes, 1961. Hato Rey. Porto-Rico. Enfin. nous avons pu établir l'équivalence vernaculaire des noms de poissons utilisés à Saint-Barthélemy et à Saint-Martin grâce à l'aimable collaboration du Dr PETIT, chef de l'hôpital de Marigot à Saint-Martin. Les bases de la systématique que nous avons utilisées, pour replacer les espèces décrites dans un cadre cohérent. sont celles qui sont exposées par BERTIN et ARAMBOURG (1958) dans le troisième fascicule du tome treize du Traité de Zoologie publié sous la direction du Pr P. GRASSÉ: nous y avons fait de larges emprunts. (OCR non contrôlé) Revue des Travaux de l'Institut des Pêches Maritimes (0035-2276) (ISTPM), 1965-03 , Vol. 29 , N. 1 , P. 1-130 Droits : Ifremer http://archimer.ifremer.fr/doc/1965/publication-4004.pdf http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4004/ | Partager |